北京华大蛋白质研发中心质谱分析服务订单-清华大学生物医学测试中心
国内外做基因测序的高校院所梳理
国内外做基因测序的高校院所梳理1. 引言基因测序是一项重要的科学技术，可以揭示生物个体的遗传信息，对于生命科学、医学研究和临床应用具有重要意义。
国内外的高校院所在基因测序领域扮演着重要角色，致力于推动基因测序技术的发展和应用。
本文将对国内外做基因测序的高校院所进行梳理和介绍。
2. 国内高校院所2.1 清华大学清华大学是中国一流的综合性大学，其基因测序实验室拥有先进的仪器设备和丰富的科研经验。
该实验室致力于基因测序技术的研究和应用，涉及基因组学、转录组学、蛋白质组学等多个领域。
清华大学的基因测序实验室在国内外享有很高的声誉，并与多家国际知名机构合作开展科研项目。
2.2 北京大学北京大学也是中国顶尖的高校之一，在基因测序领域有着卓越的研究成果。
北京大学的基因测序实验室拥有先进的测序设备和专业的科研团队，致力于基因组学和遗传学等领域的研究。
该实验室与国内外多家研究机构和生物技术公司合作，共同推动基因测序技术的发展和应用。
2.3 复旦大学复旦大学是中国著名的综合性大学，其基因测序实验室在基因组学和生物信息学等领域具有优势。
该实验室拥有先进的测序平台和专业的科研团队，致力于基因组测序和功能基因组学的研究。
复旦大学的基因测序实验室与国内外多家研究机构和生物技术公司开展合作，共同推动基因测序技术的创新和应用。
3. 国外高校院所3.1 哈佛大学哈佛大学是世界顶尖的高校之一，在基因测序领域具有广泛的研究合作和影响力。
哈佛大学的基因测序实验室拥有世界领先的测序设备和专业的科研团队，致力于基因组学、转录组学和表观遗传学等领域的研究。
该实验室与国内外多家研究机构和生物技术公司合作，开展前沿的基因测序技术研究和应用。
3.2 斯坦福大学斯坦福大学是美国著名的高等学府，其基因测序实验室在技术创新和研究成果方面具有卓越的表现。
斯坦福大学的基因测序实验室拥有先进的测序设备和专业的科研团队，致力于基因组学、遗传学和生物信息学等领域的研究。
生物信息学生物信息数据库及其信息检索讲课文档
核酸序列数据库
GenBank（ ） EMBL（ ） DDBJ （ ） 三个数据库每天互相交换数据 GenBank可通过NCBI的检索系统Entrez获取， Entrez集成来自主要DNA和蛋白序列数据
库的数据，包括物种、基因组、定位、蛋白结构和结构域等信息
其他各种专业核酸数据库
（SNP ） 收录已经识别的SNPs的数据库
HapMap Project()
收录了三大人群(非洲人,高加索人和亚洲人群)主要的变异模式,所选择的SNPs具有相对 代表性 CGED(http://lifesciencedb.jp/cged/) 收录多种癌症的临床和基因表达数据，更新到2007年
第二十四页，共60页。
第三十页，共60页。
复杂检索
1、限制字段类别 常用的有: Author: Bao YM[au]
Title: stress[ti]
Tilte/Abstract： stress[title/abstract]
Genome Assembly
GenBank
第十二页，共60页。
UniGene
Algorithms
GenBank中测序最多的20个物种
第十三页，共60页。
模式生物与基因测序
Ureaplasma urealyticum
Bacillus subtilis
Drosophila melanogaster
比，增加一些附加信息：经程序验证的显性化学图像信息、一致的二级结构衍生定义、与
MEDLINE相匹配的引用、基于源自生物实体的蛋白质或核酸链进行分类的分子匹 配。
第十八页，共60页。
三、功能数据库
收录生物分子的功能数据，由ID号与序列和结构数据链接 组织表达谱和亚细胞定位 根据不同组织中的EST、SAGE或芯片杂交信号，绘制出不同组织中表达基因的图谱： BodyMap（） Unigene（ ） SAGEmap（） GEO（） Stanford Microarray Database（）
清华大学生物医学测试质谱中心概况及ETD离子源介绍
LOGO ETD Reagent
ETD reagent used to transport electrons into the trap where they react with peptide cations
x10 6 4
202.0
3
Fluoranthene
Ion Trap With Ions
LOGO
ETD的应用Leabharlann 的应用主要用于蛋白质翻译后修饰的分析， 主要用于蛋白质翻译后修饰的分析，可以提供更多 的裂解碎片，提高对蛋白质序列分析的覆盖率， 的裂解碎片，提高对蛋白质序列分析的覆盖率，同时保 护不稳定的翻译后修饰基团， 护不稳定的翻译后修饰基团，有助于发现更多的修饰位 点。
Matrix Assisted Laser Desorption Ionization Time Of Flight Mass Spectrometry
ABI, 4800 plus
2、2D ChipLC IonTrap质谱仪 、 质谱仪
LOGO
Electro-Spray Ionization (ESI) Electron Transfer Dissociation (ETD)
LOGO
Angiotensin 1 Data analysis
ETD 649
Thanks!
ETD source introduction
LOGO
What is ETD?
Electron Transfer Dissociation – Singly-charged radical anions transfer an electron to multiply-protonated peptides in the ion trap and induce fragmentation of the peptide backbone along pathways that are analogous to those observed in electron capture dissociation (ECD)
利用GFP-Trap和酵母双杂交技术筛选TaPR1互作靶标
第44卷第5期2021年9月河北农业大学学报JOURNAL OF HEBEI AGRICULTURAL UNIVERSITYVol.44 No.5Sep.2021利用GFP-Trap和酵母双杂交技术筛选TaPR1互作靶标申松松，王 菲，耿怀民，孟麟硕，冯 燕，王海燕（河北农业大学 植物保护学院/河北省农作物病虫害生物防治工程技术研究中心，河北 保定 071000）摘要：病程相关蛋白PR1（pathogenesis related PR1 proteins, PR1）在小麦抗病防御反应中发挥重要作用。
本试验是在前期研究基础上，借助烟草成功表达TaPR1蛋白，利用 GFP-Trap 技术结合质谱分析获得与TaPR1互作的蛋白。
同时，利用酵母双杂交技术（Yeast two-hybrid, Y2H）在接种叶锈菌生理小种PHNT的‘中国春’小麦酵母文库中筛选获得与TaPR1互作的寄主蛋白。
经过序列比对分析，2种方法共同筛选出谷氨酰氨合成酶（Glutamine synthetase）、细胞色素b6（Cytochrome b6）、应激蛋白（Stress protein）等可能与TaPR1互作的蛋白，为进一步深入研究TaPR1参与小麦叶锈病防御反应的分子机制提供了理论基础。
关 键 词：小麦叶锈菌；病程相关蛋白PR1；GFP-Trap；酵母双杂交；互作蛋白中图分类号：S432.1 开放科学（资源服务）标识码（OSID）：文献标志码：AScreening of interacting target of TaPR1 using GFP-Trapand yeast two-hybrid techniqueSHEN Songsong, WANG Fei, GENG Huaimin, MENG Linshuo,FENG Yan, WANG Haiyan(College of Plant Protection, Hebei Agricultural University / Biological Control Technological Innovation Center ofPlant Diseases and Plant Pests of Hebei Province, Baoding 071000, China)Abstract: Pathogenesis related PR1 (pathogenesis related PR1 proteins, PR1) proteins played an important role inwheat disease defense response. On the basis of the previous study, the TaPR1 protein was successfully expressedby tobacco, the proteins interacting with TaPR1 were obtained by GFP-Trap technique combined with massspectrometry. At the same time, host proteins interacting with the TaPR1 were screened from the yeast libraryof‘Chinese Spring’wheat inoculated with physiological race PHNT of leaf rust by yeast two-hybrid technique(Yeast two-hybrid, Y2H). Sequence analysis showed that Glutamine synthetase, Cytochrome B6, Stress protein andother proteins that might interact with the TaPR1 were screened by both two methods. The study laid a theoreticalfoundation for exploring the molecular mechanism of the TaPR1 participating in wheat leaf rust disease defenseresponse.Keywords: wheat leaf rust; pathogenesis related PR1 proteins; GFP-Trap; yeast two-hybrid; interacting proteins收稿日期：2021-03-19基金项目： 河北省自然科学基金（C2020204028）．第一作者：申松松（1996-），男，河北邯郸人，硕士研究生，主要从事分子植物病理学研究.E-通信作者： 王海燕（1977-），女，河北遵化人，博士，教授，主要从事分子植物病理学研究.E-本刊网址：http: //hauxb. hebau. edu. cn文章编号：1000-1573(2021)05-0064-07DOI：10.13320/ki.jauh.2021.008565第5期作为世界上最重要的粮食作物之一，小麦的产量受多个方面的影响，其中对产量影响最大的是小麦病害。
北京国际工程咨询有限公司_企业报告(代理机构版)
6
首都师范大学附属育新学校房山分 校 2023 年信息化建设预算项目
北京市房山区教育委 员会
7881.2 7200.0
2023-07-27 2023-07-31
7
清华大学高通量多束扫描电子显微 镜购置项目（清设招第 2022726 号）
清华大学
中标公告
5500.0
2022-12-23
本报告于 2023 年 08 月 21 日 生成
18
2022 年延庆区农村地区村庄冬季清 洁取暖项目
北京市延庆区农业农 村局
19 奔驰 MFA 物业外包服务中标公告
北京鹏盛物业管理有 限公司
3670.0 3568.8 3500.0 3400.0 3400.0 3209.8 3116.9 3036.0
2022-12-22 2023-06-28 2022-11-02 2022-12-14 2022-12-26 2022-09-22 2022-08-24 2022-12-02
1.4 大额项目列表
序号
项目名称
招标单位
预算金额（万元） 公告时间
1
北京市海淀区教师进修学校附属房 山实验学校二次装修改造项目（监 理）成交公告
北京市海淀区教师进 修学校附属房山实验 学校
800000.0
2023-07-24
2
[公开]北京工商大学改善办学保障条 件-整促改落地项目-经济学院整建
北京工商大学
*平均节支率是指，项目节支金额与预算金额的比值的平均值。（节支金额=项目预算金额-中标金额）
本报告于 2023 年 08 月 21 日 生成
1 / 41
1.2 代理项目趋势
近 3 月(2023-06~2023-08)：
高通量蛋白质分离检测系统通过验收
检测系统 的研制 与开发 ”课题 进行 了验收 。验 收专 家
长 ） 、科 技 部 国家 图书文献 信 息 中心吴 波 尔研 究 员 研究所陈义研究员 、大连 理工 大学贾凌云教授 、大连 医科大学王立 明教授 、科技部 国家科技基础条件平 台
组成员包括北京 蛋 白组 学研 究 中心钱小红研究 员 （ 组 人针对 高通 量蛋 白质分离检测系 统的研 制与 展 目标、研 究方 向、产 品规模化 生产 等 问题土
京市技术创新服务 中心王安居 主任 主持，中 国环境监 半 固体样 品的快速 高效萃取 ，在环保 、食 品、
测总站魏复盛院士担任鉴定委 员会 主任 ，中国计量科 地质 、法庭科学等领域，具有 良好的市场前 学研究 院李红梅 研 究员担任 鉴定委 员
会副主任 。委 员会成 员有 刘虎威 、 闫
专 家 组 一 致 认 为 ： 该 项 目研 究 计 划 、
连化学物理 和课题设置合理 ，项 目实施和管理规范 ，经 ！ 研究所主持承担 ，北京理工大学 、大连依利特分析 仪 理，完成 了课题合 同书 的各项任 务指标 ，一 器有 限公 司参加 的 “ 十一五 ”国家科技支撑计划项 目 “ 科学仪器设备研制 与开发 ”中 “ 高通量蛋 白质分 离 过验 收 ，同时建议 国家有 关部 门继续给予大 实现课题成果 的产业化 。 验 收会后 ，与 会领 导 、专 家 以及有 关
成德 、林 少彬 、汪 正范 、孙 汉文 、刘 潇威、刘肃 、张萍 、江林等专家 。 鉴 定 委 员 会 一 致 认 为 ： 北 京
吉 天 仪 器 有 限公 司和 中科 院 大 连 化
学物 理 研 究 所 联 合 研 制 开 发 的Ｐ Ｅ Ｌ一 １ ０ ／ ０ Ｏ ３ ０ 快速溶 剂萃取仪整 体 Ｏ０ ２０ ／００
抗MFAP3L单克隆抗体及其在肿瘤检测中的应用[发明专利]
![抗MFAP3L单克隆抗体及其在肿瘤检测中的应用[发明专利]](https://img.taocdn.com/s3/m/46c967d55727a5e9846a616a.png)
专利名称：抗MFAP3L单克隆抗体及其在肿瘤检测中的应用专利类型：发明专利
发明人：康滨,张军,邢蕊,徐宁志,吕有勇,吴琳,刘国振,刘斯奇申请号：CN200910077768.8
申请日：20090217
公开号：CN101805405A
公开日：
20100818
专利内容由知识产权出版社提供
摘要：本发明涉及产生抗MFAP3L单克隆抗体的杂交瘤、抗MFAP3L单克隆抗体及其在肿瘤检测中的应用，具体地涉及产生与人结直肠癌组织中的以及正常组织中的天然蛋白-微丝相关蛋白3样蛋白(MFAP3L)特异性结合的单克隆抗体的杂交瘤、以及相应的抗体。
进一步地，本发明涉及含有所述单克隆抗体的免疫检测试剂。
以及所述单克隆抗体或者所述检测剂在有效检测结直肠癌中的用途，从而提供了有效检测MFAP3L的检测工具。
申请人：北京华大蛋白质研发中心有限公司
地址：101318 北京市顺义区空港工业园B-8
国籍：CN
代理机构：中国国际贸易促进委员会专利商标事务所
代理人：罗菊华
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蛋白质谱鉴定 华大
蛋白质谱鉴定华大
蛋白质谱鉴定是一种用于分析蛋白质组成和结构的技术，它在
生物医学研究和临床诊断中具有重要的应用价值。
华大基因是一家
专业的生物技术公司，提供包括蛋白质组学在内的多项生物技术服务。
在蛋白质谱鉴定方面，华大基因可以利用质谱技术对样本中的
蛋白质进行分析和鉴定，包括蛋白质的组成、结构、修饰等信息。
蛋白质谱鉴定涉及到样本的制备、质谱分析和数据解释等步骤。
华大基因可以根据客户的需求进行样本的制备工作，包括蛋白质的
提取、纯化和消化等步骤，确保样品的质量符合质谱分析的要求。
在质谱分析方面，华大基因拥有先进的质谱仪设备和经验丰富的技
术团队，可以对样品进行高灵敏度、高分辨率的质谱分析，获得准
确的蛋白质信息。
此外，华大基因的专业团队还可以对质谱数据进
行解释和分析，帮助客户理解样品中蛋白质的特性和功能。
除了技术实力，华大基因在蛋白质谱鉴定服务中还注重质量控
制和数据安全。
他们严格遵循国际标准操作流程，确保分析结果的
准确性和可靠性。
同时，他们也重视客户数据的保密，采取多种措
施保护客户的数据安全。
总的来说，华大基因在蛋白质谱鉴定方面拥有丰富的经验和先
进的技术设备，可以为客户提供高质量、可靠的蛋白质谱鉴定服务。
希望这些信息能够帮助你更全面地了解华大基因在蛋白质谱鉴定领
域的能力和优势。
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清华大学生物医学测试中心样品登记表（流式细胞仪）
送样须知：
1.所送样品必须是单细胞悬液。
上机前确保已经用300目滤网过滤，样品未处理好，不可上机。
2.根据流式细胞仪的类型及荧光素的荧光光谱选择荧光抗体，尽量选择荧光光谱重叠较少的抗体组合；根据检
测物（抗原）表达量选择荧光染料。
3.做好对照，单色荧光需要阴性对照；多色荧光检测除阴性对照外，须做单色补偿对照。
4.仪器检测范围为最小检测颗粒大小0.5μm(min)，最大检测颗粒大小50μm(max)。
5.容易对管路造成污染的样品，例如细菌、酵母、支原体等BD AriaⅡ不予进行分析和分选。
6.无菌分选管自带或中心提供，7元/管。
7.预约时，请认真填写样品登记表，并进行提交。
我已经认真阅读并同意以上送样须知。
客户签字：日期：年月日。