ImageJ 操作手册

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Image j 基本操作

Image j 基本操作

Image j 基本操作imagej菜单栏列出了ImageJ的所有命令,它包含八个菜单:File:基本的文件操作,包括打开、保存、创建新图片,大多数命令看名字就知道什么意思Edit:编辑和绘制操作,以及全局设定Image:图像显示,包括图像格式的转化、怎样显示等Process:图像处理,包括点操作、过滤器和算术运算Analyze:图像分析,统计测量、直方图绘制和其他与图像分析有关的操作Plugins:创建、编辑和管理插件,列出了用户安装的所有宏、脚本和插件。

Window:已打开的窗口的选择和管理Help:升级,文档资源和版本信息File菜单New新建可以新建的东西有很多:Image:可以指定图片的标题、类型、尺寸、初始填充。

且如果Slices大于1,则创建了一个stackHyperstack:与Image-Hyperstacks-New Hyperstack相同Text Window:创建一个编写宏的文本窗口Internal Clipboard:打开ImageJ内部剪贴板中的内容System Clipboard:打开系统剪贴板中的内容TrakEM2:Fiji中还加入了编写TrakEM2程序Script:Fiji中还加入了新建脚本。

Open打开可以打开的东西也有很多:常见图片,后缀有TIFF、GIF、JPEG、DICOM、BMP、PGM和FITS格式。

也可以通过插件打开额外的后缀的图片ImageJ和NIH的图片查询表,后缀是.lut以制表符分割的表格,后缀是.xls和.csv选区,后缀是.roi和.zip文本文件,后缀是.txt、.ijm、.js和.java其他Open Next打开下一个关闭当前图片,打开目录中的下一个图片(如果有的话)。

按住Alt打开目录中的前一个图片(如果有的话)。

Open Samples打开样例打开ImageJ服务器上的样例图片,可以用来测试宏、脚本、插件等。

Open Recent打开最近文件子菜单会显示最近15个打开的文件,可以选择其中一个。

imagej使用手册

imagej使用手册

imagej使用手册
ImageJ是一款功能强大的图像处理和分析软件,使用手册如下:
1. 安装与运行:ImageJ可以在线或下载后运行,只要安装了Java 或更高
版本虚拟机的计算机即可。

支持Windows、Mac OS X以及Linux系统。

2. 显示、编辑、分析、处理、保存和打印图像:ImageJ可以显示、编辑、
分析、处理、保存和打印8位、16位和32位图像。

可读取的图片格式包括TIFF、GIF、JPEG、BMP、DICOM、FITS以及“原始图件”。

支持“堆栈”(以及多维的堆栈),一系列的图片共用一个窗口。

3. 图像处理和测量计算:可以计算用户自定义选择的面积和像素值统计,可以测量距离和角度,可以创建密度直方图和线图。

所有功能在任意倍数下均可使用。

此外,ImageJ是多线程的程序,因此,像图片读取这种较耗时的操作可与
其他操作同时进行。

希望以上信息对您有帮助。

imagej的使用方法

imagej的使用方法

imagej的使用方法
ImageJ是一款功能强大的图像处理软件,可以帮助用户轻松地进行图像的测量、分析、编辑等操作。

本文将指导用户如何使用ImageJ来处理图像。

首先,用户需要下载ImageJ软件,然后将图像导入ImageJ中。

用户可以选择从本地文件夹中导入图像,也可以从网络中导入图像,比如URL、FTP等。

接下来,用户可以通过ImageJ的图像处理功能对图像进行处理。

用户可以根据自己的需要调整图像的亮度、对比度、饱和度等参数。

此外,ImageJ还支持用户对图像进行滤镜处理、裁剪、旋转和缩放等操作。

同时,ImageJ还支持用户对图像进行测量和分析。

用户可以通过ImageJ的测量工具来测量图像中的面积、长度和角度等信息。

此外,ImageJ还拥有强大的图像分析功能,可以帮助用户分析图像中的细节信息,提取出图像中的特征和目标。

最后,用户可以通过ImageJ对图像进行编辑。

ImageJ提供了大量的编辑工具,可以帮助用户轻松添加文字、图标、标签等内容,以增加图像的可读性。

总之,ImageJ是一款强大的图像处理软件,可以帮助用户轻松地
进行图像的测量、分析、编辑等操作。

通过本文的指导,用户可以轻松地使用ImageJ来处理图像。

ImageJ官方简体中文快速入门指南

ImageJ官方简体中文快速入门指南

ImageJ官方简体中文快速入门指南ImageJ 入门by tree_cmu 2011-10-201 Image J 是什么?ImageJ是一个基于java的公共的图像处理软件,它是由National Institutes of Health开发的。

可运行于Microsoft Windows,Mac OS,Mac OS X,Linux,和Sharp Zaurus PDA等多种平台。

其基于java的特点,使得它编写的程序能以applet等方式分发。

ImageJ能够显示,编辑,分析,处理,保存,打印8位,16位,32位的图片,支持TIFF, PNG, GIF, JPEG, BMP, DICOM, FITS等多种格式。

ImageJ支持图像栈(stack)功能,即在一个窗口里以多线程的形式层叠多个图像,并行处理。

只要内存允许,ImageJ能打开任意多的图像进行处理。

除了基本的图像操作,比如缩放,旋转,扭曲,平滑处理外,ImageJ还能进行图片的区域和像素统计,间距,角度计算,能创建柱状图和剖面图,进行傅里叶变换。

[1]2 ImageJ可以做什么?概括一下,主要分为以下几个方面:A)图像的区域和像素统计(大小)。

长度,角度。

阳性点密度和数量B)光密度或辉度,并制备密度直方图和线性图。

C)两种蛋白共定位的程度(丁香园有篇专门介绍帖子/bbs/thread/18145886?keywords=imag e%20J#18145886)D)卷积,Sholl分析,傅里叶分析(这些还不会使用)E)更多功能3 Image 界面[2]界面分为:菜单栏,工具栏和状态栏。

菜单栏菜单栏从左至右分别是:文件,编辑,图形,处理,分析,插件,窗口,帮助。

文件和office word 等软件类似,主要有文件打开,关闭,保存等功能,比较特殊的一个功能是恢复功能(revert),可以直接回到上次保存过的状态。

由于编辑菜单里的取消功能(undo)只能回退一步,所以revert有时会很有帮助。

ImageJ基础操作:给图片添加文字和标注

ImageJ基础操作:给图片添加文字和标注

ImageJ基础操作:给图片添加文字和标注对图片添加标注和文字是科研图片处理中一个非常基础的操作,Image J也可以进行这方面的处理。

01利用描边和填充添加在绘制好选区(几乎只会用到箭头工具)之后选择:Edit-Draw (描边,快捷键Ctrl+D),使用事先设定好的颜色和粗细进行绘制;也可以填充设定好的颜色Edit-Fill(填充,快捷键Ctrl+F)。

文字工具也是如此,在输入文字之后,选择Edit-Draw,可以盖印到原来图片上。

如果要修改颜色、字体、粗细等绘图属性,可以选择Edit-Option-Colors/Fonts/Line Width…进行修改。

当然,其中一些选区工具如Arrow T ools(箭头工具)可以直接双击该工具修改其绘图属性。

颜色的修改还可以双击工具栏中的Color Picker(拾色器)来修改:当然,Fiji也提供简单的绘图工具,包括Pencil Tool(铅笔工具)、Paintbrush T ool(画笔工具)、Flood Fill Tool(填充工具)和Overlay Brush T ool(浮层画笔工具),可以直接或者以Overlay的形式在图片上面进行涂鸦,但是科研图片处理中基本用不到。

每个工具都可以双击进行属性修改。

02 利用ROI Manager添加也可以将标注(文字和箭头等)以选区的形式保存到选区管理器(ROI Manager)里面,勾选Show All,然后利用拼合图层(Flatten)来盖印生成新的图片。

注意:会新生成一个添加了标注的图片。

03 利用Overlay图层添加在利用选区工具和文字工具做好标注之后,还可以使用Image-Overlay-Add Selection(快捷键是Ctrl+B),来建立Overlay图层,最后直接导出成非tif格式图片,获得标注后的图片。

或者建立Overlay图层之后,利用ROI Manager的拼合图层(Flatten)在本图层盖印,再导出成各种位图格式。

imagej使用方法2篇

imagej使用方法2篇

imagej使用方法2篇ImageJ是一款功能强大的图像处理软件,它提供了丰富的图像处理和分析工具,被广泛应用于各个领域,如生物学、医学、材料科学等。

本篇文章将介绍ImageJ的基本使用方法,帮助读者快速上手。

第一篇:ImageJ使用方法(上)一、ImageJ的安装与启动在使用ImageJ之前,首先需要下载并安装该软件。

ImageJ的官方网站提供了Windows、Mac和Linux系统的安装包,用户可以根据自己的操作系统选择相应的版本进行下载。

安装完成后,双击打开软件图标即可启动ImageJ。

在启动过程中,系统可能会提示安装Java环境,请按照提示进行操作。

二、图像的导入与显示ImageJ支持多种图像格式,包括常见的BMP、JPG、PNG等格式,用户可以通过以下几种方式将图像导入ImageJ中:1. 点击菜单栏中的“File”,选择“Open”选项,然后在弹出的文件选择窗口中找到并选择要导入的图像文件。

2. 直接将图像文件拖拽到ImageJ的界面上。

3. 使用快捷键Ctrl+O(Windows系统)或Command+O(Mac系统)打开图像文件。

导入图像后,ImageJ会自动显示图像的缩略图,并在软件窗口的上方显示图像的完整路径和名称。

三、图像处理与分析1. 亮度、对比度调整:点击菜单栏中的“Image”,选择“Adjust”子菜单,然后可以对图像的亮度和对比度进行调整。

2. 图像缩放:点击菜单栏中的“Image”,选择“Scale”选项,在弹出的对话框中输入缩放比例,即可对图像进行放大或缩小。

3. 噪声去除:点击菜单栏中的“Process”,选择“Noise”,然后选择“Despeckle”选项,可以去除图像中的噪声。

4. 图像滤波:点击菜单栏中的“Process”,选择“Filters”选项,然后可以选择不同的滤波算法对图像进行滤波处理。

5. 边缘检测:点击菜单栏中的“Process”,选择“Find Edges”选项,可以对图像进行边缘检测。

image_j中文使用方法

image_j中文使用方法

ImageJ这套软件可以自动帮你你计算细胞数,也可以定量分析DNA电泳或是Western blot条带。

step 1.首先打开软件后,开启图档ImageJ这套软件可以自动帮你你计算细胞数,也可以定量分析DNA电泳或是Western blot条带。

step 1.首先打开软件后,开启图档step 2.请先做校正,选择Analyze底下的Calibrate选项,再选择校正的模式,使用Uncalibrate OD,再按ok按下ok之后会出现校正的图形Step 3.在要分析的第一条(first lane)加上一个长型框(工具列第一个选项),再按下Analyze/Gels/select first Lane快速键(Ctr+1),此时框架中会出现一个号码1,之后可以移动框架到第二个lane再选择Analyze/Gels/select second Lane快速键(Ctr+2),当然可以一直加下去,最后按Analyze/Gels/plot Lanes快速键(Ctr +3)。

Step 4.分析以后会出现图型表示你刚选择的框内的影像强度,此时可以看到有几个比较高的区段,就是我们想定量的band,使用直线工具(工具列第五个选项)先将图形中高点为有band的区域和没有band的区域分开再,使用魔术棒工具(工具列第八个选项)点选要分析的区域。

Step 5.当我们点选分析时,在result的对话视窗会出现分析的数据,依序点选就会出现每个band的值。

注:当我们选择分析的条带也可以是横向选取,就可以只比较相同大小的DNA 的含量,同样也可以应用在western blot或其它类似实验条带的分析上。

使用ImageJ 分析图像中的颗粒数[] 原创教程,转载请保留此行1,到本站资料下载-实用小工具栏目下载 ImageJ 并安装。

2,打开ImageJ并打开要分析的图片。

请看演示图片。

3,把图像二值话或者设定阈值。

选择Image - Adjust - Threshold...根据提示设定你需要的阈值。

使用ImageJ对照片进行标尺处理

使用ImageJ对照片进行标尺处理

使用ImageJ对照片进行标尺处理
1. 打开ImageJ软件,并导入需要处理的照片。

点击菜单栏的“文件”(File),选择“打开”(Open),然后选择要处理的照片文件。

2. 在工具栏中选择“直线选择工具”(Straight Line Selection Tool)。

这个工具用于画出标尺线。

3. 在照片上点击并拖动鼠标,绘制出一条标尺线。

确保标尺线与物体的边界对齐,以便准确测量尺寸或距离。

4. 单击菜单栏的“分析”(Analyse),选择“设置标尺”(Set Scale)。

在弹出的对话框中,输入物体实际尺寸或使用已知的标准单位进行设置。

例如,如果标尺线的长度为10厘米,则在“已知距离”(Known Distance)字段中输入10,并选择合适的单位(如“厘米”)。

5. 在同一个对话框中,选择标尺线的起点和终点,并输入其对应的实际距离。

点击“OK”按钮,完成标尺设置。

6. 可以进行进一步的测量或编辑,如测量其他物体尺寸或距离,添加文字或箭头标注等。

7. 完成标尺处理后,保存处理后的照片。

点击菜单栏的“文件”(File),选择“保存”(Save),然后选择保存文件格式和路径。

注意事项:
- 在绘制标尺线时,要确保图像缩放比例一致,以便准确测量。

- 如果是处理多个照片,可以使用批处理功能来自动处理大批
量的图片。

以上是使用ImageJ对照片进行标尺处理的简要步骤。

通过这
些步骤,您可以方便地对照片进行标尺处理,以满足不同应用场景
的需求。

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