辣椒遗传图谱的构建与QTL定位研究进展

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主要蔬菜作物基因定位与分子辅助选择育种

主要蔬菜作物基因定位与分子辅助选择育种

主要蔬菜作物基因定位与分子辅助选择育种【摘要】本文主要探讨了主要蔬菜作物基因定位与分子辅助选择育种的重要性和发展前景。

首先介绍了基因定位技术在蔬菜作物育种中的应用,以及分子辅助选择育种在蔬菜作物中的作用。

然后总结了主要蔬菜作物的重要基因定位研究进展和分子辅助选择育种的成功案例。

接着分析了该领域面临的挑战和未来发展趋势。

最后强调了主要蔬菜作物基因定位与分子辅助选择育种的重要性,并展望了未来的发展前景。

通过本文的研究和总结,可以更好地了解主要蔬菜作物基因定位与分子辅助选择育种的现状,为未来的研究提供重要参考。

【关键词】关键词:主要蔬菜作物、基因定位、分子辅助选择育种、育种、研究、挑战、发展、重要性、展望、前景、现状。

1. 引言1.1 主要蔬菜作物基因定位与分子辅助选择育种主要蔬菜作物基因定位与分子辅助选择育种是现代农业科学和技术的重要研究方向之一。

随着基因组学和生物技术的发展,利用分子标记辅助选择优质基因成为育种的一个重要手段。

在蔬菜作物领域,通过基因定位和分子辅助选择育种,可以更准确地选择优良基因,加速杂交育种过程,提高育种效率,培育出更高产、更抗病、更适应各种环境的新品种。

蔬菜作物的基因定位研究,主要通过构建遗传图谱和物理图谱,利用分子标记技术进行标记辅助选择。

而分子辅助选择育种则是通过分子标记技术对目标基因进行筛选和检测,从而加速育种过程,提高选择效率。

通过这些技术手段,可以实现对抗病性、抗逆性、品质等重要性状的精准控制和改良,为蔬菜作物的品种改良和优化提供了强大的技术支持。

主要蔬菜作物基因定位与分子辅助选择育种是推动蔬菜作物育种进步的重要途径之一,将为提高蔬菜产量、品质和抗逆性,推动蔬菜产业的发展做出重要贡献。

随着技术的不断创新和完善,相信在未来的研究中,主要蔬菜作物基因定位与分子辅助选择育种将迎来更加美好的发展前景。

2. 正文2.1 基因定位技术在蔬菜作物育种中的应用基因定位技术在蔬菜作物育种中的应用是一种利用分子标记和遗传连锁图谱来确定特定性状相关基因位置的方法。

辣椒抗疫病基因初步定位

辣椒抗疫病基因初步定位

Journal of Northeast Agricultural University东北农业大学学报第52卷第3期52(3):20~252021年3月March 2021辣椒抗疫病基因初步定位张曦,王秀雪,邹春蕾*(辽宁省农业科学院蔬菜研究所,沈阳110161)摘要:辣椒疫病是威胁辣椒生产主要病害,改良品种抗性是解决这一问题最有效途径。

选用对辣椒疫霉菌3号生理小种免疫的高代自交系ZCM334为父本抗源,构建F 1、BC 1F 1、F 2群体分析辣椒抗疫病遗传规律性。

结果表明,在感病对照全部发病时,ZCM334对辣椒疫霉菌3号生理小种抗性由一对显性主效基因控制;利用SLAF-BSA 技术对BC 1F 1抗、感极端分离群体混池测序,将辣椒抗疫病基因定位在辣椒第5号染色体5.1Mb 范围内,候选区域内共有26个候选基因,为下一步目标基因精细定位奠定基础。

关键词:辣椒;疫病;SLAF-BSA ;初步定位中图分类号:S641.3;Q781文献标志码:A文章编号:1005-9369(2021)03-0020-06张曦,王秀雪,邹春蕾.辣椒抗疫病基因初步定位[J].东北农业大学学报,2021,52(3):20-25.DOI :10.19720/ki.issn.1005-9369.2021.03.003.Zhang Xi,Wang Xiuxue,Zou Chunlei.Preliminary mapping of phytophthora blight resistance genes in pepper[J].Journal of Northeast Agricultural University,2021,52(3):20-25.(in Chinese with English abstract)DOI :10.19720/ki.issn.1005-9369.2021.03.003.Preliminary mapping of phytophthora blight resistance genes inpepper/ZHANG Xi,WANG Xiuxue,ZOU Chunlei(Vegetable Research Institute,LiaoningAcademy of Agricultural Sciences,Shenyang 110161,China)Abstract:Phytophthora blight is the main disease threatening the production of pepper.Improving the resistance of varieties is the most effective method to solve this problem.The high generation inbred line ZCM334,which was immune to Phytophthora capsici No.3physiological species,was used as the paternal parent resistance source.The F 1,BC 1F 1and F 2populations were constructed to analyze the genetic characteristics of pepper resistance to phytophthora blight.The results showed that the resistance of ZCM334to phytophthora blight was controlled by a pair of dominant gene,when all the susceptible controls diseased.SLAF-BSA technique was used to sequencing the resistant and susceptible populations of BC 1F 1.The phytophthora resistance gene was located in the range of 5.1Mb on chromosome 5of pepper.There were 26candidate genes in the candidate region,and it laid the foundation for the further fine mapping of target genesKey words:pepper;phytophthora blight;SLAF-BSA;preliminary mapping 基金项目:辽宁省青年科技创新人才培养专项资金项目(311024);辽宁省自然科学基金计划重点项目(20170540506);辽宁省农业重大专项(2019JHI/10200003)作者简介:张曦(1984-),女,助理研究员,博士,研究方向为辣椒抗病育种。

数量遗传(QTL)定位的原理及研究进展

数量遗传(QTL)定位的原理及研究进展
3、市场分析方法
、营销人员必备知识
3、数量性状的遗传特征
1、市场营销基本概念 孟德尔性状遗传特征 2 、电信市场介绍 受单基因或寡基因控制 3、市场分析方法
不存在基因间的互作 基因表现不受环境影响而变异
复杂数量性状的遗传特征 1、市场营销基本概念
多基因的效应不是累加的,存在基因 2、电信市场介绍 间的上位性; 3、市场分析方法 基因的表现因环境而异,存在基因型 与环境的互作; 存在基因的多效性和异质性; 较低的外显率; 随机机误影响较大,统计功率较低。
二、营销人员必备知识
1、市场营销基本概念 染色体水平(细胞遗传学) 2 二、营销人员必备知识 1、电信市场介绍 、市场营销基本概念 RNA 水平(分子遗传学) 3 2、市场分析方法 、电信市场介绍 1 、市场营销基本概念 DNA 水平(分子数量遗传学—主要研究数量性状)。
二、营销人员必备知识
2、数量性状 3、市场分析方法
营销人员必备知识
四、QTL定位的原理及方法
1 、 QTL 定位的原理 营销人员必备知识
QTL 定位是通过分析整个染色体组的DNA标记和数量性状表 1、市场营销基本概念 型值的关系,将 2、电信市场介绍 QTL逐一定位到连锁群的相应位臵,并估计 营销人员必备知识 其遗传效应 ; 3、市场分析方法 QTL 定位就是采用类似单基因定位的方法将QTL定位在遗传 1、市场营销基本概念 图谱上,确定 QTL与遗传标记间的距离(以重组率表示); 2、电信市场介绍 QTL 定位实质是分析分子标记与QTL之间的连锁关系,是基 3 1、市场分析方法 、市场营销基本概念 于一个特定模型的遗传假设,是统计学上的一个概念,与数 2、电信市场介绍 量性状基因有本质区别。 3、市场分析方法
(3) 性状-标记回归(trait-marker regression,TMR)

花生分子遗传图谱构建与QTL定位研究进展_朱亚娟

花生分子遗传图谱构建与QTL定位研究进展_朱亚娟

收稿日期:2014-02-21基金项目:国家农业科技成果转化资金项目(2013GB2D000303)作者简介:朱亚娟(1982-),女,河南长葛人,助理研究员,硕士,主要从事花生栽培及新品种选育研究。

E-mail:zhuyajuan6418@126.com*通讯作者:王晓林(1967-),男,河南上蔡人,副研究员,本科,主要从事花生栽培及新品种选育研究。

E-mail:wxl2962603@163.com花生分子遗传图谱构建与QTL定位研究进展朱亚娟1,张伯阳2,崔建民1,王晓林1*(1.驻马店市农业科学院油料作物研究所,河南驻马店463000;2.河南农业大学生命科学学院,河南郑州450002)摘要:近年来,随着分子标记技术及统计分析方法的迅速发展,许多作物已构建了较为饱和的分子遗传连锁图谱,利用这些图谱已定位了很多重要性状的QTL。

综述了近年来花生分子遗传图谱构建以及重要性状的QTL定位研究进展,包括花生野生种、栽培种、栽培-野生种间分子遗传图谱的构建,以及抗病性、产量、品质、形态和生理等性状的QTL定位,并对今后的发展方向进行了展望。

关键词:花生;遗传连锁图谱;QTL定位;分子标记中图分类号:S565.2 文献标志码:A 文章编号:1004-3268(2014)09-0001-05Research Advances in Molecular Genetic MapConstruction and QTL Mapping in PeanutZHU Ya-juan1,ZHANG Bo-yang2,CUI Jian-min1,WANG Xiao-lin1*(1.Oil Crops Research Institute,Zhumadian Academy of Agricultural Sciences,Zhumadian 463000,China;2.College of Life Sciences,Henan Agricultural University,Zhengzhou 450002,China)Abstract:In recent years,with the rapid development of molecular marker technology andstatistical analysis methods,saturated molecular genetic maps have been constructed for manycrops,and a lot of QTLs for many important traits have been located.Recent progress on geneticmap construction and QTL mapping for important traits in peanut was reviewed,including theintra-specific and inter-specific linkage map construction for wild and cultivated peanut species andQTL mapping for disease resistance,yield,morphological and physiological traits.The perspectivefor further research was also proposed in this review.Key words:peanut;genetic linkage map;QTL mapping;molecular marker 20世纪80年代以来,随着分子生物学技术的迅速发展,诞生了各类DNA分子标记技术,主要包括RFLP、RAPD、SSR、ISSR、AFLP、STS、SRAP、TRAP、SNP、RGA等。

作物QTL分析的原理与方法

作物QTL分析的原理与方法

作物QTL定位方法与技术作物QTL定位的方法主要有传统连锁分析、基因芯片 技术和深度学习等。连锁分析通过群体遗传学手段,鉴定两个或多个基因位点 间的连锁关系,进而确定控制性状的QTL。基因芯片技术利用基因组wide的标 记分布,对大量基因位点进行同时检测,高效地定位QTL。深度学习则利用神 经网络等算法,自动化学习和识别数据中的特征,实现对QTL的精准定位。
四、自然群体
自然群体是指在没有人为干预下自然形成的群体,如野生种、地方品种、自然 变异群体等。这些群体通常具有丰富的遗传变异和复杂的遗传结构,对于研究 作物的适应性、抗逆性和产量等性状的遗传基础非常有用。此外,自然群体还 可以用于发现和克隆稀有或特殊的QTL。
五、基于基因组的作图群体
随着基因组学技术的发展,基于基因组的作图群体越来越受到重视。这种群体 可以通过重测序技术获得大量的SNP(单核苷酸多态性)标记,并利用这些标 记构建高密度的遗传图谱。这种图谱可以用于精细定位和克隆QTL,以及研究 基因组中的结构变异和非编码区基因组。
2、QTL分析的具体步骤
(1)数据采集:收集作物的基因型和表型数据。基因型数据可以通过高通量 测序技术获得,而表型数据则可以通过田间试验和室内分析等方法获得。
(2)作图:利用作图软件将基因型和表型数据组装成图,以展示它们之间的 关系。常用的作图软件包括QTL Cartographer、QTL IciMapping等。
原理
1、QTL的概念及定义
QTL是指作物基因组中控制数量性状的基因座位,它们可以通过影响表型变异 来影响作物的农艺性状。QTL通常分为两类:主效QTL和微效QTL。主效QTL是 指对表型变异起主要作用的QTL,而微效QTL则是指对表型变异起较小作用的 QTL。

辣椒英文文献已读

辣椒英文文献已读

2001年,C. Djian-Caporalino · L.Pijarowski · A. Fazari M. Samson · L.Gaveau · C.O’Byrne · V. Lefebvre C. Caranta · A. Palloix · P. Abad发表文章High-resolution genetic mapping of the pepper (Capsicum annuumL.)resistance loci Me3 and Me4 conferring heat-stable resistance to root-knot nematodes (Meloidogyne spp.)采用从C. annuum F1代得到的双单倍体(DH)群体构建了两张种内图谱,主要采用AFLP 和RAPD标记。

图谱长度1,582 cM ,共227 标记,18个连锁群,覆盖了67%的辣椒基因。

本研究采用的材料是C. annuum parents ‘Yolo Wonder’(‘YW’) and‘PM687’。

抗性品系PM687来源于印度,从PI322719群体中获得,YW是一个感病品种,Me3和Me4都是抗根结线虫基因。

PM687和YW杂交F1代有103个单双倍体(DH),163株F2代个体,‘Perennial’, another inbred line of C. annuum (see Table 1)used to generate the DH200 pepper map,另外一个亲本。

采用RAPD和AFLP标记,分析产生了与Me3连锁的8个相斥性标记和4个相引性标记。

在基因两边最近的距离是0.5,1.0,1.5和3cm,Me4与Me3相距100cm,Me3最近的基因名为Q04-0.3,距RAPD标记10.1cm,名为CT135d的距RFLP标记2.7cm.。

数量性状基因座(QTL)精细定位的研究进展

数量性状基因座(QTL)精细定位的研究进展

数量性状基因座(QTL)精细定位的研究进展来源:卢超的日志本文转自博士论坛,希望与大家分享!生物界的许多性状是以数量性状为基础的,该类性状的发生不是决定于一对等位基因,而是受到两对或更多对等位基因的控制,每对等位基因彼此之间没有显性与隐性的区别,而是共显性。

这些等位基因对该遗传性状形成的作用微小,所以也称为微效基因(minor gen e),它们在染色体上的位置称为数量性状基因座(quantitative trait loci, QTL)。

数量性状就是由许多对微效基因的联合效应造成的一类具有正态分布特性的性状,具有这种性状的个体在正态分布中的位置决定于它们所具有的微效基因的多少。

数量性状之所以复杂,是因为这种性状与基因型之间没有一一对应的关系,并且环境因素对它有显着的影响[1]。

1961年,Thoday首次利用一对侧翼标记定位一个QTL[2],随后QTL的研究得到飞速发展。

现已证明,只要是控制连续分布性状的数量性状基因座,就能在实验群体或远交群体中定位[3] 。

在整个QTL的研究中,可分为发现QTL,QTL的定位估计和精细定位[4]。

Glazier认为可分成四个步骤:连锁和关联分析,精细定位,序列分析和候选基因的功能检测[5]。

在模式生物小鼠的QTL研究,已描述的实验步骤更为详细[6]:第一,把QTL定位到染色体的区段上。

典型的QTL定位方法须对几百个杂交后代进行恰当的表型检测;利用覆盖整个基因组的75-100个遗传标记进行基因组扫描,遗传标记的平均跨度为15-20个厘摩(cM);准确基因分型,然后对性状和遗传标记之间进行连锁和关联分析;计算QTL与某标记位点靠近的可能性大小。

这种方法即使经过成百上千次的表型和基因型的分析,定位的QTL在染色体上还是一个较大的区间。

第二,把一个QTL的作用与其它QTL的作用分开。

通常在同源系(congenic strain)中进行,这样就把多基因遗传的性状转化成单基因性状进行研究。

数量性状基因座(QTL)定位的研究进展

数量性状基因座(QTL)定位的研究进展

1 分 子 遗 传 标 记
以 D A多 态 性 为 基 础 的一 个 理 想 分子 遗 传 标 记 (eei m re) 有 :1高 度 多 态 ;2 丰 富性 ;3 中 N gnt akr具 c () () ()
性 ;4 共显性 或显隐性 。衡 量一个 分子遗传标 记的多态性程度大小系一般用两个 指标 来表示 。一个是 () 杂合 率 , H=1 一

。其 中 , 表 示等位基 因数 目, n P 表示第 i 个等位基 因频率 , 般有 ≤1 / ; 一 —1n 另
n 一

个 是 多 态 信 息 含 量 ( , ) P C=2∑ ∑ pp( 一PP)一 般 总有 PC<H。 Pc ,I 1 i , j I

个 基 因是 否 多 态 的衡 量 指 标 为 ma( I <0 9 , I x P C) .5 P C>0 1 .。

Bsd 的平 均 值 差 异 法 ( 称 MB法 ) ( ) ae) 简 ;2 以性 状 为 基 础 (ri—B sdme o ) 方 法 ( 称 T Ta t ae t d 的 h 简 B法 ) 。许
多 学 者 根据 不 同 群 体 的遗 传 特 性 , 别 提 出 了 相 应 的 标 记 座 位 与 Q L相 互 关 联 的 检 测 方 法 , 涉 及 到 的 分 T 所 群 体 包 括 : 交 系 间 分 离 群 体 , 交 系 间 分 离 群 体 , 倍 单 倍 体 ( H) 体 , 个 近 交 系 间 的 重 组 近 交 系 近 异 加 D 群 两 ( 几)一 粒 传 群 体 (S , 倍 体 群 体 等 j R , SD)单 。
合 区间作 图( I 、 ae 方法 、 CM) Bys 多区间作 图( I ) 多 Q L 图 、 MM 、 T 作 多性状作 图( M) m 等等 。 Q L 位及其效应估计 的试验设计方 法是单个基 因定位方法 的推广 , T定 它依赖 于一 个标 记基 因座 的等 位基 因与其 连锁 的 Q L 因座 的等位基 因间的连锁 分析 。因此进行 Q L定位 首先要 有一 个 足 以覆 盖整 T基 T
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h t t p : / / x u e b a o . j x a u . e d u . c a
E —ma i 1 : n d x b 7 7 7 5@ s i Ag r i c u h u r a e Un i v e r s i t a t i s J i a n g x i e n s i s
f e r t i l i t y r e s t o r e r i n p e p pe r . Th e p a pe r a l s o d i s c us s e s t h e pr o bl e ms a b o u t t h e r e l a t e d s t u d i e s a n d t he a i m i s t o p r o v i d e t h e t h e o r y r e f e r e n c e f o r mo l e c u l a r ma r k e r—a s s i s t e d s e l e c t i o n o f p e p pe r .
i n t e g r a t e d m a p s , a n d t h e Q T L s ma p p i n g o f m a i n a g r o n o mi c t r a i t s s u c h a s d i s e a s e a n d i n s e c t r e s i s t a n c e t r a i t s ,
并 具独 特 的辣 味 、 香 味 和色泽 , 既 是一种 重要 的蔬 菜作 物 , 也是 重要 的调 味品 , 具 有重 要 的经济 价值 和食
疗保 健作 用 。辣椒 遗传 学和 生物技 术研 究一 直是 国内外研 究 热 点之 一 , 特 别是 随着 分 子生 物 技术 的快 速发 展 , 辣 椒遗 传 图谱构建 和 Q T L ( q u a n t i t a t i v e t r a i t l o c u s , Q T L ) 定 位研究 取 得重 大 进展 。本文 对 近 十年
关键词 : 辣椒 ; 遗传图谱 ; Q T L定 位
中图分类号 : ¥ 6 4 1 . 3
文献标志码 : A
文章编号 : 1 0 0 0—2 2 8 6 ( 2 0 1 3 ) 0 2— 0 3 0 1 — 0 6
R e s e a r c h Ad v a n c e s i n Ge n e t i c Ma p p i n g a n d QT L i n P e p p e r
Z O N G Ho n g . x i a , Z HO U K u n — h u a , F AN G R o n g , C H E N X u e - j u n
( 1 . V e g e t a b l e a n d F l o w e r I n s t i t u t e , J i a n g x i A c a d e my o f A g r i c u l t u r a l S c i e n c e s , N a n c h a n g 3 3 0 2 0 0, C h i n a ; 2 . C o l l e g e o f A g r o n o m y , J X A U, N a n c h a n g 3 3 0 0 4 5 , C h i n a ) Ab s t r a c t : T h i s p a p e r s u mm a r i z e s t h e r e s e a r c h e s c o n c e r n e d w i t h g e n e t i c ma p p i n g a n d Q T L s a n a l y s i s o n
对近十年来构建的辣椒遗传图谱和相关性状的qtl定位研究进展进行了总结分析包括辣椒种内遗传图谱种间遗传图谱和整合图谱的构建以及抗病虫性状和细胞雄性不育恢复性等主要农艺性状的qtls定位并对相关研究中存在的问题进行了讨论以期为辣椒分子标记辅助选择育种提供理论参考
江 西农业 大学 学报
2 0 1 3 , 3 5 ( 2 ) : 3 0 1— 3 0 6
r e l a t e d t r a i t s i n p e pp e r i n t he r e c e n t d e c a d e, i n c l u di ng c o ns t r u c t i o n o f i n t r a s p e c i ic f ma ps , i n t e r s p e c i ie f ma ps ,
辣 椒 遗 传 图谱 的构 建 与 QT L 定 位 研 究 进 展
宗 洪 霞 , 周 坤 华 , 方 荣 ,陈 学 军
( 1 . 江西省农业科学院 蔬菜 花卉研究所 , 江西 南 昌 3 3 0 2 0 0 ; 2 . 江西农业 大学 农学院 ,江西 南 昌 3 3 0 0 4 5 ) 摘要 : 对近十年来 构建 的辣 椒遗传图谱和相关 性状 的 Q T L定位 研究进 展进行 了总结 分析 , 包括辣椒 种 内遗 传 图谱 、 种 间遗传图谱 和整合 图谱 的构建 , 以及抗病 虫性 状和 细胞雄 性不 育恢 复性等 主要农 艺性状 的 Q T L s定 位, 并对相关研究 中存在 的问题进行 了讨论 , 以期为辣椒分子标记辅助选择育种提供理论参考 。
Ke y wo r d s : p e p p e r ; g e n e t i c m a p p i n g ; Q T L
辣椒( C a p i c u m s p p . ) 为茄科 辣椒 ( 2 n= 2 4 ) 属一 年生 或多 年生 草本植 物 , 其 果实 维生 素 C含 量 丰富 ,
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