(精编资料推荐)RNA提取中各种试剂的作用

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提取DNA、RNA过程中各成分的作用

提取DNA、RNA过程中各成分的作用

CTAB呈白色或浅黄色结晶体至粉末状,有刺激气味,易溶于异丙醇,可溶于水,震荡时产生大量泡沫,能与阴离子、非离子、两性表面活性剂有良好的配位性。

具有优良的渗透、柔化、乳化、抗静电、生物降解性及杀菌等性能。

中文名十六烷基三甲基溴化铵英文名Hexadecyl trimethyl ammonium Bromide别称西曲溴铵,CTAB,CTMAB化学式C16H33(CH3)3NBr分子量364.36CAS登录号57-09-0EINECS登录号200-311-3熔点250-237℃水溶性13 g/L (20°C)外观白色或浅黄色结晶体应用本品为天然、合成橡胶、硅油和沥青乳化剂,表面活性剂。

十六烷基三甲基溴化铵别称:西曲溴铵、溴棕三甲基铵、溴烷铵,鲸蜡基三甲基溴化铵;CTAB;CTMAB;HTAB;CTABr;阳性皂英文名 Hexadecyl trimethyl ammonium Bromide;Cetrimonium Bromide 分类季铵盐CAS号 57-09-0分子式 C16H33(CH3)3NBr 或C19H42NBr分子量 364.446熔点:250-237℃溶解性:13 g/L (20°C)密度:1.3220 g/ml2物理化学性质编辑本品呈白色或浅黄色结晶体至粉末状,有刺激气味,易溶于异丙醇,可溶于水,震荡时产生大量泡沫,能与阴离子、非离子、两性表面活性剂有良好的配位性。

具有优良的渗透、柔化、乳化、抗静电、生物降解性及杀菌等性能。

本品化学稳定性好,耐热、耐光、耐压、耐强酸强碱。

用途:本品为天然、合成橡胶、硅油和沥青乳化剂;合成纤维、天然纤维和玻璃纤维的抗静电剂、柔软剂;护发素的调理剂;相转移催化剂;乳液起泡剂、表面活性剂,分析试剂,涤纶真丝化剂,皮革加脂剂,它还用于助焊剂、焊锡膏生产里起表面活性剂作用,活性强,对亮点、虚焊、焊电饱满都有一定作用。

HLB值15.8,属于阳离子表面活性剂[1],溶于热水、乙醇、三氯甲烷,易溶于异丙醇水溶液,微溶于丙酮,不溶于醚。

rna提取试剂盒原理

rna提取试剂盒原理

rna提取试剂盒原理RNA提取试剂盒是用于从细胞或组织样品中提取RNA的一种化学试剂盒。

RNA提取是分子生物学和基因表达研究的重要步骤之一,能够有效地分离RNA并去除DNA、蛋白质和其他杂质。

本文将详细介绍RNA提取试剂盒的原理。

一、RNA提取试剂盒的组成RNA提取试剂盒主要由以下几个部分组成:1. 细胞裂解缓冲液:用于破坏细胞膜和核膜,释放出细胞内的RNA。

2. 溶解液:用于溶解破坏后的细胞和组织样品中的核酸。

3. 酚/氯仿:用于分离RNA。

4. 筛选柱:用于去除DNA、蛋白质和其他杂质。

5. 洗涤缓冲液:用于洗涤筛选柱,去除残留杂质。

6. 去离子水:用于洗涤筛选柱后洗脱纯化后的RNA。

二、RNA提取试剂盒的原理1. 细胞裂解首先,需要将样品中的细胞或组织裂解,释放出RNA。

细胞裂解缓冲液中包含有破坏剂,如SDS和EDTA等,能够破坏细胞膜和核膜,并释放出细胞内的RNA。

2. 核酸溶解经过细胞裂解后,需要将样品中的核酸溶解。

溶解液中含有高浓度的盐和pH调节剂,能够使DNA和RNA分子变性并溶于水相中。

3. RNA分离接下来,需要将RNA与DNA、蛋白质和其他杂质分离。

酚/氯仿是一种常用的分离试剂,可以将RNA从DNA、蛋白质和其他杂质中分离出来。

酚/氯仿具有不同的密度,在试管中形成两个不同层次的相,上层为水相(含有RNA),下层为有机相(含有DNA、蛋白质和其他杂质)。

这样就可以通过移液器或吸管将上层水相取出。

4. RNA纯化虽然通过酚/氯仿可以将RNA分离出来,但仍然存在一些杂质。

因此需要进行纯化步骤。

筛选柱中含有硅胶或磁性珠等材料,能够吸附RNA并去除DNA、蛋白质和其他杂质。

经过洗涤缓冲液的洗涤后,去离子水可以将纯化后的RNA从筛选柱中洗脱。

三、RNA提取试剂盒的应用RNA提取试剂盒广泛应用于基因表达研究、分子生物学和遗传学等领域。

例如,可以用于分离不同组织或细胞类型中的RNA,并进行基因表达谱分析;也可以用于研究基因转录调控机制等。

核酸提取常见试剂地作用原理

核酸提取常见试剂地作用原理

核酸提取常见试剂地作用原理核酸提取是分子生物学研究中的基础步骤之一,常用于从细胞或组织中提取和纯化核酸。

核酸提取试剂包括细胞裂解缓冲液、蛋白酶、盐溶液、有机溶剂等。

核酸提取试剂的作用原理主要涉及以下几个方面:1.细胞裂解缓冲液:细胞裂解缓冲液是为了打破细胞膜和核膜,使细胞内的核酸暴露出来。

细胞裂解缓冲液一般含有一些离子和试剂,如EDTA、SDS等。

EDTA可以螯合离子,使核酸不被酶降解。

SDS则可以破坏细胞膜和核膜的完整性,使核酸释放出来。

2. 蛋白酶:蛋白酶的作用是降解核酸分子上的蛋白质,使核酸与蛋白质分离。

在核酸提取的过程中,蛋白酶可以去除核酸表面的蛋白质,从而提高核酸的纯度。

常用的蛋白酶有蛋白酶K和蛋白酶ase。

3.盐溶液:盐溶液的作用是使DNA在溶液中凝集并沉淀。

盐的高浓度可以中和DNA的负电荷,使DNA之间的静电斥力减弱,从而导致DNA分子的凝集和沉淀。

4.有机溶剂:有机溶剂在核酸提取中起到萃取作用,使DNA从细胞裂解液中分离出来。

有机溶剂常用的有酚类、氯仿和异丙醇。

酚类溶剂可以破坏细胞和核膜的完整性,同时与DNA形成无水醇相互作用,促使DNA分离出来。

氯仿可以和DNA结合,并与水进行分配,从而加速DNA的沉淀。

异丙醇则可改变溶液的表面张力,使DNA分子凝胶化和沉淀。

5.离心:离心是核酸提取中的一个重要步骤。

通过离心,可以将细胞碎片、蛋白质、碎屑等杂质与纯净的核酸分离开来。

离心的原理是通过旋转离心机,利用离心力将混合液中的成分分离开来,使沉淀物和上清液分离。

总的来说,核酸提取试剂是通过改变细胞的环境和物理化学性质来实现核酸的分离纯化。

通过使用细胞裂解缓冲液打破细胞膜和核膜,加入蛋白酶降解蛋白质,使用盐溶液凝集和沉淀DNA,加入有机溶剂进行DNA的萃取,最后通过离心分离杂质和DNA。

这些步骤综合起来,能够从复杂的样品中纯化出相对纯净的核酸。

rna提取试剂盒原理

rna提取试剂盒原理

rna提取试剂盒原理标题:RNA提取试剂盒原理及其在分子生物学中的应用引言:RNA(核糖核酸)是生物体内的重要分子之一,它承担着转录和翻译过程中的信息传递和表达功能。

为了研究RNA的结构、功能和调控机制,科学家们发展了各种RNA提取试剂盒,通过这些试剂盒可以将RNA从生物样本中提取出来。

本文将重点介绍RNA提取试剂盒的原理及其在分子生物学研究中的应用。

一、RNA提取试剂盒的原理1. 细胞破碎与裂解:在RNA提取过程中,首先需要对细胞进行破碎和裂解,以释放细胞内的RNA。

这一步可以通过物理方法(如超声波处理、高压破碎)或化学方法(如细胞裂解缓冲液)来实现。

2. RNA的选择性结合:细胞裂解后,需要将RNA与其他细胞成分(如DNA、蛋白质)分离。

RNA提取试剂盒通常使用硅胶或磁珠等材料,通过其表面带有的亲和基团与RNA特异性结合,实现RNA的选择性分离。

3. 杂质的去除:在RNA分离过程中,还常伴随着DNA、蛋白质等杂质的存在。

为了获得纯度较高的RNA样品,RNA提取试剂盒会添加特定的缓冲液或柱子材料,能够去除这些杂质。

4. RNA的洗脱与回收:经过前面几步处理后,RNA会被特定的洗脱缓冲液溶解,并从材料表面或柱子中释放出来,最终得到高纯度的RNA可用于后续实验分析。

二、RNA提取试剂盒在分子生物学中的应用1. 基因表达分析:RNA提取试剂盒是进行基因表达分析的重要工具。

通过提取细胞或组织中的RNA,可以进一步通过定量PCR、实时荧光定量PCR或基因芯片等方法来测量特定基因的表达水平。

2. RNA测序:随着高通量测序技术的发展,RNA提取试剂盒在RNA 测序(RNA-seq)中的应用越来越广泛。

通过提取RNA,可以对全转录组进行测序,从而揭示基因的组成、结构和表达模式。

3. miRNA研究:miRNA(微小RNA)在基因调控中发挥着重要作用。

RNA提取试剂盒可以用于提取细胞或组织中的miRNA,并进一步研究其在疾病发生机制、肿瘤诊断和治疗等方面的功能。

RNA提取中各种试剂的作用

RNA提取中各种试剂的作用

RNA提取中各种试剂的作用1. 细胞裂解缓冲液:细胞裂解缓冲液通常包含非离子性表面活性剂(如Triton X-100)、蛋白酶,以及缓冲盐等成分。

这些成分的组合可以有效破坏细胞膜和核膜,使得细胞释放RNA分子。

2.离子吸附柱:离子吸附柱是用于提取RNA的常用工具。

其表面具有对RNA具有亲合力的柱子,可以选择性地结合RNA分子,同时去除其他污染物。

离子吸附柱通常与玻璃纤维滤芯结合使用,可用于去除DNA、蛋白质和其他杂质。

3. DNAase:DNA酶主要用于去除RNA提取物中的DNA污染。

DNA酶可以特异性地降解DNA分子,从而避免在RNA分析中可能引起的干扰。

4. DNase inactivation reagent:这是一种用于阻断DNA酶活性的试剂。

添加DNase inactivation reagent可以有效地阻止DNAase继续降解RNA。

5. RNase inhibitor:RNase抑制剂是用于保护RNA分子免受RNase 降解的试剂。

RNase抑制剂可以结合并抑制RNase的活性,从而保持RNA 完整性。

6.酚-氯仿提取:酚-氯仿提取是一种用于去除蛋白质和DNA污染的方法。

在这个步骤中,RNA溶液被混合使用酚和氯仿,这样可以将蛋白质和DNA分配到有机相中,而RNA则留在水相中。

7.乙醇沉淀:乙醇沉淀是用于净化RNA的常用方法。

通过在RNA溶液中加入高浓度乙醇,可以使RNA分子与乙醇形成沉淀,从而将其他污染物分离。

8.RNA溶解缓冲液:RNA溶解缓冲液可以在最后的步骤中重悬沉淀的RNA。

这个缓冲液可以保持RNA的完整性,防止其降解。

以上只是RNA提取过程中一些常用试剂及其作用的简要介绍。

在实际操作中,可能还会使用其他试剂以满足特定的需求,例如使用Trizol试剂实现RNA、DNA和蛋白质的同时提取。

此外,不同实验目的和样本类型也可能需要不同的试剂和方法进行处理。

分子生物学实验报告试剂

分子生物学实验报告试剂

一、实验背景分子生物学是一门研究生物大分子如核酸、蛋白质等结构与功能的科学。

在分子生物学实验中,试剂的选择和使用对实验结果的准确性至关重要。

本实验报告将详细介绍分子生物学实验中常用的试剂及其作用。

二、实验试剂1. 核酸提取试剂(1)酚/氯仿:用于从细胞中提取DNA和RNA,具有强烈的蛋白变性作用。

(2)异丙醇:用于DNA的沉淀,降低DNA的溶解度。

(3)无水乙醇:用于RNA的沉淀,降低RNA的溶解度。

(4)RNA酶抑制剂:防止RNA降解,保证实验结果的准确性。

2. DNA提取试剂(1)Tris-HCl缓冲液:用于DNA的提取,调节pH值,保持酶的活性。

(2)EDTA:抑制金属离子与DNA结合,防止DNA降解。

(3)SDS(十二烷基硫酸钠):用于蛋白质的变性,使蛋白质与DNA分离。

(4)蛋白酶K:降解蛋白质,去除蛋白质杂质。

3. DNA纯化试剂(1)琼脂糖凝胶:用于DNA的分离和纯化。

(2)DNA纯化试剂盒:用于DNA的纯化和回收。

4. DNA扩增试剂(1)PCR反应缓冲液:提供反应所需的pH值、盐浓度等。

(2)dNTPs(脱氧核苷三磷酸):作为PCR反应的原料。

(3)引物:用于PCR反应的特异性扩增。

(4)Taq酶:DNA聚合酶,负责DNA的合成。

5. DNA检测试剂(1)溴化乙锭(EB):用于DNA的染色,便于在紫外光下观察。

(2)琼脂糖凝胶电泳缓冲液:用于DNA的电泳。

(3)DNA标记物:用于DNA的定量分析。

6. 蛋白质提取试剂(1)裂解缓冲液:用于蛋白质的提取,保证蛋白质的完整性。

(2)蛋白酶抑制剂:防止蛋白质降解。

(3)SDS:使蛋白质变性,便于与核酸分离。

7. 蛋白质纯化试剂(1)柱层析:用于蛋白质的纯化。

(2)凝胶过滤:用于蛋白质的纯化。

8. 蛋白质检测试剂(1)考马斯亮蓝G-250:用于蛋白质的定量分析。

(2)BCA法:用于蛋白质的定量分析。

(3)SDS-PAGE凝胶:用于蛋白质的分离和纯化。

核酸提取常见试剂的作用原理

核酸提取常见试剂的作用原理

核酸提取常见试剂的作用原理核酸提取是从细胞、组织中分离、纯化出核酸的过程。

核酸提取的常见试剂包括细胞裂解液、蛋白酶K、乙酸钠、异丙醇以及盐溶液等。

这些试剂根据其作用原理可分为裂解细胞膜、消化蛋白质、沉淀杂质、精炼核酸等几个步骤。

首先,细胞裂解液是核酸提取中最关键的试剂之一,其作用是破坏细胞膜和核酸与蛋白质间的非共价键,使其释放到裂解液中。

细胞裂解液主要由含有蛋白酶的缓冲盐溶液组成,蛋白酶的作用是分解蛋白质,使核酸得以顺利释放。

其次,蛋白酶K是一种特异性水解蛋白质的酶,主要作用是将裂解产物中的核酸外源性污染物进行消化降解,从而提高核酸的纯度。

蛋白酶K在酸性、碱性和高温条件下都具有较好的活性,因此可以在一定程度上去除核酸提取过程中可能存在的污染。

乙酸钠在核酸提取中主要用作沉淀钙离子,这是因为钙离子可以结合核酸形成不溶于水的盐类沉淀,从而使核酸纤维变得更加容易提取。

乙酸钠在碱性条件下结合钙离子,并形成不溶于水的钙酸盐沉淀,从而使得核酸能够更好地沉淀,减少杂质的存在。

异丙醇是核酸提取中的一种有机试剂,主要作用是通过改变核酸和水的亲合性来实现核酸的提纯。

异丙醇可以显著降低核酸与水之间的溶解度,使核酸从水中沉淀出来。

除了降低溶解度,异丙醇还能减少核酸与蛋白质之间的相互作用,从而防止核酸与蛋白质的复合物形成。

最后,盐溶液在核酸提取过程中主要用作洗涤核酸的试剂,其作用是去除核酸中的杂质以及一些可能残留的试剂。

盐溶液中的高离子浓度能够帮助核酸与水中的杂质分离,使核酸在洗涤过程中保持稳定。

综上所述,核酸提取常见试剂在提取过程中有着不同的作用原理,包括裂解细胞膜、消化蛋白质、沉淀杂质以及精炼核酸等几个步骤。

它们通过不同的机制来实现核酸的纯化、提纯以及去除污染物,为后续的核酸分析提供高质量的样品。

核酸提取常见试剂的作用原理

核酸提取常见试剂的作用原理

异硫氰酸胍强用力得蛋白质变性剂,能迅速溶解蛋白质,导致细胞结构破碎,核蛋白由于其二级结构得破坏消失而迅速与核酸分离。

胍盐就是破坏蛋白质三维结构得离液剂,在通常使用得蛋白质变性剂中作用最强得就是异硫氰酸胍,它们可以使多数蛋白质转换成一随机得卷曲状态。

含有强力得阴离子与阳离子基团,它们可以形成较强得氢键。

在还原剂存在得情况下,异硫氰酸胍可以断裂氢键,而去垢剂,如SDS存在得情况下,可以破坏疏水作用、盐酸胍、尿素盐酸胍就是一个核酸酶得强抑制剂,它并不就是一种足够强得变性剂,可以允许完整得RNA从富含RNase得组织中提取出来。

4-8M可断裂氢键,有两种可能机制:1变性蛋白与盐酸胍、尿素优先结合,形成变性蛋白—变性剂复合物,当复合物被除去,从而引起N-D反应平衡向右移动,随着变性剂浓度增加,天然状态得蛋白不断转变为复合物,最终导致蛋白质完全变性;2盐酸胍、尿素对氨基酸得增溶作用,能形成氢键,当浓度高时,能破坏水得氢键结构,结果盐酸胍、尿素就称为非极性残基得较好溶剂,使蛋白质内部得疏水残基伸展与溶解性加强,盐酸胍、尿素引起得变性往往就是不可逆得、高浓度尿素使蛋白质变性并抑制Rnase活性十二烷基肌氨酸钠使蛋白质解体变性巯基试剂1防止蛋白质或酶等(如辅酶A)分子中SH基团氧化成二硫键,2在某些酶反应过程中维持体系得还原环境。

DTT,DDTE、巯基乙醇应用最广,谷胱甘肽也常应用,由于她就是生物体内得还原剂,同时氧化后能被谷胱甘肽还原酶原位释放、DNA提取中,常使用巯基乙醇,维持缓冲液得还原环境,防止多酚类氧化,由于具有一定得毒性,浓度不应高于2%。

巯基乙醇β-巯基乙醇得主要作用就是破坏RNase蛋白质中得二硫键(肽与蛋白质分子中得半胱氨酸残基中得键)、1 还原蛋白质二硫键,使Rna酶变性2抑制酚类氧化,若氧化,核酸会变成灰黑色,苯酚得氧化产物苯醌等氧化物引起磷酸二酯键得断裂及导致RNA与DNA得交联3保护蛋白质得巯基蛋白质提取中需要巯基乙醇还原二硫键,使RNA酶失活化学变性剂SDS、尿素、盐酸胍能破坏疏水键、盐键、氢键、范德华力使蛋白质变性但不影响肽键与二硫键,不能使蛋白质彻底变性加上还原剂巯基乙醇或DTT,能还原二硫键,使RNA彻底变性DTT二硫苏糖醇刺激性气味要小很多,毒性也比巯基乙醇低很多。

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氯仿是分子量比较大的有机溶剂,在提取RNA时,氯仿可以有效的使有机相和无机相迅速分离。

RNA提取过程,有机相中主要是酚和蛋白结合,从而使得蛋白和RNA脱离,RNA进入水相。

氯仿的作用有多个方面,加入氯仿,虽然有变性蛋白质的作用,但是其主要用处是用来分相,实际上是加速有机相和水相的分层。

一般的trizol试剂在4度下是油状悬浮液,提高温度,放置一段时间,自然也会分相。

离心后混合物分成三层:下层苯酚-氯仿层,中间层,上层无色的水样层。

RNA无一例外地存在于水样层当中。

水样层的容量大约为400ul。

【标准:1mlTrizol加200ul的氯仿,水样层的容量大约为所加Trizol 容量的60% 】
上层水相,PH 5.1左右,当溶液pH在酸性的时候,RNA分子就会沉淀在酚与溶液的界面,只有RNA分子留在水相。

而当pH接近中性时,RNA就会溶解在水相,(导致PH中性的大概原因是trizol与样品比例不对,应该尽量保证提取量的前提下使trizol过量)
Trizol法提RNA,加氯仿就是要剧烈震荡才行,这样才能彻底地两相混匀。

异丙醇的作用是通过-OH的疏水作用使得RNA链中的亲水基团受到保护,等同于沉淀,但是这是个反应时发生在水相中,与前面的氯仿不矛盾。

通过将水样层和异丙醇混合来沉淀RNA,RNA沉淀在离心前通常不可见,形成一胶状片状沉淀附着于试管壁和管底。

异丙醇是沉淀核酸用的,作用和乙醇一样。

只不过用量少一点,0.6V~1V就够了,在水相很多,离心管容积有限,加不下太多乙醇的时候一般会用异丙醇沉淀。

不过感觉效果不如乙醇,偶尔会有沉淀不出来东西的时候。

【400ul的水相对应500ul的的异丙醇。


醇沉淀是很经常用的方法,因为RNA和某些杂质不溶于异丙醇,所以可以用来沉淀。

乙醇沉淀的主要目的是沉淀+除盐。

TRIzol主要物质是异硫氰酸胍,它可以破坏细胞使RNA释放出来的同时,保护RNA的完整性。

加入氯仿后离心,样品分成水样层和有机层。

RNA存在于水样层中。

收集上面的的水样层后,RNA 可以通过异丙醇沉淀来还原。

无论是人、动物、植物还是细菌组织,TRIzol法对少量的组织(50-100 mg)和细胞(5×106)以及大量的组织(≥1 g)和细胞(>107)均有较好的分离效果。

TRIZOL 试剂操作上的简单性允许同时处理多个的样品。

所有的操作可以在一小时内完成。

TRIZOL抽提的总RNA能够避免DNA和蛋白的污染。

故而能够作RNA 印迹分析、斑点杂交、poly(A)+ 选择、体外翻译、RNA酶保护分析和分子克隆。

提取时需要注意一些问题:提取时要做到超净台内操作、操作带一次性手套、EP管及Tip头都要用0.1%处理(0.1%DEPC浸泡过夜后,高压蒸气灭菌)、小心、细致、晃动及每次移液要轻。

这样做的唯一目的就是两个,一是小心RNAse的污染降解RNA;二是动作过度暴力破坏RNA的完整性。

另外你提的RNA做电泳的问题,一般RNA电泳应该是做甲醛变性电泳,但是一般的琼脂糖电泳也可以,需要上样量稍微大些,并且跑电泳的时间越短越
好(这样也是为了减少外界RNAse对RNA的降解),跑完电泳立刻观察,这样也可以,但是如果样品中的RNA量很低或者说不是很高的话是检测不到的。

因为这些试剂都会影响后续实验,所以用酒精洗一到两遍.一是酒精可以溶解一些沉淀中可能的有机物杂质,二是洗掉异丙醇,氯仿试剂,酒精的易挥发性在这里的到运用,
最后的乙醇主要是洗涤异丙醇,也可以溶解一部分蛋白,痕量的乙醇很容易挥发掉。

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