医学信息检索与利用》概论

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医学信息检索与利用--总结

医学信息检索与利用--总结

医学信息检索与利用总结信息素养包括信息意识、信息知识、信息能力、信息道德信息广义是指一切事物的存在方式、运动状态与相互联系特征的一种表达和陈述,在自然界、人类社会和人类思维普遍存在的一切物质和事物的属性。

信息狭义上指一切含有新内容或新知识的消息,即对接受者来说是预先不知道的报道。

零次文献是指未公开出版的实验记录、原始录音(像)、书信、手稿、口头交流的信息或实物等。

指以作者本人的研究成果为依据而撰写并公开发表或出版的信息。

是对一定范围、时间或类型的大量一次文献按其特征收集整理、压缩、加工,并按一定顺序组织编排、用于检索查找利用这些文献而编制的文献。

如书目、索引、文摘、题录、简介等。

14.三次文献三次文献是在充分利用二次文献的基础上对一次文献做出的系统整理和概括的论述,并加以分析综合编写而成的概括性文献。

主题词是以自然语言为基础,以概念组配为基本原理,并经过规范化处理,表达主题的最小概念单元,作为信息存储和检索依据的一种检索语言。

主题词,又称“叙词”,17.关键词关键词是出现在文献题名、文摘、正文中,能够表达文献主题,具有检索意义的语词。

数据库结构组成层次划分记录:记录是构成数据库的一个完整的基本信息单位.一条记录通常代表一条文献.字段:字段是组成记录的数据项目.如数据库中的篇名,著者,危险出处,文摘,机构,语种等字段.什么是信息检索语言、如何分类检索语言是根据文献信息储存与检索需要而创造的用来描述文献特征和表达检索提问的人工语言分为两类:描述文献外表特征的检索语言;描述文献内容特征的检索语言文献外表特征包括题目、作者、作者工作单位、文献发表时间、专利号、报告号等。

是以文献的外表特征作为文献存储的标识和文献检索提问的出发点而设计的语言。

文献内容特征需要我们深入到文献内容中间,寻找与文献主题相关度较大的特征性标识。

按其结构原理主要分为分类检索寓言、主题检索语言、和代码检索语言。

位置检索(W)With 表示改算符两侧的检索词必须按照输入的顺序排列,且两者之间只允许有一个空格或标点符号,不允许有任何字母或词(nW)nword 表示此算符两侧的检索词之间最多允许间隔n个词,且两者之间的相对位置不能颠倒(N)near 表示该算符两侧的检索词相邻,且位置可以颠倒(nN)nNear 表示该算符两侧的检索词可以间隔最多n个词,且两者之间的顺序可以颠倒CBM 中国生物医学文献数据库基本检索方法1.布尔逻辑组配检索:not > and > or2.截词检索3.模糊检索/精确检索,模糊检索能够扩大检索范围,提高查全率;精确检索是检索结果中命中的字符串等同于检索词的一种检索,提高查准率。

新版五年制预防医学专业《医学信息检索与利用》课程教学大纲-新版.pdf

新版五年制预防医学专业《医学信息检索与利用》课程教学大纲-新版.pdf

《医学信息检索与利用》课程教学大纲课程名称:医学信息检索与利用授课专业:五年制预防医学专业学时与学分:总学时为24学时(理论课12学时,实验课12学时),1.5学分一、课程性质和目的本课程是一门系统讲授医学信息检索与利用的基础理论与技术方法学课程,它以医学信息检索与利用为主线,以各种医学数据库与Internet医学信息检索为重点,使学生在了解医学信息检索基本知识的基础上,熟悉并掌握各种医学及相关学科数据库的特点和检索方法,以及网络医学资源的分布与利用方法,培养学生的信息素质,提高其获取信息和利用信息的能力,较好地利用现代信息技术和网络信息资源来提高学习或学术研究的水平。

教学大纲的所列理论课内容都是要求学生学习的,但不是全部在课堂上讲授,可以通过多种方式教学,也可由学生自学。

教学内容的要求分三级,第一级为掌握的内容,要求学生牢记并能口述自由表达,还能应用这些理论解释有关生理现象以及应用于后续课程;第三级为了解内容,学生对此内容应有一初步印象;第二级为熟悉内容,介于掌握与了解内容之间。

检索实习课重点要求实际联系理论,巩固理论知识,拓宽思维,突出培养学生的动手能力、综合分析能力、应用能力和创新能力。

本大纲适用于我校五年制本科、七年制本硕的临床、口腔、预防、检验、护理等专业的教学。

二、理论课教学内容及基本要求第一章信息检索概论学时分配:3学时掌握:全文(原始文献)的获取方法;计算机检索常用运算符的含义及作用、扩展检索与缩小检索。

熟悉:检索语言类型与作用;检索方法、途径及步骤。

了解:信息、知识、情报、文献的概念;文献类型及其作用:按加工程度、载体类型、出版形式划分。

重点介绍一次文献、二次文献、三次文献、科技图书、期刊的特点与作用;检索工具类型与作用:目录(书名目录、分类目录、著者目录、主题目录)、索引、文摘;计算机检索基础:计算机网络信息检索系统的组成、数据库类型(文献型、事实型、数据型)、扩展检索与缩小检索;检索效果评价:查全率、查准率。

医学文献检索与利用:信息资源检索

医学文献检索与利用:信息资源检索
❖ 具体来讲:了解并熟悉各自专业及相关学科 检索工具的使用方法。查找并研读高质量的 参考文献,在此基础上完成学术论文和学位 论文的写作。
教学内容与安排-学什么
❖ 1 信息检索基础知识(信息资源、信息检索原理、 计算机检索基础)—信息获取基础:授之以渔
❖ 2图书馆电子资源概述(信息源:专业检索系统及 数据库)——从哪获取
自称是“打开世界化学文献的钥匙” 形象地说明文献检索的“钥匙”作用
为什么要学
❖学习需要 ❖教学需要 ❖科研需要
站在巨人的肩膀上
科研选题的基本过程
1. 问题的发现
工作中发现 学术交流 灵感 意外事件
2. 文献的复习
查阅文献资料
3. 再评价
可行性分析
4. 确定课题
“信息的有效交流是学科发展的根基”。
俄罗斯学者布留索夫说:
❖“学问与其说是知识的储蓄,倒 不如说是善于在书海中找到知识 的本领”。
--------------------给你一把打开知识宝库的钥匙
文献信息资源是知识的宝库 文献检索是开启知识宝库的钥匙
美国《化学文摘》封面上醒目的印着: Key To The World’s Chemical Literature
体语信息源是以人的体态表述出来的信息资源。
如表情、手势、姿态、舞蹈等。
体载信息源多属于经验性、未被组织和符号化的知 识信息,其特点表现为:
⑴ 广泛性。人们在一切社会交往中,随时都有获 取口传信息的机会,但由于其自发性较强而不便于组织 管理(教学、会议除外)。
⑵ 针对性。口传信息主要是靠人与人的直接交流 而得,所以具有很强的针对性,并辅之以手势、表情, 易于理解,富于启发性,生动直观。
总结、重组)检索到的信息,创 造出新的知识和信息 ❖ 为完成毕业论文和进一步研究作 准备

医学信息检索与利用

医学信息检索与利用

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• 生物医学中心 BMC
BioMed Central
(http://www.biomedcentra1.com/)
• 英国一家独立的商业性出版机构 • 最重要的开放获取杂志出版商之一 • 内容涵盖生物学和医学的所有主要领域,主要包括麻醉学、 生物化学、生物信息学、生物技术、癌症、细胞生物学、微 生物学、分子生物学等57个分支学科。 • 能快速且免费提供经过同行评议的生物医学期刊的全文服务。 • 采取向作者和机构会员收费的方式为开放获取期刊提供资助, 在BMC期刊上发表的文章,作者拥有版权。 • 已出版200种OA期刊。
MeSH Translation Table
主题词注释表
自动转换匹配原理 PubMed对输入 Journals Translation Table 期刊注释表 检索框中的检索词 进行自动转换匹配, Common Phrase List 常用词组表 将其逐步地与 其数据库中 的 Author Index 各类词表核对 作者索引表 转换、匹配
生物医学信息检索与利用
2012年11月
把握相关文献搜集过程的关键环节
(一)理解是信息检索的前提
理解项目内容的实质含义,灵活能动地扩展检索用词, 避免用词局限;对检出文献进行鉴别、筛选、翻译、 归纳;
项目名称:手持式心电图机 (手持+便携+微型+小型+袖珍+迷你)*心电图机
(二)选词全面性及其扩展思路
Directory of Open Access Journals

瑞典隆德大学(Lund Univ)图书馆开发维护。 提供全球免费开放存取(OA)期刊目录的网 站,共收录各学科8300种免费电子期刊,全 部为同行评审或主编质量控制的学术期刊,制 作了期刊简介及网站链接。 提供按刊名、学科浏览,期刊关键词检索。

医学信息检索与利用第一章 概论 PPT课件

医学信息检索与利用第一章 概论 PPT课件

和吸收的自觉程度。
五 文献 (Document,Literature)
文献——记录有知识信息的一切载体。
文献三要素:知识;载体;记录手段
文献的含义:知识是文献的实质内容,
信青 息岛
载体是文献的存在形式,记录是联系
检大 索学
二者的手段。
教医
研学
室院
信息、知识、情报、文献概念结构图
信青 息岛 检大 索学 教医 研学 室院
网络(近100种搜索引擎可搜索几千
万-上亿网页,基于internet检索系
信青 息岛 检大 索学 教医 研学 室院
统,各种文本、超媒体、虚拟平台、 网格)
以上两种为主要存储和传输文献的载体
电子文献的文件类型
文本型: Txt, DOC ,PDF( Acrob at reader )
超文本/超媒体型
(hypertext/
息岛
检 大 社会信息— Social information
索学
教医 研学
机器信息— Machine information
室院
二、知识(Knowledge)
人类社会实践的总结,是人的主观世 界对于客观世界的概括和如实反映。
人类通过信息对自然界、人类社会以
及思维方式与运动规律的认识和掌握,
信青 息岛 检大 索学 教医 研学 室院
中国高等教育文献保障系统(CALIS)联合目录
/advanceSearch.do
信青 息岛 检大 索学 教医 研学 室院
国家科技图书文献中心(NSTL) /marcdi/SimpleSearch.jsp
如: 《全国外文生物医学期刊联合目录》 《全国高等医药院校图书馆外文期刊联合目录》

医学信息检索与利用

医学信息检索与利用

常用的信息检索技术包括布尔逻辑运 算符、自然语言理解技术、信息抽取 技术等。
信息检索类型
按存储载体分,有自由文本检索、元 数据检索、结构化数据检索;按检索 方式分,有全文检索、关键词检索、 模糊检索等。
医学信息检索的重要性
医学信息量大
随着医学科技的发展,医学信息 量呈爆炸式增长,如何快速准确 地获取所需信息成为一项重要任
出有价值的信息。
04
医学信息利用与知识管 理
医学信息利用的方法与技巧
确定信息需求
明确所需信息的主题、范围和 目的,以便更有效地进行信息
检索。
选择合适的检索工具
根据信息需求选择合适的医学 数据库、学术搜索引擎等检索 工具。
制定检索策略
根据信息需求和检索工具的特 点,制定合适的关键词、布尔 逻辑运算符等检索策略。
06
医学信息检索与利用的 未来发展
人工智能在医学信息检索中的应用
自然语言处理
利用人工智能技术对自然语言文本进行语义理解和分析,提高医 学信息检索的准确性和效率。
智能推荐系统
通过分析用户行为和兴趣,为用户推荐相关的医学信息,提高信 息获取的针对性和满意度。
图像识别技术
应用于医学影像信息的检索,通过图像识别技术快速准确地检索 出相关影像资料。

证据整合
对不同来源的医学证据进行整 合,为临床决策提供支持。
医学信息知识的共享与传播
学术交流平台
建立学术交流平台,促 进医学信息知识的共享
和传播。
学术会议
举办或参加学术会议, 与同行交流最新的研究
成果和进展。
学术出版
发表学术论文、专著等 ,传播医学信息知识。
继续教育
开展继续教育项目,提 高医务人员的医学信息

医学信息检索与利用概论 PPT课件

医学信息检索与利用概论 PPT课件

(Medical Subject Headings, 简称MeSH)
《中图法》 (第四版) 1999年3月
五大部类: 1.列宁主义、毛泽东思想、邓小平理论 2.哲学 3.社会科学:下分九大类 4.自然科学:下分十大类 5.综合性图书
《中图法》各大类目名称
MeSH简介 (p.4)
1.MeSH的组成部分
(三)按内容的加工程度划分
1.一次文献(Primary literature) 也称原始文献,是作者根据自己的工作和研究成果而创作的 原始文献。包括专著、期刊论文、学位论文、研究报告、专利 说明书等。 2. 二次文献(Secondary literature) 对大量分散无序的一次文献进行收集整理,按照其外表特征 (如篇名、作者、出处)或内容特征(如主题、分类)进行有序的编 排,以供读者查找。如索引、目录、文摘等。 3. 三次文献(Tertiary literature) 针对某一专题,作者在利用二次文献的基础上,选用大量与 之相关的一次文献,经过系统地阅读、分析、研究、整理和概 括而写成的文献。如综述、评论、述评、进展、动态、指南等。
二、网络医学信息资源的类型与特点
(一)网络医学信息资源的类型 1.按出版物类型划分:
(1)电子期刊: CNKI,维普, 万方, OVID, SpringerLink
(2)电子图书: 超星数字图书馆, SpringerLink (3)特种医学信息资源:
①学位论文: CNKI, 万方 ②专利文献 :万方 ③标准文献 :万方 ④医学会议信息 : CNKI, 万方
2.MeSH的主题词可以是单词或词组 (p.5)
3.树状结构表(Tree Structures) (p.5)
4.副主题词表(Subheadings) (p.6)

2024年度医学信息检索与利用课件

2024年度医学信息检索与利用课件
语义理解和歧义消解
医学术语具有专业性和多义性,如何实现准确的语义理解 和歧义消解是医学信息检索的关键问题。
22
医学信息检索的发展趋势
01
基于深度学习的检索 技术
深度学习技术能够自动学习和提取文 本特征,进一步提高医学信息检索的 准确性和效率。
02
跨语言信息检索
随着全球化的发展,跨语言信息检索 成为医学信息检索的重要方向,能够 帮助医学工作者获取更全面的医学信 息。
科研人员需要利用医学信息检索工具跟踪学 科前沿和研究热点,了解最新的研究动态和 成果。
学习并掌握医学信息分析 和挖掘技术
科研人员需要学习并掌握医学信息分析和挖 掘技术,从海量的医学信息中提取有价值的 知识和发现。
2024/3/23
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公众健康教育与医学信息检索
2024/3/23
获取权威的医学知识和信息
公众在获取医学知识和信息时,需要选择权威的医学网站和数据库 ,确保获取的信息准确可靠。
学习基本的医学信息检索技能
公众需要学习基本的医学信息检索技能,如关键词选择、检索策略 制定等,以便更好地获取所需的医学知识。
提高健康素养和自我保健能力
通过学习和掌握医学信息检索技能,公众可以提高自己的健康素养 和自我保健能力,更好地维护自己和家人的健康。
医学词汇分词技术
针对中文医学文本,采用专业的分词算法对文本进行分词处理。
医学词汇词性标注
对分词后的医学词汇进行词性标注,为后续文本处理提供基础信 息。
9
医学文本挖掘技术
医学实体识别
从医学文本中识别出疾病、症状、药物等实体,为后续分析和挖掘 提供基础数据。
医学关系抽取
从医学文本中抽取实体之间的关系,如疾病与症状、药物与疾病等 关系。
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逻辑与(AND) A AND B:检索词A和检索词B同时出 现在一条记录中。 其作用是缩小检索范围,提高查准率。
A and B
例如查有关“妇女吸烟”的文献,检索式可写成: Women and smoking
逻辑非(NOT) A NOT B:记录必须包含检索词A但不能 包含检索词B。即在含有A检索词的文献 中去除含有B检索词的文献。 其作用是缩小检索范围,提高查准率。

通过布尔逻辑运算符来连接检索词,以及表 示运算优先级的括号组成的一种表达检索要 求的算式
逻辑或(OR)
A OR B:记录中出现检索词A或检索词B或 两词同时出现在一条记录中。 其作用是扩大检索范围,提高查全率
A OR B
如查有关维生素C方面的文献,检索式可写成: Vitamin C or Ascorbic acid
默认检索
默认检索又称缺省检索、隐含检索,是指在检 索系统预先设定的多个字段中进行检索。 如:在WinSPIRS系统的MEDLINE数据库中, Search状态为默认检索所有非限制字段,包括: ti,ab,MH等字段。 CBMdisc中的“缺省”检索是在中文标题、文 摘、主题词、关键词、特征词、刊名等6个字 段中搜词检索。
数据库的结构
文档(file) 记录(record) 字段(field)
数据库的结构
文档(file) 数据是能满足某种特定目的或某一特定 数据处理系统需要的一种数据集合,由 一个或多个文档构成
现期文档、回溯文档(如MEDLINE) 顺排文档、倒排文档

记录(record)
数据库中基本文献单元 一个记录在数据库中通常记录着一篇文 献的相关信息
《医学信息检索与利用》概论
南昌大学医学院文献检索教研室 钟丽萍
Where is the wisdom we have lost in knowledge? Where is the knowledge we have lost in information? ——T. S. Eliot (1888-1965) 我们在信息里面失去的知识, 到哪里去了? 我们在知识里面失去的智慧, 到哪里去了? 艾略特(1888-1965)
截词检索
截词(Truncation):检索者将检索词在他认为合 适的地方截断。 截词检索:检索时针对检索词附加一个截断符 号,指明该检索词在与数据库中的词比较时, 采取完整匹配还是部分匹配。
无限截断
检索词串与被检索词实现部分一致的匹配,被 截断的部分没有限定有多少个字符。




左截断:*leukemia:preleukemia 、leukemia 右截断:leukocyt*:leukocyte leukocytic leukocythemia 中间截断:leuk*ic:leukemic leukaemic leukemogenic leukocytoctastic 左右截断:*leukemia*:leukemia preleukemia leukemias
其他检索途径
专利号、国际连续出版物编号、化学物 质登记号检索,分子式检索、特征词检 索、记录顺序号检索等。
计算机检索途径的另一划分法
简单检索 复合检索 高级检索 目录检索 导航检索 专家检索
简单检索(Simple Search)
也称初级检索、自由词检索、基本检索。 指在数据库首页的检索词输入框(查询 提问框)内输入一个单词或词组,提交 检索工具查询的一种检索方式。

分类检索
分类法(Classification):
利用学科、专业、概念之间的逻辑关系建立 起来的一种等级体系。 分类号:由数字或数字加字母构成,代表一 个个概念;概念间有上下隶属关系,也有同 位间的并列关系。 国内常用的分类法是:《中国图书资料分类 法》

著者检索
著者(author)检索是用文献上署名的作 者或编者的姓名作为检索入口词。 检索时注意著者姓名的处理:姓前,名 后;姓用全称,名用首字母。 如:Charles Greenberg处理 为:Greenberg c 闻玉梅 处理为:wen ym
引文检索
参考文献:在学术论文、综述、专著文 献后面,列有的著者撰文借鉴利用过的 书目清单。 引用文献:列有参考文献的文献。 参考文献又称为被引用文献。 引文检索:以被引用文献为检索起点来 查找引用文献的过程。
机构检索
以机构名称为检索词,来查找该机构学 者发表的文献。
刊名检索
检索指定刊物上发表的文章。 有的数据库提供刊名浏览,只需点击刊 名链接即可 有的数据库则需输入刊名:刊名全称或 刊名缩写 刊名缩写全称转换可查Pubmed的 Journal Database()
数据库的类型与结构
数据库是指有计算机进行处理的一定数 量同类信息的有序集合,是用来存储和 查找文献的电子化检索工具。
数据库的类型
书目型数据库(bibliographic database) 事实型数据库(fact database) 数值型数据库(numeric database) 全文数据库(full text database) 图像型数据库(image database,atlas online)
标题词(title word) 关键词(key word) 文摘词(abstract word) 全文词(full text word)

主题词检索
主题词(subject,subject headings)
又称叙词,是一种规范化的检索语言。 主题词的规范作用在于:对同义词、近义词、 异形词、全称与缩写进行归并,以保证一词 输入,多词命中。 规范的依据:医学主题词表(MESH) 例:renal failure see kidney failure
书目数据库(Bibliographic Database)
存储的是二次文献,包括文献的外部特征、 题录、文摘和主题词等,检索结果是所 需文献的线索而非原文。 许多书目数据库是印刷型文献检索工具 的机度版,如MEDLINE、CBMDISC等
数值数据库(Numeric Database)
主要包含的是数字数据,如各种统计数 据、科学实验数据、科学测量数据等。
字段(field)
组成记录的基本信息单元。 每一个字段都描述文献的某一方面特征, 包括外表特征和内容特征。 每个字段有自己的名称和缩写,如:题 名(ti)、著者(au)、文摘(ab)、出版年(py) 等
计算机检索的途径
检索途径是指用记录的某一特征为检索 切入点进行检索。
自由词检索
自由词又称文本词(text word),是作者写 文章时所使用的自然词语,包括:
高级检索指在已设定的高级检索窗口中 输入多个检索词,运用逻辑组配关系, 查找同时满足多个检索条件的数据,在 高级检索界面上一次性实现本应多次检 索的结果的一种检索方式。
Байду номын сангаас 高级检索
多栏逻辑组配
多栏复合检索
词表查询
目录检索(Category Search)
或称分类检索,有些检索工具如雅虎、 万方,提供分类目录检索。 目录检索指按类名分类,每类又分为若 干子类目,层层逐级展开,最后点击末 级类名,显示网页名链接和简短内容提 要,点击链接,显示相关网页内容(如 雅虎),或显示该类的文献记录(如万 方、维普)。
例如医学上使用的化学制剂、药物的各种理 化参数、人体生理上的各种数值,人口统计 数据都可收入数值数据库。 美国国立医学图书馆编制的化学物质毒性数 据库RTECS,包含10万多种化学物质的急、 慢性毒理实验数据。

事实数据库(Fact Database)
存储的是用来描述人物、机构、事物等 信息的情况、过程、现象的事实数据。

按文献发布的类型分类
图书 期刊 特种文献
按揭示文献内容程度分类
一次文献 二次文献 三次文献
第二节 计算机检索与数据库
计算机检索:利用计算机从文献数据库 或因特网上查寻所需文献信息的过程。 包括:联机检索、光盘检索、网络检索
计算机检索发展简史
脱机检索(off-line retrieval) 联机检索(on-line retrieval) 光盘检索(optical disc retrieval) 网络检索
限定检索
不少数据库提供limit检索功能,用来对检 出结果进行数量限制. 常用的限定检索有:语种(language)、文 献类型(publication type)、出版日期 (publication date)、只要含有全文的记录 (full text only)、限于临床医学期刊 (clinical journals)等。
国际经济合作与发展组织提出知识的4W 概念:know-what;know-why;knowhow;know-who
基本概念3
情报(Information) 当人们为了解决某一特定问题去搜寻所 需要的知识,那一部分知识就是情报, 是被传递的知识或事实。 情报的三个基本属性:

知识性、传递性、效用性
基本概念4
第一节 基本概念1
信息(Information) 英国科学家K.Popper认为信息可分为:
有关客观物质世界的信息 有关人类主观精神世界的信息 有关概念世界的信息

基本概念2
知识(knowledge)

人类在认识世界、改造世界的过程中,不断 接受客观事物发出的信息,经过思维加工, 获得对事物本质及其运动规律的认识,由此 信息转化为知识。
全文检索可直接获取原始资料,而不是书目 检索时的线索,提高了用户的检索效率。 在DIALOG中有48种医药期刊全文数据库, 我国有《中国学术期刊》数据库、万方数据 库、维普数据库等全文数据库。

图像数据库(Image Database)
以图像为信息主体,配有文字解释,如: 解剖图谱、中药图谱、诊断图谱、手术 图谱等。 如:NLM的The visible Human Project; 哈佛大学医学院的The Whole Brain Atlas等。
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