基因组时代临床医生如何做到精准诊断遗传性肾脏病

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肾病内科遗传性肾病的诊断和治疗

肾病内科遗传性肾病的诊断和治疗

肾病内科遗传性肾病的诊断和治疗遗传性肾病是指由基因突变引起的肾脏疾病,其在临床上具有高度的遗传性和复杂性。

肾病内科在遗传性肾病的诊断和治疗方面扮演着重要的角色。

本文将就遗传性肾病的诊断和治疗进行探讨。

一、遗传性肾病的诊断1. 临床表现的分析遗传性肾病的临床表现多样化,包括肾小球疾病、肾小管疾病和间质性肾炎等。

通过观察患者的症状和体征,如蛋白尿、血尿、高血压、水肿等,可以初步判断疾病类型,为后续的诊断提供线索。

2. 家族史的调查遗传性肾病具有明显的家族聚集性,因此调查患者的家族史对确定疾病是否遗传具有重要意义。

了解家族中是否存在患者或携带者,以及疾病的传递规律和表型特点,能够为遗传咨询和基因检测提供依据。

3. 实验室检查的应用实验室检查是诊断遗传性肾病的重要手段之一。

通过尿常规、肾功能指标、免疫学检查等,可以进一步评估肾脏功能和炎症情况,辅助判断疾病类型。

4. 分子遗传学检测分子遗传学检测是诊断遗传性肾病的金标准之一。

通过对相关基因的突变检测,可以确定遗传性肾病的基因型和突变类型,为患者的基因咨询、遗传咨询和家族遗传学调查提供依据。

二、遗传性肾病的治疗1. 对症治疗遗传性肾病的治疗应以对症处理为主,针对疾病的不同表现进行治疗,如控制血压、减少蛋白尿、抗炎治疗等。

同时,合理的饮食控制和生活方式调整也对疾病的进展具有积极的影响。

2. 肾替代治疗遗传性肾病进展至晚期时,肾替代治疗成为必要的治疗手段。

包括透析和肾移植两种方式。

透析通过人工的方式排除体内废物和多余液体,缓解肾功能衰竭的症状。

肾移植则是将健康的肾脏移植到患者体内,提供正常的肾脏功能。

3. 基因治疗近年来,基因治疗成为遗传性肾病治疗的新方向。

通过基因编辑技术、基因表达调控等手段,修复或替代受损的基因,改变疾病的遗传状态,为患者提供持久的治疗效果。

4. 遗传咨询和家族遗传学调查遗传性肾病对家族的遗传风险较高,因此在诊断和治疗过程中,遗传咨询和家族遗传学调查具有重要的意义。

基因组学技术在肾脏疾病治疗中的应用

基因组学技术在肾脏疾病治疗中的应用

基因组学技术在肾脏疾病治疗中的应用肾脏疾病是一类十分严重的疾病,严重影响着人们的健康。

目前,基因组学技术在肾脏疾病治疗领域有着广泛的应用,尤其是在肾病的早期预测和诊断、治疗监测以及个体化治疗方面,具有非常重要的意义。

一、基因组学技术在肾脏疾病早期预测与诊断中的应用基因组学技术能够对肾脏疾病的遗传因素进行分析,将不同基因型与肾脏疾病、药物代谢和个体化治疗的反应联系起来。

知道了某些遗传因素与肾脏疾病的关系后,就能够在早期发现疾病的存在,因此,基因组学技术已成为预测和诊断肾脏疾病风险的有力工具。

例如,据研究表明,基因组学技术在肾脏移植术前的免疫系统配型中能起到很好的作用。

此外,常用的肾脏疾病如糖尿病、肾小球局灶性硬化、多囊肾等疾病,与许多基因的变异都有关系。

通过对这些基因进行检测,我们就能够及时了解个体患者是否存在肾脏疾病的风险,从而采用相应的预防和治疗措施,防止肾脏疾病的进一步发展。

二、基因组学技术在肾脏疾病监测中的应用随着医学技术的发展,基因组学技术在肾脏疾病治疗中的应用越来越广泛,不仅在预测和诊断方面,还在肾脏疾病治疗监测中起到了极其重要的作用。

例如,监测肾脏移植术后的生长抑素(Ghrelin)变化,就能够了解移植后免疫系统的恢复情况。

这将有助于医生及时调整药物摄入量,防止药物副作用和免疫反应。

此外,基因组学技术还能够帮助个体患者更好地掌握自己的健康状况,以求更好的自我监测。

基因组学技术通过对基因的分析,可以预测肾脏疾病的进展情况和治疗反应。

个体患者了解自己的基因组信息后,可以制定更加科学的治疗方案,提高治疗效果,减少治疗时间和药物副作用。

三、基因组学技术在肾脏疾病的个体化治疗方面的应用基因组学技术在肾脏疾病的个体化治疗方面应用广泛,它通过分析每个人的基因组信息,来制定针对性强的治疗措施。

通过基因检测,能够了解每个人在药物代谢方面存在的个体差异。

因此,在制定治疗方案时,医生可以根据患者的基因组信息,进行个性化药物治疗,提高疗效,降低药物副作用。

基因组时代临床医生如何做到精准诊断遗传性肾脏病

基因组时代临床医生如何做到精准诊断遗传性肾脏病

基因组时代临床医生如何做到精准诊断遗传性肾脏病摘要虽然临床医生通过诊断性实验室(遗传检测机构或实验室)所提供的新的遗传学技术如二代测序及染色体芯片等极大地提高了对遗传性肾脏病的诊断,然而,要做到精准诊断此类疾病,首先需要临床医生能识别出可能的此类疾病患者,然后在熟知各种遗传检测方法的基础上依据患者表型选择恰当的分子诊断技术手段和合适的组织标本进行检测,获得的遗传检测报告需结合患者的表型、可能的遗传模式以及共识指南等进行临床解读,与此同时发挥研究性实验室功能,通过应病而设的技术方法解决诊断性实验室无法解决的特殊问题,最终为患者及其家庭提供精准诊治意见。

遗传性肾脏病广义上是指由于遗传物质结构或功能改变所导致的肾脏疾病;狭义上则指由于遗传物质结构或功能改变所致、按一定方式垂直传递、后代中常常表现出一定发病比例的肾脏疾病。

此类疾病按照遗传病的分类可分为染色体病、单基因病、多基因病、线粒体病和体细胞遗传病,按照累及肾脏部位分为肾小球病、肾小管病、肾小管间质病、肾血管病、肾脏尿路畸形、肾囊肿和肾脏肿瘤。

自遗传学进入肾脏病领域的近40年里,遗传学、分子生物学和生物信息学的飞速发展带动并促进了对遗传和肾脏疾病关系的认识,且实现了对遗传性肾脏病的分子诊断。

研究显示,遗传性肾脏病是成人慢性肾脏病最严重阶段终末期肾病五大常见原因之一,约占25岁前起病的慢性肾脏病患者的20%,占儿童肾移植患者的30%,可见遗传性肾脏病并不罕见。

然而,此类疾病种类繁多,起病隐匿,临床表现常不特异,甚至直至进展至终末期肾病时才被发现,因此早期、及时确切的诊断此类疾病成为亟待解决的临床问题。

新的遗传学技术如二代测序和基因芯片在临床实践中的广泛应用,提高了临床医生对遗传性肾脏病的诊断,但由此也产生了一系列问题,如哪些肾脏病需要分子诊断,如何选择合适的遗传检测方案,如何基于临床对诊断性实验室出具的遗传检测报告进行解读等。

显然这些问题的解决是做到精准诊断遗传性肾脏病的关键一步,需要临床医生在提高对遗传性肾脏病识别力的基础上,掌握并及时更新遗传学知识,且与专业的实验检测专家、生物信息学家、遗传学家合作,充分发挥研究性实验室作用,进而为每一位患病个体及所在家庭的精准诊断、客观遗传咨询提供科学严谨的依据。

肾脏疾病诊断与治疗的前沿技术

肾脏疾病诊断与治疗的前沿技术

肾脏疾病诊断与治疗的前沿技术概述:肾脏是人体重要的排毒器官,承担着维持水平衡、清除废物物质和调节酸碱平衡等重要功能。

然而,肾脏疾病的发生率逐年上升,给患者健康和生活品质带来了巨大威胁。

为了更好地诊断和治疗肾脏疾病,医学界不断探索新的技术和方法。

本文将介绍一些目前在肾脏疾病诊断与治疗领域具有前沿地位的技术。

一、基因检测在肾脏疾病中的应用近年来,基因检测成为了医学领域的一个重要方向,其中也包括对于肾脏相关基因变异的分析。

通过遗传学检测方法可以发现某些与肾脏相关的突变或多态性基因变异,这些变异往往与特定类型的遗传性肾脏疾病密切相关。

通过对患者进行基因检测,可以准确筛查出患有遗传性肾脏疾病的风险人群,为早期预防和治疗提供依据。

目前最常用的基因检测技术是基于PCR(聚合酶链反应)原理的方法。

这种方法可以在细胞或组织样本中扩增特定基因片段,从而对其进行分析和鉴定。

此外,还有通过高通量测序技术进行全基因组、全外显子甚至单个细胞的DNA测序分析等前沿技术陆续应用于肾脏疾病领域。

二、体外生物支撑系统改善肾功能当患者出现严重肾功能损害时,传统治疗方法往往无法快速修复受损的肾脏组织。

但随着科技进步,体外生物支撑系统在改善肾功能方面取得了突破性进展。

这些系统能够模拟人体自然代谢过程,同时清除废物物质和平衡电解质。

通过将患者血液引入体外环回装置中,废物被过滤,血液被净化,并再次输入患者体内,从而起到替代肾脏功能的作用。

目前,体外生物支撑系统在透析治疗中已经开始使用,并取得了一定的临床效果。

然而,由于技术复杂性和设备成本等因素的限制,这种前沿技术目前仍处于实验阶段,但具有巨大的潜力。

三、纳米颗粒在肾脏疾病治疗中的应用纳米颗粒是指直径在1到100纳米之间的微小颗粒,这种纳米级别的颗粒具有较大比表面积和特殊物理化学性质。

近年来,人们发现纳米颗粒在肾脏疾病诊断与治疗中具有很好的应用前景。

一方面,在光学成像方面,通过将特定类型的荧光标记物或对比剂包裹在纳米颗粒表面,可以使其更好地进入肾脏组织,并观察到相应信号。

肾病内科遗传性肾病的诊断与治疗

肾病内科遗传性肾病的诊断与治疗

肾病内科遗传性肾病的诊断与治疗遗传性肾病(Hereditary Kidney Disease)是一类常见的遗传性疾病,主要由基因突变引起,临床表现为肾小球、肾小管或肾间质损害。

肾病内科作为肾脏疾病的专科领域,在遗传性肾病的诊断和治疗中发挥着重要的作用。

本文将重点探讨肾病内科在遗传性肾病的诊断与治疗中所面临的挑战以及应对措施。

1. 诊断1.1 家族史和临床表现的收集对于怀疑遗传性肾病的患者,首先应通过详细的病史询问和体格检查来收集相关信息。

家族史是判断是否为遗传性肾病的重要依据,包括了解是否有同代亲属存在相似的肾脏疾病。

此外,对患者进行全面的临床表现观察,包括尿检、肾功能指标和影像学检查等,以了解病情的严重程度和类型。

1.2 遗传咨询和遗传学检测在确定患者可能存在遗传性肾病后,遗传咨询和遗传学检测是必不可少的步骤。

遗传咨询包括对患者及其家属进行详细的遗传病史和遗传风险评估,以指导患者的诊疗和生育选择。

遗传学检测可以通过检测相关基因的突变,确认遗传性肾病的确诊,并预测疾病的发展及转归。

2. 治疗2.1 对症治疗针对遗传性肾病引起的肾小球、肾小管或肾间质损害,可以采取对症治疗的措施。

例如,对于伴有蛋白尿和高血压的肾病患者,可以采用血压控制、蛋白尿控制、血脂调节等综合治疗措施,以减缓肾脏损害的进展。

2.2 药物治疗对于某些特定类型的遗传性肾病,药物治疗可能是一种有效的治疗方法。

例如,针对一部分突变导致蛋白尿的遗传性肾病患者,可以选择ACE抑制剂或ARB类药物来控制蛋白尿,减轻肾脏负担。

此外,对于遗传性多囊肾等疾病,目前尚无特效药物治疗,但可以通过药物控制症状、减轻并发症等方式来改善患者的生活质量。

2.3 肾脏替代治疗对于晚期遗传性肾病患者,常伴随着严重的肾功能衰竭,此时可能需要采取肾脏替代治疗,包括血透、腹透或肾移植等方法。

具体的治疗方案需根据患者的具体情况来制定。

3. 个体化治疗遗传性肾病涉及的基因异常多种多样,临床表现也具有明显的异质性。

肾脏疾病的基因检测方法

肾脏疾病的基因检测方法

肾脏疾病的基因检测方法概述:近年来,随着科学技术的发展,基因检测在医学领域中扮演越来越重要的角色。

特别是对于肾脏疾病等遗传性疾病的诊断和治疗,基因检测起到了非常重要的作用。

本文将介绍肾脏疾病的基因检测方法。

一、单基因遗传性肾脏疾病的检测方法:单基因遗传性肾脏疾病包括多囊肾、遗传性肾小管酸中毒等。

通过遗传咨询和家系分析,可以确定家族中是否存在这些肾脏疾病。

进一步,可以进行DNA测序以寻找可能引起该疾病的突变位点。

二、复杂遗传性肾脏疾病的关联分析法:复杂遗传性肾脏疾病包括慢性肾衰竭、高血压性肾小球硬化等。

这些不仅受到单个基因突变影响,还与环境因素和多个基因之间的相互作用有关。

通过关联研究,可以分析某些基因与特定肾脏疾病之间的相关性。

三、全外显子测序:全外显子测序是一种高通量测序技术,可以直接对所有编码蛋白质的基因进行测序。

这项技术已广泛应用于识别各类遗传性肾脏疾病中的突变位点。

通过对患者和正常人群的比较,可以发现特定基因变异与肾脏疾病发生的相关性,从而提供了可能的诊断和治疗方法。

四、筛查易感基因:随着人类基因组计划的完成,我们了解到一些人在患上某种肾脏疾病方面具有高风险。

例如,在多囊肾中,突变位点PKD1和PKD2被认为是主要致病因子。

利用PCR扩增等技术,可以筛查出携带这些易感基因的个体,并提前采取预防措施。

五、同义突变分析:同义突变指DNA序列改变后所产生的氨基酸序列不发生变化的突变,然而这些同义突变可能会对蛋白质的功能产生不同程度的影响。

通过同义突变分析,可以探索这些突变位点与肾脏疾病的关联性,并指导进一步的诊断和治疗。

六、基因表达谱分析:基因表达谱是指在特定条件下基因表达水平的整体描述。

基因表达谱分析可以帮助我们了解驱动肾脏疾病发生和发展的关键信号通路以及相关基因调节机制。

通过对肾脏组织或细胞中上万个基因进行检测和比较,可以为了解肾脏疾病提供新的线索。

结论:随着基因检测技术的不断进步,肾脏疾病的诊断和治疗也得到了极大改善。

肾脏疾病的遗传学研究与基因治疗

肾脏疾病的遗传学研究与基因治疗

肾脏疾病的遗传学研究与基因治疗近年来,肾脏疾病对于全球范围内的健康问题越来越成为关注焦点。

无论是先天性还是后天性的肾脏疾病,都给患者和家庭带来了巨大的经济和心理负担。

然而,随着科学技术的进步,肾脏疾病的遗传学研究和基因治疗正日益受到重视。

一、肾脏疾病的遗传学研究遗传学是生物医学领域中重要且不可或缺的一部分,它探讨了基因对人类健康和发展的影响。

在肾脏领域,遗传性肾小球肾炎(hereditary nephritis)等一系列常见遗传性肾脏疾病引起了广泛关注。

稳定表达人体基因组(The Human Genome Stability BAF (HG SBAC)),由美国国立卫生院赞助,在全球范围内收集和整理了数百个患有遗传性肾脏疾病的人的基因样本,以便研究遗传突变对肾脏功能的影响。

通过深入研究这些患者的遗传信息和表型数据,研究人员发现了一系列与肾脏疾病相关的基因变异。

例如,在Alport综合征的研究中,科学家发现从3型、4型和5型胶原α链编码基因突变都会导致此综合征的发生。

此外,还有多个其他遗传突变在不同类型的遗传性肾小球肾炎中也得到了确认。

这些遗传学研究为深入了解肾脏疾病提供了重要线索,并为早期诊断和治疗提供了可能。

二、基因治疗在肾脏疾病中的应用随着基因治疗技术的快速发展,许多科学家开始探索将其应用于肾脏疾病的治愈和改善。

基因治疗是通过向患有特定遗传缺陷或突变的患者体内递送正常功能基因来修复或替代受损基因,以达到治疗目的。

在肾脏疾病领域,基因治疗已经显示出了潜在的前景。

例如,许多遗传性肾小球肾炎患者缺乏一种叫做补体因子H(complement factor H)的功能蛋白质,这导致免疫系统攻击肾小球而导致炎症和损伤。

科学家通过基因治疗技术将正常的补体因子H基因导入患者体内,成功地恢复了正常的免疫功能并减轻了肾脏损伤。

此外,在多囊肾(Polycystic Kidney Disease)等其他一些遗传性肾脏疾病中也发现了类似的潜力。

精准医学时代下基因检测创新与不足探讨

精准医学时代下基因检测创新与不足探讨

精准医学时代下基因检测创新与不足探讨精准医学时代是以个体化医疗为核心的医学模式,通过基因检测来实现个体化医疗的目标。

基因检测通过分析个体的基因组信息,可以提供有关个体疾病风险、药物反应等方面的信息,为医生制定个体化的治疗方案提供重要参考。

然而,随着精准医学的发展,人们也逐渐意识到基因检测在实践中仍然存在一些挑战和不足之处。

本文将探讨基因检测在精准医学时代下的创新与不足。

首先,基因检测在健康管理方面有很大潜力。

通过基因检测,可以提前了解个体患病的风险,并采取有针对性的预防和干预措施,从而达到早期诊断和预防的目的。

比如,BRCA1和BRCA2基因突变与乳腺癌和卵巢癌的发生有密切关联,如果患者通过基因检测得知自己携带这些突变,可以采取预防措施,如定期进行乳腺和卵巢癌筛查,选择预防性手术等,从而尽可能避免患病的风险。

其次,基因检测在个体化药物治疗方面也发挥着重要作用。

基因检测可以帮助医生预测患者对某些药物的反应,这对于选择合适的药物剂量和优化治疗效果非常重要。

例如,对于华法林这种抗凝药物,CYP2C9和VKORC1基因的突变会影响华法林的代谢和疗效,基因检测可以帮助医生确定合适的药物剂量,减少不良反应和提高疗效。

此外,基因检测在个体健康管理和疾病预测方面也有许多创新。

随着高通量测序技术的发展和成本的降低,基因检测的可行性和可及性越来越高。

研究人员正在利用大规模基因检测数据来构建预测模型,用于预测个体发生某种疾病的风险。

通过对大规模基因检测数据的深度分析,可以识别出与疾病相关的新的遗传变异和基因表达谱,这有助于对疾病的发生机制进行更深入的研究,并为疾病预测和干预提供更精确的依据。

然而,尽管基因检测在精准医学时代下有很多创新,但也存在一些挑战和不足之处。

首先,基因检测的准确性和可靠性仍然是一个问题。

基因检测需要对个体的基因组进行测序和分析,这个过程中可能会出现测序错误、数据分析误差等问题,从而影响结果的准确性。

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基因组时代临床医生如何做到精准诊断遗传性肾脏病摘要虽然临床医生通过诊断性实验室(遗传检测机构或实验室)所提供的新的遗传学技术如二代测序及染色体芯片等极大地提高了对遗传性肾脏病的诊断,然而,要做到精准诊断此类疾病,首先需要临床医生能识别出可能的此类疾病患者,然后在熟知各种遗传检测方法的基础上依据患者表型选择恰当的分子诊断技术手段和合适的组织标本进行检测,获得的遗传检测报告需结合患者的表型、可能的遗传模式以及共识指南等进行临床解读,与此同时发挥研究性实验室功能,通过应病而设的技术方法解决诊断性实验室无法解决的特殊问题,最终为患者及其家庭提供精准诊治意见。

遗传性肾脏病广义上是指由于遗传物质结构或功能改变所导致的肾脏疾病;狭义上则指由于遗传物质结构或功能改变所致、按一定方式垂直传递、后代中常常表现出一定发病比例的肾脏疾病。

此类疾病按照遗传病的分类可分为染色体病、单基因病、多基因病、线粒体病和体细胞遗传病,按照累及肾脏部位分为肾小球病、肾小管病、肾小管间质病、肾血管病、肾脏尿路畸形、肾囊肿和肾脏肿瘤。

自遗传学进入肾脏病领域的近40年里,遗传学、分子生物学和生物信息学的飞速发展带动并促进了对遗传和肾脏疾病关系的认识,且实现了对遗传性肾脏病的分子诊断。

研究显示,遗传性肾脏病是成人慢性肾脏病最严重阶段终末期肾病五大常见原因之一,约占25岁前起病的慢性肾脏病患者的20%,占儿童肾移植患者的30%,可见遗传性肾脏病并不罕见。

然而,此类疾病种类繁多,起病隐匿,临床表现常不特异,甚至直至进展至终末期肾病时才被发现,因此早期、及时确切的诊断此类疾病成为亟待解决的临床问题。

新的遗传学技术如二代测序和基因芯片在临床实践中的广泛应用,提高了临床医生对遗传性肾脏病的诊断,但由此也产生了一系列问题,如哪些肾脏病需要分子诊断,如何选择合适的遗传检测方案,如何基于临床对诊断性实验室出具的遗传检测报告进行解读等。

显然这些问题的解决是做到精准诊断遗传性肾脏病的关键一步,需要临床医生在提高对遗传性肾脏病识别力的基础上,掌握并及时更新遗传学知识,且与专业的实验检测专家、生物信息学家、遗传学家合作,充分发挥研究性实验室作用,进而为每一位患病个体及所在家庭的精准诊断、客观遗传咨询提供科学严谨的依据。

一、分子诊断的适应证遗传检测的诊断价值仅限于具有遗传病因的疾病。

也就是说,遗传检测适用于肾脏科医生依据专业知识高度怀疑某种肾脏病为遗传病。

然而,如果将遗传检测作为除外某种肾脏病系遗传原因所致则是不合适的。

详细地收集表型(包括病史、体格检查、生化检查、肾组织病理检查、影像学检查以及家族史调查)对判断肾脏病有无遗传病因必不可少。

相当数量的遗传性肾脏病在儿童期甚至婴儿期、胎儿期就出现症状,因此起病年龄早,特别是当临床对某种肾脏病诊断不清楚时往往被作为怀疑遗传病的依据之一。

伴有肾外表现的肾脏病、双侧先天性肾脏尿路畸形、对包括激素在内的多种免疫抑制剂都耐药的肾病综合征以及有家族聚集现象的肾脏病均提示遗传病的可能。

依据肾活检组织的特异性病理改变及一些生化检查如血乳酸水平、半乳糖苷酶α活性等可明确诊断某些肾脏病为遗传病。

然而值得注意的是,对于小家系、呈常染色体隐性遗传的肾脏病和新发变异引起的肾脏病而言,通常缺乏家族史;遗传性肾脏病临床表现多样,而肾脏科医生关于此类疾病的认识往往基于小样本患者,且此类疾病的儿童患者可能尚未表现出有诊断价值的症状或肾脏病理改变,临床中采用的确诊方法非标准化等,造成临床医生很难判断某种肾脏病是否为遗传病,从而借助遗传检测寻找病因,而比较低的遗传检测阳性率则会误导临床医生放弃遗传性肾脏病的诊断。

此外,改善全球肾脏病预后组织在2017年活体供肾者的评估与护理指南指出,潜在活体供肾者患有导致肾衰竭的遗传性肾脏病时不可以作为捐献者。

因此,建议潜在活体供肾者进行遗传检测,一则可以指导供体选择,再则有助于判断肾脏预后。

二、遗传检测方案的选择目前在临床实践中用于分子诊断遗传性肾脏病的检测方法主要是基于基因组DNA水平的分析,而基于目标基因mRNA水平及编码蛋白水平的分析极少。

基于基因组DNA水平的检测方法大到可以检测染色体核型,小到可以检测基因中单个碱基的改变。

目前常用的遗传检测方案包括对基因变异的检测和对拷贝数变异的检测。

其中对基因变异的检测通过一代测序和二代测序,二代测序又包括目标序列靶向捕获测序、全外显子组测序和全基因组测序;对拷贝数变异的检测主要通过染色体微阵列分析。

国内外已有文章就上述遗传检测技术的优点、缺点及适用范围进行了详细的论述。

遗传检测方案的选择必须基于患者的临床表现,因此要求对患者进行深入细致的临床评估。

如果所怀疑的遗传性肾脏病致病基因仅1个或几个,可以选择一代测序或特定疾病目标序列靶向捕获测序,如果因多器官畸形而怀疑基因组病则选择染色体微阵列分析,如果临床评估无定论但又高度怀疑遗传性肾脏病、表型具有高度遗传异质性或特定疾病目标序列靶向捕获测序结果阴性时可选择孟德尔遗传病目标序列靶向捕获测序、全外显子组测序或全基因组测序。

三、遗传检测报告的临床解读尽管目前诊断性实验室出具的遗传检测报告依据美国医学遗传学与基因组学学会(American College of Medical Genetics,ACMG)2015年"序列变异解读标准和指南"并结合人群与疾病数据库和生物信息分析工具对变异进行了分级与评价,但是并不能直接用于临床诊断,还必须评估变异是否与患者的临床表现一致。

临床医生在对一份遗传检测结果进行有关变异致病性、遗传方式及与疾病关系的解读时需注意以下特殊情况。

1.致病性变异判断方面:(1)当全外显子组或目标序列靶向捕获测序检测报告提示结果阴性,然而临床高度怀疑肾脏病与某个单基因有关时,要考虑到基因深部内含子和非翻译区的变异。

目前全外显子组或目标序列靶向捕获测序仅检测分析与外显子交界20个碱基左右的内含子区域,无法覆盖深部内含子,而非翻译区的变异在数据初始分析时往往被过滤掉。

由于目前对非编码区的研究较少,可供参考的注释数据不多,若怀疑上述位置存在致病性变异时,需要同时进行功能实验,可以提取能表达待检测基因的组织RNA进行深度测序,或将RNA逆转录为cDNA 进行一代测序,从而明确非编码区是否存在致病性变异。

(2)往往认为同义变异不会导致所编码氨基酸的改变,因此多数同义变异在分析数据时会被过滤掉,仅有位于外显子首位或末位的同义变异因有可能影响剪接而被关注;而在评价错义变异的影响时会综合参考编码氨基酸的进化保守性、正常及疾病人群数据库及生物信息学工具预测的结果。

然而已有研究显示,非外显子首末位的同义和错义变异也可以改变剪接位点,影响mRNA的生成。

一些功能预测软件如Human Splicing Finde、MutPred和MaxEntScan可以预测变异对剪接的影响,但预测的效能及准确性有限,可以通过体外微小基因实验模拟体内剪接过程,对临床意义不明的同义、错义变异功能进行分析。

(3)虽然剪接位点变异在ACMG证据等级中被分为无功能变异(极强致病性变异证据),但一定需要通过RNA或蛋白质功能分析确认;当剪接位点变异导致框内缺失或插入,使得蛋白质的关键结构域得到保留,那么证据等级会因此降低(中等致病性变异证据)。

2.家系共分离分析确定变异来源并判断是否符合预期的遗传模式:(1)新发变异是指子代基因组中存在的不同于父母基因组的变异,一般来自父母生殖腺嵌合(精子或卵子)或受精卵发育过程中的自发变异。

判定新发变异患儿的父母下一胎再患病概率时,需要考虑到父母生殖细胞嵌合体的存在,这类患者再发风险取决于变异在生殖细胞发生的时间及变异细胞的比率。

(2)非经典孟德尔遗传现象如单亲二体。

单亲二体是指同源染色体或染色体上的部分片段均来源于父母中的一方,是卵子或精子形成期间或者是在胎儿早期发育中发生的随机事件,发病率较低,约为1/3 500。

单亲二体可导致隐性基因发生纯合变异。

因单亲二体导致的常染色体隐性遗传病呈非经典的孟德尔遗传模式,隐性致病基因仅来自父母一方;由于单亲二体是随机事件,因此下一胎再患病概率小,在解读基因报告和进行遗传咨询时应引起注意。

(3)考虑常染色体隐性遗传性肾脏病的先证者通过靶向二代测序或一代测序检测到致病基因纯合变异,而父母外周血DNA经一代测序或定量PCR 分析却仅在一方找到相应位点的杂合变异时,应考虑到潜在的遗传病理机制,包括点突变伴重叠区域外显子大片段缺失、单亲二体、生殖细胞嵌合、新发变异和等位基因脱扣。

3.分析表型特点与序列变异关系时需要注意:(1)外显不全,并不是所有含显性致病基因致病性变异的个体都出现临床表现,这可能和生长发育、年龄和性别相关。

(2)表现度差异,致病基因可引起不同患儿临床表现及严重程度不同。

四、研究性实验室助力精准诊断遗传性肾脏病遗传性肾脏病精准诊断需要团队合作,需要临床医生、分子遗传学家、诊断性实验室和研究性实验室的专家保持密切的沟通和合作,最好定期共同就每例进行遗传检测的患者予以"剥丝抽茧"分析和讨论。

诊断性实验室无法解决上述提及的遗传检测报告临床解读注意的特殊情况,而研究性实验室则可有机地结合患儿、应疾病需要而设实验方案,对特殊问题进行求证、解决。

常染色体隐性遗传病由位于同源染色体等位基因的纯合或复合杂合致病性变异引起,而真正的纯合变异更可能发生在近亲婚配的家庭中。

北京大学第一医院儿科近期一项研究显示[15],6例来自非近亲婚配家庭的患有常染色体隐性遗传性肾脏病的先证者发现"特殊"纯合变异,即先证者通过二代测序或一代测序检测到致病基因纯合变异,但经验证后仅在父母一方发现相同变异,显然这与传统的孟德尔遗传规律不符,很难对先证者同胞复发风险作出准确评估。

而在研究性实验室中通过更换引物后重复测序、单体型分析、基因组实时定量PCR和单核苷酸多态性分析的方法,证明了点突变伴重叠区域外显子大片段缺失、单亲二体、生殖细胞嵌合或新发变异是上述"特殊"纯合变异的遗传病理机制,进而为临床医生关于此类疾病有效的个性化管理、遗传咨询提供了科学依据,同时亦强调了基于亲代DNA变异的分离分析至关重要;二代测序提供的遗传结果必须谨慎解释,必要时应由生物信息学分析人员重新审查原始数据。

对COL4A5基因已报道,且在多个人群数据库(包括dbSNP数据库、千人数据库和ESP6500基因组数据库)中频率极低的变异c.2858G>T(p.G953V)基于中国人重新评估致病性的研究显示[16],该变异不是导致X连锁Alport综合征致病性变异,在中国人中的频率可达0.0113。

研究结果提示对已报道的致病性变异的解读必须结合患者的临床表现,且需注意人群数据库中某变异在不同种族中发生频率不同。

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