第六章DNA的损伤与修复共89页
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DNA的损伤和修复

简称AP位点。
C 碱基的互变异构
由于碱基氢原子位置的可逆性变化,导致基因发生 酮式-烯醇式或氨式-亚氨式间的结构互变。 导致A-C错配或G-T错配。
3 自由基对DNA的氧化损伤
O2.,OH. ,H2O2等
如:造成DNA链上脱氧戊糖C-3或C-5磷脂键断裂。
自由基还可引起碱基损伤或脱落。
二、物理因素引起的DNA损伤
指DNA分子内发生较大片段的交换,也称为重组。
移位的DNA可以在新位点上颠倒方向反置(倒位), 也可以在染色体之间发生交换重组。
二、突变的意义
1. 突变是进化、分化的分子基础
进化过程是突变的不断发生所造成的。
没有突变就没有今天的五彩缤纷的世界。 遗传学家认为:没有突变就不会有遗传学。
大量的突变都属于由遗传过程自然发生的,
叫自发突变或自然突变(spontaneous mutation)。
•
由于基因突变产生的新性状是生物 从未有过的性状,因此它是
• • •
产生新基因的途径, 生物变异的根本来源, 为生物进化提供了原始的材料。
2. 突变导致基因型改变
突变只改变基因型,而无可察觉的表型改变。
多态性 (polymophism):是用来描述个体之间的基因 型差别现象。利用DNA多态性分析技术,可识别个体差
碱基对组成或排列顺序的改变。
时间:DNA复制时期,即细胞(有丝和减数)分裂间期。
基因的精确复制是相对的。一定的条件下基因结构发生变化变成一个新基因(突变基因)。 于是后代的表现型中也就出现祖先了从未有的新性状
基因突变
插入
┯┯┯┯ ATGC TACG ┷┷┷┷
缺失 替换
┯┯┯┯┯ ATAGC TATCG ┷┷┷┷┷ ┯┯┯ AGC TCG ┷┷┷ ┯┯┯┯ ACGC TGCG ┷┷┷┷
C 碱基的互变异构
由于碱基氢原子位置的可逆性变化,导致基因发生 酮式-烯醇式或氨式-亚氨式间的结构互变。 导致A-C错配或G-T错配。
3 自由基对DNA的氧化损伤
O2.,OH. ,H2O2等
如:造成DNA链上脱氧戊糖C-3或C-5磷脂键断裂。
自由基还可引起碱基损伤或脱落。
二、物理因素引起的DNA损伤
指DNA分子内发生较大片段的交换,也称为重组。
移位的DNA可以在新位点上颠倒方向反置(倒位), 也可以在染色体之间发生交换重组。
二、突变的意义
1. 突变是进化、分化的分子基础
进化过程是突变的不断发生所造成的。
没有突变就没有今天的五彩缤纷的世界。 遗传学家认为:没有突变就不会有遗传学。
大量的突变都属于由遗传过程自然发生的,
叫自发突变或自然突变(spontaneous mutation)。
•
由于基因突变产生的新性状是生物 从未有过的性状,因此它是
• • •
产生新基因的途径, 生物变异的根本来源, 为生物进化提供了原始的材料。
2. 突变导致基因型改变
突变只改变基因型,而无可察觉的表型改变。
多态性 (polymophism):是用来描述个体之间的基因 型差别现象。利用DNA多态性分析技术,可识别个体差
碱基对组成或排列顺序的改变。
时间:DNA复制时期,即细胞(有丝和减数)分裂间期。
基因的精确复制是相对的。一定的条件下基因结构发生变化变成一个新基因(突变基因)。 于是后代的表现型中也就出现祖先了从未有的新性状
基因突变
插入
┯┯┯┯ ATGC TACG ┷┷┷┷
缺失 替换
┯┯┯┯┯ ATAGC TATCG ┷┷┷┷┷ ┯┯┯ AGC TCG ┷┷┷ ┯┯┯┯ ACGC TGCG ┷┷┷┷
DNA的损伤和修复ppt课件

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(a)亚硝酸修饰G、C、A;(b)羟基修饰C;(c)甲基磺酸乙酯修饰T(引自Russell,1992).
3、嵌入染料对DNA的损伤作用
吖啶橙 (Acridine Orange AO) 溴化乙锭 (Ethidium Bromide EB )
扁平染料分子
分子插入
TAO T
-A
TTTCG -
-ATTTTTCG - AO -T
❖ 自由基可导致碱基、核糖、磷酸基的损伤,引起DNA的结构和 功能异常。
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7
(三)化学毒物致DNA损伤
❖ 按其作用原理可分为: 碱基类似物 碱基修饰物 嵌入染料
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8
1、碱基类似物(Base analog)
是指与DNA正常碱基结构类似的化合物,在DNA复制时掺入并与 互补链上碱基配对,从而引起碱基对的置换.
❖ 常见的DNA修复方式:直接修复、切除修复、错配修复和重 组修复
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21
(一)直接修复
❖ 直接修复
❖
细胞对DNA的某些损伤可以用很简单的方式加以修复
在单一基因产物的催化下,一步反应就可以完成。这种修复
方式叫直接修复。
包括:酶光学复活、嘌呤的直接插入、O6-甲基鸟嘌呤- DNA甲基转移、单链断裂重接等。
常见的损伤有:碱基脱落、碱基破坏、嘧啶二聚体形成、单链和 双链DNA断裂、DNA交联、DNA-蛋白质交联等。
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14
(一) 碱基和核糖的破坏
❖ 由于碱基或者核糖的损伤,在DNA链上形成不稳定位点,最 终可导致DNA链的断裂。
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16
(二)错配
《DNA的损伤和修复》PPT课件

1. 转换 (transition):
同型碱基间的置换: 嘌呤代替另一嘌呤,嘧啶代替另一嘧啶
2. 颠换 (transversion):
异型碱基间的置换:嘌呤变嘧啶,嘧啶变嘌呤
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6
点突变-镰刀型红细胞贫血
正常红细胞
镰刀型红细胞
整理ppt
7
血红蛋白HB基因发生碱基对置换,导致红细胞形状改变。
显性致死:杂合态即有致死效应。 隐性致死:纯合态时才有致死效应
4)条件致死突变:
在某些条件下致死,而在另些条件下成活的突变。
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24
(二)从对遗传信息的改变:
1)同义突变:
碱基置换后,原密码子变成了另一个密码子,但由于密码子
的兼并性,因而改变前、后密码子所编码的氨基酸不变,故
实际上不会发生突变效应。
DNA的损伤与修复
刘国红
整理ppt
1
第一节 DNA损伤的概念、类型、意义
整理ppt
2
一 DNA损伤的概念
DNA损伤 (DNA damage) :
DNA复制过程中发生的DNA核苷酸序列的改变。 从分子水平看,指DNA分子碱基顺序或数目的改变。
DNA损伤又称基因突变(gene mutation):
2-氨基嘌呤(2-AP)
整理ppt
47
5-BU是胸腺嘧啶(T)的结构类似物, 酮式结构易与A配对;烯醇式结构易与G配对。 两轮复制后,A-T替换为G-C.或G-C替换为A-T.
酮式
烯醇式
整理ppt
48
2-AP是腺嘌呤A的类似物, 既可与T配对,也可与C配对。 A.T→ 2-AP.T→2-AP.C→G.C
1945.8 日本广岛、长崎原子弹事件,当地居民受核辐射影响,肿瘤、 白血病的发病率明显增高。
同型碱基间的置换: 嘌呤代替另一嘌呤,嘧啶代替另一嘧啶
2. 颠换 (transversion):
异型碱基间的置换:嘌呤变嘧啶,嘧啶变嘌呤
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6
点突变-镰刀型红细胞贫血
正常红细胞
镰刀型红细胞
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7
血红蛋白HB基因发生碱基对置换,导致红细胞形状改变。
显性致死:杂合态即有致死效应。 隐性致死:纯合态时才有致死效应
4)条件致死突变:
在某些条件下致死,而在另些条件下成活的突变。
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24
(二)从对遗传信息的改变:
1)同义突变:
碱基置换后,原密码子变成了另一个密码子,但由于密码子
的兼并性,因而改变前、后密码子所编码的氨基酸不变,故
实际上不会发生突变效应。
DNA的损伤与修复
刘国红
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1
第一节 DNA损伤的概念、类型、意义
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2
一 DNA损伤的概念
DNA损伤 (DNA damage) :
DNA复制过程中发生的DNA核苷酸序列的改变。 从分子水平看,指DNA分子碱基顺序或数目的改变。
DNA损伤又称基因突变(gene mutation):
2-氨基嘌呤(2-AP)
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47
5-BU是胸腺嘧啶(T)的结构类似物, 酮式结构易与A配对;烯醇式结构易与G配对。 两轮复制后,A-T替换为G-C.或G-C替换为A-T.
酮式
烯醇式
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48
2-AP是腺嘌呤A的类似物, 既可与T配对,也可与C配对。 A.T→ 2-AP.T→2-AP.C→G.C
1945.8 日本广岛、长崎原子弹事件,当地居民受核辐射影响,肿瘤、 白血病的发病率明显增高。
DNA损伤与修复ppt课件

生物多样性依赖于:
平衡 DNA突变
DNA修复
第一节
DNA损伤
DNA Damage
一、多种因素通过不同机制导致DNA损伤
(一)体内因素
DNA复制错误 DNA自身的不稳定性 机体代谢过程中产生的活性氧
DNA复制错误:
在DNA复制过程中,碱基的异构互变、4种dNTP之间浓度 的不平衡等均可能引起碱基的错配 DNA复制的错配率约1/1010 复制错误还表现为片段的缺失或插入。 特别是DNA上的短片段重复序列,在真核细胞染色体上 广泛分布,导致DNA复制系统工作时可能出现“打滑” 现象,使得新生成的DNA上的重复序列拷贝数发生变化。 亨廷顿病、脆性X综合征、肌强直性营养不良等。
E.coli的NER主要由4种 蛋白质组成: UvrA UvrB UvrC UvrD
人类的DNA损伤核苷酸切除修复
① 首先由损伤部位识别蛋白XPC和XPA等,再加上DNA 复制所需的SSB,结合在损伤DNA的部位;
② XPB、XPD发挥解旋酶的活性,与上述物质共同作用 在受损DNA周围形成一个凸起;苷酸修复错配系统:
•MSH(MutS homologs)蛋白 •与MutL同源的MLH和PMS蛋白
•真核细胞错配修复系统即无MutH蛋白,也无半 甲基化标记母链。 •错配修复系统利用冈崎片段连接前的DNA缺口 辨别错配碱基所在的DNA链。
三、DNA严重损伤时需要重组修复
DNA自身的不稳定性 :
DNA结构自身的不稳定性是DNA自发性损伤中最频繁和 最重要的因素。 当DNA受热或所处环境的pH值发生改变时, DNA分子上 连接碱基和核糖之间的糖苷键可自发发生水解,导致碱基 的丢失或脱落,其中以脱嘌呤最为普遍。 含有氨基的碱基还可能自发脱氨基反应,转变为另一种碱 基,即碱基的转变,如C转变为U,A转变为I(次黄嘌呤) 等。
DNA损伤与修复

与DNA修复有关的人类遗传疾病:
• 着色性干皮病(Xeroderma pigmentosum) • 布伦氏症候群(Bloom’s syndrome) • 遗传性大肠癌(Hereditary nonpolyposis colon
cancer;HNPCC)
着色性干皮病
(Xeroderma pigmentosum)
重组修复
☆ DNA于复制时会越过受损区域进行复制
☆ 经重组修复,受损的DNA仍然存在于子代的 一个细胞中。
☆ 重组修复不会浪费时间, 重组修复可让负 伤的DNA在细胞中仍可照常进行分裂。
重组修复
根据 DNA 末端连接需要的同源性,分为
• 非同源末端连接:DNA分子之间不需要广泛的同 源性,主要是在免疫球蛋白重组时对DNA双链进 行连接,在细胞有丝分裂G1/G0期起主要作用。
第六章 DNA损伤与修复 DNA damage and repair
分子生物学研究中心
第一节 DNA损伤的原因及后果
电离辐射 烷化剂
可 见 光
复制错误
核苷类似物
H+
mC
P/
8-oxoG
U
P
DNA 损伤类型
• 碱基脱落 • 碱基修饰 & 去氨基化
• 化学修饰 • 光损伤
• 链内交联 • DNA-蛋白质 交联 • DNA链断裂
二、切除修复相关的酶和基因 •尿嘧啶糖基化酶为主要的始动因素,可作 为DNA损伤的生物标记物。
•大肠杆菌Uvr基因家族、人ecrr基因和切除 修复基因等
三、错配修复相关基因 •MSH2、MLH1等蛋白参与错配修复,而错
配修复的缺陷往往是癌变的第一步。
•错配修复基因:Muthls系统、人类的hmsh2/3、
第六章 DNA的损伤与修复

(3) 嵌合剂的致突变作用。
嵌合染料是另一类重要的DNA修饰剂。包括丫啶橙 (acridine orange)、原黄素(proflavin)、叮黄素 (acriflavine)等染料。 这些试剂为平面分子,其分子大小与碱基对大小差不 多,可以嵌入到DNA双链碱基对之间,在嵌入位置上引起 单个碱基对的插入或缺失突变。嵌合染料也能嵌入单链 DNA的碱基之间,这些突变都会引起阅读框的改变,造成 移码突变。
p53 当UVB损伤DNA造成p53突变后,突变型p53因 失去了对细胞周期的正常调控,使得损伤的DNA 继续复制,从而提高了染色体畸变的偶发率和遗 传的不稳定性,角质形成细胞极易发生克隆增生 和恶性转化。
着色性干皮病(xeroderma pigmentosis,XP) 是一种切除修复有缺陷的遗传性疾病。在研 究其发病机制时,发现一些相关的基 因,称为 XPA、XPB、XPC等。这些基因的表达产物起辨 认和切除损伤DNA的作用。 XP病人是由于XP基因有缺陷,不能修复紫外 线照射引起的DNA损伤,因此易发生皮肤癌。
现象:U和A在复制中配对 C自发脱氨基氧化而生成U
修复机制:尿嘧啶-N-糖基酶系统 参与的酶:尿嘧啶-N-糖基酶
AP内切核酸酶 (AP endonucleases ) DNA聚合酶 II 脱嘌呤/ 嘧啶位点(AP 位点) DNA连接酶
修复机制: 尿嘧啶-N-糖基酶系统
2. 错配修复系统(mismatch repair system, MRS)
现代生活环境使人可能接触各种各样药品、化妆品、食物 防腐剂、杀虫剂、工业用试剂、污染物等,其中很多化合物已 被证明具有致癌性质。 研究表明在175种已知的致癌剂中,有157种是诱变剂。这 些物质是通过诱导体细胞突变而致癌的。例如食物防腐剂AF-2。 食物熏蒸剂二溴乙烯、抗血吸虫药物、多种染发添加剂以及工 业化合物氯乙烯等都具致癌性。 因而要靠科学治理环境,保护环境就是保护人类自身。
DNA的损伤、修复

在插入酶的催化下,以正确 插入酶的催化下, 的催化下 的碱基插入空位, 的碱基插入空位,修复 DNA
聚合酶的催化下 的催化下, 在 DNA 聚合酶的催化下,以 互补链为模板, 互补链为模板,合成新的单链 片段以填补缺口 片段以填补缺口
连接酶催化连接片段 催化连接片段, 由 DNA 连接酶催化连接片段, 封闭缺口
(一)引起DNA损伤的因素: 引起DNA损伤的因素: DNA损伤的因素 自发因素: 1.自发因素: 1).脱嘌呤和脱嘧啶 DNA分子通过自发水解 经常发生脱嘧 分子通过自发水解经常 DNA 分子通过自发水解 经常 发生脱嘧 啶和脱嘌呤反应, 啶和脱嘌呤反应 , 使嘌呤碱和嘧啶碱从 DNA分子的 脱氧核糖分子的脱氧核糖 DNA 分子的 脱氧核糖 - 磷酸骨架上脱落下 来。 例如,在腺嘌呤和鸟嘌呤的N 例如,在腺嘌呤和鸟嘌呤的N- 9及脱 氧核糖C 之间的N 糖苷键常发生自发 氧核糖C-1′之间的N-糖苷键常发生自发 水解反应而断裂, 从而失去嘌呤碱基, 水解反应而断裂 , 从而失去嘌呤碱基 , 使该嘌呤碱基所编码的遗传信息丢失。 使该嘌呤碱基所编码的遗传信息丢失。
特异性的核酸内切酶识别 特异性的核酸内切酶识别 DNA 核酸内切酶 的损伤部位, 的损伤部位,并在该部位的 5' 端作一切口
糖苷酶识别受损伤的 DNA 糖苷酶识别受损伤的 碱基, 碱基,并将该碱基切除
由核酸外切酶(或 DNA 聚合 核酸外切酶( 5'→3'端逐一切除损 酶Ⅰ)从 5'→3碱基的脱氨基作用 碱基中的胞嘧啶(C)、腺嘌呤(A)和 鸟嘌呤(G)都含有环外氨基,氨基有时 会自发脱落,从而使胞嘧啶变为尿嘧啶 (U),腺嘌呤变为次黄嘌呤(I), 鸟嘌 呤变为黄嘌呤(X)。 这些脱氨基产物的配对性质与原来的 碱基不同,即U与A配对,I和X均与C配对。 而且DNA复制时,它们将会在子链中产生 错误而导致DNA损伤。
分子生物学:第6章 DNA损伤与修复

DNA损伤的后果
点突变 缺失 插入 到位或转座 断裂
* 突变可以是进化上的需要。有意义,无意义。
DNA Repair
DNA repair
• Direct repair • Excision repair • Mismatch repair • Recombination repair • SOS system
• 紫外线 • DNA被小于260nm波长紫外线照射时,形
成嘧啶二聚体。也能产生DNA断裂。
TT, CC, TC 二聚体
AT互换
• 1.Ultraviolet irradiation
• A- T became T-T
电离辐射引起DNA损伤
电离辐射产生电离辐射的直接和间接作用,导 致碱基改变、互换,脱落或修饰、脱氧核糖变化、 DNA单双链断裂 或交联(DNA-DNA,DNA-蛋白 质)。
O
RN
P
O
RN
O
N
N
O
RN
O
UV
P N CH3
O Photolyase
RN
CH3
CH3 O
N
CH3
O
)
胸嘧啶二聚体 ( T T )
1) Remove damaged region
2) Resynthesis (再合成) DNA
3) Ligation(结扎)
BER
• Special enzymes replace just the defective(错误的) base
DNA复制误差
核苷酸错误掺入: 掺入率 为10-10 DNA聚合酶使用核酸外切酶活性
C
A
碱基错配
自主突变
碱基异构突变:核苷酸上碱基互换 脱氨基:环外氨基脱落C变成U,A变成H,G变成X。 脱嘌呤和脱嘧啶:嘌呤和嘧啶水解 碱基修饰与断链:自由基CH3、O2 和细胞代谢物
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改变一个碱基使之发生错配;破坏一个碱基使之在正常情况 下无法配对。
诱发突变与人类的癌症
黄曲霉素(AFB)引起肝癌,紫外线(UV)照射 会导致皮肤癌。
肿瘤抑制基因是一种编码抑制肿瘤形成的蛋白质 基因。如果发生突变则会致癌。对南非和东亚肝癌病 人的P53基因的分析发现,AFB特异性诱导G-T颠换, 引起P53发生突变,而在同一地区的肺癌、肠癌和乳 腺癌的病人中未发现此现象。
着色性干皮病(xeroderma pigmentosis,XP) 是一种切除修复有缺陷的遗传性疾病。
在研究其发病机制时,发现一些相关的基 因,称为 XPA、XPB、XPC等。这些基因的表达产物起辨认和切 除损伤DNA作用的。
XP病人是由于XP基因有缺陷,不能修复紫外线 照射引起的DNA损伤,因此易发生皮肤癌。
移码突变(frame-shift mutation): 由于插入或缺失突变引起DNA的阅读框(ORF)发生改
变,从而产生不同蛋白质的过程。
(3) 倒位 (inversion) 或转位(translocation)
DNA重组使其中一段核苷酸倒置,或从一处迁移到另一处。
(4) 双链断裂
2. 突变后果
修复DNA损伤的能力是生物能保持遗传稳定性 所在;
DNA分子的变化并不是全部都能被修复成原样 的,因此生物才会有变异、有进化。
5.1 DNA损伤的原因
5.1.1 DNA分子自发性损伤
1. DNA复制中的错误
碱基配对的错误概率约为10-1_10-2;在DNA聚合酶 的校对作用下,错配概率降到10-5_10-6 ;
(3) 嵌合剂的致突变作用。
嵌合染料是另一类重要的DNA修饰剂。包括丫啶橙 (acridine orange)、原黄素(proflavin)、叮黄素 (acriflavine)等染料。
这些试剂为平面分子,其分子大小与碱基对大小差不 多,可以嵌入到DNA双链碱基对之间,在嵌入位置上引起 单个碱基对的插入或缺失突变。嵌合染料也能嵌入单链 DNA的碱基之间,这些突变都会引起阅读框的改变,造成 移码突变。
(1)致死性:
突变发生在对生命至关重要的基因上, 可导致个体或细胞的死亡。
致死突变:严重影响生物体生活力,导致个 体死亡的突变。
可分为显性致死突变(杂合态即可致死)和 隐性致死突变(纯合态才致死)。
(2)基因功能的改变
突变是某些疾病的发病基础 包括遗传病、肿瘤及有遗传倾向的病。 有些已知其遗传缺陷所在。 但大多数尚在研究中。
突变影响生物的代谢过程,导致一个特定生 化功能的改变或丧失。如微生物的营养缺陷型。
突变导致生物体外观上可见的形态结 构的改变。例如果蝇的红眼→白眼突变:
例: UVB 所致的基因突变 UVB: 290-320nm
由于修复系统的缺陷或偶发的错误修复,则会 导致某些基因突变,使得角质形成细胞的细胞 周期的调控出现异常,进一步发生克隆性增生 和永生化生长而导致皮肤癌的发生。
度整整富集了1000万倍。 如果人吃了鱼或鹰,那么人体内DDT富集量更是高得可怕。会
引起突变
“低剂量、长期暴露的蓄积作用”
(3)突变导致基因型改变:
这种突变只有基因型的改变,而没有可察觉的表 型改变。
多态性 (polymorphism):
是用来描述个体之间的基因型差别现象。利用 DNA多态性分析技术,可识别个体差异和种、株间差 异。
1. 突变类型
(1) 点突变(point mutation)
DNA单一碱基的变异 转换(transition):嘌呤与嘌呤、嘧啶与嘧啶之间替换 颠换(transvertion):嘌呤与嘧啶之间的替代
野生型等位基因:将自然界中普遍出现或指定实验用的某一 品系的性状作为“野生型”或“正常”的性状,与这种性状 相关的等位基因称为野生型等位基因。
通常以酮式存在,有时也以烯醇式存在。当BU先以酮式掺 入DNA,继而又变成烯醇式时,进一步复制使DNA中 A- T对变成 G- C对。同样道理也引起 G- C向 A- T的转换,BU可以使细菌 的突变率提高近万倍。
除BU外,还有5-溴脱氧尿苷、5-氟尿嘧啶、5-氯尿嘧 啶及它们的脱氧核苷。
另一种被广泛应用的碱基类似物是2-氨基嘌呤(2AP),是一种腺嘌呤A类似物,可和胸腺嘧啶T配对。可 再和胞嘧啶C 配对,产生A-T 、G-C的转换,或2-AP以和 胞嘧啶C 配对形式进入DNA后再和胸腺嘧啶T 配对后产生 G-C、A-T的转换。
4. 诱发突变
概念:
由各种诱变剂诱发的DNA的突变。每一种诱变剂有其对 应的特异性(如对G-C,A-T转换)和对特定的突变位点的 偏好,例如:甲磺酸乙酯(EMS)和紫外线(UV)“偏好” G-C, A-T转换,黄曲霉素B1(AFB1)则偏好于C-G,AT颠换。
诱变机制: 诱变剂通过3种机制诱发突变:取代DNA中的一个碱基;
3. 化学因素引起的DNA损伤
(1)碱基类似物、修饰剂对DNA的损伤 (2)烷基剂对DNA的损伤 (3)嵌合剂对DNA的损伤。
(1) 碱基类似物对DNA的损伤
某些化学物质和正常的碱基在结构上类似,有时会替代 正常碱基而掺入DNA分子,一旦这些碱基类似物进人DNA 后,由于它们的配对能力不同于正常碱基,便引起DNA复制 过程中其对应位置上插入不正确碱基。
黄曲霉素B1(aflatoxin B1,AFB1) 一种很强的致癌剂。 在鸟嘌呤 N-7位置上形成一加成复合物后产生无嘌呤位
点。修复要求SOS系统参与。SOS越过无嘌呤位点并在这些位 点对应处选择性插入腺嘌呤,使鸟嘌呤残基脱嘌呤的试剂偏向 于产生G-C T-A颠换。
现代生活环境使人可能接触各种各样药品、化妆品、食物 防腐剂、杀虫剂、工业用试剂、污染物等,其中很多化合物已 被证明具有致癌性质。
第六章
DNA的损伤与修复
The damage and repair of DNA
DNA损伤的概念:
DNA双螺旋结构发生的任何改变。
主要分为两种: 单个碱基的改变 双螺旋结构的异常扭曲
DNA损伤修复的重要性
DNA存储着生物体赖以生存和繁衍的遗传信息,
维护DNA分子的完整性对细胞至关紧要;
再经过DNA结合蛋白和其他因素作用下,错配率仍 在10-10。
(1)碱基的异构互变
DNA每种碱基有几种形式,称互变异构体, 异构体中原子的位置及原子之间的键有所不同。
碱基各自的异构体间可以自发发生变化(烯 醇式与酮基间互变);
A=C T=G 上述配对发生在DNA复制时,会造成子代 DNA序列与亲代DNA不同的错误损伤.
烷化剂的种类很多,常见的有甲磺酸乙酯(EMS)、亚硝 基胍(NG)和芥子气等。
EMS能使鸟嘌呤的 N位置上有乙基,成为7一乙基鸟嘌 呤。与胸腺嘧啶配对,故能使G-C转换成A-T。
烷化剂的另一作用是脱嘌呤。例如烷基在鸟嘌呤N位上 活化糖苷键引起断裂,使嘌呤从DNA链上脱掉,产生缺口。 复制时,与缺口对应的位点上可能配上任一碱基,从而引 起转换或颠换;而且去嘌呤后的DNA容易发生断裂,引起 缺失或其他突变。
研究表明在175种已知的致癌剂中,有157种是诱变剂。这 些物质是通过诱导体细胞突变而致癌的。例如食物防腐剂AF-2。 食物熏蒸剂二溴乙烯、抗血吸虫药物、多种染发添加剂以及工 业化合物氯乙烯等都具致癌性。
因而要靠科学治理环境,保护环境就是保护人类自身。
5.1.2 DNA损伤的后果
导致DNA分子结构变化(亦即发生突变) 生物体在表型上突变
例如 5-溴尿嘧啶(BU)和 5-溴脱氧尿嘧啶(BrdU)是T结 构类似物。细菌在含BU的培养基中培养时,部分DNA中的T被BU 取代,BU有两种互变异构体,一种是酮式结构(第6位上有一个 酮基),它可以代替T而掺入DNA,并与A配对;当BU发生互变异 构成为烯醇式(第6位上是一个羟基)后,就容易和G配对。
(2) 缺失(deletion)/ 插入(insertion)
DNA链上一个或一段核苷酸的消失或加入。
例如在 E.coli的lacl基因中发现一种 4个碱基序列(CTGG) 在野生型中连续重复了 3次。J. Miller等人研究了这个基因突 变热点(hot Spots)产生的原因。发现某些热点是由重复序列 引起的。所谓热点即一个基因中比其他位点更容易发生突变的 位点。
自发水解使嘌呤和嘧啶从DNA链的核糖磷酸骨架上脱落。
哺乳类动物细胞,在30ºC下,20h内DNA链自发脱落嘌呤 约1000个,嘧啶约500个。
(4)活性氧引起的碱基修饰与链断裂
细胞呼吸的副产物O2-, H2O2造成DNA损伤,产 生一些碱基修饰物(胸腺嘧啶乙二醇、羟甲基尿嘧 啶等),还可引起DNA单链断裂等损伤; 这些损失 的积累可导致老化。
胶联(binding)
同一条DNA链上或两条DNA链上的碱基间以共价键 结合;DNA与蛋白质之间也以共价键相连;组蛋白、染 色质中的非组蛋白、调控蛋白、与复制和转录有关的酶 都会与DNA以共价键连接。
胶联是细胞受电离辐射后在显微镜下看到的染色体 畸变的分子基础,会影响细胞的功能和DNA复制。
辐射引起DNA分子结构的多种变化
2. 物理因素引起的DNA损伤
(1)紫外线(UV)引起的DNA损伤 DNA受到大剂量紫外线(260nm)照射时,同一条链
上相邻的嘧啶以共价键连成二聚体;TT, CC, CT之间都 可形成二聚体。
复制时,此处产生 空耗过程,DNA不 能复制,细胞不能 分裂,导致凋亡。
紫外线引起的DNA损伤 --最易形成胸腺嘧啶二聚体(TT)
p53
当UVB损伤DNA造成p53突变后,突变型p53因 失去了对细胞周期的正常调控,使得损伤的DNA 继续复制,从而提高了染色体畸变的偶发率和遗 传的不稳定性,角质形成细胞极易发生克隆增生 和恶性转化。
有害物质富集 例: DDT在水环境中存在量仅为3×10-6ppm(mg/L)的时候,当
诱发突变与人类的癌症
黄曲霉素(AFB)引起肝癌,紫外线(UV)照射 会导致皮肤癌。
肿瘤抑制基因是一种编码抑制肿瘤形成的蛋白质 基因。如果发生突变则会致癌。对南非和东亚肝癌病 人的P53基因的分析发现,AFB特异性诱导G-T颠换, 引起P53发生突变,而在同一地区的肺癌、肠癌和乳 腺癌的病人中未发现此现象。
着色性干皮病(xeroderma pigmentosis,XP) 是一种切除修复有缺陷的遗传性疾病。
在研究其发病机制时,发现一些相关的基 因,称为 XPA、XPB、XPC等。这些基因的表达产物起辨认和切 除损伤DNA作用的。
XP病人是由于XP基因有缺陷,不能修复紫外线 照射引起的DNA损伤,因此易发生皮肤癌。
移码突变(frame-shift mutation): 由于插入或缺失突变引起DNA的阅读框(ORF)发生改
变,从而产生不同蛋白质的过程。
(3) 倒位 (inversion) 或转位(translocation)
DNA重组使其中一段核苷酸倒置,或从一处迁移到另一处。
(4) 双链断裂
2. 突变后果
修复DNA损伤的能力是生物能保持遗传稳定性 所在;
DNA分子的变化并不是全部都能被修复成原样 的,因此生物才会有变异、有进化。
5.1 DNA损伤的原因
5.1.1 DNA分子自发性损伤
1. DNA复制中的错误
碱基配对的错误概率约为10-1_10-2;在DNA聚合酶 的校对作用下,错配概率降到10-5_10-6 ;
(3) 嵌合剂的致突变作用。
嵌合染料是另一类重要的DNA修饰剂。包括丫啶橙 (acridine orange)、原黄素(proflavin)、叮黄素 (acriflavine)等染料。
这些试剂为平面分子,其分子大小与碱基对大小差不 多,可以嵌入到DNA双链碱基对之间,在嵌入位置上引起 单个碱基对的插入或缺失突变。嵌合染料也能嵌入单链 DNA的碱基之间,这些突变都会引起阅读框的改变,造成 移码突变。
(1)致死性:
突变发生在对生命至关重要的基因上, 可导致个体或细胞的死亡。
致死突变:严重影响生物体生活力,导致个 体死亡的突变。
可分为显性致死突变(杂合态即可致死)和 隐性致死突变(纯合态才致死)。
(2)基因功能的改变
突变是某些疾病的发病基础 包括遗传病、肿瘤及有遗传倾向的病。 有些已知其遗传缺陷所在。 但大多数尚在研究中。
突变影响生物的代谢过程,导致一个特定生 化功能的改变或丧失。如微生物的营养缺陷型。
突变导致生物体外观上可见的形态结 构的改变。例如果蝇的红眼→白眼突变:
例: UVB 所致的基因突变 UVB: 290-320nm
由于修复系统的缺陷或偶发的错误修复,则会 导致某些基因突变,使得角质形成细胞的细胞 周期的调控出现异常,进一步发生克隆性增生 和永生化生长而导致皮肤癌的发生。
度整整富集了1000万倍。 如果人吃了鱼或鹰,那么人体内DDT富集量更是高得可怕。会
引起突变
“低剂量、长期暴露的蓄积作用”
(3)突变导致基因型改变:
这种突变只有基因型的改变,而没有可察觉的表 型改变。
多态性 (polymorphism):
是用来描述个体之间的基因型差别现象。利用 DNA多态性分析技术,可识别个体差异和种、株间差 异。
1. 突变类型
(1) 点突变(point mutation)
DNA单一碱基的变异 转换(transition):嘌呤与嘌呤、嘧啶与嘧啶之间替换 颠换(transvertion):嘌呤与嘧啶之间的替代
野生型等位基因:将自然界中普遍出现或指定实验用的某一 品系的性状作为“野生型”或“正常”的性状,与这种性状 相关的等位基因称为野生型等位基因。
通常以酮式存在,有时也以烯醇式存在。当BU先以酮式掺 入DNA,继而又变成烯醇式时,进一步复制使DNA中 A- T对变成 G- C对。同样道理也引起 G- C向 A- T的转换,BU可以使细菌 的突变率提高近万倍。
除BU外,还有5-溴脱氧尿苷、5-氟尿嘧啶、5-氯尿嘧 啶及它们的脱氧核苷。
另一种被广泛应用的碱基类似物是2-氨基嘌呤(2AP),是一种腺嘌呤A类似物,可和胸腺嘧啶T配对。可 再和胞嘧啶C 配对,产生A-T 、G-C的转换,或2-AP以和 胞嘧啶C 配对形式进入DNA后再和胸腺嘧啶T 配对后产生 G-C、A-T的转换。
4. 诱发突变
概念:
由各种诱变剂诱发的DNA的突变。每一种诱变剂有其对 应的特异性(如对G-C,A-T转换)和对特定的突变位点的 偏好,例如:甲磺酸乙酯(EMS)和紫外线(UV)“偏好” G-C, A-T转换,黄曲霉素B1(AFB1)则偏好于C-G,AT颠换。
诱变机制: 诱变剂通过3种机制诱发突变:取代DNA中的一个碱基;
3. 化学因素引起的DNA损伤
(1)碱基类似物、修饰剂对DNA的损伤 (2)烷基剂对DNA的损伤 (3)嵌合剂对DNA的损伤。
(1) 碱基类似物对DNA的损伤
某些化学物质和正常的碱基在结构上类似,有时会替代 正常碱基而掺入DNA分子,一旦这些碱基类似物进人DNA 后,由于它们的配对能力不同于正常碱基,便引起DNA复制 过程中其对应位置上插入不正确碱基。
黄曲霉素B1(aflatoxin B1,AFB1) 一种很强的致癌剂。 在鸟嘌呤 N-7位置上形成一加成复合物后产生无嘌呤位
点。修复要求SOS系统参与。SOS越过无嘌呤位点并在这些位 点对应处选择性插入腺嘌呤,使鸟嘌呤残基脱嘌呤的试剂偏向 于产生G-C T-A颠换。
现代生活环境使人可能接触各种各样药品、化妆品、食物 防腐剂、杀虫剂、工业用试剂、污染物等,其中很多化合物已 被证明具有致癌性质。
第六章
DNA的损伤与修复
The damage and repair of DNA
DNA损伤的概念:
DNA双螺旋结构发生的任何改变。
主要分为两种: 单个碱基的改变 双螺旋结构的异常扭曲
DNA损伤修复的重要性
DNA存储着生物体赖以生存和繁衍的遗传信息,
维护DNA分子的完整性对细胞至关紧要;
再经过DNA结合蛋白和其他因素作用下,错配率仍 在10-10。
(1)碱基的异构互变
DNA每种碱基有几种形式,称互变异构体, 异构体中原子的位置及原子之间的键有所不同。
碱基各自的异构体间可以自发发生变化(烯 醇式与酮基间互变);
A=C T=G 上述配对发生在DNA复制时,会造成子代 DNA序列与亲代DNA不同的错误损伤.
烷化剂的种类很多,常见的有甲磺酸乙酯(EMS)、亚硝 基胍(NG)和芥子气等。
EMS能使鸟嘌呤的 N位置上有乙基,成为7一乙基鸟嘌 呤。与胸腺嘧啶配对,故能使G-C转换成A-T。
烷化剂的另一作用是脱嘌呤。例如烷基在鸟嘌呤N位上 活化糖苷键引起断裂,使嘌呤从DNA链上脱掉,产生缺口。 复制时,与缺口对应的位点上可能配上任一碱基,从而引 起转换或颠换;而且去嘌呤后的DNA容易发生断裂,引起 缺失或其他突变。
研究表明在175种已知的致癌剂中,有157种是诱变剂。这 些物质是通过诱导体细胞突变而致癌的。例如食物防腐剂AF-2。 食物熏蒸剂二溴乙烯、抗血吸虫药物、多种染发添加剂以及工 业化合物氯乙烯等都具致癌性。
因而要靠科学治理环境,保护环境就是保护人类自身。
5.1.2 DNA损伤的后果
导致DNA分子结构变化(亦即发生突变) 生物体在表型上突变
例如 5-溴尿嘧啶(BU)和 5-溴脱氧尿嘧啶(BrdU)是T结 构类似物。细菌在含BU的培养基中培养时,部分DNA中的T被BU 取代,BU有两种互变异构体,一种是酮式结构(第6位上有一个 酮基),它可以代替T而掺入DNA,并与A配对;当BU发生互变异 构成为烯醇式(第6位上是一个羟基)后,就容易和G配对。
(2) 缺失(deletion)/ 插入(insertion)
DNA链上一个或一段核苷酸的消失或加入。
例如在 E.coli的lacl基因中发现一种 4个碱基序列(CTGG) 在野生型中连续重复了 3次。J. Miller等人研究了这个基因突 变热点(hot Spots)产生的原因。发现某些热点是由重复序列 引起的。所谓热点即一个基因中比其他位点更容易发生突变的 位点。
自发水解使嘌呤和嘧啶从DNA链的核糖磷酸骨架上脱落。
哺乳类动物细胞,在30ºC下,20h内DNA链自发脱落嘌呤 约1000个,嘧啶约500个。
(4)活性氧引起的碱基修饰与链断裂
细胞呼吸的副产物O2-, H2O2造成DNA损伤,产 生一些碱基修饰物(胸腺嘧啶乙二醇、羟甲基尿嘧 啶等),还可引起DNA单链断裂等损伤; 这些损失 的积累可导致老化。
胶联(binding)
同一条DNA链上或两条DNA链上的碱基间以共价键 结合;DNA与蛋白质之间也以共价键相连;组蛋白、染 色质中的非组蛋白、调控蛋白、与复制和转录有关的酶 都会与DNA以共价键连接。
胶联是细胞受电离辐射后在显微镜下看到的染色体 畸变的分子基础,会影响细胞的功能和DNA复制。
辐射引起DNA分子结构的多种变化
2. 物理因素引起的DNA损伤
(1)紫外线(UV)引起的DNA损伤 DNA受到大剂量紫外线(260nm)照射时,同一条链
上相邻的嘧啶以共价键连成二聚体;TT, CC, CT之间都 可形成二聚体。
复制时,此处产生 空耗过程,DNA不 能复制,细胞不能 分裂,导致凋亡。
紫外线引起的DNA损伤 --最易形成胸腺嘧啶二聚体(TT)
p53
当UVB损伤DNA造成p53突变后,突变型p53因 失去了对细胞周期的正常调控,使得损伤的DNA 继续复制,从而提高了染色体畸变的偶发率和遗 传的不稳定性,角质形成细胞极易发生克隆增生 和恶性转化。
有害物质富集 例: DDT在水环境中存在量仅为3×10-6ppm(mg/L)的时候,当