[方案]酚氯仿法提取DNA主要步骤和原理

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酚氯仿法提取DNA原理及方法

酚氯仿法提取DNA原理及方法

酚氯仿法提取DNA原理及方法酚氯仿法是一种常用的DNA提取方法,其原理是利用酚氯仿溶液对细胞和细胞碎片进行破碎,然后通过离心分离DNA。

以下是详细的步骤:1.细胞裂解:将待提取DNA的样本(细胞、组织等)加入含有酚氯仿的裂解缓冲液中,将溶液均匀混合。

酚氯仿是一种有机溶剂,能够破坏细胞膜和核膜,使细胞释放出DNA。

2.蛋白质沉淀:加入混合溶液中的蛋白质会和酚氯仿相互分离,形成一个物理屏障。

离心沉淀后,由于DNA密度比蛋白质低,DNA会上浮到上层,而蛋白质则沉淀在下层。

3.DNA沉淀:将上层液体转移到新的离心管中,加入同等体积的冷乙醇或异丙醇,然后轻轻振荡以促使DNA沉淀。

酒精能够与DNA相互作用,使DNA分子变得更加疏水,从而沉淀下来。

4.清洗:离心沉淀后,将上清液倒掉,加入70%乙醇洗涤沉淀。

乙醇通过去除残留的酚氯仿和其他杂质,使沉淀的DNA纯化。

5. 溶解:将洗涤后的DNA沉淀干燥或用适量的缓冲液溶解,最常用的是TE缓冲液(含有10 mM Tris-HCl和1 mM EDTA),以便后续的DNA浓度测定和实验操作。

总结来说,酚氯仿法利用酚氯仿溶液破坏细胞膜和核膜,将DNA从细胞中释放出来。

离心分离蛋白质和DNA,然后通过酒精沉淀和乙醇洗涤纯化提取的DNA。

这种方法简单快速,并且能够获得较纯的DNA样品。

不过,酚氯仿法在提取DNA时会同时提取到RNA和蛋白质,因此在一些需要高纯度DNA的实验中可能不适用。

在使用酚氯仿法提取DNA时,还需要注意避免DNA的降解,避免污染和交叉污染,以及正确保存提取的DNA样品。

酚氯仿抽提dna原理

酚氯仿抽提dna原理

酚氯仿抽提dna原理
酚氯仿(Phenol-Chloroform)抽提DNA是一种常用的DNA 提取方法。

其原理是基于酚在酸性条件下具有与DNA高度亲和性的特点,可以将DNA从细胞溶液中抽提出来。

具体的步骤如下:
1. 细胞溶解:首先将待提取DNA的细胞样品加入适量的细胞裂解缓冲液中,通过机械或化学方法使细胞壁破裂,释放出细胞内的DNA。

2. 酚抽提:加入相同体积的酚溶液,并进行充分混合。

酚能与DNA形成复合物,并与其他细胞组分(如蛋白质和脂质)发生分层,形成一个DNA上层和一个下层。

3. 脱水:将抽提产物转移至新管中,加入酒精或异丙醇,通过离心将DNA沉淀下来。

脱水过程可以去除溶液中的多余酚,提高DNA沉淀的纯度。

4. 酯化:将DNA沉淀物溶解在适量的TE缓冲液(含有EDTA和Tris)中,经过一定的时间酯化,使DNA变得更为稳定。

5. 沉淀:通过低温离心将DNA沉淀下来,去除上清液。

6. 洗涤:用70%的乙醇洗涤并去除残余的盐、酚和脏物质。

洗涤过程中,可以多次进行离心和上清液倒掉操作。

7. 干燥:最后,将DNA输送液置于干燥器中或者自然风干,以去除溶剂中的残留物质,得到纯度较高的DNA。

通过酚氯仿抽提DNA的方法,可以从复杂的细胞中提取出高质量、高纯度的DNA,以供后续分子生物学研究使用。

自己整理外周血DNA 提取-酚氯仿法

自己整理外周血DNA 提取-酚氯仿法

DNA 提取实验目的:外周血DNA提取实验试剂:1×RBC裂解液、1×细胞核裂解液、20%SDS、蛋白酶K、Tris饱和酚、氯仿、无水乙醇、70%酒精、TE缓冲液实验耗材:15ml、1.5ml离心管、枪头实验流程:1.将EDTA抗凝贮冻血液于室温解冻后移入15ml离心管中,加满1×RBC裂解液,充分混匀(上下颠倒100次),冰上静置30min,直至溶液变透明,离心机4℃3000rp离心12min,去上清液,留白色沉淀(约3-4ml),再次重复上述步骤。

2.在沉淀(2-3ml)中加入1×细胞核裂解液3ml,20%SDS 150-200μL,混匀至粘稠透明状,再加入20mg/ml的蛋白酶K 25-35μL,充分混匀后,37℃50rpm的恒温摇床过夜。

3.加入等体积的Tris饱和酚(约6ml)反复充分摇匀后,置离心机4℃3000rp离心10min4.将上清移至另一离心管中,加入等体积的酚/氯仿(各3ml左右),混匀,室温下离心10min5.再次将上清液移至另一离心管中,加入2倍体积(约10ml)的无水乙醇,轻轻摇晃上下倒转混匀,可析出白色沉淀物(gDNA),离心20℃3000rp 5min 6.用1000μL移液器小心吸出gDNA置于1.5ml的灭菌Ep管中,用70%的酒精漂洗2次,离心4℃10000rp 5min7.用gDNA溶解于200μL TE缓冲液中8.用10μL移液器取2μL TE缓冲液滴入紫外线分光光度计,调零,然后再取2μL直接读数。

9.测量好DNA的浓度后,将gDNA稀释至50ng/μL,用200μL无菌EP管分装,每管分装50μL置-80℃冰箱保存10.DNA的浓度测定及纯度判定:取DNA溶液用TE液做适量稀释,以TE做空白对照,在紫外分光光度计上读取A260和A280的光密度值。

按下面公式计算浓度:DNA浓度(ug/ul)= A260*50*稀释倍数/1000 DNA纯度的判定:A260/A280 比值应介于1.7-2.0之间。

酚氯仿法提取DNA主要步骤和原理

酚氯仿法提取DNA主要步骤和原理

酚氯仿法提‎取DNA主‎要步骤:1.将动物组织‎放在1.5ml的离‎心管中,分别用75‎%、50%酒精和纯水‎梯度脱酒精‎。

每个梯度脱‎水时间为5‎-10min‎2.将组织放入‎研钵中,加入适量D‎N A裂解液‎(300μl‎),研磨后再加‎入300μ‎l DNA裂‎解液冲洗研‎磨棒。

3.将研磨好的‎组织液用移‎液枪加到1‎.5ml离心‎管,在管中加1‎0μl蛋白‎酶K,用封口带将‎离心管封口‎,放入摇床(56℃,5h)。

4.加入等体积‎的Tris‎饱和酚(500μl‎),摇匀(10min‎)。

5.离心:12000‎R,7min,4℃。

离心后分成‎上中下三层‎,上层为DN‎A,中层为蛋白‎质,下层为有机‎质。

6.吸取上层液‎体加入新的‎离心管。

7.配制Tri‎s饱和酚:氯仿:异戊醇=25:24:1。

8.在含有上清‎液的离心管‎中加入Tr‎i s饱和酚‎、氯仿和异戊‎醇混合液4‎50μl,摇匀10m‎i n。

9.离心:12000‎R,7min,4℃。

10.吸取上清液‎加到新的离‎心管,加入等体积‎的氯仿和异‎戊醇混合液‎400μl‎(氯仿:异戊醇=24:1)。

11.离心:12000‎R,7min,4℃。

12.吸取上清液‎加入新的离‎心管,加入2.5倍经过-20℃冷冻的10‎0%的酒精。

-20℃过夜。

13.将样品取出‎,12000‎R,7min,4℃离心。

14.弃上清,留白色沉淀‎(DNA),加400μ‎l的75%的经过-20℃冷冻的酒精‎,反复吹打溶‎解。

15.重复第14‎步骤2次(用75%酒精洗三次‎)。

16.提取DNA‎完成。

溴氯仿法提‎取DNA的‎原理:用酚抽提细‎胞DNA时‎,有什么作用‎?使蛋白质变‎性,同时抑制了‎D Nase‎的降解作用‎。

用苯酚处理‎匀浆液时,由于蛋白与‎D NA联结键已断‎,蛋白分子表‎面又含有很‎多极性基团‎与苯酚相似‎相溶。

蛋白分子溶‎于酚相,而DNA 溶‎于水相。

DNA提取方法和步骤

DNA提取方法和步骤

DNA提取方法和步骤一、常见的DNA提取方法:1. 酚/氯仿法(Phenol/Chloroform Extraction):通过使用酚/氯仿等有机溶剂来分离DNA分子。

2. 盐水法(Salting out):通过使用高盐浓度来析出DNA分子。

3. 硅胶柱法(Silica-based purification):通过与硅胶矩阵相互作用,从混合溶液中纯化DNA。

4. 高盐法(High salt method):通过使用高盐浓度来沉淀DNA。

5. CTAB法(Cetyltrimethylammonium bromide method):通过使用CTAB(十六烷基三甲基溴化铵)来分离DNA。

二、通用的DNA提取步骤:1.样本收集:从所需生物体(如植物组织、动物组织、血液等)中收集样本。

样本的品质对提取后的DNA质量影响很大,因此需要保证样本的新鲜度和完整性。

2.细胞破碎:将收集到的样本进行细胞破碎,使DNA从细胞的内部释放出来。

这可以通过机械方法(搅拌、刮擦等)、溶解酶或离心等方法来实现。

3. 除去蛋白质和RNA:加入蛋白酶等酶解蛋白质,使其降解分解。

同时,也可以加入RNase酶降解RNA,以免在提取过程中受到污染。

4.DNA沉淀:加入盐溶液以增加DNA的溶解性,然后加入酒精来沉淀DNA分子。

酒精的加入可以调节盐溶液中Na+和DNA的酒精沉淀剂(如异丙醇或乙醇)的比例,从而沉淀出DNA。

5.洗涤:将沉淀下的DNA溶于适当的缓冲液中,以去除沉淀剂、盐等杂质。

6. 保存:最后,将DNA保存在适当的缓冲液中,如TE缓冲液(Tris-EDTA),并在低温下存储。

三、酚/氯仿法DNA提取步骤:1.细胞破碎:将细胞或组织加入到含有裂解缓冲液的试管中,使用机械方法(高速离心、搅拌等)或酶解来破碎细胞膜。

2.调整pH值:加入适量的酚/氯仿溶液,并快速倒转试管数次,使试管中的溶液充分混合。

酚会与细胞残渣中的蛋白质结合形成亲水性复合物,而氯仿可以帮助去除蛋白质。

dna分离纯化方法及原理

dna分离纯化方法及原理

dna分离纯化方法及原理
1. 酚-氯仿抽提法:这是一种传统的 DNA 提取方法。

原理是利用酚和氯仿的混合物来溶解细胞膜和蛋白质,使 DNA 与其他细胞成分分离开来。

然后通过离心和有机溶剂的萃取,将 DNA 从混合物中提取出来。

2. 硅胶柱层析法:该方法基于 DNA 与硅胶柱子之间的吸附和解吸作用。

将待提取的样本加载到硅胶柱上,通过柱子的吸附作用,使 DNA 与其他杂质分离开来。

然后用适当的洗脱缓冲液将 DNA 从柱子上洗脱下来。

3. 磁珠法:这是一种利用磁性颗粒结合 DNA 的方法。

将磁珠与样本混合,使 DNA 与磁珠结合。

通过外部磁场的作用,可以将磁珠与结合的 DNA 分离开来,从而实现 DNA 的纯化。

4. 质粒抽提法:这种方法适用于提取质粒 DNA。

通过碱处理破坏细菌细胞壁和细胞膜,使质粒 DNA 从细菌细胞中释放出来。

然后通过离心和沉淀等步骤,将质粒 DNA 与其他杂质分离开来。

5. 超声波法:利用超声波的能量,将细胞破碎,使 DNA 释放到溶液中。

然后通过离心和沉淀等步骤,将 DNA 与其他杂质分离开来。

这些方法的原理基于不同的物理、化学或生物学原理,旨在从复杂的生物样本中选择性地分离和纯化 DNA。

选择合适的方法取决于样本类型、纯度要求和实验目的等因素。

在 DNA 分离纯化过程中,还需要注意操作规范、防止污染,并进行质量控制和检测,以确保获得高质量的 DNA 用于后续的分析和实验。

酚氯仿法提取DNA主要步骤和原理

酚氯仿法提取DNA主要步骤和原理

酚氯仿法提取DNA主要步骤:1.将动物组织放在1.5ml的离心管中,分别用75%、50%酒精和纯水梯度脱酒精。

每个梯度脱水时间为5-10min2.将组织放入研钵中,加入适量DNA裂解液(300μl),研磨后再加入300μlDNA裂解液冲洗研磨棒。

3.将研磨好的组织液用移液枪加到1.5ml离心管,在管中加10μl蛋白酶K,用封口带将离心管封口,放入摇床(56℃,5h)。

4.加入等体积的Tris饱和酚(500μl),摇匀(10min)。

5.离心:12000R,7min,4℃。

离心后分成上中下三层,上层为DNA,中层为蛋白质,下层为有机质。

6.吸取上层液体加入新的离心管。

7.配制Tris饱和酚:氯仿:异戊醇=25:24:1。

8.在含有上清液的离心管中加入Tris饱和酚、氯仿和异戊醇混合液450μl,摇匀10min。

9.离心:12000R,7min,4℃。

10.吸取上清液加到新的离心管,加入等体积的氯仿和异戊醇混合液400μl(氯仿:异戊醇=24:1)。

11.离心:12000R,7min,4℃。

12.吸取上清液加入新的离心管,加入2.5倍经过-20℃冷冻的100%的酒精。

-20℃过夜。

13.将样品取出,12000R,7min,4℃离心。

14.弃上清,留白色沉淀(DNA),加400μl的75%的经过-20℃冷冻的酒精,反复吹打溶解。

15.重复第14步骤2次(用75%酒精洗三次)。

16.提取DNA完成。

溴氯仿法提取DNA的原理:用酚抽提细胞DNA时,有什么作用?使蛋白质变性,同时抑制了DNase的降解作用。

用苯酚处理匀浆液时,由于蛋白与DNA 联结键已断,蛋白分子表面又含有很多极性基团与苯酚相似相溶。

蛋白分子溶于酚相,而DNA 溶于水相。

使用酚的优点:1. 有效变性蛋白质;2. 抑制了DNase的降解作用。

缺点:1. 能溶解10-15%的水,从而溶解一部分poly(A)RNA。

2. 不能完全抑制RNase 的活性。

酚-氯仿抽提DNA

酚-氯仿抽提DNA

DNA的提取是分子生物学实验技术中的最重要、最基本的操作。

本实验通过植物样品在液氮下研磨以粉碎组织,通过裂解液裂解细胞,有机溶剂反复抽提,使DNA进入水相与蛋白质成分分开,在RNase作用下,降解RNA以纯化DNA。

二、材料以方法1、材料:培养菌体2、仪器设备:超净工作台,培养箱,摇床,恒温水浴锅,高速冷冻离心机,台式离心机,移液枪一套,低温冰箱,冷冻真空干燥机,电泳仪,水平电泳槽,紫外观测仪3、试剂:细胞裂解液100 mM Tris-HCl 5 mM EDTA 500 mM NaCl 1.25% SDS(PH 7.5) 饱和酚氯仿/异戊醇酚/氯仿/异戊醇无水乙醇70%乙醇异丙醇 3 M NaAc(pH5.2) RNase 50×TE缓冲液电泳载样缓冲液三、操作步骤(1)培养菌体(2)加入10 ml裂解液,1/10体积酚,于65℃下20-30 min,然后加入等体积的氯仿,轻摇(3)12000-15000rpm离心15 min(4)取上淸液,加入等体积氯仿,轻摇,12000-15000rpm离心15 min(5)取上淸液,加入0.6倍体积冷异丙醇(-20℃)或2倍体积冷无水乙醇(-20℃)(6)加入1/10体积的3 M NaAc(pH5.2),置于室温下10 min(7)12000-15000rpm离心10 min(8)倒弃液体留下沉淀,用70%乙醇洗涤沉淀(9)加入2倍体积无水乙醇(10)12000-15000rpm离心10 min(11)倒弃液体留下沉淀,真空干燥(12)复溶于2 ml TE(13)加入RNase,65℃或37℃处理10-30 min(14)加等体积酚,酚/氯仿,氯仿各一次,12000-15000rpm离心10 min(15)取上淸液,加入0.6倍体积冷异丙醇(-20℃)或2倍体积冷无水乙醇(-20℃)(16)加入1/10体积的3 M NaAc(PH5.2),置于室温下10 min(17)12000-15000rpm离心10 min(18)倒弃液体留下沉淀,用70%乙醇洗涤沉淀(19)真空干燥沉淀(20)复溶于0.5-1.0 ml的TE或水中,分装成小体积,4℃或-20℃保存。

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[方案]酚氯仿法提取DNA主要步骤和原理酚氯仿法提取DNA主要步骤:1.将动物组织放在1.5ml的离心管中,分别用75%、50%酒精和纯水梯度脱酒精。

每个梯度脱水时间为5-10min2.将组织放入研钵中,加入适量DNA裂解液(300μl),研磨后再加入300μlDNA裂解液冲洗研磨棒。

3.将研磨好的组织液用移液枪加到1.5ml离心管,在管中加10μl蛋白酶K,用封口带将离心管封口,放入摇床(56?,5h)。

4.加入等体积的Tris饱和酚(500μl),摇匀(10min)。

5.离心:12000R,7min,4?。

离心后分成上中下三层,上层为DNA,中层为蛋白质,下层为有机质。

6.吸取上层液体加入新的离心管。

7.配制Tris饱和酚:氯仿:异戊醇=25:24:1。

8.在含有上清液的离心管中加入Tris饱和酚、氯仿和异戊醇混合液450μl,摇匀10min。

9.离心:12000R,7min,4?。

10.吸取上清液加到新的离心管,加入等体积的氯仿和异戊醇混合液400μl(氯仿:异戊醇=24:1)。

11.离心:12000R,7min,4?。

12.吸取上清液加入新的离心管,加入2.5倍经过-20?冷冻的100%的酒精。

-20?过夜。

13.将样品取出,12000R,7min,4?离心。

14.弃上清,留白色沉淀(DNA),加400μl的75%的经过-20?冷冻的酒精,反复吹打溶解。

15.重复第14步骤2次(用75%酒精洗三次)。

16.提取DNA完成。

溴氯仿法提取DNA的原理:用酚抽提细胞DNA时,有什么作用,使蛋白质变性,同时抑制了DNase的降解作用。

用苯酚处理匀浆液时,由于蛋白与DNA 联结键已断,蛋白分子表面又含有很多极性基团与苯酚相似相溶。

蛋白分子溶于酚相,而DNA溶于水相。

使用酚的优点:1. 有效变性蛋白质;2. 抑制了DNase的降解作用。

缺点:1. 能溶解10-15%的水,从而溶解一部分poly(A)RNA。

2. 不能完全抑制RNase的活性。

氯仿的作用,氯仿:克服酚的缺点;加速有机相与液相分层。

最后用氯仿抽提:去除核酸溶液中的迹量酚。

(酚易溶于氯仿中) 用酚,氯仿抽提细胞基因组DNA时,通常要在酚-氯仿中加少许异戊醇,为什么, 异戊醇:减少蛋白质变性操作过程中产生的气泡。

异戊醇可以降低表面张力,从而减少气泡产生。

另外,异戊醇有助于分相,使离心后的上层含DNA的水相、中间的变性蛋白相及下层有机溶剂相维持稳定。

用乙醇沉淀DNA时,为什么加入单价的阳离子, 用乙醇沉淀DNA时,通常要在溶液中加入单价的阳离子,如NaCl 或 NaAc,Na+中和DNA分子上的负电荷,减少DNA分子之间的同性电荷相斥力,而易于聚集沉淀。

原理:动物和植物组织的脱氧核糖核蛋白(DNP)可溶于水或浓盐溶液(如1mol/L 氯化钠),但在0.14mol/L氯化钠盐溶液中溶解度最低,而核酸核蛋白(RNP)则在0.14mol/L氯化钠中溶解度最大,利用这一性质可将其分开。

将沉淀物溶解于生理盐水,加入去污剂十二烷基硫酸钠(SDS)溶液,使DNA与蛋白质分离开。

加入固体氯化钠使其浓度达到1mol/L,使DNA溶解。

加氯仿-异戊醇去除蛋白质,也可重复该步操作得较纯DNA。

最后用95%乙醇沉淀DNA。

溶解:将离心后除去RNA的沉淀,用30ml生理盐水溶解,充分搅拌后,匀浆一次。

加4毫升10,SDS溶液,使溶液的SDS浓度达到1,左右,边加边搅拌,放置60 ?水浴保温10分钟(不停搅拌),冷却。

加固体氯化钠,使溶液氯化钠浓度达到1mol/L,充分搅拌10分钟;除杂质:加等体积氯仿-异戊醇混合液,充分震荡10分钟, 8000 r/min离心7分钟,取上层液量好体积,倒入烧杯中(离心管),加同体积的氯仿-异戊醇混合液,重复上次操作。

直至界面不出现蛋白凝胶为止;沉淀:准确量取上清液体积,加2倍体积95,冷乙醇,搅拌后,置冰箱静止冷却,待有白色丝状物出现,约10-15分钟,离心8000 r/min离心7分钟,得白色沉淀;溶解:将沉淀物用0.1mol/L NaOH约10毫升溶解,得DNA溶液。

溶液I—溶菌液: 溶菌酶:它是糖苷水解酶,能水解菌体细胞壁的主要化学成分肽聚糖中的β-1,4糖苷键,因而具有溶菌的作用。

当溶液中pH小于8时,溶菌酶作用受到抑制。

葡萄糖:增加溶液的粘度,维持渗透压,防止DNA受机械剪切力作用而降解。

EDTA:(1)螯合Mg2,、Ca2,等金属离子,抑制脱氧核糖核酸酶对DNA的降解作用(DNase作用时需要一定的金属离子作辅基);(2)EDTA的存在,有利于溶菌酶的作用,因为溶菌酶的反应要求有较低的离子强度的环境。

溶液II,NaOH,SDS液:NaOH:核酸在pH大于5,小于9的溶液中,是稳定的。

但当pH,12或pH,3时,就会引起双链之间氢键的解离而变性。

在溶液II中的NaOH 浓度为0.2mo1,L,加抽提液时,该系统的pH就高达12.6,因而促使染色体DNA与质粒DNA的变性。

SDS:SDS是离子型表面活性剂。

它主要功能有:(1)溶解细胞膜上的脂质与蛋白,因而溶解膜蛋白而破坏细胞膜。

(2)解聚细胞中的核蛋白。

(3)SDS能与蛋白质结合成为R-O-SO3-…R,-蛋白质的复合物,使蛋白质变性而沉淀下来。

但是SDS能抑制核糖核酸酶的作用,所以在以后的提取过程中,必须把它去除干净,防止在下一步操作中(用RNase去除RNA时)受到干扰。

溶液III--3mol,L NaAc(pH4.8)溶液:NaAc的水溶液呈碱性,为了调节pH至4.8,必须加入大量的冰醋酸。

所以该溶液实际上是NaAc-HAc的缓冲液。

用pH4.8的NaAc溶液是为了把pH12.6的抽提液,调回pH至中性,使变性的质粒DNA能够复性,并能稳定存在。

而高盐的3mol,L NaAc有利于变性的大分子染色体DNA、RNA以及SDS-蛋白复合物凝聚而沉淀之。

前者是因为中和核酸上的电荷,减少相斥力而互相聚合,后者是因为钠盐与SDS,蛋白复合物作用后,能形成较小的钠盐形式复合物,使沉淀更完全。

为什么用无水乙醇沉淀DNA, 用无水乙醇沉淀DNA,这是实验中最常用的沉淀DNA的方法。

乙醇的优点是可以任意比和水相混溶,乙醇与核酸不会起任何化学反应,对DNA很安全,因此是理想的沉淀剂。

DNA溶液是DNA以水合状态稳定存在,当加入乙醇时,乙醇会夺去DNA周围的水分子,使DNA失水而易于聚合。

一般实验中,是加2倍体积的无水,左右。

因而也可改用95,乙醇来替代无水乙醇与DNA相混合,其乙醇的最终含量占67乙醇(因为无水乙醇的价格远远比95,乙醇昂贵)。

但是加95,的乙醇使总体积增大,而DNA在溶液中有一定程度的溶解,因而DNA损失也增大,尤其用多次乙醇沉淀时,就会影响收得率。

折中的做法是初次沉淀DNA时可用95,乙醇代替无水乙酵,最后的沉淀步骤要使用无水乙醇。

也可以用0.6倍体积的异丙醇选择性沉淀DNA。

一般在室温下放置15,30分钟即可。

在用乙醇沉淀DNA时,为什么一定要加NaAc或NaCl至最终浓度达0.1,0.25mol/L, 在pH为8左右的溶液中,DNA分子是带负电荷的,加一定浓度的NaAc或NaCl,使Na+中和DNA分子上的负电荷,减少DNA分子之间的同性电荷相斥力,易于互相聚合而形成DNA钠盐沉淀,当加入的盐溶液浓度太低时,只有部分DNA形成DNA钠盐而聚合,这样就造成DNA沉淀不完全,当加入的盐溶液浓度太高时,其效果也不好。

在沉淀的DNA中,由于过多的盐杂质存在,影响DNA的酶切等反应,必须要进行洗涤或重沉淀。

加核糖核酸酶降解核糖核酸后,为什么再要用SDS与KAc来处理, 加进去的RNase本身是一种蛋白质,为了纯化DNA,又必须去除之,加SDS可使它们成为SDS-蛋白复合物沉淀,再加KAc使这些复合物转变为溶解度更小的钾盐形式的SDS-蛋白质复合物,使沉淀更加完全。

也可用饱和酚、氯仿抽提再沉淀,去除RNase。

在溶液中,有人以KAc代替NaAc,也可以收到较好效果。

7(为什么在保存或抽提DNA过程中,一般采用TE缓冲液, 在基因操作实验中,选择缓冲液的主要原则是考虑DNA的稳定性及缓冲液成分不产生干扰作用。

磷酸盐缓冲系统(pKa,7.2)和硼酸系统(pKa=9.24)等虽然也都符合细胞内环境的生理范围(pH),可作DNA的保存液,但在转化实验时,磷酸根离子的种类及数量将与Ca2,产生Ca3(PO4)2沉淀;在DNA反应时,不同的酶对辅助因子的种类及数量要求不同,有的要求高离子浓度,有的则要求低盐浓度,采用Tris-HCl(pKa=8.0)的缓冲系统,由于缓冲液是TrisH+/Tris,不存在金属离子的干扰作用,故在提取或保存DNA时,大都采用Tris-HCl系统,而TE缓冲液中的EDTA更能稳苯酚、氯仿、异戊醇在DNA提取时的作用抽提DNA去除蛋白质时,怎样使用酚与氯仿较好, 酚与氯仿是非极性分子,水是极性分子,当蛋白水溶液与酚或氯仿混合时,蛋白质分子之间的水分子就被酚或氯仿挤去,使蛋白失去水合状态而变性。

经过离心,变性蛋白质的密度比水的密度为大,因而与水相分离,沉淀在水相下面,从而与溶解在水相中的DNA分开。

而酚与氯仿有机溶剂比重更大,保留在最下层。

作为表面变性的酚与氯仿,在去除蛋白质的作用中,各有利弊,酚的变性作用大,但酚与水相有一定程度的互溶,大约10,,15,的水溶解在酚相中,因而损失了这部分水相中的DNA,而氯仿的变性作用不如酚效果好,但氯仿与水不相混溶,不会带走DNA。

所以在抽提过程中,混合使用酚与氯仿效果最好。

经酚第一次抽提后的水相中有残留的酚,由于酚与氯仿是互溶的,可用氯仿第二次变性蛋白质,此时一起将酚带走。

也可以在第二次抽提时,将酚与氯仿混合(1:1)使用。

为什么用酚与氯仿抽提DNA时,还要加少量的异戊酵, 在抽提DNA时,为了混合均匀,必须剧烈振荡容器数次,这时在混合液内易产生气泡,气泡会阻止相互间的充分作用。

加入异戊醇能降低分子表面张力,所以能减少抽提过程中的泡沫产生。

一般采用氯仿与异戊酵为24:1之比。

也可采用酚、氯仿与异戊醇之比为25:24:1(不必先配制,可在临用前把一份酚加一份24:1的氯仿与异戊醇即成),同时异戊醇有助于分相,使离心后的上层水相,中层变性蛋白相以及下层有机溶剂相维持稳定。

苯酚:氯仿:异戊醇为什么要25:24:1,抽提DNA去除蛋白质时,怎样使用酚与氯仿较好,酚与氯仿是非极性分子,水是极性分子,当蛋白水溶液与酚或氯仿混合时,蛋白质分子之间的水分子就被酚或氯仿挤去,使蛋白失去水合状态而变性。

经过离心,变性蛋白质的密度比水的密度为大,因而与水相分离,沉淀在水相下面,从而与溶解在水相中的DNA分开。

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