酚氯仿法提取DNA主要步骤和原理

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提取dna的方法及原理

提取dna的方法及原理

提取dna的方法及原理提取DNA的方法及原理DNA提取是生物学和遗传学研究中的一项基础操作,它是获取DNA样本的过程。

DNA提取的方法有很多种,下面将介绍几种常用的DNA提取方法及其原理。

1. 高盐法高盐法是一种简单且常用的DNA提取方法。

其原理是利用高盐溶液中DNA与其他细胞组分(如蛋白质)之间的亲和性差异。

在高盐环境下,DNA更容易溶解而不与蛋白质结合,从而实现DNA的提取。

具体步骤包括细胞破碎、加入高盐溶液、离心分离DNA和去除蛋白质等。

2. 酚/氯仿法酚/氯仿法是一种经典的DNA提取方法。

其原理是利用酚和氯仿两种溶剂的密度差异,将DNA从细胞中分离出来。

具体步骤包括细胞破碎、加入酚/氯仿混合液、离心分离DNA和去除蛋白质等。

3. 硅胶柱法硅胶柱法是一种高纯度DNA提取方法。

其原理是利用硅胶柱上的硅胶颗粒与DNA之间的亲和性差异。

DNA样本在经过一系列处理后,通过硅胶柱,DNA能够与硅胶颗粒结合,而杂质则被洗脱。

最后,通过洗脱DNA,即可获得高纯度的DNA。

硅胶柱法的优点是提取纯度高、操作简单,适用于分子生物学研究和临床诊断。

4. 磁珠法磁珠法是一种高效、快速的DNA提取方法。

其原理是利用带有亲和基团的磁珠与DNA之间的亲和性,实现DNA的选择性吸附和洗脱。

具体步骤包括磁珠悬浮液制备、样本加入、磁珠与DNA结合、磁珠分离、洗脱DNA等。

除了上述常用的DNA提取方法外,还有其他一些特殊的DNA提取方法,如酶解法、离心法、凝胶切割法等。

这些方法在不同的实验和应用中具有各自的特点和优势。

总结起来,DNA提取的方法多种多样,选择适合的方法取决于实验目的、样本类型和实验条件等。

无论采用哪种方法,都需要严格控制实验操作,以确保提取到高质量的DNA样本。

DNA提取的成功与否直接影响到后续的实验结果,因此在进行DNA提取时,需要注意样本的保存、细胞破碎的方式、溶解液的选择等因素,以获得可靠且高纯度的DNA。

DNA操作规程

DNA操作规程

DNA提取和纯化技术标准操作规程组织样品先保存在1.5ml或者2ml的离心管中,用酒精固定低温保存。

DNA提取方法:1、酚-氯仿法:1.1适用范围酚-氯仿法提取DNA原理为在有EDTA及SDS等去污剂存在下用蛋白酶K消化细胞,通过酚-氯仿混合物萃取DNA溶液中的蛋白质类有机物质,而保留DNA于水相溶液中的提取方法。

缓冲液及试剂1) 蛋白酶K2) 细胞裂解液:母液:10%SDS(m/v),0.1M Tris·HCl(PH8.0),0.5M EDTA(PH8.0);裂解液终浓度:200ml裂解液:10%SDS 10ml0.1M Tris·HC 2ml0.5M EDTA 40mlddH2O 149ml3) 饱和酚;4) 100%氯仿;5) 100%异戊醇;6) 100%乙醇、70%乙醇;7) TE(PH8.0):10mmol·ml-1 Tris·HCl(PH8.0),0.1 mol·ml-1 EDTA(PH8.0)1.2组织样品DNA提取步骤:1.2.1取绿豆体积一半大小的组织,在1.5ml离心管中加300µl的双蒸灭菌水,待取下的组织乙醇挥发完之后,用剪刀剪碎组织,使组织细胞悬浮于双蒸水中1.2.2加7000µl的双蒸水冲洗剪碎的组织1.2.312000rpm离心5min,使组织与水分离,弃上清,再13000rpm离心2min,可用移液枪吸出残余的双蒸水。

1.2.4加DNA提取液,即裂解液,加600µl 55℃预热的裂解液,使细胞破碎,再加入5µl的蛋白酶K,结合组蛋白。

1.2.5混匀后,在55℃水浴2h30min,水浴前半小时,每隔5min轻轻摇匀一次。

1.2.6从水浴中取出离心管,冷却至室温,加入600µl酚氯仿(苯酚∶氯仿∶异戊醇=25∶24∶1),轻轻混匀,静置10min,12000rpm离心10min。

酚氯仿法提取DNA原理及方法

酚氯仿法提取DNA原理及方法

酚氯仿法提取DNA原理及方法酚氯仿法是一种常用的DNA提取方法,其原理是利用酚氯仿溶液对细胞和细胞碎片进行破碎,然后通过离心分离DNA。

以下是详细的步骤:1.细胞裂解:将待提取DNA的样本(细胞、组织等)加入含有酚氯仿的裂解缓冲液中,将溶液均匀混合。

酚氯仿是一种有机溶剂,能够破坏细胞膜和核膜,使细胞释放出DNA。

2.蛋白质沉淀:加入混合溶液中的蛋白质会和酚氯仿相互分离,形成一个物理屏障。

离心沉淀后,由于DNA密度比蛋白质低,DNA会上浮到上层,而蛋白质则沉淀在下层。

3.DNA沉淀:将上层液体转移到新的离心管中,加入同等体积的冷乙醇或异丙醇,然后轻轻振荡以促使DNA沉淀。

酒精能够与DNA相互作用,使DNA分子变得更加疏水,从而沉淀下来。

4.清洗:离心沉淀后,将上清液倒掉,加入70%乙醇洗涤沉淀。

乙醇通过去除残留的酚氯仿和其他杂质,使沉淀的DNA纯化。

5. 溶解:将洗涤后的DNA沉淀干燥或用适量的缓冲液溶解,最常用的是TE缓冲液(含有10 mM Tris-HCl和1 mM EDTA),以便后续的DNA浓度测定和实验操作。

总结来说,酚氯仿法利用酚氯仿溶液破坏细胞膜和核膜,将DNA从细胞中释放出来。

离心分离蛋白质和DNA,然后通过酒精沉淀和乙醇洗涤纯化提取的DNA。

这种方法简单快速,并且能够获得较纯的DNA样品。

不过,酚氯仿法在提取DNA时会同时提取到RNA和蛋白质,因此在一些需要高纯度DNA的实验中可能不适用。

在使用酚氯仿法提取DNA时,还需要注意避免DNA的降解,避免污染和交叉污染,以及正确保存提取的DNA样品。

酚氯仿抽提dna原理

酚氯仿抽提dna原理

酚氯仿抽提dna原理
酚氯仿(Phenol-Chloroform)抽提DNA是一种常用的DNA 提取方法。

其原理是基于酚在酸性条件下具有与DNA高度亲和性的特点,可以将DNA从细胞溶液中抽提出来。

具体的步骤如下:
1. 细胞溶解:首先将待提取DNA的细胞样品加入适量的细胞裂解缓冲液中,通过机械或化学方法使细胞壁破裂,释放出细胞内的DNA。

2. 酚抽提:加入相同体积的酚溶液,并进行充分混合。

酚能与DNA形成复合物,并与其他细胞组分(如蛋白质和脂质)发生分层,形成一个DNA上层和一个下层。

3. 脱水:将抽提产物转移至新管中,加入酒精或异丙醇,通过离心将DNA沉淀下来。

脱水过程可以去除溶液中的多余酚,提高DNA沉淀的纯度。

4. 酯化:将DNA沉淀物溶解在适量的TE缓冲液(含有EDTA和Tris)中,经过一定的时间酯化,使DNA变得更为稳定。

5. 沉淀:通过低温离心将DNA沉淀下来,去除上清液。

6. 洗涤:用70%的乙醇洗涤并去除残余的盐、酚和脏物质。

洗涤过程中,可以多次进行离心和上清液倒掉操作。

7. 干燥:最后,将DNA输送液置于干燥器中或者自然风干,以去除溶剂中的残留物质,得到纯度较高的DNA。

通过酚氯仿抽提DNA的方法,可以从复杂的细胞中提取出高质量、高纯度的DNA,以供后续分子生物学研究使用。

基因组DNA的提取方法—酚

基因组DNA的提取方法—酚

基因组DNA的提取方法—酚-氯仿抽提法1. 将95% 酒精浸泡过的标本取出,用吸水纸吸去标本表面的乙醇,用1×TE Buffer浸泡两次,每次20min。

2. 解剖取个体胸部肌肉组织约0.02g,将组织转入1.5mL离心管加入1mL液氮使其迅速冻结, 用玻璃棒迅速有力地将团状组织研磨成细粉末。

3. 加入500uL消化液(消化液成分为NaCl 0.1mol/L, Tris-HCl 0.3mol/L, EDTA 0.01mol/L, SDS 1%, Proteimase K 200ug/mL),于56℃恒稳水浴中消化8-10小时, 每隔两小时摇晃一次。

4. 消化结束后,加入等体积的饱和酚(pH7.6),用封口胶封好,置于混匀器上约12小时,离心10分钟(10000r/m)。

5. 取上清液于另一新的EP管中,加入等体积的酚:氯仿:异戊醇(25:24:1),缓慢抽提20分钟,离心10分钟(10000r/m)。

6. 取上清液于另一新的EP管中,加入等体积的氯仿:异戊醇(24:1),缓慢抽提20分钟,离心10分钟(10000r/m)。

7. 取上清液于另一新的EP管中,加入2倍体积的预冷的无水乙醇,-20℃放置2小时。

8. 离心后,DNA沉积于管底,用70%的预冷的乙醇洗涤2次,37℃烘干。

烘干的DNA溶于TE中,4℃保存。

9. 于基因组DNA中加入终浓度为50ug/mL的RNase(每次使用前90℃灭活10min),于37℃消化1.0-1.5hr。

10. 用0.8%的琼脂糖凝胶检测,取3μL DNA样品及2μL Load-buffer (含溴酚蓝和缓冲液),加入点样孔。

实验所用Marker是 DNA(EcoR/HindIII),100V电压电泳90分钟。

凝胶成象分析仪进行检测。

11. 用紫外可见分光光度计测定DNA的OD值,判定DNA纯度和浓度。

酚氯仿法提取DNA主要步骤和原理

酚氯仿法提取DNA主要步骤和原理

酚氯仿法提‎取DNA主‎要步骤:1.将动物组织‎放在1.5ml的离‎心管中,分别用75‎%、50%酒精和纯水‎梯度脱酒精‎。

每个梯度脱‎水时间为5‎-10min‎2.将组织放入‎研钵中,加入适量D‎N A裂解液‎(300μl‎),研磨后再加‎入300μ‎l DNA裂‎解液冲洗研‎磨棒。

3.将研磨好的‎组织液用移‎液枪加到1‎.5ml离心‎管,在管中加1‎0μl蛋白‎酶K,用封口带将‎离心管封口‎,放入摇床(56℃,5h)。

4.加入等体积‎的Tris‎饱和酚(500μl‎),摇匀(10min‎)。

5.离心:12000‎R,7min,4℃。

离心后分成‎上中下三层‎,上层为DN‎A,中层为蛋白‎质,下层为有机‎质。

6.吸取上层液‎体加入新的‎离心管。

7.配制Tri‎s饱和酚:氯仿:异戊醇=25:24:1。

8.在含有上清‎液的离心管‎中加入Tr‎i s饱和酚‎、氯仿和异戊‎醇混合液4‎50μl,摇匀10m‎i n。

9.离心:12000‎R,7min,4℃。

10.吸取上清液‎加到新的离‎心管,加入等体积‎的氯仿和异‎戊醇混合液‎400μl‎(氯仿:异戊醇=24:1)。

11.离心:12000‎R,7min,4℃。

12.吸取上清液‎加入新的离‎心管,加入2.5倍经过-20℃冷冻的10‎0%的酒精。

-20℃过夜。

13.将样品取出‎,12000‎R,7min,4℃离心。

14.弃上清,留白色沉淀‎(DNA),加400μ‎l的75%的经过-20℃冷冻的酒精‎,反复吹打溶‎解。

15.重复第14‎步骤2次(用75%酒精洗三次‎)。

16.提取DNA‎完成。

溴氯仿法提‎取DNA的‎原理:用酚抽提细‎胞DNA时‎,有什么作用‎?使蛋白质变‎性,同时抑制了‎D Nase‎的降解作用‎。

用苯酚处理‎匀浆液时,由于蛋白与‎D NA联结键已断‎,蛋白分子表‎面又含有很‎多极性基团‎与苯酚相似‎相溶。

蛋白分子溶‎于酚相,而DNA 溶‎于水相。

dna纯化方法

dna纯化方法

dna纯化方法
DNA纯化方法
DNA纯化是分子生物学中的一个重要步骤,它是从混合物中分离出DNA分子的过程。

DNA纯化方法有很多种,其中常用的方法包括酚/氯仿法、离心柱法、磁珠法等。

酚/氯仿法是最常用的DNA纯化方法之一。

它的原理是利用酚和氯仿的密度差异,将DNA分子从其他杂质中分离出来。

具体操作步骤如下:首先将细胞裂解,使DNA分子释放到溶液中;然后加入等体积的酚/氯仿混合液,混合均匀后离心分层;最后将上层的DNA溶液取出,加入等体积的异丙醇,沉淀DNA分子。

离心柱法是一种快速、简便的DNA纯化方法。

它利用离心柱的特殊结构,将DNA分子从其他杂质中分离出来。

具体操作步骤如下:首先将细胞裂解,使DNA分子释放到溶液中;然后将DNA溶液加入离心柱中,离心分离DNA分子和其他杂质;最后将离心柱中的DNA分子洗涤、洗脱,得到纯净的DNA分子。

磁珠法是一种高效、自动化的DNA纯化方法。

它利用磁珠表面的亲和分子与DNA分子的特异性结合,将DNA分子从其他杂质中分离出来。

具体操作步骤如下:首先将细胞裂解,使DNA分子释放到溶液中;然后加入磁珠,使其与DNA分子结合;最后利用磁力将磁珠与DNA分子分离,得到纯净的DNA分子。

DNA纯化方法有很多种,每种方法都有其优缺点。

在选择纯化方法时,需要根据实验的具体要求和样品的特点进行选择。

DNA和RNA提取方法及原理

DNA和RNA提取方法及原理

DNA和RNA提取方法及原理DNA提取方法:1.酚/氯仿方法:这是最早应用的DNA提取方法之一,适用于绝大多数生物样本。

原理是利用酚酸抽提DNA,酚酸能溶解细胞膜和蛋白质,而DNA在酚相沉淀。

然后用氯仿提取,分离DNA与酚相中的蛋白质和RNA。

最后通过乙醇沉淀纯化DNA。

这种方法可以得到高质量的DNA,但操作过程相对繁琐。

2.硅胶基质法:硅胶基质可吸附DNA,该方法使用硅胶膜或硅胶粉末来固定DNA,通过洗涤去除杂质,最后用洗脱液从硅胶上洗脱DNA。

这种方法具有简便和高纯度的优点,适用于大规模提取DNA。

3.盐酸法:盐酸法以酸性条件下使DNA变为不溶性沉淀物的原理,通过加入盐酸将DNA沉淀下来,然后经过洗涤和乙醇沉淀纯化。

这种方法适用于提取纯度要求不高的DNA。

RNA提取方法:1.酚酸提取法:这是最常用的RNA提取方法之一、原理类似于DNA的酚/氯仿法,通过酚酸将核酸与蛋白质和其他杂质分离。

然后通过氯仿脱脂,去除酚相中的蛋白质,并且获得RNA水相。

最后通过乙醇沉淀纯化RNA。

这种方法适用于大多数样品,得到的RNA纯度较高。

2.硅胶基质法:与DNA提取类似,它也适用于RNA的提取。

通过硅胶膜或硅胶粉末结合RNA并洗脱,用洗脱液分离RNA与杂质。

这种方法适用于大规模提取RNA。

3.氯仿法:这是一种较为简便的RNA提取方法,它通过氯仿脱脂去除脂质和其他杂质,并且能够同时去除DNA。

最后用乙醇沉淀纯化RNA。

这种方法适用于需要较快速提取RNA的情况。

DNA和RNA提取的基本原理都是通过分离和纯化DNA或RNA与其他杂质的物质。

酚酸提取法和硅胶基质法同属于酚酸法,都是通过酚酸和氯仿来分离DNA或RNA与蛋白质和其他杂质。

其中酚酸能溶解细胞膜和蛋白质,并且DNA或RNA在酚相中沉淀,而蛋白质和RNA在氯仿相中溶解。

然后通过洗脱和纯化步骤,从酚酸相中提取DNA或RNA。

盐酸法与酚酸法不同,它是通过酸性条件下使DNA变为不溶性沉淀物来分离DNA与其他杂质。

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酚氯仿法提取DNA主要步骤:1.将动物组织放在1.5ml的离心管中,分别用75%、50%酒精和纯水梯度脱酒精。

每个梯度脱水时间为5-10min2.将组织放入研钵中,加入适量DNA裂解液(300μl),研磨后再加入300μlDNA裂解液冲洗研磨棒。

3.将研磨好的组织液用移液枪加到1.5ml离心管,在管中加10μl蛋白酶K,用封口带将离心管封口,放入摇床(56℃,5h)。

4.加入等体积的Tris饱和酚(500μl),摇匀(10min)。

5.离心:12000R,7min,4℃。

离心后分成上中下三层,上层为DNA,中层为蛋白质,下层为有机质。

6.吸取上层液体加入新的离心管。

7.配制Tris饱和酚:氯仿:异戊醇=25:24:1。

8.在含有上清液的离心管中加入Tris饱和酚、氯仿和异戊醇混合液450μl,摇匀10min。

9.离心:12000R,7min,4℃。

10.吸取上清液加到新的离心管,加入等体积的氯仿和异戊醇混合液400μl(氯仿:异戊醇=24:1)。

11.离心:12000R,7min,4℃。

12.吸取上清液加入新的离心管,加入2.5倍经过-20℃冷冻的100%的酒精。

-20℃过夜。

13.将样品取出,12000R,7min,4℃离心。

14.弃上清,留白色沉淀(DNA),加400μl的75%的经过-20℃冷冻的酒精,反复吹打溶解。

15.重复第14步骤2次(用75%酒精洗三次)。

16.提取DNA完成。

溴氯仿法提取DNA的原理:用酚抽提细胞DNA时,有什么作用?使蛋白质变性,同时抑制了DNase的降解作用。

用苯酚处理匀浆液时,由于蛋白与DNA 联结键已断,蛋白分子表面又含有很多极性基团与苯酚相似相溶。

蛋白分子溶于酚相,而DNA 溶于水相。

使用酚的优点:1. 有效变性蛋白质;2. 抑制了DNase的降解作用。

缺点:1. 能溶解10-15%的水,从而溶解一部分poly(A)RNA。

2. 不能完全抑制RNase 的活性。

氯仿的作用?氯仿:克服酚的缺点;加速有机相与液相分层。

最后用氯仿抽提:去除核酸溶液中的迹量酚。

(酚易溶于氯仿中)用酚-氯仿抽提细胞基因组DNA时,通常要在酚-氯仿中加少许异戊醇,为什么?异戊醇:减少蛋白质变性操作过程中产生的气泡。

异戊醇可以降低表面张力,从而减少气泡产生。

另外,异戊醇有助于分相,使离心后的上层含DNA的水相、中间的变性蛋白相及下层有机溶剂相维持稳定。

用乙醇沉淀DNA时,为什么加入单价的阳离子?用乙醇沉淀DNA时,通常要在溶液中加入单价的阳离子,如NaCl 或NaAc,Na+中和DNA 分子上的负电荷,减少DNA分子之间的同性电荷相斥力,而易于聚集沉淀。

原理:动物和植物组织的脱氧核糖核蛋白(DNP)可溶于水或浓盐溶液(如1mol/L氯化钠),但在0.14mol/L氯化钠盐溶液中溶解度最低,而核酸核蛋白(RNP)则在0.14mol/L氯化钠中溶解度最大,利用这一性质可将其分开。

将沉淀物溶解于生理盐水,加入去污剂十二烷基硫酸钠(SDS)溶液,使DNA与蛋白质分离开。

加入固体氯化钠使其浓度达到1mol/L,使DNA溶解。

加氯仿-异戊醇去除蛋白质,也可重复该步操作得较纯DNA。

最后用95%乙醇沉淀DNA。

溶解:将离心后除去RNA的沉淀,用30ml生理盐水溶解,充分搅拌后,匀浆一次。

加4毫升10%SDS溶液,使溶液的SDS浓度达到1%左右,边加边搅拌,放置60 ℃水浴保温10分钟(不停搅拌),冷却。

加固体氯化钠,使溶液氯化钠浓度达到1mol/L,充分搅拌10分钟;除杂质:加等体积氯仿-异戊醇混合液,充分震荡10分钟,8000 r/min离心7分钟,取上层液量好体积,倒入烧杯中(离心管),加同体积的氯仿-异戊醇混合液,重复上次操作。

直至界面不出现蛋白凝胶为止;沉淀:准确量取上清液体积,加2倍体积95%冷乙醇,搅拌后,置冰箱静止冷却,待有白色丝状物出现,约10-15分钟,离心8000 r/min离心7分钟,得白色沉淀;溶解:将沉淀物用0.1mol/L NaOH约10毫升溶解,得DNA溶液。

溶液I—溶菌液:溶菌酶:它是糖苷水解酶,能水解菌体细胞壁的主要化学成分肽聚糖中的β-1,4糖苷键,因而具有溶菌的作用。

当溶液中pH小于8时,溶菌酶作用受到抑制。

葡萄糖:增加溶液的粘度,维持渗透压,防止DNA受机械剪切力作用而降解。

EDTA:(1)螯合Mg2+、Ca2+等金属离子,抑制脱氧核糖核酸酶对DNA的降解作用(DNase作用时需要一定的金属离子作辅基);(2)EDTA的存在,有利于溶菌酶的作用,因为溶菌酶的反应要求有较低的离子强度的环境。

溶液II-NaOH-SDS液:NaOH:核酸在pH大于5,小于9的溶液中,是稳定的。

但当pH >12或pH<3时,就会引起双链之间氢键的解离而变性。

在溶液II中的NaOH浓度为0.2mo1/L,加抽提液时,该系统的pH就高达12.6,因而促使染色体DNA与质粒DNA的变性。

SDS:SDS是离子型表面活性剂。

它主要功能有:(1)溶解细胞膜上的脂质与蛋白,因而溶解膜蛋白而破坏细胞膜。

(2)解聚细胞中的核蛋白。

(3)SDS能与蛋白质结合成为R-O-SO3-…R+-蛋白质的复合物,使蛋白质变性而沉淀下来。

但是SDS能抑制核糖核酸酶的作用,所以在以后的提取过程中,必须把它去除干净,防止在下一步操作中(用RNase 去除RNA时)受到干扰。

溶液III--3mol/L NaAc(pH4.8)溶液:NaAc的水溶液呈碱性,为了调节pH至4.8,必须加入大量的冰醋酸。

所以该溶液实际上是NaAc-HAc的缓冲液。

用pH4.8的NaAc溶液是为了把pH12.6的抽提液,调回pH至中性,使变性的质粒DNA能够复性,并能稳定存在。

而高盐的3mol/L NaAc有利于变性的大分子染色体DNA、RNA以及SDS-蛋白复合物凝聚而沉淀之。

前者是因为中和核酸上的电荷,减少相斥力而互相聚合,后者是因为钠盐与SDS -蛋白复合物作用后,能形成较小的钠盐形式复合物,使沉淀更完全。

为什么用无水乙醇沉淀DNA?用无水乙醇沉淀DNA,这是实验中最常用的沉淀DNA的方法。

乙醇的优点是可以任意比和水相混溶,乙醇与核酸不会起任何化学反应,对DNA很安全,因此是理想的沉淀剂。

DNA溶液是DNA以水合状态稳定存在,当加入乙醇时,乙醇会夺去DNA周围的水分子,使DNA失水而易于聚合。

一般实验中,是加2倍体积的无水乙醇与DNA相混合,其乙醇的最终含量占67%左右。

因而也可改用95%乙醇来替代无水乙醇(因为无水乙醇的价格远远比95%乙醇昂贵)。

但是加95%的乙醇使总体积增大,而DNA在溶液中有一定程度的溶解,因而DNA损失也增大,尤其用多次乙醇沉淀时,就会影响收得率。

折中的做法是初次沉淀DNA时可用95%乙醇代替无水乙酵,最后的沉淀步骤要使用无水乙醇。

也可以用0.6倍体积的异丙醇选择性沉淀DNA。

一般在室温下放置15-30分钟即可。

在用乙醇沉淀DNA时,为什么一定要加NaAc或NaCl至最终浓度达0.1~0.25mol/L?在pH为8左右的溶液中,DNA分子是带负电荷的,加一定浓度的NaAc或NaCl,使Na+中和DNA分子上的负电荷,减少DNA分子之间的同性电荷相斥力,易于互相聚合而形成DNA 钠盐沉淀,当加入的盐溶液浓度太低时,只有部分DNA形成DNA钠盐而聚合,这样就造成DNA沉淀不完全,当加入的盐溶液浓度太高时,其效果也不好。

在沉淀的DNA中,由于过多的盐杂质存在,影响DNA的酶切等反应,必须要进行洗涤或重沉淀。

加核糖核酸酶降解核糖核酸后,为什么再要用SDS与KAc来处理?加进去的RNase本身是一种蛋白质,为了纯化DNA,又必须去除之,加SDS可使它们成为SDS-蛋白复合物沉淀,再加KAc使这些复合物转变为溶解度更小的钾盐形式的SDS-蛋白质复合物,使沉淀更加完全。

也可用饱和酚、氯仿抽提再沉淀,去除RNase。

在溶液中,有人以KAc代替NaAc,也可以收到较好效果。

7.为什么在保存或抽提DNA过程中,一般采用TE缓冲液?在基因操作实验中,选择缓冲液的主要原则是考虑DNA的稳定性及缓冲液成分不产生干扰作用。

磷酸盐缓冲系统(pKa =7.2)和硼酸系统(pKa=9.24)等虽然也都符合细胞内环境的生理范围(pH),可作DNA的保存液,但在转化实验时,磷酸根离子的种类及数量将与Ca2+产生Ca3(PO4)2沉淀;在DNA反应时,不同的酶对辅助因子的种类及数量要求不同,有的要求高离子浓度,有的则要求低盐浓度,采用Tris-HCl(pKa=8.0)的缓冲系统,由于缓冲液是TrisH+/Tris,不存在金属离子的干扰作用,故在提取或保存DNA时,大都采用Tris-HCl系统,而TE缓冲液中的EDTA更能稳苯酚、氯仿、异戊醇在DNA提取时的作用抽提DNA去除蛋白质时,怎样使用酚与氯仿较好?酚与氯仿是非极性分子,水是极性分子,当蛋白水溶液与酚或氯仿混合时,蛋白质分子之间的水分子就被酚或氯仿挤去,使蛋白失去水合状态而变性。

经过离心,变性蛋白质的密度比水的密度为大,因而与水相分离,沉淀在水相下面,从而与溶解在水相中的DNA分开。

而酚与氯仿有机溶剂比重更大,保留在最下层。

作为表面变性的酚与氯仿,在去除蛋白质的作用中,各有利弊,酚的变性作用大,但酚与水相有一定程度的互溶,大约10%~15%的水溶解在酚相中,因而损失了这部分水相中的DNA,而氯仿的变性作用不如酚效果好,但氯仿与水不相混溶,不会带走DNA。

所以在抽提过程中,混合使用酚与氯仿效果最好。

经酚第一次抽提后的水相中有残留的酚,由于酚与氯仿是互溶的,可用氯仿第二次变性蛋白质,此时一起将酚带走。

也可以在第二次抽提时,将酚与氯仿混合(1:1)使用。

为什么用酚与氯仿抽提DNA时,还要加少量的异戊酵?在抽提DNA时,为了混合均匀,必须剧烈振荡容器数次,这时在混合液内易产生气泡,气泡会阻止相互间的充分作用。

加入异戊醇能降低分子表面张力,所以能减少抽提过程中的泡沫产生。

一般采用氯仿与异戊酵为24:1之比。

也可采用酚、氯仿与异戊醇之比为25:24:1(不必先配制,可在临用前把一份酚加一份24:1的氯仿与异戊醇即成),同时异戊醇有助于分相,使离心后的上层水相,中层变性蛋白相以及下层有机溶剂相维持稳定。

苯酚:氯仿:异戊醇为什么要25:24:1?抽提DNA去除蛋白质时,怎样使用酚与氯仿较好?酚与氯仿是非极性分子,水是极性分子,当蛋白水溶液与酚或氯仿混合时,蛋白质分子之间的水分子就被酚或氯仿挤去,使蛋白失去水合状态而变性。

经过离心,变性蛋白质的密度比水的密度为大,因而与水相分离,沉淀在水相下面,从而与溶解在水相中的DNA分开。

而酚与氯仿有机溶剂比重更大,保留在最下层。

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