常用细胞凋亡检测方法(图)

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细胞凋亡试验常用的方法

细胞凋亡试验常用的方法

细胞凋亡试验常用的方法(MTT法、荧光法、DNA琼脂糖凝胶电泳法与流式细胞仪检测法)(一)药物对肿瘤细胞的抑制效应的MTT法:用培养基将肿瘤细胞调整至2 X108个/L,在96孔板中每孔加入100ul细胞悬液于37℃、5% CO2下培养过夜。

次日每孔加入不同浓度的药物100mg/L作为试验组,设加完全培养基不加药物的阴性对照,并用功能明确的药物为阳性对照和0.5%的乙醇溶剂对照,每组均设4-6个复孔(平行孔)、37℃、5% CO2继续培养。

培养至12h、24h、48h、实验终止前4-6h加入10ulMTT(5g/L),培养4-6h后,阴性对照孔中已形成明显的蓝紫色颗粒结晶时加100ul/孔SDS-HCl终止反应,于37℃存放过夜。

用酶标仪在A570波长下测吸光度值,按下式计算抑制率抑制率(%)=(1-试验组平均吸光度值/阴性对照组平均吸光度值)x 100%。

(二)荧光法:选用上述最佳浓度作用于肿瘤细胞,培养细胞48h后,收货细胞用PBS洗2-3次后用0.4%多聚甲醛室温下固定30min。

弃去固定液,并用PBS洗2次后,用1%Triton X-100作用4min加入适量的0.5mg/L DAPI 荧光染色60min,用PBS冲洗3次,取10ul滴片,干燥后于荧光显微镜下检测断裂的颗粒和片状荧光。

(三)DNA琼脂糖凝胶电泳法:1、DNA提取:用大方瓶培养肿瘤细胞,每瓶10ml,细胞浓度为3 x 108个/ml,每隔药物浓度、作用时间均设2瓶,共分3个时间段,4个药物浓度。

共培养26瓶细胞。

分别于细胞中加入不同浓度的药物,于37℃、5% CO2中分别培养12h、24h、48h,收货细胞,用PBS洗2-3次。

于-20℃将细胞冷却处理10min后将细胞收集至离心管中,加1ml细胞裂解液,再加蛋白酶K,轻轻振摇使悬液混匀,成黏糊状,50℃过夜。

冷却后加入等体积的饱和酚溶液,混合后10000r/min离心10min,吸出上层水相,移至另一离心管中,再加入等体积饱和酚溶液重复抽提一次,直到无蛋白为止。

细胞凋亡的几种检测方法

细胞凋亡的几种检测方法

细胞凋亡的几种检测方法Company number:【WTUT-WT88Y-W8BBGB-BWYTT-19998】细胞凋亡的几种检测方法1、形态学观察方法(1)HE(苏木精—伊红染色法)染色、光镜观察:凋亡细胞呈圆形,胞核深染,胞质浓缩,染色质成团块状,细胞表面有“出芽”现象。

(2)丫啶橙(AO)染色,荧光显微镜观察:活细胞核呈黄绿色荧光,胞质呈红色荧光。

凋亡细胞核染色质呈黄绿色浓聚在核膜内侧,可见细胞膜呈泡状膨出及凋亡小体。

(3)台盼蓝染色:如果细胞膜不完整、破裂,台盼蓝染料进入细胞,细胞变蓝,即为坏死。

如果细胞膜完整,细胞不为台盼蓝染色,则为正常细胞或凋亡细胞。

此方法对反映细胞膜的完整性,区别坏死细胞有一定的帮助。

(4)透射电镜观察:可见凋亡细胞表面微绒毛消失,核染色质固缩、边集,常呈新月形,核膜皱褶,胞质紧实,细胞器集中,胞膜起泡或出“芽”及凋亡小体和凋亡小体被临近巨噬细胞吞噬现象。

2、 DNA凝胶电泳细胞发生凋亡或坏死,其细胞DNA均发生断裂,细胞内小分子量DNA片断增加,高分子DNA减少,胞质内出现DNA片断。

但凋亡细胞DNA断裂点均有规律的发生在核小体之间,出现180-200bpDNA片断,而坏死细胞的DNA断裂点为无特征的杂乱片断,利用此特征可以确定群体细胞的死亡,并可与坏死细胞区别。

正常活细胞DNA 电泳出现阶梯状(LADDER)条带;坏死细胞DNA电泳类似血抹片时的连续性条带3、酶联免疫吸附法(ELISA)核小体测定凋亡细胞的DNA断裂使细胞质内出现核小体。

核小体由组蛋白及其伴随的DNA片断组成,可由ELISA法检测。

检测步骤1、将凋亡细胞裂解后高速离心,其上清液中含有核小体;2、在微定量板上吸附组蛋白体’3、加上清夜使抗组蛋白抗体与核小体上的组蛋白结合‘4、加辣过氧化物酶标记的抗DNA抗体使之与核小体上的DNA结合’4、加酶的底物,测光吸收制。

用途该法敏感性高,可检测5*100/ml个凋亡细胞。

细胞凋亡的六种检查方法

细胞凋亡的六种检查方法

细胞凋亡的六种检查方法一、引言细胞凋亡是一种重要的细胞死亡方式,它在生物体的正常发育和疾病的发生中都起到了重要作用。

因此,对于细胞凋亡的检测方法也成为了科学家们关注的焦点之一。

本文将介绍六种常见的细胞凋亡检测方法。

二、TUNEL法TUNEL法是一种常见的检测DNA断裂和凋亡细胞数量的方法。

它利用末端脱氧核苷酸转移酶(TdT)标记DNA断裂末端,并通过荧光或酶标记来检测。

操作步骤如下:1. 取出样品,并将其固定在载玻片上;2. 用缓冲液进行处理,使得DNA断裂末端暴露出来;3. 加入TdT和dUTP标记物,使得dUTP与DNA断裂末端连接;4. 洗涤样品,并加入抗dUTP抗体标记物;5. 洗涤样品,并观察荧光或颜色变化。

三、Annexin V染色法Annexin V染色法可以同时检测早期和晚期凋亡细胞。

它利用细胞表面磷脂酰肌醇二磷酸(PIP2)的变化,通过Annexin V结合检测细胞凋亡。

操作步骤如下:1. 取出样品,并将其固定在载玻片上;2. 加入Annexin V标记物,使得其与PIP2结合;3. 加入PI染色剂,使得细胞核染色;4. 观察荧光或颜色变化。

四、Caspase活性检测法Caspase活性检测法可以检测细胞内Caspase的活性水平,从而判断凋亡的程度。

操作步骤如下:1. 取出样品,并将其固定在载玻片上;2. 加入Caspase底物和缓冲液,使得Caspase底物被水解;3. 观察荧光或颜色变化。

五、DNA Ladder分析法DNA Ladder分析法可以检测DNA的断裂情况,从而判断凋亡的程度。

操作步骤如下:1. 取出样品,并提取其中的DNA;2. 用琼脂糖凝胶电泳分离DNA,并观察条带形态。

六、电子显微镜观察法电子显微镜观察法可以直接观察细胞的形态和结构变化,从而判断凋亡的程度。

操作步骤如下:1. 取出样品,并进行适当处理;2. 用电子显微镜观察细胞形态和结构变化。

七、总结以上六种方法是常见的细胞凋亡检测方法,每种方法都有其特点和优缺点。

鉴定细胞凋亡的常用方法

鉴定细胞凋亡的常用方法

鉴定细胞凋亡的常用方法细胞凋亡是细胞程序性死亡的一种形式,是维持生物体正常生长发育和组织修复的重要机制。

凋亡与疾病的关系密切,如肿瘤、神经退行性疾病、心血管疾病等。

因此,鉴定细胞凋亡的常用方法对于疾病的诊断和治疗具有重要的意义。

本文将介绍几种常用的细胞凋亡鉴定方法。

一、TUNEL法TUNEL法是一种基于末端脱氧核苷酸转移酶(dUTP-nick end labeling,TUNEL)技术的细胞凋亡检测方法。

该方法通过在细胞凋亡时,末端脱氧核苷酸转移酶(dUTP-nick end labeling,TUNEL)将标记物dUTP标记在DNA的3'末端,然后使用荧光显微镜观察标记物的荧光强度。

该方法的优点是操作简便,结果准确可靠,适用于多种样本类型的细胞凋亡检测。

二、Annexin V-FITC/PI双染法Annexin V-FITC/PI双染法是一种流式细胞术检测细胞凋亡的方法。

该方法通过Annexin V结合细胞膜上的磷脂酰胆碱(PS)和PI结合细胞核DNA,将细胞分为四个区域:Annexin V-FITC(-)/PI(-)区域表示正常细胞;Annexin V-FITC(+)/PI(-)区域表示早期凋亡细胞;Annexin V-FITC(+)/PI(+)区域表示晚期凋亡细胞;AnnexinV-FITC(-)/PI(+)区域表示坏死细胞。

该方法的优点是高灵敏度和高特异性,可以同时检测细胞凋亡和坏死。

三、DNA Ladder检测DNA Ladder检测是一种检测细胞凋亡的传统方法。

该方法通过电泳分离DNA,检测DNA的大小和形态是否发生变化,如出现约180bp 的DNA片段,则提示细胞凋亡。

该方法的缺点是需要较多的细胞样本,且不能区分细胞凋亡的早期和晚期。

四、Caspase活性检测Caspase是细胞凋亡的重要调节因子,Caspase活性检测是一种检测细胞凋亡的方法。

该方法通过检测Caspase活性的改变来判断细胞凋亡的程度,如Caspase-3活性增加,则提示细胞凋亡。

常用细胞凋亡检测方法(图)

常用细胞凋亡检测方法(图)

常用细胞凋亡检测方法(图)转载请注明来自丁香园发布日期:2012-02-16 13:41 文章来源:丁香通关键词:丁香园生物专题义翘神州细胞培养点击次数:951一、细胞凋亡的形态学检测1、光学显微镜和倒置显微镜①未染色细胞:凋亡细胞的体积变小、变形,细胞膜完整但出现发泡现象,细胞凋亡晚期可见凋亡小体。

贴壁细胞出现皱缩、变圆、脱落。

②染色细胞:常用姬姆萨染色、瑞氏染色等。

凋亡细胞的染色质浓缩、边缘化,核膜裂解、染色质分割成块状和凋亡小体等典型的凋亡形态。

2、荧光显微镜和共聚焦激光扫描显微镜一般以细胞核染色质的形态学改变为指标来评判细胞凋亡的进展情况。

常用的DNA 特异性染料有:HO 33342 (Hoechst 33342),HO 33258 (Hoechst 33258), DAPI。

三种种染料与DNA的结合是非嵌入式的,主要结合在DNA的A-T碱基区。

紫外光激发时发射明亮的蓝色荧光。

Hoechst是与DNA特异结合的活性染料,储存液用蒸馏水配成1mg/ml的浓度,使用时用PBS稀释,终浓度为10 ug/ml。

DAPI为半通透性,用于常规固定细胞的染色。

储存液用蒸馏水配成1mg/ml的浓度,使用终浓度一般为10 ug/ml。

结果评判:细胞凋亡过程中细胞核染色质的形态学改变分为三期:Ⅰ期的细胞核呈波纹状(rippled)或呈折缝样(creased),部分染色质出现浓缩状态;Ⅱa期细胞核的染色质高度凝聚、边缘化;Ⅱb期的细胞核裂解为碎块,产生凋亡小体(图1)。

3、透射电子显微镜观察结果评判:凋亡细胞体积变小,细胞质浓缩。

凋亡Ⅰ期(pro-apoptosis nuclei)的细胞核内染色质高度盘绕,出现许多称为气穴现象(cavitations)的空泡结构(图2);Ⅱa期细胞核的染色质高度凝聚、边缘化;细胞凋亡的晚期,细胞核裂解为碎块,产生凋亡小体。

二、磷脂酰丝氨酸外翻分析(Annexin V法)磷脂酰丝氨酸(Phosphatidylserine, PS)正常位于细胞膜的内侧,但在细胞凋亡的早期,PS可从细胞膜的内侧翻转到细胞膜的表面,暴露在细胞外环境中(图3)。

细胞凋亡常见的检测方法

细胞凋亡常见的检测方法

细胞凋亡常见的检测方法
细胞凋亡常见的检测方法包括:
1. 细胞形态观察:细胞凋亡时,细胞会出现形态改变,如细胞体积减小、细胞核变小、细胞膜起泡等,可以通过显微镜观察细胞形态的改变来判断细胞是否发生凋亡。

2. 核染色观察:通过核染色技术,如单染色或双染色,可使用碘化丙啶、DAPI等荧光染料或Giemsa染色等方法,观察细胞核的形态和染色情况,从而判断细胞是否发生凋亡。

3. DNA损伤分析:通过DNA断裂、破碎等损伤的检测方法,如凝胶电泳分析、单细胞凝胶电泳分析、TUNEL染色等,可以检测细胞DNA的完整性,判断细胞是否发生凋亡。

4. 细胞膜的磷脂外翻:通过荧光标记磷脂的外露,如荧光标记的Annexin V结合细胞膜上翻暴露的磷脂,可以评估细胞凋亡程度。

5. 细胞色素C的释放:细胞凋亡时,线粒体膜破裂导致细胞色素C的释放,可以通过免疫荧光染色或Western blot等方法检测细胞色素C的定位及含量,来判断细胞是否发生凋亡。

6. caspase酶活性检测:Caspase酶是细胞凋亡过程的关键执行酶,通过检测Caspase活性、测定Caspase相关蛋白的水解活性,如Caspase-3、Caspase-8、Caspase-9等,可以判断细胞是否发生凋亡。

7. Annexin V/PI染色:通过Annexin V与细胞膜外露的磷脂结合,并使用胞内核酸染料PI进行双染色,可以实现对活细胞、早期凋亡细胞、晚期凋亡细胞的区分和定量。

细胞凋亡检测AnnexinVFITC单染法AssayofCellApoptosis

细胞凋亡检测AnnexinVFITC单染法AssayofCellApoptosis

细胞凋亡检测(Annexin-V-FITC 单染法)(Assay of CellApoptosis)2010-05-25 20:06:41 来源:浏览次数:197细胞凋亡或称程序性细胞死亡(Programmed Cell Death ,PCD)是细胞的生命现象之一,它在机体的胚胎发育、组织修复及自身反应性T淋巴细胞的清除等方面起着十分重要的作用。

细胞凋亡调节的失控可导致临床各种疾病的发生。

如老年性痴呆与神经细胞凋亡过度有关,自身免疫性疾病和肿瘤与细胞凋亡的抑制有关。

细胞凋亡有别于细胞坏死,它有一系列的细胞形态学和生物化学的改变,包括出现染色质浓缩、DNA降解、凋亡小体形成等。

关键词:一、实验原理细胞凋亡或称程序性细胞死亡(Programmed Cell Death ,PCD)是细胞的生命现象之一,它在机体的胚胎发育、组织修复及自身反应性T淋巴细胞的清除等方面起着十分重要的作用。

细胞凋亡调节的失控可导致临床各种疾病的发生。

如老年性痴呆与神经细胞凋亡过度有关,自身免疫性疾病和肿瘤与细胞凋亡的抑制有关。

细胞凋亡有别于细胞坏死,它有一系列的细胞形态学和生物化学的改变,包括出现染色质浓缩、DNA降解、凋亡小体形成等。

在正常的活细胞,磷脂酰丝氨酸(phosphotidylserine,PS)位于细胞膜的内侧,但在凋亡的细胞,PS 从细胞膜的内侧翻转到细胞膜的表面,暴露在细胞外环境中。

Annexin-Ⅴ(膜联蛋白-V)是一种分子量为35-36KD的Ca2+ 依赖性磷脂结合蛋白,能与PS高亲和力结合。

因此将Annexin-Ⅴ进行荧光素(如FITC、PE)或生物素(Biotin)标记,以标记了的Annexin-Ⅴ作为探针,利用或可检测细胞凋亡的发生。

二、实验仪器和材料Annexin V-FITC(膜联蛋白-V-FITC)500μl/250μl 20μg/ml标记缓冲液(Binding Buffe)r 40/20 mlPBS(1×)60/30 ml20μl , 200μl , and 1000μl 和微量可调速载玻片(用于观察)盖玻片(用于观察)去离子水冰块或荧光显微镜三、实验方法1.凋亡细胞的制备:小鼠腹腔注射地塞米松25mg/kg体重,10h后解剖取胸腺,分离胸腺细胞。

细胞凋亡检测方法和实验标准

细胞凋亡检测方法和实验标准

细胞凋亡检测方法和实验标准常用的细胞凋亡检测方法1. DNA片段化检测DNA片段化是细胞凋亡的一个明显特征。

常用的DNA片段化检测方法包括:- 凝胶电泳:将凋亡细胞的DNA提取出来,通过凝胶电泳可以观察到DNA片段化的特征。

- TUNEL(末端脱氧核苷酸转移酶介导的dUTP接头标记):使用TUNEL试剂可以标记凋亡细胞的DNA断裂端,通过显微镜观察可以检测到凋亡细胞的存在。

2. 细胞色素c释放检测细胞凋亡时,线粒体内的细胞色素c会释放出来。

常用的细胞色素c释放检测方法包括:- 免疫荧光染色:使用特定抗体标记细胞色素c,通过荧光显微镜观察可以检测到细胞色素c的释放情况。

- Western blotting:使用特定抗体检测细胞色素c的蛋白表达水平,可以间接判断细胞色素c的释放。

3. 细胞内和细胞外凋亡标志物检测细胞凋亡过程中会产生一些特定的标志物,可以用于凋亡检测。

常用的细胞内和细胞外凋亡标志物包括:- 单克隆抗体检测:使用特定抗体识别和检测细胞内和细胞外的凋亡相关标志物,如凋亡相关蛋白、凋亡相关受体等。

- 酶标记法:利用特定的酶标记物标记凋亡相关标志物,通过酶标仪测量酶的活性来判断凋亡的发生。

实验标准为了保证细胞凋亡检测的可靠性和精确性,在进行实验时应遵守以下标准:1. 样本准备:样本的准备应严格遵循实验方案,包括细胞培养、药物处理、提取样本等步骤。

同时,应采用质量控制措施,确保样本的一致性和可比性。

2. 试剂选择:选择具有高灵敏度和特异性的试剂,确保能够准确检测细胞凋亡的发生。

3. 方法验证:在进行细胞凋亡检测之前,应先进行方法验证和优化,确保所选择的方法可以准确、可重复地检测细胞凋亡。

4. 阳性和阴性对照:在每个实验中都应包括阳性和阴性对照,以确认实验结果的准确性和可靠性。

5. 数据分析:对实验结果进行准确的数据分析和统计处理,确保结果的可解释性和可靠性。

6. 结果报告:结果应准确、清晰地呈现,包括实验方法、样本信息、数据分析和统计结果等信息。

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常用细胞凋亡检测方法(图)转载请注明来自丁香园发布日期:2012-02-16 13:41 文章来源:丁香通关键词:丁香园生物专题义翘神州细胞培养点击次数:951一、细胞凋亡的形态学检测1、光学显微镜和倒置显微镜①未染色细胞:凋亡细胞的体积变小、变形,细胞膜完整但出现发泡现象,细胞凋亡晚期可见凋亡小体。

贴壁细胞出现皱缩、变圆、脱落。

②染色细胞:常用姬姆萨染色、瑞氏染色等。

凋亡细胞的染色质浓缩、边缘化,核膜裂解、染色质分割成块状和凋亡小体等典型的凋亡形态。

2、荧光显微镜和共聚焦激光扫描显微镜一般以细胞核染色质的形态学改变为指标来评判细胞凋亡的进展情况。

常用的DNA 特异性染料有:HO 33342 (Hoechst 33342),HO 33258 (Hoechst 33258), DAPI。

三种种染料与DNA的结合是非嵌入式的,主要结合在DNA的A-T碱基区。

紫外光激发时发射明亮的蓝色荧光。

Hoechst是与DNA特异结合的活性染料,储存液用蒸馏水配成1mg/ml的浓度,使用时用PBS稀释,终浓度为10 ug/ml。

DAPI为半通透性,用于常规固定细胞的染色。

储存液用蒸馏水配成1mg/ml的浓度,使用终浓度一般为10 ug/ml。

结果评判:细胞凋亡过程中细胞核染色质的形态学改变分为三期:Ⅰ期的细胞核呈波纹状(rippled)或呈折缝样(creased),部分染色质出现浓缩状态;Ⅱa期细胞核的染色质高度凝聚、边缘化;Ⅱb期的细胞核裂解为碎块,产生凋亡小体(图1)。

3、透射电子显微镜观察结果评判:凋亡细胞体积变小,细胞质浓缩。

凋亡Ⅰ期(pro-apoptosis nuclei)的细胞核内染色质高度盘绕,出现许多称为气穴现象(cavitations)的空泡结构(图2);Ⅱa期细胞核的染色质高度凝聚、边缘化;细胞凋亡的晚期,细胞核裂解为碎块,产生凋亡小体。

二、磷脂酰丝氨酸外翻分析(Annexin V法)磷脂酰丝氨酸(Phosphatidylserine, PS)正常位于细胞膜的内侧,但在细胞凋亡的早期,PS可从细胞膜的内侧翻转到细胞膜的表面,暴露在细胞外环境中(图3)。

Annexin-V是一种分子量为35~36KD的Ca2+依赖性磷脂结合蛋白,能与PS高亲和力特异性结合。

将Annexin-V进行荧光素(FITC、PE)或biotin标记,以标记了的Annexin-V作为荧光探针,利用流式细胞仪或荧光显微镜可检测细胞凋亡的发生。

碘化丙啶(propidine iodide, PI)是一种核酸染料,它不能透过完整的细胞膜,但在凋亡中晚期的细胞和死细胞,PI能够透过细胞膜而使细核红染。

因此将Annexin-V 与PI匹配使用,就可以将凋亡早晚期的细胞以及死细胞区分开来。

方法1、悬浮细胞的染色:将正常培养和诱导凋亡的悬浮细胞(0.5~1×106)用PBS洗2次,加入100ul Binding Buffer和FITC标记的Annexin-V(20ug/ml)10ul,室温避光30min,再加入PI(50ug/ml)5ul,避光反应5min后,加入400ul Binding Buffer,立即用FACScan进行流式细胞术定量检测(一般不超过1h),同时以不加AnnexinV-FITC及PI的一管作为阴性对照。

2、贴壁培养的细胞染色:先用0.25%的胰酶消化,洗涤、染色和分析同悬浮细胞。

3、爬片细胞染色:同上,最后用荧光显微镜和共聚焦激光扫描显微镜进行观察。

结果[图4、图5]注意事项1、整个操作动作要尽量轻柔,勿用力吹打细胞。

2、操作时注意避光,反应完毕后尽快在一小时内检测。

三、线粒体膜势能的检测线粒体在细胞凋亡的过程中起着枢纽作用,多种细胞凋亡刺激因子均可诱导不同的细胞发生凋亡,而线粒体跨膜电位DYmt的下降,被认为是细胞凋亡级联反应过程中最早发生的事件,它发生在细胞核凋亡特征(染色质浓缩、DNA断裂)出现之前,一旦线粒体DYmt崩溃,则细胞凋亡不可逆转。

线粒体跨膜电位的存在,使一些亲脂性阳离子荧光染料如Rhodamine 123、3,3-Dihexyloxacarbocyanine iodide[DiOC6(3)]、Tetrechloro-tetraethylbenzimidazol carbocyanine iodide[JC-1]、Tetramethyl rhodamine methyl ester(TMRM)等可结合到线粒体基质,其荧光的增强或减弱说明线粒体内膜电负性的增高或降低。

方法:将正常培养的细胞和诱导凋亡的细胞加入使用终浓度为Rhodamine 123(1mM)或终浓度为DiOC6(25nM),JC-1(1mM),TMRM(100nM),37℃平衡30min,流式细胞计检测细胞的荧光强度。

注意事项1、始终保持平衡染液中pH值的一致性,因为pH值的变化将影响膜电位。

2、与染料达到平衡的细胞悬液中如果含有蛋白,他们将与部分染料结合,降低染料的浓度,引起假去极化。

四、DNA片断化检测细胞凋亡时主要的生化特征是其染色质发生浓缩, 染色质DNA在核小体单位之间的连接处断裂, 形成50~300kbp长的DNA大片段, 或180~200bp整数倍的寡核苷酸片段, 在凝胶电泳上表现为梯形电泳图谱(DNA ladder)。

细胞经处理后,采用常规方法分离提纯DNA,进行琼脂糖凝胶和溴化乙啶染色,在凋亡细胞群中可观察到典型的DNA ladder。

如果细胞量很少,还可在分离提纯DNA后,用32P-ATP和脱氧核糖核苷酸末端转移酶(TdT)使DNA标记,然后进行电泳和放射自显影,观察凋亡细胞中DNA ladder的形成。

1、大分子染色体DNA片段的测定细胞凋亡的早期,染色体断裂成为50~300kbp长的DNA大片段。

所有超过一定分子量大小的双链DNA分子在琼脂糖凝胶中的迁移速度相同。

线性DNA的双螺旋半径超过凝胶半径时,即达到分辨力的极限。

此时凝胶不再按分子量的大小来筛分DNA,DNA 像通过弯管一样,以其一端指向电场一极而通过凝胶,这种迁移模式称之为"爬行"。

因此,细胞凋亡早期产生的50~300kbp长的DNA大片段不能用普通的琼脂糖凝胶电泳来分离。

通常采用脉冲电泳技术可圆满地解决这一问题。

这个方法是在凝胶上外加正交的交变脉冲电场。

每当电场方向改变后,大的DNA分子便滞流在爬行管中,直至新的电场轴向重新定向后,才能继续向前移动。

DNA分子量越大,这种重排所需要的时间就越长。

当DNA分子变换方向的时间小于电脉冲周期时,DNA就可以按其分子量大小分开。

参考文献Brown,D.G., Sun, X.M., and Cohen, G.M.(1993) Dexamethasone-induced apoptosis involves cleavage of DNA to large fragments prior to internucleosomal fragmentation. J. Biol.Chem. 268, 3037-30392、DNA Ladder 测定方法:收获细胞(1′107)沉淀?细胞裂解液?13000rpm′5min, 收集上清?1%SDS 和RnaseA(5mg/ml)56°C,2h?蛋白酶K(2.5mg/ml)37°C,2h?1/10体积3M 醋酸钠和2.5倍体积的冷无水乙醇沉淀DNA,4℃过夜?14000rpm′15min?最后将沉淀溶解在TE buffer中,加DNA Loading Buffer?1.2%琼脂糖凝胶电泳,EB染色并照相。

结果:[图6]参考文献Herrmannm M, Lorenz HM, Voll R et al. A Rapid and simple method for the isolation of apoptotic DNA fragments. Nucleic Acid Res. 1994; 22:5506-55073、凋亡细胞DNA含量的流式细胞计分析方法:收集细胞?70%冷乙醇(in PBS)4℃固定过夜?PBS洗涤,1000rpm′10min?RNase A(0.5mg/ml)37℃消化30min?PI(50mg/ml)染色,室温避光15min?FACScan分析DNA亚二倍体的形成及细胞周期的变化。

结果:[图8]4、ApoAlertTM LM-PCR Ladder Assay (CLONTECH)优点:敏感度高,适合于检测少量样本,小部分凋亡细胞。

如临床活组织检测。

五、TUNEL法细胞凋亡中, 染色体DNA双链断裂或单链断裂而产生大量的粘性3'-OH末端,可在脱氧核糖核苷酸末端转移酶(TdT)的作用下,将脱氧核糖核苷酸和荧光素、过氧化物酶、碱性磷酸酶或生物素形成的衍生物标记到DNA的3'-末端,从而可进行凋亡细胞的检测,这类方法称为脱氧核糖核苷酸末端转移酶介导的缺口末端标记法(terminal-deoxynucleotidyl transferase mediated nick end labeling, TUNEL)。

由于正常的或正在增殖的细胞几乎没有DNA的断裂,因而没有3'-OH形成,很少能够被染色。

TUNEL实际上是分子生物学与形态学相结合的研究方法,对完整的单个凋亡细胞核或凋亡小体进行原位染色,能准确地反应细胞凋亡典型的生物化学和形态特征,可用于石蜡包埋组织切片、冰冻组织切片、培养的细胞和从组织中分离的细胞的细胞形态测定,并可检测出极少量的凋亡细胞,因而在细胞凋亡的研究中被广泛采用。

六、Caspase-3活性的检测Caspase家族在介导细胞凋亡的过程中起着非常重要的作用,其中caspase-3为关键的执行分子,它在凋亡信号传导的许多途径中发挥功能。

Caspase-3正常以酶原(32KD)的形式存在于胞浆中,在凋亡的早期阶段,它被激活,活化的Caspase-3由两个大亚基(17KD)和两个小亚基(12KD)组成,裂解相应的胞浆胞核底物,最终导致细胞凋亡。

但在细胞凋亡的晚期和死亡细胞,caspase-3的活性明显下降。

1、Western blot 分析Western blot 分析Procaspase-3的活化,以及活化的Caspase-3及对底物多聚(ADP-核糖)聚合酶[poly(ADP-ribose)polymerase,PARP]等的裂解。

方法:收集细胞→PBS洗涤→抽提细胞裂解液→蛋白定量→SDS-PAGE电泳→硝酸纤维素膜或PVDF膜转移→5%脱脂奶粉封闭,室温1.5~2h或4℃过夜→Caspase-3多抗或单抗室温反应1~2h或4°C过夜→TBS-T(含0.05% Tween 20的TBS)洗3次,5~10min/次→HRP-标记的羊抗鼠IgG或AP标记的羊抗鼠IgG室温反应1~2h→TBS-T洗3次,5~10min/次?→ECL显影或NBT/BCIP显色。

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