pubmed检索教程教程
第八章pubmed 检索方法

(3)著者检索: 遵循“姓前名后”原则,姓用全称,名用缩写。 如:Smith JR
Smith J@ Yang[AU]
(4)刊名检索: 可用期刊名全称,也可用MesH期刊名缩写检索。 如:Molecular biology of the cell[ta]
Mol biol cell[ta]
(5)文献类型检索: 文献类型标识符[PT],如欲检索综述文献可使 用检索式review[PT]即可。
Internet网络上有三十多个站点提供Free Medline检索服务,如:PubMed, HealthGate, Medscape,Medical Matrix,BioMedNet等。但只 有PubMed是官方网站。
/pubmed
三、Pubmed检索系统
Pubmed检索规则:
Pubmed进行字段限定检索时,字段标识符加 在检索词之后;字段标识符必须用方括号括起来; 大小写以及检索词与方括号之间有无空格无关紧 要。
Pubmed处理布尔逻辑表达式是按从左到右的 顺序进行的。但可以通过括号来改变运算顺序。 如果Pubmed发现检索式中有非限定的词组,它就 自动检索该词组,再将该集合与检索式的其它项 进行运算。
字段标识符 [AD]:机构、第一作者地址 [ALL]:所有字段 [AU]:作者姓名 [TA]:期刊名 [LA]:语种 [MAJR]:主要概念的医学主题词 [MH]:医学主题词 [PT]:出版类型 [TW]:文本词 [TI]:题名 [DP]: 出版日期
练习题: 1、查肺肿瘤放射疗法,任选题录、文摘、全 文各1篇,按Medline格式显示。 (lung neoplasms/radiography[mh]) 2、比较brain[tw]和brain的检索结果 3、检索Vitamin h,查验检索词的转换情况 4、比较Smith JR[AU]和Smith JR的检索结果 5、查期刊molecular biology of the cell 上的文章 6、检索肺肿瘤2002年综述文献
pubmed检索教程

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促进全世界范围内生物技术信息收集的合作。
复旦大学图书馆文献检索教研室
2016/5/27
NCBI网站
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复旦大学图书馆文献检索教研室
2016/5/27
NCBI提供的数据库
检索大分子生物学数据
获取GenBank, EMBL等数据库的核酸序列;
获取 Swiss-port,PIR,PRF,PDB 等蛋白质序列, 从核酸序列翻译到蛋白质的序列;
文献相关注释
基金编号 基因符号 期编号
资助调研者
资助调研单位 国际标准期刊号
20
美国立医学图书馆识别号
复旦大学图书馆文献检索教研室
期刊全称
2016/5/27
最后修订日期 规范词表词 规范词确立日期 系统组织的文摘
版权拥有者
题录提供机构的识别号 病史相关与原始记录
其他关键词
提供其他关键词的机构 数据提供者机构 文章总页数 出版商提供数据时间 期刊出版国
美国医学文献数据库
2013.4
1
复旦大学图书馆文献检索教研室
2016/5/27
一、数据库概况
(一)编制单位:美国国立医学图书馆(NLM)
(二)收录学科内容:
主要收录生物医学、卫生保健以及生命科学相关文 献。
包括行为科学、健康专业所需要的化学、生物工艺 学、基础研究;临床、护理、公共卫生、卫生政策 发展或相关教育活动的内容。 2000年起增加了生物、环境科学、海洋生物、植物 和动物学、生物物理学和生物化学等生命科学方面 的研究内容。
复旦大学图书馆文献检索教研室 2016/5/27
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一、数据库概况
(三)文献来源:
70多个国家和地区;近5000种生物医学期刊
PubMed使用教程指南

引言概述
PubMed是一个公认的医学文献数据库,由美国国家医学图书馆(NLM)开发和维护。
这个教程指南是第二部分,旨在深入介绍如何使用PubMed数据库来检索医学文献,并提供一些高级功能和技巧。
正文内容
一、使用MeSH(医学主题词)进行高级检索
1.了解MeSH的概念和分类体系
2.使用MeSH浏览器来查找和浏览主题词
3.利用MeSH词汇筛选器进行高级检索
4.使用MeSH树进行链式搜索
5.了解MeSH组合词的使用方法
二、使用文献筛选器和高级检索器
1.使用高级检索器来限定检索结果
2.利用文献筛选器进行精确的文献检索
3.使用搜索历史和搜索详情来追踪检索过程
4.利用查询器来创建复杂的检索语句
5.使用MeSH流行趋势来了解当前研究热点
三、利用搜索工具和文献管理器
1.使用索引工具来查找文章的相关信息
2.使用MyNCBI创建和管理文献收藏夹
3.使用单击目录搜索相关文献
4.使用外部工具和来获取全文和其他资源
5.使用CitationMatcher进行文献引用的匹配
四、了解首选项和界面定制
1.个性化设置首选项和搜索界面
2.添加和删除搜索工具和菜单
3.自定义搜索结果的显示格式
4.创建个人帐户并管理订阅邮件和提醒
5.利用网站帮助和文献教育资源进行学习和培训
五、了解常见问题和解决方案
1.如何处理搜索结果过多或过少的情况
2.如何处理重复文献和非相关文献
3.如何使用布尔运算符进行复杂的检索
4.如何处理缺失的全文和报告
5.如何解决其他常见问题和疑问
总结。
pubmed检索教程(课堂PPT)

stroke[ti] thrombolysis[ti]
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2020/8/8
三、PubMed 基本检索规则
著者检索:姓全称在前,名首字母在后,[au]。 如: smith ab[au] “paulsen e”[au]
思考题:中国学者的名字该如何转换呢? 如: 闻玉梅 卢正宏
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2020/8/8
三、PubMed 基本检索规则
国际标准期刊号
美国立医学图书馆识别号
20
期刊全称
2020/8/8
最后修订日期
规范词表词
规范词确立日期
系统组织的文摘
版权拥有者
题录提供机构的识别号
病史相关与原始记录
据库检索。
PubMed等文献数据。
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2020/8/8
(二) PubMed的特点
广域网免费提供题录和文摘 提供与原文的网址链接(部分免费获取) 提供检索词智能转换匹配 界面简洁,操作简便(须IE7.0以上版本)
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2020/8/8
(三) PubMed收录数据
MEDLINE Indexed
促进全世界范围内生物技术信息收集的合作。
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NCBI网站
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2020/8/8
NCBI提供的数据库
检索大分子生物学数据
获取GenBank, EMBL等数据库的核酸序列;
获 取 Swiss-port,PIR,PRF,PDB 等 蛋 白 质 序 列 , 从核酸序列翻译到蛋白质的序列;
获取基因和染色体图谱;蛋白质三维结构数据 及大分子模式(MMDB)等其他生物信息数
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一、 PubMed简介
开发机构:
pubmed高级检索方法

pubmed高级检索方法一、pubmed高级检索基础1.1 首先呢,pubmed是个超棒的医学文献宝库。
它的高级检索功能就像一把神奇的钥匙,能让你更精准地找到你想要的东西。
咱别小看这个功能,它就像一个隐藏的宝藏地图,要是会用,那可真是如鱼得水。
1.2 你得知道,pubmed高级检索界面有很多选项。
就好比一个大超市,每个货架都有不同的东西。
这里的选项就是那些货架,你得清楚每个货架放的是啥,才能快速找到你需要的“商品”,也就是文献啦。
二、检索字段的运用2.1 比如说作者字段。
这就像找人一样,你知道作者是谁,那就直接在作者字段里输入作者的名字。
这就好比你在人群里找一个熟人,直接喊他名字就好啦。
不过有时候作者名字可能有多种写法,你得像个侦探一样,把可能的写法都试试,可不能一根筋。
2.2 还有标题字段。
如果一个文献的标题里有你想要的关键词,那在标题字段检索就像瓮中捉鳖一样容易。
标题可是文献的招牌,往往包含了核心内容。
你要是想找关于某种疾病特定治疗方法的文献,在标题里搜这个治疗方法的名字,很可能就一击即中。
2.3 期刊字段也不能忽视。
你要是对某个期刊特别感兴趣,或者知道你要找的文献大概率发表在某个期刊上,那就在期刊字段里输入期刊名。
这就像你知道一个人住在某个小区,直接去那个小区找他就对了,省得满世界乱找。
三、布尔逻辑运算符的使用3.1 AND这个运算符啊,就像是交朋友里的“志同道合”。
你输入两个关键词,中间用AND连接,那搜索出来的文献就是同时包含这两个关键词的。
比如说你搜“糖尿病 AND 胰岛素”,那找出来的文献就是既和糖尿病有关,又提到胰岛素的,这样就把范围缩小得很精准了。
3.2 OR这个运算符呢,有点像广撒网。
当你输入两个关键词,中间用OR连接,搜索出来的文献只要包含其中一个关键词就会被显示。
比如“感冒 OR 流感”,那只要是关于感冒或者流感的文献都会出来。
这在你不确定具体用词或者想扩大搜索范围的时候很有用,就像你想找水果,苹果或者香蕉都可以满足你吃水果的愿望,这里的苹果和香蕉就相当于不同的关键词啦。
pubmed文献检索方法

pubmed文献检索方法【原创版4篇】目录(篇1)I.检索PubMed的意义II.PubMed的检索方法III.PubMed检索结果的展示和筛选IV.检索PubMed的注意事项正文(篇1)I.检索PubMed的意义PubMed是全球最大的生物医学数据库之一,提供了大量的生物医学文献资源。
对于研究人员、医学专业人士和学生来说,了解和掌握PubMed的检索方法,可以帮助他们快速找到所需的文献。
II.PubMed的检索方法1.打开PubMed网站,输入网址:https:///2.在页面左侧导航栏中选择“Search”按钮,进入检索页面。
3.在检索页面中,可以选择不同的检索方式,如关键词、作者、出版日期等。
4.输入检索词后,点击“Search”按钮,即可得到相关的检索结果。
III.PubMed检索结果的展示和筛选1.检索结果会按照相关度排序,用户可以选择不同的排序方式。
2.每个检索结果都包含标题、摘要、作者、出版日期等信息。
3.对于需要进一步阅读的文献,可以点击“Open”按钮,查看全文。
4.可以通过筛选条件,如主题、关键词、学科领域等,缩小检索范围。
IV.检索PubMed的注意事项1.避免使用过于具体的检索词,以免得到过多的无关结果。
2.对于复杂的检索需求,可以使用逻辑运算符和短语检索等方式进行组合检索。
目录(篇2)I.引言A.为什么需要pubmed文献检索方法B.pubmed简介II.pubmed文献检索方法A.如何使用pubmed1.输入关键词2.选择检索结果3.查看文献详情B.pubmed的优点1.方便快捷2.检索结果全面3.文献质量较高C.pubmed的不足1.检索结果可能不全面2.文献质量可能较低3.检索结果可能存在误导III.结论A.pubmed文献检索方法的重要性和实用性B.如何利用pubmed进行有效的文献检索正文(篇2)pubmed文献检索方法是一种非常实用的工具,可以帮助科研人员快速、准确地检索到所需的文献。
pubmed主题词检索的主要步骤

pubmed主题词检索的主要步骤
步骤一:访问PubMed数据库
打开浏览器,访问https://,进入PubMed数据库的官方网站。
步骤二:选择检索类型
根据需要,选择合适的检索类型,如文章标题、摘要、作者等。
步骤三:输入主题词
在搜索框中输入相关的主题词或关键词,例如疾病名称、药物名称等。
步骤四:设置检索条件
根据需求,设置检索条件,如时间范围、文章类型等。
步骤五:点击搜索按钮
点击搜索按钮开始检索相关的文献。
步骤六:查看检索结果
浏览PubMed数据库返回的检索结果,并根据需要进行筛选和排序。
步骤七:阅读文献摘要
点击感兴趣的文献标题,阅读文献的摘要部分,了解文献的内容和结论。
步骤八:获取全文
如有需要,点击文献页面提供的全文链接,获取完整的文献。
PubMed使用教程指南

2024/9/21
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一、基本检索
6.期刊检索
2024/9/21
发送至检索恇
点击选中
20
一、基本检索
6.期刊检索
2024/9/21
点击执行检索
21
一、基本检索
6.期刊检索
2024/9/21
检索成果
22
二、辅助检索区
1.Limit (限定检索) 2.Preview/index(预览/索引) 3.History(检索史) 4.Clipborard(剪贴板) 5.Detail(检索式详览)
28
2024/9/21
环节1 点击预览和索引
环节2 输入待选词
环节4 拟定与检索栏中 检索提问旳逻辑关系
环节3 索引选词
29
3.History(检索史)
▪ 检索式回忆 ▪ 编辑检索式 ▪ 如#3 AND child
2024/9/21
30
检索历史回忆
2024/9/21
检索式
检索时间 检出篇数
检索式编号可替代检索式进行输入检索
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2024/9/21
点击有关规范词
64
2024/9/21
选择检索 选择副主题词
65
2024/9/21
执行检索
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2024/9/21
检索成果 题录:著者、篇名、刊名
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2.阿司匹林治疗心肌梗死
2024/9/21
首先,将概念切提成2个面: Aspirin/治疗应用 心肌梗死/药物治疗
然后,分别进行规范词选择检索
68
2024/9/21
69
2024/9/21
70
2024/9/21
- 1、下载文档前请自行甄别文档内容的完整性,平台不提供额外的编辑、内容补充、找答案等附加服务。
- 2、"仅部分预览"的文档,不可在线预览部分如存在完整性等问题,可反馈申请退款(可完整预览的文档不适用该条件!)。
- 3、如文档侵犯您的权益,请联系客服反馈,我们会尽快为您处理(人工客服工作时间:9:00-18:30)。
如: liver cancer
结果显示页右侧Details 显示系统自动匹配转换 的检索词
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复旦大学图书馆文献检索教研室
2018/10/19
四、PubMed 检索限制
PubMed可以针对检索结果作进一步的限制
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复旦大学图书馆文献检索教研室
2018/10/19
Article types Text availability Publication dates Species
文献类型限定 全文、免费全文、摘要限定 出版日期限定 研究对象人/动物限定
Languages
Sex
语种限定
性别限定
Subjects
Ages
各主题领域限定
年龄限定
Journal categories 各种专题子数据库限定
Search fields
28
复旦大学图书馆文献检索教研室
MeSH选项:基本检索框前Search下拉菜单的
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复旦大学图书馆文献检索教研室
2018/10/19
(2)医学主题词表(MeSH)
用规范词查找“肝肿瘤”的文献
文章A
著者用词:
文章B
著者用词: Liver tumor
Liver cancer
规范主题词 MeSH: Liver neoplasms
规范主题词 MeSH:
界面简洁,操作简便(须IE7.0以上版本)
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复旦大学图书馆文献检索教研室
2018/10/19
(三) PubMed收录数据
MEDLINE Indexed
1966 to prensent 的MEDLINE已标引数据,有MeSH字段和 摘要,每条记录标有: [PubMed-indexed for MEDLINE]
数据加入PubMed日期 文献勘误 参考文献勘误 全部著者姓名 全部调研者姓名 作为文章主题的著者全称
文献相关注释
基金编号 基因符号 期编号
资助调研者
资助调研单位 国际标准期刊号
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美国立医学图书馆识别号
复旦大学图书馆文献检索教研室
期刊全称
2018/10/19
最后修订日期 规范词表词 规范词确立日期 系统组织的文摘
2018/10/19
一、 PubMed简介
开发机构: NCBI(美国国立生物技术信息中心)
任务:
利用计算机信息处理技术,建立分子生物学、生物化 学、遗传学知识的自动存储和分析系统,并开展相关 先进方法的研究。 促进生物技术研究者和医药治疗人员对数据库和软件 的使用。
Publisher-Supplied
出版商提供的电子文献题录,每条记录标有: [PubMed-as supplied by publisher],分为两类: MEDLINE 收录,逐步转为In Process, Indexed状态。 Not MEDLINE:PubMed 收录,MEDLINE不收录,一 直标注[PubMed-as supplied by publisher]或[PubMed]
正在撤消中的文章 初版文献 修订和再版的文章 子专题文档 太空署提供的数据 二次文献数据库以及文章讨论的 分子序列访问号 原文来源 引用了病例的文献内部处理代码 标准期刊缩写 文献标题 翻译标题 更新文献 文献正在更新 期刊卷号
22
复旦大学图书馆文献检索教研室
2018/10/19
三、PubMed 基本检索规则
版权拥有者
题录提供机构的识别号 病史相关与原始记录
其他关键词
提供其他关键词的机构 数据提供者机构 文章总页数 出版商提供数据时间 期刊出版国
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数据库文献编号
复旦大学图书馆文献检索教研室 2018/10/19
作为主题词的个人姓名
出版状态 文献类型 出版模式(纸张或电子) 参考文献数 已撤回的文献 酶或化学物质代码
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复旦大学图书馆文献检索教研室
2018/10/19
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复旦大学图书馆文献检索教研室
2018/10/19
三、PubMed 基本检索规则
自动转换匹配检索词:
对常用医学名词自动在规范词索引(主题词、副 主题词、物质名称)中转换、并默认在所有记录 字段中匹配。
"liver neoplasms"[MeSH Terms] OR ("liver"[All Fields] AND "neoplasms"[All Fields]) OR "liver neoplasms"[All Fields] OR ("liver"[All Fields] AND "cancer"[All Fields]) OR "liver cancer"[All Fields] 25 复旦大学图书馆文献检索教研室 2018/10/19
stroke thrombolysis[ti]
stroke[ti] AND thrombolysis[ti] stroke[ti] thrombolysis[ti]
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复旦大学图书馆文献检索教研室 2018/10/19
三、PubMed 基本检索规则
著者检索:姓全称在前,名首字母在后,[au]。 如: smith ab[au] “paulsen e”[au] 思考题:中国学者的名字该如何转换呢? 如: 闻玉梅 卢正宏
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复旦大学图书馆文献检索教研室
2018/10/19
三、PubMed 基本检索规则
刊名检索:全称或MEDLINE认可的标准缩写, [so] 如:Journal of investigative dermatology[so] J invest dermatol[so]
输入刊名检索发表在该刊上 的文献(限定出处字段SO)
美国医学文献数据库
2013.4
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复旦大学图书馆文献检索教研室
2018/10/19
一、数据库概况
(一)编制单位:美国国立医学图书馆(NLM)
(二)收录学科内容:
主要收录生物医学、卫生保健以及生命科学相关文 献。
包括行为科学、健康专业所需要的化学、生物工艺 学、基础研究;临床、护理、公共卫生、卫生政策 发展或相关教育活动的内容。 2000年起增加了生物、环境科学、海洋生物、植物 和动物学、生物物理学和生物化学等生命科学方面 的研究内容。
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复旦大学图书馆文献检索教研室 2018/10/19
六、PubMed其他资源
1. Mesh Database(规范化医学主题词表)
功能:
确定规范化主题词 查看主题词词义注释、树状结构表 选择副主题词、扩展下位主题词、指定主要主题词
进入途径:
MeSH Database链接:PubMed主页,Advanced Search界面
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复旦大学图书馆文献检索教研室
(以上由2009年7月数据库提供)
2018/10/19
二、 MEDLINE的检索平台
广域网免费平台:NCBI-PubMed(含非 MEDLINE数据)
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复旦大学图书馆文献检索教研室
2018/10/19
二、 MEDLINE的检索平台
校园网内可用平台(IP控制) Ovid SP
字段限定
2018/10/19
五、PubMed 高级检索
一个网页中集多种功能于一体
其他检索资源
基本检索
检索式编制
检索词索引
检索历史
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复旦大学图书馆文献检索教研室
2018/10/19
五、PubMed 高级检索
Search Builder(检索式编制): 检索框中只能输入检索词,不能输入检索式。 多个字段检索要分多次输入。 Search History(检索历史): 检索历史中显示历次检索式、时间和检出篇数。 可组配检索式,如:#1 OR #2,#1 AND child 点击编号可对检索式进行删除、保存等操作。
therapy/treat/treatment, surgery, radiotherapy…
两个概念之间:舌根癌 AND 治疗 36 复旦大学图书馆文献检索教研室
2018/10/19
获取基因和染色体图谱;蛋白质三维结构数据 及大分子模式( MMDB )等其他生物信息数 据库检索。
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PubMed等文献数据。
复旦大学图书馆文献检索教研室 2018/10/19
(二) PubMed的特点
广域网免费提供题录和文摘 提供与原文的网址链接(部分免费获取)
提供检索词智能转换匹配
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复旦大学图书馆文献检索教研室
2018/10/19
PubMed记录字段说明
文摘 第一著者单位地址
出版商提供文献识别号
著者群 版权说明 参考评论文献
合著者
文献参考评论 定稿版 校样版 输入日期
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复旦大学图书馆文献检索教研室
输入完成日期 2018/10/19 电子出版日期
电子出版日期
文献出版日期
Liver neoplasms
词表中:liver cancer See liver neoplasms
进入 MeSH
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复旦大学图书馆文献检索教研室
2018/10/19
MeSH 注释界面
MeSH详细注释界面
MeSH词检索
例1:检索2009-2013年关于舌根癌治疗的文献。
课题分析:
舌根癌的不同表达形式(OR): tongue base cancer、 cancer/carcinoma/tumor of tongue base 、 cancer of the base of tongue… 治疗的不同表达形式(OR) :