全内反射荧光显微镜 - 北京大学单分子与纳米生物学实验室

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隐失驻波、负折射材料(NIM)在全内反射荧光显微术下的综合应用

隐失驻波、负折射材料(NIM)在全内反射荧光显微术下的综合应用

隐失驻波、负折射材料(NIM)在全内反射荧光显微术下的综合应用11191050张正德(北京航空航天大学,北京102206)摘要:针对隐失波最新发展及应用,查阅了前人所写论文 (蒋练军、金辉霞, 2006) (王琛、王桂英、徐至展, 2004) (王晓秋、吴世法、简国树、王克逸、王景芝、潘石, 2003) (王琛、王桂英、徐至展, 全内反射荧光显微术, 2002) (范路生、薛轶群、王晓华、王钦丽、林金星, 2011),综合考虑到负折射率材料对隐失波振幅的增益和两束光波全内反射形成的隐失驻波,可做如下设想:采用隐失驻波照亮荧光标记样本并采用负折射率材料制成的扁平镜头用以显微镜聚焦,可以达到分子级别的小范围照亮和高分辨率测量。

关键词:隐失波、负折射率材料、全内反射、超显微技术Abstract:According to the evanescent wave the latest development and application, refer to the previous paper .Comprehensive considering the negative refractive index material on evanescent wave amplitude gain and two beam of light wave total internal reflection formation of evanescent standing wave, can play the following ideas: the evanescent standing wave light fluorescent marker sample and the negative refractive index material made of flat lens to focus microscope, can achieve the molecular level of small range light and high resolution measurement.Key words:Evanescent wave,Negative refractive Index Materials(NIM),Total internal reflection,Ultra micro technology0引言(引用自 (王琛、王桂英、徐至展, 全内反射荧光显微术, 2002)) 自世界上第一台光学显微镜问世以来,显微科学取得了迅猛的发展。

全内反射荧光显微镜概述

全内反射荧光显微镜概述

3. 物镜型光学成像系统中物镜


由于细胞的典型折射率为1.33~1.38,因此要实现全内 反射,在物镜型全内反射荧光成像系统中物镜的数值 孔径(NA)必须大于1.38。 当物镜数值孔径为1.4时,只有很小的一部分数值孔径 范围(1.4-1.38=0.02)被利用,入射角可调节范围 (最大孔径角与全内反射角的差值)很小,光束校准 比较难,同时光束的强度也很难提高。若使用数值孔 径为1.65的物镜,则有一个大的多的孔径范围(1.651.38=0.27)可以被利用,则入射角可调节范围变大, 降低了操作难度。高数值孔径的物镜的使用是物镜型 全内反射荧光成像系统的关键。
全内反射


全内反射是一种普遍存在的光学现象。 考虑一束平面光波从折射率为n1的介质进入到折射 率为n2的介质中。入射光在表面上一部分发生反射, 另一部分则发生透射。入射角θ1和透射角θ2之间满 足关系式n1sinθ1=n2sinθ2 当n1大于n2时,全反射就可能发生:即所有的入射光 线全部反射出来,称为全内反射。
2.2 物镜型

而在物镜型成像系统中,显微镜的物镜既是发生全内反射的 光学器件,又是样品荧光信号的收集器。其优点是样品的大 小没有棱镜的限制,样品的放置非常方便,并且由于样品远 离物镜而可以与多种其他技术相结合,例如微操作,微分干 涉成像系统,光镊技术,扫描探针显微术等等,因而相对于 棱镜型展现出更加广阔的生物应用前景。
2.1棱镜型

棱镜型利用激光经过棱镜并产生全内反射,其隐失波照射已 被荧光标记的生物样品,其激发光从另一侧进入物镜并被 CCD相机捕捉。棱镜作为发生全内反射的光学器件。物镜只 是作为荧光信号收集器。在探测上,它也不容易受到入射光 的干扰。缺点是放置样品的空间位于棱镜和盖玻片之间,所 以样品大小和样品的放置受到限制。

华大测序原理辊环复制

华大测序原理辊环复制

华大测序原理涉及多种技术,包括单分子实时DNA测序技术、合成多聚尾技术、荧光标记及探针制备、数据质量控制与分析方法等,它经过持续的技术迭代,如今已经成为中国、乃至全球生物技术领域的一个重要里程碑。

那么具体到测序原理来说,即以下的全内反射荧光(total internal reflect fluorescence, TIRF)应用方法:全内反射荧光显微镜(TIRFM)是华大测序所应用的一种非常有效的单分子检测技术。

当光线穿过一层薄薄的液体时,只有那些位于光线照射平面内表面之上的分子能够被激发,并且这些分子发出的荧光可以被相机记录下来。

这一技术使得我们能够捕捉到单个分子的运动,为生物学研究提供了前所未有的高分辨率。

其次,华大测序的另一个核心技术是单分子实时DNA测序技术。

这一技术实现了对单个DNA 分子的识别和读取,从根本上解决了传统Sanger测序中需要预先构建模板这一难题。

这一技术利用了合成多聚尾技术,实现了对单个DNA分子的随机标签,从而使得在后续的测序过程中能够实现单分子定位,能够实现复杂体系下的单分子检测。

这种技术的实现不仅突破了传统的Sanger测序技术,更将测序技术的效率提高到了前所未有的新高度。

至于样本处理方面,华大测序采用的是逆转录试剂盒的方法来获取模板DNA。

这个过程主要是先将血液中的RNA逆转录为DNA,然后再将这个DNA进行PCR扩增,最后进行测序。

至于数据产出,华大测序的产出结果可以通过各种软件进行拼接,最终形成完整的基因序列。

同时华大测序还通过引物延伸方向的不同来识别不同的样本来源,这种机制的运用大大提高了测序的效率和准确性。

以上就是华大测序的基本原理,其在生命科学研究中发挥着不可或缺的作用。

不过需要注意,生命科学是一个极其复杂而又变化莫测的领域,华大测序作为一种工具或方法,它的作用是有限的,最终的结果还需要结合其他科学手段进行综合分析。

全内反射荧光显微术名词解释

全内反射荧光显微术名词解释

全内反射荧光显微术名词解释全内反射荧光显微术,听起来就像是从科幻电影里蹦出来的名词,是吧?其实它可是一种非常酷炫的显微镜技术,能让我们看到那些微小得像针尖一样的细胞和分子。

想象一下,把光线像小箭一样射向样品,当光线以一定的角度入射,嘿,光线就不再穿透,而是在界面上反射回来,这就是全内反射的魔法!这时候,样品里的荧光分子会被激发,发出闪闪的光芒,简直就像夜空中的繁星,令人心醉。

用这个技术,科学家们可以观察生物样品,像细胞膜、蛋白质等。

大家知道细胞是生命的基本单位,对吧?而这些微小的结构可不是轻易就能看清的,普通显微镜就像是用放大镜看远处的星星,模糊得很。

全内反射荧光显微术却像是把宇航员送到了太空,直接给你展示了细胞内部的每一个角落,真是让人眼前一亮。

这项技术的魅力在于,能在活细胞中进行观察。

别小看这一点,很多传统的显微镜技术可得把细胞弄得死去活来才能看清。

可是全内反射荧光显微术却让我们能够在“现场”观察,活生生的细胞在做什么,简直就像在看一场精彩的真人秀!你可以看到细胞的动态变化、分裂过程,甚至是它们如何和周围的环境互动,这些都是生命中最微妙的瞬间。

说到荧光,这里有个小秘密。

荧光分子就像是小小的发光棒,只有当它们被特定波长的光激发时,才会闪耀出美丽的光芒。

像小孩子玩耍一样,开心得不得了。

这种现象让我们能够区分不同的细胞,甚至标记特定的蛋白质,形成色彩斑斓的图像。

这些图像比任何油画都要生动,简直就是生命的艺术品。

想想看,科学家们在显微镜下能看到的那些细胞,像极了微缩版的城市,热闹非凡。

全内反射荧光显微术也让我们在医学研究中大放异彩。

比如在癌症研究中,科学家们通过观察癌细胞的特征,发现它们是如何突破正常细胞的防线,蔓延到其他地方的。

这种技术帮助我们了解疾病的根本,寻找更有效的治疗方案。

感觉像是在揭开一个个神秘的面纱,让我们看清楚那些潜藏在暗处的真相。

操作全内反射荧光显微术可不是随便拍拍的事。

它需要一套精密的设备和技术,像调整光路、选择激发波长,这些都得小心翼翼。

全内反射荧光显微术及其在生物单分子科学中的应用(精)

全内反射荧光显微术及其在生物单分子科学中的应用(精)

全内反射荧光显微术及其在生物单分子科学中的应用北京大学力学与工程科学系生物医学工程专业02级博士钟建学号: 10203829摘要:全内反射荧光显微技术利用全内反射产生的隐失波激发样品,由于隐失波强度成指数衰减,使激发区域限定在样品表面的一薄层范围内,因此具有其它光学成像技术无法比拟的高的信噪比。

它是当今世界上研究单分子科学最具前途的新型生物光学显微技术之一,可以用来实现对单个荧光分子的直接探测。

近年来,已被生物物理学家们广泛应用于单分子的荧光成像中。

本文主要介绍了全内反射荧光显微技术的基本知识及其在生物单分子科学上的应用。

关键词:全内反射荧光显微技术,生物单分子,隐失波生物单分子研究是指在单分子水平上对生物分子行为(包括构象变化、相互识别、相互作用等的实时﹑动态检测以及在此基础上的操纵和调控等,籍此深入阐明构效、构性关系。

生物单分子研究已经成为21世纪生命科学领域的一个重点研究方向。

在生命科学领域有着广泛的研究前景。

生物单分子研究要求发展超高分辨率的成像技术,从而在分子尺度上探测生命活动的细节。

新一代光学显微技术以其高的空间分辨率和时间分辨率、无损伤、以及对单分子活体探测的可行性,成为生物学家和物理学家的研究热点。

目前国际上公认的最有前途的单分子光学成像技术有全场相衬显微术、共焦荧光显微术,近场光学扫描显微术和全内反射荧光显微术[1]。

这些技术在分子生物学、分子化学、激光医学及纳米材料等领域受到广泛关注,并产生了深远的影响。

其中,全内反射荧光显微术是近年来新兴的一种光学成像技术,它利用全内反射产生的隐失场来照明样品,从而致使在百纳米级厚的光学薄层内的荧光团受到激发,荧光成像的信噪比很高。

这种方法的成像装置简单,极易和其它成像技术、探测技术相结合。

目前已成功的实现200nm甚至更低的空间分辨率。

因此被生物物理学家用来观察单分子成像,也被细胞生物学家和神经科学家来观测发生在细胞膜上的生理反应[2]。

全内反射荧光显微镜TIRFM介绍

全内反射荧光显微镜TIRFM介绍

TIRFM 原理
全内反射是一项依赖于消逝波的技术。 在两种不同折射率介质的临界面上,临界角 的光线几乎被完全反射: c= sin-1 (n2/n1) n1 > n2 消逝波只能够传播到盖玻片后几百纳米内 典型的有效照明下渗透度只有50nm到100nm
低折射率 q 高折射率
只有临近盖玻片表面(近场)的荧光分子才能 被激发。远场分子不受激发。
如何得到消逝波
标本折射率 消逝波 水 n2 =1.33 细胞内液 n2 =1.38
d
盖波片 (n1=1.52 for PLAPO60XOTIRFM) (n1=1.78 for APO100XOHR ) 镜油 (n0=1.52 for PLAPO60XOTIRFM) (n0=1.78 for APO100XOHR )
安装简单 可用于膜片钳实验 物镜数值孔径受限制
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全内反射照明的切换
宽场荧光照明
盖波片
物镜
激光
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高灵敏度冷CCD --- EMCCD Rolera-MGi
背感光、高量子效率,>90% 芯片增益EMCCD,不放大读出噪音 高速度,全幅30fps,最高300fps以上 低温制冷CCD
EM CCD在以下应用具有无可比拟的优势: 1。单分子成像:Single molecule imaging 2。全内反射:Total internal reflection 3。转盘式共聚焦:Spinning Disk 5。Ca等的离子测定 6。快速时间序列的荧光3D成像
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化学生物学研究中的分析检测方法

化学生物学研究中的分析检测方法

label-free microRNA detection using
oligonucleotide-silver nanoclusters as probe
Target
Anal. Chem. 84, 4587–4593 (2012) Biosens. Bioelectron. 41, 348-353 (2013)
22
4.核磁与活体成像
核磁共振在蛋白质研究中的应用
蛋白质结构和功能解析用分子力学计算得到蛋白质三维结构23
蛋白质动力学的研究 NMR技术可提供从ps至ms时间内蛋白质分子的运动信息
蛋白质和药物之间的相互作用 判断小分子是否与蛋白质有相互作用及作用强度
膜蛋白解析
24
磁共振成像在化学生物学中的应用
超分辨成像技术
细胞内单分子的检测方法
原子力显微镜单分子成像与单分子力谱法
重要发展方向
2. 单细胞检测
高通量单细胞分析 单细胞电化学及其它成像技术 活体成像技术
单细胞光学成像 分离技术 发展趋势
7
3. 生物质谱与质谱成像
质谱在组学研究中的应用 质谱成像技术 敞开式离子化技术 发展趋势
4. 核磁与活体成像
Anal. Chem. 84, 1452–1458 (2012) Chem. Commun. 49(9), 862-864 (2013)
30
MIT的Strano教授在Acc. Chem. Res. (2014)用一整段并引用一张原图介 绍了Biosens. Bioelectron. 2010, 26: 169,评价称鞠课题组做出了“这 个领域的一项奠基性工作”。
30
Boronic acid-functionalized magnetic carbon nanotubes for highly specific enrichment of glycopeptides

全内反射荧光成像基本原理

全内反射荧光成像基本原理

hv H**
H hv
S2




S0
精品课件
S1




分子荧光的产生
激发态停留时间短、返回速度快的途径发生的几率大。 荧光:10-7-10-9s 磷光:10-4-100s
精品课件
电子跃迁的单重态(单线态)与三重态(三线态)
在光致激发和去激发光的过程中,分子中的价电子(n, π)处于不同的自旋状态,通常用多重态M来描述:
荧光是相同多重态间的允许跃迁,产生速度快:109—10-7s,又叫快速荧光或瞬时荧光。外部光源停止照射, 荧光马上会消失。
磷光发射:第一激发三重最低振动能级到基态(104—10s),外部光源停止照射后,可以持续一段时间。
精品课件
全内反射荧光显微镜结构
目前,大多数全内反射荧光显微镜主要有两种基本类 型:棱镜型和物镜型(或无棱镜型)。
精品课件
由于隐失波仅在界面上极薄的一层范围内传播,所以利用 隐失波照明样品,可以仅激发厚度大约 100nm 内的荧光团, 而更深层溶液中的荧光基团不会被激发,因此极大地提高了 显微成像的对比度和信噪比。
d12是渗透深度,它等于从分界面处到光强衰减 l/e 处的 距离。
精品课件
精品课件
隐失波强度成指数衰减曲线
M=2S+1=1 电子自旋的大小用自旋量子数S表示,S可为+1/2或- 1/2,这里的正负号取决于自旋的方向。基态中每个能级 通常被两个自旋相反的即自旋配对的电子占据,M=1,成 为单重态。
精品课件
当成对电子中的一个被激发到S1、S2等电子能级激 发态时,其自旋不变,即仍和处于基态的另一电子 成对 。这些能态都被称为单线态或 单重态(singlet state)。
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当一束平面光波从折射率为n1的介质进入到折射率为n2的介质中
消逝波----全内反射荧光镜的关键所在
消逝波 消逝场(evanescent field)
荧光消逝波 θ2=90° θc=sin-1(n2/n1)
全内反射的仪器组成
全内反射荧光显微成像系统
棱镜型
物镜型
成像系统的消逝场 是通过入射光经棱 镜发生全反射产生 的
基本概念
Title 全内反射荧光显微术:
Title 数值孔径:
全内反射荧光显微术:
全内反射荧光显微术是利用全内反射产 生的消逝波来照射样品,从而致使在样 品表面数百纳米级厚度的光学薄层内的 荧光团受到激发,使单分子成像。
数值孔径:
数值孔径又叫做镜口率,简写为N.A。它是 由物体与物镜间媒质的折射率n与物镜孔径 角的一半(a\2)的正弦值的乘积,其大小 由下式决定:N.A=n×sin a/2
全内反射荧光技术发展历程
1965年
Hirsch field 完成了第一个 全内反射荧光 实验
1995年
Yanagida小 组用TIRFM技 术首次在液体 溶液中得到了 荧光标记的单 个蛋白质分子 的成像.
1996年
Moerner小 组又用这项技 术实现了限制 在丙烯酰胺胶 体的纳米孔中 的单分子的三 维成像。
层析深度分别为~ 500nm~800nm , 而全内反 射显微术典型的垂直照明深度<100nm。这么 薄的光学层析层切片意味着信噪比 比共焦系统 好得多, 细胞的光损伤和光漂白也很小。
全内反射荧光显微镜优点:
1:信噪比高 2:分辨率高 3:对生物样本损伤小
与共焦技术相比, 单光子或双光子的共焦系统层 析深度分别为~ 500nm~800nm , 而全内反射显 微术典型的垂直照明深度<100nm。这么薄的光 学层析层切片意味着信噪比 比共焦系统好得多, 细胞的光损伤和光漂白也很小。
合适的pH值:PH:4.25
合适的TPPS的浓度:1.5x10-6 -1"L’
2.蛋白质的分泌:
A. 为刺激给予之前;B、C. 为刺激给予后 MIN6 细胞用吖啶橙荧光染料转染后给予50 mmol/ L 氯化钾
刺激,应用TIRFM 得到全反射影像
A1 为刺激给予之前;B、C1 为22mmol/ L 葡萄糖给予之后 MIN6 细胞应用吖啶橙荧光染料转染后给予高浓度葡萄糖刺激,
应用TIRFM 得到全反射影像。
3.全内反射荧光显微镜同原子 力显微镜结合的应用
Injected Fluorescent Beads
1) Silanization of whisker crystals 2) Modification of PC-linker
成像系统的消逝场 是通过入射光经物 镜本身全反射产生
棱镜型系统包括三个主要部分
(1) 倒置的相衬光学显微镜; (2) 可以二维精确移动的样品台; (3) 用来发生全反射的棱镜
棱பைடு நூலகம்型评价
棱镜型系统在实现上更加容易,它只
1
需要激光光源、棱镜和显微镜。
在探测上,它也不容易受到入射光信
2
号的干扰
全内反射荧光显微镜
Presented by 何维清 张帆 吴夕 姚兴荣
Contents
11..全全内内反反射射荧荧光光技技术术发发展展历历程程 22..全全内内反反射射的的基基本本原原理理 33..微微镜镜及及荧荧光光显显微微镜镜比比较较的的优优缺缺点点 44..全全内内反反射射荧荧光光显显微微术术应应用用
有效消除直到近红外范围的色差
最高级的UIS2物镜是UPLSAPO系列,它杰出的超级复消色差特点有效 地消除了从可见光谱直到1000nm范围内的色差。这意味着从紫外到红 外范围内的成像都可以只用一个物镜实现。这一系列物镜在使用覆盖很 宽谱带的荧光进行多色观察时,可以获得出色的清晰图像而不产生颜色 偏移
wa sa m plifiedt hreet imesin thef igure) [T PPSI-1.5x10 '-I-L’;[BSA]=6ig"-L-',P H425 1, 吕 k -1.,i- (丁PPS);2 ,B ulk solodon( TPPS十】3SA);
3, I n te rf ace (丁PPSI B SA
全内反射的应用
蛋白质吸附平衡 表面分子浓度梯度变化 表面分子的旋转 荧光寿命及反应速率的测量及选择性观
测细胞/底物接触区等 其中蛋白质界面吸附平衡是全内反射荧
光法的重点应用领域
1:关于测定蛋白质分的吸附平衡的应用
Thes ynchronousf luorescence spectra( Ax= 230r un)o f TP PS i nd if ferente nvironment( thei ntensityo fi nterface
CCD功用介绍
比较:
一般的光学显微镜: 分辨率为250nm
1
显微图像的信 噪比不高
2 光源对生物样 本照射的损伤
3
光学衍射所致 的分辨极限 (R≥ 0.61λ/nsin θ)
比较:
一般的光学 显微镜分辨率为250nm 因此有:1:信噪比高 2:分辨率高 3:对生
物样本损伤小 与共焦技术相比, 单光子或双光子的共焦系统
全内反射的基本原理
全内反射与Snell 定律 ----Snell 定律
入射光在两介质接触面一部分发生反射,一部 关分系发由生折Sn射ell。定入律射角θ1和透射角θ2之间满足
θ2 =90° θc=sin-1(n 2/n 1) ----全内反射
生由。上即式所可有知的,入当射n1光大线于全n2部时反,射全出反来射称就为可全能内发 反射
放置样品的空间收到棱镜的限制
3
物镜
物镜型
物镜型全内反射荧光显微镜成像系统
图4 物镜型全内反射荧光显微镜示意图
棱镜形和物镜型的简易光路图
拥有更宽波长范围内的高透过率
IX2系列的内置物镜采用UW多层鍍膜技术,能够有效消除超宽谱带上的反射, 在可见光到近红外光的波长范围内能够实现平坦的高透过率,在近红外和紫外 范围内的透过率显著提高。总之,在较宽波长范围内的性能使它非常适合当今 最需要的研究用途。
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