2008 级蛋白质工程复习题
蛋白质工程试题
蛋白质工程试题1.蛋白质分子的构型与构象构型：是分子中原子的特定空间排布。
当构型相互转变时，必须有共价键的断裂和重新形成。
基本构型有L-型和D型两种。
这种构型无法通过单键的旋转相互转换。
构象:是组成分子的原子或基团围绕单键旋转而成的不同空间排布，构象的转换不要求有共价键的断裂和重新形成,在化学上难以区分和分离。
2.内核假设原理所谓内核是指蛋白质在大自然的进化中形成的保守内部区域。
这样的区域一般由氢键连接而成的二级结构单元组成。
内核假设原理就是所有蛋白质的折叠形式主要决定于其内核中残基的相互作用和组织形式。
遵循这样的内核原理意味着蛋白质工程无法创造出超越天然蛋白质所具有二级结构的新蛋白质二级结构。
3. van't Hoff焓平衡常数与焓/熵的关系式为：－RT lnK = △H - T△S。
取对数可以变为： lnK = －△H/RT + △S/R。
进一步推导可以变为：d（lnK）/d（1/T）= －△H/R。
基于此，以lnK对1/T可以得到一条曲线。
在这条曲线上任何一点的斜率就是△H/R，其中的△H称为van't Hoff焓。
通过解析van't Hoff焓随温度变化的曲线特点，可以用于测定蛋白质体系构象平衡的转变，主要是两态转变模型的分析。
也就是通过这样的曲线分析，可以预测蛋白质天然构象退在折叠时的容易程度。
4. 盒式突变法也称为片断取代法（DNA fragment replacement）。
这一方法的要点是利用目标基因中具有的适当的限制性酶切位点，用具有任何长度、任何序列的DNA片断来置换或者取代目标基因上的一段DNA序列。
5、熔球态在折叠途径中第一个可以观测到的中间体是柔性无序的为折叠多肽链卷折成局部有组织的球状体，称为熔球体melton globule。
熔球体具有天然态的大多数二级结构，但不如天然结构致密，蛋白质内部的密堆积相互作用尚未形成，环肽区和表面结构多数处于未折叠状态，侧链可以活动。
蛋白质工程生物技术探索考核试卷
B.真核表达系统
C.无细胞表达系统
D.电子表达系统
20.以下哪个技术主要用于蛋白质工程中的结构预测？()
A.同源建模
B.蛋白质设计
C.分子对接
D.量子化学计算
（请在此处继续答题）
二、多选题（本题共20小题，每小题1.5分，共30分，在每小题给出的四个选项中，至少有一项是符合题目要求的）
1.蛋白质工程基本步骤包括序列分析、结构预测、设计突变、表达纯化、功能测试。例如，通过在酶的活性部位引入疏水性氨基酸，可以提高其热稳定性。
2.蛋白质工程在生物制药中用于优化蛋白质药物的稳定性和减少免疫原性。例如，通过替换可能引起免疫反应的氨基酸，开发更安全的药物。
3.蛋白质折叠是功能实现的前提，影响折叠的因素包括氨基酸序列、环境条件、pH值等。
1.以下哪些是蛋白质工程中常用的设计方法？()
A.理性设计
B.随机突变
C.计算机模拟D.Fra bibliotek上都是2.蛋白质工程可以应用于以下哪些领域？()
A.医药
B.农业
C.食品工业
D.能源
3.以下哪些因素可能影响蛋白质的活性？()
A.温度
B. pH值
C.氧气浓度
D.蛋白质浓度
4.下列哪些技术可以用于蛋白质表达？()
A.氨基酸序列
B.蛋白质浓度
C.环境温度
D.上述所有因素
8.以下哪个酶在蛋白质工程中常用于DNA的切割？()
A.逆转录酶
B.限制性内切酶
C.连接酶
D.聚合酶
9.下列哪种方法通常用于蛋白质工程中的定向进化？()
A.随机突变
B.理性设计
C.模拟退火
D.计算机辅助设计
生物化学蛋白质复习题
蛋白质习题一：解释下列名词1、肽平面及二面角：①肽平面：肽键具有一定程度的双键性质，参与肽键的六个原子C、H、O、N、Cα1、Cα2不能自由转动，位于同一平面，此平面就是肽平面，也叫氨酰平面。
②二面角：两相邻酰胺平面之间，能以共同的Cα为定点而旋转，绕Cα-N键旋转的角度称φ角，绕C-Cα键旋转的角度称ψ角。
φ和ψ称作二面角，亦称构象角。
2、氨基酸残基：在多肽链中的氨基酸，由于其部分基团参与了肽键的形成，剩余的结构部分则称氨基酸残基。
3、β-折叠：蛋白质中常见的二级结构,是由伸展的多肽链组成的。
4、β-转角：多肽链中常见的二级结构,是连接蛋白质分子中的二级结构（α-螺旋和β-折叠），使肽链走向改变的一种非重复多肽区，一般含有2～16个氨基酸残基。
5、超二级结构：指蛋白质分子中相邻的二级结构单位组合在一起所形成的有规则的、在空间上能辨认的二级结构组合体。
6、结构域：指蛋白质多肽链在二级结构的基础上进一步卷曲折叠成几个相对独立的近似球形的组装体。
7、氨基酸的等电点：指氨基酸的正离子浓度和负离子浓度相等时的pH 值，用符号pI表示。
8、蛋白质的变性与复性：①蛋白质的变性作用：蛋白质分子的天然构象遭到破坏导致其生物活性丧失的现象。
蛋白质在受到光照、热、有机溶剂以及一些变性剂的作用时，次级键遭到破坏导致天然构象的破坏，但其一级结构不发生改变。
②蛋白质的复性：指在一定条件下，变性的蛋白质分子恢复其原有的天然构象并恢复生物活性的现象。
9、亚基：体内许多蛋白质分子含有两条或两条以上多肽链，每一条多肽链都有完整的三级结构，称为亚基10、疏水相互作用:非极性分子之间的一种弱的非共价的相互作用。
这些非极性的分子在水相环境中具有避开水而相互聚集的倾向。
11、胶原蛋白：是动物结缔组织中最丰富的一种结构蛋白，它是由原胶原蛋白分子组成，原胶原蛋白是一种具有右手超螺旋结构的蛋白。
每个原胶原分子都是由3条特殊的左手螺旋（螺距0.95nm，每一圈含有3.3个残基）的多肽链右手旋转形成的。
蛋白质工程复习资料整理版
蛋白质工程复习资料整理版一．名词解释：1.自由界面扩散法：它是根据蛋白质在不同溶剂中的溶解度不同，选择两种溶解性差别大的溶剂，将溶有待结晶蛋白质的溶液小心地放在另一种溶液的上层，首先在界面区域达到瞬间的过饱和，随着两层溶液互相扩散，各自形成一个浓度梯度，当扩散趋向平衡时，蛋白质的溶液达到一定的过饱和度，便形成了晶核。
2.丝素蛋白：是从蚕丝中提取的天然高分子纤维蛋白，含量约占蚕丝的70％～80％，含有18种氨基酸，其中甘氨酸(gly)、丙氨酸(ala)和丝氨酸(ser)约占总组成的80％以上3.大豆分离蛋白(SPI)：是以大豆为原料经过加工制成的，大豆分离蛋白等电点4. 5～5 ,4.PAGE：聚丙烯酰胺凝胶电泳，是一种以聚丙烯酰胺凝胶为支持介质的区带电泳，它是在恒定的、非解离的缓冲系统中分离蛋白质，属于非解离电泳。
5.角蛋白:是非水溶性蛋白质，存在于皮肤、毛发、羽毛、指甲、爪和蹄中。
角蛋白中含有大量胱氨酸，二硫键的形成是非水溶性的主要原因。
6.蛋白质纤维:是指基本组成物质为蛋白质一类的纤维,按来源分有天然的和人造的和再生的两种。
7.结构域：二级结构和结构模式以特定的方式组织连接，在蛋白质分子中形成两个或多个在空间上可以明显区分的三级折叠实体，称为结构域。
8.胶原蛋白：是构成细胞外基质的主要成分之一, 广泛存在于哺乳动物体内。
其良好的生物相容性, 稳定的理化性质使其成为生物工程和生物制药中的重要载体。
9.蛋白质工程：按人们意志改变蛋白质的结构和功能或创造新的蛋白质的过程。
包括在体外改造已有的蛋白质，化学合成新的蛋白质，通过基因工程手段改造已有的或创建新的编码蛋白质的基因去合成蛋白质等。
为获得的新蛋白具备有意义的新性质或新功能，常对已知的其他蛋白质进行模式分析或采取分子进化等手段。
10.热塑性挤出：指含水量低的粉状原料在剪切场中同时受压受热，形成塑块，迫使其通过成型模具。
11.固定化酶：水溶性酶经物理或化学方法处理后，成为不溶于水的但仍具有酶活性的一种酶的衍生物。
蛋白质工程复习试题
蛋白质工程复习题一、名词解释结构域：基因突变：融合蛋白：蛋白的表达模式:蛋白质的分子设计：构型：构象：α氨基酸：原核表达：蛋白质的二级结构：蛋白质的三级结构：蛋白质分子的四级结构：蛋白质的分子设计：分子伴侣：启动子：增强子：乳糖操纵子：二、单选题1.下列不属于蛋白质结构测定的技术是（）A X射线晶体衍射技术B 核磁共振波谱技术C 生物信息学预测蛋白质结构D 缺失突变技术2. 下列不属于蛋白质结晶技术的是（）A 悬滴法B 坐滴法C 微量扩散小室法D 插入突变法3. 增加蛋白质分子的热稳定性的常用方法是（）A 提高脯氨酸的含量B 在蛋白质分子中引入二硫键C 增加蛋白质分子的α螺旋D 增加β折叠4. 蛋白质工程的最终目的是( )A 开发新产品B 创造新理论C 制造具有新性能的新蛋白质结构D 研究蛋白质的氨基酸组成5. 抗体属于（）A 基因B 蛋白质C DNAD RNA6、不属于蛋白质空间结构的基本组件的是（）A α螺旋B β层C 环肽链D 结构域7、不属于强烈倾向于形成α螺旋的氨基酸（）A AlaB GluC ProD Met8、蛋白质分子的完全从头设计属于（）A 小改B 中改C 大改D 没改9. 蛋白质工程的基本原理是（）A 中心法则B 热力学第二定律C 中心法则的逆推D 模型对比三、填空题1. 维持蛋白质一级结构的作用力是（）和（）。
2.目的蛋白的表达模式检测的方法有（）和（）3.蛋白质分子设计的目的是（）和（）4．常用的蛋白表达系统有（）、（）和（）。
5. 蛋白质工程的基本原理是（）6．常用的蛋白表达系统有（）、（）和（）。
四、简答题1.简述蛋白质工程研究的基本途径。
2.欲使目的蛋白在大肠杆菌中表达，则表达载体的一般特点是什么？3、简述X射线晶体衍射技术测定蛋白质晶体结构的具体步骤。
4、简述目的蛋白原核表达的基本步骤。
5、简述蛋白质在生物体内的形成的过程.6、蛋白质分子设计的步骤是什么？7. 一个蛋白质由300个氨基酸组成，请简述用搭桥PCR的方法在该蛋白的150个氨基酸处插入GAATCT这6 个碱基的基本步骤。
蛋白质工程考试复习资料
名解蛋白质工程：蛋白质工程是以蛋白质的结构与功能的关系研究为基础，利用基因工程技术对现存蛋白质加以改造，组建成新型蛋白质的现代生物技术。
蛋白质超二级结构：相邻的二级结构单元组合在一起，彼此相互作用，形成规则排列的组合体，以同一结构模式出现在不同的蛋白质中，这些组合体称为超二级结构，或结构模体。
结构域：指二级结构和结构模体以特定的方式组织连接，在蛋白质分子中形成两个或多个在空间上可以明显区分的三级折叠实体。
结构域是蛋白质折叠中的一个结构层次，介于超二级结构和三级结构之间，是蛋白质三级结构的基本单位，也是蛋白质功能的基本单位。
分子伴侣：是一类相互之间有关系的蛋白分子，能识别正在合成的多肽或部分折叠的多肽并与多肽的一定部位相结合，帮助这些多肽转运、折叠或组装，但其本身并不参与最终产物的形成。
定向进化：在实验室中模仿自然进化的关键步骤-突变、重组和筛选，在较短时间内完成漫长的自然进化过程，有效地改造蛋白质，使之适于人类的需要。
这种策略只针对特定蛋白质的特定性质，因而被称为定向进化。
第二遗传密码：氨基酸顺序与蛋白质三维结构之间存在着对应关系，人们称之为第二遗传密码或折叠密码。
蛋白质的化学修饰：凡通过活性基团的引入或去除，而使蛋白质一级结构发生改变的过程统称为蛋白质的化学修饰。
基因突变的概念：基因突变是指由于DNA碱基对的置换、增添或缺失而引起的基因结构的变化。
蛋白质组学：蛋白质组学定量检测蛋白质水平上的基因表达，从而揭示生物学行为(如疾病过程和药物效应)，以及基因表达调控的机制的学科。
双向电泳：是等电聚焦电泳和SDS-PAGE的组合，即先进行等电聚焦电泳（按照pI分离），然后再进行SDS-PAGE（按照分子大小），经染色得到的电泳图是个二维分布的蛋白质图。
蛋白质芯片：也叫蛋白质微阵列，是将大量蛋白质有规则地固定到某种介质载体上，利用蛋白质与蛋白质、酶与底物、蛋白质与其他小分子之间的相互作用检测分析蛋白质的一种芯片。
《蛋白质工程》本科生复习题
蛋白质的分子设计：亲和标记：透析：蛋白质工程：双向电泳亲和层析抗体库技术:蛋白质组学：抗体酶：第二遗传密码：蛋白质芯片：等电聚焦：单克隆抗体：蛋白质打靶技术噬菌体表面展示技术:蛋白质超二级结构结构域基因突变蛋白质的化学修饰激光捕获显微切割技术1.（）的优点是操作简便、条件温和，不会引起酶的变性失活，载体价廉易得，可反复使用。
A 吸附法B偶联法（共价结合法）C交联法D包埋法2.不属于强烈倾向于形成α螺旋的氨基酸（）A AlaB GluC ProD Met“分子病”是由于基因突变造成蛋白质分子中仅仅一个氨基酸残基的变化就引起的疾病。
下列不属于分子病的是（）A 地中海镰刀状红血球贫血症B 血友病C 苯丙酮尿症D 老年性痴呆症3.可以方便地在溶液中研究分子结构并且可以使试样不经受任何破坏的蛋白质结构分析方法是（）A 核磁共振B X-射线晶体衍射法C 现代光谱技术D 三维电镜重构法蛋白质和酶制品纯度鉴定通常采用的方法不包括下列哪一种（）A SDS-聚丙烯酰胺凝胶电泳法B等电聚焦电泳法C超速离心沉降分析法D亲和层析法4.蛋白质微阵列( Protein micro-array) ，将大量蛋白质有规则的固定在某种介质载体上，利用蛋白质与蛋白质、酶与底物、蛋白质与其他小分子之间相互作用检测分析蛋白质的技术称为（）A 蛋白质芯片技术B 蛋白质分子印迹技术C表面等离子体共振技术D酶联免疫吸附剂测定5.下列哪项不是初步鉴定蛋白质晶体的方法( )A.刮擦法B.脱水法C.偏振光法D.浓度差法6.蛋白质分子引起280nm光吸收的最主要成分是（）A.肽键B.半胱氨酸的-SH基C.苯丙氨酸的苯环D.色氨酸的吲哚环7. TNBS（2，4，6-三硝基苯磺酸）是（）的化学修饰常用试剂。
A 巯基B氨基C羧基D二硫键8. 蛋白质工程的基本流程正确的是( )①蛋白质分子结构设计②DNA合成③预期蛋白质功能④据氨基酸序列推出脱氧核苷酸序列A．①②③④B．④②①③C．③①④②D．③④①②9. 下列不属于蛋白质结构测定的技术是（）A X射线晶体衍射技术B 核磁共振波谱技术C 生物信息学预测蛋白质结构D 缺失突变技术10. 通过增加内氢键数目可以改善蛋白质设计的哪项目标（）A 热稳定性B对氧化的稳定性C对重金属的稳定性 D pH稳定性11. 蛋白质分子设计的关键是（）A 建立所研究蛋白质的结构模型B 找出对所要求的性质有重要影响的位置C 预测突变体的结构D 定性或定量计算优化所得到的突变体结构是否具有所要求的性质12. 下列不属于蛋白质结晶技术的是（）A 悬滴法B 坐滴法C 微量扩散小室法D 插入突变法13. 增加蛋白质分子的热稳定性的常用方法是（）A 提高脯氨酸的含量B 在蛋白质分子中引入二硫键C 增加蛋白质分子的α螺旋D 增加β折叠14 蛋白质工程的基本原理是（）A 中心法则B 热力学第二定律C 中心法则的逆推D 模型对比下列氨基酸中，人体不能自身合成的有：（ ) A、丙氨酸 B、组氨酸 C、赖氨酸 D、酪氨酸15. 关于 alpha-螺旋错误的是：（）A、螺旋中每 3.6 个氨基酸残基为一周B、为右手螺旋C、一个氢键闭合的环包含12个原子D、氨基酸侧链 R 基团分布在螺旋外侧1. 从DNA到蛋白质，按照中心法则，体外表达要分为( ) ，和( )两个步骤。
蛋白质工程复习资料
蛋白质工程复习资料一级结构：蛋白质多肽链中氨基酸残基的排列顺序。
二级结构：一段连续的肽单位借助于氢键，排列成的具有周期性结构的构象。
超二级结构：相邻的二级结构单位组合在一起，彼此相互作用，行为规则排列的组合体，以同一结构模式出现在不同的蛋白质中。
结构域：二级结构和结构模体以特定的方式组织连接，在蛋白质分子中形成两个或多个在空间上可以明显区分的三级折叠实体。
三级结构：蛋白质的多肽链在各种二级结构的基础上再进一步盘曲或折叠形成具有一定规律的三维空间结构。
四级结构：由两条或两条以上具有独立三级结构的多肽链组成的蛋白质就是寡聚蛋白质分子中多肽链间通过次级键相互组合而形成的空间结构。
蛋白质的变性：天然蛋白质分子受到某些物理因素或者化学因素的影响时，会引起蛋白质天然构象的破坏，导致生物活性的降低或完全丧失的过程。
蛋白质的复性：当变性因素除去后，变性蛋白又可以重新恢复到天然构象的现象。
第二遗传密码：氨基酸顺序与蛋白质三维结构之间存在着对应关系。
分子伴侣：一类可介导蛋白质的正确折叠与装配，但并不构成被介导的蛋白质组分的蛋白。
小改：进行蛋白质修饰或基因定位突变中改：进行蛋白质分子裁剪拼接晶体：离子，原子和分子这些微粒在三维空间中周期性重复排列形成的结构。
盐析现象：蛋白质在高浓度中性盐溶液中会沉淀析出的现象。
盐溶现象：在蛋白质水溶液中加入晒量的中性盐（如硫酸铵，硫酸钠，氯化钠）会增加蛋白质分子表面的电荷，增强蛋白质分子与水分子的作用，从而使蛋白质在水溶液中的溶解度增大的现象。
蛋白质芯片：也叫蛋白质微阵列，是将大量蛋白质有规则地固定到某种介质载体上，利用蛋白质与蛋白质，酶与底物，蛋白质与其他小分子之间的相互作用检测分析蛋白质的一种芯片。
噬菌体技术：将目的基因克隆在丝状噬菌体衣壳蛋白的基因中，是外源基因产物与衣壳蛋白融合，伸展在噬菌体表面，可用来直接检测表达产物的某些活性。
蛋白质组：基因组表达的全部蛋白质及其存在方式。
- 1、下载文档前请自行甄别文档内容的完整性，平台不提供额外的编辑、内容补充、找答案等附加服务。
- 2、"仅部分预览"的文档,不可在线预览部分如存在完整性等问题,可反馈申请退款(可完整预览的文档不适用该条件!)。
- 3、如文档侵犯您的权益，请联系客服反馈,我们会尽快为您处理(人工客服工作时间：9:00-18:30)。
第一章蛋白质结构基础复习题
1、蛋白质工程、构型与构象、交错构象、Ramachandra构象图、多肽链的构象角、氨基酸残基、肽单位、螺旋偶极子、两亲性螺旋、π螺旋、疏水内核、结构模体、基因、蛋白质折叠、分子伴侣
2、蛋白质工程的主要步骤包括哪些？
3、蛋白质工程的基本目标、基本途径及中心问题是什么？
4、二十种常见氨基酸按侧链性质可分为极性氨基酸和疏水氨基酸，其中疏水氨基酸包括A1a、Val、Leu 、Ile、Met 、Pro、Phe . Gly（极性or非极性）；极性氨基酸又可分为极性不带电荷Ser、Thr、Asn、Gln、Cys、Tyr 、Trp（有时归于非极性氨基酸）和His，极性带正电荷Arg、Lys，极性带负电荷Asp、G1u。
5、芳香族氨基酸包括Tyr、Trp、Phe，具有哪两种特性。
光谱特性和紫外线吸收特性
6、强烈倾向于形成α螺旋的氨基酸残基包括Ala、Glu、Leu和Met；非常不利于α螺旋形成的残基有Pro、Gly 、Tyr和Ser。
7、平行β层和反平行β层的区别。
8、简述环肽链及环肽链结构库的意义。
10、结构域的定义及其特征。
13、写出下列字母或词组的中文含义：
PDB-----蛋白质结构数据库protein data bank，PDB
coiled-coil αhelix------线绕式α螺旋
domain------结构域
loop----环肽链
codon----密码子
14、蛋白质在体内形成的两个阶段以及蛋白质工程设计和制造新蛋白质的基础性困难是什么？
15、蛋白质工程中增加蛋白质稳定性的基本途径有哪些？
第二章蛋白质分子设计复习题
1、内核假设、二元模式
2、简述蛋白质设计的目的及存在问题。
3、一般来说蛋白质设计循环包含哪几个步骤。
5、为什么说蛋白质工程是一个具有反向生物学性质的新课题。
6、何谓全新蛋白质设计。
9、在自然界惟一用于肽链交叉连接的方法是？
10、蛋白质功能设计的途径有哪些？
第三章蛋白质的修饰和表达复习题
1、蛋白质修饰的化学途径包括哪两种？
2、、重叠延伸、盒式突变法、质粒不相容性
4、写出下列词的中文含义：DTT、PCR、Tet 、Amp、E.coli、
5、利用基因融合技术表达外源基因的缘由有哪些？
6、为什么说大肠杆菌表达体系是外源基因表达的首选体系？
7、一个典型的大肠杆菌表达载体应包括哪些成分？
8、作为外源基因表达载体的启动子应具备什么标准？
9、寡核苷酸介导的基因突变中用于突变的引物应具备哪些特征？
第四章突变蛋白质的物理化学性质分析复习题
1、热力学函数、熔球态、过渡态、中间态、
2、简述蛋白质量热实验的原理。
3、蛋白质折叠动理的研究技术包括？
4、蛋白质折叠中间态包括哪些可能的形式？
5、多肽链间的非共价相互作用包括哪些类型？
第七章蛋白质的分离纯化与鉴定
1-10
第九章蛋白质组学2、5、6。