16章分子流行病学
流行病学-单项选择题

流行病学-单项选择题第一章绪论一、单项选择题:1.下列哪一点不是流行病学定义中的内涵()A研究对象是人群B不仅研究疾病,而且研究健康状态C重点研究疾病的症状及体征D重点研究疾病及健康状态的分布及影响因素,并提出控制消灭疾病促进健康的策略及措施2.现代流行病学的形成与发展不包括下面哪个部分()A对传染病及慢性病流行因素的研究B流行病学研究方法的发展C对疾病防治措施的研究D对疾病临床治疗的研究3.关于流行病学,下列哪种说法是正确的()A流行病学从分子水平认识疾病B流行病学从细胞水平认识疾病C流行病学从群体水平认识疾病D流行病学从个体水平认识疾病4.流行病学的研究范围是()A传染病B疾病和健康状况C传染病和地方病D传染病和非传染病5.关于流行病学,下列哪种说法正确A从个体的角度研究疾病和健康状况及其影响因素B只研究传染病的流行特征和防治措施C只研究慢性病的危险因素D研究人群中疾病和健康状况的分布及其影响因素D观察性研究、实验性研究、理论性研究7.关于流行病学下列哪条是不正确的()A它是医学的基础学科B它以个体为研究对象B它能为卫生决策提供依据D它可以研究疾病的自然史二、多项选择题:1.流行病学任务的三个阶段是()A揭示流行B揭示现象C找出原因D提供措施E确定病因2.流行病学观察方法包括A描述性研究B病例对照研究C队列研究D干预性研究E临床试验研究3.流行病学主要应用于()A考核疾病的防制效果B评价人群的健康状况C研究疾病预防和控制D研究疾病的病因E以上均不是4.流行病学和临床医学的区别在于()A流行病学以群体为研究对象,而临床医学以个体为研究对象B流行病学研究以描述疾病和健康的分布为起点并分析决定分布的因素,而临床医学从个体的症状、体征和各种理化检查入手以作出临床诊断C流行病学以预防疾病和促进健康为目的,而临床医学以治疗疾病为目的D从学科特征上讲,流行病学具有宏观性,而临床医学属于微观范畴E流行病学主要研究传染病的特征,而临床医学的重心在非传染病5.流行病学在病因未明疾病研究中的一般程序是()A描述疾病的分布B分析影响分布的因素C提出病因假设D检验或验证病因假设E制定针对病因的预防策略和措施6.流行病学的主要观点是()A群体观点B多病因论的观点C社会医学和生态学的观点D对比的观点E概率论的观点三、名词解释:流行病学四、填空题:1.流行病学研究对象的三个层次_________、_________、_________。
16 S rRNA在细菌分类鉴定研究中的应用

16 S rRNA在细菌分类鉴定研究中的应用*刘文强1,贾玉萍2,赵宏坤3(1.聊城大学农学院,山东聊城252059;2.山东大学生命科学学院,山东济南252100;3.山东农业大学动物科技学院,山东泰安271018)摘要:细菌的16 S 核糖体RNA(ribosome RNA,rRNA)以其在进化上的特征性序列,现已被广泛用于细菌分类和鉴定的分子指标。
其具体操作是,以聚合酶链式反应(PCR)分离细菌样本中的16 S rRNA的基因片段,通过克隆、测序或酶切、探针杂交获得其序列信息,再与16 S rRNA数据库中的序列数据进行比较,确定其在进化中的位置,从而鉴定样本中可能存在的微生物种类。
文章综述了16 S rRNA作为微生物系统分子分类鉴定的理论基础和方法,以及在细菌分类鉴定中的应用。
关键词:16 S rRNA;细菌;鉴定;分类传统的细菌系统分类的主要依据是形态特征和生理生化性状,采取的主要方法是对细菌进行纯培养,然后从形态学、生理生化反应特征以及免疫学特性等方面加以鉴定。
大量菌种的分类鉴定是一项繁琐、费时的工作,因此迫切需要建立一种简单、方便、易于操作的分类鉴定方法,使人们在一定程度上更加科学、精确、快速地找到微生物的分类地位,为微生物资源的开发利用奠定基础。
20世纪60年代开始,分子遗传学和分子生物学技术的迅速发展使细菌分类学进入了分子生物学时代,许多新技术和方法在细菌分类学中得到广泛应用。
Cai H Y等[1]认为,rRNA基因序列己成为一个分子指标,可以广泛地用于各种微生物的遗传特征和分子差异的研究。
目前,大量已知微生物的DNA都被测定并输入国际基因数据库,成为对微生物鉴定分类非常有用的参照系统,从而可以通过对未知微生物DNA序列的测定和比较分析,达到对其进行快速、有效的鉴定分类的目的。
随着微生物核糖体数据库的日益完善,该技术已应用于海洋、湖泊和土壤、大气微生物菌群和病原微生物等环境微生物多样性的分析[2]。
【同济医科大学】优质课《医学微生物学》第16章-白喉棒状杆菌

微荚膜、菌毛、毒素和多种酶类 * 所致疾病 • 军团病 流感样型(轻型) 肺炎型(重病型) 肺外感染 • 医院内感染 污染中央空调、冷却塔水后引起
三.微生物学检查与防治
一般取下呼吸道分泌物、肺活检组 织或胸腔积液等标本进行细菌学检查。
无嗜肺军团菌特异性疫苗 控制污染源 首选红霉素治疗
第四节 假单胞菌属
其属下共有46个菌种。
嗜肺军团菌 L.pneumophila 一.生物学性状
1. 嗜肺军团菌的形态学特征
* G-杆菌,常规染色不易着色
* 端生或侧生鞭毛,有微荚膜和菌毛 * 在组织中呈短杆状,人工培养基上 呈多形态性
Giemsa染色:呈红色
Dieterle镀银染色:呈黑褐色
2. 培养特性、抗原结构及抵抗力
对人致病:百日咳鲍特菌(B. pertussis)
副百日咳鲍特菌(B.parapertussis) 对动物致病:支气管败血鲍特菌(B. bronchiseplica)
百日咳鲍特菌 B. pertussis
* 百日咳鲍特菌俗称百日咳杆菌 * 人类百日咳因病程较长而得名 * 咳嗽呈阵发性或痉挛性 * 百日咳主要威胁:肺部继发感染 癫痫 脑病
一.生物学性状
1. 百日咳杆菌的形态学特征
* G-短小杆菌,有毒株有荚膜和菌毛
2. 培养特性与变异菌种
培养特性
* 初次分离时营养要求较高 * 常用含甘油、马铃薯、血液的鲍-金培 养基
变异菌种
S型菌株(新分离):称为Ⅰ相菌,有荚膜, 毒力强; R型菌株(人工培养):为Ⅳ相菌,无荚膜, 无毒力
3. 抗原结构及抵抗力
* 因在生长过程中产生绿色水溶性色素,感 染后的脓汁或敷料上出现绿色,故得名。
柯萨奇病毒A组16型研究进展_王一平

收稿日期:2012-02-14;修回日期:2012-02-28作者简介:王一平(1984-),女,硕士研究生,主要从事疫苗质控和研究评价工作。
通信作者:梁争论,博士,研究员,主要从事肝炎病毒、肠道病毒方面的研究工作。
E-mail:lzlun good·163.com ·综述·柯萨奇病毒A组16型研究进展王一平综述;毛群颖,梁争论审校(卫生部生物技术质量控制重点实验室,中国食品药品检定研究院,北京100050)摘要:柯萨奇病毒A组16型(CA16)是引起手足口病(HFMD)的主要病原体,与肠道病毒71型(EV71)交替或共同流行;特别是近年在西太平洋地区呈现流行强度高、重症和死亡人数多的特点,已成为该地区的重大公共卫生问题。
研发安全有效的疫苗是控制HFMD流行的有效手段。
由于EV71所致疾病在重症和死亡病例中所占比例高,对其疫苗研发得到了广泛关注,全病毒灭活疫苗已进入III期临床,有望即将应用于婴幼儿HFMD的防控。
EV71疫苗的顺利研发随之也增加了对CA16疫苗研发的迫切性。
近年来日本、新加坡以及中国台湾地区逐渐开始关注CA16相关的研究,我国也有多家企业开展CA16疫苗的研发。
本文就CA16的病原学,流行病学,实验室诊断,治疗和预防等方面进行了综述。
关键词:柯萨奇病毒A组16型(CA16);疫苗中图分类号:R373.2+3文献标志码:A文章编号:1005-5673(2012)03-0062-05Progress in research on Coxsackievirus A16WANG Yi-ping,MAO Qun-ying,LIANG Zheng-lun(Key Laboratory of the Ministry of Health for Research on Quality and Standardization of Biotech Products,National Institute for Food and Drug Control,Beijing,100050,China)Abstract:Coxsackievirus A16(CA16)is one of major pathogens associated with human hand,foot,and mouth diseases (HFMD).It always circulates alternatively or combanatively with Enterovirus71(EV71)on a global scale and caused many HFMD outbreaks.In particular,in recent years the epidemics of HFMD have appeared high strength,more severe cases and deaths in the Western Pacific region,the diseases have become a major public health problem in this region.The effective way to control the HFMD epidemic is to generate a safe and effective vaccine.Due to high proportion of severe ca-ses and deaths,the development of EV71vaccines have obtained a widespread concern and its inactivated whole-virus vac-cines have entered Phase III clinical trials,which are expected to be used in the prevention and control of HFMD in infants and young children in the near future.The smooth development of the EV71vaccine brings about the urgency of the re-search and development of CA16vaccine.Recently,more and more attention has been paid to CA16-related research in Ja-pan,Singapore and Taiwan area,China,and several Chinese enterprises have carried out the development of CA16vac-cine.In this paper,etiology,epidemiology,laboratory diagnosis,treatment and prevention of CA16are reviewed.Key words:Coxsackievirus A16(CA16);Vaccine1CA16病原学柯萨奇病毒(Coxsackievirus,CV)属于小RNA 病毒科肠道病毒属,可引起心肌炎、脑炎、肾炎、结膜炎等多种疾病。
医学遗传学习题集(附答案解析)第16章遗传病的预防

第十五章遗传病的预防遗传咨询的主要步骤包含正确诊断、确立遗传方式、对再发风险的预计、提出对策和举措、随访和扩大咨询。
目的是确立遗传病患者和携带者,并对后来辈生病的危险率进行展望,以便商谈应采纳的预防举措,减少遗传病患儿的出生,降低遗传病的发病率,提升人群遗传素质和人口质量。
遗传咨询是预防遗传病的重要举措。
(一)选择题( A 型选择题)1.对一些危害严重、致残的遗传病,当前还没有有效疗法,也不可以进行产前诊断,再次生育时的再发风险很高,宜采纳的对策。
A.遗传咨询B.出生后诊断C.人工授精D.不重生育E.药物控制2.曾生育过一个或几个遗传病患儿,重生育该病患儿的概率,称为。
A.再发风险B.生病率C.患者D.遗传病E.遗传风险3.杂合子的显性基因或纯合体中的隐性基因所产生的可检出遗传病百分率称为。
A.百分比B.外显率C.不完整外显D.半显性遗传E.完整显性遗传4. 不属于遗传咨询范围的种类是。
A.婚前咨询B.行政咨询C.居心理阻碍的咨询D.产前咨询E.一般咨询5.遗传咨询医师一定掌握诊断各样遗传病的基本技术,包含。
A.临床诊断B.酶学诊断C.细胞遗传学诊断D.基因诊断E.以上都是6.遗传咨询的主要步骤为A.正确诊断B.确立遗传方式C.对再发风险的预计D.提出对策和举措E.以上都是7.我国当前列入重生儿筛查的疾病有。
A. PKU B.SARS C.甲状腺炎D.非细菌感染E.DMD8.遗传咨询中的概率计算不包含。
A.中概率B.条件概率C.前概率D.联合概率E.后概率9.不合适进行人工授精的状况是。
A.一对夫妻婚后出生了严重的常染色体遗传病患儿B.再次生育时再发风险高,但有产前诊断方法C.丈夫为染色体易位的携带者D.已生出了遗传病患儿E.丈夫患严重的常染色体遗传病10.在遗传咨询中应用Bayes定理的要求是。
A.娴熟地运用孟德尔定律、掌握各样单基因遗传病的遗传规律B.熟习各样遗传方式在不一样组合下亲代与子代的关系C.并应拥有剖析推理能力,擅长思虑各样状况下的因果关系D.运用概率论于医学遗传学的领域,对每一实例做出判断E.以上都是11.Bayes定理在遗传咨询中的应用的目的是。
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第一章绪论一、单项选择题:1.下列哪一点不是流行病学定义中的内涵 CA 研究对象是人群B 不仅研究疾病,而且研究健康状态C 重点研究疾病的症状及体征D重点研究疾病及健康状态的分布及影响因素,并提出控制消灭疾病促进健康的策略及措施2.现代流行病学的形成与发展不包括下面哪个部分( D )A.对传染病及慢性病流行因素的研究B.流行病学研究方法的发展C.对疾病防治措施的研究D.对疾病临床治疗的研究3.关于流行病学,下列哪种说法是正确的( C )A.流行病学从分子水平认识疾病B.流行病学从细胞水平认识疾病C.流行病学从群体水平认识疾病D.流行病学从个体水平认识疾病4.流行病学的研究范围是( B )A.传染病B.疾病和健康状况C.传染病和地方病D.传染病和非传染病5.关于流行病学,下列哪种说法正确(D )A.从个体的角度研究疾病和健康状况及其影响因素B.只研究传染病的流行特征和防治措施C.只研究慢性病的危险因素D.研究人群中疾病和健康状况的分布及其影响因素6.流行病学工作的三个阶段是( B)A 描述分布、提出假设、验证假设B 揭示现象、找出原因、提供措施C 整理资料、分析资料、得出结论D 观察性研究、实验性研究、理论性研究7.关于流行病学下列哪条是不正确的( B )A.它是医学的基础学科B.以个体为研究对象C.它能为卫生决策提供依据D.它可以研究疾病的自然史参考答案一、单项选择题:1.CDCBD 6.B 7.B第二章病因推断一、单项选择题:1.下面哪种因果联接方式,在探讨病因时,能够全面反映事物的本来面目()A 单因单果B 单因多果C 多因单果D 多因多果2.判断因果关系的标准中()是必须的A 联系的合理性B 联系的时间顺序C 联系的恒定性D 联系的可逆转性3.随着吸烟量的增加,肺癌的发生危险(RR)也增加,由此支持吸烟导致肺癌的因果联系,这一推理运用的是()A.求同法B.差异法C.共变法D.同异并用法4.如发现非乙肝病毒感染者不发生肝癌,则支持乙肝病毒是发生肝癌的影响因素,这一推理运用的是()A.求同法B.差异法C.共变法D.同异并用法5.当怀疑的病因(暴露)减少或去除,引起疾病发生率下降,可进一步支持因果关联,这一种判断运用的标准是()A 关联的合理性B 关联的恒定性C 关联的合理性D 关联的强度6.流行病学病因研究中以下哪一条不为必须达到的()A 关联的强度B 关联的时间顺序C 终止效应D 关联的剂量—反应关系7.发达国家人均脂肪摄入量与大肠癌发生率,均高于发展中国家,由此支持脂肪摄入量与大肠癌之间的因果关联, 这一推理运用了因果判定标准中的( )A.关联的时间顺序B.暴露与疾病的分布一致C.关联的可重复性D.终止效应8.幽门螺杆菌结合部位在胃窦细胞,它可随胃窦细胞进入十二脂肠引起炎症、削弱粘膜,使其易于遭受酸的损伤,由此支持幽门螺杆菌是十二批肠溃疡的发病原因,这一推理运用了因果判断标准中的()A 关联的时间顺序B 关联的强度C 关联的可重复性D 关联的合理性9.不同国家的学者在不同时间对本国人群作研究,均得出高盐饮食引起高血压,由此支持高盐饮食是影响高血压发生的危险因素这一推理运用了判定标准中的()A 关联的特异性B 关联的时间顺序C 关联的可重复性D 关联的合理性10.在病因研究的轮状模型中,强调宿主与下列( )因素的关系A.生物因素B.环境因素C.化学因素D.物理因素11.下列哪项不是因果关联的判定标准()A 样本大小B 时间顺序C 联系的合理性D 剂量反应关系12.疾病发生的基本条件是下列哪一种组合()A 患者、家庭、社会B 病因、宿主、环境C 传染病、传播途径、易感者D 理化、生物、社会因素13.流行病学的病因定义为A 存在时必定引起疾病的因素B 对疾病发生必不可少的因素C 使疾病发生概率升高的因素D 疾病发生机制中的生物因素14.因果关联是指()A 暴露—疾病有较强的统计学关联B 暴露—疾病分类资料存在相关C 暴露—疾病排除偏倚后的关联D 暴露—疾病有时间先后的无偏关联15.生态学病同模型中所指的因素为(? )A.动同、宿主、环境B.心理、生理、环境C.生物、环境、卫生保健D.生物、生理、社会16.疾病因素模型将因素分为如下两个层次()A 生物学因素和非生物学因素B 宿主因素和环境因素C 可预防因素和不可预防因素D 外围的远因和致病机制的近因17.病因网络模型的主要优点是A 涉及的病因链较多且相互交错B 涉及的因素清晰具体且系统性强C 没有确定必要病因的困难D 没有确定充分病因的困难18.以下关于充分病因的正确真实的陈述是( )A 单个的充分病因不存在,而多个病因可以组合成充分病因B 外围的远因不是充分的,但很接近疾病结局的病因是充分的C 寻找充分病因有利于彻底预防或根除疾病D 充分病因正是概率因果观要抛弃的观念19.以下关于必要病因的哪一项是正确的?()A 所谓的必要病因一定同相应疾病的分类依据有关B 传染病有必要病因(病原体),而非传染病没有必要病因C 如果要预防疾病,一定需要去除必要病因D 吸烟是肺癌的必要病因20.静脉注射吸毒是艾滋病毒感染的A 直接病因B 间接病因C 充分病因D 必要病因21.病因研究的主要推理方法包括A 提出和验证假设的方法B 假设演绎法和Mill准则C 科学实验四法D 猜测和求证方法22.假设演绎法中,推出的经验证据成立,则()A 假设可能成立B 假设必定成立C 假设尚不能成立D 假设本身难以推论23.有对照(比较)组的研究,其共同的逻辑学基础是()A.求同法B.差异法C.同异并用法D.共变法24.暴露与疾病由于有共同的原因而产生的关联是A 偶然关联B 继发关联C 间接因果关联D 直接因果关联25.病因判定标准中哪些是必需的()A.前因后果和终止效应B.前因后果和关联的合理性C.广义关联强度和关联的可重复性、关联的合理性D 广义关联强度和前因后果参考答案一、单项选择题:1-5:DBCBC 6-10:DBDCB 11-15ABCDA16-20:DBDAB 21-25:BACBD第三章疾病的分布一、单项选择题:1.根据暴露来精确测量发病机率的疾病频率测量指标是()A 发病率B 罹患率C 感染率D 发病密度2.测量人群中某隐性感染为主的疾病时,所用指标为()A 发病率B 罹患率C 感染率D 续发率3.小范围、短时间内相同病例数的突然增多现象,可能是()A 散发B 爆发C 流行D 大流行4.某病在某地区显著超过该病历年散发发病率水平时,称()A 散发B 爆发C 流行D 大流行5.下列影响疾病的人群分布特征的因素中哪一项与疾病之间的关联相对来说最强A.年龄B.性别C.职业D.民族或种族6.某地为了解人群高血压发病情况拟进行一次普查,说明调查结果可统计()A 发病率B 罹患率C 患病率D 累积发病率7.某地连续三年统计肝癌死亡率进行比较,以判断发病趋势下列哪一种计算较合理()A各年粗死亡率比较B各年年龄标化死亡率比较C各年性别标化死亡率比较D各年病死率比较8.某地痢疾发病近年来持续在较高水平,这种表现为()A 统计地方性B自然地方性C 自然疫源性D非地方性表现9.拟了解儿童急性呼吸道感染情况,应选用以下那一个测量指标()A 发病率B 罹患率C 患病率D 期间患病率10.下列哪项因素与发病率的变化无关()A 致病因素的作用明显加强和减弱B 患病率的升高或下降C 疾病诊断水平的提高或下降D 诊断标准的变化11.下列哪项因素与患病率的变化无关()A发病率的升高或下降B病死率的升高或下降C人口总数自然增加或减少D治疗水平的提高或降低12.进行感染性腹泻监测时应选择的疾病频率测量指标是()A 罹患率B 发病专率C 发病率D 时点患病率13.疾病分布是指A 民族分布、性别分布、职业分布B 时间分布、地区分布、人群分布C 城乡分布、年龄分布、民族分布D 民族分布、年龄分布、职业分布14.在比较不同地区发病率或死亡率时应注意使用()A 年龄别发病率、年龄别死亡率B 性别发病率、性别死亡率C 民族别发病率民族别死亡率D 标化发病率、标化死亡率15.发病率指标来自()A 对住院病人的调查B 对门诊病人的调查C 对社区人群的调查D 对所有病人的调查16.患病率指标来自A 现况调查资料B 门诊病例资料C 住院病例资料D 专科医院病例资料17.对暴发性肝炎评价临床抢救效果时最恰当的指标应是()A死亡率B发病率C患病率D病死率18.对于一种危害严重的疾病,采取针对病因的措施后,在评价其预防效果时,应采用哪些指标最合适A 死亡率B发病率C患病率D病死率19.1994年平山县发现喘憋性肺炎的流行,暴露总人口数为83271人,经调查诊断发病例数共1478例,试问在资料分析时疾病的频率指标应选用()A发病率B罹患率C感染率D期间患病率参考答案一、单项选择题:1-5:BCBCA 6-10:CBAAB11-15CCBDC 16-19:ADBB第四章描述性研究一、单项选择题:1.欲调查某地HbsAg携带情况,可采用:()A 前瞻性调查B 抽样调查C 爆发调查D 回顾性调查2.下列哪种情况适用于抽样调查?()A 为发现某病全部病例并提供治疗B 为早期发现癌症患者以降低其死亡率C 欲知道某地一定时间内某病的患病情况D 要了解各种疾病的常年发病情况3.某乡5000户约2万人,欲抽其1/5人口进行某病调查,随机抽取1户开始后,每隔5户抽取1户,抽到的户其每个成员均进行调查,这种抽样方法为:()A 分层抽样B 系统抽样C 整群抽样D 简单抽样4.在抽样调查中,下列哪种抽样方法的抽样误差最大?()A 单纯随机抽样B 系统抽样C 分层抽样D整群抽样5.在流行病学研究中,使用较多的一类方法是()A 观察法B 临床试验法C 病例询问法D 干预试验法6.现患研究主要分析指标是()A 患病率B 发病率C 死亡率D 二代发病率7.关于暴露时间的推算,下列哪项是不恰当的()A 同源爆发暴露时间的推算,可从流行曲线的高峰处向前推一个常见潜伏期。
我国部分地区BVDV的分子流行病学调查和一株BVDV的全基因测序分析

青岛农业大学硕士学位论文我国部分地区BVDV分子流行病学调查和遗一{专进化分析结果显示,本实验室保存的毒株BVDVl.a、BVDVi—b、BVDVl-c、BVDVl-O、BVDVl.m、BVDVI.2a,其中DTl0、DTI、HNl、TJ3、HBI为BVDVl一m亚型,与BVDVZM.95株处于同一分支;GS5和GSI为BVDVl.O亚型与SD0803株一个分支;TJ2、TJI为BVDVl.b亚型,与中国株JN704144处于一个分支,与德国株CP7同源性也很高;TJ7是BVDVI.c型与澳大利亚株JN967700同源性很低,但与另一株澳大利亚Bega株同源性较高,与其比较接近;TJ9、TJ6、TJ5、TJl0、TJ4、TJ8和DT2、DT3、DT4、DT6、DT9、DTIl、DTl2、GS2、GS3两组为BVDVI.a亚型,与美国的SDI株和日本的Nose株的同源性较接近,BJI自成一个分支,是从北京某商品小牛血清中分离得到,怀疑是新的毒株亚型,JNI为BVDV2a亚型,与德国株的AJ30438处在一个分支,如图1.2。
我国河南、天津、山西大同、甘肃等地多流行BVDVI.a、BVDVI-b、BVDVl一c、BVDVl.O、BVDVI.m基因型,山东有BVDV-2型感染,其中在北京产的商品小牛血清中检测到一株BVDV,疑似是BVDV新毒株,还需要进行进一步的分析。
3讨论BVDV基因组由5’-UTR、一个大的开放阅读框(ORF)和37.UTR三部分组成。
5’.UTR末端的茎环结构在RNA翻译起始和复制过程中起着很大的作用【84】,根据病毒5'-UTR基因序列可将BVDV分为BVDV1型和BVDV2型,BVDVl型可分为若干亚型,BVDV2型又分为BVDV2.a和BVDV2.b。
依据5UTR构建系统进化树,分析本实验室保存的毒株基因亚型与世界各地的典型毒株的关系,发现我国上述地区存在的BVDV亚型主要为BVDVI—a、BVDVI.b、BVDVl-c、BVDVl.O、BVDVl.m基因型,DTl0、DTl、HNI、TJ3与猪源的ZM.95毒株同源性很近,揭示了BVDV在我国的流行和传播过程中,猪作为易感宿主可能参与了其中,当然作为这一种猜测还需要进一步研究来证实。
流行病学第十六章 分子流行病学

第三节 主要研究方法
(三)生物标志的选择和检测
2. 生物标志选择的原则 生物标志的选择还需符合下列原则: (1)生物标志应特异、稳定; (2)标本采集、储存方便; (3)检测方法简单、实用,而且操作规范,便于与同类研究结果比较; (4)检测方法灵敏度和特异度高。
第三节 主要研究方法
(三)生物标志的选择和检测
选自携带基因多态频率较低的另一个人群,则可产生“假阳性”结果。
第三节 主要研究方法
巢式病例对照研究 巢式病例对照研究是基于大样本人群队列的病例对照研究,由于在基线调查
时就已经收集暴露信息并采集了生物样本,可以避免选择偏倚和信息偏倚,使研
究对象更具有代表性和可比性,非常适合分子流行病学研究。其基本方法是:开 始按照队列研究进行设计实施,收集有关基线流行病学资料和生物标本;在随访
第一节 概述
(三)与传统流行病学的关系
第一节 概述
(三)与传统流行病学的关系
第一节 概述
(三)与传统流行病学的关系
分子流行病学研究实际上是将生物标志的检测技术应用于常规的流行病 学研究中。分子流行病学研究中的生物标志总体上可分为三类:暴露生物标志
(exposure biomarker),简称暴露标志(exposure marker,Mexp);效
第二节 生物标志
(三)易感性标志 遗传易感性生物标志是机体稳定存在的遗传性的可测量指标,这种生物 标志可以是基因型的改变,如某个基因的缺失,某段未知染色体片段的拷贝 数变异(copy number variation,CNV)或者单核苷酸多态性;也可以是 功能学或者表型的改变,如代谢表型、DNA修复能力等。随着人类基因组 计划及环境基因组计划的完成,越来越多的基因及其多态性被发现,这些基 因大多行使机体的日常功能,多态性的改变可能影响其参与的多个生物学途 径,如细胞分化、细胞凋亡、细胞周期调控以及DNA修复等,从而导致一
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第7版 流行病学配套光盘
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✓人群易感性或治疗反应 生物个体间的遗传 和环境不同,对于疾病的易感性或者治疗的 反应差别甚大。
✓基础医学 基础医学的快速发展,从分子及 基因水平上提出很多发病机制及病因假设。
机体易感性因素
模式II
主观感觉 客观指标
健康
疾病
健康指标 疾病指标
图16-1 健康-疾病连续带示意图 (health-disease continuum,HDC)
第7版 流行病学配套光盘
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传统流行病学
暴露
前瞻性研究
?
回顾性研究
疾病
分子流行病学
暴露
疾病
图16-2 传统流行病学与分子流行病学的关系(EDC模型)
(Schulte,1993)
第7版 流行病学配套光盘
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图16-3 传统流行病学主要是探讨ED之间是否存在关联,但无法解释此
类关联的机制
图16-4 暴露标志: 血清可替宁或者尿液中的 NNAL衡量吸烟者的暴露水平,PAH加合物
估计吸烟产生致癌物的实际剂量
图16-5 易感性标志: GSTM1遗传缺陷导 致的代谢能力的改变
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人类基因组流行病学网站 - HuGE Net
第7版 流行病学配套光盘
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分子流行病学在我国的发展
✓20世纪80年代初开始进行分子流行病学研究, 当时仅限于传染病,如对轮状病毒腹泻、大肠 杆菌腹泻等的研究。
✓90年代中后期,分子流行病学研究开始得到了 长足的发展,逐渐推广到流行病学的各个领域。
✓ 研究手段越来越多 质粒图谱、核酸分子杂交、抗原 抗体技术、生物芯片技术、质谱技术....
✓ 应用范围不断扩大 流行病学、预防医学、基础医学、 生物学、遗传学、环境科学和人类学等。
第7版 流行病学配套光盘
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与传统流行病学的关系
传统流行病学
Exposure
?
分子流行病学
Cancer
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微生物感染的测定等。
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➢ 生物有效剂量标志
指经吸收、代谢活化、转运,最终与靶组织细胞内DNA或蛋白质 相互作用的外源性物质或其反应产物的含量。
包括DNA 加合物、蛋白质加合物、DNA 蛋白交联物等。
生物学标志
环境暴露物质
生物材料
DNA加合物
蛋白质加合物 (血红蛋白)
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人类基因组计划
1990年启动,2003年发表完整的基因序列图
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人类基因组流行病学(human genome epidemiology,HuGE) 的产生和发展
✓ 1998年,Khoury和Dorman首次提出了人类基因组流行病学的概 念:应用流行病学与基因组信息相结合的研究方法,开展以人群 为基础的研究,评价基因组信息对人群健康和疾病的流行病学意 义,是遗传流行病学与分子流行病学交叉的前沿领域。
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✓1995年以后,我国有关分子流行病学的研究论 文逐渐增多。
✓1997年第四届中华流行病学会委员会首次设立 分子流行病学学组,次年召开了第一次全国分 子流行病学学术会议。
第7版 流行病学
✓ 研究内容更加丰富 包含疾病和健康状态相关生物标 志的分布、影响因素、人群易感性、防治效果评价、 预后分析等。
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➢ 分子流行病学的发展历程
分子流行病学概念的演变
国外:
✓1972年,提出“流感的分子流行病学”的名词。 ✓1977年,法国学者Higginson:分子流行病学是应用
精细技术进行生物材料的流行病学研究。 ✓1982年,Perera和Weinstein提出“癌症分子流行病
学”。
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➢分子生物学理论和技术的迅速发展
理论的突破 如:DNA双螺旋模型、遗传中心法则、遗 传密码、RNA逆转录、表观遗传修饰、微小RNA等。
技术的创新 各种凝胶电泳、体外核酸扩增、DNA测序、 蛋白质测序、分子杂交、基因克隆、色谱分析、生物芯 片技术等。
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易感性标志 指宿主对疾病发生、发展易感程度的生物标 志。
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暴露标志
➢ 外暴露标志 是指暴露因素进入机体之前的标志和剂量。
如病毒、细菌、生物毒素、吸烟烟雾、环境物质等。
➢ 内暴露标志 指被宿主吸收的外源性暴露物质的量。
包括对化学毒物、饮食中的营养素和可能致癌剂以及
图16-6 疾病或效应标志: 包括抑癌基因的突 变,细胞学或表遗传的改变,表达异常等
第7版 流行病学配套光盘 (Elston RC, 2002)
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第二节 生物标志
暴露标志 与疾病或健康状态有关的暴露因素的生物标志。 包括外暴露标志、内暴露标志和生物有效剂量标志。 效应标志 宿主暴露后产生功能性或结构性变化,并进一 步引起疾病亚临床阶段和疾病发生过程的生物标志。包括 早期生物效应标志、结构和(或)功能改变标志、临床疾 病标志等。
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“海平面”
患者 亚临床者
健康 者
“冰山” 现象
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模式I
暴露因素
┏━━━━┳━━━━━╋━━━━━┳━━━━┓
健健康康态态←←→→亚健康态潜←在→疾潜病在态疾←病→态临←界→疾临病界态疾←病→态亚←临→床态亚←临→床临态床←态→ 临床态
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✓1986年定义:分子流行病学的核心在于把先进的实 验室方法和分析流行病学结合起来,从而查明环境 和(或)宿主病因。
✓1993年定义:分子流行病学是在流行病学中应用生 物标志或生物学测量。
✓1996年定义:分子流行病学狭义上讲是测量作为暴 露和效应的生物标志——信息大分子:DNA、RNA 和蛋白质。
苯并(a)芘、 亚硝胺
环氧乙烯
白细胞 红细胞
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效应标志
➢ 早期生物效应标志