系谱
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家畜育种学实习
实习三 系谱的编制与及亲缘程度评定 主要内容
一、系谱的编制
二、个体近交系数的计算 三、个体间亲缘系数的计算
一、系谱的编制
系谱的种类
• 系谱：
– 用来描述个体间亲缘关系及个体特性的图谱
• 系谱的分类：
• 竖式系谱 • 横式系谱 • 结构式系谱 • 箭头式系谱 • 畜群系谱
竖式系谱
• 按子代在上，亲代在下，公畜在右，母畜在左的 格式，填写成表格形式 • 应该标注出个体的主要生产性能及特点 • 例如：
箭头式系谱
• 专供评定亲缘程度时使用的系谱格式 • 用箭头将个体间的关系相互连结 • 与亲缘程度评定无关的个体不必画出
畜群系谱
• 根据整个畜群的血统关系，按交叉排列的 方法编制 • 编制方法(略)
二、个体近交系数的计算
• 近交系数
– 个体的两个等位基因同源相同的概率 – 近交导致群体中杂合子频率减少的程度 – 形成个体的两个配子间因近交而造成的相关系数
亲缘系数的计算步骤
– 画出箭头式系谱
– 找出两个体间的所有共同祖先 – 写出一个体经过共同祖先到另一个体的所有 通径 – 分析共同祖先及两个体的近交情况，分别计 算各个体的近交系数 – 根据每条通径的情况计算出个体两个体间的 亲缘系数
举例
– 箭头式系谱:
• 计算11号与13号间的亲缘系数：
– 11号与13号的共同祖先：22号 – 11号到13号的所有通径链： 11 22 13 11 25 22 13 – 共同祖先及两个体的近交情况: • 22号、13号非近交个体 • 11号是近交个体，其近交系数：0.25 – 11号与13号个体间的亲缘系数：
449
120 49 6 103 8 105 10 5 8 103 8 155 105 10 Ⅰ（亲代） Ⅱ（祖代） Ⅲ（曾祖代）
横式系谱
• 按子代在左，亲代在右，公畜在上，母畜在下的格 式填写，用大括号括起来 • 应该标注出个体的主要生产性能及特点 • 例如：
结构式系谱
• 公畜用方块“□”表示，母畜用圆圈“○”表示 • 将出现次数最多的个体放在适中位置，以免线条过多交叉 • 将同一代的个体放在一个水平线上，在几个世代中重复出 现的个体放在最早出现的那一代位置 • 一头家畜在系谱只能占据一个位置，出现多少次即用多少 根线条来连接 • 无需注明生产性能
作业：
• 实习六： • 实习十： (二)、(三)、(四) • 实习十一： (一)、(二)、(三)
• 根据通径系数原理，个体x的近交系数即是形成 x个体的两个配子间的相关系数，用Fx表示 • 计算公式：
个体近交系数的计算方法
• 基本原理：通径分析 • 计算步骤：
– 画出个体的箭头式系谱 – 找出个体双亲的所有共同祖先 – 写出个体父亲经过共同祖先到母亲的所有通径 – 分析共同祖先的近交情况并计算共同祖先的近交 系数 – 根据每条通径的情况计算出个体近交系数
• 所有个体在一条通径链上只能出现一次
• 通径链上的箭头最多只能在共同祖先处改变一 次方向
三、个体间亲缘系数的计算
• 亲缘系数表示两个体间的遗传相关程度 • 个体间的亲属关系
– 直系：祖先与后代间的关系 – 旁系：非祖先与后代的关系
ห้องสมุดไป่ตู้
• 旁系亲属间亲缘系数的计算公式
• 直系亲属间亲缘系数的计算公式
举例
• 画出箭头式系谱 （需计算1号的近交系数） • 找出双亲的共同祖先：22号 • 写出双亲间的通径链：
11 11 22 25 13 22
13
• 共同祖先的近交情况：22号为非近交个体 • 计算1号个体的近交系数：
写通径链的注意事项
• 所有通径链只能从一个亲本到另一亲本
• 所有通径链必须经过共同祖先
实习三 系谱的编制与及亲缘程度评定 主要内容
一、系谱的编制
二、个体近交系数的计算 三、个体间亲缘系数的计算
一、系谱的编制
系谱的种类
• 系谱：
– 用来描述个体间亲缘关系及个体特性的图谱
• 系谱的分类：
• 竖式系谱 • 横式系谱 • 结构式系谱 • 箭头式系谱 • 畜群系谱
竖式系谱
• 按子代在上，亲代在下，公畜在右，母畜在左的 格式，填写成表格形式 • 应该标注出个体的主要生产性能及特点 • 例如：
箭头式系谱
• 专供评定亲缘程度时使用的系谱格式 • 用箭头将个体间的关系相互连结 • 与亲缘程度评定无关的个体不必画出
畜群系谱
• 根据整个畜群的血统关系，按交叉排列的 方法编制 • 编制方法(略)
二、个体近交系数的计算
• 近交系数
– 个体的两个等位基因同源相同的概率 – 近交导致群体中杂合子频率减少的程度 – 形成个体的两个配子间因近交而造成的相关系数
亲缘系数的计算步骤
– 画出箭头式系谱
– 找出两个体间的所有共同祖先 – 写出一个体经过共同祖先到另一个体的所有 通径 – 分析共同祖先及两个体的近交情况，分别计 算各个体的近交系数 – 根据每条通径的情况计算出个体两个体间的 亲缘系数
举例
– 箭头式系谱:
• 计算11号与13号间的亲缘系数：
– 11号与13号的共同祖先：22号 – 11号到13号的所有通径链： 11 22 13 11 25 22 13 – 共同祖先及两个体的近交情况: • 22号、13号非近交个体 • 11号是近交个体，其近交系数：0.25 – 11号与13号个体间的亲缘系数：
449
120 49 6 103 8 105 10 5 8 103 8 155 105 10 Ⅰ（亲代） Ⅱ（祖代） Ⅲ（曾祖代）
横式系谱
• 按子代在左，亲代在右，公畜在上，母畜在下的格 式填写，用大括号括起来 • 应该标注出个体的主要生产性能及特点 • 例如：
结构式系谱
• 公畜用方块“□”表示，母畜用圆圈“○”表示 • 将出现次数最多的个体放在适中位置，以免线条过多交叉 • 将同一代的个体放在一个水平线上，在几个世代中重复出 现的个体放在最早出现的那一代位置 • 一头家畜在系谱只能占据一个位置，出现多少次即用多少 根线条来连接 • 无需注明生产性能
作业：
• 实习六： • 实习十： (二)、(三)、(四) • 实习十一： (一)、(二)、(三)
• 根据通径系数原理，个体x的近交系数即是形成 x个体的两个配子间的相关系数，用Fx表示 • 计算公式：
个体近交系数的计算方法
• 基本原理：通径分析 • 计算步骤：
– 画出个体的箭头式系谱 – 找出个体双亲的所有共同祖先 – 写出个体父亲经过共同祖先到母亲的所有通径 – 分析共同祖先的近交情况并计算共同祖先的近交 系数 – 根据每条通径的情况计算出个体近交系数
• 所有个体在一条通径链上只能出现一次
• 通径链上的箭头最多只能在共同祖先处改变一 次方向
三、个体间亲缘系数的计算
• 亲缘系数表示两个体间的遗传相关程度 • 个体间的亲属关系
– 直系：祖先与后代间的关系 – 旁系：非祖先与后代的关系
ห้องสมุดไป่ตู้
• 旁系亲属间亲缘系数的计算公式
• 直系亲属间亲缘系数的计算公式
举例
• 画出箭头式系谱 （需计算1号的近交系数） • 找出双亲的共同祖先：22号 • 写出双亲间的通径链：
11 11 22 25 13 22
13
• 共同祖先的近交情况：22号为非近交个体 • 计算1号个体的近交系数：
写通径链的注意事项
• 所有通径链只能从一个亲本到另一亲本
• 所有通径链必须经过共同祖先