RT-PCR名解
三种PCR技术

《反义PCR在肿瘤检测中的应用》 肿瘤患者总是存在转移灶而加速病情的恶化, 转移灶的检测对肿瘤患者的诊断分期、治疗、复发、 预后判断、术后综合治疗的选择都有极大的意义。 反义PCR是是近年来发展的一种在亚显微水平检 测隐匿性肿瘤转移的方法,具有高特异性、高敏感性、 操作简便的特点。 在临床检测中,从早期的IE染色到现在常用的免 疫组织化染色,都存在低估转移数目的局限性,如: 免疫组织化方法可以从2xl05个骨髓细胞中检 出1个McF-7细胞。而反义PCR法可从106个淋巴细胞中 检出1个McF--7细胞。 此外,反义PCR采用mRNA为标志物,反义PCR法 有效地解决了从多个正常等位基因中分离突变基因的 问题。
易错PCR存在的问题 碱基的变异具有倾向性:种碱基比例不平衡的情 况下,A.T--CG的变异比率通常高于CG--AT,的变 异比率 易错 PCR 产量和变异水平偏低 模板的要求较高,最好是只含目的基因的DNA片段 解决方法 寻找新的影响酶功能、同时又不带来碱基变异偏 好的因素,开发更多的易错 PCR方法 易错 PCR多种诱变条件的简化 《定向进化-易错PCR方法提高华根霉Rhizopus chinensis CCTCC M201021脂肪酶的活力 》
《反向PCR法扩增花粉特异表达基因PSG076启动子》 在植物的有性生殖过程中,花粉的正常发育受阻 将会产生雄性不育,这是杂种优势利用中的关键材料。 因此可利用花粉特异性启动子驱动破坏花粉生长的基 因表达,促使花粉败育,从而获得雄性不育转基因材 料。 PSG076是小麦花粉特异性表达基因,本研究对其 上游启动子序列进行分离,并选择了已知序列上有切 点的酶进行切割,获得了1.4Kb的上游启动子序列。
RNA提取:Trizol试剂方法提总RNA EV71和Cox.A16的鉴别诊断 RT-PCR
PCR及RT-PCR概述

PCR及RT-PCR概述一、目的掌握聚合酶链式反应(PCR) 及逆转录-聚合酶链式反应(RT-PCR)的基本方法二、原理PCR用于扩增位于两段已知序列之间的DNA区段。
在由Taq DNA聚合酶催化的一系列合成反应中,使用两段寡核苷酸作为反应的引物。
一般情况下,这两段寡核苷酸引物的序列互不相同,并分别与模板DNA 两条链上的各一段序列互补,而这两段模板序列又分别位于待扩增的两侧。
反应时它包括三个基本步骤: (1) 变性(Denature):目的双链DNA 片段在94℃下解链; (2) 退火(Anneal):两种寡核苷酸引物在适当温度(50℃左右)下与模板上的目的序列通过氢键配对;(3) 延伸(Extension):在Taq DNA 聚合酶合成DNA 的最适温度下,以目的DNA 为模板进行合成.由这三个基本步骤组成一轮循环,理论上每一轮循环将使目的DNA 扩增一倍(图4),这些经合成产生的DNA 又可作为下一轮循环的模板,所以经25-35 轮循环就可使DNA 扩增达106倍。
RNA的多聚酶链式反应(RT-PCR)是以RNA为模板,联合逆转录反应(reverse transcrip-tion, RT)与PCR,可用于检测单个细胞或少数细胞中少于10个拷贝的特异DNA,为RNA病毒检测提供了方便;并为获得与扩增特定的RNA互补的cDNA提供了一条极为有利和有效的途径。
RNA扩增包括两个步骤:①在单引物的介导下和逆转录酶的催化下,合成RNA的互补链cDNA;②加热后cDNA与RNA链解离,然后与另一引物退火,并由DNA聚合酶催化引物延伸生成双链靶DNA,最后扩增靶DNA。
在RT-PCR中关键步骤是RNA的逆转录,cDNA的PCR与一般PCR条件一样。
由于引物的高度选择性,细胞总RNA无需进行分级分离,即可直接用于RNA的PCR。
但RT-PCR对RNA制品的要求极为严格,作为模板的RNA分子必须是完整的,并且不含DNA、蛋白质和其它杂质。
RT-PCR名解

______________________________________________________________________________________________________________逆转录PCR,或者称反转录PCR(reverse transcription-PCR, RT-PCR),是聚合酶链式反应(PCR)的一种广泛应用的变形。
在RT-PCR中,一条RNA链被逆转录成为互补DNA,再以此为模板通过PCR进行DNA扩增。
实时PCR(real-time PCR),属于定量PCR(Q-PCR)的一种,以一定时间内DNA的增幅量为基础进行DNA的定量分析。
real time PCR 的定量使用荧光色素,目前有二种方法。
一种是在ds DNA中插入特异的荧光色素,例如SYBR Green荧光染料;另一种使用一种能与增幅DNA序列中特定寡核酸序列相结合的一种荧光探针(probe),如Taqman探针。
两种方法原理不同。
SYBR Green荧光染料游离时不发光,当反应体系中存在双链DNA时,SYBR Green与双链DNA结合,此时才发光。
Taqman探针带有一个荧光基团和一个淬灭基团,荧光基团连接在探针的5’末端,而淬灭基团则在3’末端。
PCR扩增时在加入一对引物的同时加入一个特异性的荧光探针,探针完整时,报告基团发射的荧光信号被淬灭基团吸收;PCR扩增时,Taq酶的5'-3'外切酶活性将探针酶切降解,使报告荧光基团和淬灭荧光基团分离,此时荧光基团发出的荧光信号可以被检测到。
real time PCR 与 reverse transcription PCR 相结合,能用微量的RNA来找出特定时间、细胞、组织内的特别表达的遗传基因。
这两种RT PCR的组合又被称之为“定量RT-PCR (quantitative RT-PCR)”精品资料。
rt pcr原理

rt pcr原理RT-PCR原理RT-PCR是一种广泛应用于分子生物学和医学诊断领域的实验技术,其全称为反转录聚合酶链式反应(Reverse Transcription Polymerase Chain Reaction)。
本文将详细介绍RT-PCR的原理。
一、反转录(Reverse Transcription)1. 反转录的概念反转录是指将RNA模板上的信息逆向转录成为DNA序列。
在RT-PCR中,反转录是制备cDNA(complementary DNA)模板的关键步骤。
cDNA是由RNA模板逆向合成的双链DNA,它可以作为PCR 扩增的模板。
2. 反转录过程反转录过程由三个主要部分组成:RNA逆向转录、RNA降解、cDNA 合成。
首先,需要使用反转录酶将RNA模板逆向转录为单链cDNA;然后通过碱基切除和填充,将单链cDNA变为双链cDNA;最后使用RNase H或其他酶降解RNA模板,得到纯净的cDNA。
二、聚合酶链式反应(Polymerase Chain Reaction)1. PCR的概念聚合酶链式反应是一种体外扩增核酸序列的技术。
它可以在短时间内从微量样品中扩增出大量特定的DNA序列。
2. PCR过程PCR过程由三个主要步骤组成:变性、退火、延伸。
首先,将DNA 双链分离为两条单链,即变性;然后引入引物(primers),使其与目标序列的两端互相补合,形成一个模板-引物复合体;最后,使用DNA聚合酶在引物的作用下延伸新链。
三、RT-PCR原理1. RT-PCR的概念RT-PCR是一种结合反转录和聚合酶链式反应技术的方法,用于从RNA模板中扩增特定的DNA序列。
它可以将RNA转录为cDNA,并通过PCR扩增cDNA。
2. RT-PCR过程RT-PCR过程由四个主要步骤组成:反转录、初步扩增、二次扩增、检测。
首先进行反转录反应,将RNA逆向转录为cDNA;然后进行初步扩增,使用特定引物扩增目标序列;接着进行二次扩增,使用内部引物对初步扩增产物进行进一步扩增;最后进行检测,确定是否存在目标序列。
简述RT-PCR的原理及应用

简述RT-PCR的原理及应用1. RT-PCR的原理RT-PCR(Reverse Transcription Polymerase Chain Reaction)是一种将RNA转录成DNA并通过聚合酶链式反应(PCR)扩增的技术。
它结合了逆转录反应(RT)和PCR技术,能够从RNA分子中扩增出目标序列的DNA片段。
RT-PCR的原理可以分为以下几个步骤: - 逆转录反应:在逆转录酶(RT酶)的作用下,将RNA模板反转录成单链cDNA(互补DNA)。
- 第一链合成:通过加入一条适配器序列,形成一条新的DNA链,并使其保持单链状态。
- 第二链合成:加入第二个引物,依靠DNA聚合酶进行DNA链的合成。
此时,所得到的双链cDNA与原始RNA分子完全互补。
这样,通过逆转录和扩增两个步骤,我们可以从RNA模板中获得目标序列的DNA片断。
接下来,这些DNA片段可以通过PCR技术进一步扩增,以获取更多目标DNA。
2. RT-PCR的应用RT-PCR技术具有广泛的应用范围,包括以下几个方面:2.1 基因表达分析RT-PCR广泛应用于基因表达分析领域,其敏感性、特异性和快速性使其成为研究基因表达的重要工具。
通过从细胞中提取RNA,然后经过逆转录反应合成cDNA,最后通过扩增PCR得到目标基因的片段,可以定量分析目标基因在不同条件或组织中的表达水平。
2.2 病毒检测与诊断RT-PCR技术在病毒检测和诊断方面具有重要的应用价值。
病毒RNA是RT-PCR的理想模板,通过逆转录和扩增,可以检测病毒的存在和数量。
例如,在COVID-19大流行期间,RT-PCR被广泛用于检测冠状病毒的RNA,以诊断感染者和筛查潜在的传播者。
2.3 遗传疾病筛查RT-PCR也被广泛用于遗传疾病的筛查,特别是单基因遗传病的检测。
通过RT-PCR扩增目标基因的DNA片段,可以鉴定致病基因的突变。
这对于帮助家族中可能患有遗传病的个体进行早期诊断和咨询是非常重要的。
real-time pcr名词解释

real-time pcr名词解释
外文名【Real-time Quantitative polymerase chain reaction】
中文名【实时荧光定量多聚核苷酸链式反应】
中文简称【实时荧光定量PCR】
外文简称【RT PCR】
【实时荧光定量PCR技术】,是指在PCR反应体系中加入荧光基团,利用荧光信号积累实时监测整个PCR进程,最后通过标准曲线对未知模板进行定量分析的方法。
实时荧光定量PCR (Quantitative Real-time PCR)是一种在DNA扩增反应中,以荧光化学物质测每次聚合酶链式反应(PCR)循环后产物总量的方法。
通过内参或者外参法对待测样品中的特定DNA序列进行定量分析的方法。
·
Real-timePCR是在PCR扩增过程中,通过荧光信号,对PCR进程进行实时检测。
由于在PCR扩增的指数时期,模板的Ct值和该模板的起始拷贝数存在线性关系,所以成为定量的依据。
【技术原理】
将标记有荧光素的Taqman探针与模板DNA混合后,完成高温变性,低温复性,适温延伸的热循环,并遵守聚合酶链反应规律,与模板DNA互补配对的Taqman 探针被切断,荧光素游离于反应体系中,在特定光激发下发出荧光,随着循环次数的增加,被扩增的目的基因片段呈指数规律增长,通过实时检测与之对应的随扩增而变化荧光信号强度,求得Ct值,同时利用数个已知模板浓度的标准品作对照,即可得出待测标本目的基因的拷贝数。
rtpcr的原理实验步骤及应用

RTPCR的原理实验步骤及应用概述逆转录聚合酶链式反应(Reverse Transcription Polymerase Chain Reaction,简称RT-PCR),是一种常用的分子生物学实验技术,用于检测和定量分析RNA分子在细胞中的表达水平。
本文将介绍RT-PCR的原理、实验步骤及应用。
原理RTPCR利用逆转录酶(Reverse Transcriptase,简称RT)将RNA模板逆转录为cDNA(complementary DNA),然后通过聚合酶链式反应(Polymerase Chain Reaction,简称PCR)对cDNA进行扩增,最终得到大量的目标DNA片段。
RT-PCR的基本原理如下:1.逆转录:反转录酶RT利用RNA模板合成与之互补的cDNA。
在逆转录过程中,需要引入一条逆转录引物(反向互补RNA链)作为反转录的起始点。
2.PCR扩增:将逆转录合成的cDNA作为模板,引入一对特异性引物,通过PCR反应进行DNA扩增。
PCR反应分为三个步骤:变性、退火和扩增。
3.变性:将反应温度升高至95°C,使DNA双链变性为两条单链。
4.退火:将反应温度降低至特异性引物的退火温度,使引物与模板序列互相结合。
5.扩增:将反应温度升高至适合DNA聚合酶的活性温度,使DNA聚合酶逆反应合成DNA。
通过多轮的PCR反应,可以扩增出大量的目标DNA片段,其数量呈指数级增长。
实验步骤1. 样品处理首先需要从待检测的样品中提取总RNA,常用的提取方法有酚氯仿法和柱式纯化法。
提取得到的总RNA需要通过比色法或者用分光光度计进行测量,确保样品的质量和浓度。
2. 逆转录反应逆转录反应是将RNA模板转录为cDNA的过程。
需要准备逆转录试剂盒,主要包括逆转录酶、随机引物、dNTPs(脱氧核苷酸三磷酸盐)和逆转录缓冲液。
按照试剂盒说明书的配方,将总RNA与逆转录试剂混合,进行逆转录反应。
反应结束后,需要进行热灭活,以停止反应。
逆转录-聚合酶链反应(RT-PCR)

1. 随机六聚体引物:当特定 mRNA 由于含有使反转录酶终止的序列而难于拷贝其全长 序列时,可采用随机六聚体引物这一丌特异的引物来拷贝全长 mRNA。用此种方法时,体 系中所有 RNA 分子全部充当了 cDNA 第一链模板,PCR 引物在扩增过程中赋予所需要的 特异性。通常用此引物合成的 cDNA 中 96%来源于 rRNA。 2. Oligo(dT):是一种对 mRNA 特异的方法。因绝大多数真核细胞 mRNA 具有 3’端 Poly(A+)尾,此引物不其配对,仅 mRNA 可被转录。由于 Poly(A+)RNA 仅占总 RNA 的 1-4%,故此种引物合成的 cDNA 比随机六聚体作为引物和得到的 cDNA 在数量和复杂性 方面均要小。 3. 特异性引物:最特异的引发方法是用含目标 RNA 的互补序列的寡核苷酸作为引物, 若 PCR 反应用二种特异性引物,第一条链的合成可由不 mRNA 3’端最靠近的配对引物起 始。用此类引物仅产生所需要的 cDNA,导致更为特异的 PCR 扩增。 三、 试剂准备 1.RMA 提取试剂 2.第一链 cDNA 合成试剂盒 3.dNTPmix:含 dATP、dCTP、dGTP、dTTP 各 2mM 4.Taq DNA 聚合酶 四、操作步骤 1. 总 RNA 的提取:见相关内容。 2. cDNA 第一链的合成:目前试剂公司有多种 cDNA 第一链试剂盒出售,其原理基本相同, 但 操 作 步 骤 丌 一 。 现 以 GIBICOL 公 司 提 供 的 SuperScriptTM Preamplification System for First Strand cDNA Synthesis 试剂盒为例。
详细 实验方法
逆转录-聚合酶链反应实验方法 实验材料
组织或细胞样品 试剂、试剂盒
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实时PCR(real-time PCR),属于定量PCR(Q-PCR)的一种,以一定时间内DNA的增幅量为基础进行DNA的定量分析。
real time PCR 的定量使用荧光色素,目前有二种方法。
一种是在ds DNA中插入特异的荧光色素,例如SYBR Green荧光染料;另一种使用一种能与增幅DNA序列中特定寡核酸序列相结合的一种荧光探针(probe),如Taqman探针。
两种方法原理不同。
SYBR Green荧光染料游离时不发光,当反应体系中存在双链DNA时,SYBR Green 与双链DNA结合,此时才发光。
Taqman探针带有一个荧光基团和一个淬灭基团,荧光基团连接在探针的5’末端,而淬灭基团则在3’末端。
PCR扩增时在加入一对引物的同时加入一个特异性的荧光探针,探针完整时,报告基团发射的荧光信号被淬灭基团吸收;PCR扩增时,Taq酶的5'-3'外切酶活性将探针酶切降解,使报告荧光基团和淬灭荧光基团分离,此时荧光基团发出的荧光信号可以被检测到。
real time PCR 与reverse transcription PCR 相结合,能用微量的RNA来找出特定时间、细胞、组织内的特别表达的遗传基因。
这两种RT PCR的组合又被称之为“定量RT-PCR (quantitative RT-PCR)”。