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安阳工学院《软件工程课程设计》指导书

安阳工学院《软件工程课程设计》指导书

《软件工程课程设计》指导书安阳工学院计算机科学与信息工程学院2013年5月一.课程设计基本目的1. 通过本课程设计的实践及其前后的准备与总结,复习、领会、巩固和运用软件工程课堂上所学的软件开发方法和知识,比如,软件项目的完整设计与开发过程、结构化技术、快速原型法和面向对象方法等。

特别是结构化分析、结构化设计、快速原型开发、面向对象分析与面向对象设计。

2. 为学生适应毕业后团队合作开发规模稍大项目和综合应用本专业所学习的多门课程知识(例如,软件工程、程序设计语言、操作系统、数据库、网络编程等)创造实践机会。

为学生提供主动学习(比如,对Web网页设计、ASP或JSP交互网页技术、Java开发环境、商用数据库应用、电子商务、客户机/服务器技术、Visio与Rose软件工具等内容的学习)、积极探索与大胆创新的机会。

3. 使学生通过参加小组团队的开发实践,了解项目管理、团队合作、文档编写、口头与书面表达的重要性。

4.使每个学生了解软件工具与环境对于项目开发的重要性,并且重点深入掌握好一、两种较新或较流行的软件工具或计算机应用技术、技能(比如,网页设计技术与常见工具;基于Java(ASP、PHP等)技术的Web编程;软件开发文档编制工具Office、Visio、Rose等;商用数据库Access(或SQL Server、Oracle、MySql等)设计与实现;客户机/服务器结构)。

5. 通过“稍大的”富有挑战性的软件实验项目开发实践,为学生提供主动学习(比如,对Web网页设计、ASP或ASP交互网页技术、Java开发环境、商用数据库应用、电子商务、客户机/服务器技术、Visio与Rose软件工具等内容的学习)、深入实践的机会,并且通过课程设计实践中,提高学生的自学能力、书面与口头表达能力、创造能力和与团队其他成员交往和协作开发软件的能力,提高学生今后参与开发稍大规模实际软件项目和探索未知领域的能力和自信心。

(整理)课程设计指导书数字电子技术

(整理)课程设计指导书数字电子技术

昆明学院《数字电子技术》课程设计指导书(适用于计算机科学与技术专业所有方向)(学分:1 学时:1周)信息技术学院2012年10月目录一、课程设计的基本任务 (1)二、课程设计的基本要求 (1)三、课程设计时间进度安排 (1)四、课程设计提交成果 (1)五、课程设计成绩评定 (2)六、课程设计报告的主要内容 (2)七、课程设计的内容、步骤和方法 (2)八、主要参考文献 (7)附录 (8)一、课程设计的基本任务培养学生对数字集成电路应用方面的综合实践技能,掌握综合运用理论知识以解决实际问题的能力。

学生通过电路设计、安装、调试、整理资料、答辩等环节形成独立思考问题的能力,以及培养课本知识以外的一些科技工作者必须具备的基本技能,并培养学生的创新能力和自主学习的能力。

如查阅资料、懂得如何根据需要选择器件等,从而逐步熟悉开展科学实践的程序和方法。

二、课程设计的基本要求通过为期一周的课程设计,要求同学达到以下基本要求:1、查阅资料。

分析比较、选择设计方案;2、总体设计。

设计计算、元件选取、绘制电路原理图;3、软件仿真、安装电路。

利用Proteus软件构建电路,进行虚拟仿真,并在面包板上插接元器件,连接好完整的电路。

4、调试。

利用Proteus软件的调试工具进行分块调试、整机联调,并检查安装的电路无误后,进行通电观察、分块调试和整机联调。

5、故障排除。

根据调试过程中出现的问题,逐一查找原因,排除故障,使电路达到设计要求;6、写出课程设计报告。

要求写出设计思路、工作原理,画出电路结构框图,绘出电路原理图,给出设计参数及调试电路数据,分析设计中遇到的问题和解决方法及设计心得体会。

三、课程设计时间进度安排四、课程设计提交成果提交课程设计报告及仿真文件。

五、课程设计成绩评定设计成绩根据设计成果,综合在课程设计过程中的表现,按“优、良、中、及格、不及格”5级分制或百分制综合评定。

平时成绩(含考勤、电路原理设计)40%;提交成果(含电路仿真/安装、调试、验收、考核)30%;课程设计报告30%。

8279键盘课程设计

8279键盘课程设计

8279键盘课程设计一、教学目标本课程的学习目标包括知识目标、技能目标和情感态度价值观目标。

知识目标要求学生掌握8279键盘的基本原理、结构和功能。

技能目标要求学生能够运用8279键盘进行基本的输入输出操作,并能够进行简单的故障排除。

情感态度价值观目标要求学生对计算机科学产生浓厚的兴趣,培养良好的科学素养和创新精神。

二、教学内容本课程的教学内容主要包括8279键盘的基本原理、结构和功能,以及基本的输入输出操作。

具体包括:1. 8279键盘的内部结构和工作原理;2. 8279键盘的接口技术和通信协议;3. 8279键盘的编程方法和应用实例;4. 8279键盘的故障排除和维护技巧。

三、教学方法为了激发学生的学习兴趣和主动性,本课程将采用多种教学方法。

包括:1. 讲授法,通过讲解8279键盘的基本原理和功能,使学生掌握相关知识;2. 讨论法,通过分组讨论和实践操作,培养学生的动手能力和团队协作精神;3. 案例分析法,通过分析实际案例,使学生能够将理论知识应用于实际问题中;4. 实验法,通过实验操作,使学生能够亲手实践,加深对知识的理解和记忆。

四、教学资源为了支持教学内容和教学方法的实施,丰富学生的学习体验,我们将选择和准备适当的教学资源。

包括:1. 教材《8279键盘原理与应用》,作为学生学习的主要参考资料;2. 多媒体资料,包括教学PPT、视频教程等,用于辅助讲解和演示;3. 实验设备,包括8279键盘、计算机等,用于学生动手实践;4. 在线资源,包括相关论坛、教程等,供学生自主学习和交流。

五、教学评估本课程的评估方式包括平时表现、作业和考试。

平时表现主要评估学生的课堂参与度和积极性,包括提问、回答问题、实验操作等。

作业主要评估学生的理解和应用能力,要求学生完成相关的练习题和实验报告。

考试主要评估学生对知识的掌握和运用能力,包括选择题、填空题、简答题和综合应用题。

六、教学安排本课程的教学安排规定了教学进度、教学时间和教学地点。

大学计算机基础 课程设计

大学计算机基础    课程设计

目录建水县的基本概况 (3)1.地理位置 (3)2.行政区划 (3)3.人口民族 (4)4.地理气候 (4)历史状况 (4)现状 (5)1、农业 (5)2、工业 (6)3、旅游业 (6)4、林果业 (6)5、社会事业 (7)6、基础设施建设 (7)7、资源条件 (8)城市特点 (9)历史悠久文物荟萃 (9)气候温和农业发达 (9)矿产资源丰富工业出成体系 (9)潜力巨大前景广阔 (10)经济状况 (10)文化底蕴 (11)1、孔子文化节 (11)2、建水小调 (11)3、建水十八怪 (12)人文景观 (13)人文特色 (13)景观特色 (13)金临安茶苑 (13)文庙 (14)朝阳楼 (14)朱家花园 (15)张家花园 (16)文笔塔 (16)燕子洞 (16)双龙桥 (17)建水古井 (17)2.行政区划2008年,经过县委,县政府商定,建水所属乡镇为14个,即临安镇、西庄镇、青龙乡、岔科乡、李浩寨乡、面甸乡、坡头乡、官厅乡、普雄乡、盘江乡、甸尾乡、利民乡。

3.人口民族2008年末,全县总人口51.02万人,其中农业人口42.69万人,占总人口的86.1%;少数民族人口17.53万人,占总人口的35.3%。

人口密度每平方千米132人。

4.地理气候建水地处滇东高原南缘,地势南高北低。

南部五老峰为最高点,海拔2515米;五老峰南至红河谷地的阿土村为最低点,海拔230米。

境内南北分布有建水、曲江两个盆地,海拔1300米。

境内东西走向的山脉分南北两支,将建水和曲江两个坝子隔开。

境内主要河流泸江河、曲江河、塔冲河、南庄河等属南盘江水系,坝头河、玛朗河、龙岔河等属红河水系。

建水县位于低纬度地区,北回归线横穿南境,光照时间长,无霜期长,有效积温高,属南亚热带季风气候。

受季节和地形变化影响,呈现出夏季炎热多雨,冬季温和少雨的立体气候特征。

地区年平均气温19.8℃,年平均地温20.8℃,年平均相对温度72%,年平均日照时数2322小时,年平均降雨量805毫米。

c需求分析课程设计

c需求分析课程设计

c 需求分析课程设计一、教学目标本课程的教学目标是使学生掌握需求分析的基本概念、方法和工具,能够独立进行需求分析工作,培养学生沟通协作能力和解决问题的能力。

具体分为以下三个部分:1.知识目标:学生需要掌握需求分析的基本概念、方法、工具以及相关的理论基础。

2.技能目标:学生需要能够熟练地运用需求分析工具,独立进行需求分析,并能够撰写需求分析文档。

3.情感态度价值观目标:培养学生对需求分析工作的热爱和敬业精神,提高学生沟通协作能力,使学生在面对问题时能够积极主动地寻求解决方案。

二、教学内容本课程的教学内容主要包括需求分析的基本概念、方法和工具。

具体安排如下:1.需求分析的基本概念:介绍需求分析的定义、作用、分类等。

2.需求分析的方法:讲解需求收集、需求分析、需求规格说明书编写等方法。

3.需求分析的工具:介绍常用的需求分析工具,如用例图、活动图、时序图等。

4.需求分析的实践:通过案例分析,让学生了解需求分析在实际项目中的应用。

三、教学方法为了提高教学效果,本课程将采用多种教学方法相结合的方式进行教学。

具体方法如下:1.讲授法:讲解需求分析的基本概念、方法和工具。

2.案例分析法:分析实际项目中的需求分析案例,让学生了解需求分析的应用。

3.实验法:让学生通过实际操作,掌握需求分析的工具和技巧。

4.讨论法:鼓励学生积极参与课堂讨论,提高学生的沟通协作能力。

四、教学资源为了支持教学内容的传授和教学方法的实施,我们将准备以下教学资源:1.教材:选择一本与需求分析相关的权威教材作为主要教学资料。

2.参考书:提供一批需求分析相关的参考书籍,供学生课后自学。

3.多媒体资料:制作需求分析的PPT、视频等多媒体资料,丰富教学手段。

4.实验设备:准备计算机、投影仪等实验设备,为学生提供实践操作的机会。

五、教学评估为了全面、客观地评估学生的学习成果,我们将采取以下评估方式:1.平时表现:通过观察学生在课堂上的参与程度、提问回答等情况,评估学生的学习态度和理解能力。

课程设计2ask

课程设计2ask

课程设计2ask一、教学目标本课程的教学目标是让学生掌握学科的基本知识和技能,能够运用所学知识解决实际问题。

具体目标如下:1.知识目标:学生能够理解并掌握学科的基本概念、原理和方法,包括具体知识点1、具体知识点2等。

2.技能目标:学生能够运用所学知识进行技能1、技能2等,提高解决实际问题的能力。

3.情感态度价值观目标:学生通过本课程的学习,培养对学科的兴趣和热情,增强对科学探究的意识和能力,形成积极的科学态度和价值观。

二、教学内容根据教学目标,本课程的教学内容主要包括内容1、内容2等。

具体安排如下:1.内容1:通过讲解和案例分析,使学生理解概念1、概念2等。

2.内容2:通过实验和练习,使学生掌握技能1、技能2等。

三、教学方法为了实现教学目标,本课程将采用多种教学方法,包括讲授法、讨论法、案例分析法和实验法等。

具体应用如下:1.讲授法:用于讲解概念1、概念2等基本知识。

2.讨论法:通过小组讨论,引导学生深入思考问题1、问题2等。

3.案例分析法:通过分析实际案例,使学生掌握技能1、技能2等。

4.实验法:通过实验操作,培养学生的实践能力和科学探究精神。

四、教学资源为了支持教学内容和教学方法的实施,本课程将利用多种教学资源。

具体包括:1.教材:选用教材名称,作为学生学习的基本资料。

2.参考书:推荐参考书名称等,供学生拓展阅读。

3.多媒体资料:利用课件、视频等,丰富教学手段,提高学生的学习兴趣。

4.实验设备:准备实验器材,为学生提供实践操作的机会。

五、教学评估为了全面、客观地评估学生的学习成果,本课程将采用以下评估方式:1.平时表现:通过观察学生在课堂上的参与程度、提问回答等情况,评估其学习态度和理解能力。

2.作业:布置适量的作业,要求学生独立完成,以评估其对知识的掌握和运用能力。

3.考试:安排定期考试,测试学生对课程知识的全面理解和运用能力。

以上评估方式将结合平时表现、作业和考试等方面,全面反映学生的学习成果。

c课程设计90分

c课程设计90分

c课程设计90分一、教学目标本课程的教学目标是使学生掌握C语言的基本语法、数据结构和算法,培养学生具备基本的编程能力和良好的编程习惯。

具体分为以下三个部分:1.知识目标:(1)理解C语言的基本语法,包括变量、数据类型、运算符、表达式等;(2)掌握控制结构,包括条件语句、循环语句等;(3)熟悉函数的定义和调用,了解函数的参数传递和返回值;(4)了解数据结构的基本概念,包括数组、链表、栈和队列等;(5)理解算法的基本概念,掌握常用的排序和查找算法。

2.技能目标:(1)能够使用C语言编写简单的程序,解决实际问题;(2)具备良好的编程习惯,包括代码规范、注释规范等;(3)掌握调试程序的方法,能够定位并修复程序中的错误。

3.情感态度价值观目标:(1)培养学生对编程的兴趣,激发学生主动学习的动力;(2)培养学生团队合作的精神,提高学生沟通交流的能力;(3)培养学生勇于面对挑战,解决问题的信心和决心。

二、教学内容本课程的教学内容主要包括C语言的基本语法、数据结构和算法。

具体安排如下:1.第一章:C语言概述,介绍C语言的发展历程、特点和基本语法;2.第二章:数据类型和表达式,讲解C语言的数据类型、运算符和表达式;3.第三章:控制结构,包括条件语句、循环语句等;4.第四章:函数,讲解函数的定义、参数传递和返回值;5.第五章:数组和字符串,介绍数组的概念和字符串的处理方法;6.第六章:指针,讲解指针的概念和用法;7.第七章:链表,介绍链表的基本操作和应用;8.第八章:栈和队列,讲解栈和队列的原理及应用;9.第九章:算法,介绍常用的排序和查找算法。

三、教学方法本课程采用讲授法、讨论法、案例分析法和实验法等多种教学方法,以激发学生的学习兴趣和主动性。

1.讲授法:教师通过讲解C语言的基本语法、数据结构和算法,使学生掌握相关知识;2.讨论法:教师学生进行小组讨论,共同解决问题,提高学生的沟通能力;3.案例分析法:教师通过分析典型案例,使学生更好地理解C语言的应用;4.实验法:学生动手编写程序,验证所学知识,培养学生的实际操作能力。

崔健_课程设计说明书

崔健_课程设计说明书

计算机科学与技术教研室课程设计说明书(2015-2016学年第一学期)注:成绩均用百分制。

总成绩=平时成绩*20%+报告成绩*40%+演示与答辩成绩*40%设计题目:医生教育网络课堂1、课程设计的目的(1)更深入地理解和掌握Web系统开发技术这门课程中的有关基本概念,程序设计思想和方法。

(2)掌握系统分析设计、数据库设计、类的设计的使用;使学生充分了解Web应用程序的设计和开发的基本过程,掌握常用的Web开发技术,培养学生综合运用所学的知识去开发一个实用性网站的能力。

(3)锻炼从文献资料中获得知识的能力,提高学生从别人经验中找到解决问题的途径的能力,初步培养学生软件开发的意识和能力。

2、课程设计正文2.1系统分析2.1.1 需求与功能分析医生教育网络学堂网站是医院对外宣传的窗口,是医院的“商标”也是展示全体医师专业能力,加强对外联系,互相学习,共同发展的阵地,网站建设的目的是促进医生与医院共同发展。

在这个高度信息化的社会里,建立医院自己的学习网站是最直接的宣传手段。

我们将系统分为前台页面展示和后台管理两大模块,将使用对象为管理员并赋予最大权限。

此外,在开发过程中,我们利用JavaScript实现动态图片的展示,通过CSS结合HTML 的精心设计,在实现基本功能同时,尽力达到简约时尚、页面布局合理舒适,色彩清新的界面设计,提高网站的观赏性,让人耳目一新。

网站实现以下功能:(1)用户注册登陆;(2)课件管理;(3)会议管理;(4)反馈与调研;(5)个人管理2.1.2 可行性分析及开发环境网站主要使用Adobe Dreamweaver进行前台页面的设计,用MySQL进行数据库的编写,然后用eclipse环境使用JSP、JDBC技术来实现和后台数据库的对接,最后用Tomcat充当服务器进行执行配置调试,这都是比较成熟的技术,我们也掌握着这些技术,所以在技术上是完全可行的。

(1)Adobe Dreamweaver cs5简介Dreamweaver是Adobe 公司推出的可视化网页制作工具,它与Flash、Fireworks合在一起被称为网页制作三剑客,这三个软件相辅相承,是制作网页的最佳选择。

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1. 课程设计目的:《专业课程设计》是面向生物技术方向高年级学生的综合性课程。

目的是使学生进一步巩固加深所学的基础理论、基本技能和专业知识,使之系统化、综合化;培养学生独立工作、独立思考并运用已学的基本理论和知识解决实际问题的能力;培养学生的科学素质,提高学生的抽象思维能力、加强培养学生自己获取知识和更新知识的能力。

本课程通过应用生物信息学的方法,从公用数据库上收集自己所需的数据,并用计算机进行处理,从而获取自己所需要的信息。

独立于另外两个专业课设,此次课设主要应用生物信息学的方法,通过网络资源挖掘所需的核酸与蛋白质的秘密,完成所给任务。

2. 课程设计题目选择:2.1课设题目选择:此次课程设计包括两个方面(任选一个):为核酸和蛋白质。

前者为在人的基因组中,搜索可能的新基因。

后者为应用网络资源对所感兴趣蛋白质进行分析,分析其结构与功能关系或对一未知功能的蛋白质进行功能预测与分析。

蛋白质直接关系表达结果问题,研究意义重大。

分析蛋白质结构、功能及其关系是蛋白质组计划中的一个重要组成部分。

研究蛋白质结构,有助于了解蛋白质的作用,了解蛋白质如何行使其生物功能,认识蛋白质与蛋白质(或其它分子)之间的相互作用,这无论是对于生物学还是对于医学和药学,都是非常重要的。

对于未知功能或者新发现的蛋白质分子,通过结构分析,可以进行功能注释,指导设计进行功能确认的生物学实验。

通过分析蛋白质的结构,确认功能单位或者结构域,可以为遗传操作提供目标,为设计新的蛋白质或改造已有蛋白质提供可靠的依据,同时为新的药物分子设计提供合理的靶分子结构。

2.2 课设题目确定:上学期被选进福州大学生物工程研究所细胞组,承担对毕赤酵母发酵的PTD(TAT)-SOD蛋白分子即PS2蛋白分子性质的表征。

经过凝胶过滤层析技术和SDS-PAGE,糖蛋白的BSA染色,多糖电泳确定了PS2在分子结构特征上存在多聚体、和糖基化现象。

为此想以此课程设计为契机,对PS2蛋白分子进行生物信息学的分析进一步评价PS2蛋白结构和功能的关系。

本文借助从UnProt蛋白数据库中搜集到足够数量和不同物种来源Cu,Zn-SOD;运用生物信息学软件进行序列比对,和绘制进化树。

对所得结果进行分析。

然后用得到的保守序列作为出发序列搜索相关数据库,(例如PROSITE数据库),从而分析该序列的功能和结构信息,及功能和结构的关系,并对PS2蛋白分子进行基于一级结构的物理化学性质和生物化学性质、二级结构信息等进行预测。

3.PS2蛋白简介人铜,锌超氧化物歧化酶(hCuZn-SOD)是一种重要的胞内酶,对机体的氧化和抗氧化平衡起着至关重要的作用,此酶能清除超氧阴离子自由基,保护细胞免受损伤,因此SOD有非常广泛的应用前景,但是SOD是一种大分子物质,外源的野生型SOD很难跨膜进入细胞发挥其生物活性。

蛋白转导区域(PTD)的核心序列是段多肽片断,该多肽片断介导蛋白的转导及其在细胞内的定位。

本研究所巧妙地运用该多肽片断,构建毕赤酵母菌株将PTD与SOD联接,制备出PTD-SOD[4-5],即PS2活性蛋白。

3.1 TAT-PTD的发现人类免疫缺陷病病毒(HIV)表达反式激活蛋白TA T是一个与RNA 结合的核蛋白,为HIV感染早期所合成的小分子调节蛋白,能促进HIV基因表达,增加HIV病毒的复制和感染性。

1988年Green[56]和Frankel[57]首次报告了HIV-1TAT蛋白具有穿过生物膜的能力,全长86个氨基酸,具有3个功能结构域:其一是对于反式激活尤为重要的酸性N-端区域;其二是富含半胱氨酸的DNA结合区(22~37位氨基酸),带有一个锌指基元;其三为碱性区(包括第47~58位氨基酸),该功能区主要介导Tat蛋白发生细胞内在化。

1994年,Fawell et al[60].将这一理论衍生,他们指出将TA T的36个氨基酸与一个异源蛋白化学交联后可将此蛋白转导入细胞。

Vives[61]等对TAT通过细胞膜的转导作用进行了研究,发现该蛋白分子中一个富含碱性氨基酸、具有较多正电荷的多肽片段(TA T48-60)与TAT的跨膜转导有关。

随后,Dowdy[62]等通过蛋白或多聚肽与TA T短肽的融合改善Tat蛋白的跨膜递送,该短肽区域即Tat蛋白跨膜递送的核心序列(47~57残基):YGRKKRRQRRR,这11个残基富含带正电荷的碱性氨基酸:其中有6个精氨酸(Arg)、2个赖氨酸(Lys),简称TAT-PTD。

3.2 Cu,Zn-SOD简介Cu/Zn-SOD作为SOD结构上的第一族,是人们对于SOD结构研究的突破口,也是人们了解最多的一种SOD。

比较不同来源的Cu/Zn-SOD的氨基酸序列可以发现,它们的同源性都很高[6]。

有些氨基酸还很保守,在所有序列中都不变,这暗示着这些氨基酸与活性中心有关。

如图1-1牛红细胞Cu/Zn-SOD的结构所示:)的咪唑氮配位外,还与一每个铜原子除分别与4个组氨基酸残基(His44·46·61·118轴向水分子形成远距离的第五配位,Zn则与3个组氨酸残基(His)和1个61·69·78)配位。

Cu、Zn共同连接组氨酸61组成“咪唑桥”结构。

天冬氨酸(D81图1-1 牛红细胞Cu/Zn-SOD的结构示意图[7]3.课程设计报告内容3.1课设软件的介绍:3.1.1 UniProt3.1.2 SwissProt3.1.3 NCBI3.1.4 EBI3.1.5 CLC3.2 各物种各类Cu,Zn-SOD氨基酸序列的获得:进入UniProt数据库:/界面如下:输入:Superoxide dismutase [Cu-Zn]后逐步进行限定,包括对酶标号EC,片段fragment,交叉参考:cross-reference进行限定。

最终的检索词为:Superoxide dismutase [Cu-Zn] AND ec:1.15.1.1NOT chaperone AND fragment:no NOT database:pir NOT database:refseq NOT database:refseq NOT database:unigene。

运行输出界面如下:点击,进入下载页面:获得FASTA文件。

后将已知的PS2分子序列复制到FASTA文件的第一条序列。

以便一下分析。

文件格式如下:3.3搜索保守序列clustalw2在线分析比对:进入网站:/Tools/clustalw2/index.html运行,输出结果如下:其中可以下载比对结果文件:.aln,.dnd/点击进入界面:同源的分数比较:一般70分以上的可以认定为在同一物种中,因此一般选用的分数为30分以上70分以下。

这样分析出的结果既可保证其物种间的基本联系,还可使所分析的不是同一物种,但是如果个数很多,这种方法就不适用了。

此次比对得分在30-70分的结果如下:3.3 保守序列结构:3.4一级结构的分析:由上述详细的比对可以得出一个共同点:出现组氨酸(H),甘氨酸(G)的地方都比较保守。

一般情况下:出现组氨酸时一般是位金属离子提供配位点,或者为活性中心。

而出现甘氨酸时一般预示着存在着β折叠片二级结构。

通过比对得出保守结构(一般保守结构大于8个AA):148-161位置:TGNAGSRLACGKIG3.1.4.2 二级结构分析:3.1.4.3 三级结构分析:预测工具:Swiss-Model(由SwissProt提供的目前最著名的蛋白质三级结构预测服务)预测思想:同源比较建模 (homology comparatvie modeling)显示及分析工具:RasMol分析过程如下:首先将PS2分子序列提交给SwissModel Automatic Modelling Mode/workspace/index.php?func=modelling_simple1界面如下:输出结果如下:由上述结果可以得出:直接生成三维结构:随后进行3D-Blast比对结果如下:3.1.5 理化性质预测:3.1.5.1 分子量、等电点及化学组成:采用SwissProt在线预测软件/tools/protparam.html 界面如下:输出预测结果如下:3.1.5.2 酶切和断裂位点预测:3.1.5.3 跨膜预测:采用SwissProt在线跨膜螺旋预测软件TMHMM Server v. 2.0 http://www.cbs.dtu.dk/services/TMHMM-2.0/进入界面如下:请输入氨基酸单字母序列输出结果如下:根据上述预测结果PS2蛋白并不存在跨膜结构。

3.1.6.2 SignalP 3.0 Server采用SwissProt在线信号肽预测软件SignalP 3.0 Server http://www.cbs.dtu.dk/services/SignalP/进入界面如下:请输入氨基酸单字母序列输出结果如下:说明:S - 评分的信号肽预测是根据每个氨基酸所处提交序列的位置做出评分,高分数表明了相应的氨基酸是一个信号肽,低分数表明氨基酸是一个成熟蛋白。

C- 评分是``裂解位点''评分。

对于每个职位提出的序列,一架C -评分报告,其中只应在显着高的裂解位点。

当裂解位点的位置是指由一个单一号码第一个残留的成熟蛋白,如裂解位点的氨基酸之间的对应26-27号这说明种成熟的蛋白质始于(并包括)的27号氨基酸。

由上述软件预测得出:PS2蛋白存在信号肽,并且不是分泌蛋白。

在与实际PS2蛋白的性质不同,因为PS2本身就是一个成熟蛋白,并能在毕赤酵母中分泌表达。

可能原因是:在PS2构建的毕赤酵母上就存在信号肽,并在酵母体系中分泌表达。

3.1.6.3 预测真核蛋白的亚细胞定位。

3.1.6.4 LipoP 1.0 Server LipoP 1.0 Server用来预测脂蛋白,也用来区分脂蛋白信号肽、其他信号肽和格兰氏阴性菌N端膜螺旋。

3.1.7.1 NetPhos 2.0 ServerNetPhos 2.0 Server预测真核蛋白普通磷酸化位点,主要对Ser,Thr,Tyr位点进入界面:输出结果如下:请输入氨基酸单字母序列3.1.7.2 NetPhosK 1.0 ServerNetPhosK 1.0 Server预测真核蛋白激酶特异磷酸化位点,蛋白激酶如PKA, PKC, PKG, CKII, Cdc2, CaM-II, ATM, DNA PK, Cdk5, p38 MAPK, GSK3, CKI, PKB, RSK, INSR, EGFR和Src。

进入界面如下:请输入氨基酸单字母序列输出结果:3.1.7.3 NetNGlyc 1.0 ServerDictyOGlyc 1.1 Server预测人体蛋白N-糖基化位点在线软件进入界面如下:请输入氨基酸单字母序列输出结果如下:由上面可以看出:PS2蛋白序列中的确存在一个N-糖基化位点。

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