微生物基因组研究进展及意义
病原微生物基因组组装与注释研究
病原微生物基因组组装与注释研究病原微生物是引起人类疾病的主要因素之一。
了解病原微生物的基因组组装与注释对于深入研究其致病机制、寻找新的治疗方法以及预防疾病具有重要意义。
本文将探讨病原微生物基因组组装与注释的研究进展和意义。
病原微生物基因组组装是指将测序得到的碱基序列按照一定的规则拼接成连续的基因组序列。
这一步骤对于后续的基因组注释非常重要，因为只有获得完整的基因组序列才能准确地预测基因的位置和功能。
目前，常用的基因组组装方法主要有两种：de novo组装和参考基因组组装。
de novo组装是指在没有参考基因组序列的情况下，通过将测序得到的短读段按照重叠关系拼接成较长的连续序列。
这种方法适用于没有已知基因组序列的微生物。
然而，由于病原微生物基因组通常具有较高的GC含量和重复序列，de novo组装存在一定的挑战。
因此，研究人员通常会使用参考基因组组装方法。
参考基因组组装是指将测序得到的短读段与已知基因组序列进行比对，根据比对结果来拼接基因组序列。
这种方法能够提高组装的准确性和连续性，特别适用于已有参考基因组序列的微生物。
然而，由于病原微生物的基因组通常具有一定的变异性，参考基因组组装方法可能会导致一些漏掉的变异。
基因组组装完成后，接下来的步骤是基因组注释。
基因组注释是指对基因组序列进行功能预测和注释，包括基因的位置、编码蛋白质的功能以及非编码RNA等。
目前，基因组注释主要依赖于比对数据库和基于模型的注释方法。
比对数据库是指将基因组序列与已知的蛋白质数据库进行比对，根据比对结果来预测基因的位置和功能。
这种方法能够快速地进行基因组注释，但是对于新的基因或者未知功能的基因可能存在一定的局限性。
基于模型的注释方法是指通过构建基因模型，根据基因的结构和功能特征来预测基因的位置和功能。
这种方法能够更准确地预测基因的位置和功能，特别适用于新的基因或者未知功能的基因。
病原微生物基因组组装与注释的研究对于理解病原微生物的致病机制具有重要意义。
年度总结微生物(3篇)
第1篇一、引言微生物作为地球上最基本的生物群体，与人类生活息息相关。
在过去的这一年里，微生物领域的研究取得了显著成果，不仅加深了我们对微生物的认识，也为人类健康、农业、环境保护等领域提供了新的思路。
本文将对微生物领域的研究进展进行总结，并对未来发展趋势进行展望。
二、微生物领域研究进展1. 微生物基因组学微生物基因组学是微生物领域研究的热点之一。
近年来，随着测序技术的快速发展，微生物基因组数据量呈指数级增长。
以下是一些重要进展：（1）微生物基因组注释：通过生物信息学方法，对微生物基因组进行注释，揭示其基因功能、代谢途径等信息。
（2）微生物基因岛研究：发现微生物基因岛在基因转移、适应性进化等方面发挥重要作用。
（3）微生物基因组进化：通过比较不同微生物基因组，研究其进化历程和适应性进化机制。
2. 微生物与人类健康微生物与人类健康密切相关。
以下是一些微生物领域在人类健康方面的研究进展：（1）肠道菌群与疾病：研究发现，肠道菌群与多种疾病的发生、发展密切相关，如肥胖、糖尿病、心血管疾病等。
（2）微生物与抗生素耐药性：随着抗生素的广泛应用，细菌耐药性逐渐增强。
研究微生物耐药机制，为开发新型抗生素提供依据。
（3）微生物与传染病：研究微生物与传染病的相互作用，有助于开发新型疫苗和治疗方法。
3. 微生物与农业微生物在农业领域发挥着重要作用。
以下是一些微生物领域在农业方面的研究进展：（1）微生物肥料：利用微生物促进植物生长，提高农作物产量和品质。
（2）生物防治：利用微生物抑制害虫和病原菌，减少化学农药的使用。
（3）微生物酶制剂：利用微生物生产酶制剂，提高工业生产效率。
4. 微生物与环境保护微生物在环境保护方面具有重要意义。
以下是一些微生物领域在环境保护方面的研究进展：（1）生物修复：利用微生物降解污染物，净化环境。
（2）生物降解：研究微生物降解塑料、有机物等，减少环境污染。
（3）微生物与碳循环：研究微生物在碳循环中的作用，为应对气候变化提供科学依据。
微生物学研究的最新进展及其应用
微生物学研究的最新进展及其应用微生物学是研究微生物及其生态、生理、遗传学、生物化学及其与疾病、卫生、农业、环境、工业、能源等的科学。
随着科技的发展，微生物学的研究也在不断深入。
最新进展1. CRISPR-Cas9技术CRISPR-Cas9技术是指利用CRISPR-Cas系统进行基因编辑的方法。
这种技术能够将DNA序列切除或替换成新的DNA序列，导致基因组的特定部分发生变化。
CRISPR-Cas9技术被广泛应用于微生物学研究中，如构建抗药性菌株、探究微生物代谢途径等。
2. 基因组学基因组学是指对生物体的基因组进行全面研究。
近年来，基因组学在微生物学中的应用日益广泛。
通过对微生物基因组的分析，可以了解微生物代谢、毒力、抗药性等方面的信息，从而开展微生物防治、抗菌药研发等。
3. 合成生物学合成生物学是指将生命体系的分子元件进行组合和重新编程，为生命进程设计新的组织、细胞和生物功能。
在微生物学中，合成生物学被广泛应用于微生物代谢、细胞生长、生物制品生产等领域，为微生物工业化生产开辟了新途径。
应用1. 小分子化合物开发小分子化合物是指分子量小于500的化合物。
微生物学可用于小分子化合物的开发。
利用微生物合成反应途径，可生产大量的小分子化合物，如药物、抗生素等。
2. 食品加工微生物在食品加工中发挥着重要作用。
酸奶、豆腐、面包、啤酒等都是利用微生物发酵而制成的。
微生物学研究可为食品加工提供新的技术支持，如开发新的微生物种类，制造新的发酵食品等。
3. 环境治理微生物在环境治理领域也具有重要作用。
微生物可以降解污染物，改善水质和土壤质量，修复受污染的环境等。
微生物学研究为环境治理提供了一系列新的治理方法和技术手段。
4. 医学疾病微生物学在医学疾病方面具有广泛的应用。
利用微生物学技术，可以开发新的抗生素，治疗感染性疾病等。
同时，微生物学研究还可以了解致病菌的致病机理和病原菌抗药性的原因，为治疗和预防疾病提供新的思路和方法。
病原微生物的新研究进展
病原微生物的新研究进展研究者们对病原微生物进行的新近研究，深化了我们对病原微生物的认识，为预防和治疗传染病带来了新的希望。
本文将就病原微生物研究的最新进展进行探讨，并介绍其对传染病防控的意义。
一、基因编辑技术的应用随着基因编辑技术的飞速发展，研究者们能够更深入地了解病原微生物的基因组，以及病原微生物与宿主之间的相互作用。
基因编辑技术的应用不仅可以帮助科学家们揭示病原微生物的致病机制，同时也为开发高效的治疗手段提供了新的思路。
例如，利用基因编辑技术，科学家们成功地改造了某些细菌的基因组，使其失去致病能力，从而探索了新的治疗传染病的途径。
二、新型抗生素的研发随着多年来过度使用抗生素，细菌对传统抗生素的抵抗性也逐渐增强，这给临床治疗带来了巨大的挑战。
然而，最近的研究表明，一些新型抗生素的出现对于解决这一问题具有重要意义。
科学家们通过开展大规模的病原微生物抗性基因研究，发现了一些潜在的抗生素靶点，并利用计算机模拟技术设计出了一批新型抗生素。
这些新药物具有更好的抗菌活性，有望在临床上取得更好的疗效。
三、病原微生物的群体行为研究病原微生物不再仅仅被视为单个单细胞微生物，科学家们发现它们在形成感染过程中展示出了一定的群体行为。
例如，有些细菌会形成生物膜来保护自己免受宿主免疫系统的攻击。
此外，一些研究还揭示了细菌之间通过化学信号相互交流的现象。
这些群体行为的研究为我们理解病原微生物的感染机制提供了新的视角，也为研发新型抗菌药物提供了新的思路。
四、病原微生物与宿主免疫的相互作用病原微生物与宿主免疫系统的相互作用是决定感染病程和结果的重要因素。
最近的研究发现，病原微生物在感染宿主时，可以通过多种方式来干扰宿主免疫系统的正常功能。
这些干扰机制涉及到病原微生物表面的一些分子结构，如细菌的外膜蛋白和多糖结构等。
对这些分子结构的深入了解，可以帮助我们发展出针对性的疫苗和免疫治疗策略，提高人们对病原微生物的抵抗力。
综上所述，病原微生物的新研究进展极大地丰富了我们对于病原微生物的认识，为疾病的预防和治疗带来了新的希望。
微生物的基因组学
微生物的基因组学：探究微小世界的奥秘微生物是我们周围无处不在的生物体，其中包括细菌、真菌、病毒等等。
它们既是人类的宝库，也是人类的健康威胁。
则是研究微生物基因组的科学，通过对微生物基因序列和表达的研究，揭示出微生物中各种基因的功能和相互关系，以及微生物与环境的互动关系。
本文将深入探究微生物基因组学这一领域的研究内容和应用，以期让读者更好地了解这一领域的研究进展和意义。
一、基因组学的基本概念基因组学是指对生命体系中基因组结构、组成、功能及相互关系等方面进行研究的学科。
它的出现起源于对基因的研究，随着生物信息技术的快速发展，基因组学成为了一个独立的学科，主要研究的是基因组结构、功能、演化和调节等方面。
基因组学既可以从宏观角度探究一个生物体所有基因的全貌，也可以从微观角度研究一个特定基因的结构和功能，因此在许多重要领域得到广泛应用。
二、微生物基因组学的研究内容微生物基因组学主要研究微生物的基因组结构、基因功能以及基因调控等方面。
下面我们将详细探讨这些内容。
1. 基因组结构研究微生物基因组的研究是从细胞的核酸分子开始的，通过分析细胞中的核酸分子，可以了解微生物的基因组结构和组成，从而探讨微生物的基因表达模式和调节机理。
微生物基因组的研究首先要进行测序，目前主要有两种测序方法：Sanger测序和高通量测序（HTP）。
Sanger测序是目前最传统的DNA序列测序技术，它能够测出长达1000bp的DNA序列。
而HTP测序由于技术的不断发展，能够测出14亿bp以上的DNA序列，因此应用越来越广泛。
2. 基因功能研究微生物基因功能的研究是通过基因表达分析、生物信息学分析等方法来了解基因的功能及相互关系。
随着生物信息学技术的不断发展，基因功能预测也变得越来越准确。
通过这些方法，可以对微生物中众多基因的功能进行深入研究，并对这些基因在微生物生长、代谢以及对环境应变等方面的作用做出解释。
3. 基因调节研究基因调节是指在不同的生物学条件下，通过某些因素对基因表达水平的调整，为基因表达提供信号。
微生物学的研究进展
微生物学的研究进展微生物学是研究微生物界生命活动及其与其他生物以及环境的相互作用的学科。
自然界中微生物的种类极为繁多，包括了细菌、病毒、真菌、原生动物等。
微生物在生物界中具有非常重要的作用，例如产生氧气、帮助植物吸收营养、分解废物等。
与此同时，微生物还能够导致许多疾病，造成生态系统的破坏等问题。
因此，微生物学的研究具有非常重要的意义。
在科技的发展下，越来越多的微生物被发现，微生物学研究的内容也越来越丰富。
下面将从以下三个方面着重介绍微生物学的研究进展。
微生物的基因组学研究近年来，随着高通量测序技术的发展，微生物的基因组学研究取得了巨大的进展。
这项技术能够快速、准确地测序大量的DNA或RNA序列，尤其是第二代高通量测序技术，其测序速度更快、精度更高。
通过测序技术，人们发现许多微生物中存在着大量的基因，在这些基因中有许多还没有被发现、研究。
利用基因组学技术，我们可以预测微生物的一些特性，比如说它们能否合成某些化合物、遇到某些环境条件会发生哪些变化等。
这有望为人类解决一些疑难问题提供新的思路。
微生物的多样性研究微生物的种类非常多，在各种环境中都能找到它们的身影。
科学家对各种微生物进行系统的分类学研究，以便更好地理解微生物的多样性和分类规律。
随着技术的进步，科学家们开始重视微生物界中那些特殊的、难以培养的微生物。
这些微生物在地球上的生存环境中扮演着至关重要的角色，但由于难以培养，我们对它们的了解很有限。
为了更好地了解这些微生物，科学家在微生物分离、培养以及分类方面进行研究，提供了一种新的思路。
微生物的生态学研究微生物在生态系统中具有非常重要的作用。
科学家通过监测环境中的微生物群落，了解了它们的功能在自然界中的作用，并提供了一些新对策。
微生物能够分解废物，对污染环境的处理具有火山重大的贡献。
在许多工业污水处理过程中，微生物都发挥着重要的作用。
同时，微生物对植物的生长和其他动物的生命也具有重要的影响。
总结微生物学是一门综合性的学科，而且也是研究的热点领域。
微生物功能基因组学的发展及其应用前景
微生物功能基因组学的发展及其应用前景微生物是地球上最古老、最多样化、最广泛存在的组织之一，其存在形态编码了地球历史的变迁和自然环境的演变。
微生物功能基因组学（Microbial Functional Genomics）是通过对微生物基因组的全面筛查和功能注释，从而了解微生物在不同环境和条件下的适应策略和生存机制，以及相关基因和调节元件的功能及其影响机制的科学。
微生物功能基因组学的发展在基因组科学技术和计算机软件等方面的迅速发展推动了微生物功能基因组学的不断深入。
传统的微生物分类学几乎只能靠形态学观察，很难理解微生物的生态和功能。
然而，通过对微生物基因组的测序和解析，可以了解微生物的全基因组结构，包括编码蛋白质序列的基因、RNA等序列和基因调控元件等。
同时，随着基因序列数据银行的不断增加和计算机硬件和软件的不断更新，可以实现全基因组的比较、甄别和分类。
研究人员可以分析所研究微生物的基因结构、功能特征、调控途径和互动关系等，以解析细胞代谢和能量转化的分子机制，并挖掘与宿主，环境和人类健康相关的生物学规律。
微生物功能基因组学的应用前景1. 广泛应用于工业生产从工业上来说，微生物功能基因组学的应用尤为广泛。
以酿造业为例，利用功能基因组学可以针对酿造过程中酒体、风味、口感和香气等特性关键基因进行筛选和功能注释，从而开展新型酒精饮品的研发。
此外，对于微生物的多组学信息长时间的积累和筛选，已经在微生物代谢和产物生物技术等领域取得了重大突破，包括利用工业微生物制造抗生素、发酵剂、样品分离索赔、氢气等。
2. 辅助医学成果显著以医学上来说，微生物功能基因组学为微生物医学研究和治疗的发展提供了有力支持。
在传染病管理和预防中，可以通过对某些感染性病菌的基因组完全解析，精准消灭病菌并控制病情的传播。
同时，利用系统生物医学学科的理论和技术，深度挖掘和分析代谢组、蛋白组、基因组等多领域的数据，可以推断出病原生物感染过程中的致病机制，为寻求有效的治疗方法和研制新型制剂提供了理论基础。
人类微生物组计划及其研究进展
人类微生物组计划及其研究进展随着科技的快速发展和人们对健康的关注不断加深，微生物组研究逐渐成为一个备受重视的领域。
近年来，人类微生物组计划的推出，进一步加速了该领域的研究进程。
本文将介绍人类微生物组计划的背景和意义，以及其研究进展和应用前景。
一、人类微生物组计划的背景和意义人体微生物组是指寄生在人体中的细菌、真菌、病毒以及其他微生物的总称，因为数量巨大而成为人体共同体的一部分。
微生物群落与人的健康密切相关，通过与人体相互作用，影响人体健康、免疫、代谢等多个方面。
人类微生物组研究随之逐渐崛起，其重要性日益显现。
2007年，美国国家卫生研究院正式推出了人类微生物组计划，力求全面掌握人体上百万种细菌、真菌、病毒和其他微生物物种的组成及功能。
该计划得到了全球数十个国家和地区的支持，被誉为微生物群落研究领域的“人类基因组计划”。
人类微生物组计划的推出，为精准医疗和个性化治疗提供了重要的科学基础。
其重要意义在于：一方面，通过深入研究微生物组的结构和功能，能够更清晰和完整地认识人体的生物学特征；另一方面，微生物组变化与许多疾病有关，比如炎症性肠病、肥胖症、糖尿病等，因此，学习人类微生物组的调控机理和变化规律，对于分析人体变化和疾病的机理、预测疾病的发生以及制定个性化治疗方案都具有重要的指导意义。
二、人类微生物组计划的研究进展人类微生物组计划的推出，大大推动了微生物组研究的深入。
目前，微生物组学在国际上得到越来越广泛的关注，学术界不断推出了一系列关于微生物群落组成、功能以及它们与人类疾病关联性等方面的重要研究。
1. 人类微生物组组成人类微生物组中大约有1万多种细菌、1万种真菌和数百种病毒，涉及到人体皮肤、口腔、胃肠、生殖系统等多个部位。
不同肠系微生物群落的种类和数量差异较大，这是人体微生物组呈现个体差异最明显的部分。
此外，人体微生物组随着外部环境、年龄、饮食等因素的变化而发生更改。
近年来，国际上的微生物组学研究团队通过对微生物基因组进行了大规模测序，最终得出了人类微生物组的基本组成，包括以古菌为代表的三种原核生物和细菌双歧杆菌、嗜盐菌、肠球菌、厌氧菌等。
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微生物基因组研究进展及其意义近年来，病原微生物的基因组研究取得了飞速的进展。
所谓基因组研究是指对微生物的全基因进行核苷酸测序，在了解全基因的结构基础上，研究各个基因单独或数个基因间相互作用的功能。
由于过去人们大多从表型分析入手，寻找已知功能的编码基因，实际只了解微生物中极少数的基因，如链球菌的链激酶基因、结核杆菌编码的热休克蛋白基因等。
还有大量未知基因未被发现。
通过基因组研究，则从根本上揭示了微生物的全部基因，不仅可发现新的基因，还可发现新的基因间相互作用、新的调控因子等。
这一研究将使人类从更高层次上掌握病原微生物的致病机制及其规律，从而得以发展新的诊断、预防及治疗微生物感染的制剂、疫苗及药品。
此外，新发现的微生物酶及蛋白还可能有在工农业生产上的应用价值。
因此，全球除已完成了70余株覆盖重要病毒科的病毒代表株全基因组研究外，据美国基因组研究所（The Institute for Genomic Research, TIGR）报道，目前已完成了19种微生物基因组测序，其中11种与人类及疾病相关（嗜血流感杆菌，生殖道支原体，肺炎支原体，幽门螺杆菌，枯草杆菌，伯氏疏螺旋体，结核杆菌，梅毒螺旋体，沙眼衣原体，普氏立克次体）。
另外，还有40余种微生物已被登记正在进行测序，预计在1999～2000年完成〔1〕。
病毒基因组研究进展病毒因其基因组小，是进行基因组研究最早的生物体。
早在1977年已完成了噬菌体DNA的全基因测序。
存在于脊髓灰质炎疫苗中的SV40，是最早完成全基因测序的与疾病相关的病毒；此后，许多病毒均已完成了全基因测序，并根据序列的开放阅读框架（ORF）对编码蛋白进行了推导。
已对相当一些病毒蛋白进行了重组表达，还对一些病毒基因编码的调控序列进行了研究。
除一般大小的病毒已完成了基因组测序，对大基因组病毒，疱疹病毒科，如水痘病毒基因组为0.125Mb(Mega-basepair,兆碱基对)〔2〕。
巨细胞病毒，基因组为0.229Mb〔3〕。
我国已对痘苗病毒天坛株（约0.2Mb）进行了全基因测序，发现与国外的痘苗毒株序列有明显的差异〔4〕。
我国还对甲、乙、丙、丁、戊、庚型肝炎病毒进行了国内毒株的全基因测序。
近来还对国内2株发现的虫媒病毒毒株完成了全基因测序。
我国从不同来源的标本中发现了不少乙肝病毒变异株，有的具有特殊的生物学特性〔5〕。
对病毒基因中调控因子的分析，发现了与乙肝病毒增强子作用的新细胞核因子〔6〕。
因此，目前对病毒的基因组研究已进入了后基因组阶段，即从全基因水平研究病毒的生物学功能，同时发现新的基因功能。
对于医学病毒学当前主要方向是研究病毒基因组中与致病及诱生免疫应答相关的基因，从而揭示和解决迄今尚未解决的问题，以达到控制或消灭一些重要病毒感染的目的。
建议目前可进行后基因组研究的领域为：1．病毒持续性感染：基因组中与持续性感染相关的基因，基因变异或调控因子研究。
已报道的乙肝病毒的前核心基因出现终止密码突变，可逃逸机体对E抗原的免疫应答，有利于病毒持续感染〔7〕。
2．病毒与肿瘤的关系：已知EB病毒、人乳头状瘤病毒、乙肝病毒等均与肿瘤相关。
对这些病毒的基因组或基因变异研究，有可能揭示部分致瘤的机理，如最近报道EB病毒LMP-1基因羧基端缺失30个碱基对，可能具有更高的致癌性〔8〕。
3．病毒变异株或新出现毒株的致病性改变：如近来发现肺出血性汉坦病毒〔9〕，对人致病的H5禽流感病毒以及复制性特别强的乙肝毒株〔10〕等，对嗜性改变的巨细胞病毒〔11〕从基因水平进行了研究。
4．病毒编码复制酶基因及其调控的研究：有些病毒具有独特的复制酶，如对人免疫缺陷病毒酶的研究导致开发出有效的抗病毒制剂。
还有一些病毒（如丙型肝炎病毒）复制酶的编码基因虽已明确，但未能大量在体外表达，而且对这些酶在细胞内病毒复制中所起的作用也不清楚，延误了抗病毒制剂的开发，应抓紧进行研究。
5．病毒受体的研究：已知病毒受体多数是复合型，近来发现人免疫缺陷型病毒的受体除CD4外还有副受体〔12〕。
受体是病毒入侵细胞的第一关，通过全基因组研究将更有利于发现复合的病毒受体。
综上所述，本世纪后期已从基因组水平研究病毒的功能〔13〕，因此，我们应注意将病毒基因的研究重点转移到研究病毒基因与细胞的相互作用中来，以开辟对病毒致病机理研究的广阔天地。
细菌基因组研究进展广义的细菌包括细菌、衣原体、支原体、立克次体、螺旋体及放线菌，因此细菌的基因组研究也包括这些微生物。
除放线菌外，细菌基因组大小为1至数个Mb。
目前正在研究测序的细菌已超过40余种。
与致病相关的主要细菌、真菌及寄生虫，参见表1。
表1 正在进行全基因组测序的主要细菌、真菌与寄生虫〔1，14〕1．细菌全基因组测序的基本方法由于细菌基因组一般在数百个kb至数个Mb，快速测序的策略用经典鸟枪法（shot gun）建立基因文库，然后随机克隆测序。
第一个完成全基因测序的嗜血流感杆菌就是用此法完成的。
鸟枪法的基本步骤为先将细菌的染色DNA机械地随机切割成一定相对分子质量范围的片段，分别构建大小两套文库。
小片段（1～2kb）经末端修补处理后克隆入如pUC18质粒载体内；大片段（15～20kb）克隆入λ噬菌体载体中，然后进行大规模测序。
以后则需进行序列的缺口填补。
缺口填补是关键步骤，一般需用几种方法相互组合才能完成，花费的时间及精力很多。
能否完成缺口填补有时会成为完成全基因组测序的关键。
获得全基因组的资料后，还要利用计算机软件进行数据分析，推测ORF是否为真实的蛋白编码序列，检查功能位点，分析共有序列或特征序列（启动子，信号肽，保守基序conserved motifs）等。
如不是私人公司支持的研究，全基因组的研究资料将在杂志或互联网络上发表，供科学界参考和使用〔15〕。
2．细菌基因组研究所提供的机遇和挑战目前，微生物界正面临在下一世纪中如何发展的严峻问题。
在20世纪微生物学科为生命科学及人类的健康作出了卓越的贡献。
全世界唯一被消灭的天花，痘苗的发展及应用起了关键作用。
由于微生物基因组较小，将会超过其它生物更快地完成基因组的结构与功能分析，获得的信息将会首先被应用于药物、疫苗产品的开发和疾病的防治。
例如最近对2株不同的幽门螺杆菌基因组分析和对比，发现1994年自美国分离的菌株199与1987年自英国分离的菌株26695，仅有（6～7）％的基因结构差异。
这些不同基因的半数集中在一个高变区中。
曾有学者认为，幽门螺杆菌可引起不同临床疾病但也可对人有利，其机理可能与菌的基因结构相关。
目前的结果揭示应重点研究这些菌株特异区基因，同时应研究与定居基因表达相关的序列，此外还应考虑过去被忽视的机体因素在幽门螺杆菌致病中的地位〔16〕。
通过对比幽门螺杆菌和最近完成全基因测序的空肠弯曲菌，发现两种菌仅有17％不同的基因序列。
其中，幽门螺杆菌有独特的基因使之能在胃酸存在的条件下生存并分解尿素。
弯曲菌则比螺杆菌有2倍多的起调控作用的基因。
这些基因可能使弯曲菌能适应多种环境，如人肠腔、鸟肠道、牛奶中。
因弯曲菌能在外环境中生存，在美国去年引起的腹泻患者达30万人〔17〕。
又如至今未能在体外培养的梅毒螺旋体基因组为1 138 006bp，其毒力因子由一个12个潜在的膜蛋白家族和数个可能的溶血素组成。
对比梅毒与引起Lyme病的螺旋体基因组，也发现了致病性的诸多基因〔18〕。
结核杆菌基因组的分析也已完成，含4 411 529 bp，编码约4 000个基因。
发现该菌有大量基因是编码脂类合成与分解酶，发现2个富含甘氨酸的新家族，可能是引起该抗原变异的来源〔19〕。
即使尚未完成全基因组分析，国外已对肺炎链球菌、肠球菌和乳球菌的关键基因序列进行了开发研究〔20〕。
最值得我们重视的是，这是个新领域，是可以进行创新研究的高起点。
3．如何迎接挑战过去我国微生物界的老一代专家曾在学术上作出过卓越贡献。
建国以来老中青学者们在反细菌战、发展疫苗、建立诊断试剂等方面，为控制传染性疾病获得了大量成果。
因此开展微生物基因组研究具有较强的实力。
建议采取以下路线：（1）选择我国特有的或对发展中国家影响大的微生物，进行基因组测序。
由于我国经济实力有限，只宜选择少数微生物进行。
尽量选择国外尚未进行过的微生物为对象。
通过这项研究，可使我国微生物界有少数骨干掌握细菌基因组研究的策略和技术全过程，有利于今后基因组功能研究的开展。
（2）对于已公布的基因组要及时掌握，根据我国的需要进行序列分析，选择好有限目标对几种细菌作基因功能研究。
应注意在基因功能研究中，学习与借鉴病毒基因功能研究的已有经验。
微生物学家不仅要将分子水平研究与细菌的生物学特性互相联系，还要联系临床及流行病学科、药物学科、生化学科和免疫学科。
此外还需要建立适用的细胞及动物模型，以保证基因研究有后劲。
（3）加强微生物界学者在细胞生物学、生物信息学以及生物大分子学方面的知识更新，以适应微生物学科将面临的革命性变化。
估计今后的微生物诊断、治疗和预防都会有所改变，及早作好准备方可立于不败之地。
编者评述：科学家们预言21世纪在自然科学领域中，生命科学仍占主要地位。
重点将是研究人类基因组，深入研究基因功能。
微生物的基因组研究较之人类基因组研究要简单一些，但由于微生物种群繁多，搞清其基因组功能亦非易事。
20世纪70年代国外已开展了这方面工作，这几年进展很快，在开展基因核苷酸序列研究中，我国也有不少结果在国际基因库登录。
进一步将开展研究其功能。
本文概括地介绍了微生物基因组的研究进展，特别是文章最后部分提出今后我国开展微生物基因组研究路线的建议，指出研究不仅要与国际研究接轨，更重要的是结合我国实际情况有所创新。
微生物学科的发展将面临革命化的变革，应及早有所认识。
闻玉梅教授的这篇文章给了我们启示。