str嵌合率报告解读
细胞str鉴定报告
细胞str鉴定报告细胞STR鉴定报告概述细胞STR（Short Tandem Repeat）鉴定是一种常用的分子生物学技术，可以用于确定细胞系的身份和纯度。
本报告旨在介绍细胞STR鉴定的原理、方法、数据分析和结果解释。
原理STR是指短串联重复序列，即由2-6个碱基组成的重复序列。
在人类基因组中，存在许多这样的STR位点，并且不同个体之间的STR位点序列也存在差异。
利用PCR扩增这些位点，可以得到一个由不同长度的DNA片段组成的电泳图谱，称为STR分型图谱。
比较不同样本之间的分型图谱可以确定它们是否来自同一来源。
方法1. 提取DNA：将待检测细胞系中的DNA提取出来，并通过比色法或荧光法测量其浓度和纯度。
2. PCR扩增：选取一组标准化的STR位点进行PCR扩增，通常包括16个核心位点和1个性别鉴定位点。
PCR反应体系包括模板DNA、引物、dNTPs、Taq聚合酶等成分。
3. 电泳分离：将PCR产物通过聚丙烯酰胺凝胶电泳分离，并在荧光染料或银染剂下可视化。
4. 数据分析：将样本的STR分型图谱与数据库中的参考样本进行比对，确定其身份和纯度。
常用的数据库包括ATCC、DSMZ、JCRB等。
结果解释细胞STR鉴定结果通常以一个由数字和字母组成的序列来表示，每个数字代表一个STR位点上的长度，字母代表该位点上的等位基因。
例如，“13, 14 / 12, 13”表示在D13S317位点上，该样本有13个重复单位长的等位基因和14个重复单位长的等位基因；在D7S820位点上，该样本有12个重复单位长的等位基因和13个重复单位长的等位基因。
根据STR分型图谱之间的相似程度可以判断不同细胞系之间是否存在交叉污染或混合污染。
如果两个细胞系存在共同点，则它们很可能来自同一来源；如果两个细胞系完全不同，则它们来自不同来源；如果两个细胞系存在一定程度的相似性，则需要进一步进行确认和排除可能存在的污染情况。
结论通过对待检测细胞系进行STR鉴定，可以确定其身份和纯度，并且排除交叉污染和混合污染的可能性。
STR-PCR半定量检测嵌合体方法在异基因造血干细胞移植中的应用
STR-PCR半定量检测嵌合体方法在异基因造血干细胞移植中的应用[摘要] 目的:应用短串联重复序列-聚合酶链反应(STR-PCR)半定量方法检测异基因造血干细胞移植后供者细胞比例并探讨其临床意义。
方法：给30例接受移植的患者行移植后嵌合体检测,采集外周血提取DNA,对9个STR位点行聚合酶链反应扩增,扩增完成后行聚丙烯酰胺凝胶电泳及硝酸银染色显影,再计算嵌合率。
结果：30例患者均检测到供者细胞,24例达到完全嵌合(CC),6例形成混合造血(MC)。
在移植后14 d,稳定植入的患者多数表现为CC。
CC组的aGVHD发生率高于MC组,7例患者在复发前检测到嵌合率(donor cell,DC)下降,经相应免疫治疗后有3例达到CC。
结论：监测异基因造血干细胞移植后嵌合率的动态变化过程,PCR-STR是一种简单经济的方法,可根据嵌合状态指导个体化免疫治疗,对患者的长期存活有重要意义。
［关键词］短串联重复序列-聚合酶链反应；异基因造血干细胞移植；嵌合体分析［Key words］short tandem repeat-polymerase chain reaction; allogeneic hematopoietic stem cell transplantation; analysis of chimerism异基因造血干细胞移植现今已经成为临床上各种恶性及非恶性血液病治疗的一项重要措施,供者细胞植入受者体内后供者细胞及受者细胞含量情况是动态变化的,需要进行动态的检测。
检测结果有助于判断移植是否成功,及预测移植物抗宿主病的发生与疾病的复发,并指导下一步免疫干预治疗的应用［1］。
短串联重复序列(STR)是由2～6个碱基对组成的一种遗传标记,已在移植后嵌合体检测中广泛使用。
传统的STR-PCR检测方法敏感性多大于5%,但当供受者性别相同时,无法计算供者细胞的嵌合率。
我们对30例接受异基因造血干细胞移植(allo-HSCT)的患者进行了动态嵌合体的监测,根据嵌合结果,为患者的临床治疗和预后提供依据。
STR-PCR分析嵌合体在同种异基因造血干细胞移植中的应用
STR－PCR分析嵌合体在同种异基因造血干细胞移植中的应用【摘要】利用荧光标记的多重PCR 扩增短串联重复序列结合毛细管电泳检测供者细胞嵌合率(DC),以探讨该方法的连续检测对异基因造血干细胞移植后转归的预警作用，采集27例清髓性外周血干细胞移植患者移植前、移植后不同时段的外周血或骨髓，DNA样本用Profiler Plus和Cofiler Plus商品化试剂盒扩增后,用ABI310遗传分析仪进行毛细管电泳,确定基因位点及峰面积,根据基因型的差异选择嵌合率计算公式。
结果表明：两种试剂盒测得的DC嵌合率一致;在27对中能区别出供受差别的STR位点，Profiler Plus为(4-9)个, Cofiler Plus为(2-6)个。
26例患者均在移植后28天出现供者细胞，1例患者未出现供者细胞。
14例患者DC 100%,均获得持久植入,至今仍无白血病生存；另有9例患者出现不稳定混合嵌合(MC)状态(DC为0%-%),其中5例为血液学复发。
27例病人中有6例死亡。
上述5例复发患者均在出现临床症状前发生DC量下降;供者细胞完全嵌合组移植物抗宿主病(GVHD)的发生率高于MC组。
结论：动态检测DC可用于移植动力学研究,对移植物早期植入或被排斥、疾病复发以及GVHD的发生均有预警作用,对早期实施临床干预治疗有重要的指导意义。
【关键词】同种异基因造血干细胞移植；毛细管电泳; 嵌合体Application of Chimerism Analysis to Allogeneic Hematopoietic Stem CellAbstract The aim of this study was to analyze chimerism, evaluate the status of engraftment and predict the outcome of allogeneic hematopoietic stem cellshort tandem repeat (STR) amplification using fluorescence labeling polymerase chain reaction (PCR) combined with capillary electrophoresis. Peripheral blood and bone marrow in 27 patients whoreceived myeloablative allogenetic cell transplantation were collected before and after transplantation in different times. 10 and 7 different STR markersby using a commercial AmpF/STR Profiler Plus/Cofiler plus PCR amplification kits. Separation of the PCR products and fluorescence detection were performed by ABI prism 310 Genetic Analyzer with capillary electrophoresis. The Genescan and Genotype soft ware were used for size calling and quantification of peak areas. The formula to calculate donordifferent allelic distribution type between donor and recipient. The results showed that donor chimerism was similar by the two methods. The median number of informative alleles was (4-9) by Profiler Plus and (2-6) by Cofiler Plus. The donor alleles appeared in 26patients on day 28 post transplantation. One patient was not observed to appear donor alleles. 14 patients with 100% donor chimerism (DC) had stable engraftment and they still survive in free leukemia. 9 patients had unstable mixed chimerism (DC: 0%-%), and 5 of them reldied. Decrease of donor chimerism appeared prior to graft rejection and disease relapse. The incidence of GVHD was higher in group of full donor chimerism. It is concluded that dynamicelectrophoresis is a valuable tool for predicting graft rejection, disease relapse and occurrence of GVHD, and provides a basis for early clinical intervention in the patients receivedKey words allogeneic hematopoieticcapillary electrophoresis; chimerism J Exp Hematol 2007; 15(2):337-341同种异基因造血干细胞移植是治疗恶性血液病和免疫缺陷性疾病的有效手段之一,移植成功与否与供者细胞在受者体内的植入情况,即嵌合体的形成有关。
str鉴定报告
str鉴定报告STR鉴定报告概述STR（Short Tandem Repeats）是一种广泛应用于人类遗传学和法医学领域的分子生物学技术。
本报告旨在通过STR分型结果对样本进行鉴定和分析。
样本信息本次鉴定样本为一名男性，姓名为张三，身份证号码为XXX。
样本来源于公安机关委托进行亲子关系鉴定。
实验方法采用PCR扩增技术，选用ABI 3500 Genetic Analyzer进行电泳分离和检测。
选取15个STR位点进行检测，包括D8S1179、D21S11、D7S820、CSF1PO、D3S1358、TH01、D13S317、D16S539、D2S1338、D19S433、vWA、TPOX、FGA、AMEL和Yfiler。
结果解读通过电泳图谱可得到如下结果：位点名称等位基因大小（bp）D8S1179 13, 14D21S11 29, 30.2D7S820 10, 11.2CSF1PO 10, 12D3S1358 15, 17TH01 6, 7.2D13S317 11, 12.1D16S539 10, 13.3D2S1338 17, 20.2D19S433 13, 14.2vWA 16, 18TPOX 8, 11FGA 22, 25.2AMEL X,YYfiler DYS391:10, DYS389I:13, DYS439:12, DYS389II:30,DYS438:12根据上述结果，可以得出以下结论：1. 样本中15个STR位点均能够得到等位基因大小，说明样本质量良好。
2. 样本与被鉴定人母亲的等位基因大小均不一致，排除了被鉴定人与母亲之间的亲子关系。
3. 样本与被鉴定人父亲的等位基因大小在所有15个STR位点均一致，说明样本与被鉴定人父亲之间存在父子关系。
结论根据以上分析结果，可以得出以下结论：1. 样本为一名男性，身份证号码为XXX。
2. 样本与被鉴定人母亲之间不存在亲子关系。
3. 样本与被鉴定人父亲之间存在父子关系。
STR分型检测技术在胎儿性染色体嵌合体检测中的应用
《中国产前诊断杂志（电子版）》 ２０２２年第１４卷第１期·论著· ＳＴＲ分型检测技术在胎儿性染色体嵌合体检测中的应用胡听听 胡蓉 张艳霞 袁腾龙 卢健 王继成 （广东省妇幼保健院医学遗传中心，广东广州 ５１１４００）【摘要】 目的 探究短串联重复序列（ｓｈｏｒｔｔａｎｄｅｍｒｅｐｅａｔ，ＳＴＲ）检测技术在产前诊断性染色体嵌合体检测中的价值。
方法 自２０１８年１月至２０２０年５月在广东省妇幼保健院医学遗传中心，对孕妇具有产前诊断指征的样本进行绒毛穿刺、羊水穿刺或脐血穿刺，进行ＳＴＲ检测发现的３４例性染色体嵌合体，并同时对其应用染色体微阵列分析（ｃｈｒｏｍｏｓｏｍｅｍｉｃｒｏａｒｒａｙａｎａｌｙｓｉｓ，ＣＭＡ）检测技术进行进一步检测，对两种方法进行比较，评价检测结果。
结果 ３４例ＳＴＲ结果性染色体嵌合体中，主要嵌合体类型为４５，Ｘ／４６，ＸＸ、４５，Ｘ／４６，ＸＹ，其中ＣＭＡ也提示为嵌合的比例为７３．５３％。
结论 在产检诊断检测胎儿异常染色体中，ＳＴＲ检测技术可以为临床遗传咨询提供快速而相对准确的信息和依据，为孕妇提早做抉择准备和心理安慰具有重要作用。
【关键词】 短串联重复序列；染色体微阵列分析；性染色体嵌合；产前诊断【中图分类号】 Ｒ７１４．５５ 【文献标识码】 Ａ犇犗犐：１０．１３４７０／ｊ．ｃｎｋｉ．ｃｊｐｄ．２０２２．０１．００５基金项目：广东省医学科学技术研究基金项目（Ｂ２０１９１５０） 通信作者：王继成，Ｅ ｍａｉｌ：ｊｉｃｈｅｎｇ０９２７＠１２６．ｃｏｍ犞犪犾狌犲狅犳犛犜犚犻狀狆狉犲狀犪狋犪犾犱犻犪犵狀狅狊犻狊狅犳狊犲狓犮犺狉狅犿狅狊狅犿犲犿狅狊犪犻犮犻狊犿犎狌犜犻狀犵狋犻狀犵，犎狌犚狅狀犵，犣犺犪狀犵犢犪狀狓犻犪，犢狌犪狀犜犲狀犵犾狅狀犵，犔狌犑犻犪狀，犠犪狀犵犑犻犮犺犲狀犵 犕犲犱犻犮犪犾犌犲狀犲狋犻犮狊犆犲狀狋犲狉，犌狌犪狀犵犱狅狀犵犠狅犿犲狀犪狀犱犆犺犻犾犱狉犲狀犎犲犪犾狋犺犆犪狉犲犎狅狊狆犻狋犪犾，犌狌犪狀犵狕犺狅狌５１１４４０，犌狌犪狀犵犱狅狀犵，犆犺犻狀犪犆狅狉狉犲狊狆狅狀犱犻狀犵犪狌狋犺狅狉：犢犻狀犃犻犺狌犪，犈 犿犪犻犾：犼犻犮犺犲狀犵０９２７＠１２６．犮狅犿【犃犫狊狋狉犪犮狋】 犗犫犼犲犮狋犻狏犲 Ｔｏａｎａｌｙｚｅｔｈｅｖａｌｕｅｏｆｓｈｏｒｔｔａｎｄｅｍｒｅｐｅａｔ（ＳＴＲ）ｉｎｐｒｅｎａｔａｌｄｉａｇｎｏｓｉｓｏｆｃｈｒｏｍｏｓｏｍａｌｍｏｓａｉｃｉｓｍ．犕犲狋犺狅犱狊 ３４ｃａｓｅｓｗｉｔｈｓｅｘｃｈｒｏｍｏｓｏｍｅｍｏｓａｉｃｉｓｍｄｅｔｅｃｔｅｄｂｙＳＴＲｏｒｃｈｒｏｍｏｓｏｍｅｍｉｃｒｏａｒｒａｙａｎａｌｙｓｉｓ（ＣＭＡ）ｉｎＰｒｅｎａｔａｌＤｉａｇｎｏｓｉｓＣｅｎｔｅｒｏｆＧｕａｎｇｚｈｏｕｍａｔｅｒｎａｌａｎｄＣｈｉｌｄｒｅｎＨｅａｌｔｈＣａｒｅＨｏｓｐｉｔａｌｆｒｏｍＪａｎｕａｒｙ２０１８ｔｏＭａｙ２０２０ｗｅｒｅｓｅｌｅｃｔｅｄａｓｔｈｅｓｔｕｄｙｏｂｊｅｃｔ．Ｔｈｅｎｗｅｃｏｍｐａｒｅｄｔｈｅｔｗｏｍｅｔｈｏｄｓｏｆｔｈｅｄｅｔｅｃｔｉｏｎｒｅｓｕｌｔｓ．犚犲狊狌犾狋狊 Ｔｈｅｍａｉｎｓｅｘｃｈｒｏｍｏｓｏｍｅｍｏｓａｉｃｉｓｍｏｆｔｈｅ３４ｃａｓｅｓｗｅｒｅ４５，Ｘ／４６，ＸＸａｎｄ４５，Ｘ／４６，ＸＹ，ａｎｄｔｈｅＣＭＡｒｅｓｕｌｔｓｏｆｓｅｘｃｈｒｏｍｏｓｏｍｅｍｏｓａｉｃｉｓｍｗｅｒｅ２５（７３．５３％）．犆狅狀犮犾狌狊犻狅狀 ＳＴＲｉｓａｎｉｍｐｏｒｔａｎｔｔｅｓｔｆｏｒｐｒｅｎａｔａｌｄｉａｇｎｏｓｉｓｏｆｃｈｒｏｍｏｓｏｍａｌｍｏｓａｉｃｉｓｍ．【犓犲狔狑狅狉犱狊】 Ｓｈｏｒｔｔａｎｄｅｍｒｅｐｅａｔ；Ｃｈｒｏｍｏｓｏｍｅｍｉｃｒｏａｒｒａｙａｎａｌｙｓｉｓ；Ｓｅｘｃｈｒｏｍｏｓｏｍｅｍｏｓａｉｃｉｓｍ；Ｐｒｅｎａｔａｌｄｉａｇｎｏｓｉｓ 短串联重复序列（ｓｈｏｒｔｔａｎｄｅｍｒｅｐｅａｔ，ＳＴＲ）为基因组中由核心序列２～７ｂｐ重数次到数十次的高度串联重复序列，由于其具有在不同人群不同个体间具有高度多态且高杂合度，并且其检测快捷简便，使其在临床遗传性疾病检测和法医学等方面具有广泛的应用［１，２］。
羊水染色体报告的初步解读（三）----嵌合体
羊水染色体报告的初步解读（三）----嵌合体今天小编将和大家一起聊聊如何解读羊水细胞的嵌合体的报告。
1.要解读嵌合体报告，首先需要了解什么是嵌合体？嵌合体分为几种类型？嵌合体是指一个由两种或多种具有不同核型的细胞系所组成的个体。
可以分为同源嵌合体（mos）和异源嵌合体（chi）。
在临床上更为常见的是同源嵌合体，其不同核型的细胞系起源于同一个合子，导致染色体数目和结构畸变的染色体不分离、染色体丢失、染色体核内复制等改变发生在受精卵的早期卵裂中，可形成各种染色体数目和结构畸变的嵌合体。
（嵌合体产生的原理图解）2.羊水报告中的嵌合体描述是怎么进行描述的呢？下面是小编向各位孕妈举的几个例子：例1（数目改变）：mos 45,X[13]/46,XX[7]，此胎儿为同源嵌合体，共分析了20（13 7）个细胞，个体的细胞有两种核型，其中13个是45,X，另外7个是46,XX。
例2（数目改变）：mos 45,X[15]/47,XXX[3]/46,XX[5],此胎儿为同源嵌合体，共分析了23个细胞，个体的细胞有三种核型，其中15个是45,X，3个是47,XXX，还有5个是46,XX。
例3（结构畸变）：mos 46,XX，t（2；12）（q24.1；p13.2）[5]/46,XX[15],此胎儿为同源嵌合体，共分析了20个细胞，其中5个为2号染色体与12号染色体相互易位核型，另外15个为46,XX。
（报告提示为21-三体嵌合体）3.如果对羊水染色体的嵌合体结果有疑问，复查脐血是否可以明确诊断？羊水细胞为胎儿体表、泌尿道、呼吸道、消化道等脱落的细胞，来源于外胚层、中胚层和内胚层；而脐血属于胎儿循环系统，来源于中胚层，因此复查脐带血不一定能完全代表胎儿的真实核型。
4.嵌合体患者有哪些表现呢？嵌合体患者的临床表现变异较大，可从无明显症状到典型的染色体病临床表现，变化不等，这与异常核型所占比例、细胞异常发生的时机和部位，染色体畸变的种类等相关。
STR-PCR半定量检测嵌合体方法在异基因造血干细胞移植中的应用
STR-PCR半定量检测嵌合体方法在异基因造血干细胞移植中的应用[摘要] 目的:应用短串联重复序列-聚合酶链反应(STR-PCR)半定量方法检测异基因造血干细胞移植后供者细胞比例并探讨其临床意义。
方法：给30例接受移植的患者行移植后嵌合体检测,采集外周血提取DNA,对9个STR位点行聚合酶链反应扩增,扩增完成后行聚丙烯酰胺凝胶电泳及硝酸银染色显影,再计算嵌合率。
结果：30例患者均检测到供者细胞,24例达到完全嵌合(CC),6例形成混合造血(MC)。
在移植后14 d,稳定植入的患者多数表现为CC。
CC组的aGVHD发生率高于MC组,7例患者在复发前检测到嵌合率(donor cell,DC)下降,经相应免疫治疗后有3例达到CC。
结论：监测异基因造血干细胞移植后嵌合率的动态变化过程,PCR-STR是一种简单经济的方法,可根据嵌合状态指导个体化免疫治疗,对患者的长期存活有重要意义。
［关键词］短串联重复序列-聚合酶链反应；异基因造血干细胞移植；嵌合体分析［Key words］short tandem repeat-polymerase chain reaction; allogeneic hematopoietic stem cell transplantation; analysis of chimerism异基因造血干细胞移植现今已经成为临床上各种恶性及非恶性血液病治疗的一项重要措施,供者细胞植入受者体内后供者细胞及受者细胞含量情况是动态变化的,需要进行动态的检测。
检测结果有助于判断移植是否成功,及预测移植物抗宿主病的发生与疾病的复发,并指导下一步免疫干预治疗的应用［1］。
短串联重复序列(STR)是由2～6个碱基对组成的一种遗传标记,已在移植后嵌合体检测中广泛使用。
传统的STR-PCR检测方法敏感性多大于5%,但当供受者性别相同时,无法计算供者细胞的嵌合率。
我们对30例接受异基因造血干细胞移植(allo-HSCT)的患者进行了动态嵌合体的监测,根据嵌合结果,为患者的临床治疗和预后提供依据。
亲权鉴定中嵌合体str基因分型1例
血痕
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14，16
11，18，19
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2019 年
法 医 学 杂 志
12 月
第 35 卷
第6期
· 783 ·
9，11
13，15，20，22
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10，11
9，12，13
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28，29，30，32.2
8，11
11，13
作者简介：李辉（1989—），女，主要从事法医物证学鉴定；E-mail：
931459423@
通信作者：景强，女，教授，主要从事法医物证学和法医毒物学研究及鉴定；E-mail：
·案例报道·
亲权鉴定中嵌合体 STR 基因分型 1 例
李辉，李莹娟，姜淑玲，石存祥，景强
（昆明法医院司法鉴定中心，云南 昆明 650034）
关键词：法医遗传学；嵌合体；DNA 分型；三联体；亲子鉴定
中图分类号：DF795.2
文献标志码：B
文章编号：1004-5619（2019）06-0782-03
1
DYS635、DYS389Ⅱ、DYS627、DYS460、DYS458、DYS19、
亲缘关系进行鉴定，用 FTA 卡采集孩子、某男（疑父，
Y GATA H4 、DYS448 、DYS391 、DYS456 、DYS390 、
时采集孩子带有毛囊的毛发、口腔拭子各 1 份。
DYS449、 DYS393、 DYS439、 DYS481、 DYF387S1、
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str嵌合率报告解读
方法采集健康献血者外周血按白细胞比例两两混合制备不同供受者比例的体外嵌合体模型,对15个STR位点进行荧光标记复合扩增,扩增产物进行序列分析仪毛细管电泳,计算嵌合率。
结果实验测得嵌合率与扩增前样本嵌合率呈显著直线相关,r=0.999 7,最小检出供者细胞嵌合率1%。
供者嵌合率≥5%的嵌合体模型嵌合率的检测值与理论值差别无统计学意义(P0.05),5%的模型嵌合率检测值与理论值差别有统计学意义(P0.05)。
结论荧光标记复合扩增STR基因结合序列分析仪毛细管电泳检测嵌合率方法个体识别力高,特异,敏感,当供者嵌合率≥5%时能准确反映异基因造血干细胞移植后患者的嵌合状态。