荧光复合扩增DXS6804、DXS6799和DXS7132基因座

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北京明正司法鉴定中心通过两项认证认可

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被 检 验 人 为女 孩 、 孩 的 生母 和祖 母 , 染 色体 遗 传 女 常
学标 志 、 染 色体 遗传 学标 志 和 线 粒 体 D A 的检 验 Y N 均无应 用价 值 . 只能借 助 于 X 染 色体 遗传 学标 志的检
验 分 析 手 段 作 者 对 1 5个 X— T 基 因 座 进 行 了 分 SR
递下 来 .故祖 母一 亲一 女 X染色 体 S R分 型 如 同 母 孙 T 常规 三 联体 ( 亲 一 亲 一 孩 )的 常染 色体 S R检 父 母 小 T 测, 非父排除率也能用常染色体 S R相关公式计算[ T 4 1 。
型 比对 , 不排 除该 祖母 与孙女 存在 亲祖 孙 关 系。
【] 秋 玲 , 3刘 吕德 坚 , 虎 . S R基 因座 荧 光 复 合 扩 增 体 系的 赵 X— T 建 立及 其应 用【. 医学杂 志. 0 9 2 ( )4 5 4 8 J法 ] 20 ,5 6 :2 — 2 . [] z o ,R X— ho sm l resP s,peet n tr 4 Si r . crmoo a makr at rsn a df ue b u 【. oe s c ItG n t s 2 0 ,2 :3 9 . J F rni Sin :e ec , 0 8 ( )9 - 9 1 c i
Ch n s o r  ̄ o o e s c i e eJ u n fF r n i S i c
系 .此 时X— T 发挥 了其 独特 的优 势 。x 色体 特有 SR 染 的遗 传 方式 为 :男 性 的x 色 体 以单 倍 型 形式 存 在 , 染
只能遗传 给女儿 ,不遗传 给儿子 ,而且男性 的 x染色
X— T ( S R DXS 1 3 D 9 、 DXS 4 4、 DXS 7 9、 7 3 、 XS 8 1 72 68

浦喆常染色体建库试剂

浦喆常染色体建库试剂
常染色体建库试剂
品牌:浦喆
1.试剂盒采用5色荧光标记,21个基因座复合扩增。
2.基因座包括:D19S433、D5S818、D21S11、D18S51、D6S1043、Amelogenin、D3S1358、D13S317、D7S820、D16S539、CSF1PO、PentaD、D2S441、vWA、D8S1179、TPOX、PentaE、TH01、D12S391、D2S1338、FGA。
2.基因座包括::DYS19、DYS385 a/b、DYS389 I、DYS389 II、DYS390、DYS391、DYS392、DYS393、DYS437、DYS438、DYS439、DYS448、DYS456、DYS458、DYS635、Y GATA H4、DYS481、DYS533、DYS576、DYS643、DYS460、DYS549、DYF387S1a/b、DYS449、DYS518、DYS627、DYS570、DYS527a/b、DYS447、DYS444、DYS557、DYS596。
3.试剂盒内包含热启动酶、引物、缓冲液、内标、control DNA、LADDER、扩增水,无需额外购买
4.试剂盒为免提直扩试剂,适用于血卡、口腔卡、滤纸、棉签及提取纯化的DNA模板。
5.1.5小时内可完成PCR扩增,有利于快速处理大批量样本。
6.试剂盒规格:25微升体系可满足100次反应。
7.试剂盒保质期一年及以上。
8.*投标方必须保证免费提供技术人员到用户指定地点进行样本检验,并在投标时提供不少于50人份的检验报告,保证响应及时;保证不少于1400人份的Y染色体库建库量,检验过程中所产生的所有费用均由投标人承担,
3.试剂盒内包含扩增需要的所有试剂(热启动酶、引物、缓冲液、内标、Ladder、扩增水等)。

山东地区汉族人群15个X—STR基因座的遗传多态性

山东地区汉族人群15个X—STR基因座的遗传多态性
P C R体 系。 对 山 东地 区 无 关 汉 族 人 群 4 8 1例 个 体 ( 女性 2 9 5例 , 男性 1 8 6例 ) 的 1 5个 X 染 色体 上 筛选 的 S T R基 因座 ( D XS I O 0 1 1 、 D XS I O 1 、 G A T A 1 6 5 B 1 2 、 D XS 6 7 9 5 、 DXS 6 8 0 0 、 DXS 6 8 0 1 、 D XS 6 8 0 3 、 D XS 7 1 3 2 、 DXS 7 1 3 3 、 DXS 7 4 2 3、 DXS 7 4 2 4、 DX S 8 3 7 7 、 D XS 8 3 7 8、 D XS 9 8 9 8和 T B) 进 行 检 测 结果 所检测的 1 5个 X— S T R 基
U n i v e r s i t y ,S h a n g h a i 2 D 3 3 .C h i n a , "2 . S h a n g h a i K e y L a b o r to a r y f o F o r e n s i c Me d i c i n e ,I n s t i t u t e 0 , ’ F o r e n s i c
MA T e n d, XU j , Y A N G Y a - j u n | , S U N K u a n 2 ,X U E F u - z h o n f ,J I N L , L I S h i — l i n | ( 1 . n r y o f E d u c a t i o n K e y L a b o r t a o r y o f C o n t e m p o r a r y A n t h r o p o l o g y ,S c h o o l f o L f i e S c i e n c e s ,F u d a n

特异性短串联重复序列位点检测在遗传病产前诊断中的应用

特异性短串联重复序列位点检测在遗传病产前诊断中的应用

3050Guangxi MePdai JouglaODep2020,If42,No.23论著•临床研究特异性短串联重复序列位点检测在遗传病产前诊断中的应用▲刘晓丽钟青燕罗世强王秋华许泽辉覃柳群王敬仁陈丽竹唐宁(广西柳州市妇幼保健院医学遗传科,柳州市出生缺陷预防与控制重点实验室,柳州市545001,电子邮箱:1027609273@)【摘要】目的探讨特异性短串联重复序列(STR)位点检测用于染色体病的产前诊断以及鉴定地中海贫血产前诊断样本的母源成分污染的可行性。

方法纳入3587例存在生育中、重型地中海贫血胎儿风险的孕妇,收集羊水或绒毛标本以及外周血标本。

抽提标本基因组DNA后,利用荧光PCR毛细管电泳法检测21号染色体及性染色体上特异性STR位点!D21S1435、D21Sll、D21S14n、DXS6809、DXS981、X22)和一个性别基因(AMXY),并将胎儿和母亲的STR遗传位点进行比对以分析是否存在母源成分污染。

分析6例母源成分污染羊水或绒毛样本的地中海贫血基因检测结果,并比较STR位点检测与染色体核型分析对所有病例21-三体、X染色体嵌合体的检出情况。

结果特异性STR位点检测结果提示6例存在母源成分污染,但重新提取DNA 检测后提示均无母源污染,并检出2例地中海贫血基因型为--sea/c SEA,及时引产。

采用特异性STR位点检测和染色体核型分析两种技术均检出2例21-三体胎儿,1例嵌合型性染色体异常。

结论特异性STR位点检测可以鉴别产前诊断样本是否存在母源成分污染,是地中海贫血产前诊断的必要补充;其还可以检测出21-三体及性染色体数目异常,在快速产前诊断中具有重要的意义。

【关键词】母源成分鉴定;地中海贫血;染色体病;产前诊断;短串联重复序列【中图分类号】R714.5;R556.7【文献标识码】A【文章编号】0253三304(2020)23-3050-05 DOI:10.11675/j.Osn.0253-4304.2020.23.11Application of spedSc stort tandem1'epeai locus detection in preatal diagnosis of geeetic diseasesLIE Xiao-lt,ZH0NG Qing-jan,LUO Shi-jiang,IW1NG Qd-Wua,XU Ze-jui,QIELd-qun,IW1NG Jing-ree,CHEE Li-zhu,TAAGNing (Department cf Medical Geoetics,Liuzhoo Maternith and Chill Hospital,Liuzhoo K o-Laboratorr for Preenhoo and Control ef Birth Defects,Liuzhoo545001,China)(Abstract)Objective To explore the feasibility ot specific shoe tandem repeats(STR)locus detection in the prenatal diagnosis of chromosome disease as welt as in identifying mateeal contamination of specimens for prenatal thalassemia diagnosis.Methods The samples of amniotic Iuid ot villus and pSphef blood were collected from 3587peegnaniwomen woih hogh-eosk deeoeeeyeoemodeeaieoeseeeeeihaea s emoaeeiuses.AeieegenomocDNAetieacioon of the samples,Iuorescenco PCR capblae electrophoresis was used to detect specify STR genetic loci on chromosome 21and see chromosomes(D21S1435,D21S11,D21S1411,DXS6809,DXS981,X22),as wel t as a see yene(AMXY), and then the STR genetic loci of the fetus and mother were compared for identifying mateeal contamination.The results of thalassemia gene detection were analyzed in the six amniotic fluib ot villus specimens with mateeal contamination, and the detection results for21-trisomy and X-chromosome chimeesm in ft cases were compared between STR locus detection and kwyotype a nalysis.Reshlts Six cases were identifed as mateeal contamination by specific STR locus detection;then DNA e-cxtraction was perfoened,and no mateeal contamination was reposed,but two cases were diagnosed as thalassemia genotype ot--SEA/_N EA and were promptly treated by induced mboe Two21-trisomy and one chimeec see chemosome abnoenality were ibentif e d by two technologies separately,specific STR locus detection and kwyotype analysis.Conclusion Specify STR locus detection can identity the presence of mateeal contamination in▲基金项目:广西医药卫生科研课题(Z20170528,Z20180043)作者简介:刘晓丽(1991〜),女,硕士,初级技师,研究方向:分子遗传学。

MDM2基因扩增检测试剂盒(荧光原位杂交法)说明书

MDM2基因扩增检测试剂盒(荧光原位杂交法)说明书

MDM2基因扩增检测试剂盒(荧光原位杂交法)说明书【产品名称】通用名称:MDM2基因扩增检测试剂盒(荧光原位杂交法)英文名称:FISH detection Kit for the amplification of MDM2 gene【包装规格】10人份/盒、20人份/盒【预期用途】本产品用于检测福尔马林固定、石蜡包埋人脂肪肉瘤组织样本中的MDM2基因扩增情况[1,2]。

【检验原理】荧光原位杂交法(Fluorescent In Situ Hybridization,FISH)能够使细胞中特定的核苷酸片段通过荧光而清楚的呈现,FISH试验过程中包含了双链DNA的解链,荧光标记的DNA探针能够与目标序列结合[2-3]。

杂交完成之后,多余的探针被清洗掉,同时,细胞核被复染剂4',6-二脒基-2-苯基吲哚(DAPI)染色会发出蓝色的荧光。

本试剂盒包含一组探针:MDM2(红色)位点和CEP12(绿色)位点及DAPI复染剂。

正常细胞信号方式:每个细胞显示两个绿色信号及两个红色信号。

异常细胞信号方式:细胞中若出现三个及以上红色信号且绿色信号不小于两个。

【主要组成成分】MDM2 /CEP12探针及DAPI于-20℃避光、密封储存;不应与有毒、有污染和有不良气味的物品混存;开封后,探针及DAPI 24小时内可在2-8℃避光、密封储存;24小时内不能使用完的,请放置于-20℃±5℃避光、密封储存;自生产之日起有效期为一年。

【适用仪器】本试剂盒探针杂交需在杂交仪上进行杂交,如ThermoBrite。

本试剂盒探针需在荧光显微镜下观察并分析结果。

所需荧光显微镜的配置包括:物镜:在FISH分析上,使用100×消色差浸油类型物镜可取得满意效果。

镜油:在浸油式物镜上使用的镜油应为低水平自发荧光配方,并专门在荧光显微镜上使用。

滤光片:建议客户处客使用探针前向滤片组供应商了解所使用的滤片组的详细情况,以便选择与标记荧光染料相适应的滤片组。

16个X-STR基因座的连锁不平衡检验和突变率调查

16个X-STR基因座的连锁不平衡检验和突变率调查

16个X-STR基因座的连锁不平衡检验和突变率调查李莉;刘俊宏;朱如心;林源【摘要】目的:检测X染色体上16个STR基因座的连锁不平衡情况,并对其遗传稳定性进行调查。

方法从华东汉族群体选取女性无关个体500名、家系885个,提取血样DNA,利用自主研发的IDtyperX-16试剂盒对16个X-STR基因座进行多重PCR扩增和毛细管电泳分型,使用PowerMarker v3.25软件对基因座进行连锁不平衡检验,并分析各个基因座的突变率。

结果16个X-STR基因座彼此之间不存在连锁不平衡现象;有10个基因座检见突变,其中DXS6809和DXS7132的突变率均高达0.0048。

结论对于IDtyperX-16试剂盒中的16个X-STR基因座,在亲权鉴定中应用时可运用乘积原理计算似然率,但若遇到不符合遗传规律的情形(尤其是DXS6809、DXS7132基因座),应考虑存在突变的可能。

%Objective To assess the patterns oflinkage disequilibrium (LD ) of16 STR loci on X chrom o-som e and investigate the genetic stability. Methods G enom ic DNA samples extracted from blood stains from 500 unrelated individuals and 885 lineage m em bers from E astern C hinese H an population were genotyped through m ultiplex am plification using ID typerX-16 kit by our independent research followed by capillary electrophoresis. LD was assessed by PowerM arker v3.25 software and m utation rate of every locus was analyzed. Results LD were not found at the 16 X-STR loci. A llele m utations were observed at 10 loci. A m ong them ,m utation rates of DXS6809 and DXS7132 were both up to 0.004 8. Conclusion W hen the 16 X-ST R loci included in ID typerX-16 kit were used for parentage testing, product princi-ples can be applied to calculatethe likelihood, but m utation should be taken into consideration in the case that the genotypes do not m eet the genetic law(especially atDXS6809 and DXS7132).【期刊名称】《法医学杂志》【年(卷),期】2014(000)006【总页数】4页(P437-440)【关键词】法医遗传学;X染色体;短串联重复序列;连锁不平衡;突变率【作者】李莉;刘俊宏;朱如心;林源【作者单位】司法部司法鉴定科学技术研究所上海市法医学重点实验室,上海200063;司法部司法鉴定科学技术研究所上海市法医学重点实验室,上海 200063; 华东政法大学研究生教育学院,上海 200042;司法部司法鉴定科学技术研究所上海市法医学重点实验室,上海 200063;司法部司法鉴定科学技术研究所上海市法医学重点实验室,上海 200063【正文语种】中文【中图分类】DF795.2X染色体有着特殊的遗传方式,即女性的X染色体可以遗传给儿子和女儿,而男性的X染色体只能遗传给女儿。

3个X-STR基因座复合扩增

3个X-STR基因座复合扩增

3个X-STR基因座复合扩增刘秋玲;吕德坚;陆惠玲;罗艳敏;方群;梁子君;何锋周;李英儒【摘要】@@ X染色体由于其特殊的遗传方式,已受到了法医DNA工作者的重视,研究X-STR的多态性和分型已成法医学上研究内容之一.为了发掘和利用X-STR 的多态性,本研究用复合扩增和银染法对3个X-STR基因座的多态性进行了研究并调查了广东汉族群体遗传学数据.【期刊名称】《法医学杂志》【年(卷),期】2006(022)006【总页数】3页(P431-432,435)【作者】刘秋玲;吕德坚;陆惠玲;罗艳敏;方群;梁子君;何锋周;李英儒【作者单位】中山大学中山医学院法医物证教研室,广东,广州,510089;中山大学中山医学院法医物证教研室,广东,广州,510089;中山大学中山医学院法医物证教研室,广东,广州,510089;中山大学附属一院妇产科,广东,广州,510089;中山大学附属一院妇产科,广东,广州,510089;中山大学中山医学院03级法医,广东,广州,510089;中山大学中山医学院03级法医,广东,广州,510089;中山大学中山医学院03级法医,广东,广州,510089【正文语种】中文【中图分类】DF795.2X染色体由于其特殊的遗传方式,已受到了法医DNA工作者的重视,研究X-STR 的多态性和分型已成法医学上研究内容之一。

为了发掘和利用X-STR的多态性,本研究用复合扩增和银染法对3个XSTR基因座的多态性进行了研究并调查了广东汉族群体遗传学数据。

血液标本来自本室日常检案样本和附属一院妇产科样本,用Chelex-100法提取DNA。

DXS7132,DXS6789和GATA172D053个基因座引物序列参照文献[1],均由上海生物工程有限公司合成。

PCR扩增总体积12.5μL,内含dNTP200μmol/L,MgCl21.5 mmol/L,KCl50mmol/L,10 mmol/L Tris-HCl(pH=8.3),0.01%BSA,Taq DNA聚合酶0.5U,DXS7132,DXS6789和GATA172D05引物为80nmol/L, 100nmol/L,150 nmol/L,模板DNA 10~20ng。

十二个X染色体STR基因座荧光标记复合扩增体系的法医学应用

十二个X染色体STR基因座荧光标记复合扩增体系的法医学应用

gnt e i p l etpo s . R sl】At ao 22 a p s e nt e epcl A oghm, 5 ll e eo pd t c i r e cohr i 【 e t t m l r g o pd xliy m n e 13 le w r y w h a ly l r a es us o l f 7 s e w e e y it. t ae s e
Jn 2 1 a. 01
十二个 x染色体 S R基 因座荧光标记复合扩增体系 T 的法医学应用
任 峥 曾祥培 陈文静 吴晓洁 童大跃 李建金 孙宏钰 , , , , , ,
3司法 部司法鉴定科 学技术研究 所上海市法 医学重点实验 室 , . 上海 2 0 6 ) 00 3 (. 1 中山大学 中山医学院法 医学 系 , 东 广州 5 0 8 ;. 东省清远市公 安局 , 广 10 0 2 广 广东 清 远 5 1 1 ; 1 55
Am pi c to y t m l a in S se i f
R N Z e g, E GXi gp i C N We - n WU X a- e, O G D -u L i -n , U o gy E h n Z N a —e , HE nj g, i j T N ay e, I a j S N H n —u, n i oi Jni
09 99 99 9i f l ( D F , adtecm ie a xls nca c a .9 9 3 u ae C C u )ad .9 9 9 ma s C P ) n o bn dmenecui hn ew s09 99 83 6i d ocss( ME d o ,n ne e h o n
过五色荧光标记引物进行复合扩增, 采用毛细管电泳技术进行产物分离和基因分型, 统计相关法医学应用参数。【 结果 】7 22
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荧光复合扩增DXS6804、DXS6799和DXS7132基因座沈靓;乔可;郑海波;王科;赖江华
【摘要】应用分子克隆技术制备出DXS6804、DXS6799和DXS7132基因座的等位基因分型标准物,通过研究复合扩增技术,构建3个基因座X—STR复合扩增的荧光检测体系。

【期刊名称】《法医学杂志》
【年(卷),期】2009(025)001
【总页数】1页(P44-44)
【关键词】法医遗传学;荧光复合扩增;X-STR
【作者】沈靓;乔可;郑海波;王科;赖江华
【作者单位】西安交通大学,医学院法医系,陕西,西安,710061;绍兴县公安局,浙江,绍兴,312000;复旦大学,上海医学院教育部医学分子病毒学重点实验室,上
海,200032;西安交通大学,医学院法医系,陕西,西安,710061;西安交通大学卫生部法医学重点实验室,陕西,西安,710061;西安交通大学,医学院法医系,陕西,西安,710061;西安交通大学,医学院法医系,陕西,西安,710061;西安交通大学卫生部法医学重点实验室,陕西,西安,710061
【正文语种】中文
【中图分类】DF795.2
应用分子克隆技术制备出DXS6804、DXS6799和DXS7132基因座的等位基因分型标准物,通过研究复合扩增技术,构建3个基因座X-STR复合扩增的荧光检测
体系。

5名实验室志愿者血,Chexlex-100法提取,-20℃保存,用于X-STR复合扩增体系灵敏度、重复性研究。

从本实验室研究多年的X-STR基因座中,选择四核苷酸
简单重复、检测结果稳定、突变率低的3个基因座:DXS6804、DXS6799和DXS7132,基因座的信息见表1。

引物查自GDB数据库,5′端5-FAM标记,由
上海生工生物公司合成。

等位基因分型标准物由分子克隆技术制备。

PCR总体积
为12.5μL,其中DNA模板1~10 ng,200μmol/L dNTP,1.5mmol/L MgCl2,1×PCR缓冲液,1U Taq酶(北京天为时代科技有限公司),0.12pmol/μL
DXS6804引物,0.2 pmol/μLDXS6799引物,0.2pmol/μL DXS7132引物。

PCR参数为94℃变性6min;94℃30 s,60.5℃35 s,72℃30 s,循环30次;72℃10min。

ABI 377遗传分析仪电泳自动收集电泳结果数据,GeneScan 3.1计算扩增产物片段长度,Genotyper 2.5进行样本基因型分型。

同时对该体系进行
准确性、灵敏度和种属特异性研究。

复合扩增产物在ABI 377遗传分析仪上得到良好的分型结果,无干扰和非特异性
扩增。

用同一样本分别电泳5次,检测到的片段长度的误差在程序预设的
±0.50bp内。

5份血样经复合扩增检测之后,结果与单基因座银染扩增所得分型
结果一致。

样本DNA含量为0.5~100 ng时,均获得理想的结果。

本复合体系的3个X-STR基因座均为简单四碱基重复序列,在实验室以往的群体
调查中,等位基因分布较均匀,个体识别能力较强,适用于中国民族群体的法医学实践。

本实验室建立的复合扩增体系对于Chelex-100法提取的常规EDTA抗凝血、血痕和肌肉组织样本均获得理想结果。

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