PubMed检索基础
pubmed检索方法

pubmed检索方法Pubmed 检索方法Pubmed 是美国国家医学图书馆(National Library of Medicine)所开发的一个免费的生物医学文献库,包含了全球几乎所有的生物医学文献,是医学研究人员和医生进行搜索和查找相关医学文献的重要工具。
本文将介绍Pubmed 的检索方法。
一、关键词检索关键词检索是 Pubmed 最常用的检索方式,通过输入关键字搜索相关的文献。
在检索时需要注意以下几点:(1)关键词要准确。
Pubmed 检索采用布尔操作符(AND、OR、NOT)连接多个关键词,关键词之间要使用英文逗号(,)隔开。
使用过多的关键词可能会导致检索结果没有想象中的好。
(2)参数设置。
可以根据需求调整相关参数,例如年份、文献类型(Review、Clinical Trial、Randomized Controlled Trial等)、文章作者、机构等。
(3)英文文献。
Pubmed 绝大部分都是英文文献,所以检索时需要使用英文关键词。
(4)筛选性强的关键词。
例如疾病名称、独特的药品名称等。
Pubmed 支持多种文献类型检索,例如:(1)临床试验在 Pubmed 首页上,勾选临床试验会检索到近期的中断临床试验、未发布的临床试验等。
(2)随机对照试验勾选随机对照试验可以检索到已发表的随机对照试验。
(3)综述勾选文章类型为系统综述或综述,可以检索到该领域最新的文献综述。
三、学科分类检索Pubmed 中的文献都会有一个或多个学科分类号(MeSH Terms),用户可以通过选择学科分类号进行检索。
在检索时需要注意以下几点:(1)科学性强的关键词。
例如,临床试验、人类、治疗法等。
(2)与所需内容相关的关键词。
例如,药物作用机制、剂量方案等。
(3)使用适当数量的关键词。
使用过少的关键词会导致检索结果过多,使用过多的关键词会导致检索结果不够全面。
Pubmed 中的文献都会有一个分值,通过分值和其他指标来对文献进行评价。
pubmed文献检索方法

pubmed文献检索方法摘要:一、PubMed简介二、文献检索方法1.基本检索2.高级检索3.检索策略三、检索实例四、检索技巧1.关键词选择2.运用布尔操作符3.限制检索范围五、文献管理与分析工具六、总结与建议正文:一、PubMed简介PubMed是由美国国立卫生研究院(NIH)开发和维护的一个免费生物医学文献数据库,包含了大量的生物医学、生命科学、化学等领域的研究文献。
它为广大科研工作者、医生和药师等提供了便捷的文献查询途径。
二、文献检索方法1.基本检索在PubMed首页,可以通过输入关键词或输入文献的题名、作者、出版年份等进行基本检索。
基本检索的结果会按照相关性排序。
2.高级检索点击检索框下方的“高级检索”按钮,可以进入高级检索界面。
高级检索允许用户对检索词、检索范围、文献类型等进行更详细的设定,从而提高检索的准确性。
3.检索策略在检索过程中,可以采用一些策略提高检索效果。
例如,使用截词符(*)进行词干检索,或将关键词用引号括起来进行精确检索。
三、检索实例以下是的一个检索实例:假设我们想查找关于“新冠病毒”(SARS-CoV-2)的研究文献,可以在检索框中输入“SARS-CoV-2”或“新冠病毒”,然后点击检索按钮。
检索结果会包括与新冠病毒相关的文章,如病毒基因序列、疫苗研究、治疗方法等。
四、检索技巧1.关键词选择选择合适的关键词是提高检索效果的关键。
可以通过查阅相关领域的专业词典、综述文章等,了解研究领域的主要术语和概念。
2.运用布尔操作符布尔操作符(AND、OR、NOT)在检索过程中起到筛选和组合检索词的作用。
例如,输入“新冠病毒AND 疫苗”,可以检索到同时涉及新冠病毒和疫苗的文章。
3.限制检索范围在检索过程中,可以通过设置文献类型、发表年份、语言等限制条件,缩小检索范围,提高检索的针对性。
五、文献管理与分析工具PubMed提供了多种文献管理与分析工具,如引文导出、文献收藏、文献标签等。
pubmed基本功能及检索

收录范围
1. MEDLINE
• 记录标注[PubMed - indexed for MEDLINE]
2. PreMeMdElDiLnIeNE数据库由美国国家医学图书馆 • 是临(时性Na医ti学o文na献l 数L据ib库ra,r每y 天of接收Me新di数c据in,e,经M简eS称H词N表LM标) 引后编,每制周,向是me印dl刷in刊e移《加I一n次de。x Medicus》》(医学索 引)、《Index to Dental Literature》(牙科 • 记录文标献注[索Pu引bMe)d 和- 《in Ipnrtoecersnsa]tiongal Nursing Index》 (国际护理索引)的光盘版,数据摘自3700种期
11单词短语词组检索单词短语词组检索22作者检索作者检索33期刊名称检索期刊名称检索44截词检索截词检索55带逻辑运算符的复合检索式带逻辑运算符的复合检索式读者培训系列讲座之pubmed1313pubmedpubmedpubmedpubmedpubmedpubmed读者培训系列讲座之pubmed1414检索出文章总篇数综述类文献总篇数单词检索系统自动进行转换匹配后生成的检索式读者培训系列讲座之pubmed1515livercancer固定搭配词组检索自动转换匹配后进行逻辑或的运算读者培训系列讲座之pubmed1616短语检索自动转换匹配后的结果读者培训系列讲座之pubmed1717强制短语词组检索针对特定的短语和词组的检索需要在短语或者词组上加上双引号
PubMed检索界面
PubMed基本检索功能
特征栏辅助检索
其他辅助检索 检索结果的处理
显示检索结果(Display) 输出检索结果(send to )
输出到文本(send to Text)
文献检索 第四课 Pubmed

温州医科大学图书馆
林薇
Contents
初识PubMed PubMed基本检索 PubMed高级检索 PubMed主题词检索 PubMed期刊检索 PubMed检索结果处理
初识 PubMed
标引质量高
更新速度快 使用方便
信息量大
选择PubMed的n个理由
/pubmed
Pubmed基本检索
一、Pubmed检索系统
(三)Pubmed基本检索 基本检索
Pubmed基本检索
一、 Pubmed的检索规则
1.
逻辑运算符: AND OR NOT
AND diabetes therapy NOT nifedipine
将检索出同时包含阿司匹林和糖尿病两个检索词的文献。
/美国国立卫生研究院
/美国国立医学图书馆
/国家生物技术信息中心
Entrez资源整合系统
NCBI资源整合系统,基于Web界面的综合生物信 息数据库,可实现跨库检索,包括
GenBank和Nucletide (2) Genoma (3) OMIM (4) Protein (5) Structure (6) Pubmed (7) PMC
(1)
初识Pubmed
一、Pubmed检索系统
(一)Pubmed收藏范围:
(1)
(P46)
Medline:标注为[Pubmed-indexed for Medline] (2) OldMedline:标注为[Pubmed-OldMedline] (3) In Progress Citations:标注为[Pubmed-in Process] (4) Publisher Supplied Citation:标注为[Pubmed-as supplied by Publisher]
PubMed检索指南

PubMed检索指南1.PubMed基本检索方式(Basic PubMed Search)进入PubMed基本检索方式主页,在检索框中可以输入任意词,包括文献作者,出版杂志等:∙键入一个或多个检索词(可以为任意词),如protein disulfide isomerase ,也可以输入缩略名如pdi等;输入多个词时,可自动识别成词组;但词数太多时,则以逻辑与的方式识别,如可以将protein disulfide isomerase识别成一个词,也有可能将其识别成“protein AND disulfide AND isomerase”尤其是出现数字等符号时不易识别成词组;∙对PubMed不能识别检索的词组,需加引号强调,如键入:“Insight II”∙以文献作者方式检索,作者名的输入格式为:姓+名如输入:Freesman DJ ,其中“姓”为全称,“名”则为首字母简写形式(“名”可以省略);∙键入的杂志名称可以是全名,也可以是杂志名的MedLine缩写格式∙或ISSN杂志号(见期刊浏览)。
∙检索时可在词尾加“*”号检索所有具有同样词头的词。
如键入:biolog*可查得biology或biological 等词。
PubMed可将多个词以词组形式查询,对PubMed不能识别检索的词组,需加引号强调,如键入:“Insight II”将识别成词组“Insight II”以方式查询,若键入:Insight II则有可能分开识别成“Insight” 和“II”两个词,以逻辑与“Insight AND II”的方式进行检索。
词与词间可用AND、OR或NOT逻辑进行连词检索。
键入检索词后,别忘了选择检索年限(30天,10年不等)及选择文献的页面显示数目。
按Enter回车键或鼠标击话界面中的“Search”按钮可得到查询文献提要(document summary page)。
2.PubMed高级检索方式 (Advanced Search)与基本检索方式不同的是增加了检索范围(search fields).和检索模式(search mode)的选择框。
PubMed基本功能及检索1

预检索/浏览索引检索(Preview/Index)
☆读者培训系列讲座之PubMed☆
预检索/浏览索引检索界面(Preview/Index)
预览检索结果,修改和增删检索词
检索预览
预检索按钮
检索式
检索结果数量
therapy
索引检索按钮 预检索/索引加词检索
☆读者培训系列讲座之PubMed☆
☆读者培训系列讲座之PubMed☆
(四)临床查询
( Clinical Queries )
☆读者培训系列讲座之PubMed☆
Ultrason Sonochem 1997 Wang zb
单个引文匹配检索
得出其他著者
☆读者培训系列讲座之PubMed☆
简介 PubMed的特点 PubMed检索界面 PubMed基本检索功能 期刊浏览检索 特征栏辅助检索 主题词浏览检索 其他辅助检索
单个引文匹配器 临床查询
☆读者培训系列讲座之PubMed☆
简介 PubMed的特点 PubMed检索界面 PubMed基本检索功能 期刊浏览检索 特征栏辅助检索 主题词浏览检索 其他辅助检索
单个引文匹配器
☆读者培训系列讲座之PubMed☆
(三)单个引文匹配检索
(Mesh Database)
• 输入题录信息,查找特定文献。 • 刊名要准确,缩写要标准 • 著者姓名大小写不敏感 • 如查找:王智彪教授 1997 年发表在 Ultrason Sonochem期刊上的一篇文 章的其他作者的名字
布尔逻辑运算符有: AND,OR或NOT
☆读者培训系列讲座之PubMed☆
简介 PubMed的特点 PubMed检索界面 PubMed基本检索功能 特征栏辅助检索
Pubmed基本的检索知识

Pubmed基本的检索知识Pubmed是医学专业常用的数据库,对于医学科研工作至关重要,但是对于Pubmed最基本的检索知识你都了解吗?下面介绍了Pubmed三种检索方式,检验一下你都get到了吗?Pubmed主界面1基本检索引文状态标记值分为:[PubMed-indexed for MEDLINE]、[PubMed-in process]、[PubMed-OLDMEDLINE]、[PubMed – as supplied by publisher]四种状态。
[PubMed-indexed for MEDLINE]:被MEDLINE所收录并被标引MeSH主题词,具有完整的书目题录信息,检索此类文章方法:在检索框输入medline [sb]。
[PubMed-in process]:每天收录由MEDLINE的期刊出版商提供的尚未经过规范化处理的数据,该库中的记录只具有简单的书目信息和文摘、每星期当该库中数据被标引MeSH词、文献类型及其他数据时转入MedLine一次,而被处理前的数据从该数据库中删除。
检索此类文章方法:在检索框输入inprocess [sb]。
[PubMed-OLDMEDLINE]:含1950年至1965年期间发表的200万篇生物医学文献。
OldMedline的记录没有MeSH字段和摘要。
检索此类文章方法:在检索框输入oldmedline [sb] [PubMed –as supplied by publisher]:是由出版商提供的电子文献MEDLINE收录范围的文献,每日被添加到In Process Citation中去,换上[PubMed – in process]的标记,并赋予一个MEDLINE的数据识别号UI;不属于MEDLINE收录范围的文献则只有PubMed数据识别号PMID 而没有MEDLINE UI。
布尔逻辑运算符(检索时需大写)AND可用来表示其所连接的两个检索项的交叉部分,也即交集部分。
pubmed高级检索方法

pubmed高级检索方法一、pubmed高级检索基础1.1 首先呢,pubmed是个超棒的医学文献宝库。
它的高级检索功能就像一把神奇的钥匙,能让你更精准地找到你想要的东西。
咱别小看这个功能,它就像一个隐藏的宝藏地图,要是会用,那可真是如鱼得水。
1.2 你得知道,pubmed高级检索界面有很多选项。
就好比一个大超市,每个货架都有不同的东西。
这里的选项就是那些货架,你得清楚每个货架放的是啥,才能快速找到你需要的“商品”,也就是文献啦。
二、检索字段的运用2.1 比如说作者字段。
这就像找人一样,你知道作者是谁,那就直接在作者字段里输入作者的名字。
这就好比你在人群里找一个熟人,直接喊他名字就好啦。
不过有时候作者名字可能有多种写法,你得像个侦探一样,把可能的写法都试试,可不能一根筋。
2.2 还有标题字段。
如果一个文献的标题里有你想要的关键词,那在标题字段检索就像瓮中捉鳖一样容易。
标题可是文献的招牌,往往包含了核心内容。
你要是想找关于某种疾病特定治疗方法的文献,在标题里搜这个治疗方法的名字,很可能就一击即中。
2.3 期刊字段也不能忽视。
你要是对某个期刊特别感兴趣,或者知道你要找的文献大概率发表在某个期刊上,那就在期刊字段里输入期刊名。
这就像你知道一个人住在某个小区,直接去那个小区找他就对了,省得满世界乱找。
三、布尔逻辑运算符的使用3.1 AND这个运算符啊,就像是交朋友里的“志同道合”。
你输入两个关键词,中间用AND连接,那搜索出来的文献就是同时包含这两个关键词的。
比如说你搜“糖尿病 AND 胰岛素”,那找出来的文献就是既和糖尿病有关,又提到胰岛素的,这样就把范围缩小得很精准了。
3.2 OR这个运算符呢,有点像广撒网。
当你输入两个关键词,中间用OR连接,搜索出来的文献只要包含其中一个关键词就会被显示。
比如“感冒 OR 流感”,那只要是关于感冒或者流感的文献都会出来。
这在你不确定具体用词或者想扩大搜索范围的时候很有用,就像你想找水果,苹果或者香蕉都可以满足你吃水果的愿望,这里的苹果和香蕉就相当于不同的关键词啦。
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PUBMED中医药内容的检索技巧
1、中医词汇首选对应的Mesh词,注重Mesh词与自由词结合,并配合自由 词的不同拼写方法。(推拿、气功)
2、中药名称首选药材拉丁名配合英文名与汉语拼音,同时需要注意中药的 上位概念如Drug,Chinese Herbal 、Plant Roots
3、方剂检索一般用方名的汉语拼音,但必需注意使用拉丁字母拼写的方名 (日韩),其中甚至有些拉丁字母拼写的方名已为Mesh词。
Carcinoma, Non-Small-Cell Lung AND radiotherapy
2.PUBMED过滤器的功能: 文献类型--综述性文献、免费全文
非小细胞肺癌/放射疗法
脑癌/放射疗法
非小细胞肺癌/化学疗法 非小细胞肺癌/遗传学
获取全文的途径
1、全文数据库
2、文献传递:FMJS、读秀、FULINK、万方医学网 3、论坛、向作者索取
字段限定的功能:高级检索或字段限定[TI] PUBMED过滤器的功能:
年龄:6-12、出版时间:近3年、文献类型:随机对照试验 文摘下载方式
Mesh在检索中的重要作用
准确性----准确揭示文献内容的主题
更进一步选择主要主题词(MAJR)即以其为核心内容,进一步缩小检索范 围,提高查准率
4、疾病的中医疗法:采用疾病主题词与对应的中医药疗法的主题词如 Drug,Chinese Herbal 、Plant Roots、Medicine,Chinese Traditional、 chinese herbal;实验研究与临床研究分别应用中药与药理作用、治疗应用 结合进行检索。
Pubmed5、 检索PUBMED中有关四逆汤的文献,请写出你所用的检索词
PUBMED反馈与加强
主要问题
没有应用到PUBMED的筛选的功能,也就是特征词 对于副主题词的作用不了解 未从detail转化情况来反思检索结果 未能理解主题标引的概念 欠缺思考、太敷衍
PUBMED基础与提高
基础 提高
1
过滤器(限定检索)----特征词
2
MESH检索----主题词与副主题词
sini tang OR sini decoction
检索式:("sini tang"[Supplementary Concept] OR "sini tang"[All Fields] OR "sini decoction"[All Fields]) OR ("sini tang"[Supplementary Concept] OR "sini tang"[All Fields])
2、在此基础上想要尝试能不能有一些PDF的文 献做为参逻辑与:空格 逻辑非:用“-”表示,“-”号前必须有空格 逻辑或:用大写“OR” ,OR的前面必须有空格
-------- 局限于某个具体网站或 一类网站
注:冒号后不能有空格,域名不能有http
用途:搜索国家、政府、组织、学校的信息 搜索死链接网站 替代站内搜索 搜索受限的网站
例: site: site: site:jp site:org site:gov
3、intile: 表示把搜索范围限定在网页标题中 例: intile: 肝炎
。
PUBMED中医药文献检索的注意事项 方剂检索一般用方名的汉语拼音,但需注意一些翻译问题及拼写不同 中医药的概念部分在增补概念[Supplementary Concept]中,也有类似主题 词的聚类功能,检索中应有效运用
"sini tang"[Supplementary Concept] OR "sini tang"[All Fields]
"si ni tang"
sinitang
日韩的汉方研究,复方常以拉丁字母拼写, 并且进入PUBMED的时间都较早,研究方 法值得借鉴
实例—分析检索词与检索技巧
1、有一位老师已查了外文数据库中有关国外研 究四逆汤的文献,但由于没有日本的医学数据库 ,想查找一些日本国内研究四逆汤的信息做研究 内容的补充,请问应该如何检索?
1
主题词与关键词的有效运用
2
PUBMED中医药内容的检索技巧
3
检索之上的分析利器GoPubMed
特征词
特征词的内涵及在检索的作用
由于临床医学、医学教育与科研人员经常需要并感
兴趣而设置的具有特殊意义的词组,形成族性限定。
人类和动物
年龄组
性别
时代特征词
妊娠
出版类型特征词
具体动物名称特征词
PUBMED2、请查找近3年发表的有关幼儿(6~12岁)哮喘的随机对照 试验的文献,要求哮喘出现在题名中,下载两篇以文摘格式保存。
PUBMED 3、请查找放射疗法对非小细胞肺癌生活质量影响的相关文献, 选择2篇下载文摘, 并尝试获取一篇免费综述性全文以截图的方式呈现。
1.检索词的提取
2.采用主题词/副主题词组配的方式 比较: "Carcinoma, Non-Small-Cell Lung/radiotherapy"[Mesh]
专指性----主题词与副主题组配检索,使检索结果更专指。
副主题:对主题词起限定作用,两者组配,缩小检索范围。 Mesh 83个副主题词 副主题词中英文对照参见FMJS,见教材附录一P212
主题词选择策略
Mesh试查----查看转化情况 应用FMJS与万方医学网辅助翻译 选用专业的医学词典 甚至是查看文献中的专业术语的翻译 Mesh的树状结构如针灸的选词
主题词与关键词的有效运用
不是每个词都有对应的主题词 没有主题标引的文献不可以用主题根据实际需求选择,最好的是使用主题词与关键词相结合 (1)已有对应主题词先进行MESH检索,确定该检索词的主题词,
进而通过Entry Terms确定同义词,拓展检索词,再以主题词 结合同义词查找 (2)没有对应主题词时可以想到检索词相关的上位词是否有对应 的主题词或者直接用关键词(最好用专业词典进行翻译)