细菌多样性的开题报告 PPT课件
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生物的多样性第十四章 丰富多彩的生物世界》第三节 神奇的微生物(共26张PPT)
细菌 说1、说根它据与形植态物分细为胞三相种比：结察构）上的，不球同点菌。 、杆菌
2、病毒也有有益之处，、如 螺旋菌三种
又分为腐生和寄生两种。
单细胞
没有成形的细胞核
寄生、腐生
促进自然界物质循环
较大（多数用肉眼 酵母菌细胞不含叶绿体。
无氧条件下生活的细菌 （厌氧性细菌）如：乳酸菌。
单细胞和多细胞 1、由于病毒寄生在活细胞中，并利用细胞中营养大量繁殖，很快会造成细胞解体死亡，引起人、动植物患病。
根霉等） • 制馒头面包、酿白酒、啤酒（酵母菌）
酵母菌
真菌与人类的关系4--- 致病
1、真菌还引起植物的病害，如小麦锈病等。 2、真菌引起人体和动物患病，如脚癣是真菌引 起的。
下图是酵母菌结构模式图，填出图中结构名称，
说说它与细菌和植物细胞相比结构上分别有哪些不同 点。
细胞壁
细胞核
细胞质 细胞膜
液泡
1、与细菌的不同点： 酵母菌有成形的细
胞核和液泡。
2、与植物细胞的不 同点：
酵母菌细胞不含叶
绿体。
真 菌
青菌
曲菌
酵母菌
蘑菇
病毒的结构特点和营养方式
1、结构特点：
还小 多数要用电子显 病毒非常微小，比细菌 真菌与人类的关系4--- 致病
酵母菌有成形的细胞核和液泡。
,
微镜才能观察到。 制米酒（曲霉、毛霉、酵母菌等）
制甜面酱（米曲霉） 、豆豉（米曲霉、毛霉、 黑根霉等）
2、病毒也有有益之处，如
结构简单，没有细胞结构 蛋白质和遗传 2、结构特点：
寄生生活，只能 有成形的细胞核，核质外有核膜包被。
2、与植物细胞的不同点：
寄生在特定生物的活细胞中。
2、病毒也有有益之处，、如 螺旋菌三种
又分为腐生和寄生两种。
单细胞
没有成形的细胞核
寄生、腐生
促进自然界物质循环
较大（多数用肉眼 酵母菌细胞不含叶绿体。
无氧条件下生活的细菌 （厌氧性细菌）如：乳酸菌。
单细胞和多细胞 1、由于病毒寄生在活细胞中，并利用细胞中营养大量繁殖，很快会造成细胞解体死亡，引起人、动植物患病。
根霉等） • 制馒头面包、酿白酒、啤酒（酵母菌）
酵母菌
真菌与人类的关系4--- 致病
1、真菌还引起植物的病害，如小麦锈病等。 2、真菌引起人体和动物患病，如脚癣是真菌引 起的。
下图是酵母菌结构模式图，填出图中结构名称，
说说它与细菌和植物细胞相比结构上分别有哪些不同 点。
细胞壁
细胞核
细胞质 细胞膜
液泡
1、与细菌的不同点： 酵母菌有成形的细
胞核和液泡。
2、与植物细胞的不 同点：
酵母菌细胞不含叶
绿体。
真 菌
青菌
曲菌
酵母菌
蘑菇
病毒的结构特点和营养方式
1、结构特点：
还小 多数要用电子显 病毒非常微小，比细菌 真菌与人类的关系4--- 致病
酵母菌有成形的细胞核和液泡。
,
微镜才能观察到。 制米酒（曲霉、毛霉、酵母菌等）
制甜面酱（米曲霉） 、豆豉（米曲霉、毛霉、 黑根霉等）
2、病毒也有有益之处，如
结构简单，没有细胞结构 蛋白质和遗传 2、结构特点：
寄生生活，只能 有成形的细胞核，核质外有核膜包被。
2、与植物细胞的不同点：
寄生在特定生物的活细胞中。
【全版】生物的多样性演示文稿推荐PPT
生物多样性受威胁现状
人类进入工业化时代时，只8.5亿人，与地球 上差不多已达到最大多样化的其他生命共同拥有地 球，今天，人口增长的速度极快，而生物多样性则 锐减。生物多样性的降低主要表现在以下几个方 面：
一、世界物种数量急剧减少
自从40亿年前地球出现生命以来，绝灭已成为生命过程的必然 事实，从那时至今，曾经生存过几十亿个物种，而绝大部分都灭绝了。 今后100年内，地球上30～70％的植物将消失。过去的灭绝都是自然 过程所致， 而今天人类毫无疑问地是物种灭绝的主要原因。
森林在哭泣！！！
云南热带雨林每年以50万亩速度消失
热带雨林破坏的结果
全世界有50﹪的生物都是在热带雨林中生活的， 但人类却以每秒大约一个足球场那么大的面积破坏 热带雨林。而且，还有树木生长的速度永远比不上 人类破坏的速度，也就是说：以后世界上的树木会 越来越少这种行为会危害到每一个在地球上的生物
1、栖息地的丧失和片段化 2、掠夺式的过度利用 3、环境污染 4、外来物种的大量引进或侵入
热带雨林的大量砍伐，
造成物种栖息地的丧失
疾病之苦（如，调节气候、洪水和病虫害）。
疾病之苦（如，调节气候、洪水和病虫害）。
美丽的热带园林景观 生物多样性衰减的原因是多方面的，有自然过程、人为因素、
野生生物种类繁多，人类对它们已经做过比较充分研究的只是极少数，大量野
过度利用造成生物资源的退化
野生生物一旦减少了，生态系统
生生物的使用价值目前还不清楚。
（湖泊中“大个子”鱼减少；
“生物入侵”是指某种生物从外地自然传入或人为引种后成为野生状态，并对本地生态系统造成一定危害的现象。
“生物入侵”是指某种生物从外地自然传入或人为引种后成为野生状态，并对本地生态系统造成一定危害的现象。
微生物多样性总结课件PPT
第二章 微生物多样性
Chapter 2 Microbial Diversity
第一节 什么是微生物多样性
1.1 微生物多样性概念
生 物 多 样 性 (biodiversity) 这 个 单 词 是 一 个 新 创 造 的 组 合 词 ， 由 生 物 (bio)和多样性(diversity)组合而成。biological diversity由托马斯·拉夫卓 伊(Thomas Lovejoy)于1980年提出，而biodiversity则由昆虫学家威尔逊 (E. O. Wilson)于1986年在国家研究委员会(National Research Council, NRC)举办的首次美国生物多样性论坛报告中提出。
-cell shapes: rods, cocci, spirals, filaments,amorphous, star-shaped, squares,…… -cell organization: multicellular from pairs and tetrads to filaments, sheets, rosettes, microbial mats,…… -cells size: average 1 to 5 microns range 0.1 to 660 microns (Thiomargarita namibiensis , giant sulfur bacteruim
454技术以平均序列读长240bp遥遥领先于同系列高通量测序仪，而序列平均读长在基因组测序拼接过程中至关重要。
Margalef 物种丰富度指数的计算公式为：
图2-1 间接法和直接法总DNA提取
❖ 生he态ter多ot样ro性ph（s: Ecacorbloo环gnicisa境lodbi因vtaeirn素seitdy）from organic compounds
Chapter 2 Microbial Diversity
第一节 什么是微生物多样性
1.1 微生物多样性概念
生 物 多 样 性 (biodiversity) 这 个 单 词 是 一 个 新 创 造 的 组 合 词 ， 由 生 物 (bio)和多样性(diversity)组合而成。biological diversity由托马斯·拉夫卓 伊(Thomas Lovejoy)于1980年提出，而biodiversity则由昆虫学家威尔逊 (E. O. Wilson)于1986年在国家研究委员会(National Research Council, NRC)举办的首次美国生物多样性论坛报告中提出。
-cell shapes: rods, cocci, spirals, filaments,amorphous, star-shaped, squares,…… -cell organization: multicellular from pairs and tetrads to filaments, sheets, rosettes, microbial mats,…… -cells size: average 1 to 5 microns range 0.1 to 660 microns (Thiomargarita namibiensis , giant sulfur bacteruim
454技术以平均序列读长240bp遥遥领先于同系列高通量测序仪，而序列平均读长在基因组测序拼接过程中至关重要。
Margalef 物种丰富度指数的计算公式为：
图2-1 间接法和直接法总DNA提取
❖ 生he态ter多ot样ro性ph（s: Ecacorbloo环gnicisa境lodbi因vtaeirn素seitdy）from organic compounds
微生物学-微生物分类及多样性 PPT
生物系统学
以进化论为指导思想，追溯系统发育，推断进 化谱系，对生物物种进行识别和归类。
微生物分类学
是研究微生物分类理论和技术方法的学科。
微生物分类
在对大量微生物进行观察、分析和描述的基础 上，以形态、结构、生理生化反应和遗传特征的异 同为根据，按进化的规律和应用的方便，分门别类 的排列成一个系统。
快速、自动化微生物检测仪器设备
依据：微生物化学组成、结构、性能 差别；代 谢过程不同、产物特异；能量转移、信息传递有差异； 与环境的关系不同。
主要仪器设备
通用：气相色谱、液相色谱、质谱、X射线衍色、 核磁共振波谱仪、激光拉曼光谱仪、激光显微镜等。
专用：阻抗测定、放射测量、微量量热计、生物 发光测量仪、药敏自动测量仪、自动微生物检测仪。
系统树中，分枝末端及连结点为结，代表生物类群； 末端结代表仍生存的种类；结之间的长度表示分子序列的 差异数值。主要采用有根树，有起源及进化方向。
常采用最节省分析法或简约法：进化变化的发生，沿 最短的途径，发生最少的变化。
细菌
Phylogenetic Trees from DNA Sequences
• Distance-Matrix Method for generating the trees
• Evolutionary Distance (ED)
• Computer compare the sequence differences and build the phylogenetic tree based on corrected ED
3. rRNA的顺序和进化
序列测定和分析方法：寡核苷酸编目法，全序列分析 法。
寡核苷酸编目法：采用rRNA酶解片断、标记、电 泳及自显影技术，然后按片断大小进行编目。只获得 部分序列，采用相似性统计方法，结果会出现偏差。
认识生物多样性PPT课件
你认为这与基因多样性有
就会使子代出现遗传性 疾病。因此，种内的基
关系吗？
因多样性，对物种的延
续有着重要意义。
基因多样性的减少会带来危害吗？
数据报告
我国已知种数 世界已知种数 百分比/%
哺乳动物
581
4342
13.39
鸟类
1244
8730
14.25
爬行类
376
6300
5.97
两栖类
284
4010
7.08
•
7、学习文学而懒于记诵是不成的，特别是诗。一个高中文科的学生，与其囫囵吞枣或走马观花地读十部诗集，不如仔仔细细地背诵三百首诗。——朱自清
•
8、一般青年的任务，尤其是共产主义青年团及其他一切组织的任务，可以用一句话来表示，就是要学习。——列宁
•
9、学习和研究好比爬梯子，要一步一步地往上爬，企图一脚跨上四五步，平地登天，那就必须会摔跤了。——华罗庚
建立自然保护区
武 夷 山 自 然 保 护 区
扎 龙 自 然 保 护 区
卧
扬
龙
子
自
鳄
然
自
保
然
护
保
区
护
区
环境保护的法律法规
第二章 野生动物保护 第八条 国家保护野生动物及其生存环境禁止任何单位 和个人非法猎捕或者破坏
第三章 野生动物管理 第二十条 在自然保护区、禁猎区和禁猎期内禁止猎捕 和其他妨碍野生动物生息繁衍的活动
•
3、学和行本来是有联系着的，学了必须要想，想通了就要行，要在行的当中才能看出自己是否真正学到了手。否则读书虽多，只是成为一座死书库。——谢觉哉
•
4、教学必须从学习者已有的经验开始。——杜威
认识生物的多样性PPT课件
10000至12000 850---940 260000
百分比 百 已 分知
13.39 比 种 14.25 是 类
我的 5.97 国 百 7.08 已 分
知数 20.3 种裸子植物） 占世界的百分比最高，由此我国被称为 （裸子植物的故乡）比，脊椎动物较高有 （鱼 类） （哺乳动物） （鸟类）， 都位于世界前列，这些数字都说明了我国是生物种类 （最丰富） 的国家之一。
生物种类 （已知）
植物 30多万 动物 150多万 细菌、真菌 10多万
2021/10/10
4
类群 哺乳动物 鸟类 爬行动物 两栖动物 鱼类 蕨类植物 裸子植物 被子植物
我国已知种类 581 1244 376 284
3862 2200至2600
约 240 30000
世界已知种类 4342 8730 6300 4010 19056
在表现，基因多样性是内在形式； b. 某种生物的数量减少或灭绝，必然会影响它所在的生态系统。 c.生态系统的剧烈变化，会加速物种多样性和基因多样性的丧失。
2021/10/10
25
二、基因的多样性 A、基因多样性的涵义
问题1：形成金鱼和狗差异的根本原因是什么？
答：不同物种细胞内的（基因）差异很大。
2021/10/10
9
问题2.三条金鱼的体色和形态都各不相同，为什么？
答：同一物种的不同个体，细胞内的 基因 也有差异。
每种生物都是一个丰富的基因库；物种的多样性实质
是基因的多样性。物种的多样性是外在表现，基因多样性是内在
了生态系统类型和生态系统结构成分的多 样性。
2021/10/10
22
资料1：位于大别山的某县，曾经是森林茂密，鸟兽众多，气候 宜人的地方。后来人们毁林开荒，耕种作物，破坏了当地动物 的栖息环境，致使林中鸟类和哺乳动物大大的减少，有的甚至 消失。这说明了什么？
百分比 百 已 分知
13.39 比 种 14.25 是 类
我的 5.97 国 百 7.08 已 分
知数 20.3 种裸子植物） 占世界的百分比最高，由此我国被称为 （裸子植物的故乡）比，脊椎动物较高有 （鱼 类） （哺乳动物） （鸟类）， 都位于世界前列，这些数字都说明了我国是生物种类 （最丰富） 的国家之一。
生物种类 （已知）
植物 30多万 动物 150多万 细菌、真菌 10多万
2021/10/10
4
类群 哺乳动物 鸟类 爬行动物 两栖动物 鱼类 蕨类植物 裸子植物 被子植物
我国已知种类 581 1244 376 284
3862 2200至2600
约 240 30000
世界已知种类 4342 8730 6300 4010 19056
在表现，基因多样性是内在形式； b. 某种生物的数量减少或灭绝，必然会影响它所在的生态系统。 c.生态系统的剧烈变化，会加速物种多样性和基因多样性的丧失。
2021/10/10
25
二、基因的多样性 A、基因多样性的涵义
问题1：形成金鱼和狗差异的根本原因是什么？
答：不同物种细胞内的（基因）差异很大。
2021/10/10
9
问题2.三条金鱼的体色和形态都各不相同，为什么？
答：同一物种的不同个体，细胞内的 基因 也有差异。
每种生物都是一个丰富的基因库；物种的多样性实质
是基因的多样性。物种的多样性是外在表现，基因多样性是内在
了生态系统类型和生态系统结构成分的多 样性。
2021/10/10
22
资料1：位于大别山的某县，曾经是森林茂密，鸟兽众多，气候 宜人的地方。后来人们毁林开荒，耕种作物，破坏了当地动物 的栖息环境，致使林中鸟类和哺乳动物大大的减少，有的甚至 消失。这说明了什么？
第6节物种的多样性(PPT课件(初中科学)23张)
三、生物物种的多样性
没有人能确切地知道地球上到底有多少种生物。 到目前为止，所发现的生物种类已超过 175 万。 它们形态各异，遍布地球的每个角落。
从幼嫩的小草到参天的大树，从水中的游鱼到 天上的飞鸟，从肉眼看不见的细菌和病毒到庞 大的蓝鲸和大象，从栽培作物、驯鹰养动物到人 类自身，都可以感受到种类繁多、多姿多彩的 生物世界。
3．视察草履虫的外形和细胞结构，并将在显微镜下实际视察 到的草履虫的形态结构画在上面的方框内。
4．视察草履虫运动，运动时通常哪一端在前？
草履虫
纤毛 口沟 食物泡 胞肛 伸缩泡
食物残渣 排出废物 消化食物 摄取食物 运动
食物泡
大核 小核
伸缩泡 口沟 纤毛
食物泡 胞肛
草履虫与衣藻相比，两者的细胞结构和食物来源 有什么不同？
酵母菌
硅藻
眼虫
变形虫
衣藻、草履虫、变形虫、酵母菌、细菌等单细胞生物既是一个 细胞，也是一个完整的生物体。 为什么?
它们具备了生命的基本特征:
如摄食、排出废物、能对环境变化产生反应、能生长和繁育、 具有遗传变异现象等。
一、单细胞生物
特点： ①个体微小 ②全部生命活动在一个细胞内完成
衣藻
是一种单细胞的藻类，
动，其细胞结构如图所示。衣藻属于植物，是
因为其具有（ D ）
A、鞭毛
B、伸缩泡
C、细胞核 D、叶绿体
3、下图为衣藻结构示意图。
（1）判断衣藻属于植物，主要因为它的 细胞结构中有：_叶__绿__体___。 （2）衣藻的全部生命活动在一个细胞内完 成，因此衣藻又属于_单__细__胞___生物。
（3）根据细胞学说的内容可知，衣藻细胞 是由_细__胞__分__裂___产生的。
生物的多样性及其保护PPT教学课件
我 国
１、物种丰富。我国是世界上野生生物 物种最丰富的国家之一。
生 ２、特有和古老的物种多。许多稀有古
物 老的物种都能在我国找到。
多
样 ３、经济物种丰富。我国有许多具有很
性
高经济价值的野生生物，有几十种
特
农作物及家养动物起源于我国。
点 ４、生态系统多样。海洋、沼泽、江
河、湖泊、高山、平原、沙漠等各
动物需要以特定的生物为食物，同时它的发展 又需要相应的生物来制约它；植物需要特定的动物 来为它传粉、散播种子，还需要各种微生物将不能 利用的有机物分解为无机盐以便重新利用。各种生 物共同维持生态系统的结构与功能。
野生生物的灭绝或严重减少将导致生态系统稳 定性的破坏，甚至造成生态灾难。
多种多样的生物共 同维持生态系统的 结构与功能
式各样的生态系统为各种生物提供
ቤተ መጻሕፍቲ ባይዱ
了必要的生存环境。
我 国
１、物种丰富。我国是世界上野生生物 物种最丰富的国家之一。
生
２、特有和古老的物种多。许多稀有古 老的物种都能在我国找到。
物
多
３、经济物种丰富。我国有许多具有很 高经济价值的野生生物，有几十种
样
农作物及家养动物起源于我国。
性 ４、生态系统多样。海洋、沼泽、江
我 国
１、物种丰富。我国是世界上野生生物 物种最丰富的国家之一。
生 ２、特有和古老的物种多。许多稀有古
物 老的物种都能在我国找到。
多
样 ３、经济物种丰富。我国有许多具有很
性
高经济价值的野生生物，有几十种
特
农作物及家养动物起源于我国。
点 ４、生态系统多样。海洋、沼泽、江
河、湖泊、高山、平原、沙漠等各
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16
多样性分析
样本采集 分离纯化
形态察
菌种鉴定
系统发育 多相分类学鉴定
菌种保藏
代谢产物分析
斜面保藏 甘油保藏 冷冻干燥保藏
17
形态、大小、染色、运动性、鞭毛和荚膜
表达 特征
生理生化(API 50CH) 酶学(API ZYM)
表型
脂肪酸
化学
多
分类
醌
相
分
部分
类
基因组
16S rDNA序列同源比对
学
鉴
2
• 1 研究背景、目的及意义
3
1.1 研究背景
4
5
全世界胡杨林分布图
50 3 0
6
7
8
1.2 研究目的：
• 1 ) 对胡杨内生细菌进行筛选、纯化，用现代分子 生物学方法进行分子鉴定，阐明胡杨内生细菌的 多样性分布和种群结构。
• 2 ) 进行16S rDNA鉴定和构建进化树来确定它们 之间的亲缘关系，可以得知在塔里木河中游胡杨 内生细菌多样性。
19
2.4 特色与创新
特色
本研究选取的样点是世界保存较完整、较偏僻、 未受人类活动污染的自然胡杨林保护区。 首次对具有耐盐碱、耐热、耐旱、耐寒、耐贫瘠 特性的胡杨树中抽出茎杆液进行内生细菌的多样 性分析。
20
• 创新
• 1）首次对胡杨茎杆内生细菌进行研究，初步阐明 胡杨内生细菌的多样性和种群结构。
• [8]Bowen, G.D., Rovira, A.D., 1991. In: Waisel, Y., Eschel, A., Kafkafi, U. (Eds.), Plant Roots: The Hidden Half. Marcel Dekker, New York, pp. 349–388.
13
2019/9/16
14
2 . 研究内容、技术路线及可行 性
15
• 2.1 研究内容
从塔里木河中游胡杨林区废弃的Vgan河和Kiyik古 河道两岸的原始胡杨作为采样目标，抽出胡杨茎秆液， 然后用三种培养基（TSA,LB,NA）进行细菌的分离、 纯化和鉴定，分析在盐含量高、干旱的土壤环境中胡 杨内生细菌种类的多样性，对潜在的新种进行多相分 类学鉴定。
• 3 ) 对潜在新种进行多相分类学鉴定，确定其进化 地位。
9
采样地点
· 尉犁
卡尔曲尕
Vgan河 Kiyik河
10
采样地点
11
12
1.3 研究意义
• 1）首次探讨胡杨茎杆液内生细菌的种群结构和分 布状况。
• 2）阐述干旱、地下水面比较低的环境下胡杨树内 生细菌种类的多样性。
• 3）研究具有潜在应用价值的菌株及其特色产物。 • 4）进一步探索胡杨内生细菌的抗菌和抗虫机制。
遗传型
定
全基
DNA相似性（杂交）
因组
G+C （摩尔百分含量）
系统发育 16S rDNA序列进化分析确定进化地位
18
2.3 可行性分析
1）本研究采用的实验方法和技术路线都是非常 成熟的。 2）我们实验室可以提供完成本研究的相关条件。 3）本人在微生物学和分子生物学理论方面知识扎 实，查阅了大量的文献，在导师、师兄和师姐的 指导下，积累了丰富的实验经验。这为我实验的 顺利进行奠定了理论和实践基础。
• [9] Chaintreuil, C., Giraud, E., Prin, Y., Lorquin, J., Baˆ, A., Gillis, M., de Lajudie, P., Dreyfus,B., 2000. Photosynthetic Bradyrhizobia are natural entophytes of the African wild rice Oryza breviligulata. Appl. Environ. Microbiol. 66, 5437–5447.
• 2）对分析胡杨内生菌的多样性提供新的数据。 • 3）对特色菌株进行精确的分类学鉴定。
21
3. 预期结果
• 1)初步鉴定塔河中游胡杨内生细菌的生态分布及 优势种。
• 2)期待发现1-2株新种或新纪录种。 • 3)向GenBank注册细菌16SrDNA序列≥30个。 • 4)拟发表文章1-2篇。
22
4. 实验计划
• 2009年4月-2009年5月 采样 • 2009年5月-2009年6月 查阅文献 • 2009年6月-2010年1月 分离纯化与保种 • 2010年1月-2010年5月 分子鉴定 • 2010年5月-2010年6月 多样性分析 • 2010年6月-2010年9月 拮抗菌株的筛选 • 2010年9月-2011年2月 特色产物分析 • 2011年2月-2011年5月 实验结果分析及数据处理，撰写
潜在应用价值. 中国药学杂志, 2001,36(1): 14−15 . [5] 杨瑞先,陈立军,等.油菜内生细菌种群多样性分析.西北农林科技大 学学报(自然科学版),2005:33 . • [6]乔海莉; 田呈明; 骆有庆; 冯晓峰; 孙建华; 赵新丽 .新疆天然胡杨林 土壤微生物多样性的研究 .北京林业大学学报.2007: 5.
24
[7] Shimizu M, Nakagawa Y, Sato Y, et al. Studies on endophytic • actinomycetes (I): Streptomyces sp. isolated from • Rhododendron and its antifungal activity? J Gen Plant • Pathol, 2002, 66(4): 360−366.
2008级硕士研究生毕业论文开题报告
塔河中游胡杨内生细菌的分离 鉴定及多样性分析
姓 名 ：卡依尔·玉素甫 指导教师 ：艾尔肯·热合曼 教授 专 业 ：微生物 研究方向 ：资源微生物
资源微生物实验室
1
报告内容
• 1 研究背景、目的及意义 • 2 研究内容、技术路线及可行性 • 3 预期结果 • 4 研究计划 • 5 参考文献
论文 • 2011年5月-2011年6月 送审论文，毕业答辩
23
5.参考文献
• [1] 杨海莲,孙晓璐.宋末.植物内生细菌研究.微生物通报, 1998,25(4):224- 226.
• [2] 赵东红,陆玲,秦怀兰.一种微生物发酵产蓝色素的稳定性及毒研究. 食品与发酵工业,1998,24(5).
• [3] 东秀珠, 蔡妙英. 常见细菌系统鉴定手册. 北京: 科学出版社, 2001. • [4] 谷苏, 邵华, 蒋晓华, 等. 药用植物内生真菌多样性及其活性成分的
多样性分析
样本采集 分离纯化
形态察
菌种鉴定
系统发育 多相分类学鉴定
菌种保藏
代谢产物分析
斜面保藏 甘油保藏 冷冻干燥保藏
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形态、大小、染色、运动性、鞭毛和荚膜
表达 特征
生理生化(API 50CH) 酶学(API ZYM)
表型
脂肪酸
化学
多
分类
醌
相
分
部分
类
基因组
16S rDNA序列同源比对
学
鉴
2
• 1 研究背景、目的及意义
3
1.1 研究背景
4
5
全世界胡杨林分布图
50 3 0
6
7
8
1.2 研究目的：
• 1 ) 对胡杨内生细菌进行筛选、纯化，用现代分子 生物学方法进行分子鉴定，阐明胡杨内生细菌的 多样性分布和种群结构。
• 2 ) 进行16S rDNA鉴定和构建进化树来确定它们 之间的亲缘关系，可以得知在塔里木河中游胡杨 内生细菌多样性。
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2.4 特色与创新
特色
本研究选取的样点是世界保存较完整、较偏僻、 未受人类活动污染的自然胡杨林保护区。 首次对具有耐盐碱、耐热、耐旱、耐寒、耐贫瘠 特性的胡杨树中抽出茎杆液进行内生细菌的多样 性分析。
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• 创新
• 1）首次对胡杨茎杆内生细菌进行研究，初步阐明 胡杨内生细菌的多样性和种群结构。
• [8]Bowen, G.D., Rovira, A.D., 1991. In: Waisel, Y., Eschel, A., Kafkafi, U. (Eds.), Plant Roots: The Hidden Half. Marcel Dekker, New York, pp. 349–388.
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2019/9/16
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2 . 研究内容、技术路线及可行 性
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• 2.1 研究内容
从塔里木河中游胡杨林区废弃的Vgan河和Kiyik古 河道两岸的原始胡杨作为采样目标，抽出胡杨茎秆液， 然后用三种培养基（TSA,LB,NA）进行细菌的分离、 纯化和鉴定，分析在盐含量高、干旱的土壤环境中胡 杨内生细菌种类的多样性，对潜在的新种进行多相分 类学鉴定。
• 3 ) 对潜在新种进行多相分类学鉴定，确定其进化 地位。
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采样地点
· 尉犁
卡尔曲尕
Vgan河 Kiyik河
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采样地点
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1.3 研究意义
• 1）首次探讨胡杨茎杆液内生细菌的种群结构和分 布状况。
• 2）阐述干旱、地下水面比较低的环境下胡杨树内 生细菌种类的多样性。
• 3）研究具有潜在应用价值的菌株及其特色产物。 • 4）进一步探索胡杨内生细菌的抗菌和抗虫机制。
遗传型
定
全基
DNA相似性（杂交）
因组
G+C （摩尔百分含量）
系统发育 16S rDNA序列进化分析确定进化地位
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2.3 可行性分析
1）本研究采用的实验方法和技术路线都是非常 成熟的。 2）我们实验室可以提供完成本研究的相关条件。 3）本人在微生物学和分子生物学理论方面知识扎 实，查阅了大量的文献，在导师、师兄和师姐的 指导下，积累了丰富的实验经验。这为我实验的 顺利进行奠定了理论和实践基础。
• [9] Chaintreuil, C., Giraud, E., Prin, Y., Lorquin, J., Baˆ, A., Gillis, M., de Lajudie, P., Dreyfus,B., 2000. Photosynthetic Bradyrhizobia are natural entophytes of the African wild rice Oryza breviligulata. Appl. Environ. Microbiol. 66, 5437–5447.
• 2）对分析胡杨内生菌的多样性提供新的数据。 • 3）对特色菌株进行精确的分类学鉴定。
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3. 预期结果
• 1)初步鉴定塔河中游胡杨内生细菌的生态分布及 优势种。
• 2)期待发现1-2株新种或新纪录种。 • 3)向GenBank注册细菌16SrDNA序列≥30个。 • 4)拟发表文章1-2篇。
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4. 实验计划
• 2009年4月-2009年5月 采样 • 2009年5月-2009年6月 查阅文献 • 2009年6月-2010年1月 分离纯化与保种 • 2010年1月-2010年5月 分子鉴定 • 2010年5月-2010年6月 多样性分析 • 2010年6月-2010年9月 拮抗菌株的筛选 • 2010年9月-2011年2月 特色产物分析 • 2011年2月-2011年5月 实验结果分析及数据处理，撰写
潜在应用价值. 中国药学杂志, 2001,36(1): 14−15 . [5] 杨瑞先,陈立军,等.油菜内生细菌种群多样性分析.西北农林科技大 学学报(自然科学版),2005:33 . • [6]乔海莉; 田呈明; 骆有庆; 冯晓峰; 孙建华; 赵新丽 .新疆天然胡杨林 土壤微生物多样性的研究 .北京林业大学学报.2007: 5.
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[7] Shimizu M, Nakagawa Y, Sato Y, et al. Studies on endophytic • actinomycetes (I): Streptomyces sp. isolated from • Rhododendron and its antifungal activity? J Gen Plant • Pathol, 2002, 66(4): 360−366.
2008级硕士研究生毕业论文开题报告
塔河中游胡杨内生细菌的分离 鉴定及多样性分析
姓 名 ：卡依尔·玉素甫 指导教师 ：艾尔肯·热合曼 教授 专 业 ：微生物 研究方向 ：资源微生物
资源微生物实验室
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报告内容
• 1 研究背景、目的及意义 • 2 研究内容、技术路线及可行性 • 3 预期结果 • 4 研究计划 • 5 参考文献
论文 • 2011年5月-2011年6月 送审论文，毕业答辩
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5.参考文献
• [1] 杨海莲,孙晓璐.宋末.植物内生细菌研究.微生物通报, 1998,25(4):224- 226.
• [2] 赵东红,陆玲,秦怀兰.一种微生物发酵产蓝色素的稳定性及毒研究. 食品与发酵工业,1998,24(5).
• [3] 东秀珠, 蔡妙英. 常见细菌系统鉴定手册. 北京: 科学出版社, 2001. • [4] 谷苏, 邵华, 蒋晓华, 等. 药用植物内生真菌多样性及其活性成分的