PubMed外文数据库检索
6.数据库检索外文 Pubmed医学专业研究生必看

3、关键词与主题词检索
Pubmed的关键词检 索有何特别? 有了Pubmed的特色 功能还要主题词检索 作什么?
为什么还要强调主 题词检索?
2
3 4
只要用主题词 检索就足够了 吗?
1
(1)为什么还要强调主题词检索?
• 主题词是在关键词的基础上经过规范化处理的,就是在文 献存储时,对文献中的同义词、近义词、多义词等进行严 格的控制与规范,使得同一主题概论的文献相对集中在一 个主题词之下。
• Publisher-Supplied
出版商提供的电子文献题录,每条记录标有:
[PubMed-as supplied by publisher],分为两类: – MEDLINE 收录,逐步转为In Process, Indexed状态。 – Not MEDLINE:PubMed 收录,MEDLINE不收录, 一直标注[PubMed-as supplied by publisher]或 [PubMed]
检索键
只查重点论述的文献
系统自动扩展检索下位词, 勾选后不检索下位词
(4)只要用主题词检索就足够了吗
• 不是每个词都有对应的主题词 • 没有主题标引的文献不可以用主题词检索 ----如何识别主题标引的文献 策略:根据实际需求选择,最好的是使用主 题词与关键词相结合
4、值得推荐的功能与资源
1. 2.
特点
• • • • • • • • 资源免费 收录广泛 更新迅速 数据权威 检索方便 检索结果精准 个性化定制功能丰富 外部分析工具功能强大
是目前使用最广泛、影响力最大的生物医学信息资源检索系统。
• MEDLINE Indexed
1966 to prensent的MEDLINE已标引数据, 有MeSH字段和摘要,每条记录标有: [PubMed-indexed for MEDLINE]
PubMed数据库检索系统

Author address [AD] Author [AU] Language [LA] Journal Title [TA] EC/RN Number [RN] MeSH Major Topic [MAJR] MeSH Subheadings [SH] MeSH Terms [MH] PubMed检索方式 [PT] Text Words Publication Type [TW] Title [TI] Title/Abstract PubMed主要提供以下几种检索方式:[TIAB]
(五)引文匹配
提供通过已知的文献线索,查询特定文献的 摘要、作者、文献题目等信息。包括单篇引文匹配 和成匹引文匹配两个界面。
检索Tang BK在《Biochemical Pharmacology》 杂志第29卷第14期上发表的文章 。 要求: 用单篇引文匹配检索。
2 . 限定检索(Limits)
可以进行各种字段限定及其它的限定检索。以进一步 缩小检索范围。 包括:作者限定;期刊限定;文献发表时间;文献研 究对象、性别年龄划分;文献语种;数据库子段;文献类 型以及拟检索字段限定等。
进 行 限 制 后 只 能 检 索 medline 中 的 内 容 , “ in
PubMed接入
网址: /pubmed
/pubmed
1. 简单检索( Go)
在此可以进行任意词语的检索。如自由词、人名
、主题词、期刊名称等,系统会进行自动转换和匹配 ,并显示检索结果。 简单检索界面允许实现检索词的逻辑组配、截词 (*) 、字段限定和短语等检索,但逻辑组配需用大写( AND;OR;NOT)。
process” and “supplied by publisher”因还没有进 行字段制作,不能检索到。
[医学]第五章(1) PUBMED外文医学期刊文献检索
![[医学]第五章(1) PUBMED外文医学期刊文献检索](https://img.taocdn.com/s3/m/2dce36120912a216147929d3.png)
/pubmed/
检索词输入框
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PubMed记录唯一识别号PMID
PubMed记录的四种来源
1.MEDLINE 是PubMed记录的主要来源,标注为[PubMedindexed for MEDLINE]。
2.In-process citations 是系统为加快文献的报道速度,将尚未标 引MeSH主题词、文献类型的最新文献记录先存入临时库中, 待完成加工处理后再转入MEDLINE的记录,标注为[PubMedin Process]。
MEDLINE是一个数据库,是美国国立医学图书馆(The National Library of Medicine,NLM)创建的国际性综合生物医学信息书目数据库,是当前国际上最权 威的生物医学文献数据库。内容包括美国《医学索引》(Index Medicus,IM)的全部 内容和《牙科文献索引》(Index to Dental Literature)、《国际护理索引》 (International Nursing Index)的部分内容,涉及基础医学、临床医学、环境医学、 营养卫生、职业病学、卫生管理、医疗保健、微生物、药学、社会医学等领域。 MEDLINE收录1966年以来世界70多个国家和地区出版的4000余种生物医学期刊 的文献,近1400万条记录。目前每年递增30-35万条记录,以题录和文摘形式进行 报道,其中75%是英文文献,70%-80%文献有英文文摘。
概况
网址:/pubmed 或 /pubmed 或 (com; org; net)
由美国国立医学图书馆(National Library of Medicine - NLM)国家生物技术信息中心( National Center for Biotechnology Information NCBI)向因特网用户提供免费MEDLINE检 索服务(1997-6-26)
PUBMED数据库检索

学信息书目数据库MEDLINE的免费网络版。
内容包括美国《 Index Medicus》、《
Index to Dental Literature》、《
International Nursing Index》和部分生命 科学领域的期刊文献。
(一)PUBMED概述
主题词检索
PUBMED的基本检索
PubMed首页缺省界面即为基本检索界面;
PubMed检索系统具有自动词语转换匹配功能。
检索举例:检索有关鼻衄研究方面的文献。
nosebleed
Stomach cancer diet
Stem cell research[ta]
Stem cell research
PUBMED的主题词检索
进入主题词检索界面的几种方法,既如何进
入MeSH Database查询界面。
主题词的加权检索、扩展检索以及与副主题
词之间的匹配。
主题词注释。
West nile virus
检索示例
检索阿司匹林治疗心肌梗死的文献。
Myocardial infarction
PUBMED的高级检索
PubMed高级检索可实现多字段检索;
可以实现布尔逻辑运算;
可以对检索式进行管理。
检索举例
检索有关Wnt信号与干细胞(stem cell)调空
方面的研究文献。
Wnt Stem cell
PUBMED的限定检索
PubMed提供的过滤器(Filters)用于对检索
法的异同。
外文期刊全文数据库检索
第三军医大学图书馆:李彭元 联系电话:752063 E_mail:libripy@
pubmed检索系统

(三)高级检索
#2 #1
逻辑与 逻辑或 逻辑非 删除 显示结果
检索历史
清除检索史
显示细节
保存到NCBI
点击查看检索结果
例:检索高血压护理方面的文献
hypertension
例:检索高血压护理方面的文献
例:检索高血压护理方面的文献
Hype压护理方面的文献
(四)强制检索:“gastric ulcer”
(五)截词检索:antidod*
(六) 字段限定检索:blood[ta]、blood[so]
( 七) 逻辑组配检索:由左至右、或and优先
(二)主题词检索
主题词 检索词对应的主题词,而非文献 主题词注释信息 检索生成器选项
∨ 副主题词: 限定检索主 题词某一方 面的文献
Zhonghua cancer wai ke za zhi
同时输入多个检索条件
(一)基本检索:智能检索
西咪替丁治疗胃溃疡
Stomach ulcer 主题词 Gastric ulcer Cimetidine
文本词
拆 分
自动转换匹配功能
对输入的有实际意义的检索词、短语,系统会自动进行词
语的匹配转换,并返回检索结果。
一、简 介
收录1865年以来80多个国家和地区出版的39个文种的5600 余种期刊的生物医学文献2200多万篇。内容覆盖医学、护理、 牙科、兽医、卫生制度与医疗保险、临床前科学等。
现收录期刊5600余种,美国占47%,39个文种,英文文献
90%,80%有英文摘要, 70%可链接全文,17%免费获取全文。
(二)
缺点:
主题词检索
PubMed系统中只有MEDLINE数据库中的记录进行了主题 词标引,所以主题词检索只对MEDLINE中的记录有效, 而PubMed中其他来源的记录不支持主题词检索,因此,
pubmed检索英文文献的步骤

pubmed检索英文文献的步骤要进行PubMed检索英文文献,可以按照以下步骤进行:1. 访问PubMed网站,打开浏览器,输入"/pubmed",进入PubMed网站的首页。
2. 定义研究主题,明确你感兴趣的研究主题,可以是某个特定的疾病、医学领域或者其他相关主题。
3. 使用关键词进行检索,在PubMed首页的搜索框中输入与你的研究主题相关的关键词。
关键词应该是具体而明确的,以便缩小搜索范围。
4. 高级搜索选项,如果你想进一步精确搜索结果,可以使用高级搜索选项。
点击搜索框旁边的"Advanced"按钮,可以在更多的搜索字段中输入关键词,如作者、期刊、出版日期等。
5. 筛选搜索结果,当你点击搜索按钮后,PubMed将会显示与你关键词相关的文献列表。
可以根据自己的需要使用筛选选项来缩小搜索结果的范围,如出版日期、文章类型、文献来源等。
6. 阅读摘要和全文,在搜索结果中,你可以点击文章标题或摘要以获取更多信息。
摘要通常提供了文章的简要概述,帮助你判断是否与你的研究主题相关。
有些文章可能提供免费全文,可以直接阅读,而有些文章可能需要付费或订阅才能获取全文。
7. 下载文献,如果你找到了感兴趣的文献,可以选择下载或保存文献的选项。
这样你就可以在离线状态下阅读或打印文献。
8. 引用和相关文献,在每篇文献的页面上,你可以找到该文献的引用和相关文献。
这些引用和相关文献可能对你的研究有帮助,可以进一步扩展你的文献检索范围。
9. 检索历史和搜索提醒,PubMed还提供了检索历史和搜索提醒的功能。
检索历史可以帮助你回顾之前的搜索记录,搜索提醒可以让你及时获取最新的相关文献。
总结起来,PubMed检索英文文献的步骤包括访问PubMed网站、定义研究主题、使用关键词进行检索、使用高级搜索选项、筛选搜索结果、阅读摘要和全文、下载文献、查找引用和相关文献,以及利用检索历史和搜索提醒功能。
外文医学文献检索工具Pubmed、SCI模板

1.1 什么是PubMed?
❖ 创建机构:美国国立医学图书馆(NLM)下设的美国生物技 术信息中心(NCBI)
❖ 摘要型(Abstract)的数据库, 提供文献的线索 ❖ 特色:免费、收录广、内容全、检索途径多、检索体系完备
、文摘库、部分文献可以免费获得全文 ❖ 整合在NCBI的统一检索平台Entrez上,与该平台其他数据库
• 用户利用一个MeSH词能找出所有有关该主题的文献 – 不同拼写:leukemia(s), leukaemia(s)→leukemia – 同义词: cancer(s), tumor(s), tumour(s), neoplasm(s) →neoplasms
3.3 MESH主题词检索
➢ 一篇文章可有多个MeSH词 ➢ 主题词可以组配相应的副主题词 ➢ 主题词的树状结构表:系统默认对含有下位概念的主题词进
2.3 期刊检索
二是利用期刊字段限定检索,其输入规则是:在刊名之后 加上刊名字段符。 例如:Cancer RES[TA]。
三是通过“Advanced”中的“Journal”,可以检索该刊 发表的文献。
四是通过“Journals in NCBI Databases”,查找到该刊 后,再选定该刊,发送到检索框进行期刊检索。
2.4 短语精确检索
❖对检索词加上双引号(英文状态)进行强制检索 ❖短语精确精确检索时,Pubmed关闭自动词语匹配功能 ❖例如:检索框中输入“traditional Chinese medicine”, PubMed将“traditional Chinese medicine”作为一个不可 分割的短语在数据库的所有可检索字段中进行检索。
➢ 如果单词数量大于600,则PubMed自动提示延长词干。 ➢ 截词功能只限于单词,对词组无效。
外文医学文献检索工具Pubmed、SCI

1.2 PubMed的发展历程
1997198319711879-
PubMed网络数据库 Medline光盘数据库 Medline联机检索系统 Index Medlcus(IM)检索期刊
1.3 PubMed的收录范围
收录全世界80多个国家5200多种生物医学期刊的文摘及题 录数据,涉及40多个语种
• 用户利用一个MeSH词能找出所有有关该主题的文献 – 不同拼写:leukemia(s), leukaemia(s)→leukemia – 同义词: cancer(s), tumor(s), tumour(s), neoplasm(s) →neoplasms
3.3 MESH主题词检索
一篇文章可有多个MeSH词 主题词可以组配相应的副主题词 主题词的树状结构表:系统默认对含有下位概念的主题词进
1.3 PubMed的收录范围
部分文献可直接获取全文,包括
Pubmed Central(PMC,收录期刊780余种);NLM开发 的免费生物医学数字化期刊全文数据库
开放获取(Open Acess,OA)期刊 部分出版商提供的免费文献
1.4 PubMed的记录来源
MEDLINE Indexed
• 逻辑运算符号的顺序为从左至右,可以 用全括号来改变其运算顺序。
2.7 限定检索
• 限定检索功能是对上一次检索操作结果进行限定。 • 限定检索将限定在MEDLINE数据库中进行。限定检索结
束后,需要将限定取消,点击“Clear all”。 • 选择条件就是点击选中限定选项。 • PubMed可限定内容包括:字段、文献类型、语种、日期
外文生物医学文献检索工具的使用技巧与策略
——Pubmed与SCI
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- 2、"仅部分预览"的文档,不可在线预览部分如存在完整性等问题,可反馈申请退款(可完整预览的文档不适用该条件!)。
- 3、如文档侵犯您的权益,请联系客服反馈,我们会尽快为您处理(人工客服工作时间:9:00-18:30)。
大部分为英语语种的文献,其中我国大陆期刊80多
种。
二、MedLine数据库使用形式
MedLine CD-ROM 由出版商将数据库制成了光盘,然后邮寄给用户 。 不同出版商的数据库检索界面略有不同,我国主要 引进Ovid(原Silver Platter)公司产品。检索界面与 CBMdisc类似。
PubMed的主体部分,记录末尾标有[PubMed-indexed for MedLine]。 (2)PreMedline
临时性的医学数据库,收录最新出版的文献,缩短文献报 道时差。PreMedline中的记录每天有进有出,新进的记录标有 [PubMed-in process],标引好主题词和文献类型等字段的记录 转入Medline。
检索区 主要功能区 辅助功能区
二、PubMed主页简介
1.检索区 位于主页上方,通过点击数据库栏列表中PubMed旁
边的下拉菜单,根据实际检索需要可以更改数据库(主 要用来检索的数据库有:all database、PubMed、 Protein、Nucleotide、GSS、EST、Structure、Genome 等),高级检索(Advanced ),点击Help可查看检索帮 助,在检索式输入框中输入检索式,点击“Search”按 钮,可执行检索操作。
PMID(PubMed Unique Identifier)号,用PMID号可快 速检索到该ID号对应的文献。
提纲
一.PubMed概述 二.PubMed主页简介 三.PubMed检索规则 四.PubMed的检索途径和方法 五.PubMed的检索结果处理
二、PubMed主页简介
PubMed主页面分为3部分 1. 检索区 2. 主要功能区 3. 辅助功能区
论文的原文语种是英语?
一、PubMed概述
3.学科范围 主要收录生物医学学科方面的论文,涉及基础
医学、临床医学、护理学、口腔医学、兽医学、营 养卫生、药理和药剂学、预防医学、卫生管理、医 疗保健和情报科学等领域,
一、PubMed概述
4. 数据来源
PubMed中的数据来源于以下四个部分: (1)Medline
1.PubMed的由来
1879年 ,Index Medicus(IM) 1964年 ,MEDLARS(Medical Literature Analysis and
Retrieval System,医学文献分析与检索系统) 20世纪80年代 ,MEDLINE CD-ROM
20世纪90年代,PubMed
一、PubMed概述
4. 数据来源
(3)Publisher Supplied Citations 是出版商直接向PubMed递送的电子文献,记录标记:
[PubMed-as supplied by publisher]。 (4)OldMEDLINE
目前含有1951-1965年的150多万条题录,不含有摘要,保 持旧版MeSH词表的标引。记录标记:[PubMed-OLDMEDLINE]。
网址:/pubmed/;也可 由Google搜索引擎链接进入(搜索词为PubMed)。正如其 名字PubMed=Public+Medicine所暗示,从1997年起完全免 费。
PubMed是检索外文医药文献最主要的题录数据库。
PubMed主页
一、PubMed概述
注意:以上4种数据来源中,只有第(1)和第(4) 来源的记录标 引了MeSH词,因此当用主题词检索时可检索出来,而第(2)和 第(3)来源的记录则未做MeSH词标引(是最新和最近发表的文 献),因此用主题词检索时不能检索到。
一、PubMedБайду номын сангаас述
5. PMID号 PubMed中的每条记录都有一个唯一的识别号,即
PubMed
提纲
一.PubMed概述 二.PubMed主页简介 三.PubMed检索规则 四.PubMed的检索途径和方法 五.PubMed的检索结果处理
一、PubMed概述
PubMed由美国国立医学图书馆(NLM)的国家生物技 术信息中心(NCBI)开发的Entrez检索系统中最常用数据 库,主要用于检索MedLine。
二、PubMed主页简介
2. 主要功能区: 包括Using PubMed、PubMed Tools和More Resources三部分。
1)Using PubMed 主要介绍如何使用PubMed,分为PubMed Quick Start
Guide、Full Text Articles、PubMed FAQs、PubMed Tutorials和New and Noteworthy共5个部分。 其中: PubMed Quick Start Guide:
PubMed外文数据库检索
一、MedLine数据库简介
数据库类型为题录型数据库,其内容与印刷型检索
工具Index Medicus(美国医学索引,IM)、Index to Dental Literature(牙科文献索引)、 International Nursing Index(国际护理学索引)。
一、PubMed概述
2.文献收录范围及更新 收录从1947年以来80多个国家39种语言的约4800种期刊,
文献总量达到2100多万篇。约92%是英文刊物,约82%有英文 摘要。部分可直接获取全文(来自PMC及OA期刊)。
每周5天更新数据。由于近年来许多出版商通过电子期刊 平台发布预出版的论文(记录标记为Epub 或[Epub ahead of print]),因此PubMed中的文献甚至要早于最新出版的纸本期 刊。
二、MedLine数据库使用形式
PubMed(=Public+Medicine) 是美国家医学图书馆(NLM)下属的国家生物技术信息中心(NCBI) 开发的、基于WWW的因特网检索系统PubMed。 包括 MEDLINE和PREMEDLINE的完整内容。它还包括一些被 MEDLINE认为超出范围的文章和杂志。因此 PubMed 是比 MEDLINE 的更大的集合。