PubMed数据库 研究生2020 公开课课件

加双引号 短语检索
"oxygen free radicals"[All Fields]
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4、字段检索 限定字段检索更专指
Pubmed的记录字段有60多个 格式：检索词[字段标识符] 例：hepatitis[ti]不再扩展主题词
Smith c[au] Aids[so] Review[pt] 2002[dp]
PubMed数据库
一、PubMed数据库简介 二、PubMed 数据来源 三、PubMed 记录字段
四、PubMed检索功能 五、检索结果的处理 六、免费注册，个性化功能
一、PubMed 简介
• PubMed系统是由美国国立医学图书馆附属美国 国立生物技术信息中心National Center for Biotechnology Information ( NCBI)1997年开发的
• 由于自然语言存在大量的一词多义、一义多词、单复数 变化等现象，这就给读者查找文献带来了很大困难。
• 主题词将自然语言转换成规范化的人工语言，一个语词 只表达一个概念，一个概念只用一个词语来表达。保证 一词输入，多词命中，提高文献查全率。
• MeSH的主要就是起到规范化作用，保证文献的作者、标 引者和检索者在用词上的一致。
支持基本检索的规则和技术 查看检索历史 构建检索式,选择检索字段
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构建检索式,选择检索字段
选择字段
检索史
主题词检索（MeSH Database）
自然语言检索的缺点：
人为的缩小：相同概念的多种说法
人为地扩大：输入的关键字可能命中文章某处，但并 非文章重点
《医学主题词表》（Medical Subject Heading，简称MeSH）
每一篇文献标引了医学主题词（MeSH）
文献时间：1946年---
2、In process citation，临时性医学文献数据库，由正在 加工处理之中的文献记录组成。 其数据经过标引后向 MEDLINE移加。
3、Publisher supplied citation，出版商提供的电子版文 献，未被MEDLINE收录的期刊
格式：姓全称+名缩写 smith J[au]
2002年以后文献可用姓名全称检索
7、期刊名称检索 ▪ 刊名全称 (e.g., molecular biology of
the cell) ▪ 刊名缩写 (e.g., mol biol cell) ▪ ISSN号 (e.g., 1059-1524)
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Author Index
作者索引表
检索词拆分 AND
系统自动将关键词和 主题词组合检索
No Mapp来自百度文库ng
自动转换匹配主题词
默认AND连接
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3、精确检索
针对特定的短语和词组的检索，需要在短语或者词 组上用双引号引起来。如“single cell”， “oxygen free radicals”，作为一个不可分割词组 在全部字段中检索，系统不进行自动转换匹配,避 免自动匹配时将短语拆分造成误检，提高查准率
输入几个词，默认为AND组配关系 从左到右顺序检索，括号优先
2、自动词语匹配 PubMed对输入检
索框中的检索词进行 自动转换匹配，将其 逐步地与其数据库中 的各类词表核对 、转 换、匹配
MeSH Translation Table
主题词注释表
Journals Translation Table
期刊注释表
E Analytical…… 诊断治疗技术与设备
F Psychiatry…… 精神病与心理学
……
MeSH表的树状结构
上、下位主题词
SubHeadings 副主题词
对一个主题词的某个方面进行修饰限定的词，又称限 定词。提高查准率。本身无独立检索意义
例如，hepatitis b这个主题词涉及到的病因、病理、 诊断、治疗、微生物学等多个方面。
副主题词与主题词的组配不是随机的，而是有一 定规则的。如“诊断”、”治疗“不可与药物、 生物等主题词组配，只能组配疾病类主题词。
使用MeSH查询文献的步骤：
1、将查询需求化为具体的陈述句。 2、从这个陈述句中，抓出主要概念，作为查询关键字。 3、将这些关键字分别放到MeSH Database 中，比对出
5、截词检索
在词干的末尾加“*”号，PubMed就会检 索出以该词为词根的所有的词。截词检 索将关闭自动词语匹配功能。
输入bacter*，可检出bacteria、 bacterium、 bacterial…等词的文献 截词功能只限于单词，对词组无效。
6、作者姓名检索
西方人姓名书写格式： First name、Last name
目前 28000多个主题词
部分文献记录不支持主题词检索
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MeSH表的树状结构
树状结构表：根据每个主题词的词义范畴和学科属性，将全 部主题词分门别类地归入16大类，又依次细分多个级别的 类目，最多到11级）
A Anatomy
解剖学
B Organisms 生物体
C Diseases
疾病
D Chemicals&Drugs 化学物质与药物
如果期刊名称正好是一个MeSH中的词， (e.g, Gene Therapy, Science, or Cell)，建 议期刊检索使用期刊字段标识[ta](刊名 字段)。否则系统会将其作MeSH词进行 检索或在所有字段中进行检索。
molecular biology of the cell
高级检索
三、记录的字段
供检索和显示字段60多个
四、PubMed 检索功能
• 基本检索 • 高级检索 • 主题词检索 • 其他检索途径
期刊数据库检索、特定文献检索、临床查询
基本检索
1、逻辑运算符(and or not) 复合检索
AIDS AND therapy AIDS OR Acquired Immunodeficiency Syndrome Hepatitis NOT Animal
全球免费的基于网络的生物医学文献数据库。
• 有收录范围广、内容全、检索途径多、检索体 系完备等特点，部分文献还可在网上直接免费获
得全文
• 内容涉及：临床、基础医学、药学、牙医学、 护理学、公共卫生、营养、兽医学等专业
二、数据来源
1、MEDLINE ：主体
收录70余个国家5600多种生物医学期刊的题录、文摘和部分 全文，是世界上最权威的医学数据库