PubMed 数据库使用介绍

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pubmed数据库操作

pubmed数据库操作

基本检索
自动词语匹配检索 著者检索 期刊检索 截词检索 词组检索
布尔逻辑检索
基本检索
截词检索: 可通过在词干后加“*”检索以 该词干开头的所有词的文献。
需要注意的是:截词检索将关闭PubMed的 自动单词匹配功能以及Mesh主题词的扩展检索功 能 。如:输入heart attack*,不会启动自动匹配 功能检索与之匹配的Mesh主题词“Myocardial Infarction”及其下位更专指的主题词的相关文献。
高级检索
PUBMED的Advanced Search页面整合了 多种对检索有用的辅助功能,可实现如下操作:
• Searching by a specific field • Browsing the index of terms • Combining searches using history • Displaying the search details
nature
Searching by a specific field
高级检索
PUBMED的Advanced Search页面整合了 多种对检索有用的辅助功能,可实现如下操作:
• Searching by a specific field • Browsing the index of terms • Combining searches using history • Displaying the search details
基本检索
自动词语匹配检索 著者检索 期刊检索 截词检索 词组检索
布尔逻辑检索
基本检索
以作者姓全称加名首字缩写的格式输入姓名, PubMed通过自动匹配自动在作者字段进行检索。
可通过在姓名前后加双引号并加作者字段标识 [au] 关闭该功能,如:“Smith J”[au]

一PubMed数据库简介

一PubMed数据库简介
?clinicalalerts公布nih资助重要临床研究结果?clinicaltrials对公众提供临床科研的当前信息?pubmedcentral可免费提供全文生命科学文献服务功能pubmedpubmed在检索框中键入一到多个检索词按go键即显示检索结果
一、PubMed数据库简介
PubMed是美国国家医学图书馆(NLM)下属 的 国 家 生 物 技 术 信 息 中 心 (NCBI) 开 发 的 、 基 于WWW的医学数据库查询系统。
图1
其它库 NCBI其它数据库的相关记录:
PubMed建立了与NCBI其他数 据库之间联系。它们是双向网 络互连的关系(见下页图)。
NCBI中通过Entrez可互查的数据库
三、PubMed页面的结构
登录 PubMed主页
/entrez/query.fcgi /PubMed/
PubMed的网址: /pubmed
特点:收录范围广、内容全、检索途径多、 检索体系完备,可少部分获取原文。
P75
二、通过PubMed可检索 到如下的信息
MEDLINE PreMedline 出版商提供的书目信息 NCBI其它数据库的相关记录
MEDLINE:是美国国立医学ቤተ መጻሕፍቲ ባይዱ书馆
检索Common Cold AND Vitamin C
preview1
五、 PubMed辅助检索工具(三)
3. History:
保留所有的检索策略和结果,只有在执行了一次检索后, History才能有记录。 显示检索序号、检索词、检索时间以及检索结果数量。 可在检索序号之间添加逻辑运算符进行检索,如#2 AND #6 单击记录条数超级链接可以重新显示检索结果。 点击Clear History按键可以清除History和Preiew/Index中的 信息。 最多存贮检索式数为100个,检索式的存贮时间为1小时。

pubmed的使用

pubmed的使用

第3章 PubMed检索PubMed是因特网上最著名的免费Medline数据库,是由美国国立医学图书馆的生物信息技术中心(National Center for Biotechnology Information ,NCBI)提供的,其网址为:/PubMed/。

该系统于1997年开始使用,与以往的Medline 光盘数据库相比,它具有收录范围广、更新速度快、界面友好等特点,并且由于NCBI与多家出版商达成协议,出版商在期刊出版之前或在期刊出版的同时,将期刊论文题录提供给PubMed, 通过部分文献的链接可到达出版商的网站,从而获取相应期刊的全文。

3.1 PubMed的收录范围PubMed的数据主要有4个部分,即Medline、OLDMEDLINE 、In Process Citations、Record Suppled by Publisher。

Medline:与我们通常使用的Medline数据库收录的范围、年代、内容相同,但数据更新速度较快。

OLDMEDLINE:收录了1950-1965年间的美国医学索引(IM)中的题录。

In Process Citations:是一个临时性的数据库,收录准备进行标引的题录和文摘信息,每天都在接受新的数据,进行文献的标引和加工,每周把加工好的数据加入到Medline中,同时从In Process Citations库中删除。

In Process Citations中的记录标有[PubMed- in process]的标记。

Record supplied by publisher:出版商将期刊文献信息电子版提供给PubMed后,每条记录都标有[PubMed- as supplied by publisher]的标记,这些记录每天都在不停地向In Process Citations库中传送,加入到In Process Citations后,原有的标记将改为[PubMed- in process]的标记。

使用pubmed进行检索的方法

使用pubmed进行检索的方法

使用pubmed进行检索的方法使用Pubmed进行文献检索的方法摘要:本文介绍了使用Pubmed进行文献检索的方法。

Pubmed是一个免费的、全球最大的生物医学文献数据库,提供了大量的生物医学文献资源。

通过合理使用关键词、筛选条件和检索策略,可以高效地找到所需的文献信息。

本文将从以下几个方面介绍如何使用Pubmed进行文献检索:关键词选择、搜索策略、结果筛选和文献阅读。

一、关键词选择在进行文献检索之前,首先要确定适当的关键词。

关键词应该与所研究的主题相关,并且能够准确地描述研究内容。

一般来说,关键词应该是具体的、明确的,避免使用过于笼统的词汇。

同时,可以考虑使用同义词或相关词汇来扩大检索范围。

在选择关键词时,可以参考相关文献或专业术语词典,确保关键词的准确性和完整性。

二、搜索策略在Pubmed的主页上,可以找到搜索框。

在搜索框中输入关键词,然后点击搜索按钮即可进行文献检索。

Pubmed提供了多种搜索界面,如简单搜索、高级搜索和专项搜索等,可以根据需要选择合适的搜索界面。

在进行高级搜索时,可以根据文献类型、发表日期、作者、期刊等条件进行筛选。

此外,还可以使用布尔运算符(如AND、OR、NOT)来组合关键词,以进一步缩小或扩大检索范围。

三、结果筛选Pubmed的搜索结果页面会列出符合检索条件的文献列表。

为了准确地找到所需的文献,可以根据以下几个方面进行结果筛选。

首先,可以根据发表日期范围来筛选文献,以获取最新的研究成果。

其次,可以根据文章类型进行筛选,如原始研究、综述、临床试验等。

此外,还可以根据作者、期刊等信息进行筛选,以找到权威的研究成果。

四、文献阅读找到符合要求的文献后,可以点击文献标题或摘要,进而查看详细信息。

Pubmed提供了文献的摘要、作者、期刊、关键词等信息,可以帮助读者快速了解文献内容。

如果需要获取全文,可以查看文献的链接或通过图书馆等渠道获取。

在阅读文献时,要注意文献的质量和可信度,同时可以根据需要进行进一步的文献检索和引用查找。

2网上医学数据库(pubmed)

2网上医学数据库(pubmed)

PubMed页面的结构
检索提问区相关数据库链接、 检索提问框 、辅助检索工具
辅 助 功 能 区
Entrez简介、 PubMed服务、 特有检索、相 关资源
检索提示区
对各项检索功能的简单描述
PUBMED中常用的字段
Tag Name Tag Name AB Abstract AD Affiliation AU Author TI Title CN Corporate Author DPPublication Date EDAT Entrez Date FAU Full Author Name GS Gene Symbol IP Issue IS ISSN JID NLM Unique ID LA Language UID Unique Identifier PMID PMID MH MeSH Terms MHDA MeSH Date PG Pagination PL Place of Publication PMID PubMed Unique Identifier PT Publication Type RF Number of References RN EC/RN Number SO Source TA Journal Title Abbreviation VI Volume
sore各种显示方式的Fra bibliotek要内容1、Summary 2、Brief 3、Abstract 4、Citation 5、MEDLINE
各种显示方式的主要内容
6、ASN.1 7、Text 8、Protein links——可显示链接到蛋白质数据库 相关蛋白质的超链。 9、Nucleotide links——可显示链接到核苷酸数 据库相关基因的超链。 10、Structure links——可显示链接到结构数据 库中相关结构的超链。 11、Genome links——链接到相关基因组。

PubMed使用教程指南

PubMed使用教程指南

引言概述
PubMed是一个公认的医学文献数据库,由美国国家医学图书馆(NLM)开发和维护。

这个教程指南是第二部分,旨在深入介绍如何使用PubMed数据库来检索医学文献,并提供一些高级功能和技巧。

正文内容
一、使用MeSH(医学主题词)进行高级检索
1.了解MeSH的概念和分类体系
2.使用MeSH浏览器来查找和浏览主题词
3.利用MeSH词汇筛选器进行高级检索
4.使用MeSH树进行链式搜索
5.了解MeSH组合词的使用方法
二、使用文献筛选器和高级检索器
1.使用高级检索器来限定检索结果
2.利用文献筛选器进行精确的文献检索
3.使用搜索历史和搜索详情来追踪检索过程
4.利用查询器来创建复杂的检索语句
5.使用MeSH流行趋势来了解当前研究热点
三、利用搜索工具和文献管理器
1.使用索引工具来查找文章的相关信息
2.使用MyNCBI创建和管理文献收藏夹
3.使用单击目录搜索相关文献
4.使用外部工具和来获取全文和其他资源
5.使用CitationMatcher进行文献引用的匹配
四、了解首选项和界面定制
1.个性化设置首选项和搜索界面
2.添加和删除搜索工具和菜单
3.自定义搜索结果的显示格式
4.创建个人帐户并管理订阅邮件和提醒
5.利用网站帮助和文献教育资源进行学习和培训
五、了解常见问题和解决方案
1.如何处理搜索结果过多或过少的情况
2.如何处理重复文献和非相关文献
3.如何使用布尔运算符进行复杂的检索
4.如何处理缺失的全文和报告
5.如何解决其他常见问题和疑问
总结。

pubmed检索步骤 -回复

pubmed检索步骤 -回复

pubmed检索步骤-回复Pubmed是世界上最大的医学文献数据库之一,提供了大量的生物医学文献资料,包括期刊文章、会议摘要、学位论文等。

Pubmed的使用可以帮助研究人员快速检索到相关的医学文献,有效地支持他们的科研工作。

本文将介绍使用Pubmed进行文献检索的步骤,并以"乳腺癌治疗的最新进展"为例进行说明。

第一步:进入Pubmed网站首先,我们需要打开网页浏览器,输入"第二步:选择搜索关键词在Pubmed的首页上,我们可以看到一个搜索框。

输入"乳腺癌治疗的最新进展"作为关键词进行搜索。

在这里,我们需要注意的是,关键词的选择应该准确反映我们所关注的研究主题,以便能够检索到相关的文献。

第三步:筛选搜索结果点击搜索按钮后,Pubmed会根据关键词进行检索,并列出包含这些关键词的文献列表。

在这里,我们可以看到大量的搜索结果。

为了筛选出最相关的文献,我们可以使用Pubmed的搜索筛选工具。

在搜索结果页面的左侧,有一栏搜索筛选工具。

我们可以根据不同的筛选条件,比如出版日期、文章类型、研究主题等进行进一步的筛选。

以乳腺癌治疗的最新进展为例,我们可以选择筛选条件为"出版日期",选择"最近五年",以获取最近的研究进展。

第四步:查看摘要和全文在筛选出相关的文献后,我们可以点击文献标题或摘要,进一步查看文献的详细信息。

在这里,我们可以通过查看摘要了解到文献的研究内容、方法和主要结论。

如果我们对某篇文献特别感兴趣,想要获取全文信息,可以通过点击链接或按钮,获取全文或者转至相关网页。

然而,需要注意的是,Pubmed并不提供所有文献的全文,有些文章可能需要通过其他渠道获得。

第五步:导出文献信息在Pubmed上查到的文献信息可以方便地导出到其他文献管理软件,如EndNote等。

在详细信息页面,Pubmed提供了一个"导出"按钮,点击后可以选择导出格式,然后将文献信息导出到所选的文献管理软件中。

pubmed使用方法

pubmed使用方法
内容涉及:医学、药学、牙医学、护理学、卫生保健、兽医学 等专业。
MEDLINE的数据均进行过主题词标引,其可以使检索结果更加 准确和全面。 记录标注[PubMed - indexed for MEDLINE]
简介
PreMEDLINE是一个临时性医学文献数据库。它 每天都在不断地接受新数据,并进行加工(主 题标引等),加工完成后每周向Medline数据库 进行添加。
PubMed检索2000年以来有关65岁以上老人阿尔 茨海默病(Alzheimer Disease)死亡率(mortality) 的多元分析 (meta analysis)文献
65 meta analysis 2000 Alzheimer Disease mortality
检索结果处理
检索结果显示、保存 检索结果的过滤 全文获取 My ncbi个性化服务
检索结果的处理
在文献管理软件中对结果进行分析、标准化处理等
过滤器(filter)的使用演示
全文的获取
全文的链接:提供电子全文的链接 免费的全文链接: Open Access、 PMC 无电子全文的,提供馆藏链接
Entrez平台 (/Entrez/)
Entrez资源整合系统可 检索NCBI提供的30余 个数据库,且系统内数 据库间广泛多项联系, 这种联系可通过检索结 果中Link连接实现。
Entrez平台
Entrez所包含的数据库类型多样,基因序列、结构、文献、基 因组等有机结合。
sensitive search,查全率较高)与特异性(narrow,specific search,
查准率较高)
Finding Systematic Reviews
提供systematic reviews、meta analysis、reviews of clinical trials、
  1. 1、下载文档前请自行甄别文档内容的完整性,平台不提供额外的编辑、内容补充、找答案等附加服务。
  2. 2、"仅部分预览"的文档,不可在线预览部分如存在完整性等问题,可反馈申请退款(可完整预览的文档不适用该条件!)。
  3. 3、如文档侵犯您的权益,请联系客服反馈,我们会尽快为您处理(人工客服工作时间:9:00-18:30)。

Copyright ©2006
Evidence Based Medicine Center,Lanzhou University
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二、PubMed收录范围(1)
(一)MEDLINE
——全世界70多个国家和地区的4800余种生物医学期刊 ——自1966年至今数据1400万余条 ——内容每周更新一次,内容涉及医学、护理学、牙科学、兽医学、 卫生保健和前临床科学等。 ——标识[PubMed - indexed for MEDLINE] ——1950 年到1965年全世界生物医学期刊 ——目前数据大约200多万条 ——标识[PubMed - OLDMEDLINE for Pre1966] ——1996年8月开始增加该数据库,只提供基本的引文信息和文摘, ——每天更新,经过标引以后进入MEDLINE,并从PreMEDLINE 中删除这些记录。 ——标识[MEDLINE in process]
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2、主题检索(MeSH Database)
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四、PubMed检索
∮ 在 浏 览 器 地 址 栏 输 入 /pubmed, 获得PubMed 一般检索界面 / PubMed主 页。 ∮ PubMed 系统检索范围为 MEDLINE 数 据库和PreMEDLINE数据库。
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三、PubMed 系统的主要特点(3)
(二)截词检索功能 ——允许使用“*”号作为通配符进行截词检索。如:键入“bacter *”, 系统会找到那些前一部分是bacter的单词(如bacteria,bacterium, bacteriophage等),并对其分别进行检索。 ——如果这类词少于150个,PubMed会逐词检索,若超过150个, PubMed将显示如下警告信息:“Wildcard search for‘term*’used only the first 150 variations.Lengthen the root word to search for all endings”。 ——截词功能只限于单词,对词组无效。如:“infection*”包括 “infections”,但不包括“infection control”等。 ——使用截词功能时,PubMed系统会自动关闭词汇转换功能。 (三)强制检索功能 ——允许使用双引号(“”)来强制系统进行短语检索。例如“Single cell”,系统会将其作为一个不可分割的词组在数据库的全部字段中进行 检索。 ——使用双引号检索,会自动关闭词汇转换功能。 (四)PubMed系统允许使用布尔逻辑检索,但要在提问框中键入布尔逻辑 运算符(AND,OR或NOT),但布尔逻辑运算符必须大写。如: vitamin c OR zinc。
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副主题词
限定主要概 念词
扩展检索
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—包括MeSH词、参见词、副主题词等 —在该表中发现了与检索词相匹配的词,就会自动将其转换为相应 的MeSH词和Text Word词。例如:“Vitamin h”— “Biotin [MeSH Terms] OR Vitamin h [Text word]”
2.刊名转换表(Journal Translation Table)
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单/多引文 匹配检索 临床询问
专题查询
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Stomach cancer
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主题词检索
期刊查询
在研研究 查询
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1、基本索
Stomach cancer
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PubMed
马 彬
兰州大学循证医学中心 教育部循证医学网上合作研究分中心
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一、PubMed简介
※由美国国立医学图书馆(NLM)附属的 国立生物技术信息中心(NCBI)研制 的基于Web的文献数据库。 ※是NCBI检索系统数据库之一。 ※检索服务具有收录范围广、内容全、 检索途径多、访问速度快等优点。
—包括刊名全称、MEDLINE形式的缩写和ISSN号 —该转换表能把键入的刊名全称转换为“MEDLINE缩写[Journal Name]”后进行检索,例如:“new england journal of medicine”— “N Engl J Med [Journal Name]”
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(二) OLDMEDLINE
(三)In Process Citations
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二、PubMed收录范围(2)
(四)Publisher Supplied Citation
——接受出版商提供的文献数据,这种数据带有[MEDLINE record in process]的说明,其标识为[Record as supplied by
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三、PubMed 系统的主要特点(4)
(四)链接功能
☞链接相关文献 ☞链接NCBI(National Center for Biotechnology Information)数据库 ☞链接外部资源 PubMed提供从检索结果到期刊全文、生 物学数据、序列中心等的链接。 ☞链接相关图书 点击“ Books”,可参考相关书籍的文 摘页。 ☞ PubMed向用户提供期刊的缩写名称和ISSN号。
——键入的词语未在上述各表中找到相匹配的词,或者键入的词 是一个后面跟有1~2个字母的短语,PubMed即查著者索引。 ——如果仍找不到匹配词,PubMed就会把该词断开后再重复上述 自动词汇转换过程,直到找到与键入的词语相匹配词语为止。 ——若仍然没有匹配词,单个词会被联一起(用AND)在全部字段 中检索。
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三、PubMed系统的主要特点(2)
3.短语表(Phrase list)
——包括MeSH、含有同义词或不同英文词汇书写形式的统一医学 语言系统和补充概念(物质)名称表。 ——如果PubMed 系统在MeSH和刊名转换表中未发现与检索词相 匹配的词,就会查找短词表。
4.著者索引(Author Index)
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