泉方本地PubMed检索平台简介
PubMed简介及使用说明
PubMed简介及使用说明壹、简介PubMed为美国国家医学图书馆的美国国家生技资讯中心(NCBI)所制作之生物医学相关文献的书目索引摘要型资料库，目前收录1950年以来约1400多万笔生物医学相关书目资料，并提供部分免费及付费全文连结服务，需要收费的全文，读者可自行与出版社接洽。
较之于MEDLINE资料以生物医学、生命科学、生化学、行为科学为主，PubMed 资料库范围更涵盖了如下内容：1. 对于超出学科范围(如：资讯科学、航太科学) 的特定生命科学、医学、化学相关之期刊文章都会收录于本资料库中；2. 收录即将出版的医学论文；3. 已由NLM审核通过并已由PubMed Central典藏的全文文献亦收录之。
美国国家生技资讯中心(NCBI)制作了一系列的生物医学资料库如下：1.PubMed：生物医学文献书目索引摘要资料库。
2.Nucleotide：包含GenBank、RefSeq、PDB资料库中的人类基因序列资料。
3.Protein：整合了SwissProt、PIR、PRF、PDB、GenBank及RefSeq资料库中的资料，并可参照Taxonomy资料库，了解特定种类的蛋白质的在资料库中分类状况的相关说明。
4.Structure：分子构造资料库。
5.Genome：基因组合序列资料库。
6.PopSet：可查询某族群的基因序列，了解该族群演进之相关资料。
7.OMIM：遗传学资料库。
8.Taxonomy：在NCBI基因资料库中提及的微生物的核酸或蛋白质序列的分类状况之相关说明。
9.Books：收录C. elegans II.、Introduction to Genetic Analysis. 7th ed.、ModernGenetic Analysis.、Molecular Biology of the Cell. 3rd ed.、Molecular Cell Biology. 4th ed.、Retroviruses.等六本书。
PUBMED简介
此外，PubMed系统允许用户查看被引期刊名称表，点击主页上的PubMed Journal Brower即可，PubMed向用户提供期刊的缩写名称和ISSN号。
PubMed 检索
PubMed系统检索范围：MEDLINE数据库和PreMEDLINE数据库。
1.词语（主题）检索
EDAT Entrez Date 录入PubMed系统数据库的日期
FILTER Filter 由PubMed系统链接的外部资源站点所使用的用来限
定文献的技术标识
IP Issue 期刊的期号
在PubMed主页的提问框中键入英文单词或短语（大写或小写均可后回车或点击“Go”， PubMed即使用其词汇自动转换功能进行检索，并将检索结果直接显示在主页下方。例如：键入“vitamin c common cold”后回车或点击“Go”， PubMed开始检索并将检索结果显示出来。
布尔逻辑检索允许在检索词后附加字段标识以限定检索字段（字段标识要用方括号括起来，位于检索词这后）。其检索表达式的格式为：检索词[字段标识]布尔运算符检索词[字段标识]。如：dna[ mh ] AND crick [au ] AND 1993 [ dp ]; 又如：ansthma/therapy[ mh ] AND review[ pt ] AND child, preschool[ mh ]。各种字段标识见表1。
PubMed 系统的主要特点
1.词汇自动转换功能（Automatic Term Mapping）
在PubMed主页的检索提问框中键入检索词，系统将按顺序使用如下4种表或索引，对检索词进行转换后再检索。
（1）MeSH转换表（MeSH Translation Table），包括MeSH词、参见词、副主题词等。如果系统在该表中发现了与检索词相匹配的词，就会自动将其转换为相应的MeSH词和TextWord词（题名词和文摘词）进行检索。例如：键入“Vitamin h"，系统将其转换成"Biotin [MeSH Tems] OR Vitamin h [Textword]"后进行检索。
PubMed中文使用手册
PubMed中文使用手册一、PubMed 简介PubMed 是美国家医学图书馆(NLM)下属的国家生物技术信息中心(NCBI)开发的、基于WWW 的查询系统。
PubMed 是 NCBI Entrez 数个数据库查询系统下中的一个。
PubMed 是提供免费的 MEDLINE、PREMEDLINE 与其他相关数据库接入服务，MEDLINE是一个拥有 1 亿字条的巨大数据库。
PubMed 也包含着与提供期刊全文的出版商网址的链接，来自第三方的生物学数据，序列中心的数据等等。
PubMed 提供与综合分子生物学数据库的链接与接入服务，这个数据库归 NCBI 所有，其内容包括：DNA 与蛋白质序列，基因图数据、3D 蛋白构象，人类孟德尔遗传在线。
二、页面介绍（更新很快，但其内容变化一般不大）在你的浏览器中的 URL 地址框中健入/pubmed/并单击回车键后，你将进入 Pubmed 的主页面。
如图：1. 主页面左侧框的介绍（注：Cubby 和 tutorial 为最新加入的）：MeSh Browser 你可以用它来分层浏览 MesH 表Single Citation Matcher 通过填表的形式输入期刊的信息可以找到某单篇的文献或整个期刊的内容。
Batch Citation Matcher 用一种特定的形式输入期刊的信息一次搜索多篇文献。
Clinical Queries 这一部分为临床医生设置，通过过滤的方式将搜索的文献固定在 4 个范围：治疗、诊断、病原学与预后。
Old PubMed (使用以前的 PubMed 查询方式)关于每一项的具体使用方法, 后面将会有详细介绍。
Related ResourcesOrder Documents 提供一种收费性质服务，可以使用户在当地得到文献的全文拷贝（费用与发送方式各不相同）。
Grateful Med 是对另一个 NLM 基于网络的查询系统的链接。
Grateful Med 也提供 MEDLINE的接入，并且还有一些其他的数据库如 AIDSLINE、HISTLINE 等等。
一PubMed数据库简介
些记录标引，然后转入 MEDLINE ，同时
从PreMedline中删去。
New Data
PubMed
Collect
Pre-Medline
Process
Medline
PubMed
出版商提供的书目信息：出版商
提供的是整本期刊的信息，若有
部分没有被MEDLINE收录，PubMed 仍保存，在记录中做[PubMed--as
检索提示区
对各项检索功能的简单描述
NCBI数据库
Nucleotide：DNA序列数据库
Protein：蛋白质序列数据库 Genome：基因组序列数据库 Structure：分子结构模型数据库 Popset：种群、种系发生或突变序列数据库
Taxonomy：微生物类别数据库
OMIM：人类孟德尔遗传学在线数据库。
五、 PubMed辅助检索工具（二）
2. Preview/Index： Preview是对检索结果进行预览，显示检索结果的
条数和最近三次检索式，用户可根据具体情况在 检索提问框中用逻辑运算符组配新的检索式。 Index是对提交的检索词列出按字顺排列的某一字段 的索引词表的位置和数量（括弧内），可用流动 条来回进行查看列表。选中的词高亮显示，然后 选择合适的逻辑运算符进行检索。
杂志名检索
在检索框中键入杂志全名molecular biology of the cell 也可以直接键入Medline的期刊标准缩写 形式，如：mol boil cell， 键入刊物的ISSN(国际标准出版物代码） 进行检索，如1059-1524。 Cell transplantation [ta]
一PubMed数据库简介
PubMed页面的结构
检索提问区相关数据库链接、 检索提问框 、辅助检索工具
辅 助 功 能 区
Entrez简介、 PubMed服务、 特有检索、相 关资源
检索提示区对各项检索功能的简单描述
NCBI数据库
Nucleotide：DNA序列数据库 Protein：蛋白质序列数据库 Genome：基因组序列数据库 Structure：分子结构模型数据库 Popset：种群、种系发生或突变序列数据库 Taxonomy：微生物类别数据库 OMIM：人类孟德尔遗传学在线数据库。
六、特别检索服务
Journal Browser：期刊浏览器 MeSH Browser： 主题词浏览器 Citation Matcher：单篇/多篇
引文匹配器 Clinical Queries： 临床咨询
1. Journal Browser：期刊浏览器
查找指定期刊上发表的文章。可分别以 期刊的全名或名称某个词、期刊名称在 MEDLINE 的 缩 写 或 ISSN 号 来 检 索 ； 若 点 击超链 journals with links to full-text web sites，可获取与PubMed链接提供全文的期 刊名单。
如果不希望系统将两词分开，则需要用“”把 检索词括起来，即强迫PubMed进行词组检索。 如“single cell”。
当用双引号括起词语时，PubMed将不执行自动 词语匹配功能。
四、PubMed的基本检索功能（六）
逻辑运算符检索
在检索框中输入逻辑运算符，注意要大写 ，执行顺序从左向右，可用括号来改变此 顺序。
四、PubMed的基本检索功能（二）
作者姓名检索
在检索框内按照姓+名缩写(不用标点)的 格式键入作者姓名，如Smith ja，系统会自 动在作者字段内进行检索。
pubmed检索综述
pubmed检索综述PubMed是生命科学和医学领域的一种重要文献检索工具，被广泛用于学术研究、医学实践和科学进展。
本文将深入探讨如何在PubMed上进行综述检索，以帮助研究人员更有效地获取相关文献，了解领域的最新动态。
1. PubMed简介在讨论综述检索之前，我们首先要了解PubMed的基本情况。
1.1 PubMed的来源PubMed是由美国国立医学图书馆（NLM）提供的免费文献数据库，涵盖了生物医学、生命科学和相关领域的大量文献。
1.2 PubMed的特点PubMed具有广泛的学科覆盖范围，包括医学、生物学、生物化学、药学等，是医学和生命科学领域研究者获取信息的重要工具。
2. 关键词的选择与构建在进行PubMed检索时，选择和构建合适的关键词是获取准确结果的关键。
2.1 主题词与自由词利用PubMed的主题词（MeSH词）和自由词进行关键词选择，以确保检索结果的广泛性和准确性。
2.2 同义词与扩展词考虑使用相关的同义词和扩展词，以涵盖不同表达方式的文献，提高检索的全面性。
2.3 关键词的组合合理组合关键词，使用AND、OR、NOT等逻辑运算符，构建复杂而精确的检索式，以确保检索结果符合研究目的。
3. 高级检索与筛选PubMed提供了丰富的高级检索和筛选功能，帮助研究者更精准地定位所需文献。
3.1 时间范围的设定通过设定检索时间范围，可以获取最新的研究成果，同时限制检索结果的数量。
3.2 文献类型的筛选在高级检索中，可以选择特定的文献类型，如综述、临床研究、病例报告等，以便更有针对性地获取信息。
3.3 作者、期刊和机构的限定通过指定作者、期刊或机构，可以进一步缩小检索结果的范围，确保文献的质量和相关性。
4. 利用PubMed工具优化检索PubMed提供了多种工具和功能，帮助用户更方便、更快速地进行文献检索。
4.1 My NCBI账户的建立通过建立My NCBI账户，用户可以保存检索历史、创建自定义检索、设置提醒等，提高检索的效率和个性化。
Pubmed检索系统介绍
Entrez其他主要数据库
• • • • • • • Nucleotide：核酸序列数据库 Protein ：蛋白质序列数据库 Structure: 分子结构模型数据库 Taxonomy ：生物分类数据库 Genome ：基因组数据库 Expression ：基因表达数据库 Chemical ：化学数据库
hepatitis/dt 或 hepatitis/drug therapy
• 布尔逻辑表达式 vitamin c AND hepatitis/dt • 字段限制 hepatitis[titile] 或 zhang[au]
4、基本检索
作者检索：
格式：姓全称在前，名缩写在后。 例：检索Jim Smith发表的文章 检索词： Smith J 精确检索：在检索词加“Smith J”，避免 扩展检索（ Smith Ja）
• Details：显示检索细节
4、基本检索
输入检索词：
在检索框中输入检索词（主题、 作者、刊名）、词组、句子，回车或 点击 Go 系统执行检索，将自动对 检索词进行转换，显示检索结果。
CT诊断肺癌的动物学研究
显示检索结果
限定检索动物
检索词的形式：
• • • • 单个词语 hepatitis 词组 vitamin c 截词形式 hepat* 主题词/副主题词
主题词检索策略
5-1、主题词检索方法
1. 在“基本检索”框中输入检索词后自动默认主题
词
2. 点击窗口左侧PubMed Services下的MeSH
Database
3. 点开Search窗口的下拉菜单，选择 MeSH 4. 默认主题词扩展、全部副主题词检索
6、结果显示、保存、输出
PubMed数据库检索系统
PubMed重点
PubMed数据库的建立维护机构：NCBI NLM 和NCBI的全称和中文含义 PubMed的文献收录范围 其对应的光盘数据库（MEDLINE）和印刷型 检索工具的名称（医学索引、牙科文献索引、 国际护理索引） PubMed检索方式：主题词检索、自由词检索、 索引浏览检索、字段限定检索、逻辑组配检索、 截词检索、强制检索（短语）
文献标记中除了有PMID 号和MEDLINE UI号 外，还 这部分文献记录中只有 注有[PubMed- indexed for PubMed识别码〔PMID〕, MEDLINE] 的说明。 （二）PubMed数据库来源 另外还有〔PubMed – in process〕的说明。
1．MEDLINE
MEDLINE CD
MEDLINE WEB ——PubMed
/pubmed /pubmed
一、PubMed简介
（一） 数据库建立和维护
美国国立医学图书馆下属的生物技 术信息中心（ National Center for Biotechnology Information , NCBI)建立 并维护。 文献类型：期刊论文、综述、以及与 其他数据资源链接。 特点：提供原文获取服务
举例：在检索框中输入“science”
如何查找在“science ” 杂志上发表的文献 1. 在高级检索界面 —— science 限定字段 [Journal] 2. 在期刊检索界面 —— science——选 中——send to search box——search 3. 在期刊名字的右边的 Links 按钮 —— 点击——PubMed——检索该刊中的文献
查找近10年发表在“Obstetrics and gynecology”杂志上的有关子宫内膜异位 症的临床试验文献。
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图形化显示
检索结果的图形化显示，如同一张画卷， 将文献根据出版时间和影响因子，显示在坐标 系中，方便查看各种文献。
知识图谱按钮:
知识图谱可以帮助用户分析某个研究领域内，各个研究方向从最早的一篇报道开始，到每年 关于这个研究方向的篇数等，系统把年份作为X轴坐标，篇数作为Y轴坐标，然后用线条在二维图 中连接起来形成一条曲线，从而辅助判断其研究的趋势。
系统推荐的期刊名单：
推荐度指的是用户输入的拟投稿论文的关键词在该刊的出现次数，根据文献计量学的原理，出 现的次数越多，说明该方面是该刊刊载的重点，比较适合作为拟投稿量学， 并提供期刊的科目、分区、影响因子以及中国人 发表的论文等。
循证医学临床参考数据库
本数据库是在PubMed的基础上，参考美 国国立医学图书馆运用PICO设计的检索模式开 发而成，支持PICO以及自然语言检索。
本地PubMed检索界面
继承PubMed检索语法，检索界面及检索结果 与PubMed基本一致，完全不改变用户使用PubMed 的习惯。每篇文献下面增加9个功能按钮，检索结果 右侧增加7项过滤和13项数据分析。
SCI查收按钮
SCI查收功能来源于各单位用户使用ESI 学科分析加载的数据、各单位的SCI论文榜以 及用户完善的数据等，仅供参考。
知识图谱设置按钮
主题词分类：将检索结果按学科分类，勾选某一学科，可以查看检索结果中关于某一学科的内容； 副主题词分类：副主题词是对主题词的修饰和限定，比如勾选“Therapeutic use”可以查看关于某种疾病的所有药物。 年份过滤：只显示勾选的年份的文献； 频次突变设置：突变就是突然变化，比如某个研究方向，在2005年时，发表了10篇，在2006年时发表了100篇，或 者在2010年时发表了100篇，在2011年时发表了10篇，对于这种突然暴增或暴减的情况，系统引入了突变率的设置， 用于方便的发现研究的暴发点。 高频词过滤：部分高频词，在研究中是众所周知的，勾选后可以忽略。
查询馆藏按钮
查询馆藏，如果本单位有馆藏，可显示具 体的馆藏位置，如果无馆藏，则显示国内有馆 藏的单位信息。
全文链接按钮
全文链接，可显示所有可提供该文献全文 的出版社或数据库提供商或其它文献提供机构 提供的超链接地址。
引用按钮
此处的引用，是指要把该篇文献作为自己 论文文后的参考文献的引用，本系统提供两种常 用格式：温哥华与国标。
本地PubMed简介
⑴ 系统能够提供强大的数据分析功能，包括高IF论文分析、高TC论文分析 以及统计分析（作者、期刊、年份、国家）等；并能提供多方位的过滤分析功 能，包括影响因子（IF）过滤、文献被引用次数（TC）过滤及分区过滤等； 并可以在检索结果界面查看部分文献的参考文献和被引文献列表； ⑵ 系统能够提供知识图谱功能，可以对各个学术领域，根据文献内在主题 词的增长或下降比例，结合文献的权重（包括期刊的影响因子、作者的Hindex指数等）得出该领域的发展趋势，了解世界各国主流科学家的研究方向， 并以图形化的方式将结果呈现给用户；
本地PubMed数据库简介
本地PubMed简介
PubMed\Medline由美国国立医学图书馆（NLM）、 国际MEDLARS成员（中国为第16个成员国）及合作的专业组 织共同研制开发，是目前国际上公认的检索生物医学文献最具 权威、利用率最高、影响最广的数据库，也是我国卫生部认定 的科技查新必须检索的国外医学数据库、科技部认定的国际五 大权威数据库之一。 本地PubMed检索系统是华中科技大学与济南泉方合作 开发的本地化数据库产品，本系统是在PubMed的基础上结合 SCI以及谷歌学术搜索开发而成。在检索结果界面，与美国官 网PubMed相比，具有以下特点：
⑶ 系统能够提供指纹共词矩阵分析功能，对反映文献主题内容的主题词的 共现频次进行统计分析，揭示文献内在联系、研究热点和科学结构，并可以将 各组共献主题词随时间的演进显示出来；
⑷ 检索结果可以图形化显示，在一个页面可以显示上千条的检索结果记录， 并可以根据检索结果记录的特有属性，包括文献的出版时间、期刊的影响因子 等，将不同的文献归类到不同的坐标位置，便于用户区分和使用； ⑸ 通过PubMed文献助手的互助平台，可以获取97%以上PubMed全文。
· · · · · · · · · · · · · · · · · · · · · · · · · · · · · · · · · · · · · · · · · · · · · · · · · · · · · · · · · · · · · · · · · · · · · · · · · · · · · · · · 欢迎批评指正！！
PubMed期刊导航
导航根据PubMed的期刊分类展示，可以 查看各学科下的期刊、影响因子、中科院科目、 分区以及中国人发表的文章等。
查看某一本具体的期刊
点开某一本期刊，可以查看该期刊逐年收 录的文献，以及期刊的相关信息。
PubMed最佳拟投稿期刊选择
PubMed最佳拟投稿期刊选择，可以根据 拟投论文的关键词，在所有的期刊中进行查找 最佳的拟投稿期刊。
华中科技大学与济南泉方合作开发的
· · · · · · · · · · · · · · · · · · · · · · · · · · · · · · · · · · · · · · · · · · · · · · · · · · · · · · · · · · · · · · · · · · · · · · · · · · · · · · · · · · · · · · · · · · · · · · · · · · · · · · · · · · · ·
指纹共词分析按钮
共词分析可以对反映文献主题内容的关键 词的共现频次进行统计分析，揭示文献内在联 系、研究热点和科学结构。
高IF论文分析按钮，可以查看某研究方向的高影响因子的论文
高TC论文分析按钮，可以查看某研究方向的高被引的论文
知识发现按钮
当人们的需求已经不只是简单的文献检索和文献计量，而是希望能够对这些文献进行 较高层次的处理和分析以得到关于某领域总体特征和对发展趋势的预测时，知识发现将文 献变为知识，从海量文献中找到蕴藏的知识金块，将为知识创新和学科发展作出贡献。
参考文献按钮
参考文献是对原文文后参考文献的整理， 如果某条参考文献有电子链接，则加上电子链 接的功能。
引证文献按钮
引证文献分谷歌学术的以及谷歌学术中被 PubMed收录的两部分，点击超链接可以查看 具体的引证文献。
泉方学术引用次数
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泉方云图书馆其它功能模块：
1、学科支撑平台 1.1、ESI学科分析报告 1.2、潜力学科与国内外的差距 1.3、ESI投稿指南 1.4、SCI论文榜 2、泉方学术
3、机构知识库
4、3D虚拟图书馆
5、SCI课题分析与管理
6、单位图书馆门户网站定制
ESI学科分析报告
本单位SCI论文榜
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提供可以立即阅读TBL（术语标记语言）形式的结论性意见：
新英格兰上的一篇文章表明：厄贝沙坦（irbesartan）与对照组相比不 能改善心衰病人的预后和射血指数。
泉方云图书馆手机版
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施引文献
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SCI查收按钮下的查看更多，可以看到更 加详细的SCI期刊信息，包括期刊出版社、期刊 逐年的影响因子等。
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本地PubMed简介
继承PubMed检 索语法,检索界 面及检索结果 与PubMed一致
PubMed
SCI
在期刊的影响因子上， 参考了SCI发布 的期刊引证报告JCR
在被引用的次数上， 参考了谷歌学术搜索 GS(Google Scholar)
GG
&
在检索结果上增加了 数据分析，并参考了 GoPubMed统计功能