凝胶电泳缓冲液的配制

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琼脂糖凝胶电泳 配方与步骤

琼脂糖凝胶电泳 配方与步骤

�RNA琼脂糖凝胶电泳:配制:1.0.5M EDTA(pH=8.0):100ml:称取18.61g Na2EDTA·2H2O(分子量372.24),加80ml ddH2O剧烈搅拌,用NaOH调节PH值至8.0(约需2g NaOH).高压灭菌,室温保存。

2.50×TAE loading buffer:(Tris acetate-EDTA buffer)电泳缓冲液组分:2M Tris-乙酸;100mM EDTA(pH=8.0)500mL:称121.1g Trisbase(分子量121.14),加800ml ddH2O溶解,加57.1ml乙酸和50ml0.5M EDTA溶液(pH=8.0),搅拌,ddH2O定容至500mL.室温保存。

3.1×TAE loading buffer:取20ml50×TAE,ddH2O定容至1L.室温保存。

4.100×Sybergreen:500ul:取495ul1×TAE于1.5ml离心管,加入5ul Sybergreen原液混匀,4℃锡纸避光保存。

注意:Sybergreen原液需稀释10000倍;6×DNA loading buffer上样缓冲液需稀释六倍,最终稀释倍数应不小于1×。

步骤:1.制备1%琼脂糖凝胶(大胶用70ml,小胶用50ml,我们用30ml):称0.3g琼脂糖置于100ml锥形瓶中,加入30ml1×TAE,瓶口倒扣小烧杯。

微波炉加热煮沸3次,至琼脂糖全部融化,摇匀,即成1.0%琼脂糖凝胶液。

2.胶板制备:取电泳槽内的有机玻璃内槽(制胶槽)洗干净,晾干,放入制胶玻璃板.取透明胶带将玻璃板与内槽两端边缘封好,形成模子.将内槽置于水平位置,并放好梳子.将冷却到65℃左右的琼脂糖凝胶液混匀小心地倒入内槽玻璃板上,使胶液缓慢展开,直到整个玻璃板表面形成均匀胶层.室温下静置直至凝胶完全凝固,垂直轻拔梳子,取下胶带,将凝胶及内槽放入电泳槽中.添加1×TAE电泳缓冲液至没过胶板为止.3.加样:样品制备:(10ul体系/样品槽)于0.25ml离心管中样品RNA(最后加):2ul/3ul/5ul6×DNA loading buffer:10/6=1.7ul100×Sybergreen:0.1ulDEPC水:至10ul(注意:加样前要先记下加样的顺序).分别将样品加入胶板的样品小槽内,每加完一个样品,应更换一个枪头,以防污染,加样时勿碰坏样品孔周围的凝胶面.4.电泳:加样后的凝胶板立即通电进行电泳,电压60-100V,样品由负极(黑色)向正极(红色)方向移动.电压升高,琼脂糖凝胶的有效分离范围降低.当溴酚蓝移动到距离胶板下沿约1cm处时,停止电泳.5.电泳完毕后,取出凝胶,利用科212凝胶成像系统,在紫外灯(trans UV)下观察拍照保存.DNA存在则显示出红色荧光条带.RNA完美提出应该是三条带:28,18,5.8。

琼脂糖凝胶电泳

琼脂糖凝胶电泳

琼脂糖凝胶电泳试剂:溴酚蓝指示剂点样缓冲液,电泳缓冲液(TAE),40 mmol/L Tris-乙酸,1 mol/L EDTA (配制方法:24.2克Tris碱,5.71ml冰乙酸,10ml 0.5mol/L EDTA(pH8.0),定容至5000ml),0.8% 琼脂糖凝胶(配制方法:称取琼脂糖0.4克,加入50ml TAE电泳缓冲液)实验步骤1.调节电泳槽平面至水平。

检查稳压电源与正负极的线路。

2.选择孔径大小合适的点样梳子,垂直架在电泳胶模的一端,使点样梳子底部离电泳胶模底部的距离为1.0mm。

3.制备0.8%琼脂糖凝胶,100℃水浴加热至琼脂糖融化均匀。

4.用吸管取少量琼脂糖凝胶溶液将电泳胶模四周密封好,防止浇灌琼脂糖凝胶板时发生渗透。

待琼脂糖凝胶冷却至60℃左右时,摇匀,轻轻倒入电泳胶模中,琼脂糖凝胶的厚度在3~5mm。

倒胶时要避免产生气泡,若有气泡可用吸管小心吸去。

5.琼脂糖凝胶凝固后,在室温放置20分钟,小心拔掉点样梳子和电泳胶模两端的挡板,保持点样孔的完好。

6.将电泳胶模放入电泳槽中,加入电泳缓冲液,使电泳缓冲液面高出琼脂糖凝胶表面1~2mm。

如点样孔内有气泡,用吸管小心吸出,以免影响加样。

7.将蛋白样品与1/5体积的溴酚蓝指示剂点样缓冲液混合。

上样缓冲液不仅可以提高样品的密度,使样品均匀沉到样品孔内,还可以使样品带颜色,便于上样和估计电泳时间和判断电泳的位置。

8.用微量移液器将样品小心加入加样孔内,记录样品点样秩序。

9.盖上电泳槽,开启电源开关,80V恒压电泳30-60分钟,使蛋白从负极向正极移动,电泳完毕后关闭电源,戴一次性塑料手套取出凝胶,考马斯亮蓝染色。

脱色液配制1L:600ml去离子水,无水乙醇300ml,冰醋酸100ml。

凝胶电泳缓冲液的配制

凝胶电泳缓冲液的配制

2.测序凝胶加‎样缓冲液98%去离子甲酰‎胺10mol‎/L EDTA(pH8.0)0.025%二甲苯青F‎F0.025%溴酚蓝甲酰胺:许多批号的‎试剂级甲酰‎胺,其纯度符合‎使用要求,无须再进行‎处理。

不过,一旦略呈黄‎色,则应用在磁‎力搅拌器上‎将甲酰胺与‎D owex‎XG8混合‎床树脂共同‎搅拌1小时‎进行去离子‎处理,并用Wha‎t man 1号滤纸过‎滤2次,去离子甲酰‎胺分装成小‎份,充氮存于-70℃。

3.常用的电泳‎缓冲液说明:①TBE溶液‎长时间存放‎后会形成沉‎淀物,为避免这一‎问题,可在室温下‎用玻璃瓶保‎存5×溶液,出现沉淀后‎则予以废弃‎。

以片都以1‎×TBE作为‎使用液(即1:5稀释浓贮‎液)进行琼脂糖‎凝胶电泳。

但0.5×的使用液已‎具备足够的‎缓冲容量。

目前几乎所‎有的琼脂糖‎胶电泳都以‎1:10稀释的‎贮存液作为‎使用液。

进行聚丙烯‎酰胺凝胶垂‎直槽的缓冲‎液槽较小,故通过缓冲‎液的电流量‎通常较大,需要使用1‎×TBE以提‎供足够的缓‎冲容量。

②碱性电泳缓‎冲液应现用‎现配。

③Tris-甘氨酸缓冲‎液用SDS‎聚丙烯酰胺‎凝胶电泳。

4.2×SDS凝胶‎加样缓冲液‎100mm‎o l/L Tris·HCl(6.8)200mm‎o l/L二硫苏糖‎醇(DTT)4%SDS(电泳级)0.2%溴酚蓝20%甘油不含DTT‎的2×SDS凝胶‎加样缓冲液‎可保存于室‎温,应在临用前‎取1mol‎/L贮存液现‎加于上述缓‎冲液中。

5.凝胶加样缓‎冲液使用以上凝‎胶加样缓冲‎液的目的有‎三:增大样品密‎度;以确保DN‎A均匀进入‎样品孔内;使样品呈现‎颜色,从而使加样‎操作更为便‎利,含有在电块‎中能以可预‎知速率向阳‎极泳动的染‎料。

溴酚蓝在琼‎脂糖中移动‎的速率约为‎二甲苯青F‎F的2. 2倍,而与琼脂糖‎浓度无关。

聚丙烯酰胺凝胶电泳

聚丙烯酰胺凝胶电泳

8%聚丙烯酰胺凝胶电泳
50ml配方:
30%丙烯酰胺:13.33ml
10×TBE:5ml(或者5×TBE加10ml)
TEMED:25ul
10%过硫酸铵(新鲜配制):250ul
ddH2O:补到50ml
丙烯酰胺30%为29:1(质量比,丙烯酰胺:双甲叉丙烯酰胺)
电泳槽中加入0.5×TBE
银染液的配制:
固定液: 100mL 冰乙酸加水稀释至1000mL,可重复使用;
染色液: 1g AgNO3、1. 5mL 37%甲醛, 加水至1000mL (4摄氏度预冷效果佳),可重复使用,棕色瓶存放;
显色液: 30g Na2 CO3、1. 5mL 37% 甲醛、0. 2mL Na2S2O3(10mg/mL) , 加水至1000mL;
终止液:配方同固定液,10%冰乙酸,可以用回收的固定液进行终止。

染色:
1、加入固定液固定30min,水洗5-10min;
2、加入染色液染色30min,水洗2次,每次不超过30s;
3、加入显色液显色(条带清晰即可,一般不超过5min);
4、加入终止液终止反应;
需要配制的溶液:
10%过硫酸铵:称取5g过硫酸铵溶解于50ml蒸馏水中。

37%甲醛:37ml甲醛和63ml蒸馏水混匀。

10mg/mL Na2S2O3:称取0.3g溶解于30ml蒸馏水中。

10%冰乙酸:100mL 冰乙酸加水稀释至1000mL,可重复使用。

5×TBE缓冲液:54gTris,27.5g硼酸,20ml 0.5M EDTA(pH8.0),加水定容至1升。

琼脂糖凝胶电泳缓冲液的配制

琼脂糖凝胶电泳缓冲液的配制

琼脂糖凝胶电泳缓冲液的配制附录5:琼脂糖凝胶电泳缓冲液的配制有几种缓冲液适用于天然双链DNA的电泳。

它们包括Tris-乙酸盐和EDTA缓冲液(pH8.0,TAE,也称作E缓冲液)、Tris-硼酸盐缓冲液(TBE)或Tris-磷酸盐缓冲液(TPE),工作液浓度约50nm0l/L,工作pH7.5-7.8。

各种电泳缓冲液通常配制成浓溶液存放(表5-3)。

表5-3 电泳缓冲液缓冲液工作液贮存液/LTAE 1 × 50 ×40 mmol/L Tris-乙酸盐 242 g Tris;37.2g NaEDTA.2HO; 221 mmol/L EDTA 搅拌溶解;57.1 ml冰乙酸;充分搅拌后定容至1000 ml。

TPE 1× 10 ×90 mmol/L Tris-磷酸盐 108 g Tris2 mmol/L EDTA 15.5 ml磷酸(85%,1.679)40 ml 0.5mol/L EDTA(pH8.0)TBE* 0.5 × 5 ×45 mmol/L Tris-硼酸盐 54 g Tris; 3.72g NaEDTA.2HO; 221 mmol/L EDTA 27.5 g硼酸;充分搅拌溶解后定容至1000ml。

* TBE通常作为5×或10×的贮存液配制和贮存。

这种浓的贮存液pH应为8.3左右,它在应用前稀释,并用同一种贮存液制备凝胶溶液和电泳缓冲液。

有些研究者习惯用更浓的TBE贮存液,如10×的。

但是5×的贮存液更稳定,因为贮存期间溶质不沉淀。

上述三种缓冲液都工作得很好。

三者之中TAE的缓冲容量最低,如长时间电泳会被消耗。

此时的凝胶的阳性一侧将发生酸性化,凝胶中向阳极迁移的溴酚蓝的顔色呈从蓝紫色到黄色的变化,故需定期更换缓冲液。

电泳琼脂糖凝胶的配制

电泳琼脂糖凝胶的配制

电泳琼脂糖凝胶的配制
配制电泳琼脂糖凝胶的步骤如下:
1. 准备所需材料,包括琼脂糖粉、缓冲液、电解质溶液、蒸馏水等。

2. 根据实验的需要,根据琼脂糖的浓度选择适当比例的琼脂糖粉,一般浓度为0.8-2%。

3. 将所需缓冲液加入容器中,根据实验需要选择适当的缓冲液,例如Tris缓冲液、磷酸缓冲液等。

4. 在缓冲液中加入适量的琼脂糖粉,搅拌均匀,可以使用磁力搅拌器。

5. 根据实验需要,在琼脂糖溶液中添加适量的电解质溶液,例如SDS、尿素等,用于改变凝胶的性质。

6. 使用蒸馏水将溶液补充至所需体积,同时搅拌均匀,确保溶液中无颗粒。

7. 将准备好的琼脂糖溶液加热至70-80摄氏度,使其完全溶解。

8. 静置琼脂糖溶液至室温,或者加入适量冷却剂,如冰块,以加快冷却过程。

9. 将准备好的琼脂糖溶液倒入凝胶模板中,避免气泡的产生。

10. 等待凝胶完全固化,通常需要约30分钟至1小时。

11. 凝胶固化后,根据实验需要在凝胶上形成孔洞,以供电泳样品加入。

以上是电泳琼脂糖凝胶的简要配制步骤,具体的实验条件和步骤可以根据实验的要求进行调整。

SDS-PAGE电泳相关溶液的配置

SDS-PAGE电泳相关溶液的配置

电泳相关溶液的配置:1、30%丙稀酰胺混合溶液(100ml):称取29g丙稀酰胺和1g bis丙稀酰胺,用水溶解定容到100ml,过滤,4摄氏度保存一个月。

2、5×SDS电极缓冲液:称取Tris base15.1g,甘氨酸94.g,SDS 5.g 加dH2O定容至1000ml。

3、2×样品缓冲液(10ml):甘油2ml,溴酚蓝0.0202g,1MTris·Cl (pH6.8)1ml巯基乙醇0.14ml,10%SDS 4ml。

4、染色液的配制(1000ml):用量筒分别量取250ml甲醇或者乙醇、80ml乙酸;在电子天平上称取0.125%考马斯亮蓝R250 1.25g,再将其一一加到1000ml锥形瓶中,用蒸馏水加以补足至1000ml。

加入的先后顺序为:考马斯亮蓝R250,甲醇或者乙醇,蒸馏水,乙酸。

充分混匀后进行过滤,收集滤液备用。

当过滤速度变慢时要更换滤纸,快速过滤完,不可隔夜以免影响染色效果。

5、脱色液(1000ml):用量筒分别量取250ml甲醇或者乙醇、80ml乙酸、670ml蒸馏水加入烧杯中,待溶液混和均匀后加入盛脱色液的广口瓶;备用。

收集液的SDS-PAGE分析:1、取20ul收集液,加入5×样品缓冲液5ul,在80℃水浴锅中煮5min。

分离胶配方Resolving Gel (10ml)6%8%10%12%15%H2O 5.4 4.7 4.1 3.4 2.430% acrylamide mix 2.0 2.7 3.3454x resolving-gel buffer 2.5 2.5 2.5 2.5 2.520% SDS0.050.050.050.050.0520% APS0.050.050.050.050.05TEMED0.0080.0060.0040.0040.004浓缩胶配方(10ml)H2O 6.9 ml30% acrylamide mix 1.7 ml8x stacking-gel buffer1.25 ml20% SDS0.05 ml20% APS0.05 mlTEMED0.01 ml2、按照上面配方制SDS-PAGE凝胶,安装好电泳仪,在槽中加入电极缓冲液。

电泳缓冲液的配制和琼脂糖凝胶的配制

电泳缓冲液的配制和琼脂糖凝胶的配制

电泳缓冲液的配制和琼脂糖凝胶的配制常见的电泳缓冲液为TAE缓冲液(三乙酸-乙酰胺-乙酸缓冲液)和TBE缓冲液(硼酸-三乙酸-乙酰胺缓冲液)。

下面以TAE缓冲液为例,介绍一种常见的配制方法:所需试剂及材料:1.TAE缓冲液粉末2.蒸馏水3.磷酸氢二钠(NaH2PO4)4. 乙酸(Acetic acid)5. 乙酰胺(Amp-urea)6.称量器具7.搅拌器8.常温(25°C)高精度pH计配制步骤:1.根据实验需要,计算所需配制的缓冲液的体积。

2.准备用于配制的容器,并将其清洗干净。

3.称取相应质量的TAE缓冲液粉末,加入到容器中。

4.加入适量的蒸馏水,将粉末溶解均匀。

5.将NaH2PO4(磷酸氢二钠)溶解在蒸馏水中,搅拌至溶解均匀。

6.加入乙酸和乙酰胺,搅拌均匀。

7.使用pH计测量溶液的pH值。

8.如果pH值不在所需范围内(通常为8.0),可以加入适量的乙酸或乙酰胺进行调节,直到达到所需pH值。

9.最后,使用蒸馏水将溶液体积补足至所需配制的总体积。

琼脂糖凝胶的配制方法:琼脂糖凝胶是一种常用的电泳试剂,用于分离DNA、RNA或蛋白质等生物大分子。

它的主要成分是琼脂糖(Agarose),其配制方法如下:所需试剂及材料:1.琼脂糖粉末2.TAE或TBE缓冲液3.电泳仪4.中性漂洗液(例如盆子中洗涤剂)5.温度计6.凝胶模具7.干净容器配制步骤:1.准备用于配制琼脂糖凝胶的容器,并将其清洗干净。

2.根据实验需要,计算所需配制的琼脂糖凝胶的质量。

3.将琼脂糖粉末称取出来并加入容器中。

4.加入适量的TAE或TBE缓冲液,使其覆盖住琼脂糖粉末。

5.将容器密封,并放入微波炉中加热,或者可以使用传统的加热方法,将容器放进加热水浴中进行加热。

6.加热至琼脂糖完全溶解,通常需要3-5分钟。

7.轻轻摇晃或用棒子搅拌溶液,确保溶液均匀混合。

8.将溶液冷却至约55-60°C。

在冷却过程中,可以使用温度计不断监测温度。

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2.测序凝胶加样缓冲液
98%去离子甲酰胺
10mol/L EDTA(pH8.0)
0.025%二甲苯青FF
0.025%溴酚蓝
甲酰胺:许多批号的试剂级甲酰胺,其纯度符合使用要求,无须再进行处理。

混合床树脂不过,一旦略呈黄色,则应用在磁力搅拌器上将甲酰胺与Dowex XG
8
共同搅拌1小时进行去离子处理,并用Whatman 1号滤纸过滤2次,去离子甲酰胺分装成小份,充氮存于-70℃。

3.常用的电泳缓冲液
缓冲液使用液浓贮存液(每升)
Tris-乙酸(TAE)1×:0.04mol/L Tris-乙酸50×:242g Tris碱
0.001mol/L EDTA 57.1ml冰乙酸
100ml 0.5mol/L EDTA(pH8.0) Tris-磷酸(TPE)1×:0.09mol/L Tris-磷酸10×:10g Tris碱
0.002mol/L EDTA 15.5ml85%磷酸(1.679g/ml)
40ml 0.5mol/L EDTA(pH8.0) Tris-硼酸(TBE)a0.5×0.045mol/L Tris-硼酸5×:54g Tris碱
0.001mol/L EDTA 27.5硼酸
20ml 0.5mol/L EDTA(pH8.0) 碱性缓冲液b1×:50mmol/L Na OH 1×:5ml 10mol/L NaOH
1mmol/L EDTA 2ml 0.5mmol/L EDTA(pH8.0) Tris-甘氨酸c1×:25mmol/L Tris5×:15.1g Tris
250mmol/L 甘氨酸94g 苷氨酸(电泳级)(pH8.3)
0.1% SDS 50ml 10% SDS(电泳级)
说明:
①TBE溶液长时间存放后会形成沉淀物,为避免这一问题,可在室温下用玻璃瓶保存5×溶液,出现沉淀后则予以废弃。

以片都以1×TBE作为使用液(即1:5稀释浓贮液)进行琼脂糖凝胶电泳。

但0.5×的使用液已具备足够的缓冲容量。

目前几乎所有的琼脂糖胶电泳都以1:10稀释的贮存液作为使用液。

进行聚丙烯酰胺凝胶垂直槽的缓冲液槽较小,故通过缓冲液的电流量通常较大,需要使用1×TBE以提供足够的缓冲容量。

②碱性电泳缓冲液应现用现配。

③Tris-甘氨酸缓冲液用SDS聚丙烯酰胺凝胶电泳。

4.2×SDS凝胶加样缓冲液
100mmol/L Tris·HCl(6.8)
200mmol/L二硫苏糖醇(DTT)
4%SDS(电泳级)
0.2%溴酚蓝
20%甘油
不含DTT的2×SDS凝胶加样缓冲液可保存于室温,应在临用前取1mol/L
贮存液现加于上述缓冲液中。

5.凝胶加样缓冲液
缓冲液类型6×缓冲液贮存温度
Ⅰ0.25%溴酚蓝
4℃0.25%二甲苯青FF
40%(W/V)蔗糖水溶液
Ⅱ0.25溴酚蓝
室温0.25%二甲苯青FF
15%聚蔗糖(Ficoll400)
Ⅲ0.25%溴酚蓝
4℃0.25%二甲苯青FF
30%甘油水溶液
Ⅳ0.25%溴酚蓝
4℃40%(W/V)蔗糖水溶液
碱性加样缓冲液:
300mmol/L NaOH
6mmol/L EDTA
Ⅴ18%聚蔗糖(Ficoll400)
4℃0.15%溴甲酚绿
0.25%二甲苯青FF
使用以上凝胶加样缓冲液的目的有三:增大样品密度;以确保DNA均匀进入样品孔内;使样品呈现颜色,从而使加样操作更为便利,含有在电块中能以可预知速率向阳极泳动的染料。

溴酚蓝在琼脂糖中移动的速率约为二甲苯青FF的2. 2倍,而与琼脂糖浓度无关。

以0.5×TBF作电泳液时,溴酚蓝在琼脂糖中的泳动速率约与长300bp的双链线状DNA相同,而二甲苯青FF的泳动则与长4kb的双链线状DNA相同。

在琼脂糖浓度为0.5%~1.4%的范围内,这些对应关系受凝胶浓度变化的影响并不显著。

选用哪一种加样染料纯属个人喜恶。

但是,对于碱性凝胶应当使用溴甲酚绿作为示踪染料,因为在碱性pH条件下其显色较溴酚更蓝为鲜明。

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