Diamond晶体软件问题集锦
关于画晶体结构图相关软件的使用心得
看到坛子里经常有人求助画晶体结构的软件及相关的使用说明，通过自己的学习过程写一些心得和大家一起交流。
一般在拿到晶体数据时，我们利用其中的ｃｉｆ文件画图，主要利用的软件有：ｓｈｅｌｘ，ｍｅｒｃｕｒｙ，ｄｉａｍｏｎｄ这三种，以下我来分别介绍一下自己的使用心得：1.shelx的使用，这个软件是大家最为常用的，因为它即可解晶体又可画图，这个软件的使用需要记住相应的命令，早期要在ｄｏｓ下，现在的在ｘｐ下使用已经较方便了。
先总结一下相关的基本命令：read xxx(cif 的文件名)fmolkill $h(若想图看起来清晰，可以不画ｈ原子时用这个命令)ｐｒｏｊ这时看到的是基本的配位环境图若不需要的原子就可用kill删去，若配位环境还达不到你想要说明的可以利用ｇｒｏｗ命令matr1pack这时看到的是从ａ方向的晶胞堆积图，不但可以看到各个原子的配位情况，若有氢键作用，也可以看到；matr2,3是分别从ｂ，ｃ方向，这时就看你的选择是要从什么角度说明了，当然在ｍａｔｒ的命令后，我们看到的图可以通过左手方向的旋转按钮来选择其他的角度，只要能说明问题就好。
ｅｓｃ后ｔｅｌｐ０－３０（数字的选择是在画ｏｒｔｅｐ是的比例一般是３０或５０；若不输入数字，系统会有自动的默认，若想画带有晶胞的图用telp cell 命令）接下来回让你起个name, 什么都好，比如：１ｄｒａｗ１（此时画的就是ａ方向看的堆积图）接下来就是标记各原子的名字（若不想标记在ｔｅｌｐ命令前加ｌａｂｌ０命令）然后问你要画的图存成什么格式，多是选择ｈ再来就是是问你画彩图还是黑白图然后问你选择的纸张大小以上就是ｓｈｅｌｘ的基本命令了，还有一些复杂的大家可以参看陈小明等编写的《单晶衍射分析》这本书。
利用这个软件的好处在与它同时可以解晶体，当数据有些不合理的地方可以在重新解；我觉得最便利的是这个软件在表达氢键作用时非常好，所以我经常利用它画含氢键作用的结构图。
现在一些好的杂志发表的图，利用这个软件画图的很多，多集中表达是画配位环境的ORTEP图。
Diamond软件在《结构化学》“晶体结构”教学中的应用
此 可 以判 断 ．质 点Ｃ 原 子 的位 置 完全 符 合 相 当 点 的 两个 选择 ｕ 标 准 ，我 们 可 以 把 晶体 Ｃ 的相 当点 坐 落 在 所 有 的Ｃ 原 子 的 位 ｕ ｕ
置上 。
利 用 Ｄａ ｏ ｄ ｉ ｎ 软件 ， 们 可 以 很 容 易绘 制 出 晶体 Ｃ 的 空 间 ｍ 我 ｕ 点 阵 菜 单 Ｂ ｉ ＼ｉ＼ｕ ｅ ｅ ， 出对 话 框 ， 行Ｓ ｐ ｒ ｅｌ ｕｌ Ｆ ｌＳ ｐ ｒ ｌ 弹 ｄ ｌ Ｃ ｌ 进 ｕ ｅ ｌ Ｃ 的 选 择 ． 击 Ｏ 确 定 。这 样 Ｓ ｐｒ ｅ 中所 有 的质 点 Ｃ 原 子 都 显 点 Ｋ ｕｅ Ｃｌ ｌ ｕ 示 在 软 件 的 图 片 之 中 。 为 晶 体 Ｃ 的结 构 中 只有 一 种 质 点 ， 因 ｕ 而 相 当 点 位 置 坐 落在 质点 Ｃ 原 子 的位 置 上 ，所 以就 不 需 要 进行 ｕ 相 当 点 之 外 其 他 质 点 的 删 减 了 。这 样 我 们 就 直 接 得 到 了 晶体 Ｃ 的 空 间 格 子 的示 意 图 （ １ 。 图 中我 们 可 以很 明 显 地 看 出 ｕ 图 ）从 晶 体 Ｃ 的 空 间 点 阵 属 于立 方 Ｆ 子 形 式 。 ｕ 格
结构 化学 是一 门 在 原 子 、 子 水 平 上 讨 论 物 质 微 观 结 构 ， 分 研究 原 子 和分 子运 动 规 律 ，研 究 物 质 的结 构 和性 能关 系 的 科 学 ， 化 学 的一 个 重 要 分 支 。 不 仅 是 化 学 专 业 的 一 门 基 础 理 是 它 论 课 ， 且 是 化 工 、 料 、 物 、 境 等 学 科 的 一 门专 业 基 础 而 材 生 环 课 。 结 构 化学 是一 门 理 论 性 较 强 的 科 学 ， 些 概 念 抽 象 难 懂 ， 有 尤 其 是 晶 体结 构 这 部 分 内 容 ， 常 的 抽 象 微 观 ， 要 有 一 定 的 非 需 空 间 想 象 能力 。 体 结 构 的 抽 象 复 杂性 ， 学 生 来 说 有 一 定 的 晶 对 难度。因此 ， 晶体 化 学 学 习 的 重点 和难 点 ， 如何 使 学 生 能 真 是 切 地 感 知 微 观 世 界 的精 彩 和奇 妙 。 ｉ ｎ 软 件 的 引 入 可 以 将 Ｄａ ｄ ｍｏ 抽 象 复 杂 的 东 西 直 观 形 象 地 展 现 在 学 生 面前 ，发 展 学 生 的 空 间 想 象 能 力 和 抽 象 思维 能力 。 Ｄ ａ ｏ ｄ 件 是 德 国 波 恩 大 学 Ｃ ｙｔｌ ｍｐ ｃ Ｇ Ｒ公 司 开 ｉｍ ｎ 软 ｒｓ ａ ｔ ｂ ａＩ 发研 制 的 一个 化 学 专 业 软 件 。利 用 该 软 件 不 仅 能创 建 晶 体 模 型 ． 能 以各 种 形 式 （ 状 ， 棍 状 或 空 间 堆 积 状 ， 面 体 形 式 还 线 球 多 等 ） 示 晶 体 模 型 ， 且 模 型 可 以根 据 用 户 的 需 要 自由 旋 转 、 展 而 移 动 和缩 放 ， 以用 着 色 方 案 对 原 子 进 行 强 调 和 渲 染 ， 可 以 可 也 对 晶 体模 型进 行 文 字 标 注 ， 时记 录 其 运 动 过 程 ， 同 制作 成 动 画 文 件 ， 其 他 多 媒 体 播 放 器 中播 放 。其 结 果 可 以 以 Ｂ 、 Ｉ 在 ＭＰ Ｇ Ｆ、 Ｊ Ｇ 等 图 片格 式 输 出 ，同 时也 可 以用 复 制 粘 贴 命 令 将 绘 制 的 Ｐ Ｅ 图 片 文 件 直 接 放 入 文档 。 于 这 款 软 件 没 有 复 杂 的规 则 ， 令 由 命 简 单 易操 作 ．并 且 在 操 作 与 运 行 并 不 要 求 具 备较 多 的 计 算 机 知 识 ， 此 ， 可 以很 容 易 地 被 教 师 运 用 在 教 学 中 ， 高 教 学 因 它 提 的 效 率 和 质 量 。本 文 以Ｄ ａ ｏｄ３０ 版 本 为 例 ， 过 构 建 Ｃ 与 ｉｍ ｎ ． ａ 通 ｕ Ｃ Ｆ两 类 晶体 的 空 间 点 阵 模 型 ， 说 明Ｄ ａ ｎ 软 件 在 《 构 ａ， 来 ｉ ｍｏｄ 结 化学》 晶体 结 构 部 分 教 学 过 程 中的 辅 助 作 用 。 ２利 用Ｄｉｍｏ ｄ 件 构 建 晶 体 空 间点 阵 ． ａ ｎ软 用 相 当 点 的 方 法 可 以 确 定 晶胞 的空 间点 阵 。 在 晶 体 结 构 中 确 定 相 当点 的位 置 ，所 选 择 的相 当点 需 要 满 足 两 个 条 件 ： ． ａ 所选 点所 在位 置 的 种 类 和 空 间 位 置 相 同 ，如 位 于 某 种 质 点 的 中 心 ，或 某 个 特 定 几 何 构 型 的 中 心 等 ； ．所 选 点 的周 围 环 境 ｂ （ 三维 空 间 ） 同 ， 在 该 点 的 相 同方 位 和 距 离 上 有 相 同 的 质 相 如 点 和 几何 构 型 。 因此 ， 们 在 借 助 Ｄａ ｏｄ 件 构 筑 和 判 断 空 我 ｉｍ ｎ 软 间 点 阵类 型及 有关 信 息 的 时 候 ，最 关 键 的一 点也 就 是 能 够 凭 借 上 面 的 条件 找 到 合 适 的 相 当点 的位 置 ，并 成 功 用 软 件 体 现 出 来 。 我 们 选 择 了两 类 晶体 实 例 ：ｕ Ｃ 与Ｃ Ｆ， ａ 它们 分 别 代 表 红 王 凤 武
界面问题总结
Cu/Diamond界面问题总结（不仅仅是界面问题）一、复合材料热导率（导热性）影响的因素：1.界面热阻（单位面积的界面热阻和界面数）2.致密度解决措施：1.如何降低界面热阻，主要从两个方面：①提高界面结合力：(i)从基体方面考虑：在基体Cu中添加活性元素（Cu与某些元素能够形成共晶合金，如B、Si、C等，要求：1.元素要能够与碳以强键结合形成碳化物。
2.在基体Cu中的分散性好。
）缺点：元素的添加会降低基体金属本身的热物理性能，且不能实现两相界面形貌和成分的直接控制，无法更进一步提升复合材料的热物理性能。
）(ii)从增强体方面考虑：金刚石颗粒表面改性存在的问题：室温下金刚石的热导率虽然高，但高温下的热稳定性差，且易石墨化，金刚石表面会出现裂纹等缺陷；金刚石与一般金属和合金之间有很高的界面能，使金刚石不能被金属和合金润湿，亲和力很差。
方法：金刚石表面金属化，使金刚石具有金属和类金属的性能。
表面化学镀（如盐基型胶体钯活性液的一步活化法镀铜）复合化学镀：Cu-Ni-P、Ni-Cr-P、Ni-W-P等金刚石镀层（研究并不是很多）化学镀+滚镀：可以节约资源和提高镀层质量（对导热性的影响有待研究）优点：镀层在二者之间起结合桥的作用，提高金属对金刚石的粘结能力；金刚石内部缺陷如微裂纹、微小孔洞可通过充填碳化物膜得到弥补，提高金刚石本身导热能力；在复合材料高温烧结时，镀层可以隔离保护金刚石，防止发生石墨化、氧化及其他化学反应。
镀层材料选择的要求：（1）.是较强的的碳化物形成元素，可在一定条件下与金属表面发生反应来提高与金刚石的结合力（2）.在Cu基体中具有一定的溶解度，可通过扩散来实现其与金属的良好结合，但溶解度不宜过高，以防止基体热导率的恶化（3）.镀层本身和其碳化物应具有较高的热导率，避免引入较高的界面热阻存在的问题：以镀Cr为例，由外向里分别是Cu、Cu-Cr固溶体层、Cr、Cr7C3、金刚石。
其中Cu-Cr固溶体层和Cr7C3较薄。
关于画晶体结构图相关软件的使用心得-画晶体结构的软件
关于画晶体结构图相关软件的使用心得:画晶体结构的软件看到坛子里经常有人求助画晶体结构的软件及相关的使用说明，通过自己的学习过程写一些心得和大家一起交流。
一般在拿到晶体数据时，我们利用其中的ｃｉｆ文件画图，主要利用的软件有：ｓｈｅｌｘ，ｍｅｒｃｕｒｙ，ｄｉａｍｏｎｄ这三种，以下我来分别介绍一下自己的使用心得：1.shelx的使用，这个软件是大家最为常用的，因为它即可解晶体又可画图，这个软件的使用需要记住相应的命令，早期要在ｄｏｓ下，现在的在ｘｐ下使用已经较方便了。
先总结一下相关的基本命令：read xxx(cif 的文件名) fmol kill $h(若想图看起来清晰，可以不画ｈ原子时用这个命令) ｐｒｏｊ这时看到的是基本的配位环境图若不需要的原子就可用kill删去，若配位环境还达不到你想要说明的可以利用ｇｒｏｗ命令 matr1 pack 这时看到的是从ａ方向的晶胞堆积图，不但可以看到各个原子的配位情况，若有氢键作用，也可以看到；matr2,3是分别从ｂ，ｃ方向，这时就看你的选择是要从什么角度说明了，当然在ｍａｔｒ的命令后，我们看到的图可以通过左手方向的旋转按钮来选择其他的角度，只要能说明问题就好。
ｅｓｃ后ｔｅｌｐ０－３０（数字的选择是在画ｏｒｔｅｐ是的比例一般是３０或５０；若不输入数字，系统会有自动的默认，若想画带有晶胞的图用telp cell 命令）接下来回让你起个name, 什么都好，比如：１ｄｒａｗ１（此时画的就是ａ方向看的堆积图）接下来就是标记各原子的名字（若不想标记在ｔｅｌｐ命令前加ｌａｂｌ０命令）然后问你要画的图存成什么格式，多是选择ｈ再来就是是问你画彩图还是黑白图然后问你选择的纸张大小以上就是ｓｈｅｌｘ的基本命令了，还有一些复杂的大家可以参看陈小明等编写的《单晶衍射分析》这本书。
利用这个软件的好处在与它同时可以解晶体，当数据有些不合理的地方可以在重新解；我觉得最便利的是这个软件在表达氢键作用时非常好，所以我经常利用它画含氢键作用的结构图。
立方、六方diamond软件在晶体对称性教学中的应用-32点群晶体模型库的建立
Diamond 软件在晶体对称性教学中的应用-32点群晶体模型库的建立吴平伟 朱志斌 戴金辉（中国海洋大学材料科学与工程研究院 青岛 266100）摘要介绍了用Diamond 软件构造32点群晶体结构模型的方法，给出了建立晶体结构模型的具体参数。
利用此模型有助于加深学生对点群及其与晶体结构关系的理解。
关键词 Diamond 软件 32点群 晶体结构模型Use the Diamond Software to Construct the Models of 32 Point Groups Wu Pingwei, Zhu Zhibin, Dai Jinhui(Institute of Materials Science and Engineering, Ocean University of China, Qingdao 266100)Abstract A way to construct the models of 32 point groups using the Diamond software was introduced, andthe parameters of the models were given out. The models could be helpful for students in studying the 32 point groups and understanding the relationship between the point groups and the structure of crystals.Key words Diamond Software, 32 Point Groups, Model of Crystal Structure晶体的对称性是晶体化学中重要的内容，包括对称元素、对称元素的组合（点群和空间群）等。
在教学中发现，多数同学对理解这些概念没有困难，但不知道怎样把点群、空间群和晶体结构联系起来。
Diamond 软件的使用
这就是DIAMOND，一款在原子水平实现晶体结构可视化 的软件能为您做到的。
LOGO
Diamond
介绍
1.用户界面介绍 2.看图工具介绍
LOGO
软件界面
LOGO
用户界面
导航栏 表 格 面 板
LOGO
测量工具栏
LOGO
转换工具栏
LOGO
视频工具栏
LOGO
起步阶段
如何导入 晶体结构 数据文件
如何通DIAMOND自动 绘制晶体结构图
Diamond 软件的使用
LOGO
Edit your company slogan
内容
1、软件的作用
2、diamond介绍
3、起步阶段
4、绘制图像
5、实 例
LOGO
学习 Diamond 软件的作用？
如果你有晶体结构数据（空间群参数，单胞参数，原子参 数或者晶体数据文件，如cif文件），而且你希望， 1.绘制用于演示文稿或者出版物的高质量图片？ 2.了解晶体结构的构造原理？ 3.通过各种方式向客户展现晶体构造原理？
图像视角
LOGO
实 例
LOGO
LOGO
起步阶段
如何显示晶体结构数据、 距离和角度表格 以及粉末衍射图样
LOGO
绘制图像
如何手动输 入晶体结构 数据
绘制图像
如何通过结 构图绘制助 手）绘制图 像
LOGO
如何手动输入晶体结构数据
新建空 白文档
打开新 建结构 助手
输入晶胞参 数和空间群
输入原子参数 （元素、氧化 态以及配位数）
完成数据输入 ，进入结构图 像绘制助手
Diamond软件辅助《晶体化学》教学
给 学 生 ， 可 以显 示 Ｚ Ｓ的 空 间点 阵 、 还 ｎ 离子 （ 原子 ） 坐标 、 配位 多 面体 、 配位 多面体 的 堆积 方 式 等信 息 ， 从
而形 象地表 述 教 学 内容 。 大地 丰 富教 学手 段 ， 效地提 升教 学质 量 。 极 有 【 键 词１ ｉｍ ｎ 关 ａ ｏ ｄ软件 ； Ｄ 闪锌矿 Ｚ Ｓ 空 间点 阵 ； ｎ； 配位 多面体
『 中图 分类 号］ — ４ ０ ７２
１引 言
『 文献 标识 码１ Ａ
Ｂ ｉ ＼Ｃ ｎ ｅ ｔ ｕｌ ｄ ｏ ｎ ｃ Ａｔｍｓ ｏ ．质 点 就通 过 化 学 键 连 接 过程中 ． 以提 高教 学 的效 果 和质量 。 ｉｍｏ ｄ软件 的绘 制 得 到 了 晶 体 化 学是 研 究 晶体 在 原 子 水平 上 的结 构 理 起来 了 这样 就 通 过 Ｄ ａ ｎ 论 ． 示 晶体 的化 学 组 成 、 构 和 性 能 三者 之 间 的 闪 锌 矿 Ｚ Ｓ晶 体 结 构 中一 个 单 胞 的 球 棍 结 构 图 揭 结 ｎ 图 ） 黑 ｎ， ＋ 之 内在 联 系 以及有 关 原理 的化 学 分支 学科 。 晶体化 学 （ １ 。 图 １中 ， 色 球是 Ｚ ２ 白色球 是 Ｓ ， 间
２ ２年 第 ３பைடு நூலகம் ０１
淮 南师 范 学 院学报
Ｊ Ｕ Ｎ Ｌ Ｏ Ｕ Ｉ Ａ Ｏ ＭＡ Ｎ Ｖ Ｒ Ｉ Ｙ Ｏ Ｒ Ａ Ｆ Ｈ Ａ Ｎ Ｎ Ｎ Ｒ ＬＵ Ｉ Ｅ ＳＴ
Ｎ ｏ．３ ， ２０ １ ２
第 ｌ ４卷 （ 第 ７ 总 ３期 ）
Materials-Studio论坛问答全
Materials-Studio论坛问答全Materials-Studio 论坛问答全集（精选众多论坛讨论贴）1、问：用MS构造晶体时要先确立空间群,可是那些空间群的代码是啥意思啊,看不懂,我想做的是聚乙烯醇的晶体,嘿嘿,也不知道去哪可以查到它的空间群答：A、要做晶体，首先要查询晶体数据，然后利用晶体数据再建立模型。
晶体数据来源主要是文献，或者一些数据库，比如CCDC。
你都不知道这个晶体是怎么样的，怎么指定空间群呢？要反过来做事情哦：）B、我不知道你指示的代码是数字代码还是字母代码,数字代码它对应了字母的代码，而字母的代码它含盖了一些群论的知识(晶系,对称操作等),如果要具体了解你的物质或者材料属于那一个群，你可以查阅一下相关的手册,当然你要了解一些基本的群论知识.MS自带了一些材料的晶体结构,你可以查询一下.2、问：各位高手，我用ms中的castep进行运算。
无论cpu是几个核心，它只有一个核心在工作。
这个怎么解决呢？答：请先确认以下几个问题：1，在什么系统下装，是否装了并行版本。
2，计算时设置参数的地方是否选择了并行。
3，程序运算时，并不是时时刻刻都要用到多个CPU3、问：我已经成功地安装了MS3.1的Linux版本，串行的DMol3可以成功运行。
但是运行并行的时候出错。
机器是双Xeon5320(四核)服务器，rsh和rlogin均开启，RHEL4.6系统。
其中hosts.equiv的内容如下：localhostibm-consolemachines.LINUX的内容如下：localhost:8现在运行RunDMol3.sh时，脚本停在$MS_INSTALL_ROOT/MPICH/bin/mpirun $nolocal -np $nproc $MS_INSTALL_ROOT/DMol3/bin/dmol3_mpi.exe $rootname$DMOL3_DATA这一处，没法执行这一命令并行运算时，出现以下PIxxxx(x为数字)输出ibm-console 0 /home/www/MSI/MS3.1/DMol3/bin/dmol3_mpi.exelocalhost 3 /home/www/MSI/MS3.1/DMol3/bin/dmol3_mpi.exe请问这是什么原因？谢谢！答：主要是rsh中到ibm-console的没有设置把/etc/hosts改为127.0.0.1 localhost.localdomain localhost ibm-console在后面加个ibm-console也希望对大家有帮助!4、问：在最后结果的dos图中,会显示不同电子spd的贡献,我想问的是,假设MS考虑的原子Mg的电子组态为2p6 3s2,那么最后的dos 结果中的s,p是不是就是2p,跟3s的贡献.比如更高能量的3p是否可能出现在dos中?如果可能的话，在这种情况下,如何区分2p和3p的贡献,谢谢.答：A、取决于你的餍势势里面没有3p电子，DOS怎么会有呢？自然，你的1p1s也不会出现在你的DOS中。
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小木虫Diamond软件问题集锦晶体版版主yanhualover2010年6月13日1.Diamond出图时怎么设置dpi数目我在使用Diamond出图时分辨率并不算小，可是编辑说我的图只有96dpi，但杂志要求至少600dpi,请问我该怎么设置？答: 在picture/layout.../对话框的Targets中选择Bitmap，然后就可以自己输入需要的分辨率了.要保存为位图格式才可以。
如果是JPG格式，还是96dpi.答: 呵呵，发现在tools下拉菜单的option里.2.Diamond椭球图阴影画图如图中所示，怎么画出每个椭球中的阴影部分？我用的是3.1d版本.答:这个是在diamond中的'原子设置中'中选的，具体如下：picture-------atoms design-------style and colors-------style中选择octant即可。
3.怎样建立氢键我这儿有一个cif文件，一个tab文件和两个已经用diamond作好的图，但不知道这两个图是怎么画出来的，想知道作图过程，请diamond高手用word或pdf写出作图过程。
答：没什么技术含量的吧，堆积一下，删掉多余的原子，创建氢键就好。
4.怎样建立单个分子diamond一打开cif，就是堆积图，怎么才能显示一个分子。
答：好像最新的更新包已经改过这个bug了。
但是因为没有对应的破解程序，所以俺还是用以前的3.0，经常遇到这个问题。
如果你的分子间没有作用，即：没有乱七八糟的键连在一起，选中一个原子，然后，ctrol+M, 选中一个分子，然后，反选，即选中除该分子之外的所有分子，然后一键 delete, 就ok了。
如果分子连成片，就删吧。
对于非中心分子，即含反离子的分子结构要小心，不要把反离子漏掉了。
当然，如果不用画就没问题了。
以上拙见，仅供参考。
答：diamond打开cif时选“建立单个分子”，然后点完成，不要点下一步。
5.请教diamond画C60遇到的问题（1）我这个C60在画多面体的时候，中间inset 的atom的半径在每个面上都要自己一个一个去设定radium，有没有同类原子半径一起设置的？里面没有找到。
（2）当我把中间的 dummy原子（就是为了画多面体的时候新加入的）的半径设为0后，如果想改C60的每个面的颜色的画，这个怎么改的？（3）最后问一下，我保存的图片中背景的 diamond demonstrator 如何去掉。
另献上我第一幅diamond图，如下。
答：1. 可以在atom设置里找到假原子直接设置2. 以假原子为中心画多面体3. 你用的应该是未破解版本。
6.diamond中如何在螺旋链中插入一根棒diamond中如何在螺旋链中插入一根棒，以及如何看结构是单螺旋还是双螺旋结构，如何画出单，双螺旋结构？答：插入几个哑原子，然后连键，进行一些设置就可以了。
前段时间有人传了一些Diamond的说明，其中有一个文件就是详细说明这个棒怎么画的。
找到了这个文件，感谢原作者Crystalsnet，我把它上传到纳米盘，你自己下载下来看看就知道怎么做了。
答：在孔道两侧虚拟两个原子，然后在这两个原子间成建，设置一下键参数就可以了！答：具体说，选择两端的几个院子，再找这几个的中心位置，分别insert atoms , 再连接心连接， insert bond, 在按你的意思edit the bond。
7.如何去掉M-C,M-H连接打开一个晶体数据后，在connectivity中把M-C,M-H去掉后。
再点complete fragments后，这些M-C,M-H又连上了，求助高手。
答：点下connect now 再确定试试。
8.diamond里面如何定义元素化合价怎么样定义元素的化合价，然后使半径比例随之改变？？默认设置好像都是原子半径。
答：问题解决了，在atomic parameter里面。
9.diamond画配位环境时到一定程度原子就长不出来了，是怎么回事今天用diamond画配位环境时画到一定程度（配位环境没画完）原子就长不出来了，不知是怎么回事？请高手指点，谢谢！答：试试在“Type of sphere”中把Rmax值设大一些。
答：或者试试用小太阳符号“Fill coordination directly"。
10.修改Diamond的默认单胞数我不知道动了什么参数让Diamond的默认单胞数为2了，也就是说每次一打开就是两个单胞里的不对称结构单元，在哪改回去吖？答：菜单栏的picture-->guidance-->picture creation assistant-->destroy all atoms, bonds 项选勾，下一步-->在fill cell range with项里选择需要的单胞数，按完成。
OK！每次用diamond打开cif文件时，在引导项中注意选择单胞数，就可以控制显示的单胞数了。
11.在diamond里怎么让所有一定键长的原子连起来呢如题.我怎么选connectivity,设上DMAX,按OK,不管用呢?答：我这么做也不管用，后来就在读入cif之后先不生成图，先在connectivity里设定要的健长范围就可以了。
答：那是没有设上，该了之后要再点一下需设原子才行。
答：管用的，应该是你操作有问题。
12.怎么取消透视图我用的是3.0读完cif之后出现的直接是透视图，怎么取消啊？答：应该是用Representation Settings。
答：用central projection命令！13.绘制黄色和蓝色矩形请高手帮忙看一下图中的黄色和蓝色矩形区域如何画？通过原子建立平面时，所得的矩形太大，不知道如何调整到所要的大小。
答：好像Diamond里没法加这样的矩形框，这个图好像中的矩形框应该是在其它软件中加的，或者不是用Diamond绘制的，比如，可以在Word里加矩形框，然后设置透明度或许可以。
答：在Diamond里加平面是很大，因为平面是无限延伸的，像这种有限的平面实际是些多面体，通过共面的点建立的，像拓扑图里经常出现一些表示两个面夹角的情况，就是这么做出来的，你可以尝试一下。
答：不错，用加多面体的方法，借助哑原子可以做的。
14.Diamond结构图寻求完美的颜色对比见识一下各位高手所作的MS或Diamond做晶体的结构图，主要想参照一下颜色搭配！答：在polyhedra designs 和 atom designs 里面改成你想要的颜色就行了呀。
15.如何去掉Diamond 中画的图Diamond 背景字样求助Diamond 中画的图copy到word中总有Diamond 背景字样，如何去掉呀？答：你用的那个版本没有破解。
16.溶剂水没加氢如何画氢键我最近想画个氢键堆积图，可是溶剂水没加氢，用diamond画时溶剂水和羧酸氧上的氢键显示不出来，求助高手我应该怎么办啊?答：先加上氢了，或者你把所有的氢都删掉，直接把O-O之间用虚线连起来就可以了。
答：不加H直接连接O。
O键容易被审稿人质疑的。
最好还是想办法加加H。
答：给溶剂水加氢,先要从残余峰里面找到和氧的距离比较合适的，然后再去固定住一般就可以的。
答：我都是参照文献的氢键数值，直接在Diamond里设定D...A距离然后连接。
实在想做的完美，可以在解析结构时，使用envi X 2,找出原子X周围较为合理的H，然后将其固定，后者先在Diamond里找出形成氢键D...A的原子对，然后在解析结构时在这两个原子之间加入Dummy，并将Dummy定义为H，然后对H进行固定，这样可能就合适了。
答：具体的情况很复杂，加H的技巧很多，实在一言难尽。
17.diamond中怎么画堆积图diamond中怎么画堆积图啊？有机配体要怎么删除啊？答：啥样的堆积图？把原子半径改大一点不行吗？答：估计是你填充单胞不够。
18.原子坐标图中的错误是怎么回事？怎样避免？谢谢。
答：你那个弹出的错误提示正好把后面的挡住了，不能移开一点再贴上来吗？只能帮你猜谜了，估计是原子坐标没给，因为其它地方不会提示这个错误的。
答：他好像不是从文件读入的结构信息，而是自己手动输入的，一般绘图软件都可以手动输入的。
19.如想构造多面体请问如想构造多面体，中心原子有两个如CeVO4，中心原子为Ce和V 以配位原子为O来构造两套多面体用什么办法？答：先选中中心原子，然后在object里选polyhedra，然后选ligand做边,如此重复两次就能得到两个多面体。
答：一般XP都是画配位环境图，基本上所有的图都能用Diamond做。
答：CeVO4多面体骨架图：20.怎样美化diamond图实在没办法，自己对照着说明第一次画图，是LiYF4晶体。
白钨矿型四方晶系，空间点群C6 4h-I4 1/a，晶胞参数a=5.167，c=10.794我自己画得不知道是什么，求哪位帮帮忙啊。
答：原子比例不太合适，原子小些棍粗些会比较美观；还有坐标上的箭头最好去掉然后把abc字体改大点，不然这样的图放到文章上字会看不清楚。
画拓扑重在选择节点，看你选择什么作为结构单元，如果是选某种原子那很方便，在diamond菜单中改变这种原子之间的默认键长；如果选择的是两个原子的中心或者多个原子的中心，那就需要在shelx程序中添加原子（cent/x命令），然后再在diamond中改变默认键长。
首先自己要了解清楚你的结构，然后选择合适的节点，有的时候从不同角度理解结构，可能会选择不同的节点。
答：画拓扑的话，做好用一下olex，可以自动简化节点。
21.diamond保存图片时可以设置分辨率吗用diamond画图，保存图片选择tif格式直接保存后，像素很低，感觉不清楚。
diamond 里可以设置，像素，分辨率，再保存吗？答：当然可以。
在layout里设置一下，600最好。
答：一般300就可以了。
答：“当然可以。
在layout里设置一下，600最好。
”这个好象是对bmp起作用。
22.关于diamond中氢键粗线设置问题如题，在diamond中，由build-create h-bond产生的氢键为较细的虚线，如何把氢键设置得粗一点我试了一下，如果在picture-bond design 设置粗细，则氢键也会变成实线，与其他的化学键分不开。
麻烦大家指导如何把氢键设粗又还是保持虚线的形式？答：首先进入edit,选edit bonds,然后选中你要设置的氢键类型，比如ＮＯ键，选中ｄｅｓｉｇｎ，通过调节ｒａｄｉｕｓ可以调节键的粗细，然后在ｆｒａｇｍｅｎｔａｔｉｏｎ里输入大于１的数字线就成虚线了，我一般选４，你可以自己调节。
答：你可以全选键然后加粗，点应用、不点确定。