药物基因检测位点及意义
肿瘤科药物基因检测介绍
Subject incidences of grade 3/4 diarrhoea based on UGT1A1 genotype Green, yellow, and pink bars represent the incidences for patients harbouring UGT1A1 wild-type (*1/*1), heterozygous (*1/*6, *1/*28), and homozygous (*6/*6, *6/*28, *28/*28) genotypes, respectively. Abbreviation: RR=relative risk.
美国FDA已在伊立替康药品说明书上规定，使用伊立替康 前需检测患者是否携带有UGT1A1*28。
UGT1A1*28突变率
UGT1A1*6（G71R，211G>A）是东方人群中特有的突变等位基 因，该突变使UGT1A1活性下降70％，伊立替康所致4级中性粒细 胞减少症的发生率升高3倍。
Med Oncol (2013) 30:604
UGT1A1基因具有多态性，其表达水平高度可变，导致不同患 者间SN-38糖化反应速率相差最高达50倍。UGT1A1基因功能缺陷 可导致SN-38显著增加，从而显著增加腹泻/中性粒细胞减少发生。
UGT1A1基因具有多态性，国外研究发现最常见的是位于其启动 子区TATA盒内的TA重复次数多态性UGT1A1*28。野生型含6次TA重复 （TA6，UGT1A1*1），突变型个体含7次重复（TA7，UGT1A1*28）。
Use label-recommended dosage and administration (Moderate recommendation)
药物基因组学检测工作
药物基因组学检测工作药物基因组学 (pharmaeogenomies)又称基因组药物学或基因组药理学，是药理学或基因组学的一个分支，它是研究基因组或基因变异对药物在人体内吸收、代谢、疗效及不良反应的影响，从而指导临床合理用药的一门新学科。
目前，很多高血压或糖尿病等常见病、多发病的患者在接受治疗时，同样的疾病使用同样剂量的同一药物，在疗效和不良反应方面存在显著差异，其原因是多方面的，其中患者间基因的个体差异因素起着相当重要的作用，正是这种差异直接导致患者对药物敏感性不同。
因而根据患者遗传背景，检测出患者的基因个体差异，选取正确的药物并确定正确的给药剂量，正是药物基因组学服务的目的。
美国FDA于2007年首次批准了华法林的基因组学检测方法，用于判断其用量及敏感性。
截至2011年，美国已有70余种药物说明书上注明要求根据药物基因组学信息，制订个体化用药方案。
结合国内外基因组检测较为成熟的经验和我院的实际情况，我院临床药学科与检验科现已开展质子泵抑制剂、氯吡格雷、华法林等相关药物基因组学检测工作。
1.药物基因组学研究内容药物基因组学主要是利用已知的基因组学理论，来研究人体遗传因素对药物反应的影响，其主要内容包括：药物代谢酶、药物转运蛋白、药物作用靶点等基因多态性。
它以药物效应和安全性为目标，主要研究药物效应的个体性差异，并针对不同个体的基因型进行个性化针对治疗。
2.药物相关基因检测的适合人群通常需要长期甚至终身接受某种药物治疗的患者(如心血管药物、精神病药物、消化道药物、抗病毒药物) ;有过严重药物不良反应史或家族成员中有过药物不良反应的人;同时接受多种药物治疗的患者;经常接触有毒物质的患者;使用某种药物效果一直不理想，病情控制不稳定的患者;某些特殊人群：儿童和老年人等人群，适合作药物相关基因检测。
3.药物基因组学检测方法根据检测对象的不同，药物基因组学对用药指导的检测可以分为三类：即药物代谢酶基因检测、药物转运体基因检测、药物靶点基因检测。
中国人群常见的药物代谢相关基因多态位点及其检测方法
中国人群常见的药物代谢相关基因多态位点及其检测方法杨琳艳;杨旭;范冬梅;梁志坤;叶倩平;杨学习【摘要】药物代谢个体差异的一个重要来源是遗传多态性即药物代谢相关基因的多态性.中国人群中药物代谢酶基因多态性的系统性分析已发现了很多潜在的功能性多态性位点,因此建立起针对中国人群的药物代谢酶基因多态性的检测技术,对常见的药物代谢相关基因多态位点的检测以及针对这些多态性位点建立个性化用药技术具有重要的意义.检测药物代谢基因多态性大多采用传统的聚合酶链式反应(PCR)和限制性片段长度多态性(RFLP)等方法,随着基因诊断的快速发展,高通量、快速准确的基因多态性检测方法开始发展起来,如基因芯片法、下一代测序技术等.本文对药物代谢酶基因多态性位点及其检测方法进行综述.【期刊名称】《分子诊断与治疗杂志》【年(卷),期】2017(009)005【总页数】6页(P358-363)【关键词】药物代谢;基因多态性;下一代测序技术【作者】杨琳艳;杨旭;范冬梅;梁志坤;叶倩平;杨学习【作者单位】广州市达瑞生物技术股份有限公司,广东,广州510665;广州市达瑞生物技术股份有限公司,广东,广州510665;广州市达瑞生物技术股份有限公司,广东,广州510665;广州市达瑞生物技术股份有限公司,广东,广州510665;广州市达瑞生物技术股份有限公司,广东,广州510665;南方医科大学检验与生物技术学院,广东,广州510515【正文语种】中文药物在体内的作用过程包括药物的吸收、生物转化、分布和排泄等一系列过程。
而其中的生物转化即为药物代谢，指的是药物在体内经过吸收、重新分布以后，在药物酶的作用下其化学结构发生一系列变化的过程。
药物化学结构的变化包括其化学成分分子的缩合、降解以及分子功能团的增减和变换等。
经生物转化后，药物相应的理化性质随之发生改变，进而导致其毒理和药理活性的变化［1⁃2］。
对药物的代谢过程进行研究可以明确药物中发挥药效的活性成分，阐明药物的科学内涵，促进质量控制和剂型改进，进而指导临床用药。
基因检测到底测多少个靶点为宜（以肺癌为例）
基因检测到底测多少个靶点为宜（以肺癌为例）⼀，哪些⼈群必须做基因检测靶向药的问世带来了患者⽣存的获益，选择合适的靶向药物需要进⾏相应的基因检测，因此基因检测成为了肿瘤治疗中必不可少的⼀个环节。
在NCCN的⾮⼩细胞肺癌指南⾥都把基因检测提升到和病理同等重要的⾼度。
总⾔之:★⾮⼩细胞肺癌患者都推荐去做检测，⽆论是早期，局部晚期或晚期。
★⼩细胞因为缺乏合适的药物靶点不推荐，对于神经内分泌类的也有可能发⽣突变，也推荐做。
★当然还有患者病理不明确且⽆法取到合适病理的患者，但基于肿瘤标志物和影像学已经基本确定为肿瘤的患者也可以考虑基因检测。
★其他患者要求进⾏基因检测的情况。
⼆，测多少靶点最为合适基本原则是越后越多：耐药后及多线治疗后的患者因为肿瘤的异质性和复杂的耐药机制建议靶点相对要多，例如⼀线埃克替尼（凯美纳）或吉⾮替尼、或厄洛替尼耐药后的患者⾄少要选择9-15个基因靶点，因为类似的⼀代EGFRtki耐药的机制包括T790m， HER2 ，MET扩增，RET等等，所以尽可能的选择覆盖以上靶点的套餐；⽽单纯的只选择T790m检测往往会错失更多的靶向治疗机会。
当然三线或三线后的治疗检测可能需要更多的pannel，考虑免疫治疗的患者需要测TMB和pd-1/L1表达。
初治患者多少为宜：按照NCCN指南⾄少需要测EGFR，ALK，ROS1，当然也有初治患者会合并tp53，kras等情况，所以根据情况需要3-8个为宜。
哪些患者需要⼤PANEL：合并多种瘤种，诊断不确切，多线治疗后希望渺茫，对于靶向治疗渴望度较⾼的。
三、抽⾎或组织哪种更优⼤型临床研究benefit告诉我们，⾎液可以替代组织，当然组织仍然是⾦标准。
没有组织或者⼆次三次或四次的动态监测⾎液更为可及，⾎液更能代表全貌。
参考⽂献：WCLC20171017 ，中国医学科学院肿瘤医院王洁教授在世界肺癌⼤会上汇报的BENEFIT 研究 (CTONG1405) 数据四、哪种检测技术更优⽬前普遍建议NGS，尤其对于⾎液样本不建议ARMS.今⽇分享1、PDF:最新2017NCCN指南⾮⼩细胞肺癌V9中⽂版。
21个基因位点
21个基因位点21个基因位点是指人类基因组中的21个特定位置，这些位置上的基因与人类遗传疾病、生理功能、生物化学过程等方面有着密切的关系。
这些基因位点在医学、生物学和遗传学等领域中具有重要的研究价值。
以下是21个基因位点的简要介绍：1. BRCA1/BRCA2：与乳腺癌和卵巢癌相关的基因位点。
2. CDKN2A/CDKN2B：与阿尔茨海默病和黑色素瘤等癌症相关的基因位点。
3. CLU：与阿尔茨海默病和帕金森病等神经退行性疾病相关的基因位点。
4. CR1：与阿尔茨海默病和自身免疫性疾病相关的基因位点。
5. APOE：与阿尔茨海默病、心血管疾病和血脂代谢相关的基因位点。
6. PICALM：与阿尔茨海默病相关的基因位点。
7. ABCA7：与阿尔茨海默病和胆固醇代谢相关的基因位点。
8. TREM2：与阿尔茨海默病和神经炎症相关的基因位点。
9. SMAD3：与关节炎、克罗恩病和肠易激综合征等炎症性疾病相关的基因位点。
10. LRP1：与阿尔茨海默病、心血管疾病和胆固醇代谢相关的基因位点。
11. GSTM1/GSTT1：与药物代谢和解毒相关的基因位点。
12. ABCG2：与药物分布和细胞通透性相关的基因位点。
13. MTHFR：与同型半胱氨酸代谢、叶酸代谢和DNA甲基化相关的基因位点。
14. FTO：与肥胖和糖尿病相关的基因位点。
15. LEPR：与肥胖和糖尿病相关的基因位点。
16. INS/IGF2：与糖尿病和生长发育相关的基因位点。
17. KCNJ11：与糖尿病相关的基因位点。
18. PPARG：与糖尿病和血脂代谢相关的基因位点。
19. APOB：与血脂代谢和心血管疾病相关的基因位点。
20. ABCA1：与高胆固醇血症和动脉粥样硬化相关的基因位点。
21. ACE：与心血管疾病和高血压相关的基因位点。
基因检测的方法和临床意义
基因检测的方法和临床意义
基因检测是一种检测生物体的基因信息的方法，它可以用于疾病预测、个性化医疗、遗传病筛查等方面。
以下是基因检测的一些方法和临床意义:
1. 分子生物学方法：分子生物学方法是指通过分析生物体的基因序列来确定其种类和表达水平的方法。
这种方法可以用于检测基因变异、基因表达异常和基因调控异常等。
2. 基因组学方法：基因组学方法是指通过分析生物体的整体基因序列来确定其种类和表达水平的方法。
这种方法可以用于检测基因变异、基因组结构异常和基因组表达异常等。
3. 转录组学方法：转录组学方法是指通过分析生物体的基因转录本来确定其基因表达模式和方法。
这种方法可以用于检测基因表达异常、基因调控异常和疾病发生机制等。
4. 蛋白质组学方法：蛋白质组学方法是指通过分析生物体的蛋白质组成来确定其功能和方法。
这种方法可以用于检测蛋白质异常和疾病发生机制等。
基因检测可以在疾病预测、个性化医疗、遗传病筛查等方面发挥
重要作用。
例如，基因检测可以预测某些疾病的风险，帮助人们采取积极的预防措施;还可以帮助医生制定个性化的治疗方案，提高治疗效果和生存率;同时，基因检测也可以用于遗传病筛查，帮助家庭预防遗传疾病的发生。
药物基因检测位点及意义
基因位点
检测意义
氯吡格雷
01CYP2C192G>A
细胞色素氧化酶2C192型,代谢酶
预测氯吡格雷抵抗风险,给出个体合适剂量,提高氯吡格雷疗效,降低无效用药风险;
氯吡格雷为前药,体外无活性,口服经肠ABCB1吸收,入肝脏,经肝药酶CYP2C192、3、17代谢激活,其活性代谢产物,再经过PON1激活,才能发挥抗血小板的功效;CYP2C192、3、17及PON1酶活性决定了氯吡格雷的疗效;
93MTHFR1298A>C
亚甲基四氢叶酸还原酶,代谢酶
质子泵抑制剂：奥美拉唑、泮托拉唑、兰索拉唑、埃索美拉唑
01CYP2C192G>A
细胞色素氧化酶2C192型,代谢酶
1、治疗胃食管反流、胃溃疡、根除等,PM、IM疗效好；
2、EM疗效不理想,EM者应加用法莫替丁等；
3、UM者,换用雷贝拉唑;
预测疗效,减少无效用药
IM中间代谢型：换药,用比索洛尔或卡维地洛;或减少50%剂量;
UM超快代谢型：换药,用比索洛尔或卡维地洛;
美托洛尔的副作用有头晕、头痛、乏力、四肢冰凉、心跳减慢、胸闷、血压忽高忽低等等;
美托洛尔疗效和副作用受CYP2D6代谢酶影响,检测该基因判断患者代谢快慢,给出个体化用药剂量建议,提高疗效,降低副反应;
神经胶质瘤：替莫唑胺+放疗治疗,A意味着MGMT甲基化,替莫唑胺结合放疗,预后较好;
同上
甲氨蝶呤
68MTHFR677C>T
亚甲基四氢叶酸还原酶,代谢酶
TT基因型粘膜毒性和ADR比CT和CC型高；CT型毒性较低；CC型,副作用风险低,可用较高剂量;
93MTHFR1298A>C
亚甲基四氢叶酸还原酶,代谢酶
个体化用药基因检测概述
不同实验室和机构之间的检测方法、数据解读标准和流程可能存在差异，导致检测结果不一致。需要制定统一的 行业标准和规范，促进标准化进程。
伦理、法律与隐私保护问题
伦理考量
个体化用药基因检测涉及个人基 因信息，应尊重个人隐私权和自 主权。在检测过程中应遵循伦理 原则，确保受检者知情同意和隐
私安全。
此外，个体化用药基因检测还可以应用于健康管理领域，帮助人们了解自己的基因变异情况，制定个 性化的健康管理计划。
04 个体化用药基因检测的挑 战与前景
数据解读与标准化问题
解读准确性
个体化用药基因检测涉及复杂的基因变异信息，准确解读这些数据是关键。需要建立标准化的解读方法和流程， 确保结果的可靠性。
等健康指导。
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其他相关技术
其他相关技术包括限制性片段长度多 态性分析（RFLP）、单链构象多态性 分析（SSCP）、变性梯度凝胶电泳 （DGGE）等。
这些技术可用于检测基因突变和多态 性，为个体化用药基因检测提供依据。
03 个体化用药基因检测的应 用领域
肿瘤个性化治疗
肿瘤个性化治疗是指根据患者的基因变异情况，为其提供针 对性的治疗方案，以提高治疗效果和生存率。个体化用药基 因检测可以检测肿瘤细胞的基因变异，为医生提供治疗依据 ，帮助制定个性化的用药方案。
案例三：新药研发中的基因检测应用
总结词
加速新药研发、提高成功率
详细描述
在新药研发过程中，基因检测可以用于筛选潜在的药物靶点，评估药物的疗效和 安全性，从而加速新药的研发进程，提高成功率。
案例四：基因检测在个性化健康管理中的应用
总结词
预防疾病、个性化健康指导
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缩短调药时间，降低血栓和出血等不良反应发生。
12CYP2C9*3(1075A>C)
细胞色素氧化酶2C9*3型，代谢酶
阿司匹林
106PEAR1（G>A）
PEAR1:GG等位基因对阿司匹林抗血小板应答好；AA\AG基因型，
用阿司匹林(或结合氯吡格雷)，PCI患者，心梗和死亡率高。
预测疗效，给出个体化用量。
硝酸甘油
20ALDH2(1510G>A)
线粒体乙醛脱氢酶2，代谢酶
30%~50%的人携带有Lys504基因突变。突变者中42.4%，正常剂
细胞色素氧化酶2D6100位点多态性，代谢酶
UM超快代谢型：换药，用比索洛尔或卡维地洛。
美托洛尔的副作用有头晕、头痛、乏力、四肢冰凉、心跳减慢、胸闷、 血压忽咼忽低等等。
美托洛尔疗效和副作用受CYP2D6代谢酶影响，检测该基因判断患者 代谢快慢，给出个体化 用药剂量建议，提高疗效，降低副反应。
10CYP2D6(1758G>A)
细胞色素氧化酶2D61758位点多态性，代谢酶
坎地沙坦
64AGTR1(1166A>C)
型血管紧张素II受体1166位点，靶点
AA基因型心衰患者，使用坎地沙坦治疗，疗效应答比AC、(CC)型
好。
预测疗效。
阿托伐他汀
62ABCB1(3435T>C)
多耐药基因1的3435位点，药物转运体
TT基因型，降脂效果最好，其次是CT型。CC型降脂效果较小。
其中，CYP2C19*17突变后，氯吡格雷活性增强，敏感度高，出血风
险高，需高度关注出血风险，尤其是蛛网膜下腔出血。
02CYP2C19*3(G>A)
细胞色素氧化酶2C19*3型，代谢酶
60CYP2C19*17(C>T)
细胞色素氧化酶2C19*17型，代谢酶
152PON1(A>G)
对氧磷酶1，代谢酶
氯吡格雷简化版
(只测两个位点胞色素氧化酶2C19*2型，代谢酶
仅仅判断氯吡格雷抵抗风险，只能测出部分抵抗患者，会有漏检，且 不能判断出血风险。
02CYP2C19*3(G>A)
细胞色素氧化酶2C19*3型，代谢酶
华法林
69VKORC1(1639G>A)
维生素K环氧化物还原酶复合物1亚单位，靶点
预测降脂效果
13ABCB1(2677T>G)
多耐药基因1的2677位点，药物转运体
GG基因型患者，阿托伐他汀治疗，降脂效果比GT、TT型者明显。
预测降脂效果
叶酸
68MTHFR(677C>T)
亚甲基四氢叶酸还原酶，代谢酶
1、677的TT基因型，叶酸转化为甲基叶酸受限，使用叶酸不能降低
血中同型半胱氨酸水平。应配合使用大剂量VB12。
检测项目名称
基因位点
检测意义
氯吡格雷
01CYP2C19*2(G>A)
细胞色素氧化酶2C19*2型，代谢酶
预测氯吡格雷抵抗风险，给出个体合适剂量，提高氯吡格雷疗效，降
低无效用药风险。
氯吡格雷为前药，体外无活性，口服经肠(ABCB1)吸收,入肝脏，经肝 药酶CYP2C19*2、*3、*17代谢激活，其活性代谢产物，再经过PON1激活，才能发挥抗血小板的功效。CYP2C19*2、*3、*17及PON1酶活性决定了氯吡格雷的疗效。
2、1298的CC基因型，叶酸转化为甲基叶酸受限，使用叶酸不能降
低血中同型半胱氨酸水平。应配合使用大剂量VB12。
检测叶酸代谢通路，通路受阻者，体内叶酸缺乏，各种代谢及合成不 足，从而引发多种疾病，比如糖尿病，高血压、脑卒中、偏头痛、痴 呆、动脉硬化、静脉血栓、精神疾病，胎儿发育异常等。
93MTHFR(1298A>C)
量硝酸甘油起效慢，应换药或联用其他抗心绞痛药物。
预测硝酸甘油抵抗风险，避免用药无效事件
美托洛尔
06CYP2D6(2850C>T)
细胞色素氧化酶2D62850位点多态性，代谢酶
PM弱代谢型：换药，用比索洛尔或卡维地洛。或减少75%剂量。
IM中间代谢型：换药，用比索洛尔或卡维地洛。或减少50%剂量。
08CYP2D6(100C>T)
量的30-70；CC基因型(*3/*3)，巯嘌呤禁用或将剂量减少到正常 起始剂量的6%，硫唑嘌呤减少剂量到正常起始剂量的10%，并将给
药频率从每天一次减少到每周三次。并根据骨髓抑制情况进一步调整 药物剂量。硫鸟嘌呤给药情况类似。
预测疗效及毒副作用：酶活性咼，药物有效成分被代谢火活的多，毒 性低，疗效也减低，疾病复发率咼。酶活性低，药物有效成分被火活 的少，疗效好，但副作用风险高，复发率低。
02CYP2C19*3(G>A)
细胞色素氧化酶2C19*3型，代谢酶
硫唑嘌呤
巯嘌呤、硫鸟嘌呤
19TPMT*3(T>C)
巯嘌呤甲基转移酶*3型，代谢酶
TT基因型(*1/*1),酶活性正常，正常剂量给药。CC基因型(*3/*3)，
酶活性低，硫鸟嘌呤和嘌呤类似物毒性高，可使患者出现严重骨髓抑 制，可致命，应减剂量。TC基因型(*1/*3)，减少剂量到正常起始剂
亚甲基四氢叶酸还原酶，代谢酶
质子泵抑制剂：奥 美拉唑、泮托拉唑、 兰索拉唑、埃索美 拉唑
01CYP2C19*2(G>A)
细胞色素氧化酶2C19*2型，代谢酶
1、 治疗胃食管反流、胃溃疡、根除H.pylori等，PM、IM疗效好；
2、EM疗效不理想，EM者应加用法莫替丁等；
3、UM者，换用雷贝拉唑。
预测疗效，减少无效用药
糖皮质激素
27PAI-1(4G/5G)
纤溶酶原激活物抑制物-1，效应分子
判断股骨头坏死的风险：PAI-1 4G/5G:4G5G高风险，5G低风
险；ABCB1 C3435T:CC高风险 ；C T/TT低风险。
62ABCB1(3435T>C)
多耐药基因1的3435位点，药物转运体
风险较高：PAI-1及ABCB1均为高风险，即两个高风险，则风险度
高。需高度关注骨骼反应，冋时配伍用双膦酸盐。降低激素剂量并换 用其他药物。
风险度中等：PAI-1及ABCB1中，有一个高风险，则风险度中等，需 要关注骨骼反应，一旦有不良反应征象，即配伍用双膦酸盐。
风险度低：PAI-1及ABCB1均为低风险，则风险度低。但仍需关注骨 骼反应，一旦有不良反应征象，即配伍用双膦酸盐。