药物基因检测位点及意义
肿瘤科药物基因检测介绍
Subject incidences of grade 3/4 diarrhoea based on UGT1A1 genotype Green, yellow, and pink bars represent the incidences for patients harbouring UGT1A1 wild-type (*1/*1), heterozygous (*1/*6, *1/*28), and homozygous (*6/*6, *6/*28, *28/*28) genotypes, respectively. Abbreviation: RR=relative risk.
美国FDA已在伊立替康药品说明书上规定，使用伊立替康 前需检测患者是否携带有UGT1A1*28。
UGT1A1*28突变率
UGT1A1*6（G71R，211G>A）是东方人群中特有的突变等位基 因，该突变使UGT1A1活性下降70％，伊立替康所致4级中性粒细 胞减少症的发生率升高3倍。
Med Oncol (2013) 30:604
UGT1A1基因具有多态性，其表达水平高度可变，导致不同患 者间SN-38糖化反应速率相差最高达50倍。UGT1A1基因功能缺陷 可导致SN-38显著增加，从而显著增加腹泻/中性粒细胞减少发生。
UGT1A1基因具有多态性，国外研究发现最常见的是位于其启动 子区TATA盒内的TA重复次数多态性UGT1A1*28。野生型含6次TA重复 （TA6，UGT1A1*1），突变型个体含7次重复（TA7，UGT1A1*28）。
Use label-recommended dosage and administration (Moderate recommendation)
药物基因组学检测工作
药物基因组学检测工作药物基因组学 (pharmaeogenomies)又称基因组药物学或基因组药理学，是药理学或基因组学的一个分支，它是研究基因组或基因变异对药物在人体内吸收、代谢、疗效及不良反应的影响，从而指导临床合理用药的一门新学科。
目前，很多高血压或糖尿病等常见病、多发病的患者在接受治疗时，同样的疾病使用同样剂量的同一药物，在疗效和不良反应方面存在显著差异，其原因是多方面的，其中患者间基因的个体差异因素起着相当重要的作用，正是这种差异直接导致患者对药物敏感性不同。
因而根据患者遗传背景，检测出患者的基因个体差异，选取正确的药物并确定正确的给药剂量，正是药物基因组学服务的目的。
美国FDA于2007年首次批准了华法林的基因组学检测方法，用于判断其用量及敏感性。
截至2011年，美国已有70余种药物说明书上注明要求根据药物基因组学信息，制订个体化用药方案。
结合国内外基因组检测较为成熟的经验和我院的实际情况，我院临床药学科与检验科现已开展质子泵抑制剂、氯吡格雷、华法林等相关药物基因组学检测工作。
1.药物基因组学研究内容药物基因组学主要是利用已知的基因组学理论，来研究人体遗传因素对药物反应的影响，其主要内容包括：药物代谢酶、药物转运蛋白、药物作用靶点等基因多态性。
它以药物效应和安全性为目标，主要研究药物效应的个体性差异，并针对不同个体的基因型进行个性化针对治疗。
2.药物相关基因检测的适合人群通常需要长期甚至终身接受某种药物治疗的患者(如心血管药物、精神病药物、消化道药物、抗病毒药物) ;有过严重药物不良反应史或家族成员中有过药物不良反应的人;同时接受多种药物治疗的患者;经常接触有毒物质的患者;使用某种药物效果一直不理想，病情控制不稳定的患者;某些特殊人群：儿童和老年人等人群，适合作药物相关基因检测。
3.药物基因组学检测方法根据检测对象的不同，药物基因组学对用药指导的检测可以分为三类：即药物代谢酶基因检测、药物转运体基因检测、药物靶点基因检测。
中国人群常见的药物代谢相关基因多态位点及其检测方法
中国人群常见的药物代谢相关基因多态位点及其检测方法杨琳艳;杨旭;范冬梅;梁志坤;叶倩平;杨学习【摘要】药物代谢个体差异的一个重要来源是遗传多态性即药物代谢相关基因的多态性.中国人群中药物代谢酶基因多态性的系统性分析已发现了很多潜在的功能性多态性位点,因此建立起针对中国人群的药物代谢酶基因多态性的检测技术,对常见的药物代谢相关基因多态位点的检测以及针对这些多态性位点建立个性化用药技术具有重要的意义.检测药物代谢基因多态性大多采用传统的聚合酶链式反应(PCR)和限制性片段长度多态性(RFLP)等方法,随着基因诊断的快速发展,高通量、快速准确的基因多态性检测方法开始发展起来,如基因芯片法、下一代测序技术等.本文对药物代谢酶基因多态性位点及其检测方法进行综述.【期刊名称】《分子诊断与治疗杂志》【年(卷),期】2017(009)005【总页数】6页(P358-363)【关键词】药物代谢;基因多态性;下一代测序技术【作者】杨琳艳;杨旭;范冬梅;梁志坤;叶倩平;杨学习【作者单位】广州市达瑞生物技术股份有限公司,广东,广州510665;广州市达瑞生物技术股份有限公司,广东,广州510665;广州市达瑞生物技术股份有限公司,广东,广州510665;广州市达瑞生物技术股份有限公司,广东,广州510665;广州市达瑞生物技术股份有限公司,广东,广州510665;南方医科大学检验与生物技术学院,广东,广州510515【正文语种】中文药物在体内的作用过程包括药物的吸收、生物转化、分布和排泄等一系列过程。
而其中的生物转化即为药物代谢，指的是药物在体内经过吸收、重新分布以后，在药物酶的作用下其化学结构发生一系列变化的过程。
药物化学结构的变化包括其化学成分分子的缩合、降解以及分子功能团的增减和变换等。
经生物转化后，药物相应的理化性质随之发生改变，进而导致其毒理和药理活性的变化［1⁃2］。
对药物的代谢过程进行研究可以明确药物中发挥药效的活性成分，阐明药物的科学内涵，促进质量控制和剂型改进，进而指导临床用药。
怎么看懂基因检测报告结果
怎么看懂基因检测报告结果基因检测已经成为了一个热门话题，很多人都在进行基因检测，但是当他们拿到基因检测报告后，却不知道如何理解和分析这些结果。
本文将简单介绍如何看懂基因检测报告结果。
1. 了解基因检测的类型基因检测分为大众基因检测和临床基因检测两种类型。
大众基因检测是指基因检测公司通过对个人唾液或血液的检测，分析检测者的基因信息，提供可能与健康、运动、营养、亲子关系等方面相关的基因风险提示或个性化建议。
而临床基因检测是指医生根据患者的病情，进行特定基因检测并按照临床诊断规范进行解读，用于指导临床诊疗。
2. 理解基因检测报告中的基因位点基因位点是指基因组中的特定位置，每个人的基因组中有约30万个基因位点。
基因检测报告会列出检测者在每个基因位点上的基因型，通常用字母A、T、C、G表示，分别代表四种碱基。
例如，一个位点的基因型可能是AA、AG或GG等，分别表示检测者在该位点上拥有两个A基因、一个A基因和一个G基因或者两个G基因。
3. 了解基因检测报告中的基因风险提示基因检测报告通常会列出检测者在某些基因位点上的基因型与与某些疾病的相关性，例如，检测者是否携带易患乳腺癌的基因突变等。
但需要注意的是，基因风险提示只能作为参考，不能作为诊断依据。
此外，基因风险提示并不意味着患病的风险一定会增加，只是表示该基因型在人类研究中与某种疾病的发生率有一定的关系。
4. 了解基因检测报告中的健康建议基因检测报告通常会提供一些基于检测者基因型的个性化健康建议，例如，适合的饮食、运动、保健等建议。
但需要注意的是，这些健康建议仅供参考，不能作为替代医学的建议。
总之，基因检测报告需要仔细阅读和理解，最好在医生或遗传咨询师的指导下进行解读和分析。
基因检测结果不应该用来自诊或自我治疗，而应该与临床医生或遗传咨询师共同制定合理的治疗或预防方案。
药物基因检测位点及意义
基因位点
检测意义
氯吡格雷
01CYP2C192G>A
细胞色素氧化酶2C192型,代谢酶
预测氯吡格雷抵抗风险,给出个体合适剂量,提高氯吡格雷疗效,降低无效用药风险;
氯吡格雷为前药,体外无活性,口服经肠ABCB1吸收,入肝脏,经肝药酶CYP2C192、3、17代谢激活,其活性代谢产物,再经过PON1激活,才能发挥抗血小板的功效;CYP2C192、3、17及PON1酶活性决定了氯吡格雷的疗效;
93MTHFR1298A>C
亚甲基四氢叶酸还原酶,代谢酶
质子泵抑制剂：奥美拉唑、泮托拉唑、兰索拉唑、埃索美拉唑
01CYP2C192G>A
细胞色素氧化酶2C192型,代谢酶
1、治疗胃食管反流、胃溃疡、根除等,PM、IM疗效好；
2、EM疗效不理想,EM者应加用法莫替丁等；
3、UM者,换用雷贝拉唑;
预测疗效,减少无效用药
IM中间代谢型：换药,用比索洛尔或卡维地洛;或减少50%剂量;
UM超快代谢型：换药,用比索洛尔或卡维地洛;
美托洛尔的副作用有头晕、头痛、乏力、四肢冰凉、心跳减慢、胸闷、血压忽高忽低等等;
美托洛尔疗效和副作用受CYP2D6代谢酶影响,检测该基因判断患者代谢快慢,给出个体化用药剂量建议,提高疗效,降低副反应;
神经胶质瘤：替莫唑胺+放疗治疗,A意味着MGMT甲基化,替莫唑胺结合放疗,预后较好;
同上
甲氨蝶呤
68MTHFR677C>T
亚甲基四氢叶酸还原酶,代谢酶
TT基因型粘膜毒性和ADR比CT和CC型高；CT型毒性较低；CC型,副作用风险低,可用较高剂量;
93MTHFR1298A>C
亚甲基四氢叶酸还原酶,代谢酶
基因位点检测的意义
基因位点检测的意义
基因位点检测是一种通过对特定基因组中的个别位置进行检测，从而了解个体
基因组变异的方法。
这项技术在近年来得到了广泛推广和应用，对于疾病预防、诊断和治疗等方面都具有重要意义。
首先，基因位点检测可以帮助人们了解个体患病风险。
通过检测某些特定基因
位点的变异情况，可以预测个体患某些疾病的可能性。
例如，一些遗传性疾病如囊性纤维化、血友病等与特定基因位点的变异密切相关，通过基因位点检测，可以对患病风险进行评估，为疾病的预防和及早干预提供重要依据。
其次，基因位点检测对于个体化治疗也具有重要意义。
在癌症治疗中，通过对
癌细胞特定基因位点的检测，可以选择更有效的靶向药物治疗方案，提高治疗效果，减少不必要的药物副作用。
个体化用药可以基于每个患者的基因组特征进行调整，从而实现更精准的治疗。
另外，基因位点检测还可以帮助人们了解自身的遗传特征，为生殖健康和家族
规划提供重要参考。
某些基因位点的变异可能导致不孕症等生殖健康问题，通过检测这些位点，可以及早发现潜在问题，采取相应的干预措施。
此外，对于家族规划来说，了解家族中潜在的遗传疾病风险也有助于做出明智的家庭规划决策。
总的来说，基因位点检测对于提高疾病预防、治疗的效果，实现个体化医疗，
以及促进生殖健康和家族规划都具有重要意义。
随着技术的不断进步和降低成本，基因位点检测将在未来得到更广泛的应用，并为人类健康提供更多的帮助和支持。
基因检测报告
基因检测报告基因检测是一种通过分析个体基因组DNA序列来预测个体患病风险、遗传特征和药物反应的技术。
基因检测报告是基因检测的结果呈现形式，它是基因检测的重要产物，对于个体健康管理和疾病预防具有重要意义。
基因检测报告通常包括以下内容，基因位点信息、基因型分析结果、疾病风险评估、药物代谢能力评估、遗传特征分析等。
基因位点信息是指被检测的基因位点的具体位置和基因型，通过这些信息可以了解个体的基因组变异情况。
基因型分析结果是对基因型进行解读和分析，包括正常基因型、携带致病突变基因型等。
疾病风险评估是根据基因型分析结果，预测个体患某些疾病的风险程度，如心血管疾病、癌症等。
药物代谢能力评估是根据基因型分析结果，评估个体对某些药物的代谢能力，为个体用药提供参考。
遗传特征分析是根据基因型分析结果，分析个体的遗传特征，如血型、耐受力等。
基因检测报告的编制需要严格的实验操作和数据分析，确保结果的准确性和可靠性。
在编制基因检测报告时，需要遵循相关的法律法规和伦理规范，保护个体隐私和数据安全。
此外，基因检测报告还需要清晰的文字和图表呈现，使个体能够直观地理解检测结果，为个体健康管理和疾病预防提供科学依据。
基因检测报告的应用具有重要的临床和健康管理意义。
首先，基因检测报告可以帮助个体了解自己的遗传特征和潜在的健康风险，有针对性地进行健康管理和疾病预防。
其次，基因检测报告可以为个体提供个性化的用药指导，避免药物不良反应和提高治疗效果。
最后，基因检测报告还可以为家庭遗传病风险评估和生育选择提供科学依据，促进家庭健康和生育规划。
总之，基因检测报告是基因检测的重要产物，对于个体健康管理和疾病预防具有重要意义。
基因检测报告的编制需要严格的实验操作和数据分析，确保结果的准确性和可靠性。
基因检测报告的应用具有重要的临床和健康管理意义，可以帮助个体了解自己的遗传特征和潜在的健康风险，为个体健康管理和疾病预防提供科学依据。
儿童支原体肺炎耐药基因检测及临床意义
中国乡村医药·检验与影像·儿童支原体肺炎耐药基因检测及临床意义陆燕陈炳才吴鸣肺炎支原体（M P）是儿童时期社区获得性肺炎（C AP）最重要的病原体之一，支原体肺炎（MPP）占儿童CAP住院的10%～40%[1]。
本文观察我院住院的MPP 患儿咽拭子标本MP核酸检测及对大环内酯类药物耐药基因常见突变情况，比较耐药突变阳性与阴性患儿的临床表现、辅助检查及重症MPP的发生情况。
1 资料与方法1.1 标本来源2015年4月至2016年11月我院儿科住院的MPP患儿181例。
其中男87例，女94例；年龄3个月至13岁，平均5岁；血清单次MP抗体滴度≥1∶160，或恢复期和急性期MP抗体滴度呈4倍及以上增高或减低。
排除原有先天性心脏病、先天性或获得性免疫功能缺陷、遗传代谢性疾病、先天性肺支气管疾病及营养不良者。
根据检测结果将患儿分为耐药突变阳性组与耐药突变阴性组。
1.2检测方法患儿入院后用无菌棉签适度拭抹咽后壁和两侧扁桃体部位，采样后迅速将拭子放入采样管中，旋紧管盖并密封，以防干燥。
由杭州美联生物科技有限公司采用实时荧光定量聚合酶链式反应（PCR）法检测标本中肺炎支原体核酸及对大环内酯类药物常见耐药基因突变位点。
检测到A2063G或A2064G点突变即为耐药基因阳性。
试剂盒为江苏默乐生物科技有限公司生产，检测仪器为ABI 7500实时荧光定量PCR仪，测序结果分析运用DNAM AN软件。
检测患儿血常规、C反应蛋白、肝肾功能、心肌基金项目：嘉兴市科技计划项目（2014AY21031-6）作者单位：314000 浙江嘉兴市第二医院儿科通信作者：吴鸣，Email:swa llow8158@ 酶、肺炎支原体抗体、痰培养、荧光病原体抗体、胸片等，并根据具体情况选择胸部CT、心电图、胸腔B超等检查。
1.3 重症MPP诊断标准①明显气促或心动过速；②应用大环内酯类药物1周以上无效（持续腋温≥38.5℃或肺部影像学无好转甚至进展），或持续发热超过10天；③胸部影像学表现为大片状致密影，占据一个肺段或肺叶以上范围；④出现胸腔积液、肺不张、肺坏死或肺脓肿等肺内并发症；⑤出现严重低氧血症或合并其他系统严重损害。
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风险度中等：PAI-1及ABCB1中，有一个高风险，则风险度中等，需要关注骨骼反应，一旦有不良反应征象，即配伍用双膦酸盐。
风险度低：PAI-1及ABCB1均为低风险，则风险度低。但仍需关注骨骼反应，一旦有不良反应征象，即配伍用双膦酸盐。
（只测两个位点）
01CYP2C19*2(G>A)
细胞色素氧化酶2C19*2型，代谢酶
仅仅判断氯吡格雷抵抗风险，只能测出部分抵抗患者，会有漏检，且不能判断出血风险。
02CYP2C19*3(G>A)
细胞色素氧化酶2C19*3型，代谢酶
华法林
69VKORC1(1639G>A)
维生素K环氧化物还原酶复合物1亚单位，靶点
预测疗效及毒副作用：酶活性高，药物有效成分被代谢灭活的多，毒性低，疗效也减低，疾病复发率高。酶活性低，药物有效成分被灭活的少，疗效好，但副作用风险高，复发率低。
糖皮质激素
27PAI-1(4G/5G)
纤溶酶原激活物抑制物-1，效应分子
判断股骨头坏死的风险：PAI-1 4G/5G：4G5G高风险，5G低风险；ABCB1 C3435T：CC高风险；C T/TT低风险。
细胞色素氧化酶2C19*2型，代谢酶
1、治疗胃食管反流、胃溃疡、根除H.pylori等，PM、IM疗效好；
2、EM疗效不理想，EM者应加用法莫替丁等；
3、UM者，换用雷贝拉唑。
预测疗效，减少无效用药
02CYP2C19*3(G>A)
细胞色素氧化酶2C19*3型，代谢酶
硫唑嘌呤
巯嘌呤、硫鸟嘌呤
19TPMT*3(T>C)
巯嘌呤甲基转移酶*3型，代谢酶
TT基因型(*1/*1),酶活性正常，正常剂量给药。CC基因型（*3/*3），酶活性低，硫鸟嘌呤和嘌呤类似物毒性高，可使患者出现严重骨髓抑制，可致命，应减剂量。TC基因型(*1/*3)，减少剂量到正常起始剂量的30-70；CC基因型（*3/*3），巯嘌呤禁用或将剂量减少到正常起始剂量的6%，硫唑嘌呤减少剂量到正常起始剂量的10%，并将给药频率从每天一次减少到每周三次。并根据骨髓抑制情况进一步调整药物剂量。硫鸟嘌呤给药情况类似。
其中，CYP2C19*17突变后，氯吡格雷活性增强，敏感度高，出血风险高，需高度关注出血风险，尤其是蛛网膜下腔出血。
02CYP2C19*3(G>A)
细胞色素氧化酶2C19*3型，代谢酶
60CYP2C19*17(C>T)
细胞色素氧化酶2C19*17型，代谢酶
152PON1(A>G)
对氧磷酶1，代谢酶
氯吡格雷简化版
美托洛尔疗效和副作用受CYP2D6代谢酶影响，检测该基因判断患者代谢快慢，给出个体化用药剂量建议，提高疗效，降低副反应。
08CYP2D6(100C>T)
细胞色素氧化酶2D6 100位点多态性，代谢酶
10CYP2D6(1758G>A)
细胞色素氧化酶2D6 1758位点多态性，代谢酶
坎地沙坦
64AGTR1(1166A>C)
细胞色素氧化酶06PEAR1（G>A）
PEAR1：GG等位基因对阿司匹林抗血小板应答好；AA\AG基因型，用阿司匹林（或结合氯吡格雷），PCI患者，心梗和死亡率高。
预测疗效，给出个体化用量。
硝酸甘油
20ALDH2(1510G>A)
线粒体乙醛脱氢酶2，代谢酶
30%~50%的人携带有Lys504基因突变。突变者中42.4%，正常剂量硝酸甘油起效慢，应换药或联用其他抗心绞痛药物。
预测硝酸甘油抵抗风险，避免用药无效事件
美托洛尔
06CYP2D6(2850C>T)
细胞色素氧化酶2D6 2850位点多态性，代谢酶
PM弱代谢型：换药，用比索洛尔或卡维地洛。或减少75%剂量。
IM中间代谢型：换药，用比索洛尔或卡维地洛。或减少50%剂量。
UM超快代谢型：换药，用比索洛尔或卡维地洛。
美托洛尔的副作用有头晕、头痛、乏力、四肢冰凉、心跳减慢、胸闷、血压忽高忽低等等。
华法林经CYP2C9代谢后失活，基因突变者导致该药在体内蓄积，应减量；VKORC1为华法林作用靶点，基因突变者，对华法林敏感性增加，应减量。VKORC1 CYP2C9用于起始剂量和维持剂量的计算，起始剂量给药五天后，转入维持剂量微调。
缩短调药时间，降低血栓和出血等不良反应发生。
12CYP2C9*3(1075A>C)
检测叶酸代谢通路，通路受阻者，体内叶酸缺乏，各种代谢及合成不足，从而引发多种疾病，比如糖尿病，高血压、脑卒中、偏头痛、痴呆、动脉硬化、静脉血栓、精神疾病，胎儿发育异常等。
93MTHFR(1298A>C)
亚甲基四氢叶酸还原酶，代谢酶
质子泵抑制剂：奥美拉唑、泮托拉唑、兰索拉唑、埃索美拉唑
01CYP2C19*2(G>A)
检测项目名称
基因位点
检测意义
氯吡格雷
01CYP2C19*2(G>A)
细胞色素氧化酶2C19*2型，代谢酶
预测氯吡格雷抵抗风险，给出个体合适剂量，提高氯吡格雷疗效，降低无效用药风险。
氯吡格雷为前药，体外无活性，口服经肠(ABCB1)吸收,入肝脏，经肝药酶CYP2C19*2、*3、*17代谢激活，其活性代谢产物，再经过PON1激活，才能发挥抗血小板的功效。CYP2C19*2、*3、*17及PON1酶活性决定了氯吡格雷的疗效。
多耐药基因1的2677位点，药物转运体
GG基因型患者，阿托伐他汀治疗，降脂效果比GT、TT型者明显。
预测降脂效果
叶酸
68MTHFR(677C>T)
亚甲基四氢叶酸还原酶，代谢酶
1、677的TT基因型，叶酸转化为甲基叶酸受限，使用叶酸不能降低血中同型半胱氨酸水平。应配合使用大剂量VB12。
2、1298的CC基因型，叶酸转化为甲基叶酸受限，使用叶酸不能降低血中同型半胱氨酸水平。应配合使用大剂量VB12。
糖皮质诱导的股骨头坏死患者平均年龄在35岁左右，正值壮年，若因为药物的副作用致残，很可惜。基因检测可以预测糖皮质激素诱导的股骨头坏死风险。筛查出高风险患者，配合使用双膦酸盐，预防股骨头坏死。
I型血管紧张素II受体1166位点，靶点
AA基因型心衰患者，使用坎地沙坦治疗，疗效应答比AC、（CC）型好。
预测疗效。
阿托伐他汀
62ABCB1(3435T>C)
多耐药基因1的3435位点，药物转运体
TT基因型，降脂效果最好，其次是CT型。CC型降脂效果较小。
预测降脂效果
13ABCB1(2677T>G)