第九章 数量遗传学

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数量遗传学知识点总结

数量遗传学知识点总结

第一章绪论一、基本概念遗传学:生物学中研究遗传和变异,即研究亲子间异同的分支学科。

数量遗传学:采用生物统计学和数学分析方法研究数量性状遗传规律的遗传学分支学科。

二、数量遗传学的研究对象数量遗传学的研究对象是数量性状的遗传变异。

1.性状的分类性状:生物体的形态、结构和生理生化特征与特性的统称。

如毛色、角型、产奶量、日增重等。

根据性状的表型变异、遗传机制和受环境影响的程度可将性状分为数量性状、质量性状和阈性状3类。

数量性状:遗传上受许多微效基因控制,性状变异连续,表型易受环境因素影响的性状,如生长速度、产肉量、产奶量等。

质量性状:遗传上受一对或少数几对基因控制,性状变异不连续,表型不易受环境因素影响的性状,如毛色、角的有无、血型、某些遗传疾病等。

阈性状:遗传上受许多微效基因控制,性状变异不连续,表型易受或不易受环境因素影响的性状。

有或无性状:也称为二分类性状(Binary traits)。

如抗病与不抗病、生存与死亡等。

分类性状:如产羔数、产仔数、乳头数、肉质评分等。

必须进行度量,要用数值表示,而不是简单地用文字区分;要用生物统计的方法进行分析和归纳;要以群体为研究对象;组成群体某一性状的表型值呈正态分布。

3.决定数量性状的基因不一定都是为数众多的微效基因。

有许多数量性状受主基因(major gene)或大效基因(genes with large effect)控制。

果蝇的巨型突变体基因(gt);小鼠的突变型侏儒基因(dwarf, df);鸡的矮脚基因(dw);美利奴绵羊中的Booroola基因(FecB);牛的双肌(double muscling)基因(MSTN);猪的氟烷敏感基因(RYR1)三、数量遗传学的研究内容数量性状的数学模型和遗传参数估计;选择的理论和方法;交配系统的遗传效应分析;育种规划理论。

四、数量遗传学与其他学科间的关系理论基础奠定:孟德尔遗传学+数学+生物统计学理论体系完善:与群体遗传学关系最为密切;学科应用:与育种学最为密切,是育种学的理论基础和方法论; 学科发展:与分子生物学、生物进化学、系统科学和计算机科学密切结合,并产生了新的遗传学分支学科,如分子数量遗传学等。

第9章遗传学数量性状遗传分析

第9章遗传学数量性状遗传分析

系谱和概率分析
数量性状 数量上的变化 (如高度) 连续 微效多基因 敏感 统计分析
当前3页,共45页,星期日。
数量性状包括两大类:
一 是表型为严格的连续变异的性状,如牛的泌乳量, 羊毛的长度等等;
二 是表型呈非连续变异,而遗传物质的数量呈潜在 的连续变异的性状,即只有超越某一遗传阈值时才出现的性
状,如抗病、死亡率以及单胎动物的产仔数等性状,称为阈性 状(threshold character或threshold trait)。
2)数量性状呈连续性的变异;
3)数量性状的表现容易受到环境的影响;
4)控制数量性状的遗传基础是多基因系统
数量性状的遗传在本质上与孟德尔式的遗传完全一样, 只是需要用多基因理论来解释。
当前6页,共45页,星期日。
二 数量性状遗传的多基因假说
1909年,瑞典遗传学家Nilsson-Ehle对小麦和燕麦中籽粒 颜色的遗传进行了研究,发现在若干个红粒与白粒的杂交组合 中有如下A、B、C 3种情况:
数量性状:性状之间呈连续变异状态,界限不清楚,用数 字描述的性状。如人的身高、体重,作物的产量,棉花的 纤维长度等
当前2页,共45页,星期日。
质量性状和数量性状的区别
质量性状
①.变异类型
种类上的变化 (如红、白花)
②.表现型分布
不连续
③.基因数目
一个或少数几个
④.对环境的敏感性 不敏感
⑤.研究方法
401 12.888 2.252 5.075
当前30页,共45页,星期日。
现以表5-1中玉米穗长试验的结果为例,计算各个 世代的表现型方差分量:
VP1=0.665 VP2=3.560
VF2=5.075 Ve=2.178

《数量遗传》课件

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遗传方差与变异方差
01
遗传方差是指由于遗传因素所引 起的表型变异,包括基因方差和 基因型方差。
02
变异方差是指由于环境因素所引 起的表型变异,包括环境方差和 残差方差。
遗传相关与相关系数
遗传相关是指两个性状在遗传上的关联程度,可以用相关系 数表示。
相关系数是指两个性状之间的关联程度,可以用相关系数r表 示,其值介于-1和1之间,正值表示正相关,负值表示负相关 。
基因治疗
利用基因编辑技术治疗遗 传性疾病,改善人类健康 状况。
人工智能在数量遗传学中的应用
数据挖掘和分析
利用人工智能技术处理大规模数据,挖掘数量性状的 遗传规律。
预测模型
基于人工智能算法构建预测模型,预测数量性状的表 现和遗传趋势。
辅助育种
利用人工智能技术优化育种方案,提高育种效率和成 功率。
转录组学和蛋白质组学分析
通过比较不同组织、发育阶段或不同处理条件下 的转录组和蛋白质组数据,筛选与目标性状相关 的差异表达基因和蛋白质。
04
数量遗传学在育种中的应用
BIG DATA EMPOWERS TO CREATE A NEW
ERA
作物育种
作物产量
数量遗传学在作物育种中可用于提高作物的产量。通过研究数量性状基因座(QTL),可 以定位控制产量性状的基因,进而通过分子标记辅助选择(MAS)等方法,将有益基因 聚合到一起,培育出高产的作物品种。
肉质和乳制品品质
数量遗传学在动物肉质和乳制品品质改良方面也有应用。 通过研究与肉质和乳制品品质相关的QTL,可以定位控制 这些性状的基因,进而利用MAS等技术,将有益基因聚合 到一起,培育出具有优良肉质和乳制品品质的动物品种。
人类医学研究

数量遗传学

数量遗传学

质量性状:指由一对或对基因控制,在个体间能够明显区分,呈不连续性变异的性状。

数量性状:由微效多基因控制,在群体中不能明显区分,呈连续性变异的性状。

门阈性状:由微效多基因控制的,在群体中呈不连续分布的性状,一般能够明显地区分其表现形式。

数量遗传学:指用数理统计方法和数学分析方法研究数量性状遗传和变异规律的科学。

选择:在人类和自然干预下,某一群体的基因在世代传递的过程中,某种基因型个体的比例所发生的变化现象,称作选择。

适应度:比较群体中各种基因型(以个体平均留种子女数为标准)生存适应力的相对指标。

适应度就是特定基因型的留种率和群体最佳基因型留种率之比值。

选择系数:1减去适应度就是该基因型的选择系数。

留种率+淘汰率=1遗传漂变:如果群体规模较小,下一代的实际基因频率都可能由于抽样误差而偏离理论上应有的频率。

始祖效应:当来自大群体的一个小样本在特定环境中成为一个新的封闭群体,其基因库仅包括亲本群体中遗传变异的一小部分,并在新环境中承受新进化压力的作用,因而最终可能与亲本群分体。

这种过程在体现的般规律,称为始祖效应。

瓶颈效应:当大群体经历一个规模缩小阶段之后,以及在漂变中改变了基因库(通常是变异性减少)又重新扩大时,基因频率发生的变化。

同型交配:如果把同型交配严格地定义为同基因型交配,那么近交和同质选配都只有部分的同型交配,只有极端的近交方式——自交才是完全同型交配。

群体遗传学:专门研究群体的遗传结构及其变化规律的遗传学分支学科。

群体:是指一个种、一个变种、一个品种或一个其它类群所有成员的总和。

孟德尔群体:在个体间有相系交配的可能性,并随着世代进行基因交流的有性繁殖群体。

基因库:以各种基因型携带着各种基因的许多个体所组成的群体。

亚群:由于各种原因的交配限制,可能导致基因频率分布不均匀的现象,形成若干遗传特性有一定差异的群落通常称为亚群。

随机资本:在一个有性系列的生物群体中,任何一个雌性式雄性的个体与其任何一个相反性别的个体交配的机率是相同的。

数量性遗传ppt课件

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现状
目前,数量性遗传学研究已经广泛应用于农业、医学和生物多样性保护等领域 ,取得了许多重要的研究成果。同时,随着技术的进步,数量性遗传学研究的 方法和手段也在不断更新和完善。
02
数量性遗传学基本理论
遗传学基础
孟德尔遗传定律
孟德尔遗传定律是数量性状遗传的基础,包括分离定律和独立分配 定律,决定了基因在世代间的传递规律。
05
数量性遗传学研究展望
基因组学技术发展
01
基因组学技术不断进步,将有助于更深入地揭示数量性状的遗 传基础。
02
高通量测序技术的普及和应用,将加速基因组学数据的获取和
分析,提高研究效率。
基因组学技术的发展将促进对基因组结构和功能的深入研究,
03
为数量性遗传学研究提供更多线索。
基因编辑技术应用
基因编辑技术如CRISPR-Cas9等的发展,将为数量性遗传学研究提供更精确和高效 的基因操作手段。
数量性遗传学
目录
• 数量性遗传学概述 • 数量性遗传学基本理论 • 数量性状基因定位与克隆 • 数量性状基因组学应用 • 数量性遗传学研究展望
01
数量性遗传学概述
定义与特点
定义
数量性遗传学是一门研究生物数量性 状遗传规律的科学,主要关注可遗传 的连续变异,如身高、体重等。
特点
数量性状受多基因控制,且受环境因 素影响较大,因此数量性遗传学研究 需要综合考虑遗传和环境因素对数量 性状的影响。
遗传相关性与协方差分析
遗传相关性
01
表示两个数量性状之间的遗传联系,可以通过相关系数来衡量

协方差分析
02
通过比较不同来源的协方差,评估两个数量性状之间的共同遗
传变异和环境变异。

《数量遗传学基础》课件

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03
人类健康与疾病研 究
利用数量遗传学方法研究人类复 杂疾病的发生机制,为疾病预防 和治疗提供新的思路和方法。
THANKS
感谢观看
3
疾病抵抗力增强
通过研究动物的疾病抗性基因,提高动物的疾病 抵抗力,降低养殖成本和动物疾病发生率。
人类遗传学研究
疾病预测与预防
利用数量遗传学方法,研究人类遗传性疾病的发病风险相关基因 ,为疾病的预测和预防提供科学依据。
个体差异研究
通过研究人类的数量性状基因,了解个体差异的遗传基础,为个性 化医疗和健康管理提供支持。
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• 数量遗传学概述 • 数量遗传学的基本概念 • 数量性状的遗传模型 • 数量遗传学的研究方法 • 数量遗传学的应用 • 展望与未来发展
01
数量遗传学概述
定义与特点
定义
数量遗传学是研究生物群体中数量性状遗传规律的科学。
特点
数量性状是受多基因控制的,其遗传变异规律比质量性状复 杂。
04
数量遗传学的研究方法
统计分析方法
统计分析方法
QTL分析
关联分析
元分析
这是数量遗传学中最为常见和 基础的研究方法。通过统计分 析,可以对遗传数据进行分析 和解释,探究遗传变异的来源 、分布和作用机制。
数量性状位点(QTL)分析是 利用统计学方法定位控制数量 性状的基因位点,分析基因位 点对表型变异的贡献。
表型组学研究
结合新一代测序技术和成像技术,对动植物表型组进行深入研究, 以揭示表型变异与遗传变异之间的关系。
未来发展方向与挑战
01
跨物种比较研究
比较不同物种间的遗传差异,以 揭示物种进化的机制和规律,为 生物多样性保护提供科学依据。

动物遗传学-第九章 数量遗传学基础

动物遗传学-第九章  数量遗传学基础
遗传力的真值难于真正得到,一般我们查阅的遗传力都有一 定的范围。
根据特定资料估计的遗传力,只能作为一个估计值看待。
n
P
P1 P2 Pn
Pii 1nn Nhomakorabea同理可得:
n
Gi
G i
,
n
n
Ei
E i n
若E与G之间相互独立,在一个随机交配的大群体中
n
Ei 0 P G
i
群体均值能否代表群体基因型均值取决于群体大小,群 体越大,代表性愈强。
一、遗传力(heritability):
(一)概念: 亲代传递其遗传特性的能力。 或指性状的遗传方差在总方差(表型方差)中 所占的比率。
二、简单性状和复杂性状
简单(遗传)性状 (simply-inherited trait) 受很少数基因的控制,而且几乎不受环境变化的影响。
如孟德尔豌豆试验中所列举的性状都是简单(遗传)性 状。
复杂性状 (complex trait) 受多个基因的作用,而且易受遗传或非遗传因素的影
响。多在医学上使用。如糖尿病。
(二)对遗传力的理解注意事项:
遗传力是描述性状的一个特征量,遗传力大说 明受到遗传的影响大,遗传力低则环境的作用大。 性状遗传力的高低并不表示性状的好坏与畜群 的好坏。
0<h2 <1
(三)若干性状的遗传力
性状 初生重 断奶重 成年体重 椎骨数 乳头数 背膘厚 眼肌面积
表1 表猪1 一猪一些些性性状状的遗遗传传力 力
第九章 数量遗传学基础
一、质量性状和数量性状
质量性状(qualitative trait) —遗传基础是单个或少数几个基因的作用,它的 表型变异是间断的。如牛的无角与有角,兔的白 化与有色。

《数量遗传 》课件

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05
数量遗传学展望
新技术与新方法的发展
基因组学技术
随着基因组学技术的不断进步, 数量遗传学将能够更深入地研究 基因与表型之间的关联,揭示更 多复杂的遗传现象。
大数据分析方法
利用大数据分析方法,对海量的 遗传数据进行分析,能够更准确 地识别基因与性状之间的关系。
人工智能与机器学

人工智能和机器学习技术的发展 将为数量遗传学提供更强大的工 具,用于预测和解析复杂的遗传 模式。
3
数量遗传学在植物育种中还涉及到基因组学和表 型组学的研究,以加速新品种的培育进程。
人类医学研究
ቤተ መጻሕፍቲ ባይዱ
数量遗传学在人类医学研究中主 要用于疾病易感性和复杂性疾病
的研究。
通过数量遗传学的方法,可以鉴 定与疾病相关的基因和变异位点 ,为疾病的预防和治疗提供理论
依据。
数量遗传学在人类医学研究中还 涉及到基因组学和表型组学的研 究,以揭示人类复杂的疾病机制
适用范围
适用于研究多个变量之间的相互关系和因果关 系。
分析步骤
构建因果模型,通过回归分析计算路径系数,然后评估模型的拟合度和解释力 度。
主成分分析
主成分分析
用于降低数据的维度,将多个相关变量转化为少数几 个不相关的主成分。
适用范围
适用于处理大量数据,特别是当变量之间存在多重共 线性时。
分析步骤
计算变量的相关系数矩阵,通过特征值和特征向量提 取主成分,然后解释主成分的意义和作用。
研究内容与领域
研究内容
数量遗传学主要研究数量性状的遗传 基础、遗传变异和进化过程,包括基 因型和表型关系的分析、遗传力和方 差组分的估计、选择反应和遗传进展 的预测等。
领域
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◆在考虑环境效应方差时:
VF2 =VA/2 + VD/4 +VE ◆可见: ◆ 要估计F2代加性方差,必需剔除VF2中的D和E; ◆ 三个不分离世代均只能估计环境效应方差(VE),而无 法进一步剔除VD; ◆ 因此,仅有P1,P2,F1,F2四个世代还不够,需要引 入B1,B2两个世代。
加性效应所引起的遗传变异量是可以通过选择在后代中 被固定下来的。加性方差是可固定的遗传变异量,可在 上、下代间传递。
显性方差(VD)和上位性方差(VI):
显性方差是指同一座位上等位基因间相互作用引起的变
异量。
上位性方差指非等位基因间的相互作用引起的变异量。 随着基因在不同世代中的分离与重组,基因间的关系 (基因型)会发生变化,显性效应、上位性效应引起的 变异将会逐代减小而消失,不能在世代间固定。 显性方差和上位方差又统称为非加性的遗传方差。
② 准连续变异(Quasi continuous variation):
如分蘖数(穗数)、 产蛋量、每穗粒数等, 不出现有小数点数字。
但有的性状即有质量亦有数量性状的特点质量-数量性状。
( 2 )对环境条件比较敏感:
两亲本的差异是遗传引起的,而亲本内部的个体差异是环境引起; F1基因型相同,其表型的差异是环境引起,且处于两亲本之间; F2与F1平均值相同;但变异范围大于F1。
fixi2 1/4 a2 1/2 d2 1/4 a2
1/4 1/2 1/4 N=1
∑fixi=1/2 d ∑fixi2=1/2a2+1/2d2
F2的遗传方差
◆无环境作用、无连锁、无互作(VI=0)
◆若性状受k对基因控制,k对基因间作用具有累加性,则 F2的方差分量为: VF2 = ½ (a12+a22+…+ak2)+ ¼ (d12+d22+…+dk2) = ½ ∑a2 + ¼ ∑d2 ∑a2是各对基因加性效应方差的总和 VA= ∑a2 ; ∑d2是各对基因显性效应方差的总和 VD= ∑d2. ∴VF2 = VA/2 + VD/4
-----平均数方差的平方根,表示平均数变异范围
一次试验中,各个观察指标要取得一个平均数;重复了许 多次的试验,每次试验取的平均数之间也可以取得一个平均数的
平均数。每次试验的平均数同重复试验中各次平均数的平均数之
间也有一个方差,以表示每次试验的变异程度。在统计学上,平 均数的方差等于个体观察数的方差的1/n,即: S 2 S 2 / n X
◆当n = 3时 (R/2+r/2)2×3 =1/64+6/64+15/64+20/64+15/64+6/64+1/64
6R
5R
4R
3R
2R
1R
0R
多基因控制的数量遗传中等位基因数目和基因型、表 型数及分离比的关系
等位基因 分离的等 F2中性状极端 F2中的 F2中的 F2各表型比为二 对的数目 位基因数 表达的比率 基因型数 表型数 项式各项系数
1 2 (1/4)1=1/4 (3)1=3 3
(a+b=1/16
(1/4)3=1/64
(3)2=9
(3)3=27
5
7
(a+b)4
(a+b)6
4
n
8
2n
(1/4)4=1/256
(1/4)n
(3)4=81
(3)n
9
2n+1
(a+b)8
(a+b)2n
多基因假说要点: 1.决定数量性状的基因数目很多; 2.各基因的效应相等;
标准误
第三节 遗传率的测算
任何一个个体数量性状的一般 遗传模型为:P=G+E+IGE 对于大多数的数量性状而言, 基因型效应和环境效应之间没 有互作,一般都假设IGE=0, 上述模型可简化为: P=G+E 表型方差 = 遗传方差+环境方差
VP =
VG + VE
1、广义遗传率 Broad-sense Heritability
h2的估算:
H
2 N
加性方差 100% 总方差
3、用回交法估算狭义遗传力
加性-显性模型

中亲值(m)=(CC+cc)/2,假定为0
各基因型值与中亲值的差就是相应的基因型效应:
±ac为加性效应,表示CC和cc基因型值与中亲值之差 dc为显性效应,表示Cc基因型值与中亲值之差
◆ 同理,对于E,e
VG≠0:
∴ VP = VG + VE VF2 = VG(F2) + VE
综上所述:
◆ 可以用三个不分离世代的表型方差(VP1 , VP2 , VF1)来 估计VE: VE = (VP1+VP2 )/2 VE = VF1
VE = (VP1+VP2+ VF1 )/3
◆ 此时遗传方差的估算: VG(F2) =VF2 -VE=VF2 - VF1 ◆ 广义遗传率的计算:
3.各个等位基因不存在显隐性;
4.各基因的作用是累加性的。
发展:数量性状的深入研究进一步丰富了多基因假说。
如主效基因与微效基因、基因效应大小可以不同、基因
间存在上位性效应等。
∴ 数量性状可由少数效应较大的主基因控制、也可由数 目较多、效应较小的微效多基因控制。
主效基因:控制某个性状表现的效应较大的少数基因;
n为样本观测值的总数
因为
和(Xi -
)不是整数不便运算,所以将上式进一步改为:
……………… (1)
……………… (2) 将(2)式代入(1)中,得:
xi 2devation,S) 三、标准差( 2 standard
x
i
(
S=
S 2
or SD ----方差的平方根
n 1
n
)
S
(x
微效基因:数目较多,但每个基因对表现型的影响较小;
修饰基因:基因作用微小,但能够增强或削弱主基因对
基因型的作用。
如小家鼠有一种引起白斑的显性基因,白斑大小则由一 组修饰基因所控制。
超亲遗传:在植物杂交时,杂种后代出现的一种超越双亲 现象。 如水稻的两个品种:
P 早熟(A2A2B2B2C1C1)× 晚熟(A1A1B1B1C2C2)
VG 遗传方差 H 100 %= 100% 总方差 VG VE
2 B

遗传率不是性状传递的能力; 遗传率是度量变异的参数; 纯系品种基因型一致,遗传方差VG =0
H2的估算:
根据各世代性状观察值可以直接估计各世代性状表型方
差(总方差)VP ;
但是不能直接估计遗传方差VG ; 知道了VP ,若能得到VE,则也就有了VG 。 所以估计环境方差VE是估算广义遗传力的关键。
EE,ae; Ee, de; ee,- ae
◆ 涉及到多对等位基因时:
如:ccEEFF : m+(- ac + ae + af)
CCeeff:
m+(ac - ae - af)
CcEeFf: m+(dc + de + df)
F2平均值和遗传方差的计算
fi AA Aa aa
合计
xi a d -a
fixi 1/4 a 1/2 d -1/4 a
i
x)
2
n
方差和标准差是全部观察值偏离平均数的重要度量参数
S 就称为标准差(standard devi
或叫做标准误(standard error
S---标准差
均值和标准差决定了表型的分布 一般:育种要求标准差大,则差异大,利于单株的选择;
良种繁育场则标准差小,差异小,可保持品种稳定。
四、标准误


玉米穗长试验结果
VF1=2.307,VF2=5.072, 在该组合中,穗长的广义遗传率为: Hb2=(5.072-2.307)/5.072×100%=54% 说明在该杂交组合中,F2穗长的变异大约有54%是由于遗 传差异造成的,46%是环境影响造成的。
2、狭义遗传率 Narrow-sense Heritability
二、数量性状的多基因假说-----多基因的遗传
Nilsson-Ehle experiment---1909
◆当性状由n对独立基因决定时,则F2的表现型频率为:
(R/2+r/2)2n ◆当n = 2时 (R/2+r/2)2×2 =1/16+4/16+6/16+4/16+1/16 4R 3R 2R 1R 0R
第九章 数量遗传学
前述生物体的遗传表现直接由其基因型所决定可根 据个体的表现型推测其基因型组成。 质量性状(qualitative trait)的特点:表现型和基 因型的变异不连续(discontinuous)。
在杂种后代的分离群体中 可以采用经典遗传学分析 方法,研究其遗传动态。
生物界的另一类遗传性状,其表现型变异是连续的
F1 F2 (A1A2B1B2C1C2)熟期介于双亲之间 27种基因型 (其中A1A1B1B1C1C1的个体将比晚熟亲本更晚,
而A2A2B2B2C2C2的个体将比早熟亲本更早)
第二节 数量性状的研究方法
需要分析杂交后代的大量个体→ 应用数理统计等方法
→ 分析平均效应(mean)、方差(variance)、协 方差(covariance )等遗传参数→ 发现数量性状遗传 规律。
◆ 一般来说,纯系亲本P1、P2群体中各个个体的基因型是 纯合一致的,F1群体的各个个体的基因型是杂合一致的。 这3种群体均为不分离群体。不分离群体基因型一致,其遗 传方差VG=0,变异都是环境造成的,即: ∴ VG = 0 VP = VE VE = VF1 或=(VP1+VP2 )/2 ◆ 在分离世代(如F2)中,个体间基因型不同,遗传方差
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