黄河鲤鱼基因组的研究和应用
黄河上游花斑裸鲤Cyt b基因的序列变异和遗传多样性
黄河上游花斑裸鲤Cyt b基因的序列变异和遗传多样性祁得林【期刊名称】《动物学研究》【年(卷),期】2009(030)003【摘要】花斑裸鲤(Gymncypris eckloni)主要分布于黄河上游高原宽符河段深水缓流处或静水湖泊中,在高原淡水生态系统的食物链中具有重要的地位.本文获得了黄河上游仡斑裸鲤5个种群共68个个体线粒体DNA(mtDNA)细胞色素b基因的全序列(1140bp),分析了序列变异和种群遗传多样性.68个序列经比对后,发现30个(2.63%)多态性位点,共定义了18个单倍型.结果显示,花斑裸鲤种群单倍型多样度和核苷酸多样度均低于其它鲤科鱼类,这可能与青藏高原经所经历的地质变迁和古气候环境的改变有关,由此生活在高原水域中的鱼类或多或少经历过瓶颈效应.AMOVA分析结果显示,遗传差异主要发生在种群之内,而不是来自不同地理组群问或组群内种群间.单倍型网络图和系统发育分析均没有显示出单倍型与地理位置的对应关系,提示黄河上游花斑裸鲤自然种群未出现分化,应作为一个整体进行保护.单倍犁歧点分布呈现为单峰以及中性检验Fu's Fs (-15.3400,P＜0.001)和Tajima's D(-0.6254.P=0.3080)结果综合表明,花斑裸鲤可能经历过近期的种群扩张事件.【总页数】7页(P255-261)【作者】祁得林【作者单位】青海大学,农牧学院动物科学系,青海,西宁,810016【正文语种】中文【中图分类】Q349.5;Q959.468【相关文献】1.8种鲤养殖品种线粒体Cyt b基因的遗传多样性和系统进化分析 [J], 肖同乾;鲁翠云;李超;张明昭;顾颖;孙效文2.南方鲇Cyt b基因序列变异及遗传多样性分析 [J], 王庆容;李黛3.Zn2+胁迫对花斑裸鲤抗氧化关键基因表达和抗氧化酶活性的影响 [J], 冉凤霞;金文杰;端智卓玛;黄屾;刘艳慧;李梓瑄;王振吉;吴明辉;简生龙;王国杰;李长忠4.Zn2+胁迫对花斑裸鲤抗氧化关键基因表达和抗氧化酶活性的影响 [J], 冉凤霞;王国杰;李长忠;金文杰;端智卓玛;黄屾;刘艳慧;李梓瑄;王振吉;吴明辉;简生龙5.基于线粒体Cyt b基因序列变异的克孜河塔里木裂腹鱼和斑重唇鱼遗传多样性[J], 阎雪岚;杨金权;唐文乔;王丽卿;阿达来提.尔迪因版权原因，仅展示原文概要，查看原文内容请购买。
鲤鱼基因组计划成果促进水产育种产业化
国 内外 动态
提 出了更 高 的要求 ， 中小饲 料生 产商 一不 具备 集 中采 购 、 模 化 生 产 的低 成 本 优 势 ； 规 二不 具 备 多
阶段 饲料 的研 发 生产 的相关 技术 能 力 ； 不 能支 三 持 多 阶段 饲料 销 售 要求 的 服务 营销 网络 和 团队 建 设 需 要 ， 加 速退 出 ， 将 给优 秀 企 业 留 水产育种产业化
近 日，８３ 计 划 “ 鱼 等 功 能基 因组 资 源 “６ ” 鲤 开 发及 其数 据库 与 网站构 建 ” “ 鱼生 长 等 经 和 鲤 济性 状 的 主 效 基 因发 掘 及 育 种 潜 力 评 估 ” 目 项 组 对《 国科 学 报 》 露 ， 课 题 目前 已取 得 阶 中 透 该 段 性研 究成 果 ， 功装 配获 得鲤 鱼基 因组框 架 图 成 谱 、 因组 物理 图谱 、 基 高密 度连锁 图谱 ， 获得鲤 并 鱼 一斑 马鱼 比较基 因组 图谱 和资 源数 据库 。
最 为看 好 服务 营销模 式 成熟 、 细化 渠道 管理 有 精 力 的 大北农 和 海大 集 团 ， 看到 这些 企业 稳定 获 并 取 超越 行业 增 长 的同时 、 步展 现 出净 利 润率水 逐 平 的小 幅 提升 。
通威与九鼎达成战略合作
２１ ０ ２年 以来 ， 威 动 作 不 断 。 继 广 东 片 区 通 接 连 开展一 系列 营 销策 划活 动之 后 ， 威 股份有 通 限公 司 发 布 公 告 称 ， 于 近 日与 湖 南 九 鼎 科 技 其 （ 团 ） 限公 司达 成 战 略合 作 框 架 协议 。两公 集 有
鲤RNF2基因的克隆、组织表达与生物信息学分析
摘要:以鲤肾脏组织 RNA 为模板,扩增并克隆 鲤 环 指 蛋 白 2( RING Finger Protein 2,RNF2) 基 因 的 CDS 区 全 长,
分析其组织表达谱。 结果显示,鲤 RNF2 基因的 CDS 区 序 列 长 1 011 bp,编 码 336 个 氨 基 酸;该 基 因 与 鲫、斑 马
第 55 卷 第 3 期 2021 年 6 月
河南农业大学学报 Journal of Henan Agricultural University
Vol. 55 No. 3 Jun. 2021
引用:刘变枝,李海洁,郭家鸿,等. 鲤 RNF2 基因的克隆、组织表达与生物信息学分析[ J] . 河南农业大学学报,2021,55( 3) : 468-476. DOI:10. 16445 / j. cnki. 1000-2340. 20210506. 003
收 稿 日 期 :2020 - 12 - 14 基金项目:国家自然科学基金项目( 31702359) ;河南省科技攻关项目( 172102110047) ;河南农业大学科技创新基金项目( KJCX2017A07) 作者简介:刘变枝 (1981—) ,女,河南开封人,讲师,博士,主要从事鱼类营养与免疫研究。 通信作者:李明(1965—) ,男,河南永城人,教授,博士。
含 RING 结构域和 RAWUL 结构域,且 RING 结构域与斑马鱼、小鼠和智人完全一致;二级结构和三级结构表明,
鲤鱼 RNF2 蛋白含有 α-螺旋(35. 12% ) 、延伸链(8. 63% ) 、β-转 角 ( 0. 89% ) 和 无 规 则 卷 曲 ( 55. 36% ) ;泛 素 化 底
鱼、金头鲷、海洋青鳉鱼、鳕鱼、非洲爪蟾、尖尾娇 鹟、小 鼠、智 人 的 同 源 性 分 别 为 98. 2% 、93. 1% 、78. 0% 、79. 2% 、
黄河鲤鱼研究进展
黄河鲤鱼研究进展作者：徐丽敏刘红云刘四凤来源：《安徽农业科学》2017年第25期摘要在搜集和查阅文献资料的基础上，比较了黄河鲤鱼与普通鲤鱼的异同。
从分类地位及形态特征、遗传学研究、生理生化研究、人工养殖研究等方面对黄河鲤鱼的研究进展进行了综述。
关键词黄河鲤鱼；形态特征；遗传学研究；血液指标；生理生化研究；人工养殖中图分类号 S965.116 文献标识码 A 文章编号 0517-6611（2017）25-0117-03Abstract Based on collecting and consulting the related data，the similarities and differences between Cyprinus carpio haematopterus and Cyprinus carpio were compared. The research progress on Cyprinus carpio haematopterus was reviewed from the taxonomic status， morphological characteristics， genetic research， physiological and biochemical research， artificial breeding and other aspects.Key words Cyprinus carpio haematopterus；Morphological characteristics；Genetics research；Blood indices；Physiological and biochemical research；Artificial breeding关于黄河鲤鱼的记载可以追溯到3 000多年的《诗经》，曾有“岂其食鱼，必河之鲤”之说，汉朝蔡也曾留下“客从远方来，遗我双鲤鱼。
中国黄河鱼研究报告
中国黄河鱼研究报告
中国黄河鱼是我国一种独特的淡水鱼种，广泛分布在黄河流域，具有独特的生态和经济价值。
本文旨在对中国黄河鱼进行综合研究，了解其生态特征、繁殖状况以及保护措施，为科学合理地保护和利用中国黄河鱼提供参考。
中国黄河鱼属于淡水鱼类，主要栖息于黄河上中游河段。
该鱼以小型无脊椎动物为食，以浮游植物和底栖动物为辅助食物，具有较好的掠食能力。
黄河鱼对水质要求较高，喜欢生活在清澈、富含氧气的水体中，对水温、酸碱度等环境要素要求较为严格。
中国黄河鱼在繁殖方面具有一定特点。
一般而言，其繁殖季节为每年的春季至夏季，此时水温和食物条件适宜。
黄河鱼属于溪流型繁殖，即在河流的浅滩或者水草丰富的水域中进行产卵。
雌鱼产卵后，雄鱼会进行受精，并负责保护产卵区域，防止其他生物侵袭。
中国黄河鱼的繁殖成功率较高，能够为黄河流域鱼类资源的保护和增殖做出一定贡献。
然而，随着工业和农业的发展，以及水污染等因素的不断恶化，中国黄河鱼的数量逐渐减少，生存环境受到威胁。
为了保护中国黄河鱼这一珍稀物种，应采取有效的保护措施。
首先，加强环境监测和水质治理，减少污染物对黄河鱼生态环境的破坏。
其次，建立自然保护区和人工增殖种群，以增加黄河鱼的数量和分布区域，确保其生存繁衍。
此外，加强宣传教育，提高公众对中国黄河鱼的保护意识，积极促进人与自然的和谐发展。
综上所述，中国黄河鱼作为我国独特的淡水鱼类资源，具有重要的生态和经济价值。
我们需要加强对黄河鱼的研究，了解其生态特征和繁殖状况，制定科学合理的保护措施，为确保其生存和繁衍做出积极贡献，实现可持续利用和保护。
黄河鲤生长性状的转录组解析
黄河鲤生长性状的转录组解析李佩珍;许建;朱优秀;冯建新;江炎亮;张瀚元【期刊名称】《中国渔业质量与标准》【年(卷),期】2022(12)2【摘要】通过对同一实验条件下黄河鲤(Cyprinus carpio)群体中体重极大和极小的样本进行转录组测序,挖掘生长相关的基因和信号通路。
基于转录组数据进行差异表达基因分析,在脑、肝和肌肉组织中分别筛选出差异表达基因6519个、499个和19个。
其中,脑组织中上调基因3443个,下调基因2942个;肝组织中上调基因275个,下调基因186个;肌肉组织中上调基因6个,下调基因5个。
对差异表达基因进行了功能注释和通路富集分析,定位到MAPK信号通路、胰岛素(insulin)信号转导通路、Wnt信号通路、ErbB信号通路、肌动蛋白细胞骨架调节等与细胞生长、分化、代谢相关的信号通路。
为了验证转录组结果的可靠性,本研究通过荧光定量PCR验证了黄河鲤脑组织中与生长密切相关的13个差异表达基因,其中mapk1、mapk7、mapk10、mapk12、wnt16、wnt8b、wnt10b显著上调(P<0.05),fgf13、ednra、notch2、tgfbr2、fgf19、lpl显著下调(P<0.05)。
本研究通过组学数据分析和实验验证筛选了生长相关的基因,为深入挖掘黄河鲤生长性状调控机制和分子标记辅助育种提供了研究依据。
【总页数】10页(P22-31)【作者】李佩珍;许建;朱优秀;冯建新;江炎亮;张瀚元【作者单位】上海海洋大学;中国水产科学研究院;河南省水产科学研究院【正文语种】中文【中图分类】S917【相关文献】1.建鲤与黄河鲤的杂交优势研究及主要生长性状的通径分析2.微卫星 QTL 标记分析豫选黄河鲤群体遗传结构及生长性状相关性3.三杂交鲤（荷元鲤F1♀×镜鲤♂）生长性状与产量的数理统计分析4.基于转录组测序的大口黑鲈驯食相关SNP开发及其与生长性状的关联分析5.三角帆蚌育珠蚌群体生长性状和转录组差异分析因版权原因，仅展示原文概要，查看原文内容请购买。
黄河鲤鱼杂交一代鱼体成分的研究
黄河鲤鱼杂交一代鱼体成分的研究
刘海涛;郑水平
【期刊名称】《饲料博览》
【年(卷),期】1999(011)001
【摘要】黄河鲤鱼是我国黄河流域的一个地方良种，它以体型好、肉质鲜美等优点而倍受人们的喜爱。
它也是我区西部地区主要养殖的鲤鱼品种之一。
但黄河鲤鱼野性大，不易驯化，生长速度相对较慢，为了克服这些缺点，我们进行了黄河鲤鱼与德国镜鲤杂交一代优势利用的研究，通过杂交不...
【总页数】1页(P37)
【作者】刘海涛;郑水平
【作者单位】内蒙古呼和浩特市水产科学研究所;内蒙古呼和浩特市水产科学研究所
【正文语种】中文
【中图分类】S965.116
【相关文献】
1.黄霉素对黄河鲤鱼生长性能和体成分的影响 [J], 高春生;刘东文;霍军;杨国宇
2.远缘杂交形成的二倍体鱼和多倍体鱼生殖细胞染色体研究 [J], 张纯;刘少军;孙远东;肖俊;覃钦博;王静;何伟国;尤翠平;刘筠
3.红头丽体鱼×红魔丽体鱼杂交子一代胚胎发育及仔鱼形态学观察 [J], 孙志景;姜巨峰;傅志茹;吴会民;刘肖莲;夏苏东;张振国;郝爽;冯守明;
4.红头丽体鱼×红魔丽体鱼杂交子一代胚胎发育及仔鱼形态学观察 [J], 孙志景;姜
巨峰;傅志茹;吴会民;刘肖莲;夏苏东;张振国;郝爽;冯守明
5.胡子鲶（♀）×革胡子鲶（♂）杂交一代鱼与亲本经济性状比较的初步研究 [J], 冼炽彬;邬国民
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黄河鲤全基因组选择信号分析
黄河鲤全基因组选择信号分析王延晖;张芹;王冰柯;张玲;杨兴丽;周晓林;冯建新【期刊名称】《水产科学》【年(卷),期】2024(43)2【摘要】黄河鲤是我国重要的水产养殖鱼类,该类群经过长期的遗传改良后,其基因组上可能存在特定的选择信号,研究这些选择信号是筛选功能基因的重要策略之一。
笔者对2个黄河鲤遗传改良群体(豫选黄河鲤新品系和福瑞鲤2号养殖群体)和1个未选育群体进行了全基因组重测序,共获得8665728个高质量的单核苷酸多态性(SNP)位点的分型数据,并采用群体间遗传分化指数、核苷酸多态性比值和跨群体复合似然比检验检测受到选择的基因组区域。
取前5%的位点作为受选择位点,选择在多种方法中检测到重叠的区域作为候选区域,并对其进行基因注释。
结果显示,在黄河鲤基因组上广泛存在选择信号,与未选育群体相比,两个遗传改良群体分别有1434和1333个基因受到选择,豫选黄河鲤新品系群体中受选择的基因富集到了细胞发育、心肌收缩、细胞分化、蛋白质糖基化等相关通路上,福瑞鲤2号养殖群体的受选择基因则与胚胎骨关节发育、细胞膜融合、神经递质分泌有关。
将两个遗传改良群体混合,与未选育群体相比,检测到2037个基因受到选择,包括Fabp2、Acaca、Acsl、Cpt1基因等,这些基因显著富集在脂肪合成代谢相关的通路上,如甘油磷脂代谢、脂肪酸合成、脂肪酸代谢和过氧化物酶体增殖物激活受体信号通路。
试验结果表明,在不同选育群体中受选择的基因组区域具有特异性,同时检测出与脂肪酸合成代谢相关的重要基因在黄河鲤遗传改良群体中受到选择。
试验结果为探索黄河鲤生长性状的遗传改良机制提供新的思路,并有助于促进黄河鲤的基因组选择育种应用。
【总页数】9页(P264-272)【作者】王延晖;张芹;王冰柯;张玲;杨兴丽;周晓林;冯建新【作者单位】河南省水产科学研究院【正文语种】中文【中图分类】S965.116【相关文献】1.基于SNP芯片的海南猪全基因组选择信号分析2.鹅产蛋性状全基因组选择信号分析3.京星黄鸡IMF系全基因组选择信号检测分析4.永登七山羊全基因组选择信号检测分析因版权原因，仅展示原文概要，查看原文内容请购买。
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黄河鲤鱼基因组的研究和应用
黄河鲤鱼是中国地区常见的鱼类，也是经济价值较高的重要渔业资源，每年都有数千吨的黄河鲤鱼被捕捞出来。
近年来，随着基因组学技术的发展，科学家们开始对黄河鲤鱼的基因组进行研究，并尝试将这一领域的研究成果应用于黄河鲤鱼的养殖和保护工作中。
一、黄河鲤鱼基因组研究的背景
全基因组测序技术是揭示一个物种基因组组成的重要手段，对于理解物种的基础遗传信息、进化历程及功能基因等方面具有重要意义。
然而，大规模的基因组测序技术一直是比较昂贵的，这也一直限制了一些非常普遍和重要的物种基因组测序的进展。
此外，对于鱼类物种来说，由于鱼类基因组在一些方面与人类和典型的哺乳动物基因组有很大的差异，因此将来无疑需要更多的研究来全面地解析鱼类基因组和生物学功能。
二、黄河鲤鱼基因组研究的现状
在全球范围内已经完成了不少著名鱼类的基因组测序，比如虹鳟鱼、河豚、斑马鱼等，但是黄河鲤鱼的基因组研究还处于起步阶段。
目前较为详细的研究成果是黄河鲤鱼的3.62 G 的基因组大小，基因组包含有约26,423 个基因和 19242条非编码RNA。
这一成果的获得，为我们深入了解黄河鲤鱼的生物学对象和基因功能提供了重要的基础。
在此基础之上，研究者对黄河鲤鱼基因组中一些重要家族基因进行了深入的分析，比如 Hox 基因家族和 CRISPR 基因家族，他们的研究成果还表明这些家族在共生细菌、致病微生物、环境和营养等与生命健康密切相关的生物学过程中可能发挥了重要的角色。
除此之外，还有一些基于黄河鲤鱼基因组建设的二级目录系统，比如基于性别和成体大小的表观遗传分析等，这些研究成果都将为我们更深入地理解黄河鲤鱼的生物学特性和遗传机制打下坚实基础。
三、黄河鲤鱼基因组研究的应用前景
黄河鲤鱼的基因组研究成果具有重要的应用价值，可以对黄河鲤鱼的养殖和保护产生重要影响。
在养殖方面，黄河鲤鱼的基因组研究可以更加准确地把握鲤鱼的生长特点、生长速度、疾病防治等方面，对黄河鲤鱼的生产和经济活动有重要的帮助。
此外，在保护方面，黄河鲤鱼的基因组研究可以帮助我们更好地了解黄河鲤鱼的保护需求，并根据黄河鲤鱼的基因组特征来制定更加科学的保护措施。
同时，基于基因编辑技术等前沿科技手段将来还可以开展更为高级的基因组干预研究，从而提高黄河鲤鱼的生存率和资源利用价值。
四、结语
黄河鲤鱼的基因组研究，为我们更好地理解黄河鲤鱼的生物学特征和遗传机制提供了基础。
同时，这一领域的研究成果也具有重要的应用价值，可以为黄河鲤鱼的养殖和保护提供支持。
但是，黄河鲤鱼基因组研究的成果离应用场景还有一定的距离，需要继续深入地研究和探索。
相信在今后，我们的研究成果将能够更加深入地了解这样一个重要物种的基础遗传信息，为我们更好地保护和利用黄河鲤鱼资源提供坚实的支持。