毒理基因组学及其在中药安全性研究中的应用进展

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生物技术在中药领域的应用(二)

生物技术在中药领域的应用(二)

生物技术在中药领域的应用(二)生物技术在中药领域的应用生物技术作为一种新兴技术,已经在中药领域得到广泛应用。

下面是一些生物技术在中药领域的应用:1. 基因工程菌生产化合物生物技术可以利用基因工程菌来生产中药化合物。

例如,可以利用大肠杆菌表达中药黄芩中的黄芩素,这样可以大大提高黄芩素的产量,并且可以避免从黄芩根中提取黄芩素的复杂操作。

2. 基因芯片技术基因芯片技术可以用来研究中药的药效和作用机理。

利用基因芯片技术,可以轻松地分析中药在人体细胞中的作用,从而揭示中药的药效和作用机理。

3. 基因序列分析基因序列分析可以用来研究中药的组成成分和化学结构。

利用基因序列分析,可以对中药的各种化学成分进行分析和鉴定,从而更好地理解中药的药效和作用机理。

4. 基因编辑技术基因编辑技术可以用来改变中药的基因组成,从而改变中药的性质和功效。

例如,可以利用基因编辑技术来增加中药的营养价值,或者增强中药的治疗功效。

5. 细胞培养技术细胞培养技术可以用来生产中药,实现中药的大规模生产和工业化生产。

例如,可以通过细胞培养技术生产人参和黄芪等中药。

总之,生物技术在中药领域的应用,可以极大地提高中药的疗效和安全性,为人类健康事业做出更大的贡献。

6. 基因组学研究基因组学研究可以通过对不同种类中药中的基因组进行比较,发现中药中的活性成分,为中药制药提供更多的基础数据。

例如,对含有芫荽醛、巴豆醛等活性成分的香茅基因组进行分析就可以发现这些成分的合成途径以及相关基因。

7. 基因修饰基因修饰可以通过改变中药的基因组和表观遗传信息,提高中药的药效和治疗效果。

例如,通过基因修饰技术,对中药防风进行基因调控,使其产生更多的有效成分,增强了其抗肿瘤、抗癌、抗炎等功效。

8. 细胞凋亡的研究应用细胞凋亡是一种细胞自我毁灭的过程,当细胞发生癌变或者受到外部物质的损害时,细胞就会通过自我毁灭来维护整体的健康。

中药的一些成分能够促进细胞凋亡,对治疗肿瘤等疾病有着重要的作用。

中药材的安全性与毒副作用研究

中药材的安全性与毒副作用研究

中药材的安全性与毒副作用研究中药作为中国传统医学的重要组成部分,被广泛应用于临床治疗和保健领域。

然而,随着现代科学技术的发展,对中药材的安全性和毒副作用的研究也变得尤为重要。

本文将探讨中药材的安全性问题以及现代研究方法在解决中药毒副作用问题中的应用。

首先,中药材的安全性一直是人们关注的焦点。

中药材的安全性主要包括两个方面,即药材本身的安全性和药材的质量安全性。

药材本身的安全性是指药材在一定剂量范围内对人体的毒副作用。

虽然中药材源自自然,但并不意味着它们就是绝对安全的,因为中药材中含有多种活性成分,其中一些成分可能具有毒性。

因此,对中药材的毒性进行评估和研究非常重要。

同时,药材的质量安全性也是中药材安全性的重要方面。

药材的质量安全性包括药材的纯度、含量和污染物等方面。

因此,对中药材进行质量控制和质量评估也是确保中药材安全性的重要手段。

其次,现代科学技术在中药毒副作用研究中的应用不断推动了该领域的发展。

传统的中药毒副作用研究方法主要是通过临床观察和实验动物模型来评估中药的毒副作用。

然而,这些方法存在一些局限性,如观察结果的主观性和实验结果的可重复性等。

因此,现代科学技术的应用为中药毒副作用的研究提供了新的思路和方法。

例如,基因组学、蛋白质组学和代谢组学等技术的发展使得我们能够更加全面地了解中药对人体的影响。

通过这些技术,我们可以研究中药材对基因表达的影响,从而揭示中药的作用机制和潜在的毒副作用。

此外,现代科学技术还可以帮助我们评估中药材的质量安全性,如高效液相色谱、气相色谱和质谱联用技术等,可以用于检测中药材中的有害物质和污染物。

然而,中药材的安全性与毒副作用研究仍然面临一些挑战。

首先,中药材的复杂性使得对其毒副作用的研究变得困难。

中药材中含有多种活性成分,这些成分之间可能存在相互作用和协同作用。

因此,对中药材的毒副作用进行研究时,需要考虑到这些相互作用和协同作用的影响。

其次,中药材的质量安全性问题也是一个挑战。

中药鉴定新技术新方法及其应用

中药鉴定新技术新方法及其应用

中药鉴定新技术新方法及其应用中药鉴定一直是中医药领域的关键问题之一。

传统的中药鉴定主要依靠经验和观察,这种方法存在主观性和不确定性,容易导致判断错误,限制了中药质量的保障。

近年来,随着科学技术的不断进步,中药鉴定新技术和新方法不断涌现,为中药质量保障提供了更加准确和可靠的手段。

一、 DNA 条形码技术DNA 条形码技术是一种快速、准确鉴定植物物种的分子生物学技术,可以利用特定基因序列的差异性为不同的植物物种打上独特的“条形码”。

中药材是植物的不同器官组织,其 DNA 序列不同,可以通过 DNA 条形码技术进行区分。

DNA 条形码技术具有快速、准确、可靠、高通量等优点,已被广泛应用于药用植物鉴定、种质资源管理、药品质量控制等方面。

中国药典2015年版规定了一些植物药材的 DNA 条形码鉴定方法,包括麻黄、柴胡、青黛等。

还有公司研发出基于 DNA 条形码技术的中药快检仪,可以实现对中药材的快速鉴定。

二、高通量测序技术高通量测序技术是一种分子生物学技术,可以对 DNA 或 RNA 序列进行直接、快速且准确的分析。

这种技术可以在较短的时间内完成海量序列数据的产生和分析,为中药材的鉴定提供了更全面、更快速、更准确的手段。

近年来,有研究者利用高通量测序技术,对一些常见中药材进行了基因组测序和比较。

中医中药研究所在2018年对当归进行了基因组测序,解析了其基因组结构和功能,为当归的遗传改良和利用提供了科学依据。

同样,对于一些难以鉴别的中药材,如三七、川芎、地榆等,高通量测序技术也被应用于种质鉴定和品种保护。

三、毒理学鉴定技术中药毒理学鉴定技术是一种用于中药毒性评价的科学技术,可以通过各种方法评估中药的安全性。

这种技术可以为中药的临床应用提供一定的保障,避免药物毒副作用的发生。

中药毒理学鉴定技术包括细胞毒性评价、小动物毒性实验、基因毒性评价等多种方法。

细胞毒性评价和小动物毒性实验是常用的中药毒理学鉴定方法,可以评估中药对于细胞和动物的毒性反应,并且可以为中药药品的临床适用提供一定的安全保证。

现代生物学技术在中药药效研究中的应用

现代生物学技术在中药药效研究中的应用

现代生物学技术在中药药效研究中的应用1. 引言1.1 现代生物学技术在中药药效研究中的应用现代生物学技术在中药药效研究中的应用正逐渐成为中药研究的重要方向。

随着科学技术的不断发展,基因组学、转录组学、蛋白质组学、代谢组学以及细胞工程学等现代生物学技术在中药药效研究中发挥着越来越重要的作用。

通过这些技术手段,可以更加全面、深入地了解中药的药效成分、药物作用机制,以及药物在人体内的代谢路径和药效评估等方面。

现代生物学技术的应用为中药药效研究带来了全新的突破和可能性,可以大大加快中药的研究与开发过程,同时也提高了中药的临床疗效和安全性。

中药药效研究与现代生物学技术的结合将为中医药的发展注入新的活力和动力,促进中医药的国际化和现代化进程。

未来,随着现代生物学技术的不断进步和发展,中药药效研究将更多依赖于这些技术的应用,为中医药的发展开辟更加广阔的前景和可能性。

现代生物学技术将继续在中药药效研究中发挥重要作用,推动中医药的发展与传承。

2. 正文2.1 基因组学在中药药效研究中的应用基因组学在中药药效研究中的应用可以说是现代生物学技术在中药领域中的重要突破之一。

通过基因组学技术,研究人员可以对中药的药效成分进行深入的分析和研究。

基因组学可以帮助科研人员解析药材中的基因组信息,找出药材的关键基因及其功能。

这有助于揭示中药的药效成分是如何在生物体内发挥作用的,为中药的临床应用提供更加科学的依据。

基因组学也可以帮助研究人员进行中药的基因组改良和优化。

通过基因编辑技术,可以选择性地改变中药材的基因,使其产生更多有益成分或减少有害成分,从而提高中药的药效和安全性。

这种精准的基因调控技术为中药的研究和开发提供了全新的途径。

基因组学还可以帮助研究人员进行中药的遗传多样性研究,了解不同地区或不同种类中药的遗传变异情况,有助于保护和利用中药资源。

通过比较不同遗传类型的中药材,可以找出更加有效的中药组合或配方,为中医药的临床应用提供更多选择。

中药在临床后期药物安全性评价中的应用

中药在临床后期药物安全性评价中的应用

中药在临床后期药物安全性评价中的应用中药在临床后期药物安全性评价中的应用中药作为我国传统医学的重要组成部分,具有悠久的历史和丰富的临床应用经验。

然而,由于中药的复杂性和多样性,其药物安全性评价一直是医学界和药学界关注的焦点之一。

随着现代科技的进步,中药在临床后期药物安全性评价中的应用也逐渐得到了广泛认可和应用。

中药在临床后期药物安全性评价中的应用主要包括以下几个方面:首先,中药在药物毒理学评价中的应用。

药物毒理学评价是评估药物对人体的毒性和安全性的重要手段。

中药的复杂性和多样性使得其毒理学评价更加复杂和困难。

然而,通过现代科技手段,如基因组学、蛋白质组学和代谢组学等,可以对中药的毒理学特性进行深入研究,从而评估中药的毒性和安全性。

其次,中药在药物药代动力学评价中的应用。

药代动力学评价是评估药物在体内吸收、分布、代谢和排泄的过程和特性的重要手段。

中药的复杂性和多样性使得其药代动力学特性更加复杂和多样。

然而,通过现代科技手段,如体外药物代谢研究、药物代谢酶研究和药物转运蛋白研究等,可以对中药的药代动力学特性进行深入研究,从而评估中药的安全性。

再次,中药在药物不良反应监测和评价中的应用。

药物不良反应是药物治疗过程中出现的不良反应或不良事件。

中药的复杂性和多样性使得其不良反应的监测和评价更加困难。

然而,通过现代科技手段,如临床数据库、药物不良反应监测系统和药物不良反应评价方法等,可以对中药的不良反应进行监测和评价,从而提高中药的安全性。

最后,中药在药物安全性评价中的应用。

药物安全性评价是评估药物对人体的安全性和风险的重要手段。

中药的复杂性和多样性使得其安全性评价更加复杂和困难。

然而,通过现代科技手段,如临床试验、药物安全性评价指标和药物安全性评价方法等,可以对中药的安全性进行评价,从而提高中药的安全性。

综上所述,中药在临床后期药物安全性评价中的应用具有重要意义。

通过中药在药物毒理学评价、药物药代动力学评价、药物不良反应监测和评价以及药物安全性评价中的应用,可以全面评估中药的安全性和风险,为中药的临床应用提供科学依据,保障患者的用药安全。

中药毒理学的研究思路

中药毒理学的研究思路

中药毒理学的研究思路一、本文概述中药毒理学,作为中医药学与现代毒理学交叉融合的新兴学科,旨在深入探索和研究中药在使用过程中可能产生的毒性作用及其机制。

本文将从中药毒理学的研究背景、目的、意义、方法以及未来发展趋势等方面进行全面概述,以期为中药的安全使用和深入研究提供理论支撑和实践指导。

本文将回顾中药毒理学的发展历程,分析当前中药毒理学研究的现状,并指出存在的问题和挑战。

在此基础上,本文将明确中药毒理学的研究目的,即通过对中药毒性作用的深入研究,揭示中药毒性产生的机理,为中药的安全使用提供科学依据。

本文将阐述中药毒理学研究的意义。

随着中医药在世界范围内的广泛应用,中药的安全性问题日益受到关注。

中药毒理学的研究不仅有助于保障中药的安全使用,提高中药的疗效,还能推动中医药学的现代化和国际化进程。

接着,本文将介绍中药毒理学研究的主要方法和技术手段。

包括中药毒性成分的分析、毒性作用机制的研究、毒性评价体系的建立等方面。

这些方法和技术手段的运用将为中药毒理学研究提供有力支持。

本文将展望中药毒理学的未来发展趋势。

随着科学技术的不断进步和中医药学的深入发展,中药毒理学将面临新的机遇和挑战。

本文将提出中药毒理学未来的发展方向和重点研究领域,以期为中药毒理学的持续发展提供参考。

二、中药毒理学的基本概念中药毒理学,作为一门专门研究中药对人体产生有害影响的科学,其基本概念涵盖了中药的毒性、中药毒性的形成、中药毒性的评价以及中药毒性的预防与控制等多个方面。

中药的毒性是指中药在正常用法用量下出现的与治疗目的无关或意外的有害反应。

这些反应可能源于中药本身所含有的有毒成分,也可能由于药材的种植、采集、炮制、配伍等过程中产生的变化。

因此,对于中药的毒性,我们必须有清晰的认识,以便在使用中药时能够避免或减轻其毒性作用。

中药毒性的形成是一个复杂的过程,它可能受到多种因素的影响,如药材的品种、产地、采收季节、炮制方法、配伍方式、用药剂量、用药时间等。

基于毒理基因组学的川楝子肝毒性研究

基于毒理基因组学的川楝子肝毒性研究

基于毒理基因组学的川楝子肝毒性研究
近年来,临床报道中药致肝损伤事件频发,中药肝脏毒性已成为中医药安全性领域的研究热点之一。

中国药典(2010版)将川楝子标明为小毒中药,体内外研究均发现川楝子具有明显肝脏毒性。

但是作为中药引发肝损伤的常见药物之一,川楝子的毒性物质基础及机制尚不明确。

本论文以川楝子为研究对象,通过对给药后小鼠肝组织样本进行mRNA 和microRNA(miRNA)的整合基因组学分析,结合血清生化和肝组织病理学结果,初步探明川楝子肝脏毒性的时效关系、量效关系及作用机制。

论文主要包括以下三方面内容:(1)川楝子水提醇沉液致小鼠肝毒性研究。

结合常规生化、病理指标以及通过整合miRNA与mRNA两个表达谱芯片进行分析,发现川楝子水提醇沉液引起的小鼠肝脏毒性可能是由多个信号通路如氧化应激等导致的肝细胞死亡造成。

(2)川楝子乙酸乙酯萃取物致小鼠肝毒性研究。

结合常规生化和病理指标以及通过整合miRNA与mRNA两个表达谱芯片进行分析,发现乙酸乙酯萃取物引起的小鼠肝脏损伤具有量效关系,并且其毒性主要涉及了脂质代谢紊乱,同时也发现有大量药物代谢酶和核受体参与损伤过程。

(3)川楝素致小鼠肝毒性研究。

结合常规生化、病理指标和mRNA基因组学分析发现川楝素肝脏毒性具有量效关系;同时川楝素引起的小鼠肝脏毒性的mRNA 和miRNA表达谱变化具有明显的时间依赖性。

对于川楝素肝脏毒性机制的探讨,发现肝细胞坏死,脂质代谢紊乱是川楝素导致肝脏损伤的主要原因,线粒体的功能紊乱可能是损伤的原因之一;胆固醇的生物合成和p53信号通路等可能参与肝损伤后的再生修复过程。

毒理学研究进展汇报

毒理学研究进展汇报

毒理学研究进展汇报毒理学作为一门研究外源性化学物质对生物体产生有害作用的科学,在保障人类健康、保护环境以及推动医学和生物学发展等方面发挥着至关重要的作用。

近年来,随着科学技术的不断进步,毒理学研究取得了许多令人瞩目的进展。

一、研究方法的创新传统的毒理学研究方法主要依赖于动物实验,但随着技术的发展,新的研究方法不断涌现。

体外细胞培养技术的改进,使得研究人员能够更高效地模拟体内环境,研究化学物质对细胞的毒性作用。

例如,利用三维细胞培养模型,可以更好地反映细胞在组织中的真实状态,提高了毒性评估的准确性。

此外,组学技术(如基因组学、蛋白质组学和代谢组学)的应用为毒理学研究带来了全新的视角。

通过对生物体在接触毒物后的基因表达、蛋白质变化和代谢产物的综合分析,能够更全面地了解毒物的作用机制和毒性效应。

计算毒理学的发展也不容忽视。

基于大数据和机器学习算法,建立毒性预测模型,能够在实验之前对化学物质的潜在毒性进行初步评估,大大减少了实验的盲目性和成本。

二、在环境毒理学领域的进展环境中的污染物对生态系统和人类健康构成了严重威胁,因此环境毒理学的研究备受关注。

在大气污染方面,研究人员深入探讨了细颗粒物(PM25)和各种有害气体(如二氧化硫、氮氧化物等)的毒性机制。

发现 PM25 不仅能够引起呼吸系统疾病,还可能通过炎症反应、氧化应激等途径影响心血管系统和免疫系统的功能。

对于水污染,新型污染物(如药物残留、内分泌干扰物等)的毒性研究成为热点。

研究表明,这些污染物即使在低浓度下也可能对水生生物和人类健康产生长期的潜在影响。

土壤污染中的重金属和有机污染物的联合毒性作用机制也逐渐被揭示。

了解这些污染物在土壤中的迁移转化规律以及对生态系统的综合影响,对于制定有效的土壤修复策略具有重要意义。

三、在药物毒理学方面的突破药物研发过程中,毒理学研究是确保药物安全性的关键环节。

对于新开发的药物,毒理学研究更加注重早期的毒性筛选和风险评估。

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毒理基因组学及其在中药安全性研究中的应用进展随着组学等技术的不断发展与成熟,毒理基因组学受到业界的高度重视,并在中药安全性研究中应用日渐广泛。

毒理基因组学技术可从全基因组水平考察机体暴露于毒物后的系统变化,被广泛用于毒性生物标志物发现、毒性机制及毒性预测等研究。

该文简要总结了毒理基因组学的研究现状,并着重综述了其在揭示中药毒性作用机制、发现潜在毒性标志物、研究配伍毒性规律等中药安全性研究中的应用进展。

标签:毒理基因组学;中药;基因芯片;数据库;安全性评价;毒理学Toxicogenomics and its application in safety evaluation oftraditional Chinese medicineLIAN Xue-ping,AI Ni,LU Xiao-yan,FAN Xiao-hui*(Department of Chinese Medicine Science & Engineering,College of Pharmaceutical Sciences,Zhejiang University,Hangzhou 310058,China)[Abstract]Toxicogenomics (TGx)refers to a set of technologies that assess genome-wide responses after toxic agent exposure. Altered gene expression patterns that are caused by specific exposures reveal how toxicants may disrupt cellular processes and lead to side effects. Development and application of “omics” technology facilitate the toxicogenomic research which sharing and interpretation of the enormous amount of biological information generated in toxicologic field. In recent years TGx has been widely valued and successfully applied as an effective research tool to evaluate the toxic effects of traditional Chinese medicine (TCM). Here we reviewed current progress in the field of TGx and focused on its application in traditional Chinese medicine safety evaluation,especially in revealing the mechanism,finding potential toxic biomarkers and studying compatibility detoxification of TCM.[Key words]toxicogenomics; traditional Chinese medicine; microarray; database; safety evaluation; toxicologydoi:10.4268/cjcmm20151402安全性是中药现代化的重要研究领域,也是近年业界的关注热点[1-3]。

随着基因组学、转录组学、蛋白质组学和代谢组学等高通量“组学技术”(omics)的不断成熟,毒理基因组学(toxicogenomics,TGx)日渐受到毒理科学家们的重视[4],并在中药安全性研究中渐现端倪[5]。

目前,已报道的中药毒理学研究大多为实验动物给予中药或中药提取物后的急性、亚急性和长期毒性实验。

这类研究的检测指标往往仅限于病理切片等毒性作用终点,对毒性机制涉及不多,尤其缺乏分子水平的毒性机制研究。

毒理基因组学可从全基因组等尺度测定机体与毒物相互作用后的整体变化,发现毒性生物标志物,进而开展毒性机制或毒性预测等研究,已在药物筛选、新药研发和临床合理用药等领域得到了广泛应用[6-7],也为中药安全性研究提供了新的研究思路和技术工具(图1)。

本课题组在国内较早开展毒理基因组学的实践研究,并与美国FDA国家毒理研究中心、军事医学科学院高月教授课题组等紧密合作,采用基因芯片等技术创建了跨组织评价、跨平台评价及早期评价等一系列中药毒性评价新方法。

本文简要梳理并综述了毒理基因组学的研究概况及其在中药安全性研究中的应用进展,以期为进一步推动毒理基因组学在中药安全性研究中的应用。

1毒理基因组学研究平台毒理基因组学的迅猛发展得益于基因芯片技术的不断成熟。

基因芯片(gene chip)或DNA微阵列(DNA microarray),已成为转录组学研究的核心技术平台。

毒理基因组学研究中,常将组织或细胞中提取分离的mRNA使用荧光标记的核苷酸逆转录为cDNA,再将该cDNA在芯片上进行杂交,通过检测荧光强弱即可获得其表达信息;进而通过比较不同组别样本的基因表达谱,便可找出差异表达的基因,开展后续深入分析[8]。

除mRNA外,miRNA也是毒理基因组学的重要研究对象。

miRMA是一类长度为19~24个核苷酸的非编码RNA,通过互补结合到靶标mRNA,调控mRNA的翻译过程进而调节基因的表达[9]。

近年的研究表明,miRNA是全基因组表达调控的重要组成,参与了早期发育、细胞增殖与分化、细胞凋亡和脂肪代谢等一系列重要进程,也因此日益受到毒理基因组学研究人员的重视[10-11]。

此外,单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphisms,SNPs)分析也是毒理基因组学研究的重要工具,应用微阵列技术对SNPs的分析有助于解释个体对毒物的响应差异。

例如,通过分析DNA序列中单个核苷酸的改变与人类对药物不良反应易感性的变化,可以判断个体对化学物中毒易感的差异,为临床个体化治疗提供依据[12]。

值得特别指出的是,随着二代测序(next-generation sequencing,NGS)技术的迅猛发展,近年来已有课题组开始采用这一技术进行毒理基因组学研究[13-14]。

近期,美国FDA公布了不同NGS 平台的数据重复性等生物芯片质量控制计划(MicroArray Quality Control,MAQC)三期的系列研究结果,为NGS在毒理基因组学中的推广应用提供了技术规范[15-16]。

2毒理基因组学研究现状毒理基因组学受到了医药监管部门的广泛重视。

美国、欧盟、日本等均意识到毒理基因组学的应用潜力,陆续制定了相关监管政策或指南[17-18]。

美国FDA 将毒理基因组学列入机遇列表(opportunity list),并开展了一系列监管科学(regulatory science)研究[15,19-20];而美国EPA则在其政策报告中明文指出毒理基因组学将会对风险评价起到重大影响,并开展了Tox21等毒理基因组学研究项目[21]。

学术和工业界更加重视毒理基因组学。

药物研发过程中,如何在药物开发早期选择正确的候选药物,及如何准确评价候选物的潜在毒性对于药物的研发至关重要[22]。

高通量的毒理基因组学技术为化合物对动物组织如肝脏[23]、肾脏[24]、心脏[25]等潜在靶器官的影响提供更丰富和全面的毒理学信息。

目前,毒理基因组学已贯穿了药物研发的各个阶段,包括化合物筛选[26]、毒物作用机制研究[27]、毒性靶标或生物标志物的发现[28]和预测潜在毒性[29]等。

在临床或临床前常规毒性[30]、发育毒性[31]、致癌性研究[32]和筛选敏感性个体研究[33]中也得到了较广泛的应用。

毒理基因组学技术还为上市药物的风险预警和再评价提供了有效手段,有望促进临床合理用药[34]。

此外,毒理基因组学也被广泛用于种属差异和跨种属外推的研究,是基础毒理学研究和临床毒理学研究联系的桥梁,有望为潜在毒性分析研究中种属差异等问题提供一种有效的解决方法[18,35]。

随着基因芯片技术的日益成熟,毒理基因组学的技术瓶颈已从湿实验(wet lab)转至干实验(dry lab)。

如何对高通量数据进行高效地收集、管理和分析等已成为当前毒理基因组学发展所面临的最主要挑战。

微阵列基因表达数据协会(Microarray Gene Expression Data Society,MGED Society)提出了按照一个固定模式来收集所有发表的基因组数据,并制定了操作指南《关于微阵列实验的最低使用说明》(minimum information about a microarray experiment,MIAME),多数科学期刊都采用MIAME指南作为出版要求。

随着新一代测序技术的出现,MGED提出了新的指导方针,如《关于高通量测序实验的最低使用说明》(minimum information about a high-throughput SeQuencing experiment,MINSEQE)[36]。

完整的毒理基因组学数据库应不仅仅包括基因组数据,还应包括化合物属性、病理性切片、实验设计因素如给药剂量、时间和种属等信息。

目前,许多数据库都收录了大量毒理基因组学数据,如ArrayTrack[37],ArrayExpress[38],Gene Expression Omnibus(GEO)[39],Open TG-GATEs[40],DrugMatrix[41],PredTox[42],Comparative Toxicogenomics Database(CTD)[43]等,针对数据库的分析工具也逐步建立和完善,如KEGG(http://www.genome.jp/kegg/)[44],Cmap (http:///cmap/)[45]等。

本课题组与军事医学科学院高月教授课题组合作,研究搭建了有毒中药知识库TTKB,并通过整合日本毒理基因组计划TGP的Open TG-GATEs数据库中2万余张芯片数据,建立了药物肝毒性在线预测研究平台LTMap(http:///ltmap/),可用于中药潜在肝毒性及其致毒机制评价[46]。

3毒理基因组学在中药安全性评价中的主要应用3.1不良反应作用机制研究与毒性预测中药“多成分、多靶点、多效应”特点使得常规的化学药物毒理研究模式难以直接应用,从整体到细胞及分子水平的渐进分析效果难以令人满意[47-48]。

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