指纹图谱分析软件Cross checker-BY insect
牛膝药材的红外指纹图谱建立及多元统计分析
牛膝药材的红外指纹图谱建立及多元统计分析作者：贾豪雷益铭张维方雷敬卫杨春静李莹莹谢彩侠来源：《中国药房》2022年第02期中圖分类号 R284 文献标志码 A 文章编号 1001-0408（2022）02-0153-07DOI 10.6039/j.issn.1001-0408.2022.02.05摘要目的建立不同产地牛膝药材的红外指纹图谱，并进行多元统计分析。
方法采用Spectrum for Window 3.02和OMNIC 9.2软件建立61批牛膝药材样品的红外指纹图谱;以红外指纹图谱共有峰的相对峰高为变量，采用Excel 2016软件进行正态分布分析，采用SPSS 22.0软件进行聚类分析和主成分分析并计算综合得分，采用SIMCA 14.1软件进行正交偏最小二乘法-判别分析，以变量重要性投影（VIP）>1为标准，筛选影响牛膝药材成分质量的标志性波数。
结果 61批牛膝药材样品红外光谱图的相关系数为0.967 2～0.997 7;共有13个共有峰。
正态分布分析结果显示，河南产与河北产牛膝药材共有峰相对峰高的正态分布曲线未有交叉，河南产与内蒙古产牛膝药材的正态分布曲线存在交叉。
聚类分析结果显示，当组间距离为15时，61批牛膝药材样品可聚为3类，其中N1～N12聚为一类，N13～N45聚为一类，N46～N61聚为一类。
主成分分析结果显示，前3个主成分的累计方差贡献率为91.121%;河南省焦作市驾步村产牛膝药材（编号N40）的综合评分最高（2.39），河北省安国市新安村产牛膝（编号N4）的综合评分最低（-2.89）。
正交偏最小二乘法-判别分析结果显示，61批牛膝药材样品可分为3类，其中N1～N12为一类，N13～N28为一类，N29～N61为一类;共筛选出7个影响药材样品质量的标志性波数，其VIP值从大到小对应的波数依次为1 059、927、2 933、813、1 732、1 128、3 367 cm-1，其中1 732 cm-1处为皂苷类成分的特征吸收峰，1 059、1 128、927 cm-1处为糖苷类成分的特征吸收峰。
中药指纹图谱共有峰的自动识别
收稿日期:2008204216 修回日期:2008206215基金项目:国家自然科学基金(No.20775028)3通讯联系人:曹玉华,女,教授,研究方向为中药分析.第25卷第1期Vol.25 No.1分析科学学报J OU RNAL OF ANAL YTICAL SCIENCE 2009年2月Feb.2009文章编号:100626144(2009)0120041206中药指纹图谱共有峰的自动识别冯启余,曹玉华3,龚立冬(江南大学化学与材料工程学院,江苏无锡214122)摘 要:依托时间匹配、光谱信息辅助,利用自编的VB 程序,建立并比较了时间匹配和时间匹配参考光谱信息两种识别中药指纹图谱共有峰的方法,并成功地应用于肉苁蓉的高效液相色谱2二极管阵列检测器(HPL C 2DAD )法指纹图谱的建立。
结果表明,只需要人为设置色谱峰大小下限、保留值相对误差上限和最大吸收波长差值上限三个参数,VB 程序编制的指纹分析系统就能快速对所有样本进行共有峰识别和模糊数学处理,实现了无人工干预下的中药指纹图谱共有峰的自动识别,指纹图谱的建立过程客观,并且节省大量时间,其中参考光谱法识别结果更准确。
关键词:中药指纹图谱;共有峰识别;肉苁蓉;高效液相色谱2二极管阵列检测器中图分类号:O657.7+2 文献标识码:A中药是中华民族的瑰宝,现代化是中药走向世界、实现国际化的前提,其制剂的质量水平控制是现代化的中心环节[1]。
以指纹图谱[2,3]规范中药制剂的质量,被评价为中药质量控制的里程碑[4-6]。
国家食品药品监督管理局2002年发布了《中药注射剂色谱指纹图谱实验研究技术指南(试行)》[7]。
色谱法是研究指纹图谱的首选方法,高效液相色谱(H PL C )因具有灵敏、重现、适用对象广泛、分离效率高等特点而被广泛应用[8]。
峰匹配是指纹分析的关键,保留时间或相对保留值常常作为色谱指纹图谱的共有峰识别标准[9]。
但是,由于中药体系的复杂性和HPL C 仪器系统的微小波动,同一组分在各色谱图中的保留时间不尽相同。
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目录 目录 .................................................................................................................................................. I 第一章：功能与用户 ...................................................................................................................... 3 1.1 功能简介............................................................................................................................. 3 1.2 适用用户............................................................................................................................. 3 第二章：安装与运行 ...................................................................................................................... 3 2.1 安装必备...................................................................
瓜子叶一条根HPLC指纹图谱的建立及化学模式识别
福建中医药2023 年5 月第54 卷第5期Fujian Journal of TCM May 2023，54（5）瓜子叶一条根HPLC指纹图谱的建立及化学模式识别江思思，张淼，黄泽豪，刘小芬*（福建中医药大学药学院，福建福州 350122）摘要：目的建立瓜子叶一条根的HPLC指纹图谱，并以指纹图谱共有峰数据构建化学模式识别模型，评价不同来源瓜子叶一条根的差异性机制。
方法采用高效液相色谱法建立13批不同来源瓜子叶一条根的指纹图谱，构建HPLC指纹图谱共有模式，结合相似度评价、聚类分析、主成分分析和正交偏最小二乘判别分析对不同批次瓜子叶一条根药材进行评价。
结果建立瓜子叶一条根的HPLC指纹图谱，共确定15个共有峰；13批瓜子叶一条根的指纹图谱与对照图谱的相似度为0.882～0.989，聚类分析和主成分分析均将13批样品分为3类，分类结果一致；主成分分析结果表明13批样品综合质量高低依次为S12＞S4＞S10＞S5＞S7＞S1＞S9＞S8＞S3＞S11＞S13＞S6＞S2；正交偏最小二乘判别分析筛选出4个质量差异标志性成分。
结论该研究建立的HPLC指纹图谱方法稳定可靠，与化学模式识别方法相结合可为瓜子叶一条根药材质量评价提供参考。
关键词：瓜子叶一条根；HPLC指纹图谱；化学模式识别“一条根”为一类草药的统称，因其以一条明显主根入药而得名，闽台地区用于治疗风湿、关节炎与筋骨酸痛等病症［1-2］。
课题组经文献考察、市场考察与田野调查，总结闽台两地一条根类草药包括豆科7属12种（一条根基原考证另文报道）。
其中，丁癸草属植物丁癸草Zornia gibbosa Spanog.为闽台两地一条根类草药来源之一，分布于福建全省各地及台湾宜兰、新竹等地［3］。
瓜子叶一条根始载于《泉州本草》，是丁癸草的别称，其药用部分为根、茎、叶、全草，具有活血行气、强筋骨、解热毒、利尿等功效［4］。
现代药理研究表明，丁癸草具有抗肿瘤、抗炎、降糖、保肝等多种药理活性［5-6］。
Excel与中药色谱指纹图谱相似度计算
色谱峰的峰面积数值 , 对应数据录入表中的 C6 ～ N98 单元格 . 通过公式将数据录入工作表中录入的 数据自动填入 ,如 D10 中编入公式 : = IF (数据录入 ! C6 = " " , " " ,数据录入 ! C6 ) 其它单元格公式的编制可采用上述复制 、 粘贴 方式迅速完成 . P10 ～P102 单元格 : 用于计算共有模式各对应 峰的峰面积值 (采用算术平均法 ) . P10 中公式为 : = IF ( S UM ( D10: O10 ) = 0, " " , AV ERA GE (D10: O10) ) 其它单元格公式的编制可采用上述复制 、 粘贴 方式迅速完成 . Q10 ～Q102 单元格 : 用于自动填入标准物质或 某一典型对照物获得的指纹图谱并作为对照指纹图 谱的峰面积数值 . 分别对应数据录入表格的 O6 ～ O98 单元格 . Q10 中公式为 : Q10 = IF ( 数据录入 ! O6 = " " , " " ,数据录入 ! O6) 其它单元格公式的编制可采用上述复制 、 粘贴 方式迅速完成 . 到此 Excel中药指纹图谱相似度计算模板设计、 编 制完成 ,如将某中药进行不同的灭菌处理后的 4 组指 纹图谱数据录入后 ,以未经灭菌处理的指纹图谱为对 照 ,不同灭菌处理条件的 3 组为待测供试品 ,计算并打 印出的结果见图 3,可作为原始记录进行保存. 所设计的表格计算模板为通用模板 ,样品数 、 色 谱峰数等数据规模达不到上述最大数量时 , 相应的 单元格不输入数据并不影响计算结果 . 在输入数据 进行计算后 ,可通过文件的另存进行数据和计算结 果的电子版保存 . 在进行新的计算之前 ,应将数据录 入工作表中 C6 ～O98 单元格中原来的数据全部清 空后重新输入新的数据 ,以免影响计算结果 . M icro soft Excel为微软办公软件套件之一 , 几乎 每台计算机都装有 ,可轻易获得并使用 ,其所具备的 强大的数据处理和统计分析功能及美观和直观的 图、 文、 表功能 ,可作为其它药学研究数据处理的最 好工具 ,如线性或非线性回归 、 方差分析 、 t检验 、 正 交设计等 .
企业版色谱指纹图谱相似度评价软件-食品与药品教学中心
指纹图谱相似性评价
指纹图谱相似度评价软件的引入不仅大大降低了人 工计算指纹图谱相似度的工作强度，而且减少了人工 判断的随意性和主观性，提高了中药指纹图谱量化评 判的客观标准。 但在实际应用中应注意，只有色谱工作站记录处 理的指纹图谱才具备用评价软件计算的基础。 目前，国家药典委员会推荐的“中药计算机辅助相 似度评价软件”数据格式可与沃特斯(Waters)、岛 津(Shimadzu)以及安捷伦(Agilent)等仪器厂家生 产的色谱工作站数据格式直接兼容。
目前中药指纹图谱的计算机解析方法有模糊信息分析法人工神经网络法及灰色关联度聚类法等均采用了模糊数学方法相似度计算方法为夹角余弦法即把每个色谱指纹图谱都可以看作一组对应保留时间下的峰高或峰面积的数值可将这组数值看作多维空间中的向量使两个指纹图谱间相似性的问题转化为多维空间的两个向量的相似性问题利用余弦值来定量表征指纹图谱间的相似性
(2)共有指纹峰面积的比值 以对照品作为参照物的指纹图谱，以参照物峰面 积作为1，计算各共有指纹峰面积与参照物峰面积的比值。
(3)中药材的供试品图谱中各共有峰面积的比值与指纹图谱各共有峰面积的比值 比较，单峰面积占总峰面积大于或等于20％的共有峰，其差值不得大于±20％； 单峰面积占总峰面积大于或等于10％，而小于20％的共有峰，其差值不得大于 ±25％；单峰面积占总峰面积小于10％的共有峰，峰面积比值不作要求，但必须 标定相对保留时间。未达基线分离的共有峰，应计算该组峰的总峰面积作为峰面积， 同时标定该组各峰的相对保留时间。 (4)非共有峰面积 中药材供试品的图谱与指纹图谱比较，非共有峰总面积不 得大于总峰面积的10％。
梁逸曾软件计算相似度使用步骤 1．载入数据（.csv文件） 2 数据前处理，包括数据压缩、数据平移 3．谱峰识别、谱峰匹配 4．计算相似度 5．对某个成分量上的区别，可用模式识别
杨树新品种的SSR指纹图谱构建和倍性检测
Key Laboratory of Tree Breeding and Cultivation of State Forestry Administration Nanjing 210037 ）
Beijing 100091 ； 2 ． Key Laboratory of Forest Genetics ＆ Biotechnology of Ministry of Education Nanjing Forestry University
Abstract：
【Objective】Genus Populus，with many species and a long history of cultivation and utilization ，is widely
used for afforestation ，shelterbelt and timber production． In recent decades，with rapid progress in Populus breeding in China，a large number of new varieties with fast growth and superior characteristics have been developed． However，the genetic basis of these new varieties were narrow and genetic differences among parental trees for hybridization was small ， and morphological differences among Populus varieties is becoming increasingly smaller，leading to difficulties in variety identification and protection of plant breeders ’ rights （ PBＲ ） ． How to distinguish accurately and quickly new Populus varieties has become the top priority． This study was aimed to construct fingerprints，identify pedigree relationships，
下呼吸道烟曲霉菌分离株耐药性及基因型观察
下呼吸道烟曲霉菌分离株耐药性及基因型观察罗劲;陈一强;孔晋亮;黄宏;邬丽红;王可;李冰;董必英【摘要】Objective To study the resistance and homology of aspergillus fumigatus that caused lower respiratory tract infection.Methods The 31 clinical strains of aspergillus fumigatus were respectively isolated from the sputum and bronchoalveolar lavage fluid of patients who suffered from lower respiratory tract aspergillus fumigatus infection .The sus-ceptibility of five antifungal agents against aspergillus fumigatus was measured by liquid microdilution method and the ho -mology of strains was analyzed with random amplified polymorphic DNA (RAPD)assay.Results The resistance of the 31 tested aspergillus fumigatus strains was 3.2%to voriconazole,12.9%to itraconazole,25.8%to amphotericin B whereas all sensitive to caspofungin and micafungin.By RAPD,the 31 strains were divided into 10 genotypes(A~J),among which Type B was the major prevalent genotype that consisted of 10 strains.Conclusions The genotype B was proved to be the relevant type that caused lower respiratory tract aspergillus fumigatus infection in the surveyedhospital .Voriconazole ,caspo-fungin,micafungin exhibited favorable antifungal activity against Aspergillus fumigatus isolates in vitro .%目的：探讨下呼吸道烟曲霉菌烟曲霉菌耐药性和基因同源性。