植物转录因子汇总2013
植物的生长转录因子和基因调控
生态恢复：通过调控转录因子和基因表达，促进受损生态系统的恢复和重建
合成生物学：利用转录因子和基因调控元件构建人工生物系统，实现新功能或优化现有功能
提高植物生长转录因子和基因调控研究的系统性和综合性
深入研究植物生长转录因子和基因调控的相互作用关系，以及它们在不同环境条件下的变化情况。
整合多学科知识：植物生长转录因子和基因调控研究需要综合生物学、遗传学、生物化学等多个学科的知识，以揭示其内在机制。
植物的生长转录因子和基因调控
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目录
01
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02
植物的生长转录因子
03
基因调控在植物生长中的作用
04
植物生长转录因子与基因调控的相互关系
05
植物生长转录因子和基因调控的应用前景
06
展望未来研究方向
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PART 01
植物的生长转录因子
PART 02
转录因子的定义和作用
基因调控的重要性：基因调控对植物生长、发育和响应环境变化至关重要，它决定了细胞类型和功能的多样性。
基因表达的调控方式
转录水平调控：通过调节转录起始和转录速率来控制基因的表达
翻译水平调控：通过影响蛋白质合成的速率和数量来调控基因表达
翻译后水平调控：通过蛋白质的修饰、定位和稳定性等来调控基因表达
转录后水平调控：通过影响mRNA的剪接、编辑和稳定性等来调控基因表达
植物生长相关基因的调控机制
基因表达的调控：转录因子在植物生长中的重要作用
转录因子对植物生长的影响：促进或抑制生长的关键因素
基因调控对植物生长的影响
基因调控在植物生长中的重要性
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转录因子在基因调控中的作用
植物Dof转录因子及其生物学功能
植物Dof转录因子及其生物学功能徐慧妮;王康;李昆志【摘要】Dof(DNA binding with one finger)蛋白是植物特有的一类转录因子,包含一个C_2- C_2锌指,其N-末端保守的Dof结构域是既与DNA又和蛋白相互作用的双重功能域.在过去10多年的研究中,Dof蛋白在多种单子叶和双子叶植物中被分离.Dof蛋白作为转录的激活子或抑制子在植物的生长和发育中发挥重要作用.就Dof转录因子及其生物学功能的进展进行了综述.【期刊名称】《生物技术通报》【年(卷),期】2010(000)001【总页数】6页(P19-23,29)【关键词】Dof;转录因子;转录调控【作者】徐慧妮;王康;李昆志【作者单位】昆明理工大学,生物工程技术研究中心,昆明,650224;昆明理工大学,生物工程技术研究中心,昆明,650224;昆明理工大学,生物工程技术研究中心,昆明,650224【正文语种】中文Abstract: Dof(DNA-bindingwith one finger)domain proteins asplant-specific transcription factors,presumably include a single C2-C2zinc finger.Dof domain proteinsmediate bothDNA-binding and protein-protein interactions.During the past decade,numerousDof domain proteins havebeen identified in both monocots and dicots.Dof domain proteins play critical roles as transcription activators or repressors in plants growth and development.In this paper,the Dof domain protein and its biological functionswere summarized.Key words: Dof Transcription factor Transcription regulationDof转录因子是植物特有的一类转录因子,因其具有一个单锌指结构,因此被称为Dof(DNA binding with one finger)。
拟南芥B3转录因子基因超家族_罗光宇
收稿日期：2012-11-24基金项目：湖南省研究生科研创新项目(CX2012B283)；国家转基因生物新品种培育科技重大专项(2009ZX08001026B)第一作者：罗光宇(1986-)，男，硕士生，E-mail: destinygazer@ *通信作者：陈信波(1962-)，男，博士，教授，E-mail: xinbochen@拟南芥B3转录因子基因超家族罗光宇，叶玲飞，陈信波*(湖南农业大学生物科学技术学院，长沙 410128)摘要：B3类转录因子基因组成了植物所特有的B3基因超家族，按照其结构和功能的特征可将其进一步分为LA V(LEAFY COTYLEDON2 [LEC2]–ABSCISIC ACID INSENSITIVE3 [ABI3]–VAL )、ARF(AUXIN RESPONSE FACTOR)、RA V(RELATED TO ABI3 and VP1)和REM(REPRODUCTIVE MERISTEM)等4个家族。
B3基因超家族主要存在于裸子植物、苔藓和绿藻类植物中，并在植物逆境胁迫响应和生长发育过程中起着极其重要的作用。
目前已在拟南芥中发现了118个B3类转录因子，本文综述了拟南芥中B3转录因子基因超家族的系统发育和功能鉴定方面的研究进展。
关键词：拟南芥；B3基因超家族；转录因子Research progress of Arabidopsis B3 transcription factor genesuperfamilyLUO Guangyu, YE Lingfei, CHEN Xinbo *(College of Bioscience and Biotechnology, Hunan Agricultural University, Changsha 410128, China)Abstract: The B3 transcription factor genes form a plant-specific B3 gene superfamily and can be furtherclassified into four families: LAV (LEAFY COTYLEDON2 [LEC2]–ABSCISIC ACID INSENSITIVE3 [ABI3]–VAL ), ARF (AUXIN RESPONSE FACTOR), RAV (RELATED TO ABI3 and VP1) and REM (REPRODUCTIVE MERISTEM) family. The B3 transcription factor genes exist mainly in gymnosperms, mosses and green algae and play extremely important roles in plant stress responses and plant growth and development. In Arabidopsis , 118 B3 superfamily transcription factor genes have been identified. This review aims to overview the research progress of the phylogenetical and functional characterization of the B3 gene superfamily in Arabidopsis .Key words: Arabidopsis thaliana ; B3 gene superfamily; transcription factor转录因子(transcription factor)是一类能与真核基因启动子区域中顺式作用元件发生特异性相互作用的DNA 结合蛋白。
植物转录因子MYB基因家族的研究进展
植物转录因子MYB基因家族的研究进展一、本文概述植物转录因子在植物生长发育和响应环境胁迫等过程中起着至关重要的作用。
其中，MYB基因家族作为植物转录因子中最大的家族之一，其成员数量众多，功能多样，研究价值极高。
本文旨在全面综述近年来植物MYB基因家族的研究进展，从MYB基因的结构特点、分类、功能及其在植物抗逆、次生代谢、生长发育等过程中的应用进行阐述，以期为进一步深入研究MYB基因家族在植物中的功能和应用提供有益的参考。
本文将对MYB基因家族的结构特点进行概述，包括其DNA结合域的结构、保守性及其与DNA结合的机制等。
我们将对MYB基因家族进行分类，包括R2R3-MYB、3R-MYB、4R-MYB和单R-MYB等亚族，并简要介绍各亚族的特点和代表性成员。
在此基础上，我们将重点综述MYB基因在植物抗逆、次生代谢、生长发育等方面的功能和应用，包括其在响应干旱、盐碱、低温等逆境胁迫中的作用，以及在调节植物次生代谢、控制植物形态建成和生长发育过程中的作用等。
我们将对MYB基因家族的研究前景进行展望，以期为植物生物学和农业科学研究提供新的思路和方法。
二、MYB基因家族概述MYB基因家族是植物中最大且最复杂的一类转录因子家族，它们在植物的生长、发育以及应对生物和非生物胁迫等多个生物学过程中发挥着关键作用。
MYB转录因子的命名源于其特有的DNA结合域——MYB结构域，该结构域由一系列不完全重复的R（repeat）单元构成，每个R单元约包含51-53个氨基酸，通过形成螺旋-转角-螺旋（helix-turn-helix）结构来特异性地识别并结合DNA序列。
根据MYB结构域的数量和序列特征，植物MYB基因家族通常被分为四大类：R1/2-MYB、R3-MYB、MYB-related和4R-MYB。
其中，R1/2-MYB 和R3-MYB分别含有一个和三个MYB结构域，而MYB-related类则仅包含不完整的MYB结构域。
植物bHLH转录因子研究进展
植物bHLH转录因子研究进展刘文文;李文学【摘要】Basic helix-loop-helix proteins (bHLHs)are found throughout the eukaryotic kingdom,and constitute one of the largest families of plant transcription factors. They can regulate gene expression through interaction with specific motif in target genes. Phylogenetic analysis indicates that plant bHLHs are monophyletic. bHLHs are necessary for plant normal growth and development,and play important roles in abiotic-stress responses. However,we know little about their origins,structures,and functions due to the large quantities and complexity of plant bHLH family. This paper reviews on the evolution,structure characteristics,biological function of plant bHLHs,especially their functions in adapting to abiotic-stress tolerance,so as to provide a theoretical reference for further research on the function of plant bHLH transcription factors.% bHLH(basic helix-loop-helix protein)是真核生物中存在最广泛的一大类转录因子，其通过特定的氨基酸残基与靶基因相互作用，进而调节相关基因的表达.系统发育分析表明植物的bHLH转录因子为单源进化.bHLH转录因子不仅对于植物的正常生长和发育必不可缺，同时参与植物适应多种逆境胁迫的反应过程.然而，由于植物bHLH家族成员众多、参与的生物过程复杂，对于其了解还不是十分清楚.本文针对植物bHLH 的进化、结构特点、生物功能，尤其是在适应逆境胁迫中作用等的最新研究结果进行综述，以期为进一步深入了解植物bHLH转录因子的功能提供理论参考.【期刊名称】《生物技术进展》【年(卷),期】2013(000)001【总页数】5页(P7-11)【关键词】bHLH;结构特点;生物学功能【作者】刘文文;李文学【作者单位】中国农业科学院作物科学研究所，北京100081;中国农业科学院作物科学研究所，北京100081【正文语种】中文bHLH转录因子广泛存在于真核生物。
植物MYB转录因子调控次生代谢的研究进展
评述与展望Review and Progress植物MYB 转录因子调控次生代谢的研究进展张驰1王艳芳1,2陈静1,2王义1,2张美萍1,2*1吉林农业大学生命科学学院,长春,130118;2吉林省人参基因资源开发与利用工程研究中心,长春,130118*通信作者,*********************.edu摘要转录因子调节是植物基因表达和调节机制的重要组成部分，MYB 转录因子(V-myb avian myelobl-astosis viral oncogene homolog)，是植物中最大转录因子家族之一。
MYB 转录因子对多种次生代谢产物的生物合成具有转录调控作用，如硫代葡萄糖苷、黄酮类、萜类、木质素类和芪类化合物等。
本综述将对MYB 转录因子家族对植物次生代谢的影响作详细阐述，以期为后续进一步探究该转录因子家族基因的功能提供理论参考。
关键词MYB,调控,次生代谢Research Advances on the Regulation of Secondary Metabolism by Plant MYB Transcription FactorsZhang Chi 1Wang Yanfang 1,2Chen Jing 1,2Wang Yi 1,2Zhang Meiping 1,2*1College of Life Sciences,Jilin Agricultural University,Changchun,130118;2Research Center For Ginseng Genetic Resources Development and Uti-lization,Changchun,130118*Corresponding author,*********************.edu DOI:10.13417/j.gab.039.004171Abstract The transcription factor regulation is an important part of plant gene expression and regulation mechanism.MYB transcription factor (v-myb avian myeloblastosis viral oncogene homolog)is one of the largest families of transcription factors in plants.A variety of secondary metabolites is regulated by MYB transcription factors,such as the biosynthesis of glucosinolates,flavonoids,terpenoids,lignins and stilbenes.To provide reference for further exploration of the function,this review focuses on the influence of the MYB transcription factor family on plant secondary metabolism.KeywordsMYB,Regulation,Secondary metabolism基金项目：本研究由国家高技术研究发展计划(863计划)项目(2013AA102604-3)、吉林省发改委-吉林省省级产业创新专项(2016C04;2018C047-3)、吉林省科技厅自然基金项目(20170101010JC;20180101027JC)和吉林省科技厅国际合作项目(201804-14077GH)共同资助引用格式：Zhang C.,Wang Y.F.,Chen J.,Wang Y.,and Zhang M.P.,2020,Research advances on the regulation of secondary meta-bolism by plant MYB transcription factors,Jiyinzuxue Yu Yingyong Shengwuxue (Genomics and Applied Biology),39(9):4171-4177(张驰,王艳芳,陈静,王义,张美萍,2020,植物MYB 转录因子调控次生代谢的研究进展,基因组学与应用生物学,39(9):4171-4177)在漫长的自然选择和进化过程中，植物形成了独特的调节机制，其中转录因子调节是其重要的组成部分(牛义岭等,2016)。
植物NAC转录因子的研究进展
植物NAC转录因子的研究进展王芳;孙立娇;赵晓宇;王婕婉;宋兴舜【摘要】NAC (NAM、ATAF1/2、CUC2)蛋白家族是植物特异性转录因子超家族,广泛存在于多样的植物中.大多数NAC蛋白具有保守的DNA结合结构域,其大约150个氨基酸位于蛋白质的N末端,并且在C末端区域具有高度可变的转录调节区域.该类家族基因在多个生物过程中发挥关键作用,如植物生长、发育和应激反应网络.因此,NAC转录因子被持续关注.近年来,尤其是近5年来对NAC的家族成员的功能研究获取了突破性的发现.总结NAC转录因子的最新研究进展,旨在为植物的遗传改良和育种提供参考.【期刊名称】《生物技术通报》【年(卷),期】2019(035)004【总页数】6页(P88-93)【关键词】NAC转录因子;生长发育;胁迫;功能【作者】王芳;孙立娇;赵晓宇;王婕婉;宋兴舜【作者单位】东北林业大学生命科学学院,哈尔滨150040;东北林业大学生命科学学院,哈尔滨150040;东北林业大学生命科学学院,哈尔滨150040;东北林业大学生命科学学院,哈尔滨150040;东北林业大学生命科学学院,哈尔滨150040【正文语种】中文NAC名称来自矮牵牛（Petunia hybrida）的NAM及拟南芥的ATAF1/2和CUC2的第一个字母，最初由Souer等［1］和Aida等［2］发现。
NAC是植物中最大的转录因子家族之一，全基因组研究表明拟南芥（Arabidopsis thaliana）中有117个NAC基因，水稻（Oryza sativa）中有151个，大豆（Glycine max）和烟草（Nicotiana tabacum）中各有101和152个［3-6］。
越来越多的研究已经证实植物的生长发育过程及胁迫条件下的生存与NAC转录因子有关，NAC转录因子家族成员的功能研究受到了公众的广泛关注。
笔者总结了近年来NAC转录因子在调控细胞增殖与寿命、代谢物合成、细胞程序化死亡、胁迫响应、信号传导等方面的突破性进展（表1）。
植物抗寒转录因子CBF和ICE研究进展
植物抗寒转录因子CBF和ICE研究进展李瑞梅;惠杜娟;刘姣;符少萍;段瑞军;郭建春【摘要】CBF是一类植物所特有的转录因子,是植物抗寒途径的枢纽,调控下游大量抗寒基因的表达,对增强植物的抗寒能力非常重要.ICE属于一种类似MYC的bHLH 转录因子,可特异结合到CBF启动子的MYC作用元件并诱导CBF下游基因的转录表达.综述了CBF和ICE两类转录因子的发现、应用及两者之间的关系,为作物抗寒分子改良提供参考.【期刊名称】《广东农业科学》【年(卷),期】2012(039)023【总页数】5页(P132-135,138)【关键词】CBF;ICE;转录因子;植物抗寒【作者】李瑞梅;惠杜娟;刘姣;符少萍;段瑞军;郭建春【作者单位】中国热带农业科学院生物技术研究所/农业部热带作物生物学与遗传资源利用重点实验室,海南海口 571101;中国热带农业科学院生物技术研究所/农业部热带作物生物学与遗传资源利用重点实验室,海南海口 571101;中国热带农业科学院生物技术研究所/农业部热带作物生物学与遗传资源利用重点实验室,海南海口571101;中国热带农业科学院生物技术研究所/农业部热带作物生物学与遗传资源利用重点实验室,海南海口 571101;中国热带农业科学院生物技术研究所/农业部热带作物生物学与遗传资源利用重点实验室,海南海口 571101;中国热带农业科学院生物技术研究所/农业部热带作物生物学与遗传资源利用重点实验室,海南海口571101【正文语种】中文【中图分类】Q786温度与光、水、CO2、有机物和各种矿物质一起被视为植物生长中的主要外界影响因子。
低温是植物经常遭受的一种逆境胁迫，会影响植物生长和发育，限制植物自然地理分布。
近年来，全球气候不稳定，低温灾害时有发生，轻者影响植物产量，重者损伤植物甚至致死。
因此，研究植物对低温的应答机制和耐寒机理以提高农林植物低温耐受力具有重要意义。
植物对于低温的应激反应性相当复杂，其过程按先后顺序可分为低温信号感受、信号传导和转录调控等多个阶段[1]。
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Lactuca sativa (garden lettuce)
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Jin JP, Zhang H, Kong L, Gao G and Luo JC. (2014). PlantTFDB 3.0: a portal for the functional and evolutionary study
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Carica papaya (papaya) (G)Citrus clementina (clementine) (G)Citrus sinensis (sweet orange) (G)Eucalyptus grandis (rose gum) (G)Gossypium hirsutum (upland cotton)Gossypium raimondii (cotton) (G)Raphanus sativus (radish)Thellungiella halophila (G)Thellungiella parvula (G)Theobroma cacao (cocoa) (G)AP2 (1776)ARF (1914)ARR-B (914)B3 (4051)BBR-BPC (492)BES1 (651)C2H2 (7336)C3H (4019)CAMTA (518)CO-like (854)CPP (594)DBB (764)Dof (2312)E2F/DP (692)EIL (531)ERF (8688)FAR1 (2542)G2-like (3935)GATA (2229)GRAS (3915)GRF (752)GeBP (683)HB-PHD (160)HB-other (987)HD-ZIP (3436)HRT-like (95)HSF (1833)LBD (2779)LFY (100)LSD (402)M-type (2978)MIKC (2864)MYB (8746)MYB_related (6410)NAC (8133)
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Whirly (233)
YABBY (725)
ZF-HD (1066)
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bZIP (6258)
of plant transcription factors. Nucleic Acids Research, 42(D1):D1182-D1187.
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Last Modified: 2013-8-23。