微生物定殖
根围促生细菌在植物根围定殖研究进展
根围促生细菌在植物根围定殖研究进展0 引言植物根围促生菌（Plant Growth-Promoting Rhizobacteria, PGPR），在国内外的商品化进程中之所以受到很大程度的控制主要在于其应用效果的不稳定（Sandra, 2002）。
生防的稳定性是影响生物防治效果的关键问题，多年来受到国内外学者的广泛关注。
一般来说生防稳定性受到诸多因子的影响，包括生防制剂本身、病原生物、寄主植物和环境因子。
在有益生防菌与宿主植物的相互作用过程中，生防菌必须在根内或根表组织上定殖生长才能对植物生长产生影响，大量的研究表明，接种至土壤的生防菌株能否在植物根围成功定殖对于其作用的发挥至关重要。
根围定殖能力一直被认为是生防的关键所在（Klopper, 1992; 郭坚华等,1996; Annouschka, 2003）。
因此研究生防菌株的根围定殖对于揭示其生防机制、提高菌株根围的适应性和增产具有十分重要的意义。
1 根围定殖的概念Kloepper 等人将带天然抗生素标记的植物根围促生菌（PGPR）菌株接种到马铃薯种薯块表面，然后再回收该菌株，这是首次使用根部定殖（Root Colonization）一词，其定殖量一般采用自根表回收到的引入菌株的种群数量来表示（Kloepper and Beauchamp, 1991），但是没有明确给根部定殖下定义。
随着根部定殖研究的发展，学术界普遍认为根部定殖是指一种外来引入菌株在植物根部定居并繁殖的主动过程，而不只是简单的引入菌株与植物根被动相遇的过程，应该包括引入菌株与根围土著微生物的相互竞争与适应，并在植株根部以促进植株健康生长的方式有效定居并繁殖。
目前普遍接受认可的定义为：根围定殖是指在有土著微生物存在的情况下，接种至种子或植物无性繁殖体表面部位的微生物在根部繁殖并持续其种群的能力（王海华等，2002）。
不少研究表明，微生物在植物根围的有效定殖，对根圈微生态及微生物-植物的互作产生较大的影响。
Cell：植物根系如何允许有益微生物定植的
Cell：植物根系如何允许有益微生物定植的损伤和微生物模式的共同作用控制着根部的局部免疫反应Co-incidence of Damage and Microbial Patterns Controls Localized Immune Responses in RootsImpact Factor：36.216/10.1016/j.cell.2020.01.013发表日期：2020-02-06第一作者：Feng Zhou1通讯作者：Feng Zhou(*****************)1, Niko Geldner(LeadContact)(********************)1合作作者：Aure´ lia Emonet,Vale´ rie De´ nervaud Tendon,Peter Marhavy,Dousheng Wu,Thomas Lahaye主要单位：1瑞士洛桑大学植物分子生物学系(Department of Plant Molecular Biology, Biophore, UNIL-Sorge, University of Lausanne, 1015 Lausanne, Switzerland)写在前面分享标题：Cell：植物根系如何允许有益微生物定植的关键字：拟南芥，根免疫力，微生物模式，模式识别受体，局部反应，损伤门控点评：微生物相关分子模式（microbe-associated molecular patterns, MAMPs）的识别对于植物的免疫反应至关重要。
如何将这种复杂的感知系统有效地部署在不断暴露于微生物的根中仍然是一个谜。
本文通过分析拟南芥中单细胞分辨率下的MAMP受体表达和应答，观察到分化的外细胞层显示出模式识别受体(pattern-recognitionreceptors, PRRs)的低表达并且缺乏MAMP应答。
微生物在固定氮中的作用及其调控机制
微生物在固定氮中的作用及其调控机制氮是生命的基本元素之一，是构成生物体的核酸、蛋白质等必需元素。
然而，在自然界中，氮的存在形式主要是空气中的氮气(N2)，这种形式的氮却不能直接被植物吸收利用，因为固氮的反应需要高能量的化学键的断裂。
然而，在自然界中一些微生物能够利用高级别的氮化合物为能源，将空气中的氮转化成小分子低能级的氮化合物，从而实现对氮的固定。
这种过程称为生物固氮，也被认为是生态系统中最重要的氮素转化途径之一。
一、微生物固氮的类型固氮的微生物主要包括自由生活的和共生生活的两类，其中，大多数自由生活的固氮微生物属于泛菌门的一种，称为氢化菌(Hydrogenobacter)和蓝藻(Anabaena)。
1. 自由生活的微生物固氮自由生活的微生物固氮是指能独立生存，在土壤、水体等环境中自由活动并能进行固氮的微生物。
其中，最常见的是一些泛菌门的微生物，包括许多细菌属，如Azotobacter、Azospirillum、Klebsiella、Pseudomonas等，其中，Azotobacter和Azospirillum是目前应用较广的固氮微生物。
对于这类微生物，为了增加自身的固氮量，一些根据渗透压、营养要求不同的固氮微生物会发生栖息的现象，形成根结菌留在植物根系上，这时的微生物被称为共生生物。
2. 共生微生物固氮共生微生物固氮即多种微生物（一般为革兰氏气单胞菌与根瘤菌）与植物共生，形成定殖在植物根系中的根瘤菌。
根瘤菌通过有氧呼吸供植物能量，同时通过固氮向植物提供生长所需的氮。
广义上说，共生微生物固氮包括具有根瘤菌能力或寄生植物的微生物。
其中，根瘤菌是利用植物根部平面细胞中“受原体”抗体结构与植物根细胞接合后进入植物体内异化并生长发育具有固氮能力的一类菌群。
二、微生物固氮的作用与意义1. 微生物对植物固氮的帮助植物只有在植物根系中生存的共生根瘤菌的固氮作用下才能生长和繁殖。
微生物不仅利用可以耐受固氮的植物成分，而且利用解毒酶诱导因子固氮。
微生物生态学中的生态位理论与方法研究
微生物生态学中的生态位理论与方法研究微生物是地球上最古老、最广泛分布、数量最多、鉴定最困难的生物类群之一，是支持生态系统运作的基础。
微生物生态学研究微生物在不同生态环境中的数量、分布、功能以及它们之间的相互作用。
生态位理论是微生物生态学中重要的理论基础，对生物的适应性、竞争关系和生态位资源利用具有重要的指导意义。
本文将介绍微生物生态学中的生态位理论以及实验方法的研究进展。
生态位理论生态位是指生物与周围环境中的因素相互作用的空间在物理（生境）和功能（作用）两个方面的总和，是描述物种在生态系统中的占据位置及其与周围物种的关系的一种生态概念。
其基本观点是：生态位可以被人们看成“生态位置”，也可以被看做“生态空间”；任何一种生物对于生存条件的要求都表现在其生态位上。
根据生态位的定义，可以得知生态位有其内部和外部两个方面。
内部生态位主要包括营养特性、生长条件要求等方面，而外部生态位则是由生境的特点如温度、湿度、PH等环境因素所决定。
生态位理论不仅适用于微生物，也可以适用于动植物等多种生物学研究中。
生态位可分为空间生态位和时间生态位。
空间生态位是指一个物种在空间上的所占据的位置，而时间生态位是指一个物种在时间上所占据的位置。
一个物种的时间生态位也可以看做是对多个空间生态位的运用。
生态位的占据程度是一个相对的概念，不同物种占据的生态位是不一样的。
对于同一生态位的不同物种，按照它们在竞争、合作方面所表现出的适应性，来分配它们的占有度，这个分配程度叫做相对占有度。
生态位因此成为微生物生态学研究的核心之一。
生态位理论的应用微生物生态学研究中常常借助生态位理论进行相应的研究。
一个物种在特定的环境条件下所占据的生态位影响着其在生态系统中的角色、数量以及影响力等等。
生态位的作用也可以归纳为以下几个层面。
1. 确定菌群定殖在特定环境条件下，生境能够容纳或支持的微生物种类种类是有限的，具体哪些微生物可以占据生态位分别取决于其相对适应性和浓度势能。
微生物岩石定殖机制_概述及解释说明
微生物岩石定殖机制概述及解释说明1. 引言1.1 概述在地球上，岩石是最为重要和普遍存在的地质物质之一。
然而，岩石表面的微观环境却并非孤立的，而是充满了各种微生物群体。
这些微小的生命体通过各种机制和作用与岩石发生相互作用，并在其上定殖。
微生物岩石定殖机制作为一个复杂且有着广泛应用前景的研究领域，在环境科学、地质学、土壤学等领域中引起了广泛关注。
本文旨在综述微生物岩石定殖机制的概念和基本原理，并对其在自然界中所扮演的角色和功能进行探讨。
另外，我们将详细解释物理吸附、化学吸附、生长、繁殖和分泌代谢产物以及协同作用和竞争机制等不同的微生物岩石定殖机制，并通过案例研究展示微生物岩石定殖在环境修复与资源利用中的潜力。
1.2 文章结构本文分为五个主要部分。
首先是引言部分，概述了微生物岩石定殖机制的重要性和应用价值。
其次，我们将在第二部分对微生物岩石定殖机制进行详细概述，包括其定义和重要性、微生物在岩石定殖中的角色和功能以及微生物岩石界面的特征和环境因素影响。
接下来，在第三部分中，我们将深入解释物理吸附和化学吸附机制、生长、繁殖和分泌代谢产物机制以及协同作用和竞争机制等不同的微生物岩石定殖机制。
第四部分将通过自然界中的案例研究，展示微生物岩石定殖在环境修复与资源利用中的潜力，并提出未来的发展方向和挑战。
最后，在结论部分，总结了微生物岩石定殖机制的重要性和应用价值，并展望了未来针对该领域进行的可能研究和应用方向。
1.3 目的本文旨在全面介绍微生物岩石定殖机制，并阐明其在自然界中所扮演的角色和功能。
通过对不同机制的解释说明，希望能够增进对微生物岩石定殖的认识和理解。
此外，本文还将通过案例研究，探索微生物岩石定殖在环境修复与资源利用方面的潜力，并提出未来的研究方向和挑战。
最终，我们希望通过这篇文章能够促进该领域的进一步研究和应用发展，为各个领域的科学家和工程师提供有益的参考和启示。
2. 微生物岩石定殖机制概述2.1 微生物定殖的定义和重要性微生物岩石定殖是指微生物在岩石表面或内部建立居住并进行活动的过程。
微生物与免疫笔记
1.细菌的基本结构: 细胞壁、细胞膜、细胞质、核质体、核糖体。
2.细菌的特殊结构: 鞭毛、菌毛（纤毛）、性菌毛、荚膜、芽孢。
3.细菌以二分裂方式进行无性繁殖。
4.细菌分为: 球菌、杆菌、螺旋菌。
5.细菌的形态：菌落：单个微生物在适宜的固体培养基表面或内部生长、繁殖到一定程度可以形成肉眼可见的、有一定形态结构的子细胞生长群体。
菌苔：当固体培养基形成的菌落连成一片是, 便形成菌苔。
6.细胞壁主要有肽聚糖（又叫黏肽）--------革兰氏阳性菌和革兰氏阴性菌的区别肽聚糖的不同。
7.磷酸壁时革兰氏阳性菌的特有成分。
细胞壁有缺陷仍然能生长的细菌称为 L形细菌。
8.细胞壁的主要功能: 1.保持细菌的一定外形。
2.保护细菌免受外界渗透压和有害质的损害。
3.与细菌的致病性、抗原性、对噬菌体和药物的敏感性有关。
4.与革兰氏染色特性反应有关。
9.脂多糖内毒素的主要成分。
外毒素的主要成分是蛋白质。
10.细胞膜是半渗透性的生物膜。
11.荚膜的作用 1.保护细菌免受干燥。
2.储存营养。
3.有助于细菌粘附。
4.能抵抗吞噬细胞的吞噬和抵抗抗体, 使细菌发挥致病性, 是细菌致病的重要因素。
12.鞭毛 1.细菌运动有关。
2.与细菌的粘附有关。
13.性菌毛: 传递遗传物质。
14.芽孢是细菌的休眠体。
芽孢杀灭方法: 160℃干热灭菌或高压蒸汽灭菌。
15.对数期：细菌生长最快, 大小基本一致。
对外界最敏感。
药敏试验对数期。
16.细菌的合成产物1.致热源（本质是多糖）。
2.毒素。
3.侵袭性酶类。
4.细菌素。
5.色素。
6.抗生素。
7、维生素（大肠杆菌合成维生素B.K）。
17.培养基分类: 1.基础培养基。
2.营养培养基。
3.选择培养基。
4.鉴别培养基。
18.正常菌群的作用: 1.营养作用。
2、刺激免疫应答。
3、生物拮抗作用。
19.致病性：一定的病原微生物, 在一定的条件下能在特定的寄住体内引起感染过程的性能。
20.毒株: 同一种病原微生物的不同分离病原珠。
第六章微生物的生长繁殖及其控制
第六章微生物的生长生殖及其操纵一、微生物生长生殖的概念微生物的生长是指细胞物质有规律地、不可逆增加，导致个体体积扩大的生物学过程。
当细胞个体生长到一定时期，通过特定方式产生新的生命个体，即引起生命个体数量增加即生殖。
在高等生物里这两个过程能够明显分开，但对低等特别是单细胞的微生物，由于细胞小，这两个过程紧密联系、特别难划分，因此，微生物的生长生殖，一般指群体生长，这一点与研究动物、植物有所不同。
1、细菌一般没有有性生殖，多采纳二分裂方式。
2、真菌除了进行无性生殖，产生大量孢子如分生孢子、节孢子、厚垣孢子、孢囊孢子等外，还能进行有性生殖，产生有性孢子如卵孢子、接合孢子、孢囊孢子等。
二、微生物生长的测定微生物生长：单位时刻里微生物数量或生物量〔Biomass〕的变化个体计数微生物生长的测定：群体重量测定群体生理指标测定〔一〕以数量变化对微生物生长情况进行测定通常用来测定细菌、酵母菌等单细胞微生物的生长或样品中所含微生物个体的数量〔细菌、孢子、酵母菌〕。
1、培养平板计数法样品充分混匀后，取一定量的稀释液涂布或倾注在平板上，进行培养，统计平板上长出的菌落数。
注重：1）同一稀释度三个以上重复,取平均值；2）每个平板上的菌落数目适宜，便于正确计数；一个菌落可能是多个细胞一起形成，因此在科研中一般用菌落形成单位〔colonyformingunits，CFU〕来表示，而不是直截了当表示为细胞数。
2、膜过滤培养法当样品中菌数特别低时，能够将一定体积的湖水、海水或饮用水等样品通过膜过滤器，然后将膜转到相应的培养基上进行培养，对形成的菌落进行统计。
3、Themostprobablenumbermethod〔液体稀释法〕1〕未知样品进行十倍稀释；2〕取三个连续的稀释度平行接种多支试管并培养；3〕长菌的为阳性，未长菌的为阴性；4〕查表推算出样品中的微生物数目；4、显微镜直截了当计数法采纳细菌计数板或血球计数板，在显微镜下对微生物数量进行直截了当计数，计算一定容积里样品中微生物的总数量。
微生物基础知识
微生物学基础知识微生物广泛地存在于自然界，与我们共同生活在这个世界上，影响着我们生产和生活的方方面面，微生物对于大多数人来说既熟悉又陌生。
说熟悉，那是因为在我们的周围,如土壤、空气，直至我们身体无不存在着大量的微生物，我们所患的各种疾病如肝炎、痢疾、伤寒、肺炎、脑膜炎等无不与它们有关。
在制药行业，GMP对厂房的洁净度有着较为苛刻的要求：在100级洁净度下每立方米空气中的浮游菌不得多于5个，沉降菌不得多于1个；大容量注射剂必须做无菌检查，固体制剂必须做微生物限度检查。
不同的剂型不得检出相应的控制菌；在工艺用水中对细菌、霉菌、酵母菌也有要求。
这些控制指标所针对的对象都是微生物。
因此说，我们对它们是熟悉的。
说到不熟悉，那是因为我们大多数人对它们缺乏较深入的了解，如它们的外观形态、内部结构是什么样的？它们的生化特点有哪些？它们对整个生态系统有着怎么样的功与过？它们对我们制药行业会带来哪些有益或有害的影响，我们对它们应该怎样加以利用或防范？所有这些，对大多数人来说是不了解的。
因此说对它们是陌生的。
以下对微生物的一些基本知识作一简要介绍。
1、什么是微生物？微生物是一切肉眼看不见或看不清的微小生物的总称。
它们都是一些个体微小，结构简单的低等生物，包括原核类的细菌（真细菌）、放线菌、蓝细菌、支原体、衣原体、立克次体；属于真核类的真菌（酵母菌、霉菌和蕈菌）、原生动物和微藻类以及属于非细胞类的病毒和亚病毒。
那什么是“原核类”和“真核类”呢？所谓原核，是指这类微生物的细胞中没有细胞核的结构，而且其它结构成份也比较简单；所谓真核，就是在它们细胞中有一明显的细胞核。
它们在繁殖的方式上也有所区别。
原核类微生物的繁殖靠细胞的一分为二、二分为四的分裂方式来实现，因此它们也被称为“裂殖菌；而真核微生物的繁殖方式比较复杂和多样，许多种类要通过不同细胞的交配，此外在细胞壁的结构上二者也有不同，有细胞壁的原核微生物其细胞壁的主要成份是一类含氨基酸的多糖，称肽聚糖；有细胞壁的真核生物其细胞壁中含有的主要成分是纤维素（例如高等植物细胞）或甲壳质（如霉菌）。
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微生物定殖
【原创实用版】
目录
1.微生物定殖的定义和重要性
2.微生物定殖的过程和影响因素
3.微生物定殖在人体健康和疾病中的作用
4.微生物定殖的应用和研究前景
正文
1.微生物定殖的定义和重要性
微生物定殖，指的是微生物在宿主体内或体表定居并繁殖的过程。
微生物包括细菌、病毒、真菌等，它们在人体表面和内部广泛存在，与人体相互作用。
微生物定殖在生态学、医学和工业等领域具有重要意义，因为它关系到微生物在宿主体内的生存、繁殖和致病性。
2.微生物定殖的过程和影响因素
微生物定殖的过程可以分为吸附、黏附、定植和繁殖四个阶段。
首先，微生物通过吸附和黏附在宿主体表或内部组织上，然后定植于特定位点，最后在定植位点进行繁殖。
影响微生物定殖的因素有很多，包括微生物本身的特性（如菌株、毒力等）、宿主的生理和免疫状况、环境因素等。
3.微生物定殖在人体健康和疾病中的作用
微生物定殖在人体健康和疾病中扮演着重要角色。
正常情况下，人体内存在大量有益菌，它们与人体相互依赖，共同维护人体健康。
然而，当人体免疫力下降、菌群失衡时，有害菌可能会繁殖并导致疾病，如腹泻、呼吸道感染等。
此外，微生物定殖在慢性炎症、肿瘤等疾病中也发挥着作用。
4.微生物定殖的应用和研究前景
微生物定殖在医学、农业、食品工业等领域具有广泛应用。
例如，在医学领域，通过调整菌群平衡，可以治疗肠道疾病、预防肠道感染等；在农业领域，微生物定殖技术可用于提高作物产量和抗病性；在食品工业，微生物定殖可用于发酵食品的制作。