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生物学软件大全1.三维分子类RASMOL:观看生物分子3D微观立体结构RasTop:为RasMol 2.7.1的图形用户界面软件CHIME:直接在浏览器中观看3D分子MolMol:将pdb等格式的蛋白文件通过微调,存成普通的图形文件raswin.exe.gz:rasmol(win)2.7.0.1 rasmol新版本及汉化版本CrystInfo:用来快速、容易地构建、观察与检查晶体3D结构PDViewer:PDB格式文件的查看程序Weblab Viewlite:三维分子浏览工具及大量分子文件例子Weblab ViewerPro:三维分子浏览工具ICMLite:三维分子浏览工具,有一些其他软件没有的功能VMD:三维分子浏览工具,可以进行动态显示CN3D:3D分子结构观察软件WPDB:PDB文件检索显示分析软件DTMM:三维分子模型显示、编辑与构建程序Mole:高性能的大分子三维图形显示计算工具gopenmol:显示并分析分子结构及其特性POV-Rayv:生成三维图像工具软件MolPOV:将PDB文件转化为POV格式文件的软件Mol2Mol:分子文件格式转换软件PovChem:将PDB文件转化为POV格式的文件Ortep-3 for Windows:生成分子的热椭圆形点图PLATON:通用结晶学软件工具Mage:读取并演示Kinemage格式文件的专用软件Prekin :将PDB格式文件转换为Kinemage格式文件Swiss-Pdb Viewer:PDB文件显示与分析软件DINAMO:蛋白序列排队比较编辑与三维模型构建工具PCMoleeule2 Lite:查看PDB格式文件的免费软件StrukEd :化学分子编辑与三维模型生成软件JMVC:使用JA V A技术编写的三维分子查看器ReView:读取及分析XYZ格式三维分子文件Oscail:用来处理、定义与检查小分子单晶的软件包Moilin:分子构建与观察软件Tinker:与Moilin配套的DOS下的分子设计建模Biodesigner:免费的分子建模与显示软件MoluCAD:全功能的分子建模与显示工具软件Viewer Activex Control:三维分子显示控件MarvinView:JA V A语言编写的化学分子二维与三维显示程序ACD/3D Viewer for ISIS:免费的ISISDraw三维显示插件Amira:高等三维显示建模系统AmiraMol:Amira 2.3 相应的显示三维分子的增强工具Visualize:分子建模和研究软件包ScientificGL:C++OpenGLAPI三维分子开发工具Sojourner:找出小蛋白的最小能量构形并实时演示的软件2.DNA分析DNAClub:DNA处理软件JaMBW:分子生物学软件包DNATool:功能很全面的DNA序列分析工具包pDRAW:DNA分析与绘图软件,可绘制线性或环形DNA图ANNHYB:用来帮助进行PCR引物设计与基因探针设计的软件RESTRICTION ANALYSIS:限制酶消化工具ABIView:ABI格式文件显示与编辑软件Chromas:ABI格式文件显示与编辑软件Sequence viewer:获取与观察从GSDB获取的DNA序列数据及其关联特性的工具DNAssist:DNA序列分析工具DNAProbe:核苷酸序列设计工具DnaSP:DNA序列种群遗传学分析软件DFW:DNA分析软件Artemis R4:以Java语言写成的序列查看工具’ACT R1:以Java语言写成的序列比较查看器GDA:主要用来进行不连续基因数据的统计分析RDP:从一组排队比较(Align)的核酸序列中查找潜在的重组体软件Sequencher:装配DNA小片段为大的连续序列或毗连(序列)群"Contig"软件MehCalc:自动计算DNA序列热力学数据的Excel电子表格宏软件基因探索者:中文界面的功能集成、高效、快捷的基因分析软件ConsInspector:DNA蛋白结合位点预测识别软件MatInd与Matlnspector:快速匹配DNA序列与已知共有序列的软件工具GBuilder:JA V A语言编制的用来分析与显示DNA序列的软件GenomePixelizer:帮助理解基因组中的簇基因(C1ustermggene)之间的相互关系的软件LabBook Genomic XML Viewer:图形化显示并处理GenBank序列数据的免费软件Gene Construetion Kit 2 :管理并显示克隆策略中的分子构建过程软件Genalysis:比较基因组或大量基因序列的工具软件3.RNA分析RNAdraw:RNA二级结构分析软件RNAstructure:预测RNA 级结构图RnaViz:RNA二级结构图绘制程序4.蛋白质分析ANTHEPROT:蛋白序列分析软件包pSAAM:蛋白序列分析软件包VHMPT:螺旋状膜蛋白拓扑结构观察与编辑软件aminoXpress:免费的多功能蛋白分析软件包5.生化教学mmp.zip:将生化代谢中的各种途径用图表的形式表示出来linpath.zip:线性酶反应模拟软件protlab:蛋白质纯化仿真软件MOLMED.ZIP:生化基础概念演示教学程序Biochem:生化教学文件photo:光合作用教学程序Adrenalin:肾上腺素在肝糖原代谢中的作用演示Virtual Cell Lab:多媒体细胞生物学教学程序6.生化工程brd.zip:生物反应器(发酵罐)设计软件BioStat:BioStatB发酵罐控制程序PenSimv:青霉素发酵模拟软件BioProSim:发酵实时模拟软件7.序列格式转换vised:序列输入分析和格式转换软件ForCon:多序列文件格式转换软件SeqVerter:序列格式转换软件GeneStudio LE Version:序列格式显示、编辑与转换工具软件FASTA/BLAST SCAN:FASTA与BLAST查询输出文件的处理软件RevComp:序列格式转换软件8.引物分析primer Premier 5.0:引物设计工具Oligo:引物分析著名软件Primer Designer:专门用 pASK-IBA~pPR-IBA表达载体免费的引物设计辅助软件Array Designer:批量设计DNA和寡核苷酸引物工具Beacon Designer:PCR定量分析分子信标(Molecularbeacon)设计软件NetPrimer:基于WEB界面的引物设计程序9.序列综合分析pcgene:分子生物应用软件MACAW:多序列构建与分析软件Clustal W:用来对核酸与蛋白序列进行多序列比较的软件Clustal X:ClustalWWindows界面程序FASTA:数据库中查找同源序列软件GeneDoc:对序列进行相关分析等操作BLAST与Blastcl3:数据库中查找类似序列的软件及客户端软件SeqPup 0.9:生物分子序列编辑与分析软件K-Estimator 5.5:进化基因学研究软件,评估两条核酸序列核苷酸替代数BioEdit:序列编辑器与分析工具软件DAMBE:综合性序列工具软件LaserGene:综合性序列工具软件SeaView:图形化多序列队列编辑器Jalview:用Java语言写的多序列队列编辑器DNASIS:序列综合分析工具Genamics Expression:是一个DNA与蛋白序列分析工具Vector NTIViewer:载体查看软件Jellyfish:多功能序列分析软件ProSeq:核酸序列编辑与种群遗传学分析软件Gap4 database viewer:Gap4基因装配数据库读取显示软件SMS:DNA与蛋白序列分析与格式化在线工具集合Omiga:核酸与蛋白序列综合性分析软件Staden:综合序列分析工具软件包Vector NTISuite:综合性蛋白核酸分析工具包INCA:Java脚本语言写成的BLAST服务器客户端程序ISYS:NCGR开发的用JA V A语言写成的数个不同类生物信息软件与数据库的软件集合平台DNA Scriptor:DNA与蛋白序列综合分析软件Sequence Quickie-Calc:非常紧凑的分子生物学工具软件PhyloGrapher:用来显示与研究相类似的基因与蛋白序列之间的进化关系的软件10.进化树分析phylip:进化树分析软件,并可绘制进化树TreeView:进化树处理软件GeneTree:比较基因与种系进化树的程序NDE:用来编辑NEXUS格式文件的程序TreeMap:用来可视化地比较主、从进化树的程序Spectrum:分析进化信息而不用将之转化为进化树的软件Phyltools:计算与处理进化树数据的软件tree-puzzle:核酸序列、蛋白序列相似性分析及进化树构建工具ATV:JA V A语言编写的显示"New Hampshire"与NHX格式的进化树文件软件TREECON:构建和绘制进化树的软件包ProBiosys比较表现型分类法数据和分析计算核酸序列数据距离值的软件11.质粒绘图Plasmid Processor:绘制质粒图软件Plasmid ProcessorPro:绘制质粒图软件,与Plasmid Processor是同一个作者WinPlas:质粒绘图软件商业版DMUP:环状质粒绘图软件测试版Plasmid Toolkit:质粒绘制软件pDRAW:DNA分析与绘图软件,可绘制线性或环形DNA图Redasoft Visual Cloning:是有名的绘制质粒图Redasoft Plasmid 1.1软件的升级版SimVector:质粒图绘制软件12.图像处理Image Tool:科学用途的处理图像软件Image J:用Java语言写成的科学用途的处理图像软件Cross Checker:基因指纹图分析软件ALFmap:ALF(Amersham Pharmacia)图像格式转换软件Band Leader:凝胶图像处理软件Scion lmage:图像处理与分析工具OSIRIS:通用医学图像处理与分析软件Melanie 3 Viewer:免费Melanie图像查看器Smart Draw:流程图绘制软件演示版GIMPWin:图像处理自由软件ChromoZoom:比较两个图像的相同与不同之处软件bandscan:蛋白凝胶电泳图像分析软件SigmaScanPro:图像分析软件30天全功能演示版SigmaGel:凝胶图像分析软件TotalLab:图像分析软件Lablmage:凝胶图像分析软件GelDiff:定量比较两个2D凝胶图像的不同之处的JA V A软件Timediff:分析蛋白/基因表达图谱时间序列的JA V A软件QuantiScan:使用简单功能专一的凝胶扫描、分析软件PDQuest:分析2维凝胶并生成数据库的标准软件13.数据处理CurveExpert:用于ELISA标准曲线拟合的软件Cliekh Graph:实验数据作图软件Statistica:专业统计软件GraphPad PRISM:著名的数据处理软件NoSA:中文非典型数据统计分析系统CrossGraphs:多变量数据库图形显示软件SigmaPlot:绘图和数据分析软件包30天全功能评估版SYSTAT:数据统计分析与作图的利器30天全功能演示版SigmaStat:智能统计软件30天全功能演示版PeakFit:自动分离、拟合与分析非线性数据软件TableCurve:自动两维曲线拟合与经验公式查找软件TableCurve :自动三维曲面拟合与经验公式查找软件SPSS:非常权威且有名的数据统计处理软件30天全功能演示版Origin:易于使用的科学用途数据绘图与数据分析处理工具软件DATb:进行生物曲线拟合与数据分析的免费软件数据作图助手:对实验结果进行数据分析和作图的专业软件14.检索与阅读PatentIn:用于将序列专利提交给美国国家专利与商标局的辅助软件Checker:用于将序列专利提交给美国国家专利与商标局的辅助软件ica32t.exe:中国生物学文献数据库检索客户端软件PathDB检索程序:(代谢途径数据库)检索程序PubCrawler:Medline文献库与GenBank核酸序列库检索软件NetRoseBrowser:PDG格式浏览器Book Express:专门用于超星数字图书下载的工具软件EndNote:专业参考文献查询软件Reference Manager:专业参考文献查询软件Procite:参考资料检索管理软件Sequin:数据库GenBank,EMBL,DDBJ查询软件MiniViewer:数图阅览器Compresslt:JBG(NLC)”JPG转换功能软件Refs:参考文献管理软件Scholars Aid:文献参考资料等日常资料的整理软件paperworks:免费的参考文献管理软件KD:知识仓库建库管理系统15.基因芯片AMADA:用来组织、研究、显示、分析微数组(Microarray)数据软件ScanAlyze:进行微矩阵荧光图像分析软件Cluster:对大量微矩阵数据组进行分析处理的软件TreeView:用图形来显示Cluster软件分析的结果软件AMAD:微数组数据库ArrayMakerv:Stanford大学Brown实验室提供的基因芯片研究全套设备相配套的软件与文档J-Express:分析微矩阵(Microarray)实验获得的基因表达数据的软件16.其他功能软件digitizer:图形数字化软件,可以将曲线图转化为数据与等式Graph Paper:坐标纸打印软件DynaFit:酶动力学数据或配体—受体结合数据处理软件Migrate:从遗传学角度,估算人口移民率程序arlequin:人口遗传学软件正交设计助手:正交实验设计辅助工具软件FBAT:家族遗传相联检验的统计程序GGT32:图形化基因型表示软件CERVUS:使用共显性标记数据推断亲缘关系的软件Jarnac:代谢过程模拟软件包Gepasi:化学与生物化学反应动力学仿真与优化软件BCT:微生物趋向性模拟程序StochSim:随机生物化学反应模拟软件Bio_MW:生物化学分子量计算软件MatchCode:将蛋白和核酸序列进行简单匹配和格式化输出的中文软件Map Manager:回交、杂交与重组自交系分析遗传作图实验结果的软件MolEco:以遗传学方法评估杂乱交配频率的软件Canvas:绘图软件免疫室管理系统:中文免疫室综合软件Cyrillic:家谱绘图软件Frozen Cell Stock Monitor:用来管理储存在液氮容器中的生物样品(例如细胞系、血清等等)的程序MICE:虚拟动物饲养设施,用来帮助管理饲养设施中的实验动物软件DBsolve:代谢及酶—受体结合模拟软件boxit:管理生物样品的数据库系统GRR:检测系谱误差(pedigreeerrors)的应用软件健康药霸:药典类的软件AceDB:基因组数据库软件MAPL98、DIAL98与GEST98:El本学者编制的几个统计基因学(StatisticalGenetics)软件PED:系谱(Pedigree)绘制软件PEDRAW:系谱(Pedigree)绘制软件quantiRT:内置宏程序,用来辅助定量RT-PCR实验的Excel文件BateView:管理与追踪小型的实验鼠生殖群体的Excel文件MassXpert:帮助科学家预测与分析从蛋白组学研究中获得的蛋白质质谱数据的软件MestRe-C与MestRe-CnD:分析、显示与仿真1D与2D磁共振图谱的软件ACD/SpecViewer:免费光谱数据显示软件ACD/CNMR Viewer:ACD/HNMR用来显示ACD/NMR Predictors预测的所绘化学结构式Viewer:磁共振图谱文件的免费软件WinMDIver:分析流式细胞仪数据文件的免费软件TestDNA:根据已知成分值生成细胞周期FCS文件的免费工具软件Cylchred:细胞周期分析(CELLCYCLEANALYSIS)软件gX-Path Vision:生成、编辑与显示生物代谢途径的工具软件生物五笔:生物医学专业输入法17.化学绘图ACD/CHEMSKETCH:绘制分子结构的免费软件及其汉化版ACD/ChemSketch及ChemBasic:绘制分子结构的免费软件5.0版本及其汉化版Chemfont:化学符号与TureType字体,可以在Word中直接插入文章中clip.zip:化学图片集,含有近400幅与化学有关的GIF图片ISIS DRAW:绘制化学结构式的免费软件AutoNom:ISIS/Draw软件的插件(自动生成符合IUPAC命名规则的化合物名称) ChemWindows:绘制化学结构式的免费软件MarvinSketch:JA V A语言编写的小巧好用的化学结构式绘制程序ACD/Structure Drawing Applet:绘制化学结构式免费JA V A小程序ChemPen:绘制化学结构式软件ChemPen+:绘制化学结构式软件ChemPen:绘制化学结构式软件18.化学应用mmcalc.exe:分子量计算器hxfc.zip:化学方程式配平软件cmcalc10.exe:化学试剂制备计算器alkne.exe:有机化学命名练习程序chembl32.zip:Windows95下的免费化学方程式配平程序periodic.zip:小巧的元素周期表ptab32.zip:高级元素周期表CAF:计算机辅助配方软件CFT:化学式教师元素屋:查询112种元素的各个信息的中文软件化学反应方程式编辑器:制作化学反应方程式、离子方程式、分子式、离子式等CRS:化学反应方程式配平器Model ChemLabv:化学实验教育软件及其汉化版periodic.exe:免费的元素周期表化学品电子手册:一个综合性的化学品手册19.在线综合工具Biology Workbench:基于WEB的生物学综合工具sewer:网上常用在线工具集合,本地版20.在线蛋白工具BCM Search Launcher:蛋白序列二级结构预测综合站点DAS:蛋白跨膜预测服务器、输入蛋白序列,预测跨膜区域TopPred:蛋白预测服务器提供的膜蛋白拓扑学预测在线工具SOSUI:膜蛋白分类和二级结构预测在线工具PSIpred-MEMSAT:进行二级结构预测与跨膜拓朴结构预测HMMTOP:预测蛋白序列的跨膜螺旋与拓扑结构服务器SMART:提供蛋白序列,在结构域数据库中查询/显示出其结构域及跨膜区等TMpred:预测蛋白序列跨膜区TMHMM:预测蛋白的跨膜螺旋The PredictProtein server:提供蛋白数据库查询,预测蛋白各种结构的服务SPLIT:膜蛋白二级结构预测服务器PRED-TMR:提供基于SwissProt数据库统计分析的预测蛋白跨膜片段的服务CoPreThi:基于INTERNET的JA V A程序,预测蛋白的跨膜区TMAP:提供预测蛋白跨膜片段的服务21.RNA analysisPattern Search and Discovery:巴斯德研究所提供的常用RNA在线分析工具DNA sequence analysis:巴斯德研究所提供的常用特征序列查询工具Search Genes and Coding Regions:巴斯德研究所提供的常用DNA在线分析工具Oligonucleotide Calculator:巴斯德研究所提供的基因与编码区查找工具解链温度计算器:JA V A语言写的寡核苷酸计算器,给出核酸序列,计算GC百分比、解链温度、长度、分子量。

各类生物软件汇总

各类生物软件汇总

三维分子类RASMOL 2.7.2.1 观看生物分子3D微观立体结构的软件。

非常有名,巨棒!RasTop 2.03 为RasMol 2.7.1的图形用户界面软件CHIME 2.6 SP5 直接在浏览器中观看3D分子。

MolMol 2k.2 将pdb等格式的蛋白文件通过微调,存成普通的图形文件。

CrystInfo 1.0 用来快速、容易地构建、观察与检查晶体3d结构。

PDViewer PDB格式文件的查看程序。

DS ViewerPro 5.0 trail 3维分子浏览工具。

ICMLite 2.8 3维分子浏览工具,有一些其他软件没有的功能。

VMD 1.82 3维分子浏览工具,可以进行动态显示。

CN3D 4.1 3D分子结构观察软件。

WPDB 2.2 PDB文件检索显示分析软件。

DTMM 4.1 Demo 3维分子模型显示、编辑与构建程序。

gopenmol2.32 显示并分析分子结构及其特性的软件。

POV-Ray 3.6b3 生成三维图像工具软件。

WinMegaPov 1.0 3D渲染软件POV-Ray非官方编译软件。

MolPOV 2.0.8 将PDB文件转化为POV格式文件的软件。

Mol2Mol 5.2.1Demo 分子文件格式转换软件。

PovChem 2.1.1 将PDB文件转化为POV格式文件的软件。

Ortep-3 for Windows 1.076 生成分子的热椭圆形点图软件。

PLATON1.07 通用结晶学软件工具。

Mage 6.35 读取并演示Kinemage格式文件的专用软件。

Prekin 6.35 将PDB格式文件转换为Kinemage格式文件的软件。

Swiss-PdbViewer 3.7 sp5 PDB文件显示与分析软件。

DINAMO 蛋白序列排队比较编辑与三维模型构建工具软件。

PCMolecule2 Lite 查看PDB格式文件的免费软件。

StrukEd Demo 化学分子编辑与三维模型生成软件。

常用生物数据分析软件

常用生物数据分析软件

常用生物数据分析软件生物数据分析软件是用于处理、分析和解释生物学实验中产生的大规模数据的工具。

这些软件通常具有统计分析、数据可视化和生物信息学工具等功能,它们在生物学研究、医学诊断和药物开发等领域都有广泛的应用。

本文将介绍一些常用的生物数据分析软件。

1.R:R是一种免费且开源的编程语言,它提供了丰富的生物数据分析和可视化工具,如统计分析、机器学习、生物信息学和图形绘制等。

R 语言拥有庞大的用户社区和丰富的包资源,适用于各种生物学数据分析任务。

2. Python:Python是另一种常用的编程语言,它也具备强大的生物数据分析能力。

Python拥有多个生物学数据处理和分析库,如NumPy、Pandas和BioPython等。

Python的易学性、可扩展性和广泛的应用领域使其成为生物学数据分析的首选工具之一3.MATLAB:MATLAB是一种专业的科学计算和数据可视化软件,在生物学数据分析领域有广泛的应用。

它提供了丰富的统计分析和机器学习工具包,可用于生物数据的处理、分析和建模等任务。

4.SPSS:SPSS是一种常用的统计分析软件,它具有直观的用户界面和广泛的统计分析功能。

SPSS可以对生物学数据进行描述性统计、方差分析、回归分析和聚类分析等,并生成相应的报告和图表。

5.SAS:SAS是一种专业的统计分析软件,也被广泛用于生物学数据分析。

SAS拥有强大的数据管理和数据分析功能,可用于处理和分析大规模的生物学数据集。

6. Partek Genomics Suite:Partek Genomics Suite是一种专门用于基因组学和转录组学数据分析的软件。

它提供了丰富的生物学数据分析工具和流程,可用于差异表达分析、通路分析和功能注释等任务。

7. Ingenuity Pathway Analysis (IPA):IPA是一个用于通路分析和功能注释的软件。

它能够对基因表达数据进行通路分析和功能注释,并提供生物学上下游调控网络的图形可视化。

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/dispbbs.asp?BoardID=25&ID=55356/dispbbs.asp?BoardID=25&ID=71216/dispbbs.asp?BoardID=25&ID=77035SPSS教程/dispbbs.asp?BoardID=25&ID=15195/dispbbs.asp?BoardID=25&ID=17993/dispbbs.asp?BoardID=25&ID=17994/dispbbs.asp?BoardID=25&ID=17995/dispbbs.asp?BoardID=25&ID=18223/dispbbs.asp?BoardID=25&ID=48549/dispbbs.asp?BoardID=25&ID=25584中文医学统计教程/dispbbs.asp?BoardID=25&ID=24766SPSS10教程/biology/spss/Index.shtmlSAS6.12统计教程/biology/sas/Index.shtml统计软件SAS 8.2教程/biology/sas82/Index.shtmlStata统计学教程入门/biology/stata/Index.shtml Eviews3.1使用入门教程1/biology/eview/Index.shtml软件中文使用说明书大全/service/softwares/Index.shtml ·NoteExpress初级教程(step by step)·常用生物软件简介汇总(window 版)·STATISTICA/w 5.0及其在医学中的应用·利用Excel处理统计数据·数据分析、科技绘图的必备工具-Microcal O()·Band Leader中文使用说明书·BioEdit中文使用说明书下载)·Cn3D中文说明书下载·Gel-PRO ANALYZER凝胶定量分析软件演示操作)·Gene Construction Kit中文使用手册)·aminoXpress中文使用说明书)·DNAtools中文说明书下载·综合性序列分析软件DNAStar中文使用说明书)·Reference Manager 10中文使用说明书·Genamics中文使用说明书)·Vector NTI9.0中文使用说明书)·Winplas中文使用说明书·RNA Structure 3中文使用说明书)·Primer 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4.05使用简要说明(推荐)/dispbbs.asp?BoardID=25&ID=14199 paup 4.0的说明书/dispbbs.asp?BoardID=25&ID=57387 sas教程/dispbbs.asp?BoardID=25&ID=22674 /dispbbs.asp?BoardID=25&ID=25585 /dispbbs.asp?BoardID=25&ID=55356 /dispbbs.asp?BoardID=25&ID=71216 /dispbbs.asp?BoardID=25&ID=77035 SPSS教程/dispbbs.asp?BoardID=25&ID=15195 /dispbbs.asp?BoardID=25&ID=17993 /dispbbs.asp?BoardID=25&ID=17994 /dispbbs.asp?BoardID=25&ID=17995 /dispbbs.asp?BoardID=25&ID=18223 /dispbbs.asp?BoardID=25&ID=48549 /dispbbs.asp?BoardID=25&ID=25584中文医学统计教程/dispbbs.asp?BoardID=25&ID=24766。

常用生物数据分析软件

常用生物数据分析软件

常用生物数据分析软件在生物科学领域中,数据分析是一项重要的任务。

随着技术的进步,生物学研究的数据规模不断扩大,例如基因组测序数据、蛋白质互作数据、表达谱数据等。

为了处理和分析这些大规模的生物学数据,许多生物数据分析软件被开发出来。

本文将介绍一些常用的生物数据分析软件。

1.R:R是一个流行的统计分析和图形化软件,也是生物学家常用的数据分析工具之一、R具有强大的数据分析功能和广泛的统计工具包,适用于各种生物学数据分析任务,例如基因表达分析、蛋白质结构预测、基因组测序等。

2. Python:Python是一种通用的编程语言,也被广泛用于生物数据分析。

Python拥有丰富的生物信息学工具包,例如Biopython,可用于处理和分析蛋白质序列和结构、基因组测序数据等。

Python还具有强大的数据处理和可视化能力,适用于各种生物学数据分析任务。

3. NCBI工具:NCBI(美国国家生物技术信息中心)提供一系列在线工具用于生物数据分析。

NCBI提供的工具包括BLAST用于序列比对、Entrez用于文献检索、GenBank用于基因组测序数据等。

这些工具对于进行一些常见的生物数据分析任务非常有用。

4. Bioconductor:Bioconductor是一个用于生物数据分析的开源软件包集合。

Bioconductor提供了许多R语言工具包,包括用于基因表达分析、蛋白质互作网络分析等。

这些工具包提供了丰富的生物学统计学和机器学习算法,可以帮助研究人员进行高质量的生物数据分析。

5. Cytoscape:Cytoscape是一个用于生物网络分析和可视化的软件。

它可以用来分析和可视化蛋白质互作网络、基因调控网络等。

Cytoscape提供了许多插件和工具,使得生物网络分析更加方便和高效。

6. Galaxy:Galaxy是一个用于生物数据分析的在线平台。

它提供了许多常用的生物数据分析工具,并提供了一个用户友好的界面,使得生物学家可以无需编程就能进行复杂的生物数据分析任务。

生物软件汇总

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生物软件汇总,强烈推荐!质粒绘图Plasmid Processor 1.02 绘制质粒图软件。

Plasmid Processor Pro 绘制质粒图软件,与Plasmid Processor是同一个作者。

WinPlas 2.7 demo 质粒绘图软件商业版。

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ALFmap 1.22 ALF (Amersham Pharmacia) 图像格式转换软件。

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figtreea下载教程(一)

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figtreea下载教程(一)figtreea下载教程什么是figtreeafigtreea是一款专业的数据可视化工具,适用于生物信息学、系统发育学和生态学等领域。

它提供了直观的界面和多种图形化显示方式,帮助用户更好地理解和分析数据。

下载figtreea1.打开figtreea官方网站。

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安装figtreea1.找到已下载的安装文件。

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配置figtreea1.打开已安装的figtreea软件。

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–在菜单栏中找到并点击“设置”选项。

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使用figtreea1.导入数据。

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4.导出图形。

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总结figtreea是一款功能强大的数据可视化工具,通过本教程的完整流程,您可以轻松地下载、安装、配置和使用figtreea。

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免费分子生物学软件

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(二)蛋白质分析软件(AnTheProt)
AnTheProt包括蛋白质研究领域的大多数内容,功能非常强大。应用此软件包,使用个人电脑,便能进行各种蛋白质序列分析与特性预测,包括:进行蛋白质序列二级结构预测;在蛋白质序列中查找符合PROSITES数据库的特征序列;绘制出蛋白质序列的所有理化特性曲线;在互联网或本地蛋白质序列数据库中查找类似序列;计算蛋白质序列相对分子质量,计算蛋白质序列滴定曲线与等电点及计算信号肽潜在的断裂位点等许多功能。网址为:http://www.ibcp.fro
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互联网上有许多免费分子生物学软件,一些是在线使用的,也有一些可以下载在PC机上使用。
(一)质粒作图软件(P1asmidProcessor)
PlasmidProcessor是一种免费绘制质粒图软件,可以绘制线状或环状DNA。用户定义限制位点、基因段与多克隆位点,还可插入或删除DNA片段,支持剪贴板、打印和存盘功能。下载站点:http://u.fi/_kiviraum/plasmid/plasmid.html。
(九)进化树生成与分析软件(PHYLIP)
PHYLIP用来进行进化树分析。它可以分析DNA与蛋白质序列,并可绘制进化树。
程序含有许多选项可以精确控制与分析。下载网站地址为:http:///phylip.html。
(十)进化树打印软件(TreeView)
(五)序列格式转换软件(Forቤተ መጻሕፍቲ ባይዱon)
ForCon是核酸与蛋白质不同序列格式文件的转换软件,可双向转换各种常见的多序列格式文件。下载站点为:http://bioc-www.Uia.ac.be/u/jraes。
(六)序列格式转换软件(SeqVerter)
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常用生物绘图软件下载
导语:
在很多生物教材中的插图大多采用了彩色图片,使教材显得更丰富多彩。

作为传播学习信息的一种重要媒介,生物示意图已不再是可有可无的点缀,而是表达学习内容和学习方法的重要部分。

那这些生动的示意图是怎么绘制的呢?
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有什么好用的生物绘图软件?
好用的生物绘图软件,推荐亿图图示。

亿图软件画生物图,可直接使用软件内置丰富的动物细胞和植物细胞相关图形符号,也可以参考软件内的生物模板。

若软件内素材没有合适的,也可以使用画笔自己绘制。

不用担心的是,亿图软件操作十分简单,相比ps类工具,极易上手。

绘制好的图形素材还可以加入素材库,日后可以直接选用。

软件支持导出PPT、Word、JPG、PDF等十多种格式保存,可在Windows、Linux、Mac多平台操作。

系统要求
Windows 2000, Windows XP, Windows 2003, Windows Vista, Windows 7,Windows 8, Windows 10
Mac OS X 10.10 +
Linux Debian, Ubuntu, Fedora, CentOS, OpenSUSE, Mint, Knoppix, RedHat, Gentoo及更多
亿图软件绘制“生物细胞示意图”的特点
1.时尚的主题:亿图图示为用户提供多样的背景模板,挑选喜欢的模板类型,
让示意图增加趣味性。

2.用户体验:拖拽式操作,自动对齐功能,让你的操作体验更加流畅。

3.云存储服务:绘制完成的模型图,可以保存在云端,再也不担心重要的数据
图表丢失。

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5.文件恢复:当电脑不小心重启或者死机,软件自带文件恢复功能让您放心绘
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丰富的图形符号库助你快速绘制生物细胞示意图
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