2019_2020学年高中生物课时分层作业3孟德尔的豌豆杂交实验2第1课时含解析新人教版必修2
课时分层作业(三)
(建议用时：35分钟)
[合格基础练]
1．让独立遗传的黄色非甜玉米YYSS与白色甜玉米yyss杂交，得F1，F1自交得F2，在F2中得到白色甜玉米80株，那么F2中表现型不同于双亲的杂合植株应约为( ) A．160 B．240
C．320 D．480
C[黄色非甜玉米YYSS与白色甜玉米yyss杂交，得F1，F1自交得F2，F2中黄色非甜玉米∶黄色甜玉米∶白色非甜玉米∶白色甜玉米＝9∶3∶3∶1，白色甜玉米占1/16共有80株，F2中表现型不同于双亲的杂合子植株(2/16Yyss，2/16yySs)占4/16，所以共有320株，选C。] 2．一个遗传因子组成为AaBb的高等植物自交，下列叙述中错误的是( )
A．产生的雌雄配子种类和数量都相同
B．子代中共有9种不同的遗传因子组成
C．雌雄配子的结合是随机的
D．子代的4种表现类型之比为9∶3∶3∶1
A[雄配子的数量远多于雌配子的数量。]
3．具有两对相对性状的纯合子杂交，按自由组合定律遗传，在F2中能够稳定遗传的个体数占( )
A．1/16 B．2/16
C．3/16 D．1/4
D[具有两对相对性状的纯合子杂交实验中，F2个体中的纯合子有4种，其概率均为1/16。]
4．孟德尔用豌豆做两对相对性状的遗传实验不必考虑的是( )
A．亲本的双方都必须是纯合子
B．两对相对性状各自要有显隐性关系
C．对母本去雄，授以父本花粉
D．显性亲本作父本，隐性亲本作母本
D[孟德尔的豌豆杂交实验正反交的结果是一样的。]
5．南瓜所结果实中白色(A)对黄色(a)为显性，盘状(B)对球状(b)为显性，两对基因独立遗传。若让基因型为AaBb的白色盘状南瓜与“某南瓜”杂交，子代表现型及其比例如图所示，则“某南瓜”的基因型为( )
A．AaBb B．Aabb
C．aaBb D．aabb
B[P：AaBbד某南瓜”，将两对相对性状分开考虑，根据子代表现型倒推双亲的基因
型。从题图可看出，F1中白色∶黄色＝3∶1，盘状∶球状＝1∶1，所以“某南瓜”的基因型为
Aabb。]
6.已知豌豆某两对相对性状按照自由组合定律遗传，其子代遗传因子组成类型及比例如
右图，则双亲的遗传因子组成类型是( )
A．AABB×AABb
B．AaBb×AaBb
C．AABb×AaBb
D．AaBB×AABb
C[由子代中AA∶Aa＝1∶1，可推知亲代为AA×Aa；由子代中BB∶Bb∶bb＝1∶2∶1，
可推知亲代为Bb×Bb，故双亲的遗传因子组成类型为AABb×AaBb。]
7．下表是具有两对相对性状的亲本杂交得到的子二代的遗传因子组成，其中部分遗传因
子组成并未列出，而仅用阿拉伯数字表示。下列叙述错误的是( )
雌配子
YR Yr yR yr 雄配子
YR ①③YyRR YyRr
Yr YYRr YYrr ④Yyrr
yR ②YyRr yyRR yyRr
yr YyRr Yyrr yyRr yyrr
A
B．在此表格中，YYRR只出现一次
C．在此表格中，YyRr共出现4次
D．遗传因子组成出现概率的大小顺序为④>③>②>①
D[在孟德尔两对相对性状的杂交实验中，F1产生的雌、雄配子各4种，随机组合共有16种：“双杂”占4/16；“单杂”4种，各占2/16；“纯合子”4种，各占1/16。] 8．以黄色皱粒(YYrr)与绿色圆粒(yyRR)的豌豆作亲本进行杂交，F1植株自花传粉，从F1植株上所结的种子中任取1粒绿色圆粒和1粒绿色皱粒的种子，这两粒种子都是纯合子的概率为( )
A．1/3 B．1/4
C．1/9 D．1/16
A[根据题意，F1植株的遗传因子组成类型为YyRr，则F2中绿色圆粒占3/16，其中纯合子占F2的1/16，则任取1粒绿色圆粒种子，是纯合子的概率为1/3，而绿色皱粒种子一定是纯合子，所以这两粒种子都是纯合子的概率为1/3×1＝1/3，故A正确。] 9．遗传因子组成为AAbbCC与aaBBcc的小麦进行杂交，这三对遗传因子的遗传遵循自由组合定律，F1杂种形成的配子种类数及其自交后代(F2)的遗传因子组成种类数分别是( ) A．4和9 B．4和27
C．8和27 D．32和81
C[F1的基因型为AaBbCc，该个体形成配子的种类数为2(A、a)×2(B、b)×2(C、c)＝8(种)。自交后代(F2)的遗传因子组成种类数为3×3×3＝27(种)。]
10．孟德尔用豌豆做两对相对性状的遗传实验时，不必考虑的是( )
A．亲本双方都必须是纯合子
B．两对相对性状各自要有显隐性关系
C．对母本去雄，授以父本花粉
D．显性亲本为父本，隐性亲本为母本
D[做两对相对性状的遗传实验时，要求是纯合亲本杂交。两对相对性状中每一对相对性状的遗传都遵循分离定律，即两对相对性状各自有显隐性关系。以豌豆为实验材料，为避免自然条件下的自花传粉，要对母本去雄，授以父本的花粉。正交和反交的结果都一样，所以不需要考虑显性亲本为父本，隐性亲本为母本。]
11．玉米是雌雄同株的植物，顶生雄花序，侧生雌花序，已知玉米的高秆(D)对矮秆(d)为显性，抗病(R)对易感病(r)为显性，控制上述两对相对性状的遗传因子独立遗传，现有两个纯合的玉米品种甲(DDRR)和乙(ddrr)，试根据图示分析回答：
图1 图2
(1)玉米的一对遗传因子R、r的遗传遵循__________定律，欲将甲、乙杂交，其具体做法是________________。
(2)将图1中F1与另一玉米品种丙杂交，后代的表现型及比例如图2所示，则丙的遗传因子组成为________。
(3)已知玉米高秆植株易倒伏。为获得符合生产要求且能稳定遗传的新品种，按照图1所示过程得到F2后，对植株进行____________处理，选出性状组合为______________的植株，再通过多次自交并不断选择获得所需的新品种。
(4)科研人员在统计实验田中成熟玉米植株的存活率时发现，易感病植株存活率是1/2，高秆植株存活率是2/3，其他植株的存活率是1，据此得出图1中F2成熟植株性状组合有______________种，比例为________________(不论顺序)。
[解析](1)控制一对相对性状的遗传因子的遗传遵循分离定律。因玉米是单性花，欲将甲、乙杂交，所以无须去雄，只要对雌、雄花分别进行套袋处理，待花蕊成熟后，将甲(乙)的花粉撒在乙(甲)的雌蕊上，再套上纸袋。(2)由图1可知，F1的遗传因子组成为DdRr，根据图2可知，F1与品种丙杂交，其子代中高秆∶矮秆＝1∶1，抗病∶易感病＝3∶1，由此推知，亲本遗传因子组合为DdRr×ddRr，因此丙的遗传因子组成为ddRr。(3)为获得符合生产要求且能稳定遗传的新品种，即矮秆抗病纯合子，可对F2植株进行病原体感染处理，然后选出矮秆抗病植株，再通过多次自交并不断选择获得所需的新品种。(4)根据题意可知，易感病植株存活率是1/2，高秆植株存活率是2/3，其他性状的植株存活率是1，据此得出图1中F2成熟植株性状组合有4种，它们分别为高秆抗病、矮秆抗病、高秆易感病、矮秆易感病，比例为[(9/16)×(2/3)]∶(3/16)∶[(3/16)×(2/3)×(1/2)]∶[(1/16)×(1/2)]＝12∶6∶2∶1。
[答案] (1)分离对雌、雄花分别套袋处理，待花蕊成熟后，将甲(乙)的花粉撒在乙(甲)的雌蕊上，再套上纸袋(2)ddRr (3)病原体感染矮秆抗病(4)4 12∶6∶2∶1(其他顺
序也可)
12．南瓜的果实形状有球形(球甲和球乙)、扁形和长形4种，受两对等位基因A、a和B、b控制，两对等位基因独立遗传。现将两纯种球形果实的南瓜进行杂交，结果如图，请分析回答：
(1)纯种球形南瓜甲和乙的基因型是________和________。
(2)F1扁形南瓜产生配子的种类是______________。
(3)F2球形南瓜中杂合子的基因型是______________。
(4)从F2可知，当基因________存在时，就表现为扁形果实。
[解析](1)F2性状分离比为9∶6∶1，说明F1扁形南瓜的基因型为AaBb，则纯种球形南瓜甲和乙的基因型为AAbb和aaBB。(2)F1的基因型为AaBb，产生的配子的基因型为AB、Ab、aB、ab。(3)F2球形南瓜的基因型为A_bb、aaB_，其中杂合子基因型是Aabb、aaBb。(4)从F2可知，当基因A和B存在时，南瓜就表现为扁形果实，A和B都不存在时南瓜表现为长形果实，只存在A或只存在B时南瓜表现为球形果实。
[答案] (1)AAbb aaBB (2)AB、Ab、aB、ab
(3)Aabb、aaBb(缺一不可) (4)A和B
[等级过关练]
13．番茄高茎(T)对矮茎(t)为显性，圆形果实(S)对梨形果实(s)为显性(控制两对相对性状的遗传因子独立遗传)。现将一株性状表现为高茎圆形果植株的花粉授给另一株性状表现相同的植株，所得子代性状表现及比例是高茎∶矮茎＝3∶1，圆形果实∶梨形果实＝3∶1。根据以上实验结果，判断下列叙述不正确的是( )
A．上述亲本产生的子代的性状表现有4种
B．上述亲本产生的子代的遗传因子组成有9种
C．以上两株亲本可以分别通过不同杂交组合获得
D．以上两株性状表现相同的亲本，遗传因子组成不相同
D[先利用分离定律分析每一对相对性状的遗传情况。由题中高茎(显)∶矮茎(隐)＝3∶1，得出亲本的相应遗传因子组成均为Tt。由圆形果实(显)∶梨形果实(隐)＝3∶1，得出
亲本的相应遗传因子组成均为Ss，所以两亲本的遗传因子组成均为TtSs，其子代中性状表现有4种，遗传因子组成有9种。两株亲本可以通过TTSS×ttss和ttSS×TTss两种杂交组合获得。]
14．某种蛙眼色的表现型与基因型的对应关系如下表(两对基因独立遗传)：
11
( )
A．3∶1 B．3∶2
C．9∶7 D．13∶3
A[蓝眼蛙(A_B_)与紫眼蛙(aaB_)杂交，F1有蓝眼(A_B_)和绿眼(A_bb、aabb)两种表现型，据此推断亲本蓝眼蛙的基因型为AABb，紫眼蛙的基因型为aaBb。AABb×aaBb后代的表现型及比例为AaB_(蓝眼蛙)∶Aabb(绿眼蛙)＝3∶1。]
15．豌豆高茎对矮茎为显性，圆粒对皱粒为显性，控制这两对相对性状的基因分别位于两对同源染色体上。高茎豌豆产量更高，皱粒豌豆味道更甜美。现有高茎圆粒和矮茎皱粒两个纯合豌豆品种，某实验基地欲通过传统杂交育种方法培育出高茎皱粒新品种。以下是该实验基地设计的育种计划，请将该计划补充完整：
(1)第一年：
a．将两个纯合品种的豌豆种子分别种植在不同地块上，获得亲本植株；
b．以高茎圆粒豌豆为母本，在自花传粉前对母本进行________和套袋，在适宜时期取矮茎皱粒豌豆花粉对母本进行人工授粉；
c．收获F1种子。
(2)第二年：
a．种植F1种子，获得F1植株。任其自交，收获F2种子；b.保留F2种子中的________。
(3)第三年：
a．种植上年选出的F2种子，获得F2植株；
b．保留F2植株中的________，该植株占当年植株总数的________。
c．任其自交，单独收获每株F2上的F3种子，获得多份F3种子。这些F3种子共有________种基因型。
(4)第四年：
a．__________________________，获得F3植株；
b．任其自交产生F4种子，从不发生性状分离的地块的植株上获得所需纯种。
[解析]根据该同学的实验方案可以看出，该同学利用了杂交育种的方法；设两对性状分别受A、a和B、b控制。先让高茎圆粒和矮茎皱粒两个纯合豌豆品种杂交获得子一代双杂
合子高茎圆粒(AaBb)，再让子一代逐代自交，选择每一代的高茎皱粒(A_bb)，直到不再发生性状分离。(1)第一年：豌豆是严格的自花传粉的植物，为避免其自花传粉，所以自花传粉前需对高茎的母本进行人工去雄和套袋处理。(2)第二年：种植F1种子，后代发生了性状分离，保留F2种子中的皱粒种子(bb)。(3)第三年：种植上年选出的F2种子中的皱粒种子，获得F2植株；保留F2植株中的高茎植株，基因型为A_bb，该植株占当年植株总数的3/4。F2自交，后代基因型有3种，分别是AAbb、Aabb、aabb。(4)第四年：在不同地块上单独种植每株F2上的F3种子，获得F3植株；再自交产生F4种子，从不发生性状分离的地块的植株上获得所需纯种。
[答案] (1)人工去雄(或去雄) (2)皱粒种子(3)高茎植株3/4 3 (4)在不同地块上单独种植每株F2上的F3种子
生物信息学作业
生物信息学试题 1、构建分子系统树得主要方法有哪些？并简要说明构建分子进化树 得一般步骤。（20分） 答：（1）构建进化树得方法包括两种：一类就是序列类似性比较，主要就是基于氨基酸相对突变率矩阵（常用PAM250）计算不同序列差异性积分作为它们得差异性量度（序列进化树）；另一类在难以通过序列比较构建序列进化树得情况下，通过蛋白质结构比较包括刚体结构叠合与多结构特征比较等方法建立结构进化树 (2)序列比对——选取所需序列——软件绘制 具体如下： a测序获取序列或者在NCBI上搜索所需得目得序列 b在NCBI上做blast：比对相似度较高得基因，并以fast格式下载，整合在*txt文档中。 c比对序列，比对序列转化成*meg格式 d打开保存得*meg格式文件，构建系统进化树 2、氨基酸序列打分矩阵PAM与BLOSUM中序号有什么意义？它们各自 得规律就是什么？（10分） （1）PAM矩阵：基于进化得点突变模型，如果两种氨基酸替换频繁，说明自然界接受这种替换，那么这对氨基酸替换得分就高。一个PAM就就是一个进化得变异单位, 即1%得氨基酸改变。 BLOSUM矩阵：首先寻找氨基酸模式，即有意义得一段氨基酸片断，分别比较相同得氨基酸模式之间氨基酸得保守性（某种氨基酸对另一种氨基酸得取代数据），然后，以所有60％保守性得氨基酸模式之间得比较数据为根据，产生BLOSUM60；以所有80％保守性得氨基酸模式之间得比较数据为根据，产生BLOSUM80。
（2）PAM用于家族内成员相比，然后把所有家族中对某种氨基酸得比较结果加与在一起，产生“取代”数据（PAM-1 ）；PAM-1自乘n次，得PAM-n。 PAM-n中，n 越小，表示氨基酸变异得可能性越小；相似得序列之间比较应该选用n值小得矩阵，不太相似得序列之间比较应该选用n值大得矩阵。PAM-250用于约 20%相同序列之间得比较。 BLOSUM-n中，n越小，表示氨基酸相似得可能性越小；相似得序列之间比较应该选用 n 值大得矩阵，不太相似得序列之间比较应该选用n值小得矩阵。BLOSUM-62用来比较62％相似度得序列，BLOSUM-80用来比较80％左右得序列。 3、蛋白质三维结构预测得主要方法有哪些？试选择其中得一种方 法，说明蛋白质三维结构预测得一般步骤。（10分） （1） a同源建模（序列相似性低于30%得蛋白质难以得到理想得结构模型 b折叠识别(已知结模板得序列一致率小于25%) c从头预测得方法(无已知结构蛋白质模板)。 （2） 4、您所熟悉得生物信息学软件有哪些？请选择其中得至少一种软 件，结合自己得研究课题，谈谈您所选择软件得基本原理，使用
BioEdit实验报告
生物信息学引论实验课报告（3） 一、实验目的与要求 1、熟悉使用BioEdit软件基于核酸序列比对分析的真核基因结构分析； 2、熟悉使用BioEdit软件进行核酸序列的点突变定位； 二、实验内容 （一）使用BioEdit软件进行序列分析（选取一种数据）； （二） 1. 人瘦素(leptin) 基因编码区点突变408 A→C的定位：打开BioEdit软件→将人瘦素(leptin) mRNA的FASTA格式序列输入分析框→点击左侧序列说明框中的序列说明→点击Sequence栏→选择Nucleic Acid→点击Find next O RF→从起始密码ATG的第一个碱基开始查找该基因编码区408（464，NM_000230）位碱基（A）； 2. 人瘦素(leptin) 基因编码区点突变408 A→C的限制酶切点分析：再点击Sequence栏→选择Nucleic Acid→点击Restriction M ap→点击Generate Map按钮→找到该基因编码区408（464，NM_000230）位碱基后可见该位置有限制酶Hind III 的切点（AAGCTT）；（提示：如发生408 A→C突变，则该酶切点消失）； 3. 人瘦素(leptin) 基因编码区点突变408 A→C分析的引物设计：调用Internet浏览器并在其地址栏输入primer3网址（https://www.360docs.net/doc/5815659444.html,/cgi-bin/primer/primer3.cgi）→用复制/粘贴方式将人瘦素(leptin) mRNA（NM_000230）的FASTA格式序列输入分析框→在targets框填入464，1→选择Product Size (~300 bp)和Primer Tm (~58.0) →点击Pick Primesr按钮→从显示的五队引物中选择合适的引物； 4. 人瘦素(leptin) mRNA定量的引物设计：方法同“3. 人瘦素(leptin) 基因编码区点突变408 A→C分析的引物设计”，但在targets框将突变点位置改为外显子交会点位置，另外Product Size 一般选择~150 bp。
生物信息学作业1实验2
上海师范大学实验报告 实验二 一、实验原理 答：利用Blast全球联网数据库，对输入的序列进行生物信息学分析，给出与输入序列相关性最大的对应的基因信息，比较两者的同源性。 二、操作步骤 答：（1）先打开网址https://www.360docs.net/doc/5815659444.html,/ （2）点击右边的Blast链接，打开Blast数据库，进入Blast界面 （3）在Basic Blast中选择nucleotide blast （4）在对话框中输入核苷酸序列，在choose search set下的Database选项中选择Others (nr etc.) （5）把网页拉到最下方，点击Blast按钮 （6）在Descriptions 栏下找到Max ident 百分率最高的序列名称 （7）再往下拉，找到Alignments项下第一个序列，可以找到输入序列相关信息 （8）点击Accession，即能找到更多输入序列的相关信息。 1. tttcactcca tagttactcc ccaggtga 1.1它属于哪类生物? 答：属于Hepatitis C virus （丙型肝炎病毒） 1.2它属于哪类基因？ 答：属于non-structural protein 5B gene 1.3它在该基因的什么位置？ 答：它在该基因的第749-776这个位置。 1.4它与你搜索到的序列的同源性（Identities）是多少？ 答：同源性100% 2．（1）ccacccactg aaactgcaca gacaaatttg tacataagag 1.1它属于哪类生物? 答：属于Influenza A virus (A/chicken/Iran261/01(H9N2)) hemagglutinin (HA) gene （A型流感病毒，A型伊朗型261鸡流感病毒，H9N2病毒，血细胞凝集素抗原基因为依据） 1.2它属于哪类基因？ 答：属于ssRNA negative-strand viruses Orthomyxoviridae （单链RNA，负义链病毒，正粘病毒科） 1.3它在该基因的什么位置？ 答：它在该基因的第1-40这个位置 1.4它与你搜索到的序列的同源性（Identities）是多少？
生物信息学专业实习总结范文
《浙江大学优秀实习总结汇编》 生物信息学岗位工作实习期总结 转眼之间，两个月的实习期即将结束，回顾这两个月的实习工作，感触很深，收获颇丰。这两个月，在领导和同事们的悉心关怀和指导下，通过我自身的不懈努力，我学到了人生难得的工作经验和社会见识。我将从以下几个方面总结生物信息学岗位工作实习这段时间自己体会和心得： 一、努力学习，理论结合实践，不断提高自身工作能力。 在生物信息学岗位工作的实习过程中，我始终把学习作为获得新知识、掌握方法、提高能力、解决问题的一条重要途径和方法，切实做到用理论武装头脑、指导实践、推动工作。思想上积极进取，积极的把自己现有的知识用于社会实践中，在实践中也才能检验知识的有用性。在这两个月的实习工作中给我最大的感触就是：我们在学校学到了很多的理论知识，但很少用于社会实践中，这样理论和实践就大大的脱节了，以至于在以后的学习和生活中找不到方向，无法学以致用。同时，在工作中不断的学习也是弥补自己的不足的有效方式。信息时代，瞬息万变，社会在变化，人也在变化，所以你一天不学习，你就会落伍。通过这两个月的实习，并结合生物信息学岗位工作的实际情况，认真学习的生物信息学岗位工作各项政策制度、管理制度和工作条例，使工作中的困难有了最有力地解决武器。通过这些工作条例的学习使我进一步加深了对各项工作的理解，可以求真务实的开展各项工作。 二、围绕工作，突出重点，尽心尽力履行职责。 在生物信息学岗位工作中我都本着认真负责的态度去对待每项工作。虽然开始由于经验不足和认识不够，觉得在生物信息学岗位工作中找不到事情做，不能得到锻炼的目的，但我迅速从自身出发寻找原因，和同事交流，认识到自己的不足，以至于迅速的转变自己的角色和工作定位。为使自己尽快熟悉工作，进入角色，我一方面抓紧时间查看相关资料，熟悉自己的工作职责，另一方面我虚心向领导、同事请教使自己对生物信息学岗位工作的情况有了一个比较系统、全面的认知和了解。根据生物信息学岗位工作的实际情况，结合自身的优势，把握工作
孟德尔豌豆杂交实验(一)题型分析
第1章遗传的因子的发现第1节孟德尔的豌豆杂交实验（一）一、相对性状的判断 判断依据是必须为同种生物，同一性状的不同的表现类型 1.下列不属于相对性状的是（） A．兔的白毛与黑毛 B．人的体重与身高 C．豌豆的红花与白花 D．水稻的糯性与非糯性 2.下列各组生物性状中属于相对性状的是( ) A．番茄的红果和圆果 B．水稻的早熟和晚熟 C．绵羊的长毛和细毛 D．棉花的短绒和粗绒 3、下列各对性状中，属于相对性状的是（） A．狗的长毛与卷毛 B．棉花的掌状叶和鸡脚叶 C．玉米叶梢的紫色和叶片的绿色 D．豌豆的高茎和蚕豆的矮茎 二、实验材料的选择 1、豌豆作为实验材料的优点：（1）自花传粉，闭花受粉（避免了外来花粉的干扰），自 然状态下为纯种（2）具有稳定的易于区分的性状 2、人工授粉的过程：去雄（未成熟的母本）→套袋→人工受粉→套袋 1.豌豆在自然状态下为纯种的原因是( ) A．豌豆品种间性状差异大 B．豌豆先开花后受粉 C．豌豆是自花传粉、闭花受粉的植物 D．豌豆是自花传粉的植物 2.孟德尔选用豌豆作为遗传实验材料的理由是( ) ①豌豆是闭花受粉植物；②豌豆在自然状态下一般是纯种；③用豌豆作实验材料 有直接经济价值；④各品种间具有一些稳定的、差异较大而且容易区分的性状 A．①②③④ B．①② C．①②④ D．②③④ 3.利用豌豆进行杂交实验，下列相关操作及其目的叙述，存在错误的是（） A．花成熟后对母本进行去雄处理→防止自花传粉 B．去雄后进行套袋处理→避免外来花粉的干扰 C．人工授粉→进行杂交 D．授粉后继续进行套袋处理→避免外来花粉的干扰 4.在孟德尔的豌豆杂交实验中，必须对母本采取的措施是（） ①开花前人工去雄②开花后人工去雄③去雄后自然授粉 ④去雄后人工授粉⑤授粉后套袋隔离⑥授粉后自然发育 A．①③B．②④⑥C．①③⑥D．①④⑤ 三、配子的种类 有性生殖的生物可产生雌雄两种配子，即卵细胞和精子。就雌雄配子的数量而言，一般雄配子的数目远大于雌配子，即精子远比卵细胞多，就配子的类型而言，每个配子只含一对遗传因子中的一个，例如DD个体产生的配子为D型，dd个体产生的配子为d型，Dd个体则能产生2种类型的配子，即D型和d型，且D:d=1:1 1.遗传因子组成为Aa的豌豆自交过程中产生的配子情况如下，正确的是（） A．雌配子∶雄配子=1∶1 B．雌配子∶雄配子=1∶4 C．AA∶aa=1∶1 D．A∶a=1∶1 2.遗传组成为Aa的杂合子豚鼠，一次产生了100万个精子，产生精子的类型及其中含有隐性遗传因子的精子数目为（） A． A或a两种类型；50万个 B．仅含A一种类型；0个 C． AA和aa两种类型；50万个 D. 仅含a一种类型；100万个 3.下列为一对相对性状的杂交实验中性状分离现象的假设性解释，其中叙述错误的是( ) A．生物的性状是由细胞中的遗传因子决定的 B．体细胞中的遗传因子成对存在，互不融合 C．在配子中只含有每对遗传因子中的一个
生物信息学课程作业
生物信息学作业 1. Align the leghemoglobin protein from soy bean and myoglobin from human with global and local alignment software (ex. needle and water) respectively and interpret the results. ANSWER: (1)Use Needle to Align the two sequence： Aligned_sequences: 2 # 1: CAA38024.1 # 2: NP_001157488.1 # Matrix: EBLOSUM62 # Gap_penalty: 10.0 # Extend_penalty: 0.5 # Length: 203 # Identity: 43/203 (21.2%) # Similarity: 58/203 (28.6%) # Gaps: 90/203 (44.3%) # Score: 30.0 (2)Use Water to Align the two sequence： Aligned_sequences: 2 # 1: CAA38024.1 # 2: NP_001157488.1 # Matrix: EBLOSUM62 # Gap_penalty: 14 # Extend_penalty: 4 # Length: 32 # Identity: 11/32 (34.4%) # Similarity: 15/32 (46.9%) # Gaps: 0/32 ( 0.0%) # Score: 35 两种软件虽然使用同一罚分标准但得分不同。因为Needle程序实现标准pairwise全局比对，而Water则是局部比对。全局比对因为是比对全长序列，所以空位罚分多，得分较局部比对低。
生物信息学实验指导书_新版本
生物信息学 实验指导书 重庆邮电大学
生物信息学实验指导书生物信息教学部谭军编 重庆邮电大学生物信息学院
前言 生物信息学是上世纪90年代初人类基因组计划(HGP)依赖，随着基因组学、蛋白组学等新兴学科的建立，逐渐发展起来的生物学、数学和计算机信息科学的一门交叉应用学科。目前生物信息学的研究领域主要包括基于生物序列数据的整理和注释、生物信息挖掘工具开发及利用这些工具揭示生物学基础理论知识等领域。生物信息学作为新型交叉应用学科，可以依托本校已有的计算机科学、信息学、生物学和数学等学科优势，充分展现投入少、见效快、起点高的特色，推动学校学科建设和本科教学水平。 本实验指导书中的8个实验均设计为综合性开发实验，面向生物信息学院全体本科学生和研究生，以及全校对生物信息学感兴趣的其他专业学生开放。生物信息学实验室将提供系统的保障，包括采用mail服务器和linux帐号管理等进行实验过程管理和支持。限选《生物信息学及实验》的生物技术专业本科生至少选择其中5个实验，并不少于8个学时，即为课程要求的0.5个学分。其他选修者按照课时和学校相关规定计算创新学分。
实验一熟悉生物信息学网站及其数据的 生物学意义 实验目的： 培养学生利用互联网资源获取生物信息学研究前沿和相关数据的能力，熟悉生物信息学相关的一些重要国内外网站，及其核酸序列、蛋白质序列及代谢途径等功能相关数据库，学会下载生物相关的信息数据，了解不同的数据文件格式和其中重要的生物学意义。 实验原理： 利用互联网资源检索相关的国内外生物信息学相关网站，如：NCBI、SANGER、TIGR、KEGG、SWISSPORT、Ensemble、中科院北京基因组研究所、北大生物信息学中心等，下载其中相关的数据，如fasta、genbank格式的核算和蛋白质序列、pathway等数据，理解其重要的生物学意义。 实验内容： 1.浏览和搜索至少10个国外和至少5个国内生物信息学相关网站，并描 述网站特征； 2.下载各网站的代表性数据各10条（组）以上，并说明其生物学意义； 3.讨论各网站适合做何种生物信息学研究的平台，并设计一个研究设想。 实验报告： 1.各网站网址及特征描述； 2.代表性数据的下载和生物学意义的描述； 3.讨论：这些生物信息学相关网站的信息资源，可以被那些生物信息学 研究所利用。 参考书目： 《生物信息学概论》罗静初等译，北京大学出版社， 2002； 《生物信息学手册》郝柏林等著，上海科技出版社， 2004； 《生物信息学实验指导》胡松年等著，浙江大学出版社， 2003。
孟德尔豌豆杂交实验一教案
第一章第1节孟德尔的豌豆杂文实验（一） 一、教材分析： 孟德尔的豌豆杂交实验（一）是人教版必修2《遗传和进化》的第一章遗传因子发现中的第一节内容，由“一对相对性状的杂交实验”，“对分离现象的解释”，“对分离现象的解释的验证”和“分离定律”四部分内容构成。本节的教学内容是以孟德尔发现遗传因子的实验过程为主线，突出科学史和科学研究方法的教育。教材中以问题为线索，引导学生思考、分析孟德尔遗传实验的科学方法，达到阐明分离定律，最终能够运用分离定律解释一些遗传现象的教学目标。教材用科学方法教育统领了教学全过程，学生在分析实验的过程中，体验“假说—演绎法”这一科学研究的一般过程，体验孟德尔敢于质疑、敢于创新、勇于实践以及严谨、求实的科学态度和科学精神 二、教学目标 ⑴知识方面：阐明孟德尔的一对相对性状的杂交实验及分离定律。 ⑵情感态度与价值观方面：体验孟德尔遗传实验的科学方法和创新思维。 ⑶能力方面：运用分离定律解释一些遗传现象。 三、教学重点难点 1、教学重点（1）对分离现象的解释，阐明分离定律。 （2）以孟德尔的遗传实验为素材进行科学方法教育。 （3）运用分离定律解释一些遗传现象。 2、教学难点（1）对分离现象的解释。（2）对分离定律的理解。（3）假说—演绎法。 四、学情分析：学生在初中已经学习了“基因控制生物性状”和“基因的显性和隐性”等知识，初步了解了基因与生物个体性状的关系、控制相对性状的成对基因之间的关系以及为什么具有相对性状差异的双亲，后代会有复杂的表现等问题，对本节课的学习有一定的帮助。 五、教学方法 1．学案导学：见后面的学案。 2．．新授课教学基本环节：预习检查、总结疑惑→情境导入、展示目标→合作探究、精讲点拨→反思总结、当堂检测→发导学案、布置预习 六、课前准备 布置学生在课前通过上网、查报纸杂志等途径收集与孟德尔的豌豆杂交实验有关的资料。 七、课时安排：1课时 八、教学过程 (一)预习检查、总结疑惑 检查落实了学生的预习情况并了解了学生的疑惑，使教学具有了针对性。 （二）情景导入、展示目标。 ①介绍遗传规律的例子 ②介绍遗传现象与孟德尔 （三）合作探究、精讲点拨。 ［思考］：为什么用豌豆做遗传实验容易取得成功？ （1）豌豆花的结构 （2）名词：自花传粉异花传粉父本母本去雄 1、性状与相对性状
(完整版)孟德尔的豌豆杂交实验(一)知识点分析
孟德尔的豌豆杂交实验（一）知识点分析 理解课文： 1 、你认识豌豆花的结构吗？ (1)生物性状由遗传因子决定。遗传因子不相融合也不消失。 (2)体细胞中遗传因子成对存在。 (3)形成生殖细胞时，成对的遗传因子彼此分离 （4）雌雄配子结合的几率是随机均等的。 遗传因子组成相同的个体叫做______ 遗传因子组成不同的个体叫做______ 纯合子杂合子成对体细胞中遗传因子是______ 存在的纯种高茎豌有成对的高茎遗传因子（DD ）， 纯种矮茎豌豆有成对的矮茎遗传因子（dd ）。 F1自交的后代出现隐性性状，所以在F1细胞 中必然含有隐性遗传因子；而F1表现的显性 性状，因此F1体细胞中遗传因子应该是Dd
在生物的体细胞中，控制同一性状的遗传因子成对存在，不相融合；在形成配子时，成对的遗传因子发生分离，分离后的遗传因子分别进入不同的配子中，随配子遗传给后代。 拓展视野、解题技巧： 一、基因分离定律的适用范围 1.有性生殖生物的性状遗传。 有性生殖生物产生有性生殖细胞的减数分裂特有的行为。 2.真核生物的性状遗传。 3.细胞核遗传。 物质数目不稳定，遵循细胞质母系遗传规律。 4.一对相对性状的遗传。 围的局限性。 二、基因分离定律的解题点拨
掌握最基本的六种杂交组合： ②DD×dd→Dd（全为显性） ③DD×Dd→DD∶Dd＝1∶1（全为显性） ④Dd×Dd→(1DD、2Dd)∶1dd＝3∶1（显性：隐性=3：1） ⑤Dd×dd→Dd∶dd＝1∶1（显性：隐性=1：1） ⑥dd×dd→dd（全为隐性） 分离定律的习题主要有两类：一是正推类型；二是逆推类型。常见解题方法有隐性纯合突破法、根据后代分离比解题法。 1. 隐性纯合突破法： 即根据隐性性状个体的遗传因子型，比如白化病患者一定为aa，可推出他的双亲一定各含有一个a遗传因子，然后再根据其他条件推出双亲的完整遗传因子型。 2. 根据后代分离比解题法： 根据后代的分离比直接推知亲代的基因型与表现型： ①若后代性状分离比为显性：隐性=3：1，则双亲一定是杂合子。 ②若后代性状分离比为显性：隐性=1：1，则双亲一定是测交类型。 ③若后代性状只有显性性状，则双亲至少有一方为显性纯合子。 ④若后代性状只有隐性性状，则双亲都为隐性纯合子。 3.配子的确定 Aa形成两种配子A和a。 ②一对相同基因只形成一种配子。如AA形成配子A；aa形成配子a。 4.基因型的确定 aa。 表现型为显性，至少有一个显性基因，另一个不能确定，Aa或AA。做题时用“A_”表示。 ②测交后代性状不分离，被测者为纯合体，测交后代性状分离，被测者为杂合体Aa。 ③自交后代性状不分离，亲本是纯合体；自交后代性状分离，亲本是杂合体：Aa×Aa。 ④双亲均为显性，杂交后代仍为显性，亲本之一是显性纯合体，另一方是AA或Aa。杂交后代有隐性纯合体分离出来，双亲一定是Aa。 5.显隐性的确定 F1表现出的那个性状为显性。 ②杂种后代有性状分离，数量占3/4的性状为显性。 6.显性纯合体、杂合体的确定 适合于植物，不适合于动物，而且是最简便的方法。 ②测交：让待测个体与隐性类型测交，若后代出现隐性类型，则一定为杂合体，若后代只有显性性状个体，则可能为纯合体。 ③用花粉离体培养形成单倍体植株并用秋水仙素处理后获得的植株为纯合体，根据植株性状进行确定。 ④花粉鉴定法：非糯性与糯性水稻的花粉遇碘呈现不同颜色，杂种非糯性水稻的花粉是减数分裂的产物，且比例为1∶1，从而直接证明了杂种非糯性水稻在产生花粉的减数分裂过程中，等位基因彼此分离，同时证明可检验亲本个体是纯合体还是杂合体。 7.遗传概率的计算
(完整版)孟德尔的豌豆杂交实验二教学设计
第2节孟德尔的豌豆杂交实验（二） 第一课时教师肖俊华 日期:2016.9.9 一、指导思想 本节内容是孟德尔经典遗传实验的精华部分，既需要学生了解和掌握孟德尔实验的科学研究过程，更需要深刻领会孟德尔实验的科学研究方法，领略科学研究魅力，因此需要学生具有很强的分析能力和逻辑思维能力。在教学过程中，采取启发式和探究式相结合，让学生进一步体会“假说—演绎法”的研究思路、研究方法和研究过程，注重问题设置的逻辑关系和递进关系，从宏观到微观深刻理解孟德尔自由组合定律的 实质，学会应用孟德尔自由组合定律解决实际问题。 二、教学背景分析 （一）教材分析 1.教学内容分析 《孟德尔的豌豆杂交实验二》是人教版教材《遗传与进化》第一章《遗传因子发现》中第二节的内容。从教材的编排来看，这部分内容是继孟德尔杂交实验一之后，讲解两对相对性状的遗传实验。以孟德尔发现的遗传因子的实验过程为主线，由现象到本质，由简单（一对）到复杂（多对），层层深入地展开讨论，又一次领略科学探究方法——假说演绎法，是以“科学探究”为核心的，即在观察和分析杂交实验结果的基础上发现和提出问题，通过推理和想象提出解释问题的假设，再通过实验对假设进行验证，然后运用数学统计方法分析数据并得出结论。突出了科学史和科学方法的教育，让学生犹如亲历科学家的探索过程，从浓郁的历史感中获得科学知识和对科学方法的领悟。虽然教材把孟德尔的遗传实验介绍的比较清楚，但是因为学生没有这方面的生活经验，这部分知识又是从宏观实验到微观层面理解和掌握遗传的本质，学生在刚刚学过分离定律，对分离定律的基本知识和基本原理理解尚有欠缺的时机进行这部分内容的教学，内容难懂，逻辑思维要求高，科学研究方法需要体会等等，在很大程度上，给学生的理解造成障碍。例如：通过两对性状的杂交实验的现象，对自由组合现象的解释；对自由组合定律的解释验证都是直接给出的，没有很好的铺垫，自由组合定律的应用课本上没有提及，但却是学习和掌握遗传定律最根本的内容，正是基于此，让学生对这部分知识历来感觉难学，老师也对这部分内容找不到很好的就解决方法和有效的教学策略。 本节内容也是学习第二章“减数分裂与受精作用”的重要基础，并为后续学习生物变异和进化奠定基础。 2.在整个高中生物教学中的地位及相互关系 （1）本节在必修二模块中的地位和作用 本节的内容都与其他单元有紧密的联系。本单元讲述的是140年前孟德尔对遗传现象的推测，以及根据推测总结出的遗传规律。遗传规律的细胞学基础是什么?分子生物学基础是什么?需要后期的研究成果去验证、解释和发展。例如，必修模块2《遗传与进化》的第1章《遗传因子的发现》揭示的是遗传规律的细胞学基础；第3章《基因的本质》揭示的是遗传规律的分子生物学基础；第4章《基因的表达》揭示的是基因控制性状的机制；第5章《基因的突变及其他变异》是从分子生物学和细胞学角度解释性状的变异；第6章《从杂交育种到基因工程》讲述的是遗传规律的应用及其发展；第7章《现代生物进化理论》是从群体的角度，讲述遗传和变异在生物进化中的作用。总之，既然整册书是按照遗传学发展的历程来编写的，抓住这条主线，就可以像串珠一样找出各章之间的有机联系。 （二）学生情况分析 学生在初中学习过的知识与本章内容有密切的联系。例如，在初中学习的“基因控制生物的性状”的知识，初步解决了基因与生物个体性状之间的关系问题；学习的“基因的显性和隐性”的知识，初步解决了控制相对性状的成对基因之间的关系问题，以及为什么具有相对性状差异的双亲，后代会有复杂的表现
《生物信息学》上机作业
《生物信息学》上机作业 题目：对人血红蛋白（HBA1）编码基因序列的生物信息分析
目录 引言 .............................................................................................................................................. - 1 -1 正文......................................................................................................................................... - 2 - 1.1 NCBI上对相关核苷酸序列的查找............................................................................ - 2 - 1.2 BLAST运行及其结果.................................................................................................. - 2 - 1.3 BLASTX运行及其结果................................................................................................ - 6 - 2 其他软件的运行及其结果..................................................................................................... - 8 - 2.1 Clustal W运行及其结果 ............................................................................................. - 9 - 2.2 MEGA4.0运行及其结果............................................................................................. - 10 -结论 ............................................................................................................................................ - 10 -
生物信息学大实验_实验指导
实验1基因组序列组装（软件CAP3的使用） 一、实验目的 1．了解基因组测序原理和主要策略； 2．掌握CAP3序列组装软件的使用方法。 二、实验原理 基因组测序常用的两种策略是克隆法（clone-based strategy）和全基因组鸟枪法（whole genome shotgun method）。克隆法先将基因组DNA打成大的片段，连到载体上，构建DNA文库；再对每一个大片段（克隆）打碎测序。序列组装时先组装成克隆，再组装成染色体。克隆测序法的好处在于序列组装时可以利用已经定位的大片段克隆, 所以序列组装起来较容易, 但是需要前期建立基因组物理图谱, 耗资大, 测序周期长。 全基因组鸟枪法测序无需构建各类复杂的物理图谱和遗传图谱，采用最经济有效的实验设计方案，直接将整个基因组打成不同大小的DNA片段构建Shotgun文库，再用传统Sanger测序法或Solexa等新一代测序技术对文库进行随机测序。最后运用生物信息学方法将测序片段拼接成全基因组序列。该方法具有高通量、低成本优势。 序列组装时，先把把单条序列（read）组装成叠连群（contig）、再把叠连群组装成“支架”（scaffold），最后组装成染色体。 本实验将练习在Linux环境下用CAP3软件组装流感病毒基因组。 1．CAP3序列组装程序简介 Huang Xiaoqiu. 和 Madan，A. 开发的一套用于序列拼接的软件，此软件适用于小的数据集或 EST 拼接，它有如下特征： 1. 应用正反向信息更正拼接错误、连接contigs。 2. 在序列拼接中应用 reads 的质量信息。 3. 自动截去 reads5`端、3`端的低质量区。 4. 产生 Consed 程序可读的ace 格式拼接结果文件。 5. CAP3 能用于Staden软件包的中的GAP4 软件。 2．下载 此软件可以免费下载，下载地址：http：//https://www.360docs.net/doc/5815659444.html,/download.html。填写基本信息表格，即可下载。CAP3 详细参考文档可见：http：//https://www.360docs.net/doc/5815659444.html,/sas.html。 3．安装 （1）上传cap3 的压缩包到本地linux/unix 运算服务器； （2）解压缩： bash-2.05b$ tar xvf cap3.tar CAP3/ CAP3/README CAP3/cap3
孟德尔的豌豆杂交实验(一)教案
第一节孟德尔地豌豆杂交实验（一） （第二课时） 一、教学目标 1、说出对分离现象解释地验证并理解测交地概念； 2、理解分离定律地内容 3、应用分离定律解释遗传问题 二、教学重点、难点 对分离现象解释地验证、分离定律地内容及应用 三、自主学习 1、对分离现象解释地验证------测交 1）测交地概念 2）侧交地过程 思考： 杂种子一代隐性纯合子 a、测交后代为什么会出 高茎矮茎现1：1地分离比？ 测交Ｘ b、后代如果出现了1：1 地分离比，你能确定 亲本地遗传因子组合配子类型吗？ 测交后代 （）（） 测交比 2、分离定律地内容： 3、分离定律地应用及解题方法： 1)显隐性性状地判断方法（见第一课时） 2）如何确定遗传因子地组成 （1)性状为隐性性状，则为两个隐性遗传因子组成，即aa 型 性状为显性性状，则至少有一个显性遗传因子，即A Aa型 ,AA或Aa （2）测交后代发生性状分离，则被测者为杂合子，即 Aa型 测交后代不发生性状分离，则被测者为纯合子，即 AA、aa型 （3）自交后代不发生性状分离，亲本是纯合子，即 AA、aa型 自交后代发生性状分离，亲本都是杂合子即 Aa型 （4）双亲为显性，后代有隐性个体，双亲均为杂合子，即Aa ＸAa 后代均为显性，则亲本之一为AA,另一方为AA或Aa
3)怎样利用分离定律解遗传题 (1)分离定律习题类型 正推型：由亲本地性状或遗传因子组成推子代性状或遗传因子组成例：人地多指对五指为显性，两个杂合多指地双亲（Aa)，其后代地 手指正常地概率为多少？其中纯合子及杂合子概率分别是多少？ 逆推型：由子代地性状或遗传因子组成推亲本性状或遗传因子组成例：人地卷舌对非卷舌是显性，一对能卷舌地夫妇生了一个不能卷舌地孩子，这对夫妇和孩子地基因型依次是？（用R、r表示） （2)解题思路与方法 1、根据分离定律中规律性比值来直接推断 ①若后代性状分离比为显性：隐性=3：1，则双亲一定是杂合子（Aa）. 即Aa×Aa→3A__：1aa. ②若后代性状分离比为显性：隐性=1：1，则双亲一定是测交类型.即 Aa×aa→1Aa：1aa. ③若后代性状只有显性性状，则双亲至少有一方为显性纯合子. 即AA×AA或AA×Aa或AA×aa. 11、隐性纯和突破法 ①根据题意列出遗传图式 ②从遗传图式中出现地隐性纯合体突破 例1：周期性偏头痛是由常染色体上地基因引起地遗传病，一对正常地夫妇生了一个患病地女儿.判断一家三口地遗传因子组成？若这对夫妇生了一个正常孩 子，让这个孩子与一患者婚配，后代正常孩子地概率及患病地概率个多少？ （用B、b 表示） 例2：右图为一个白化病家族地遗传病系谱图(该病 受隐性遗体病，由a基因控制；1和2为双亲， 3和4为子女)，据图回答如下问题: （1）理论上，白化病家族中患病个体比正常个体数 目＿＿＿＿，其中男性患者数目与女性患者. (2)1号个体地基因型为，2号个体地 基因型为；3号个体地基因型为. 4号个体为杂合体地机率是 （3）若4号个体与一个携带此致病基因但表现正常地 女性结婚,生下一个表现型正常地孩子地机率是
生物信息学作业
CDK2基因和蛋白质序列的生物信息学分析 姓名： 学号： 专业： 1前言 细胞周期蛋白依赖激酶2(cyclin-dependent kinase 2,CDK2)，又名细胞分裂激酶2(cell division kinase 2)或p33蛋白激酶(p33 protein kinase)，其基因定位于人类基因组的12号染色体上的q13染色带上。CDK2基因全长6013bp，这部分中有7个外显子和6个内含子，7个外显子的长度依次为353bp、78bp、121bp、171bp、102bp、204bp、1264bp(可依次记为外显子1-7)。在翻译过程中，该基因转录成的mRNA的外显子1的前137bp和外显子7的后1159bp不进行翻译，属于调控序列。mRNA上只有中间的部分编码蛋白质。 CDK2基因可以转录为两种mRNA。其中，变体1长度为2325bp，编码298个氨基酸；变体2长度为2223bp，编码264个氨基酸。这两种蛋白质为CDK2的同型蛋白，功能相同，具有调控细胞分裂的功能，主要在G1期到S期和S期到G2期这两个阶段起作用。CDK2广泛分布在生物体的各种细胞的胞质溶胶和细胞核质中，但只在进行分裂的细胞中行使功能，这是因为CDK2只有与不同的细胞周期蛋白(cyclin)结合后才具有活性。CDK2可以与细胞周期蛋白A、B1、B3、E等结合后，参与细胞周期调控。由于CDK2在细胞内的数量变化有可能导致细胞周期异常而产生癌症，故CDK2基因可以被看作癌基因，其活性和表达量可以作为衡量癌症的指标。CDK2与周期蛋白E的复合体不仅能直接参与中心体复制的起始调控，还能与类Rb蛋白p107或转录因子E2F结合，促进细胞从G1期向S期转化或调控DNA复制有关的基因转录。而CDK2与周期蛋白A的复合体可以增强DNA复制因子RF-A的活性。 在CDK2分子中，被称为T环的氨基酸环阻断了活性部位，妨碍激酶履行它的酶功能，而且活性部位的氨基酸形成一种难于为蛋白质结合的形状。CDK2与周期蛋白结合时，周期蛋白将T环转出2nm以上，又将CDK2中的PSTAIRE螺旋部分转了, 并把活性部位氨基酸变成能与底物蛋白结合的正确构象。CDK2的活性不仅与周期蛋白有关，还与其上的Thr-15、Tyr-15、Thr-160三个位点是否磷酸化有关。一般情况下，与周期蛋白结合的CDK2的上述三个位点被Wee/Mik1和CAK激酶磷酸化，但此时复合体还没有活性，只有当Cdc25c将Thr-15、Tyr-15两个位点去磷酸化后，复合体才有活性。细胞中存在多种因子对CDK2进行修饰调节，此外还存在对其活性起负性调控的蛋白质，即CDK激酶抑制物，例如p21CIP/WAF1、p27KIP2等。 前面提到，CDK2基因转录的产物有两种。这两种mRNA的不同之处在于变体1由全部7个外显子组成，而变体2缺失外显子5，由剩余的6个外显子组成。这样翻译成的两种同型蛋白的长度就相差34个氨基酸。 2 材料和方法： 2.1序列数据来源 采用蛋白质名称对NCBI非冗余蛋白质数据库进行检索，CDK2蛋白的记录有1013个。而采用基因名称对NCBI非冗余核酸数据库进行检索，CDK2蛋白的记录有680个。 采用人(Homo sapiens)的CDK2蛋白序列进行BLAST搜索。 2.2序列分析方法
生物信息学论文
生物信息学论文 论文题目 PBL教学法在生物信息学课程教学中的应用与实践 指导老师：谷峻 学生姓名：吕晓莹 学号： 20112501092 院系：生命科学学院 专业：生物科学 撰写时间：2014年4月
摘要：PBL Problem-Based Leaming)，即基于问题学习，是由美国神经病学教授Barrows首创并于1969年在加拿大的麦克马斯特大学医学院试行的一种新的教学方法。PBL 的基本特点是以教师为引导，以学生为中心，通过解决问题来学习，与传统的以学科为基础，以教师为中心的教学方法相比有很大的不同。本论文通过对照PBL 教学理念和生物信息学课程理论，来探究PBL 教学法在生物信息学课程教学中应用与实践，为提高生物信息学课程教学质量提供一种可行方法。 关键词：PBL 教学法，生物信息学，应用与实践 1 前言 生物信息学是20世纪90年代由多种学科知识相互渗透、融合而兴起的一门用数理和信息科学的观点、理论以及方法去研究生命现象、组织和分析呈现指数增长的生物医学数据的一门学科，具有开放性、发展性、交叉性、综合性、应用性等特点。鉴于此，尽管国内的生物信息学科学研究开展得如火如荼，但由于受到师资、教材、授课对象、教学条件、教学法等因素限制，开设该课程的高校尚未真正形成一套成熟的、科学的教学体系。 目前, 国内的生物信息学教学基本沿用以“教师讲授为主”的传统教学模式。以课堂为中心、以理论教学为主, 进行“满堂灌”式教育, “照本宣读”的方式也比较常见。缺乏与生物信息学交叉前沿性特点相适应的型教学模式。同时，实验教学比较单一, 常以验证性为目的, 有些甚至成为了“文献检索”课程, 缺乏和专相适应的综合性、设计性实验。现代教学改革与实践证明，在教学过程中必须要突出“学生是教学活动的主体”，既要注意张扬学生“个性”，更要强化学生团队合作意识及创新、创业能力培养，以保证人才培养质量。在这种情况下，传统的教学模式已与当前社会快速发展的局面格格不入，迫切需要变革。因此，为激发学生的学习积极性和教学参与热情，探索先进的教学法以革新生物信息学的教学内容及考核方式等显得尤为重要。其中，以PBL 为例的教学法在生物信息学课程教学应用与实践中取得了良好的课程教学效果。 2 PBL 教学法的优势 2.1 PBL 教学顺应时代的发展 当今社会是信息时代, 生物学不断发展, 知识不断更新, 老师要讲的内容越来越多, 学生要读的书越来越厚, 授课内容与课时不相适应的矛盾非常突出, 且教学双方负担过重, 教学效果难以保证, 这种填鸭式的传统教学越来越无法适应信息社会的要求, 这就要求学生在接受人类已有的科学知识基础上, 着重培养创造能力, 学会自己寻找知识和创造知识的本领。而PBL 教学模式能明显减少说教式教学和学习负担, 既能加强学生独立学习，又能减轻教师的教学负担，顺应了时代的发展。 2.2 有利于培养学生主动学习的能力和形成双向交流 传统的教学模式是以学科为基础, 教师课堂讲解为主, 教学内容进度和方法均由老师决定，其 对象是学生整体, 容易忽视单一个体的学习兴趣、能力及个性特征, 学生始终处于被动地接受知识的地位, 不利于主动学习能力的培养。而PBL 教学法打破传统的界限, 采取以“学生为中心、问题为核心”的教育方式。在教师的整体把握和指导下, 学生充分运用现代化科技手段如教材、图书馆、录像、模型、文献检索系统、电脑学习软件、网络以及多媒体等多种形式进行自学。课堂上,PBL模式强调学生主动参与学习, 从而大大提高学习效果和长期记忆的形成。从教学的角度来看, 指导老师长期与同一小组学生
孟德尔的豌豆杂交实验一教案
孟德尔的豌豆杂交实验一 引言： 同学们好！如果父亲是双眼皮，母亲是单眼皮，那么孩子是什么样呢？要解决这个问题，就需要学习基因的分离定律。还记得发现这个定律的人吗？就是奥地利的孟德尔。他利用修道院一块儿不大的园地做了八年的豌豆杂交实验，终于成功揭示了遗传学的两大定律，在众多的实验材料中为什么他偏偏选择了豌豆呢？豌豆这种植物有一个特点，那就是它是自花传粉当中的极端情况叫做闭花传粉，什么意思呢？也就是说豌豆它是自己的雄蕊的花粉传到自己的雌蕊的柱头上边进行传粉受精，甚至于花儿还没有开，内部就已经完成了传粉，这样就可以保证完全按照实验者当初的设计意图来进行实验，完全不会受到外来花粉的干扰，从而保证了实验结果真实可靠，其次更大的优点是在豌豆的身上我们能发现很多易于区分的相对性状，同种性状的不同表现类型。我们在遗传学上把她它叫做相对性状。例如豌豆籽粒的圆滑和皱缩这就是一对相对性状。而籽叶的颜色黄色对绿色也是一对相对性状，豌豆身上的这些相对性状都很容易识别在我们识别的时候不会遇到太多的困难，这样就保证了实验结果非常地清楚明白，基于这两个优点，孟德尔最终选择了豌豆进行了大量的杂交实验，其实豌豆的杂交实验就是一次人工的传粉受精，当一朵花儿它还没有开放时也就是当它还是处于花蕾期的时候首先用剪刀把这朵花的雄蕊去除这个过程我们就把它叫做去雄然后我们看但你花粉发育成熟时我们可以用一支毛笔把一朵花的雄蕊的花药当中的花粉沾一点然后把它传到另一朵花的雌蕊的柱头上边，这样就完成了一次人工传粉受精，也就是让这两朵花所在的两株植物进行了一次杂交实验，再到接受花粉的这一方，也就是母本接触种子或者等种子种下去，在长成植株之后我们便可以看到实验结果了。在在这个过程当中请大家注意接受花粉的一方我们把它叫做母本，而提供花粉的一方我们把它叫做父方。好了，有了这些知识的准备下面我们就可以开始正式看下孟德尔关于一对相对性状的杂交实验，首先我们来看他研究的到底是哪一对相对性状？请看图，这幅图放映的就是孟德尔关于一对相对性状的杂交实验，首先他研究的一对相对性状就是豌豆的高茎和矮茎，首先使用纯种的高茎豌豆和纯种的矮茎豌豆进行杂交得到的后代我们把它叫做子一代，通常记做F1我们看到子一代全部都是高茎豌豆没有一株是矮茎豌豆，因此我们就把子一代所表现出来的这个性状叫做显性性状，而在子一代没能表现出来的性状，我们就把它叫做隐性性状。问题就来了，子一代全部都是高茎性状，那么矮茎性状到底是永远的消息了呢？还是暂时的隐藏了，接下来我们再往下看让子一代自交，也就是进行一次自花传粉，得到的后代我们把它称之为子二代，结果发现在子二代中，既有高茎也有矮茎，也就是说显性性状和隐性性状又都同时出现了，我们把这个现象叫做性状分离，由于孟德尔曾经在大学中接受过非常完善的教学训练，因此他就想到了用数学统计的方法来对结果进行分析，我们来看一下统计结果是在子二代中高茎有787株而矮茎有277株，如果对二者进行一个比值的话那么比值大致接近于3:1，请同学们思考一下：3:1这样的一个数字究竟是一个偶然的结果呢？还是一个固有的规律呢？子一代自交后后代发生的这种性状分离到底是不是一个普遍的现象呢？我们暂且就把3:1这样一个数字叫做性状分离比。孟德尔没有停歇，他马上又开始对其他六对相对性状在，逐对进行同样的实验。都是首先让纯种的亲本进行杂交，得到的子一代再进行自交，观察子二代的性状分离比，我们来看一下，其他杂交实验的结果，我们可以看到几乎所有的实验都显示了大致相同的结果，也就是均为子一代，只表现出一种亲本的性状，即为显性性状，而