PUBMED课后作业讲解和演示
参考教案PubMedEmba
PubMed Emba 入门教程章节一：PubMed 简介1.1 课程目标：了解PubMed 的基本概念、功能和用途。
掌握PubMed 的访问方式和基本操作。
1.2 教学内容：PubMed 的定义和背景PubMed 的功能和特点PubMed 的访问方式PubMed 的基本操作（搜索、浏览、筛选、排序等）1.3 教学活动：讲解PubMed 的基本概念和功能演示PubMed 的访问方式和基本操作学生实操：搜索并筛选文献章节二：PubMed 搜索技巧2.1 课程目标：学习PubMed 的搜索技巧，提高搜索效率和准确性。
2.2 教学内容：PubMed 的搜索方式（关键词搜索、高级搜索等）常用搜索策略和技巧（同义词、布尔运算、位置运算等）检索式的构建和优化2.3 教学活动：讲解PubMed 的搜索方式和常用搜索策略演示检索式的构建和优化方法学生实操：构建检索式并进行搜索章节三：PubMed 文献浏览和筛选3.1 课程目标：学习PubMed 文献的浏览和筛选方法，快速找到所需信息。
3.2 教学内容：PubMed 文献的浏览方式（、摘要、全文等）常用筛选条件（时间、语言、发表期刊等）排序和分组功能3.3 教学活动：讲解PubMed 文献的浏览和筛选方法演示常用筛选条件和排序分组功能学生实操：根据需求进行文献浏览和筛选章节四：PubMed 文献获取和引用4.1 课程目标：学习PubMed 文献的获取和引用方法，方便进行文献阅读和写作。
4.2 教学内容：PubMed 文献的获取方式（全文、引用信息等）文献引用格式（APA、MLA等）文献管理工具的使用（如EndNote、Zotero等）4.3 教学活动：讲解PubMed 文献的获取和引用方法演示文献引用格式的编写和文献管理工具的使用学生实操：全文、编写引用信息并使用文献管理工具章节五：PubMed 高级应用5.1 课程目标：学习PubMed 的高级应用，进行更深入的文献研究和分析。
pubmed文献检索PPT课件
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2. PubMed的主题词检索是其最具特色的 功能之一，能保证较好的查准率及查准 率。主题词组配副主题词使检索结果更 为专指，限定在主要主题词检索能使结 果更准确。
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3.但是主题词检索也有一些固有的缺陷， 比如很多专指的概念没有相应的主题词， 一些新出现的概念要几年后才收录为主 题词这种情况下，不宜采用主题词检索， 采用字段限定检索等方法也能得到较好 的查准率。此外，主题词检索还可能会 漏掉一些最新的文献（in process citations），这也是需要注意的。
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Clinical Queries临床咨询
研究范畴:一般疾病的病因学、预后、
诊断、预防以及治疗 Finding Systematic Reviews：提供系统 评价、meta分析、临床试验综述临床指 南等循证医学文献信息的查找
Medical Genetics Searches
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4）应用MeSH主题词的Major Topic（主 要主题词）检索：
可以使检索结果更加准确。
点选Restrictions Search to Major Topic headings only，
限定检索结果为主要主题词。
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建立检索式
如果有多个主题词， 可以先分别对每个主题词进行检索， 再在高级检索的Search History中用检索 序号进行布尔逻辑运算； 也可以通过主题词检索页面的PubMed search 直接建立检索式
形变异词。 ▪ 截词功能只限于单词，对词组无效
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布尔检索
布尔运算符AND，OR，NOT必须大 写 从左至右进行布尔运算 以通过加圆括符改变运算顺序
PubMed作业演示
套录文献的选项
检索式,推荐用这种 方法检索第一题
PubMed作业演示
2、以南京医科大学（NANJING MEDICAL UNIVERSITY）流行病学教研室沈洪兵为 例，用著者沈洪兵（Shen Hongbing，人名 索引形式为：Shen HB或Shen H）检索他在 Cancer Lett上发表的文章。
首先点击single citation matcher.
输入相关检 索词，点击 【Search】 按钮
点击limits选择作者地 址字段affiliation
点击all fields下拉 箭头，选择地址字 段
输入大写的AND， 前后要空格，再输 入南京医科大学英 文
点击Go系统 检索
显示检索结果,点 击Details浏览检 索式
PubMed作业演示
3、胰腺癌诊断（Pancreatic Cancer） 的比较研究（comparative study） 的随机对照试验(randomized controlled trial)方面的文献。
PubMed基本检索检 索结果的相关性低于 主题词检索，所以提 倡采用主题词检索， 所以下面介绍主题词 检索。
选择主题词检索途 径
输入检索词点 击Go
显示与输入检索词相关的主题词轮 排索引，选择主题词，选择 Pancreatic Neoplasms，点击进一步 细分该主题词的方面组配。
显示主题词的副主题词和同义词等。勾选 diagnosis，从查全考虑，还可以勾选diagnosis的 下位概念副主题词。 radiography、 radionuclide imaging和ultrasonography
查看检索式
外部资源 链接
出版商网址， 有宝石标志
pubmed操作过程和操作习题
julia s wong; wong julia s(2002年始）
逻辑运算 and(空格)、or、not
词语检索 “single cell”；“World War I”
字段限止检索 liver cancer[ti]
Dept. of Medical Information
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PubMed检索字段
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Limits：限定检索词在文献某部分出现
（字段限定检索）
Dept. of Medical Information
2021/3/5
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Limits：限定文献类型、语种、出版日期、
年龄、性别、研究对象等
Dept. of Medical InformationLeabharlann 2021/3/519
用Limit限止“年令、性别、人类或动物、出版物 类型” 会排除“premedline” 和 “supplied by publisher” 子集中的文献
记录标注：[PubMed - in process]
Dept. of Medical Information
2021/3/5
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一、PubMed数据来源及收录范围
(3) Publisher Supplied Citations
Medline未收录的文献
出版商提供的是整本期刊的信息，若有部分没有被 MEDLINE收录，PubMed仍保存。
Dept. of Medical Information
2021/3/5
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例：肝癌的化学治疗
Dept. of Medical Information
2021/3/5
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医学文献检索Pubmed作业讲解
一、用Pubmed检索下列各题，记录你的检索操作过程及命中文献数1.了解有关疯牛病（bovine spongiform encephalopathy ,BSE）起源（origin）的情况，最早的报道在哪年，记录出处。
#1 bovine spongiform encephalopathy#2 BSE#3 #1 OR #2#4 origin#5 #3 AND #4点击Display settings在sort by 下方勾选Pub Date后点击Apply进行按出版日期排序，选择最后一项的最后一条记录。
2.2005年度诺贝尔医学奖授予了幽门螺杆菌的发现者Barry J.Marshall(1951-)和J. Robin W arren(1937-)，请检索两人合作发表的论文，记录最早的一篇文献题录。
#1 Marshall BJ[au]#2 W arren JR[au]#3 #1 AND #2点击Display settings在sort by 下方勾选Pub Date后点击Apply进行按出版日期排序，选择最后一项的最后一条记录。
3.请检索有关流感病毒H5N1人疫苗(vaccine)的临床试验（clinical trial）文献。
#1 H5N1#2 vaccine#3 #1 AND #2选择限定：Species √human(人类) Article types√clinical trial(临床试验)4.RNA干扰(RNA INTERFERENCE )用于肝癌治疗的综述文献。
#1 RNA INTERFERENCE#2 liver cancer#3 #1 AND #2选择限定：Article types√Review(综述)二、用Pubmed主题途径检索下列各题，记录你的检索操作过程及命中文献数1. 有关儿童哮喘（asthma）的药物疗法方面的文献。
在左上角数据库选择下拉菜单中选择进入MeSH，在词语输入框中输入asthma，查找asthma的主题词为asthma，点击有下划线的asthma进入主题检索页面，勾选副主题词drug therapy，在右上角选AND，然后点击Add to search builder将主题词及副主题词送入上面的检索构造框中，点击Search Pubmed按钮即进行主题检索：asthma/drug therapy在该题主题检索中，儿童不作为检索进行检索，而是选择限定中的年龄限定进行限制检索。
【医学PPT课件】PubMed检索指南
限 定 检 索 窗 口 全 貌
添加作者检索
添加期刊检索
限定记录有全文、免费全文或 摘要
文献发表时间限定
记录添加到PubMed时间限定
限定记录有全文、免费全文或 摘要
人类与动物限定 性别限定
文献语种限定
文献子集限定
Terms, MeSH Subheadings, Chemical Substance Names, Personal Name as Subject 等 字段
Title/Abstract [TIAB]
四、PubMed检索功能
检索
1、自由词智能检索
在检索框中键入一到多个单词，如键入： vitamin c AND common cold hepatitis b AND (diagnosis OR therapy)
SubHeadings 副主题词
对一个主题词的多个方面进行修饰限定 的词，又称限定词。
特征栏功能介绍-Clipboard
（四） Clipboard功能介绍
将每次满意的检索结果暂时保存至此 最后集中处理（下载存盘或发E-mail） 最多500条记录，断开连接后保存8小时
（五） Details功能介绍
Details：显示计算机响应的本次检索式。
点击“URL”
/entrez/query.fcgi?cmd=Pu reSearch&db=pubmed&details_term=effect%5BAll%2 0Fields%5D%20AND%20%28%28%22magnetic%20r esonance%20imaging%22%5BTIAB%5D%20NOT%2 0Medline%5BSB%5D%29%20OR%20%22magnetic% 20resonance%20imaging%22%5BMeSH%20Terms% 5D%20OR%20MRI%5BText%20Word%5D%29%20A ND%20Review%5Bptyp%5D%20AND%20%222005/0 2/13%2000.01%22%5BEDAT%5D%20%3A%20%222
pubmed数据库使用指南
My NCBI
上机作业
• 1 检索胰腺肿瘤方面的综述
• 2 检索2006-2015年中华内科杂志被 PUBMED收录的文献
• 3 检索泰山医学院2000年至今被pubmed所 收录的文献
•THANKS!!
Lung cancer 的检索细节
检索历史
五、显示结果的处理
六、Pubmed的秘密
两大特点
• 词汇自动转换功能 • 链接功能
1、词汇自动转换功能
• （1）MeSH转换表（MeSH Translation Table），
包括MeSH词、参见词、副主题词等。如果系统在该表 中发现了与检索词相匹配的词，就会自动将其转换为相 应的MeSH词和全字段词进行检索。 • 例如：键入“Pancreatic cancer”，
注意：中文版直接用汉语拼音表示，如：
《中华内科杂志》表示为：zhonghua nei ke za zhi.
• 短语表（确定检索词是否为固定词组）
• 作者索引 外文作者：如：john smith用 Smith J[au] 中文作者： 胡大一 表示为 Hu DY[au]
或表示为 Hu, Da yi[fau] Hu, Da-yi[fau]
• ①尽量使用主题词。 • ②注意先组检索词的使用。在利用词表查词时要
找全每个词的下位词有无此先组型词组。如“乳 腺癌”(Breast Cancer)，应首先在MeSH中顺着 “肿瘤”的下位词去找。必须注意，词表中的上 下位词是按概念成族的。因此“乳腺癌”只能作 为肿瘤的下位词出现，而不会作为“乳腺”的下 位词。如果词表中有“乳腺癌”这一先组式主题 词，就不应该用“ Breast AND Cancer”或 “ Breast AND Neoplasms”的提问式来检索。
jbfAAAPubMedPPT课件
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lung cancer AND smok* 点击“ＧＯ”,检索结果9254篇
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选择Medline格式，点击disply，显示检索结果。
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例2：允许用双引号（“ ”）来强制系统进行 短语检索。输入 “single cell”，点击GO按扭。
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用“Single cell”检索的结果181861篇。
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2、Preview/index预览/索引
• 在预检索界面可执行以下功能：
• （1）、在显示检索结果前先显示检索结果的记录数量（Result）。 在检索框内输入检索式，点击preview按钮，将会显示检索结果的 篇数。点击记录数的链接，系统显示当前检索策略的检索结果。
• 匹配用的四个索引按顺序是： • Mesh Translation Table（ Mesh 转换表） • Journals Translation Table（刊名转换表） • Phrase List（短语列表） • Author Index （著者索引） • 2、自动扩展检索功能，如果没有说明系统会对主题词、
• （1）输入的是关键词，系统会找出与之对应的Mesh词，以文本 词（关键词）与Mesh词同时进行检索。例如输入taxol，系统转换 为（“paclitaxel”）[Mesh Terms]OR “ taxol”[Text Word]
• （2）如果输入的是多个词，系统未能在四个索引中找到与之一致 的词组形式，会自动将每一个词用“AND”联接起来进行检索。 如taxol lung cancer 系统转换成：
• 4、支持布尔逻辑符 AND、OR、NOT 和截词* 的使用。逻辑符 用大写。在采用多个逻辑符 表达的检索式中，括号（ ）内的检索式优先 运行。
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11、Please find out lecture below by using Single Citation Matcher on PubMed.
DOI号
DOI即数字对象唯一标识符： (Digital Object Unique Identifier-DOI)。DOI标识符作为数 字化对象的识别符，对所标识的数字对象而言，相当于人 的身份证，具有唯一性。这种特性保证了在网络环境下对 数字化对象的准确提取，有效地避免重复。一个数字化对 象的DOI标识符一经产生就永久不变，不随其所标识的数 字化对象的版权所有者或存储地址等属性的变更而改变。 查询网址： 1） 2）
4、Please type “Infarct* ” in the basic search box on PubMed ,and find out how many related words will be searched during database? ANSWER： Infarct* See “search details”
PubMed课后作业
南华大学图书馆 龙颖
1、Please find out lectures written by author below(one by one) on PubMed. 1) Smith OR 2) Woods 3) John Doebley 4) Garcia Algar, Oscar ANSWER： 1) “Smith OR”[AU] 2) “Woods ”[AU] 3) “Doebley J O”[AU]
8、 Please find out lectures about both firstline and kidney allograft on PubMed. ANSWER： First-line AND “kidney allograft”
9、Please find out the journal’s full name of Curr Cardiovasc Imaging Rep(abbr.),and its publication start year, by using Journals in NCBI Databases on PubMed. ANSWER： Journals in NCBI Databases: Curr Cardiovasc Imaging Rep
10、Please find out lectures about hypertension therapy by using Mesh Database on PubMed. ANSWER： Mesh Database : hypertension/therapy
选择主题词/副主题词实施检索
其它信息：树号；款目词；树状表
Single Citation Matcher
2、Please find out lectures published by journal below(one by one) on PubMed. 1) j hand surg [am] 2) gene therapy
ANSWER： 1) “J hand surg am”[TA] 2) “gene therapy”[TA]
3、Please find out lectures about “lung cancer” whose publication date is from 201001-01 to 2013-12-31 on PubMed. ANSWER： Lung cancer Custom date range(YYYY/MM/DD):20100101 to 20131231
5、Please find out lectures about DNA writed by Dr. Grinev in 2013 on PubMed.
ANSWER： DNA AND Grinev[AU]
6、Please find out lectures about the effects of heat or humidity on multiple sclerosis on PubMed.
ANSWER： (heat OR humidity) AND “multiple sclerosis”
7、Please find out lectures about hypertension excluding the Publication Type Letter on PubMed.
ANSWER： Hypertension NOT letter[PT]