生物信息学在医学领域的应用前沿
生物信息学在医学领域的应用前景

生物信息学在医学领域的应用前景生物信息学是研究生命科学中的基因组学、蛋白质组学、代谢组学等信息的科学。
随着大数据时代的到来,生物信息学已经成为了一个热门领域,并且在医学领域中有着广泛的应用前景。
现代医学在病理学和临床学诊断方面已经发展到了一个非常高的水平,但是这些发现都是基于一定的经验和先验知识的。
通过生物信息学技术,我们可以通过对基因组、蛋白质组和代谢组等信息的分析,发现更加深入的疾病机理。
一、基因组学在医学领域的应用基因组学是应用DNA测序技术研究基因组结构和功能的学科。
通过基因组学技术,我们可以对人类基因组做全面的研究。
近年来,人们发现,很多疾病都与基因突变有关,生物信息学技术的应用可以帮助我们更好地研究基因突变对疾病产生的影响。
在肿瘤学研究领域中,基因突变是一个非常热门的研究课题。
通过基因组测序技术,在肿瘤细胞中发现了很多基因突变,这些基因突变被认为是肿瘤发生的关键因素之一。
经过对这些基因突变的深入研究,人们可以了解到肿瘤细胞的发生机制,从而为癌症治疗提供更加精确的方案。
同时,基因组学技术还可以用于确认疾病的致病基因。
有些疾病的致病基因并不清楚,这时可以使用基因组测序技术,对被怀疑的基因进行全面的研究,找出致病基因的位置和功能,从而为治疗和预防疾病提供更加准确的依据。
二、蛋白质组学在医学领域的应用蛋白质组学是研究生物体内蛋白质在组织、细胞或器官水平上的数量、定位、运作和相互作用的科学。
蛋白质是细胞内最基本的生物分子之一,其具有多种功能,包括催化反应、信号传导、结构支架和运输等。
通过蛋白质组学技术,我们可以对蛋白质的种类和数量、空间结构和相互作用进行全面研究。
这些信息非常重要,因为它们对于疾病的诊断、治疗和预防都有着重要的指导意义。
在蛋白质组学和肿瘤学研究中,人们在肿瘤患者的血清中发现了一些特定的肿瘤标志物。
通过分析这些标志物,我们可以确定肿瘤的类型和位置以及肿瘤的分期情况。
这种方法可以在早期确诊肿瘤,提高治疗效果,并且可以做为肿瘤治疗后的监测疗效指标。
生物信息学在医学领域的应用现状与前景

生物信息学在医学领域的应用现状与前景随着基因测序技术的迅速发展和普及,生物信息学逐渐成为了医学领域中不可或缺的重要工具。
生物信息学是一门融合了计算机科学、数学和生物学的学科,主要研究如何将大量生物学数据进行计算分析处理和解释。
在医学领域中,生物信息学可被用于探索各种疾病的致病机制、筛选免疫学治疗靶点、预测药物副作用等方面,因此受到越来越多的关注。
本文将从生物信息学在肿瘤研究、遗传病诊断与基因治疗、药物研发和个性化医疗等四个方面阐述其应用现状以及未来前景。
一、肿瘤研究中的应用肿瘤是一种复杂的疾病,在其形成、发展和转移过程中有多种蛋白质、基因和代谢相关的变化。
将大量的分子生物学数据进行整合和分析,生物信息学可以发现潜在作用于肿瘤生长、转移和抵抗药物的分子标志物。
例如,肿瘤组织中蛋白质的甲基化作用和去甲基化作用的紊乱被认为是肿瘤形成过程中的关键环节之一。
利用生物信息技术,研究人员可以对这些数据进行分析和处理,发现与该疾病相关的标志物,并为肿瘤治疗提供新靶标的发现和开发。
此外,生物信息学技术也可用于肿瘤组织的分类。
不同类型的肿瘤有着不同的病理学特征,它们在基因表达和基因突变方面也存在差异。
通过在生物信息学方法的引导下,处理基因表达分析数据,可以进行分类鉴定并进一步研究各类肿瘤的致病机制。
二、遗传病诊断与基因治疗遗传病是由遗传突变引起的疾病,具有遗传和家族聚集的特点。
基于生物信息学分析技术,可以检测疾病相关基因的突变,探索其影响和机制,并为临床诊断和治疗提供依据。
例如,生物信息学技术可以用来构建基因突变型谱,以便于进一步理解某些疾病与基因相关的分子机制。
基于这些分析,可以定位治疗基因、探讨治疗方案,并制定靶向基因治疗策略。
当前,基因编辑成为基因治疗的一个重要方向,已被广泛使用在许多疾病的治疗上。
基因编辑技术是指在人类或动物细胞中精确修改某一基因的方法。
利用生物信息学技术,可以准确地设计合适的CRISPR/Cas9靶点,进行基因治疗以治疗和预防疾病。
生物信息学在医学研究中的应用进展

生物信息学在医学研究中的应用进展一、概述生物信息学,作为生命科学和计算机科学交叉融合的新兴学科,近年来在医学研究领域展现出了巨大的应用潜力和发展前景。
它借助计算机技术和信息科学的手段,对海量的生物数据进行高效处理、分析和解释,从而挖掘出隐藏在数据背后的生物学规律和意义。
在医学领域,生物信息学不仅为疾病的预防、诊断和治疗提供了全新的视角和方法,还为医学研究的深入发展注入了新的动力。
随着基因组学、蛋白质组学等学科的快速发展,医学研究所产生的数据量呈爆炸式增长,传统的数据分析方法已难以满足当前的需求。
生物信息学应运而生,为医学数据的处理和分析提供了强有力的工具。
通过生物信息学的方法,研究人员可以更加深入地了解疾病的发病机制,发现新的治疗靶点,为药物的研发提供新的思路。
生物信息学在临床诊断中也发挥着越来越重要的作用。
借助基因测序、蛋白质组学等技术手段,医生可以更加准确地判断患者的病情,制定个性化的治疗方案,提高治疗效果和患者的生存率。
生物信息学还在医学教育的普及和医学研究的创新中扮演着重要角色。
通过开设相关课程、举办学术研讨会等形式,生物信息学为培养具备跨学科知识和创新能力的医学人才提供了有力支持。
生物信息学在医学研究领域的应用进展迅速,其在疾病预防、诊断、治疗以及医学教育和研究创新等方面都展现出了巨大的潜力和价值。
随着技术的不断进步和应用领域的不断拓展,生物信息学有望在医学领域发挥更加重要的作用,为人类的健康事业作出更大的贡献。
1. 生物信息学的定义与发展生物信息学,作为一门新兴的交叉学科,在21世纪科学发展的浪潮中崭露头角。
其定义广泛而深入,它不仅是生物科学与信息科学的结合,更是计算机科学、数学、物理学等多个学科相互渗透与融合的产物。
生物信息学主要利用计算机科学的技术手段,对生物学数据进行获取、存储、传输、计算、分析和模拟等操作,从而揭示这些数据背后所蕴含的生物学奥秘和生命活动规律。
生物信息学的发展历程可以追溯到20世纪80年代末,随着人类基因组计划的启动而兴起。
生物信息学研究在医学中的应用

生物信息学研究在医学中的应用介绍:生物信息学是将计算机科学、数学和生物学相结合的一门跨学科领域,旨在利用计算机和统计学方法分析和解释生物学数据。
它在生物医学研究中发挥着重要作用,为了理解人类健康和疾病的基因组学和转录组学,生物信息学研究被广泛应用于医学领域。
基因组学研究和药物开发:生物信息学为基因组学研究和药物开发提供了关键的工具和技术。
通过对大规模的基因组数据进行分析,生物信息学揭示了许多与疾病有关的异常基因和遗传变异。
这为疾病的诊断和治疗提供了新的思路。
此外,生物信息学研究还可以识别具有特定生物活性的新药靶点,并预测候选药物的活性和副作用,从而加速药物研发过程。
个性化医学:生物信息学也在个性化医学中扮演着重要角色。
通过分析个人的基因组和表达谱数据,医生可以根据个体的遗传差异来制定个性化的治疗方案。
生物信息学还可以预测个人对药物的反应,并帮助医生选择最适合的药物和剂量。
这种个性化的医疗方法可以显著提高治疗的效果,并减少不必要的副作用。
研究癌症:生物信息学在癌症研究中也发挥着重要作用。
通过分析癌症基因组数据,生物信息学可以帮助研究人员理解癌症的发生机制并发现新的治疗靶点。
生物信息学方法还可以从大规模基因表达数据中识别出与特定类型的癌症相关的生物标志物,从而实现早期诊断和预测预后。
此外,基于生物信息学的方法也为癌症治疗提供了新的策略,如免疫治疗和靶向治疗。
研究传染病和病原菌:生物信息学在传染病和病原菌研究中也发挥着重要作用。
通过对病原菌基因组和转录组数据的分析,生物信息学可以帮助研究人员了解病原菌的生物学特性,并发现新的抗生素和疫苗靶点。
此外,生物信息学还可以通过分析病原菌基因组的多样性,帮助研究人员追踪和预测传染病的传播途径和演化。
总结:生物信息学在医学研究中的应用已经取得了重要的进展。
通过利用计算机和统计学方法分析和解释生物学数据,生物信息学揭示了许多与疾病有关的基因和遗传变异,并为基因组学研究、个性化医学、癌症研究以及传染病和病原菌研究提供了关键的工具和技术。
生物信息学在医学研究中的应用前景

生物信息学在医学研究中的应用前景一、引言生物信息学是生物学与信息科学交叉的学科领域,通过对生物学数据的收集、存储、处理和分析,来揭示生物学问题的本质和规律。
在医学研究中,生物信息学被广泛应用于基因组学、蛋白质组学、转录组学等领域,为疾病的发病机制、诊断和治疗提供了重要的信息。
本文将对生物信息学在医学研究中的应用现状进行分析,并提出相应的问题和策略建议。
二、现状分析1. 应用于基因组学研究基因组学是研究基因组的结构、组成、功能和进化的学科,生物信息学在基因组学研究中发挥了重要作用。
通过生物信息学技术,可以对基因组进行序列分析、功能注释、比较基因组学等,揭示基因的结构、功能和调控网络,为遗传性疾病的诊断和治疗提供了重要的依据。
2. 应用于蛋白质组学研究蛋白质组学是研究生物体内全部蛋白质的结构、组成和功能的学科,生物信息学在蛋白质组学研究中也发挥了重要作用。
通过生物信息学技术,可以对蛋白质进行序列分析、结构预测、功能注释等,揭示蛋白质的结构、功能和相互作用网络,为药物的研发和疾病的治疗提供了重要的信息。
3. 应用于转录组学研究转录组学是研究生物体内所有转录的RNA的学科,生物信息学在转录组学研究中发挥了重要作用。
通过生物信息学技术,可以对转录组数据进行分析、表达谱分析、信号通路分析等,揭示基因的表达模式和调控机制,为疾病的诊断和治疗提供了重要的线索。
三、存在问题1. 数据质量不稳定生物信息学研究需要大量的生物学数据,包括基因组数据、蛋白质组数据和转录组数据等。
然而,这些数据的质量不稳定,可能存在测序误差、注释错误和组装不完整等问题,给研究带来了一定的困扰。
2. 数据分析方法不完善生物信息学研究依赖于数据分析方法,然而目前的数据分析方法并不完善,存在样本大小不足、算法选择不合理和结果可解释性不强等问题。
这些问题限制了生物信息学在医学研究中的应用效果,需要进一步研究和改进。
3. 数据共享和隐私保护问题生物信息学研究需要大规模的样本和数据,然而数据共享和隐私保护问题成为了一个亟待解决的难题。
生物信息学在医学研究中的应用

生物信息学在医学研究中的应用近年来,随着生物科学和计算机技术的快速发展,生物信息学作为一个新兴的交叉学科,渐渐引起了人们的重视。
生物信息学是将计算机科学和信息技术应用于生物学领域,通过对生物数据的收集、分析和解释,为生物学研究提供了全新的途径和手段。
在医学研究中,生物信息学的应用已经取得了许多令人瞩目的成果,推动了医学诊断、治疗和药物研发的进步。
1. 基因组学和转录组学分析生物信息学在医学研究中的一大应用领域是基因组学和转录组学分析。
基因组学研究借助于生物信息学的工具和方法,可以对整个基因组的序列进行测序和分析,从而帮助科学家们理解人类基因组在健康和疾病中的重要作用。
例如,通过对基因组中的突变位点进行分析,可以发现与遗传疾病相关的致病基因,从而为临床诊断和治疗提供依据。
另外,转录组学研究是研究细胞内转录过程的科学,它可以通过大规模测序和数据分析,研究细胞在不同生理状态下基因的表达水平和转录变化情况。
通过生物信息学的手段,科学家们可以对转录组数据进行挖掘和解读,发现常见疾病或肿瘤的发生机制,并探索新的治疗策略。
这些基因组学和转录组学分析的结果,为医学研究提供了重要的基础数据,为疾病的早期预测、风险评估和治疗设计提供了新的思路。
2. 蛋白质组学和代谢组学研究生物信息学在医学研究中的另一个重要应用领域是蛋白质组学和代谢组学研究。
蛋白质组学研究是对生物体内所有蛋白质的表达水平和功能进行高通量测定和分析,通过生物信息学的工具和方法,可以对蛋白质组数据进行分析和解读,揭示蛋白质与疾病发生、发展相关的机制。
代谢组学研究则是通过对生物体内代谢产物的测定和分析,揭示生物体内代谢网络的变化,从而了解疾病发生的代谢特征和机制。
生物信息学在蛋白质组学和代谢组学研究中的应用,可以促进对疾病的早期诊断和个体化治疗的实现。
3. 基于生物信息学的靶向治疗和药物研发生物信息学在医学研究中的另一个重要应用是基于生物信息学的靶向治疗和药物研发。
生物信息学在医学研究中的应用

生物信息学在医学研究中的应用生物信息学在医学研究中的应用非常广泛,以下是一些主要应用:1.基因组学和转录组学研究:生物信息学可以通过对大规模基因和基因表达数据的分析,帮助生物学家更好地理解基因变异和表达模式与人类疾病的关系。
这有助于发现新的治疗方法,并理解疾病的发病机制。
2.蛋白质组学研究:生物信息学可以通过蛋白质分析和预测,加速研究新型蛋白质、诊断标志物和治疗方法。
这有助于发现新的药物靶点,并开发更有效的药物。
3.生物网络分析:生物信息学可以通过分析生物网络中基因、蛋白质和代谢物之间的相互作用,加深对复杂疾病的理解。
这有助于更好地理解疾病的发生和发展机制。
4.生物医学图像分析:生物信息学可以通过对大规模影像数据的分析,提高诊断精度和治疗效果,同时也可以帮助基础研究人员更好地理解生命系统的结构和功能。
例如,通过分析医学影像数据,可以更准确地诊断疾病,并制定更有效的治疗方案。
5.精准医疗:生物信息学可以帮助实现精准医疗,通过对个体基因组、蛋白质组等数据的分析,为个体提供定制化的治疗方案。
例如,在肿瘤治疗中,可以根据个体基因变异情况,制定针对性的治疗方案。
6.药物研发:生物信息学可以应用于药物研发的全过程,包括靶点发现、药物设计、药物筛选和药物优化等。
例如,通过计算机辅助药物设计,可以预测药物与靶点的相互作用,从而提高药物研发的效率和成功率。
7.预防出生缺陷:生物信息学可以帮助预防出生缺陷,通过对孕妇的基因组和产前筛查数据进行综合分析,可以预测胎儿可能的遗传缺陷,并采取相应的措施进行干预。
总之,生物信息学在医学研究中发挥着越来越重要的作用,为医学研究和医疗服务提供了强有力的支持。
生物信息学在医疗领域中的应用

生物信息学在医疗领域中的应用随着生物技术的不断发展和进步,生物信息学正在成为一个越来越重要的领域。
生物信息学可以被定义为整合、存储、分析和应用生物学数据的科学。
它已经在许多领域中发挥了重要作用,特别是在医疗领域。
本文将探讨生物信息学在医疗领域中的应用。
1. 基因组学和药物开发随着基因技术的不断发展和进步,基因测序的价格也大大降低,并且变得越来越容易访问。
通过对基因组的研究,科学家们可以从基因组水平开始了解人类疾病的基础。
基因组学通过发现与疾病相关的单个基因或基因组中的基因区域,从而生成了许多新的靶向方法。
这种针对基因组的方法可以帮助识别和开发新的分子靶向药物,特别是对于现有疾病的治疗方案无效的患者。
生物信息学在药物开发和筛选方面的作用远不止于此。
其在预测分子相互作用、编码蛋白质结构、计算生物水动力学方面的作用,都可以使药物开发速度变得更快、更高效。
2. 疾病诊断和预测生物信息学的另一个重要方面是其在疾病诊断和预测方面的应用。
生物标记和基因组学检测是疾病预测和诊断的重要部分。
生物标记和基因组学检测可以在早期诊断疾病,并将潜在的风险因素和疾病关联因素纳入到患者个性化治疗计划中。
通过对基因组和转录组学等数据的整合和分析,疾病预测和诊断的准确性也得到了很大的提高。
例如,通过分析患者的基因,科学家们可以预测患病风险,并做出必要的行动来防止或延迟疾病进展。
3. 治疗方案个性化个性化医疗是未来医疗的发展方向,而生物信息学则在实现个性化医疗方案中发挥着关键作用。
生物信息学技术可以分析患者的基因,从而找到患者特有的基因和变异。
这有助于医生更好地了解患者的特定风险因素,并制定更针对性的治疗方案。
例如,针对药物对患者的响应情况进行分析,可以帮助医生为患者选择更适合的治疗方案。
此外,生物信息学还可以帮助医生确定患者在治疗过程中出现不良反应的风险因素。
4. 疾病预防和公共卫生生物信息学在疾病预防和公共卫生方面也可以发挥作用。
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生物信息学在医学领域的应用前沿摘要:生物信息学是有生命科学、信息学、数学、物理、化学等学科相互交融而形成的新兴学科。
生物信息数据库几乎覆盖了生命科学的各个领域,截止至2010年,总数已达1230个。
生物信息学已不断渗透到医学领域的研究中。
生物信息学在医学领域中主要应用于医学基础研究、临床医学、药物研发和建立与医学有关的生物信息学数据库。
关键词:生物信息学;医学;基因;应用生物信息学是20世纪80年代以来随着人类基因组生命科学与信息科学以及数学、物理、化学等学科相互交融而形成的新兴学科,是当今最具发展前途的学科之一。
人类基因组计划的顺利推进产生了海量基因数据,这些数据中蕴藏着丰富的生物学内涵,如果能充分挖掘并加以利用,可能揭示出很多对人类有用的信息。
生物信息学已经成为生物学、医学、农学、遗传学、细胞生物学等学科发展的强大推动力量。
随着生物信息学研究的深入与发展,它已不断渗透到医学领域的研究中。
近年来,伴随着对基因组的研究不断深入,部分应用领域取得了令人瞩目的突破,其潜在的经济利益更是吸引了众多国家、企业及大量科研人员投入到相关研究中,生物信息学得到了迅猛的发展。
一、主要数据库数据库是生物信息学的主要内容,各种数据库几乎覆盖了生命科学的各个领域。
截止至2010年,生物信息数据库总数已达1230个。
生物信息数据可可分为一级数据库和二级数据库。
一级数据库的数据都直接来源于实验获得的原始数据,只经过简单的归类整理和注释,如Genbank数据库、SWISS-PROT数据库;二级数据库是在一级数据库、实验数据和理论分析的基础上针对特定目标衍生而来,是对生物学知识和信息的进一步整理,如人类基因组图谱库GDB。
在医学领域中常用的生物信息数据库主要有:核酸类数据库,如NCBI核苷酸序列数据库(Gen Bank )、欧洲核苷酸序列数据库(EMBL)、日本DNA 数据库(DDB)等;蛋白相关数据库,如蛋白质数据库(SWISS-PROT)、蛋白质信息资源库(HR)、Entrez 的蛋白三维结构数据库(MMDB)、蛋白质交互作用数据库(DIP)等;疾病相关数据库,包括综合临床数据库,如NCBI疾病基因数据库、Gene Cards等;遗传性疾病数据库,如遗传性疾病数据库(GDB)、人类遗传性疾病数据库(Gene Dis)等;肿瘤相关数据库,如肿瘤基因组解剖工程(CGAP)等;心血管疾病相关数据库,如心血管疾病相关生物医学数据库(Cardio)、心脏疾病计划及临床决策支持系统(HDP &CDM)等;免疫性疾病数据库,如免疫功能分子数据库( HMM)、免疫缺陷资源库(IDR)等;药物相关数据库,如药物和疾病数据库(Drugs)、FDA药品评审与研究中心(CDER)等。
二、生物信息学在医学领域的应用2.1 生物信息学在医学基础研究中的应用2.1.1 新基因的发现与鉴定疾病的发生发展与特异基因的改变有关,鉴定与疾病相关的基因是科学家在积极探索的一个方向,对治疗某些疑难杂症带来新的契机。
发现新基因是当前国际上基因组研究的热点,使用生物信息学的方法是发现新基因的重要手段。
现在很多疾病的致病基因已经发现,包括癌症、肥胖、哮喘、心脑血管病等,其中与癌症相关的原癌基因约有1000个,抑癌基因约有100个。
目前发现新基因的主要方法有以下3种:①通过多序列比对从基因组DNA序列中预测新基因,其本质是把基因组中编码蛋白质的区域和非编码蛋白质的区域区分开来。
②基因的电子克隆,即以计算机和互联网为手段,通过发展新算法,对生物信息数据库中存储的表达序列标签进行修正、聚类、拼接和组装,获得完整的基因序列,以期发现新基因。
③发现单核苷酸多态性。
例如,2010年我国学者通过生物信息学EST 拼接技术,RT-PCR等技术,克隆出30个人类未知功能的新基因,并通过生物信息学分析该基因NCBI: NM_145315.3,其cDNA 全长为2 262bp,有13个外显子和12个内含子组成,主要定位于人6号染色体,该基因定位于细胞质中,MTT结果显示该基因能明显抑制细胞增值。
2.1.2 蛋白质结构、功能的预测蛋白质结构的预测有演绎法和归纳法两种途径。
前者主要是从一些基本原理或假设出发来预测和研究蛋白质的结构和折叠过程,如分子力学和分子动力学。
后者主要是从观察和总结已知结构的蛋白质结构规律出发来预测未知蛋白质的结构,如同源模建和指认方法。
随着功能基因组及蛋白质组学研究技术的发展,产生了许多蛋白相关数据库及分析软件,如ExPASy。
它能根据氨基酸组成辨识蛋白质,提供氨基酸组成,蛋白质的名称、等电点和相对分子质量以及它们的估算误差,所属物种或物种种类或全部标准蛋白的氨基酸组成等信息。
对于蛋白质结构和功能,尽管可以通过实验的方法来实现,但由于目前的蛋白检测的技术水平还远跟不上涌现如潮的基因的数量,蛋白结构、功能的预测研究现状还远远不能满足实际需要。
2.2 生物信息学在临床医学中的应用诺贝尔生理学医学奖获得者利根川进指出:人类的一切疾病都与基因受损有关。
疾病发生和转归的本质是遗传信息在一定环境条件下的外在表达。
随着人类基因组计划的深入研究,当明确了人类全部基因在染色体上的位置、序列特征(包括单核苷酸多态性sin—gle—nucleotide polymorphisms,SNPs)以及他们的表达规律和产物(RNA和蛋白质)特征以后,人们就可以有效地了解各种疾病发生的分子机制,进而发展适宜的诊断和治疗手段。
基因诊断又称DNA诊断或分子诊断,通过分子生物学和分子遗传学的技术,直接检测出分子结构水平和表达水平是否异常,从而对疾病做出判断。
基因诊断常用的方法有斑点杂交法、Southern印迹法、人工合成探针的直接探测法等。
例如血友病A 的基因诊断,可直接检测FⅧ基因突变,以及用间接基因诊断法对DNA多态性标志进行连锁分析,不仅可以揭示HA的致病机制,还可用于携带者检出及产前诊断。
目前,基因诊断已在感染性疾病、遗传病、肿瘤中应用,如人乳头瘤病毒(HPV)、乙肝病毒(HBV)、结核杆菌、HIV的检测,杜氏肌营养不良症的诊断,肿瘤的诊断、残留癌细胞的识别检测。
2.3 生物信息学在药物研发中的应用传统的药物研发方法具有耗时长、成本高等缺点。
创新药物的研究具有巨大的社会效益和经济效益。
目前生物信息学已经成为生物药物研究的重要工具和手段,以基因为基础的新药开发,已成为新药开发的关键方面。
生物信息学方法可以为药物研制提供了更多的、潜在的靶标。
而人类基因组计划和蛋白组计划的实施、大量疾病相关基因及作用靶点的发现、生物信息学的兴起、为新药设计提供新的理论和思路。
寻找先导化合物是新药物研发的关键,药物作用的基础是先导化合物与靶蛋白的结合进而阻断靶蛋白的功能或改变其功能状态。
生物信息学方法在这方面的作用越来越受到重视,常用的方法有:①三维结构搜寻:又称数据库搜寻法或数据库算法,即利用计算机人工智能的模式识别技术,把三维结构数据库中的小分子数据逐一地与搜寻标准(即提问结构)进行匹配计算,寻找符合特定性质和三维结构形状的分子,从而发现合适的药物分子。
②分子对接:首先要建立大量化合物的三维结构数据库,然后依次在数据库中搜索小分子配体使其与受体的活性位点结合,并通过优化取向和构象,使得配体与受体的形状和相互作用最佳匹配。
最开始的分子对接方法是刚性的分子对接法,后来又发展为柔性的对接方法。
③三维结构生成:又称从头设计,即让计算机自动设计出与受体活性部位的几何形状和化学性质相匹配的结构新颖的药物分子。
部分药物的应用获得了丰厚的市场回报,其潜在的经济利益更使得以企业为主体的相关研究乐此不疲。
但值得注意的是,因为应用范围有限、应用时间偏短、对有关代谢作用机制仍不十分清楚等原因,这些药物的临床缺陷尚掩盖在其前所未有的治疗效果中。
因此,基因药物的发展及应用必须适应生物信息学相关研究的发展,任何超前或草率的行为,都有可能产生竟想不到的负面影响。
2.4 建立与医学有关的生物信息学数据库随着对人类疾病基因研究的深入,一些与医学有关的生物信息学数据库相继建立。
如人类遗传性疾病数据库(GeneDis)、心脏疾病计划及临床决策支持系统(HDP&CDM)、转基因/靶基因突变数据库(TBASE)、FDA药品评审与研究中心(CDER)。
如肿瘤及血液病的遗传和细胞遗传学数据库(Atlas of Genetics and Cytogenetics in Oncology and Haematology),这个数据库收集了癌症及易于进展为癌症的疾病的基因、细胞遗传学和临床特征等信息,主要服务于细胞遗传学、分子生物学、肿瘤学、血液病学和病理学的研究人员和临床医师。
由法国波瓦第尔大学( Poitiers University )、法国肿瘤细胞遗传学协会等机构创办,其中信息由研究人员在线提交并由专家审核后入库。
三、总结与展望目前,一些生物信息学工具已经应用于临床,为临床诊断、预防、治疗、临床疗效评估提供了有力的武器。
作为人类基因组计划的生物信息学分析成果,更多疾病相关基因将被发现和鉴定,同时新的药物分子靶点将被发现和确立。
生物信息学将有助于鉴定疾病易感基因、阐明疾病发生的分子机理,从而有机会发展针对疾病关键发生途径的治疗手段。
生物信息学不仅能推动医学领域未来的发展,对未来农业、食品、化妆品、环保、能源等众多领域也将产生深远的影响。
而从生物信息学的研究结果来看,其不仅具有重要的理论价值,更重要的是具有实际的应用价值,其产生的效益将是相当惊人。
我们有充分理由相信,生物信息学将在21世纪里继续得到迅速的发展,其对推动生物科学的发展、增进人类对自身的了解、增进人类对大自然的了解,所起的作用将是不可估量的。
参考文献:[1]孙红,殷作群,孙妍,丁瑜.生物信息学在医药学领域中的应用[J].医学信息,2011, 24(9).[2]巫晓芳,刘充.基因诊断技术进展[J].检验医学与临床,2010,10(20):2287-2288.[3]陶志彬,李晓晖,王学生.人类新基因LACE1的克隆和特性初步分析[J]. 生物技术,2011,21(2):1-7.[4]赵军平,赵亚力.生物信息学与医学:基因组学是生物信息学的先导[J].2010.[5]李润花,贾宝财.生物信息学在生物医学与药物开发中的应用[J].食品工程,2010, (2):16-19.[6]杨咏梅,曲迅,曹玉关. 生物信息学在医学研究中的应用进展[J].医学综述,2007, 13(22):1681-1683.[7]朱杰.生物信息学的研究现状及其发展问题的探讨[J].生物信息学,2005,3(4): 185-188.[8]汪凡军,张楚瑜.生物信息学在医学上的应用[J]. 国际检验医学杂志,2006,27(2):161-163.[9]王玉梅,王艳.国外生物信息学发展动态分析[J]. 科技情报开发与经济,2002,12(6):83-85.[10]杨畅,方福德.肿瘤生物信息数据库(1) [J].癌症进展杂志,2004,2(4): 306-315.。