量子化学计算方法
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方法得到的计算结果作为参照，该方法主要用于系列化合物 的研究：如对A1, A2, A3，先用大模型和基组对A1进行研究， 然后以该结果为参照，确定计算量适中的模型和方法并应用 于A1,A2,A3。
Gaussian03程序的使用
• G03的安装和运行； • G03的功能和程序结构； • 输入文件的编写与主要功能的使用； • 补充说明；
Gaussian 98/03: 由Pople等人编写，经过几十年的发展和完
善，
该软件已成为国际上公认的、计算结果具有较高
可靠性的量子化学软件，它包含从头算、半经验
以及分子力学等多种方法，可适用于不同尺度的
有限体系，除了部分稀土和放射性元素外，它可
处理周期表中其它元素形成的各种化合物；
Crystal 98/03： 该软件由意大利都灵大学理论化学研究所开
2.G03程序的运行：
(1).对Windows平台： a.对于刚安装好的g03，先检查环境设置情况：
需设置正确， 否则运行将出错！
左侧至上而下依次为：默认的文本编辑器；g03可执行文件所在目录； 计算中间结果存放目录；缺省的计算结果存储目录；缺省的输入文件 所在目录；PDB分子构型浏览器；
右侧至上而下依次为：设置显示属性(如背景色等)；设置文本编辑器 属性；计算过程控制属性(尤其是批作业过程)；Default.Rou文件的 编 辑(该文件内容为默认情况下，计算所花费的内存及硬盘大小)
因此，当确定了一种计算模型和方法后，最好对其进行验证， 以保证计算结果的可靠性。假设当前的研究对象是化合物A， 可通过下列途径进行验证： 1. 与A化合物现有实验结果之间的比较； 2. 若无实验方面的报道，可对与A类似的化合物B进行研究，此
时以B的实验结果作为参照； 3. 当上述方法行不通时，可以采用较大模型和较为高级的计算
G03程序的安装和运 1. G03程序的安行装：
(1).确定运行平台：Windows或Linux？ (2).对Windows平台：
直接运行setup.exe，其余步骤按提示操作即可；也可将其 它机
器上将已安装好的G03直接拷贝到本机，但需设置运行环境。 对Linux平台： a.若G03是经过压缩过的(文件结尾为gz)，用gunzip命令解 压：
例如： gunzip g03.linux.tar.gz b.若G03是打包的(文件结尾为tar)，用tar命令将其释放：
例如： tar xvf g03.linux.tar ab两步合成一步方法： tar zxvf g03.linux.tar.gz
c.设置环境变量，以c shell为例，在用户根目录下的.cshrc文件 添加下列内容：(也可在执行g03前逐条运行) setenv g03root /home/$USER(设置g03所在目录，根据实际
对计算结果进行加工和提取有用 的信息，一般包括构型描述、 能量分析、轨道组成、电荷和成 键分析等，并与实验结果比较
计算模型和方法的选取是保证计算结果可靠性的关键， 理想的情况是：1.所选取的计算模型与实际情形一致；2.采用 高级别的计算方法。但是，由于受到计算软硬件的限制，在多数 情况下，很难同时做到上述两点要求，实际操作中，当计算模 型较大时，只能选择精确度较低的计算方法，只有对较小的模 型才能选取高级的计算方法。
情况修改) source $g03root/g03/bsd/g03.login(激活g03运行时所需
环境变量) setenv GAUSS_SCRDIR /home/$USER/g03_tmp(设置临
时目录) d.运行bsd/install，自动配置并行计算环境
注：对Linux平台，运行g03时，需注意权限问题，可用chmod 命令更改权限，将所安装的g03对所有用户开放。
简介
量子化学软件目的在于将量子化学复杂计算过程程序化，从 而便于人们的使用、提高计算效率并具有较强的普适性。
绝多数量子化学程序是采用Fortran语言编写的(Fortran 77或Fortran 90)，通常由上万行语句组成。
软件分类
计算原理 研究对象
wenku.baidu.com
基于从头算或第一性原理方法 (ab initio/first principles) Gaussian、ADF、Dalton、 Gamess、Crystal、VASP、 Wien、Dmol等
量子化学计算方法
课程主要内容
一、有限尺度体系(分子、团簇等)电子结构计算 方法－G03程序的使用
二、无限周期体系(一维链状化合物、二维层状 化合物或固体表面、三维固体体相)电子结 构计算方法－VASP/CASTEP程序的使用
主要参考资料: G03用户手册或G03的帮助文件 VASP程序用户手册
相应网址: www.gaussian.com
2.确 定 计 算 目 的
采用理论方法要解决的问题
3.计 算 模 型 的 构 造
化合物构型的确定，具体途径包 括：利用实验测定结果、或者采 用软件进行构造等
4.计 算 方 法 和 程 序 的 选 取 5.计 算 结 果 的 分 析 和 整 理
根据现有的计算条件、模型的大 小以及所要解决的问题，选择可 行的计算方法和相应程序
b.编写或打开g03输入文 件
点击RUN，并给定输 出 文件名后开始运行
c.g03运行过程的控制：
不要随意点击！
最上行按钮的功能从左至右依次为： 开始运行g03；暂停进程；运行至下一模块(link)时暂停进程； 重新启动进程；清除进程(停止运算)；编辑批作业；运行完 当前任务后，暂停批作业；停止批作业的运算；观看计算结 果；打开文本编辑器；
基于半经验或分子力学方法 MOPAC、EHMO、NNEW3 等有限尺度体系(分子、簇合物等) Gaussian、ADF、Dalton、 Gamess、MOPAC、EHMO等
无限周期重复体系(晶体、固体 表面、链状聚合物等) Crystal、NNEW3、VASP、 Wien等
本研究室目前常用的量化软件：
发，
采用基于原子轨道线性组合的从头算方法来研究
固体及表面的电子结构；
VASP:
该软件由奥地利维也纳大学开发，采用基于平面波
基组的密度泛函理论来研究固体及表面的构型以
及
动力学过程；
CASTEP： MS软件模块之一，与VASP程序类似；
计算过程
1.文 献 调 研
当前的研究状况，包括实验和理 论研究现状、已解决和尚未解决 的问题
Gaussian03程序的使用
• G03的安装和运行； • G03的功能和程序结构； • 输入文件的编写与主要功能的使用； • 补充说明；
Gaussian 98/03: 由Pople等人编写，经过几十年的发展和完
善，
该软件已成为国际上公认的、计算结果具有较高
可靠性的量子化学软件，它包含从头算、半经验
以及分子力学等多种方法，可适用于不同尺度的
有限体系，除了部分稀土和放射性元素外，它可
处理周期表中其它元素形成的各种化合物；
Crystal 98/03： 该软件由意大利都灵大学理论化学研究所开
2.G03程序的运行：
(1).对Windows平台： a.对于刚安装好的g03，先检查环境设置情况：
需设置正确， 否则运行将出错！
左侧至上而下依次为：默认的文本编辑器；g03可执行文件所在目录； 计算中间结果存放目录；缺省的计算结果存储目录；缺省的输入文件 所在目录；PDB分子构型浏览器；
右侧至上而下依次为：设置显示属性(如背景色等)；设置文本编辑器 属性；计算过程控制属性(尤其是批作业过程)；Default.Rou文件的 编 辑(该文件内容为默认情况下，计算所花费的内存及硬盘大小)
因此，当确定了一种计算模型和方法后，最好对其进行验证， 以保证计算结果的可靠性。假设当前的研究对象是化合物A， 可通过下列途径进行验证： 1. 与A化合物现有实验结果之间的比较； 2. 若无实验方面的报道，可对与A类似的化合物B进行研究，此
时以B的实验结果作为参照； 3. 当上述方法行不通时，可以采用较大模型和较为高级的计算
G03程序的安装和运 1. G03程序的安行装：
(1).确定运行平台：Windows或Linux？ (2).对Windows平台：
直接运行setup.exe，其余步骤按提示操作即可；也可将其 它机
器上将已安装好的G03直接拷贝到本机，但需设置运行环境。 对Linux平台： a.若G03是经过压缩过的(文件结尾为gz)，用gunzip命令解 压：
例如： gunzip g03.linux.tar.gz b.若G03是打包的(文件结尾为tar)，用tar命令将其释放：
例如： tar xvf g03.linux.tar ab两步合成一步方法： tar zxvf g03.linux.tar.gz
c.设置环境变量，以c shell为例，在用户根目录下的.cshrc文件 添加下列内容：(也可在执行g03前逐条运行) setenv g03root /home/$USER(设置g03所在目录，根据实际
对计算结果进行加工和提取有用 的信息，一般包括构型描述、 能量分析、轨道组成、电荷和成 键分析等，并与实验结果比较
计算模型和方法的选取是保证计算结果可靠性的关键， 理想的情况是：1.所选取的计算模型与实际情形一致；2.采用 高级别的计算方法。但是，由于受到计算软硬件的限制，在多数 情况下，很难同时做到上述两点要求，实际操作中，当计算模 型较大时，只能选择精确度较低的计算方法，只有对较小的模 型才能选取高级的计算方法。
情况修改) source $g03root/g03/bsd/g03.login(激活g03运行时所需
环境变量) setenv GAUSS_SCRDIR /home/$USER/g03_tmp(设置临
时目录) d.运行bsd/install，自动配置并行计算环境
注：对Linux平台，运行g03时，需注意权限问题，可用chmod 命令更改权限，将所安装的g03对所有用户开放。
简介
量子化学软件目的在于将量子化学复杂计算过程程序化，从 而便于人们的使用、提高计算效率并具有较强的普适性。
绝多数量子化学程序是采用Fortran语言编写的(Fortran 77或Fortran 90)，通常由上万行语句组成。
软件分类
计算原理 研究对象
wenku.baidu.com
基于从头算或第一性原理方法 (ab initio/first principles) Gaussian、ADF、Dalton、 Gamess、Crystal、VASP、 Wien、Dmol等
量子化学计算方法
课程主要内容
一、有限尺度体系(分子、团簇等)电子结构计算 方法－G03程序的使用
二、无限周期体系(一维链状化合物、二维层状 化合物或固体表面、三维固体体相)电子结 构计算方法－VASP/CASTEP程序的使用
主要参考资料: G03用户手册或G03的帮助文件 VASP程序用户手册
相应网址: www.gaussian.com
2.确 定 计 算 目 的
采用理论方法要解决的问题
3.计 算 模 型 的 构 造
化合物构型的确定，具体途径包 括：利用实验测定结果、或者采 用软件进行构造等
4.计 算 方 法 和 程 序 的 选 取 5.计 算 结 果 的 分 析 和 整 理
根据现有的计算条件、模型的大 小以及所要解决的问题，选择可 行的计算方法和相应程序
b.编写或打开g03输入文 件
点击RUN，并给定输 出 文件名后开始运行
c.g03运行过程的控制：
不要随意点击！
最上行按钮的功能从左至右依次为： 开始运行g03；暂停进程；运行至下一模块(link)时暂停进程； 重新启动进程；清除进程(停止运算)；编辑批作业；运行完 当前任务后，暂停批作业；停止批作业的运算；观看计算结 果；打开文本编辑器；
基于半经验或分子力学方法 MOPAC、EHMO、NNEW3 等有限尺度体系(分子、簇合物等) Gaussian、ADF、Dalton、 Gamess、MOPAC、EHMO等
无限周期重复体系(晶体、固体 表面、链状聚合物等) Crystal、NNEW3、VASP、 Wien等
本研究室目前常用的量化软件：
发，
采用基于原子轨道线性组合的从头算方法来研究
固体及表面的电子结构；
VASP:
该软件由奥地利维也纳大学开发，采用基于平面波
基组的密度泛函理论来研究固体及表面的构型以
及
动力学过程；
CASTEP： MS软件模块之一，与VASP程序类似；
计算过程
1.文 献 调 研
当前的研究状况，包括实验和理 论研究现状、已解决和尚未解决 的问题