UniProt数据库检索及数据条目注释信息

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2.4《网络大数据库的信息检索》教学设计课题

信息技术说课稿 说课题目:《网络数据库的信息检索》 年级:高一年级教科书:《信息技术基础》 说课老师:王琳蝉 工作单位:屯昌县红旗中学 一、说教材: 1、教材地位和作用 本节容是教育科学《信息技术基础》教材第二章第四节“网络数据库的信息检索”的容。本节教材分三部分构成,一是概述,教材通过一个简单的实例来体验从网络数据库获取信息的一般过程,目的是为学习网络数据库的基本知识做准备性的铺垫。二是多样化的网络数据库,教材对这部分容介绍比较多,意在让学生充分体验网络数据库的多样性和学会对各数据库信息的获取方法。三是网络数据库评价,在本章的最后重点安排了网络数据库的评价,目的是进一步提醒教师,在信息获取活动中,要培养学生及时、科学地评价信息的习惯,这是提高获取信息资源质量的关键,也是积累信息获取经验的关键一环。在本课教材访问丰富多彩的数据库这个模块中,应适当引导学生对资源进行点评,引导学生探索数据库这一现代信息管理手段的特点,为第七章中数据库知识的学习打下基础。 2、学生状况分析 ⑴虽然学生在初中有信息课,但是作为副科没有参加升学考试,所以学生在课堂上多数的时间是玩游戏、聊天,没有纠正学习这门课程的学习态度。初中学生上了高中后,其信息技术意识层次不齐,这就要教师有计划培养学生的信息技术意识。 ⑵经过半个学期的学习,高一学生自觉性有所提高一般具备了一定的网络操作技能,这样对于本节课的学习已经有了相关知识上的准备。 3、教学目标 (1)知识与技能目标: ①学生了解网络数据库 ②学会简单的信息检索 ③体会到网络数据库的重要作用 ④运用网络数据库检索获取需要的信息容

(2)能力目标: ①培养学生利用网络数据库提高信息获取的能力 ②引导学生着重从资源获取的角度来审视数据库的价值 (3) 情感与价值观目标: ①在同学的互助下交流合作中,培养合作意识和合作精神 ②培养学生遵守网络道德,规、合法地获取网络资源 4、教学重点与难点: 学习重点:网络数据库的理解、网络数据库的多样性、网络数据库信息的检索 学习难点:对网络数据库信息的检索、学生要用科学的评价方式判断所得信息的准确性 二、说教学 教学过程实质上是学生主动学习的过程,强调激发学生的兴趣,力求形成学生强烈的学习动机和乐学、善学的学习态度。本节是采用任务驱动法导入新课,采取合作探究法解决提出的任务,对于同学们的作答采取了赏识教育法树立大家的自信心。再利用提问启发法去发现新的问题,从而导入本节的容。在新课网络数据库简介中,我采用了列举法和图表法加深对网络数据库概念的理解。网络数据库信息检索的一般过程和数字城市的介绍上都分别用了演示学习法,演示具体的各个操作步骤。网络数据库信息检索的一般过程和教育资源库的使用,都采取小组分工制合作探究法解决提出的任务。 三、说学法 教学指导在于提高学生的个性发展和全面发展。通过本节教学,主要使学生掌握以下几种学习方法: ①培养学生利用教材、网络自主学习的能力 ②培养学生动手操作能力 四、教学过程 1、导入新课 首先复习旧知识,使用任务驱动法导入新课

Uniprot数据库介绍及信息检索下载指南

UniProt数据库 一、UniProt数据库简介 蛋白质组常用数据库——UniProt数据库,是信息最丰富、资源最广的蛋白质数据库。它由Swiss-Prot、TrEMBL 和PIR-PSD三大数据库的数据整合而成,数据主要来自于基因组测序项目完成后,后续获得的蛋白质序列,并包含了大量来自文献的蛋白质生物功能的信息。一般蛋白质组搜库首选数据库也是UniProt,所以对于通过UniProt库搜库的组学数据,可以在此网站中进行蛋白功能查询。UniProt数据库可以提供的信息包括蛋白功能描述、GO条目、细胞定位、组织特异性表达情况、生理病理情况描述、互作蛋白、Domain、翻译后修饰位点等信息。蛋白的信息描述段落均会标出引用文章,并且可以跳转到PubMed界面进行浏览。 UniProt 数据库由UniProt 知识库(UniProtKB )、UniProt 档案(UniParc )、UniProt 参考资料库(UniRef)以及UniProt元基因组学与环境微生物序列数据库(UniMES)构成。 UniProtKB全称 UniProt Knowledgebase(UniProt知识库)它是经过专家校验的数据集,主要由两部分组成:UniProtKB/Swiss-Prot (包含检查过的、手工注释的条目) 和 UniProtKB/TrEMBL (包含未校验的、自动注释的条目)。Swiss-Prot 数据库特点高质量的、手工注释的、非冗余的数据集;主要来自文献中的研究成果和E-value校验过计算分析结果。有质量保证的数据才被加入该数据库!TrEMBL数据集包含高质量的计算分析结果,一般都在自动注释中富集,主要应对基因组项目获得的大量数据流以人工校验在时间上和人力上的不足。它能注释所有可用的蛋白序列。在三大核酸数据库(EMBL-Bank/GenBank/DDBJ)中注释的编码序列都被自动翻译并加入该数据库中。它也有来自PDB数据库的序列,以及Ensembl、Refeq和CCDS基因预测的序列。 UniParc全称是UniProt Archive(UniProt 档案),他是一个综合性的非冗余数据库,它包含了所有主要的、公开的数据库的蛋白质序列。由于蛋白质可能在不同的数据库中存在,并且可能在同一个数据库中有多个版本,为了去冗余,UniaraParc对每条唯一的序列只存一次!无论是否为同一物种的序列,只要序列相同就被合并为一条,每条序列提供稳定的、唯一的编号UPI。该数据库只含有蛋白质的序列信息,而没有注释数据。 UniRef(UniProt 参考资料库)可以通过序列同一性对最相近的序列进行归并,加快搜索速度。UniRef对来自UniProtKB的各种数据包括各种剪接变异体进行了分类汇总,还从UniParc中选取了一些数据以求能完整的、没有遗漏的

实用生物信息技术课程第3次作业UniProt数据库高级检索及数据条目

实用生物信息技术课程第3次作业 1 序列比对 姓名________ 学号______________ 编号_________ 日期__________ 1. 从UniProt 数据库中提取人、小鼠、大鼠血红蛋白alpha 亚基蛋白质序列,进行全局比 对,选择默认计分矩阵BLOSUM62和空位罚分,将比对结果填入表1。分析比对结果,说明得到上述结果的原因和进一步分析思路。 表1 人、小鼠、大鼠血红蛋白alpha 亚基蛋白质序列比对结果 物种 Species 登录号 Accession 得分 Score 相同氨基酸 Identity 相同和相似氨基酸 Similarity 空位 Gaps 人/小鼠 / 人/大鼠 / 小鼠/大鼠 / 2. 从RefSeq 数据库中提取人、小鼠、大鼠血红蛋白alpha 亚基编码区序列,进行全局比 对,将结果填入表2。选择不同计分矩阵和空位罚分,分析比对结果。 表2 人、小鼠、大鼠血红蛋白alpha 亚基mRNA 编码区序列比对结果 物种 Species 登录号 Accession 得分 Score 相同核苷酸 Identity 相同和相似核苷酸 Similarity 空位 Gaps 人/小鼠 / 人/大鼠 / 小鼠/大鼠 / 3. 从UniProt 数据库中检索并提取人血红蛋白alpha 亚基和胞红蛋白(Cytoglobin )序列, 分别进行全局比对和局部比对,将比对结果填入表3。分析比对结果,说明全局比对和局部比对的差别。 表3 人血红蛋白alpha 亚基和beta 亚基蛋白质序列比对结果 比对方法 长度 得分 相同氨基酸 相同和相似氨基酸 空位 Needle Water 4. 将上述数据库检索、序列比对、结果分析的方法、思路、策略用于和你研究课题相关或 你熟悉的蛋白质及其编码序列,分析比对结果,说明原因。

万方数据库检索方法

万方数据库论文检索方法 一些作者通过我们发表了职称论文,也拿到了刊物,经常回来问我们怎么检索自己的文章,发现自己检索不到文章。在此,我们专门针对这部分作者,谈一下在万方数据库,检索已发表论文的方法,如果感觉本文档对您有用请及时下载,以免文档下线。更多论文发表相关信息可以阅读我们撰写的其他文章,如《职称论文发表全攻略》、《职称论文发表网站解惑》、《职称论文发表网站答疑》等文章。 1.在万方检索论文,首先弄清楚的一点就是你发表的论文,发表论文的期刊,是否在万方数据库有收录。有的作者发表到了假的刊物上,而那个刊物根本没有任何数据库收录,只有龙源期刊网收录了,这样的论文自然在万方是检索不到的。关于假刊的辨别,在此不再赘述大家可以阅读我们之前撰写的文章《如何发表论文才能避免上当受骗》上面有详细的讲解。 2.确保你发表论文的期刊,是被万方数据库收录的,那么接下来,我们就开始检索已经发表的论文。第一步,登陆万方数据库的首页,进入首页后,我们会发现首页上有个搜索栏,搜索栏的上方有一排选项卡:“学术论文,期刊,学位,会议,外文文献,学者……”等,有两种方式可以进行检索,一种是通过论文题目进行检索,一种是通过期刊进行检索,下面我们分别举例说明两种检索方法,作者可以按照我们所说的流程进行操作。 比如题目为《我国高校生源危机的原因及对策》的论文,作者为:蒋洪池、李文燕。发表在《高教探索》2014年第3期上,那么如何进行检索呢。 (1)检索论文题目。这种方法很简单,就是把论文题目复制,粘贴到搜索栏里,这里要确保,搜索栏上方的选项卡为“学术论文”然后点击“检索”就可以了。

往往在新弹出的页面会出现好几个甚至好几页类似的文章题目的结果,在这里找到和作者名字刊物一致的结果,点开就可以了。这种方法的好处是简单方便操作,不方便的就是如果遇到比较大众化的题目,检索起来,结果就会很多,需要挨个去找。 (2)通过检索期刊检索论文。前面提到了,如果文章题目不是很大众化,那么就可以直接通过检索论文进行检索,如果文章题目大众化一些,那么可以通过检索期刊进行检索。如上面的文章,我们已经知道发表在《高教探索》2014第3期上,那么我们就可以直接检索期刊。在万方数据库首页上,点击“期刊”选项卡,点击期刊之后,就是说我们要检索期刊了。然后输入“高教探索”(注意这里只输入文字,不要加任何标点符号),然后点击“搜索”就可以了。这样,就会弹出新的页面,也就是杂志的页面,点开杂志的页面,我们会看到,右侧会有一个目录,年份,期数。点击2014下面的“3”,就进入了3期的目录里,在目录找到相应的文章和作者姓名就可以了。好了,先说的这里吧,鉴于一些第一次发表论文的作者经常问到这个问题,才专门来说明一下,希望对大家有帮助吧。如果还有其他职称论文发表方面的疑问或者问题,可以通过输入lunwentaotao 点卡姆来找到我们查看我们上面的论文发表信息,或者直接加我们的企鹅号0,我们会为你答疑解惑。 万方数据库是由万方数据公司开发的,涵盖期刊、会议纪要、论文、学术成果、学术会议论文的大型网络数据库;也是和中国知网齐名的中国专业的学术数据库。其开发公司——万方数据股份有限公司是国内第一家以信息服务为核心的股份制高新技术企业,是在互联网领域,集信息资源产品、信息增值服务和信息处理方案为一体的综合信息服务商。

文摘索引型数据库和全文数据库区别

通过对文摘索引型数据库和全文数据库的现状进行比较, 总结出两类数据库的相同和不同特征 两类数据库检索系统的相同特征 1,网络检索 无论是国外引进还是国内购置及自我开发,网络版数据库检索。网络检索方式有很多优势优势,读者可直接在任意具有权限的连接的计算机上利用通用的浏览器便捷地检索。可同时检索同一若干年代的累积数据或相关数据库的相关数据。 2,资源整合和集成检索 用户可以在同一平台上跨库检索,读者可在多个数据库的基础上跨库检索。 3,融菜单检索和高级检索于一体 文摘索引型和全文数据库都是直接面对大众读者,所以都能提供简单的菜单式检索,读者通过点击和选择菜单命令和利用检索窗口的功能键或功能词实现简单的检索。为了读者解决对复杂一点的检索往往无能为力的情况,两类数据库一般都提供了高级检索形式来实现。4,综合运用布尔检索、截词检索和位置检索等检索技术,这些传统检索技术功能就是在文摘索引型数据库检索基础上发展起来的。 5数据库检索人性化,用户无论是普通读者还是非专业人士,对检索界面、检索过程、检索帮助、个性检索、结果输出等方面一目了然。 两类数据库检索系统的不同特征 文摘索引型数据库和全文数据库的最大差别就是前者结果只提供题录和文摘等二次文献信息,后者除可提供二次文献信息外,还能提供作者原文的一次文献信息。 1,检索途径存在着差异 检索途径有主题,分类及除此之外的作者、号码等其它辅助途径, 通过数据库设置的检索字段反映检索途径的实现。不同的数据库根据检索的实际需要设置检索字段。全文数据库设置的检索字段一般较文摘索引型数据库少 2,收录文献的原则和目的不同,数据库所起的作用不同。文摘索引型数据库一般收录特定时期的综合学科领域或某一学科分支的相同或不同出版类型的文献。文摘索引型数据库能反映某一段时间内某一学科某一领域的理论和方法的进展及技术与手段的应用。全文数据库以为用户提供利用一次文献为主要宗旨,其数据库商必须和着者或出版单位商谈着作使用权问题,只有双方达成协议签署合同,并履约支付着作权报酬才能使用文献原文而收录数据库。因此全文数据库不可能存在收录文献全面性问题。相对而言,全文数据库很难像文摘索引数据库那样从宏观上反映某一学科某一领域的学术进展情况, 更不可能充当学术评价的工具。 3 ,检索技术的运用不尽相同 检索原理的不同,文摘索引型数据库是以记录组织文献, 处理每一条记录依据基于文献内容的特征属性和文献外表的特征,体现传统的布尔检索、截词检索和位置检索等功能。全文数据库主要通过运用对整个文本信息的分析,利用将全部文本划分为主题紧凑的不同子段,用不同的关键字特征标注各子段的文本切分技术和计算机自动进行全文自动抽词标引来处理原始文献的。全文检索技术能体现关键词在子段和全文出现的频率和分布,处理的是典型的非结构化的非线性的数据。 4,主题检索特征不同 文摘索引型数据库在提供自然语言的同时,一般都有自己的主题词表反映数据库中各检索词之间的关系,依据主题词表对文献进行主题标引,对每篇文献给出若干个主题词。全文数据库一般没有自己的主题词表, 主题检索依靠不加规范的自然语言实现。使用自然语言主要是基于检索最终用户的大众化, 最大好处就是避免了人工标引的随意性、繁琐性,提高了处理数

网络数据库的信息检索教案

《网络数据库的信息检索》教学设计 一、教材内容分析 本节内容是教育科学出版社《信息技术基础》教材第二章第四节“网络数据库的信息检索”的内容。本节教材分三部分构成,一是概述,教材通过一个简单的实例来体验从网络数据库获取信息的一般过程,目的是为学习网络数据库的基本知识做准备性的铺垫。二是多样化的网络数据库,教材对这部分内容介绍比较多,意在让学生充分体验网络数据库的多样性和学会对各数据库信息的获取方法。三是网络数据库评价,在本章的最后重点安排了网络数据库的评价,目的是进一步提醒教师,在信息获取活动中,要培养学生及时、科学地评价信息的习惯,这是提高获取信息资源质量的关键,也是积累信息获取经验的关键一环。在本课教材访问丰富多彩的数据库这个模块中,应适当引导学生对资源进行点评,引导学生探索数据库这一现代信息管理手段的特点,为数据库知识的学习打下基础。 二、学生情况分析 学生已具备了一定的网络操作技能,对本节课的学习已经有了相关知识上的准备。在前面的课中,学生在不经意中已经使用到了网络数据库,比如小说网、音乐网等等,只是自己不知道而已。本节课选用有较强的代表性而学生一般都没有使用过的网络数据库。 三、教学目标分析 (1)知识与技能目标:

了解网络数据库;学会简单的信息检索;运用网络数据库检索获取需要的信息内容 (2)能力目标: ①培养学生利用网络数据库提高信息获取的能力 ②引导学生着重从资源获取的角度来审视数据库的价值 (3) 情感与价值观目标: ①在同学的互助下交流合作中,培养合作意识和合作精神 ②培养学生遵守网络道德,规范、合法地获取网络资源 四、重难点分析 重点:理解网络数据库、网络数据库的多样性、网络数据库信息的检索难点:对网络数据库信息的检索、评价 五、教学策略设计 教学过程实质上是学生主动学习的过程,强调激发学生的兴趣,力求形成学生强烈的学习动机和乐学、善学的学习态度。本节是采用情景设置法,从“神奇的化学实验——大象牙膏”入手,吸引学生的学习兴趣,引导学生进入欢快的化学学习之旅。然后设置疑问:你能帮化学教师搜索到不同版本的教学资料吗?进而导入本节的内容——利用网络数据库来解决问题。在进行网络数据库新课内容时,通过设计自主学习、合作探究、任务驱动及成果展现四个大环节,让学生去认识、感受、体验、评价网络数据库。使学生对网络数据库信息检索这一重难点从感性认识提升到理性理解,从而实现本节课的学习目标。 六、教学资源与媒体准备

国内三大中文期刊全文数据库的比较

国内三大中文期刊全文数据库的比较研究(建议新手查阅) 中国期刊网全文数据库》、《维普中文科技期刊数据库》和《万方数据库资源系统数字化期刊》是国内影响力和利用率很高的综合性中文电子期刊全文数据库,这三个数据库已经成为大多数高等院校、公共图书馆和科研机构文献信息保障系统的重要组成部分。在互联网中,这三大数据库也成为中文学术信息的重要代表,体现了我国现有的中文电子文献数据库的建设水平。 笔者结合工作和学习中的实践,就上述三大数据库的收录情况、检索功能、检索结果、检索界面、用户服务等方面进行全面的比较,并通过检索实践举例进行比较分析,以供参考。 1 收录情况(数据较早,甚至不是2004年的数据,感觉更像2002年左右的数据,后面将尽可能给出最新的数据值。) 收录范围与数量 《中国期刊网全文数据库》(本文中简称“清华”)是由清华同方光盘股份有限公司、光盘国家工程研究中心和中国学术期刊(光盘版)电子杂志社共同研制出版的综合性全文数据库。该数据库收录自从1994年来公开出版发行的6600余种国内核心期刊和一些具有专业特色的中英文期刊全文,累积全文文献618万多篇,题录1500万余条,按学科分为理工A(数理科学)、理工B(化学化工能源与材料)、理工C(工业技术)、农业、医药卫生、文史哲、经济政治与法律、教育与社会科学、电子技术与信息科学九大类,126个专题文献数据库。 《中文科技期刊数据库》(本文中简称“维普”)由科技部西南信息中心主办,重庆维普资讯有限公司制作。其前身为《中文科技期刊篇名数据库》。该数据库收录了自1989年以来国内出版发行的12000种期刊,其中全文收录8000余种,按学科分为经济管理、教育科学、图书情报、自然科学、农业科学、医药卫生、工程技术等7大类,27个专辑,200个专题,按《中图法》编制了树型分类导航和刊名导航系统,基本覆盖了国内公开出版的具有学术价值的期刊,同时还收录了中国港台地区出版的108种学术期刊,积累700余万篇全文文献,数据量以每年100万篇的速度递增。 《万方数据资源系统数字化期刊》(本文中简称“万方”)是万方数据库资源系统三大组成部分之一,由中国科技信息研究所属下的北京万方数据股份有限公司创办。万方期刊收录了我国自然科学的大量期刊以及社会科学的部分期刊,范围包括基础科学、医药卫生、农业科学、工业技术、人文科学等5大类,以及英文版期刊、中国科学系列杂志,共2500多

westlaw使用指南

Westlaw International 法律在线数据库检索指南 1.主界面介绍 进入Westlaw之后的界面可以分为三大部分,页面上部为导航栏,页面左侧为快速检索区,页面右侧为检索输入区。 1.1 上方导航栏 上方导航栏共有六个标签,分别是:World Journals(期刊)、Federal(美国法律)、WLI General Subscription(所有内容)、Westlaw UK(英国法律)、Westlaw Australia(澳大利亚法律)、LawSource(加拿大法律)。 1.2 快速检索区 快速检索区有两个检索项,即Find by citation和Search these databases。 如果知道文献的引称信息(citation),比如案例文献编号、法律条例编号等,可直接通过Find by citation查询。不同类型的文献,其引称格式也不同,引称一般以该文献的出版物名称、卷、页码或年份、卷、出版物名称、页码的格式,如294 F SUPP 2D 132 、1999 1 AC 197。对各种类型文献的citation格式,系统提供查询,另外系统还可限定文献的出版国。上述功能也可通过首页工具栏的“FIND”实现。 如果您需要查询的数据库没有在当前的标签页列出,可通过Search these databases,在订购的所有数据库中查询,在检索结果列表中选择所需要的数据库进行检索。如果选择的是相同类型的多个数据库,检索界面将提供和该类文献特点有关的多个检索字段,比如选择案例库,提供的检索字段有代理人或律师、法院、法官、司法解释、标题等,使用户能实现更精确的检索。如果选择不同类型的多个数据库,因文献类型不同,没有共有字段,所以检索范围只能为全文检索,不能限定检索字段。 1.3检索输入区 系统提供两种检索方式,即“字词及连接符” (Terms and Connectors)和“自然语言”(Natural Language)。使用“字词及连接符”进行检索时,可同时限定文献的出版日期。字词之间的连接符包括逻辑算符和位置算符,逻辑算符有AND、OR、BUT NOT,位置算符可限定检索词之间的位置关系,如A /p B,表示检索词A和B须在同一个段落中,A /s B,表示检索词A和B须在同一个句子中。“Add Connectors or Expanders”的“Help”,可显示所有算符的代码及含义,方便用户选择使用。 使用“自然语言”检索时,只须用简单的英语描述您的问题,系统会分析该描述,忽略无关字词,选取检索词并作出适当的检索。如输入“must a manufacturer disclose the side effects of a drug”。 检索输入栏下是Westlaw预设的数据库列表,最多可选择在10个数据库同时检索。 2.选择数据库 数据库名称(Database Name)及其数据库识别号(Database Identifier)不一定能充分显示给用户其收录的文献类型和涵盖范围,用户可以点击数据库旁的按钮查看该数据库的内容及涵盖范围。 2.1 快速选择数据库

uniprot

全球蛋白资源数据库UniProt 收藏 UniProt 是一个集中收录蛋白质资源并能与其它资源相互联系的数据库,也是目前为止收录蛋白质序列目录最广泛、功能注释最全面的一个数据库。UniProt 是由欧洲生物信息学研究所(European Bioinformatics Institute)、美国蛋白质信息资源(Prontein Information Resource)以及瑞士生物信息研究所(Swiss Institute of Bioinformatics)等机构共同组成的UniProt协会(UniProt Consortium)编辑、制作的一个信息资源,旨在为从事现代生物研究的科研人员提供一个有关蛋白质序列及其相关功能方面的广泛的、高质量的并可免费使用的共享数据库。 UniProt 是一个向所有使用者免费开放的数据库,全球科研人员都可以登陆网站https://www.360docs.net/doc/676857473.html, 浏览并下载这些资料。借助它,科研人员可以对目的蛋白进行交互式分析或特定的分析。 1 UniProt数据库的构成 UniProt 数据库由UniProt 知识库(UniProtKB )、UniProt 档案(UniParc )、UniProt 参考资料库 (UniRef)以及UniProt元基因组学与环境微生物序列数据库(UniMES)构成。 1.1 UniProt知识库(UniProtKB) UniProt 知识库是一个专家级的数据库,它可以通过与其它资源进行交互查找的方式为用户提供一个有 关目的蛋白质的全面的综合信息。 UniProtKB包括两个组成部分:UniProtKB/Swiss-Prot与UniProtKB/TrEMBL。 1.1.1 UniProtKB/Swiss-Prot UniProtKB/Swiss-Prot 主要收录人工注释的序列及其相关文献信息和经过计算机辅助分析的序列。这 些注释都是由专业的生物学家给出的,准确性无需置疑。在UniProtKB中,注释包括对蛋白质功能、酶学特 性、具有生物学意义的相关结构域及位点、翻译后修饰情况、亚细胞定位、组织特异性、发育阶段特异性、 结构、相互作用、剪接异构体、相关疾病信息的注释等等。注释的另一个重要工作就是对同一蛋白的所有相 关报道进行归纳、总结。对蛋白质序列进行仔细检查之后,注释人员还会将相关参考序列、剪接变异体、基 因变异体和疾病相关信息全都整合起来,而且不同序列间有任何的差异也会标示出来。注释人员还会将蛋白 质数据与其它核酸数据库、物种特异性数据库、结构域数据库、家族遗传史或疾病资料数据库进行交叉参 考。 1.1.2 UniProtKB/TrEMBL UniProtKB/TrEMBL 收录的则是高质量的经计算机分析后进行自动注释和分类的序列。计算机辅助 注释使用的是Spearmint 规则,而人工注释依据的则是蛋白质家族规则,包括HAMAP 家族规则(HAMAP family rules )、RuleBase 规则、PIRSF 分类命名规则以及位点规则。UniProtKB/TrEMBL

常用国内外材料的标准及牌号对照

一. 常用国内外紧固件材料的标准及牌号对照 表<-> 钢中国GB 美国ASTM 德国DIN 日本工业JIS 英国BS 种标准种类代号标准种类代号标准种类代号牌号标准种类代号标准种类代号A194 Gr.1 Gr.2 GB669 45 Gr.2H G4051 S43C 4882 Gr.2H S45C Gr.2HM GB669 35 A307 Gr.A G3101 SS4l 5708 SS41 碳 素GB669 20 Gr.B G4051 S20C 1769 钢GB669 25 S25C GB669 30 A325 1 型1654 Cq85 1.1172 CG4051 S33C 8189 2 型 3A型 3B型 3C型 3D型 3E型 3F 型 YB6 1Cr5Mo A193 Gr.B5 G4107 SNB5 Gr.B6 GBl220 1Crl3 Gr.B6X 17440 X15Crl3 1.4024 4882 Gr.B6 GB307735CrMOA A193 Gr.B7 17200 42CrMo4 1.7225 G4107 SNB7 4882 Gr.B7 合 金 Gr.B7M 钢 和 YB6 15CrM01V Gr.B16 17240 21CrMoV57 1.7709 SNBl6 Gr.B16 不 GBl220 0Crl8Ni9 GL B8 17440 X5CrNi189 1.4301 G4303 SUS-304 GL.B8 锈 钢 Gr.B8A GBl220 1Crl8NillNb Gr.B8C X10CrNiNbl89 1.4550 SUS-347 Gr.B8C Gr.B8CA GBl220 0C17Nil2M02 Gr.B8M X5CrNiMo1810 l.4401 SUS-316 Gr.B8M Gr.B8MA Gr.B8N Gr.B8NA

UniProt数据库高级检索及数据条目注释信息

UniProt数据库高级检索及数据条目注释信息 姓名________ 学号______________ 编号_____ 日期________ 1.人珠蛋白家族检索 1)写出从UniProt数据库中检索已审阅的人珠蛋白(globin)家族12个亚基的步骤。 2)列表说明这12个珠蛋白的登录号、蛋白质名称、和序列长度。 3)与血红蛋白alpha亚基差异最大的序列是哪个?相同位点百分比? 4)与血红蛋白beta亚基差异最小的序列是哪个?差异位点共多少个? 3.列表说明从UniProt数据库中检索以下序列条目的步骤和结果: 1)所有拟南芥序列 2)已审阅拟南芥序列 3)已审阅拟南芥序列中具有蛋白质证据的序列 4)已审阅拟南芥序列中具有蛋白质证据、且具有跨膜螺旋的序列 5)已审阅拟南芥序列中具有蛋白质证据、具有跨膜螺旋和信号肽的序列 6)已审阅拟南芥序列中具有蛋白质证据、具有跨膜螺旋和信号肽、并具有二硫键的序 列 7)已审阅拟南芥序列中具有蛋白质证据、具有跨膜螺旋、信号肽、二硫键,且已经测 定三维结构的序列 3.课题相关蛋白检索 1)UniProt数据库中与你研究课题相关的物种共有多少序列条目 2)其中已审阅的序列条目有多少 3)上述已审阅的序列条目中具有蛋白质证据的有多少 4)上述具有蛋白质证据的条目中与你们实验室研究方向相关的有多少 5)上述具有与你们实验室研究方向相关的序列中与你课题相关的有多少 4.血红蛋白注释信息(请在认真查看注释信息基础上用中文总结,不要用屏幕拷贝) 1)以人血红蛋白alpha亚基为例,说明该序列条目包括几类相关文献。 2)以人血红蛋白alpha亚基为例,说明该序列条目包括几类注释信息。 3)以人血红蛋白alpha亚基为例,说明该序列条目包括哪些特征位点信息。 4)以人血红蛋白alpha亚基为例,说明该序列条目包括哪几类数据库交叉链接,其中 你最感兴趣的有哪些数据库。 5.豌豆内膜蛋白注释信息(请在认真查看注释信息基础上用中文总结,不要用屏幕拷贝) 1)以豌豆内膜蛋白PPF1_PEA为例,说明该序列条目包括哪些注释信息。 2)通过注释信息或高级检索,查找拟南芥中与PPF1_PEA属于同一家族的内膜蛋白。 3)通过查看注释信息和多序列比对,找出拟南芥中PPF1_PEA的直系同源蛋白 ALB3_ARA TH。 4)查看ALB3_ARATH的注释信息,特别是拟南芥专门数据库AraPort和TAIR,并与 PPF1_PEA的注释信息进行比较,说明如何将模式生物研究结果用于非模式生物。 6.课题相关蛋白注释信息(请在认真查看注释信息基础上用中文总结,不要用屏幕拷贝) 1)以研究课题相关或你感兴趣的蛋白质为例,说明该序列条目包括几类相关文献。 2)以研究课题相关或你感兴趣的蛋白质为例,说明该序列条目包括几类注释信息。 3)以研究课题相关或你感兴趣的蛋白质为例,说明该序列条目包括哪些特征位点信 息。 4)以研究课题相关或你感兴趣的蛋白质为例,说明该序列条目包括哪几类数据库交叉 链接,其中你最感兴趣的有哪些数据库。

常用国外数据库及检索介绍

常用国外数据库详细介绍(按国家分类) 一、美国 (1) Wiley InterScience(英文文献期刊) 主页:https://www.360docs.net/doc/676857473.html,/ 简介:Wiley InterScience是John Wiely & Sons 公司创建的动态在线内容服务,1997年开始在网上开通。通过InterScience,Wiley公司以许可协议形式向用户提供在线访问全文内容的服务。Wiley InterScience收录了360多种科学、工程技术、医疗领域及相关专业期刊、30多种大型专业参考书、13种实验室手册的全文和500多个题目的Wiley学术图书的全文。其中被SCI收录的核心期刊近200种。期刊具体学科划分为:Business, Finance & Management (商业、金融和管理)、Chemistry (化学)、Computer Science (计算机科学)、Earth Science (地球科学)、Education (教育学)、Engineering (工程学)、Law (法律)、Life and Medical Sciences (生命科学与医学)、Mathematics and Statistics (数学统计学)、Physics (物理)、Psychology (心理学)。 (2)美国IEEE (英文文献期刊) 主页:https://www.360docs.net/doc/676857473.html,/ 简介:IEEE(Institute of Electrical & Electronics Engineers)是电子信息领域最著名的跨国性学术团体,其会员分布在世界150多个国家和地区。据IEEE统计,IEEE会员总数2001年比2000年增加3.1%,达到377342人,其中学生会员为65669人,增长12.6%。 随着人们的信息越来越多地来自Internet,IEEE需要为会员提供更加完善和全面的电子信息产品和服务。IEEE应成为IEEE会员获得信息的首选之地。IEEE必须识别正确的信息,并提供对它们的访问方法。实现这个目标的重要一步是通过IEEE Xplore与IEEE/IEE Electronic Library (IEL)连接。IEL包括了1988年以来IEEE和IEE的所有期刊杂志和会议录,以及IEEE的标准,可以通过题目、关键词和摘要进行查阅。 (3)美国EBSCO(英文文献期刊) 主页:https://www.360docs.net/doc/676857473.html, 简介:EBSCO公司从1986年开始出版电子出版物,共收集了4000多种索引和文摘型期刊和2000多种全文电子期刊。该公司含有Business Source Premier (商业资源电子文献库)、Academic Search Elite(学术期刊全文数据库)等多个数据库。 Business Source Premier收录了三千多种索引、文摘型期刊和报纸,其中近三千种全文刊。数据库涉及国际商务、经济学、经济管理、金融、会计、劳动人事、银行等的主题范围,适合经济学、工商管理、金融银行、劳动人事管理等专业人员使用。数据库中有较著名"华尔街日报"(The Walls Street Journal)、"哈佛商业评论"(Harvard Business Review)、"每周商务"(Business Week)、"财富"(Fortune)、"经济学家智囊团国家报告" (EIU Country Reports)、American Banker、Forbes、The Economist等报刊。该数据库从1990年开始提供全文,题录和文摘则可回溯检索到1984年,数据库每日更新。 学术期刊集成全文数据库(Academic Search Premier,简称ASP):包括有关生物科学、工商经济、资讯科技、通讯传播、工程、教育、艺术、文学、医药学等领域的七千多种期刊,其中近四千种全文刊。 EBSCO内含有两个免费数据库:

CNKI系列数据库应用指南.doc

CNKI数据库检索应用方法 1.登录数据库 登录https://www.360docs.net/doc/676857473.html,,凭机构用户登录帐号、密码或IP自动登录。 对于学校用户,可以先进入图书馆首页,从电子资源列表中选择“中国知网数字图书馆”或者《中国期刊全文数据库》等CNKI数据库,进入检索首页。 2.下载安装全文浏览器 如果您是第一次使用CNKI的产品服务,那么您需要下载并安装CAJViewer7.0,才能看到文献的全文。CNKI的所有文献都提供CAJ文件格式,期刊、报纸、会议论文等文献还同时提供PDF文件格式。我们推荐您使用CAJ浏览器,速度更快,针对学术文献的各种扩展功能更强。点击首页上方的“下载阅览器”,点击下载后,运行软件包,根据提示进行相应选择和安装浏览器。 在此下载CAJ阅览器登录区 3. 具体检索方法——检索、导航、知网节 读者要获取自己所需要的知识和文献,可通过以下三种途径: 途径一:检索——查 目标:最快、最方便地查到所有需要的信息。减少人工操作时间和系统等待时间;减少人工挑选的时间。 CNKI知识搜索是以学术文献为搜索内容的搜索引擎,搜索范围包括期刊文献、学位论文、会议论文、报纸文献、工具书、年鉴等。包括全文搜索、工具书搜索、数字搜索、学术定义搜索、图形搜索、翻译助手等诸多功能,简单易用,实现实时的知识聚类、多样化的检索排序和最丰富的知识链接。

单库检索 在CNKI 系列数据库中的任一单独的库内检索。 单库检索设置有初级检索、高级检索和专业检索三个界面,用户可根据检索条件与检索技术水平选择其中的一个界面操作。具体方法参照下文跨库检索中的介绍。 跨库检索 读者可选择多个数据库的资源进行检索,能够在同一个检索界面下完成对期刊、学位论文、报纸、会议论文、年鉴等各类型数据库的统一跨库检索,省却了原来需要在不同的数据库中逐一检索的麻烦。 跨库检索也包括初级检索、高级检索、专业检索三种方式: ◇初级检索:读者登陆CNKI 跨库检索首页后,输入检索词即可进行初级检索,读者也可以点击数据库名称,进入单库检索。 ◇ 高级检索:提供检索项之间的逻辑关系控制,如检索“题名=图书馆学”并且/或者/不 包含“作者=文庭孝”,将检索出关于图书馆学、作者是(非)文庭孝的文章。如果要提高查准率,则可以添加多个逻辑关系,进行多种的检索控制,如相关度排序、时间控制、词频控制、精确/模糊匹配等,适合于对检索方法有一定了解的人。 简洁方便的文献及知 识元搜索,直接获取埋藏在文献中的知识 打勾选择所要检索的数据库 检索项选择 在框内输入检索词,点击“检索“按钮,即呈现检索结果

中国知网数据库信息检索__含答案

1、吉林农业大学图书馆用户利用登录“中国知网——中国知识资源总库” 分别是:___ 和___ 。利用CNKI“高级检索”主题途径的 精确检索,检索2007- 2008年题名包含“世界读书日”的期刊文章共有相关记录___条。阅读全文时 CAJ文件需要先下载安装___ 全文浏览器。吉林农业大学___ 于2007年撰写的___ ___ 一文,专门讨论高校文化建设。 2、利用中国知识资源总库(https://www.360docs.net/doc/676857473.html,)的“跨库高级检索”,检索出主题为“世界读书 日”和“阅读社会”的论文共有相关记录___ 条。 3、如何利用中国知网数据库了解某一项专利核心技术领域国内及世界来源分布情况? 4、如何利用中国知网数据库对我国有关玉米研究情况进行分析? 5、如何利用中国知网数据库的中国农业博硕士论文库

(https://www.360docs.net/doc/676857473.html,/grid2008/index/ZKCAKD.htm)检索学位授予单位是南京农业大学,由学者沈益新指导的有关绿肥作物的硕士论文? 6、如何通过中国知网数据库检索到有关酶工程领域所涉核心技术研究动态的相关文献以及某一专利的核心技术领域国内来源分布和世界来源分布情况? 7、如何通过中国知网数据库检索出同时满足下列检索条件的文献?发表时间:1983.01.01-2008.12.31;题名:大豆;作者:徐克章;单位:吉林农业大学;文献来源:大豆科学。 8、如何通过中国知网数据库检索出同时满足下列检索条件的文献?项目性质:国家自然科学基金;项目承办单位:吉林农业大学。负责人:钱爱东

9、利用中国知网数据库数据库检索中科双高期刊中影响因子排在第三位的期刊刊名 10、利用中国知网数据库检索我校文献被引用频次最高的畜牧与动物医学专业博士生导师是哪位? 11、如何检索吉林农业大学在2000年至今的农业工程类期刊文章数目? 12、如何查找北京大学出版社出版的包含“巨噬细胞能对抗原呈递进行调节,还通过分泌不同的细胞 因子对免疫细胞产生正、负调节”这段话的图书? 13、如何检索与抗体亲和力相关的图片数目? 14、全国园艺学学科院士中,发文量最多、被引频次和下载频次最大的学者发表的,由中国博士后基

Gale-Academic-OneFile学术期刊大全数据库检索指南

Gale Academic OneFile学术期刊大全数据库检索指南 作为Gale旗下的著名数据库Academic OneFile (学术期刊大全数据库)是一个综合性学术期刊数据库,包括14,000多种学术性期刊,覆盖从科学、技术、医学到人文学科的各个研究领域,适用于各个学科领域的研究者,是一个专门为学术机构量身订做的研究型数据库Academic OneFile (学术期刊大全数据库)为您提供的内容包括: ●涵括14,000多种学术期刊,其中超过6000多种为全文刊,9000多种同行评审期刊,非 全文刊几乎囊括了世界所有顶级学术期刊的索引和文摘部分; ●提供HTML 和PDF格式,并提供全球通用的Citation 信息,方便读者下载和引用;●与Thomson ISI 的Web of Science 以及Journal Citation Report实现无缝链接,方便读者 找到文章的引用信息及文章级别,期刊的历史信息及影响因子。读者也可以通过Web of Science 链接到Academic OnFile找到文章的全文 ●收录自1996年至今的Elsevier出版的期刊的所有文摘部分; ●收录自1985年至今的 全文文章; ●收录来自于NPR、CNN和CBC的音频和OR-Live的医学手术视频; ●ReadSpeaker语音朗读功能可以在线播放文章音频并能下载MP3; ●检索的文章可以翻译成11种国家的语言,其中包括中文 Academic OneFile (学术期刊大全数据库)为您提供四种检索方式 数据库页面上方的TOOLBOX(工具)中提供HELP(在线帮助)、ABOUT(数据库相关)、PREFERENCES(参数设置)、TITLE LIST(期刊列表)、NAMED USER TUTORIAL(个人注册用户教程)等资料; 分为Home (Basic Search)(基本检索)、Browser Subjects(浏览主题)、Browser Publication (浏览出版物)和Advanced Search(高级检索)四种检索方式。 一、Home基本检索 可以选择限定在Subject(主题)、Keyword(关键字)、Entire(全文)中进行检索,同时也可以通过限定to documents with full text(全文文章)、to peer-reviewed publications(同行评审出版物)、to documents with images(带图像的文章)等条件来检索结果 Download:下载保存结果,请先用Mark框选择您想要保存的结果 Share:Web2.0分享可以把结果发布到Google、Facebook、Delicious和Twitter等网站上Search Alert/ RSS feed:可以设置进行定期发送最新更新提醒 Bookmark:对检索结果的永久URL进行标识收藏,以便今后能快速获取此文章 检索结果根据文章类型分为Academic Journals 学术期刊;Magazines 杂志;Books 参考工具书;News 新闻和报纸;Multimedia 多媒体资源,检索结果Sort by(排序):Publication Date:文章的排序按照出版时间由近到远排序;Relevance:文章的排序按照与关键词的相关度由高到低排序 限制检索结果

网络数据库的信息检索

第二章信息获取 2.4网络数据库的信息检索教学分析 本节内容是将“因特网信息查找”延用至专业化的网络数据库,主要包括网络数据库简介、网络数据库信息检索的一般过程和使用多样化的网络数据库。 同学们具备了使用搜索引擎搜索信息的经验,但对如何使用网络数据库进行信息检索的还不太了解。本节课教学主题是“学会使用在网络数据库中进行信息检索”,通过同学间的交流、协作,提高信息检索的技巧,亲身体验网络数据库信息的丰富性和可靠性,学会网络数据库的信息检索的方法,同时会对网络数据库的客观评价,更加激发学生学习信息检索的兴趣。 本节课以上机体验为主,同时作为前两章的阶段练习和总结。 教学目标 1.了解网络数据库; 2.学会简单的信息检索; 3.运用网络数据库,检索需要的信息内容。 教学重点、难点 重点:从数据库中检索到自己想要的信息,体验网络数据库信息的多样性。 难点:如何提高搜索技巧、客观评价网络数据库。 教学设计思路(网络机房) 2.4网络数据库的信息检索 复习引入 复习:怎样利用google、百度搜索引擎和网际快车下载工具来通过网络搜索安装“hp1010打印机”的驱动需要的文件。 学生阅读(1分钟)我们首先看到这样的一个故事:周小波的通过运用了网络数据库,在法律在线上找到了相关的知识,然后在竞赛中获得成功。 讨论:网络给我们带来了什么? (多种答案) 2.4.1 体验网络数据库 学生体验:打开法律在线,输入关键字“教育”,浏览相应结果,把需要的文字复制下来。 网络数据库简介 1、什么是网络数据库 数据库:是存放数据的仓库,是按一定的结构和规则组织起来的相关数据的集合。 网络:用通讯设备和线路,将处在不同地方和空间位置、操作相对独立的多个计算机连接起来,再配置一定的系统和应用软件,在原本独立的计算机之间实现软硬件资源共享和信息传递,那么这个系统就是计算机网络。 数据库技术:目前是计算机处理与存储数据的最有效、最成功的技术,计算机网络的特点则是资源共享。 网络数据库:数据和资源共享这两种技术结合在一起即成为在今天广泛应用的网络数据库(也叫WEB 数据库)。它以后台数据库为基础,加上一定的前台程序,通过浏览器完成数据存储、查询等操作的系统。 2、网络数据库信息检索的一般过程 学生体验:检索“义务教育法”https://www.360docs.net/doc/676857473.html, 明确目标——提炼关键字——输入执行——评价调整

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