中文生物医学信息的获取-PPT课件
合集下载
最新整理中国生物医学.ppt
3）检索入口多：除 30 多个检索入口外， 更 提供特色的主题词检索、分类检索、第一著者检索、
文献类型、资助项目和参考文献等检索方式。尤其
是主题和副主题词检索功能将有效提高查准和查全 率。
4）检索功能完备：定题检索、限定检索、截 词检索、通配符检索，各种逻辑组配检索功能会大 大提高检索效率。
5）全文获取：目前 CBM 已经实现了与维普 全文数据库的链接功能，对于 1989 年以来的全文， 可以直接链接维普全文数据库。详情请联系维普公 司
通配符
❖ 单字通配符 ( ? ): 替代一个字符
如检索式“血?动力”，可检索出含有以下字符串的文献： 血液动力、血流动力等等。
❖ 任意通配符 ( % ): 替代任意个字符
如检索式“肝炎%疫苗”，可检索出含有以下字符串的文 献：肝炎疫苗、肝炎病毒基因疫苗、肝炎减毒活疫苗、肝 炎灭活疫苗等等。
返回
基本检索
中医药学主题词表》是CBM进行主题标引和主题检索的依据。基于 主题概念检索文献，利于提高查全和查准率。
❖ 检索入口处选择“中文主题词”。 ❖ 检索词输入框内输入“肺炎”。 ❖ 点击查找按钮，显示主题词轮排表。 ❖ 在主题词轮排表中选择主题词，点击如图中所示的红框内容。 ❖ 主题词是自然语言的规范化用语，如主题词“获得性免疫缺陷综合征”涵盖了“艾滋
智能检索：在“缺省”字段，自动实现检索词、检索词 对应主题词及该主题词所含下位词的同步检索。
❖ 选择检索入口“题目”。 ❖ 输入检索内容“高血压的治疗”。 ❖ 点击“检索”按钮。 ❖ 检索结果：题目中含有“高血压的治疗”的所有文献。
❖ 在已有检索基础上，可以进行二次检索 在检索框内输入相应的检索词“老年”，选中“二次检索”，点击 检索按钮，进行二次检索。
中文生物医学期刊文献数据库(chinesemedical.pptx
（三）刊名检索
CMCC将所收录的期刊全 部汇集在刊名列表中
也可直接在刊名输入框中 输入刊名检索词
（四）字段检索
➢ 字段检索在输入框中填写一个或多个 检索词，词间用空格隔开，允许使用*或? 通配符。
➢ 在逻辑关系列表中选择一种逻辑关系。 这里除AND、OR外,又增加了两种关系： SUB（不能出现后者）、XOR（不能同时 出现）。
• 2、Our destiny offers not only the cup of despair, but the chalice of opportunity. (Richard Nixon, American President )命运给予我们的不是失望之酒，而是机会之杯。二〇二〇年八月五日2020年8月5 日星期三
中文生物医学期刊文献 数据库
（Chinese Medical Current Contents, CMCC）
一.概况
解放军医学图书馆开发研制
收录了自1994年以来 1350余种中文生物医学期刊 该数据库文献量大 信息报道快,半月更新
二、数据库结构
CMCC共有11个字段
题名、 外文题名、 作者、
• •
T H E E N D 8、For man is man and master of his fate.----Tennyson人就是人，是自己命运的主人11:0311:03:108.5.2020Wednesday, August 5, 2020
自由词检索是同时在题名、外文题名、 关键词、摘要4个字段中搜索。
检索式输入规则如下：
☺两词之间为AND关系时，直接 以空格隔开
☺使用的一个半角的问号“?”代 表一个英文字符，“??”代表一个 汉字,使用“*”代表０－N个字符
2024生物医学信息学PPT课件
生物医学信息学PPT课件•生物医学信息学概述•生物信息学基础知识•医学图像处理技术•生物信号处理与分析目录•生物医学数据挖掘与应用•生物医学信息学伦理与法规01生物医学信息学概述定义与发展历程定义生物医学信息学是生物医学与计算机科学、信息科学等学科的交叉领域，旨在研究生物医学信息的获取、处理、存储、分析和应用等方面的理论和技术。
发展历程生物医学信息学经历了从早期的医学图像处理、生物信号处理到现代的生物信息学、临床信息学等阶段，随着大数据、人工智能等技术的发展，生物医学信息学的研究和应用领域不断拓展。
研究内容及方法研究内容生物医学信息学的研究内容包括生物医学数据的采集、处理、分析和挖掘，生物医学知识的表示、推理和应用，以及生物医学信息系统的设计、开发和应用等。
研究方法生物医学信息学采用多种研究方法，包括数学建模、统计分析、机器学习、自然语言处理等，以实现对生物医学数据的深入挖掘和有效利用。
应用领域及前景展望应用领域生物医学信息学在医疗、科研、教学等领域具有广泛的应用，如医学影像诊断、基因测序数据分析、临床决策支持、生物医学知识库构建等。
前景展望随着生物医学数据的不断积累和技术的不断进步，生物医学信息学将在精准医疗、智能诊疗、健康管理等方面发挥越来越重要的作用，为人类的健康和医疗保健事业做出更大的贡献。
02生物信息学基础知识基因组学与蛋白质组学基因组学01研究生物体基因组的组成、结构、功能及演变的科学领域，涉及基因测序、基因注释、比较基因组学等方面。
蛋白质组学02研究生物体内所有蛋白质的表达、功能、相互作用及调控的科学领域，与基因组学相辅相成，共同揭示生物体的生命活动规律。
基因组学与蛋白质组学的关系03基因组学提供生物体的遗传信息，蛋白质组学则研究这些遗传信息的表达产物，二者相互关联，共同揭示生物体的生理和病理过程。
基因表达调控与表观遗传学基因表达调控生物体内通过一系列机制调节基因的表达水平，包括转录调控、转录后调控、翻译调控等多个层面，以确保生物体在不同环境和发育阶段下能够正常生长发育。
中国生物医学文献数据库检索方法(CBM)PPT医学课件
信
27
检期索刊检方索法
2011-2012年
选中所需期刊，即
可获得该期刊的有 关文献。
信
28
检作索者检方索法
2011-2012年
在输入框输入作者姓名。
信
29
检作索者检方索法
检出结果。
2011-2012年
信
30
检索方法
• 逻辑运算符的使用
• 在基本检索状态可利用“二次检索”进行AND运算。 • 在检索历史状态可进行AND、OR、NOT运算。
2011-2012年
信
9
检索方法
• 基本检索
• 缺省字段：在中国生物医学文献数据库（CBM）中，是中文标题、 摘要、作者、 关键词、主题词和刊名内容的组合
• 智能检索：在“缺省”字段，自动实现检索词、检索词对应主题 词及该主题词所含下位词的同步检索。如：在“缺省”字段输入 “艾滋病”，勾选“智能检索”后点击“检索”按钮，系统自动 检出在缺省字段中含“艾滋病”和“获得性免疫缺陷综合征”的 所有文献。
在检索历史状态可进行AND、OR、NOT运算。
检出结果。
2011-2012年
信
35
检索结果利用
检索结果利用
• 选中所需存盘的文献，点击“保存”即可。
2011-2012年
信
37
检索结果利用
• 存盘的示例。
2011-2012年
信
38
检索事例
检索事例
• 检索有关曲安奈德治疗口腔扁平苔藓的文献。
中国生物医学文献数据库 （CBM）
内容提纲
• 数据库简介 • 访问方式 • 检索方法 • 检索结果利用 • 检索事例
2011-2012年
医学文献检索---中国生物医学文献数据库CBM介绍PPT课件
• MeSH中没有中医药学方面的副 主题词，检索时注意区别。
2010年9月
医学文献检索 • SinoMed
SinoMed系统登录
➢进入中山大学主页
•
➢进入图书馆主页
•
➢进入医学图书馆主页
•
主题检索： #1 354 唾液酸类[扩展全部树]/全部副主题
词 #2 1499 获得性免疫缺陷综合征[主题词]/全
部 副主题词
#3 86500 肿瘤[扩展树：1]/全部副主题词 基本检索： #4 9677 恶性
#5 59 #210a1n0d年（9#月2 or #3 and #4）
医学文献检索 • SinoMed
2010年9月
医学文献检索 • SinoMed
2010年9月
医学文献检索 • SinoMed
20102010年9月
医学文献检索 • SinoMed
2010年9月
医学文献检索 • SinoMed
2010年9月
医学文献检索 • SinoMed
2010年9月
➢ 收录范围
• 收录1978年以来1600多种中国生物医学 期刊，以及汇编、会议论文的文献题录， 年增长量约40余万篇，数据总量达350 余万篇。学科范围涉及基础医学、临床 医学、预防医学、药学、口腔医学、中 医学及中药学等生物医学的各个领域。
2010年9月
医学文献检索 • SinoMed
SinoMed数据规范
2010年9月
医学文献检索 • SinoMed
2010年9月
医学文献检索 • SinoMed
2010年9月
医学文献检索 • SinoMed
医学文献检索 • SinoMed
2010年9月
2010年9月
医学文献检索 • SinoMed
SinoMed系统登录
➢进入中山大学主页
•
➢进入图书馆主页
•
➢进入医学图书馆主页
•
主题检索： #1 354 唾液酸类[扩展全部树]/全部副主题
词 #2 1499 获得性免疫缺陷综合征[主题词]/全
部 副主题词
#3 86500 肿瘤[扩展树：1]/全部副主题词 基本检索： #4 9677 恶性
#5 59 #210a1n0d年（9#月2 or #3 and #4）
医学文献检索 • SinoMed
2010年9月
医学文献检索 • SinoMed
2010年9月
医学文献检索 • SinoMed
20102010年9月
医学文献检索 • SinoMed
2010年9月
医学文献检索 • SinoMed
2010年9月
医学文献检索 • SinoMed
2010年9月
➢ 收录范围
• 收录1978年以来1600多种中国生物医学 期刊，以及汇编、会议论文的文献题录， 年增长量约40余万篇，数据总量达350 余万篇。学科范围涉及基础医学、临床 医学、预防医学、药学、口腔医学、中 医学及中药学等生物医学的各个领域。
2010年9月
医学文献检索 • SinoMed
SinoMed数据规范
2010年9月
医学文献检索 • SinoMed
2010年9月
医学文献检索 • SinoMed
2010年9月
医学文献检索 • SinoMed
医学文献检索 • SinoMed
2010年9月
第二章 生物信息提取 生物医学电子学课件
各种皮肤表面大电极—接触电极
金属板电极与圆形电极
•
过去常用的电极
不与皮肤直接接触，而涂上电极膏，减少由于移 动产生的伪差。 电极与皮肤接触处是绝缘材料。绝缘电极通过电 容感应来读取信号。关键在于得到介电常数大又 很薄的介质，电容量大，阻抗低。
浮置电极—非接触电极
•
干电极和绝缘电极
•
各种皮下微电极
六、电极的种类及其选用
金属电极简单，方便，但是会在长期使用 后产生副作用，电极也容易极化产生电阻 变大，电压波动等现象，因此长时的纪录 通常都采用可逆电极。 Ag-AgCl电极
制作过程 特点是电位变化很小，仅有几μV~10μV ，电 极阻抗趋向于电阻性，因此电极阻抗与频率 基本上无关。
静息电位的记录
细胞产生的电位分布于三个串联电阻上，
分别为组织电阻、微电极电阻和放大器输 入电阻。
动作电位的记录
神经元—微电极—放大器系统等效电路如下：
图中，Rμ为微电极电阻，由于微电极很细，阻抗 高，不可忽略。C1为微电极电阻的分路电容（双 电层电容），Rg为放大器的输入电阻，Cg’为放 大器的输入电容。
在常温下（25oC）：
00 .5 9 0 lo ga n
例题：
溶度积Ksp：饱和溶液, [Ag+][Cl-]= Ksp。
二、电极的极化
当电极通过电流后，其电极电位偏离平衡值。这 种现象就是电极的极化 。 一个孤立的电极不会产生电流，其电位始终处于 平衡状态。只有在两个电极间接入外电路时，每 个电极里才会产生电流。从而电极就发生极化现 象。 原电池在外电路接通的情况下可产生电流。 电解电池需要消耗外能源的电能才能产生电流。 引导电极比拟电极也能起换能器的作用。它将生物机体
医学信息获取及利用ppt课件
教材P42 图2.7纠错
0.37
0.23
0.13
案例分析
假设有一个字符列表“abcdefg”,它们在一个 文件中出现的频率依次分别是17、7、22、13 、77、90、45。试用霍夫曼编码算法为每个字 母编码。
计算机断层扫描图像
计算机放射图像 数字化X线摄影图像 数字化 X 线 乳腺摄影图 像
512×512×12
2048×2048×12 2048×2048×12 4096×4096×12
40
2 2 4
20M
16M 16M 128M
医学图像信息获取的基本原理
医学图像信息获取的过程（两个阶段）
光电转化：将反映不同光强度的医学图像信息转 化成模拟电信号，
医学生理信息获取的基本原理（续）
（2）医学传感器拾取信号的原理
医学传感器概念：传感器又称换能器，是医学检测 仪器与人体直接耦合的一种设备，其作用是对人体 生理信号进行感知和拾取，并转换成模拟电信号。 医学传感器分类（表2.3）
工作原理分：物理型、化学型和生物型 输入信息分：有位移型、压力型、速度型、流量型、温度型和电 位型 用途分：脉搏传感器、脑电传感器、胃电传感器
医学图像信息获取的基本原理（续）
象素点的灰度级别
一幅图像的清晰度和保真度除了与象素点的采样 周期有关，还与表示该象素点的灰度级别有关
灰度级别越高，效果越好，反之就越差。 人眼对黑白程度只能分辨出20多个级别，常用1个字节 256等级；用2个字节表示，灰度级别高了，有64k个等 级，但存储空间却增加了1倍
医学图像信息获取的基本原理（续）
图像信息的表示形式
生物医学信息检索PPT课件
生物医学信息检索
国外生物医学检索工具
1
国外生物医学检索工具
在生命科学领域中常用的检索刊有： 美国《医学索引》(Index Medicus,IM) 荷兰《医学文摘》(Excerpta Medica,EM) 美国《生物学文摘》(Biological Abstracts, BA) 美国《化学文摘》(Chemical Abstracts, CA) 美国《科学引文索引》(Science Citation Index,SCI)
16
17
美国《医学索引》(IM)-MeSH表
主题词变更表
一、组成
字顺表 树状结构表
副主题词表
二、作用 MeSH表的影响力是相当广泛的，它 对其他中外文检索工具都有一定的参考作用。
它是指导我们使用规范化检索语言的工具，沟 通检索者和标引者的桥梁。
18
美国《医学索引》(IM) -MeSH表
主题词变更表 由两个表反映主题词的变更情况。
并按刊名缩写字顺排列； (6)非英文文献先按文种缩写排列，同一文种下按
刊名缩写字顺排列
9
IM—Subject Section
10
美国《医学索引》(IM)
2.著者索引编排原则： (1)仅在第一著者后列出全部文献题录内容 (2)非第一著者只设参见条目, “see” (3)著者的姓在前用全称，名在后用首字母缩写； (4)匿名著者部分，按刊名缩写字顺排列。 注意：
姓氏前缀De、La、Van、Von与前缀一起提前， 并且与姓氏间加空格； 表示家族等级的后缀Jr、Sr、Ⅰ、Ⅱ等放在姓 氏的最后。
11
IM—Author Section
12
IM—Bibliography of Medical Reviews
国外生物医学检索工具
1
国外生物医学检索工具
在生命科学领域中常用的检索刊有： 美国《医学索引》(Index Medicus,IM) 荷兰《医学文摘》(Excerpta Medica,EM) 美国《生物学文摘》(Biological Abstracts, BA) 美国《化学文摘》(Chemical Abstracts, CA) 美国《科学引文索引》(Science Citation Index,SCI)
16
17
美国《医学索引》(IM)-MeSH表
主题词变更表
一、组成
字顺表 树状结构表
副主题词表
二、作用 MeSH表的影响力是相当广泛的，它 对其他中外文检索工具都有一定的参考作用。
它是指导我们使用规范化检索语言的工具，沟 通检索者和标引者的桥梁。
18
美国《医学索引》(IM) -MeSH表
主题词变更表 由两个表反映主题词的变更情况。
并按刊名缩写字顺排列； (6)非英文文献先按文种缩写排列，同一文种下按
刊名缩写字顺排列
9
IM—Subject Section
10
美国《医学索引》(IM)
2.著者索引编排原则： (1)仅在第一著者后列出全部文献题录内容 (2)非第一著者只设参见条目, “see” (3)著者的姓在前用全称，名在后用首字母缩写； (4)匿名著者部分，按刊名缩写字顺排列。 注意：
姓氏前缀De、La、Van、Von与前缀一起提前， 并且与姓氏间加空格； 表示家族等级的后缀Jr、Sr、Ⅰ、Ⅱ等放在姓 氏的最后。
11
IM—Author Section
12
IM—Bibliography of Medical Reviews