临床常见细菌
表1 菌名编码
编码菌名
1100Staphylococcus spp
1101Staphylococcus aureus
1102staphylococcus auricularis
1103staphylococcus capitis
1104staphylococcus cohnii
1105staphylococcus epicermidis
1106staphylococcus heamolyticus 1107staphylococcus hominis
1108staphylococcus hyicus
1109staphylococcus intermedius
1110staphylococcus lentus
1111staphylococcus saprophyticus 1112staphylococcus schleiferi
1113staphylococcus simulans
1114staphylococcus warneri
1115staphylococcus xylosus
1116Staphylococcus lugdunensis
1117Staphylococcus saccharolyticus
1200Streptococcus spp
1201Streptococcus acidominimus
1202Streptococcus aglactiae(Group B) 1203Streptococcus anginosus
1204Streptococcus bovis
1205Streptococcus constellatus
1206Streptococcus dysgalactiae
1207Streptococcus equi(Group C/G)
1208Streptococcus equinus(Group D)
1209Streptococcus intermedius
1210Streptococcus mitis
1211Streptococcus mutans
1212Streptococcus pneumoniae
1213Streptococcus pyogenes(Group A) 1214S.treptococcus zooepidemicus(GroupC) 1215Streptococcus sanguis
1216Streptococcus viridans
1217Group A streptococcus
1218Group B streptococcus
1219Group C streptococcus
1220Group G streptococcus
1221Group D enterococcus
1222Group D nonenterococcus
1223Streptococcus groupA,C,F,G
1224Enterrococcus avium
1225Enterococcus casseliflavus
1226Enterococcus durans
1227Enterococcus faecalis
1228Enterococcus faecium
1229Enterococcus gallinarum
1230Enterococcus hirae
1231Streptococcus group F
1300Corynebacterium spp
1301Corynebacterium diphtheriae
1302Corynebacterium diphtheriae subsp.gravis 1303Corynebacterium diphtheriae subsp.mitis
1304Corynebacterium diphtheriae subsp.intermedius 1305Corynebacterium pseudotuberculosis
1306Corynebacterium xerosis
1307Corynebacterium pseudodi phtheriae
1308Corynebacterium bovis
1309Corynebacterium seminale
1310Corynebacterium jeikeium
1311Corynebacterium minutissimum
1312Corynebacterium striatum
1313Corynebacterium ulcerrans
1314Corynebacterium urealuticum
1315Corynebacterium GroupJK
1316Dermabacter hominis
1400Rhosococcus spp
1401Rhodococcus equi
1410Gemella spp
1411Gemella haemolysans
1412Gemella morbillorum
1420Pediococcus spp
1421Pediococcus pentosaceus
1422Pediococcus acidilactici
1423Pediococcus damnosus
1430Lactococcus species
1431Lactococcus garvieae
1440Leuconostoc species
1500Listera spp
1501Listeria ivanovii
1502Listeria monocytogenes
1503Listera innocua
1504Listera grayi
1505Listera seeligeri
1506Listera welshimeri
1600Erysipelothrix spp
1601Erysipelothrix rhusiopathiae
1700Nocardia spp
1701Nocardia asteroides
1702Nocardia farcinica
1703Nocardia brasiliensis
1704Nocardia otitidiscaviarum
1705Nocardia brevicatena
1800Actinomyces spp
1801Actinomyces pyogenes(Arcanobacterium pyogenes) 1802Actinomyces neui ssp anitratus
1803Actinomyces neui ssp neus
1804Actinomyces bernardiae
1805Arcanobacterium haemolyticum
1900Bacillus spp
1901Bacillus anthracis
1902Bacillus brevis
1903Bacillus cereus
1904Bacillus circulans
1905Bacillus licheniformis
1906Bacillus megaterium
1907Bacillus pumilus
2000Enterobacteriaceae
2010Citrobacter spp
2011Citrobacter amalonaticus
2012Citrobacter farmeri
2013Citrobacter braakii
2014Citrobacter freundii
2015Citrobacter youngae
2016Citrobacter werkmanii
2017Citrobacter diversus
2018Citrobacter koseri
2020Wdwardsiella spp
2021Wdwardsiella tarda
2022Wdwardsiella hoshinae
2030Enterobacter spp
2031Enterobacter aerogenes
2032Enterobacter amnigenus
2033Enterobacter asburiae
2034Enterobacter cloacae
2035Enterobacter sakazakii
2036Enterobacter gergoviae
2037Enterobacter hormaechchei
2038Enterobacter intermedium
2039Enterobacter agglomerans
2040Escherichia spp
2041Escherichia coli
2042Escherichia coli O157
2043Escherichia fergusonii
2044Escherichia hermannii
2045Escherichia vulneris
2046Escherichia (enteroinvasive E.coli, EIEC) 2047Escherichia coli Group AD
2048Escherichia (enteropathogenic E.coli, EPEC) 2049Escherichia (enterotoxigenic E.coli, ETEC)
2051Hafnia alvei
2060Klebsiella spp
2061Klebsiella ornithinolytica
2062Klebsiella ozytoca
2063Klebsiella pneumoniae
2064Klebsiella rhinoscleromatis
2065Klebsiella terrigena
2066Klebsiella planticola
2067Klebsiella ozaenae
2070Morganella spp.
2071Morganella morganii biogroup 1
2072Morganella morganii sibonii 1 type
2073Morganella morganii
2080Prpteus spp
2081Prpteus mirabilis
2082Prpteus vulgaris
2083Prpteus penneri
2090Providencia spp
2091Providencia alcalifaciens
2092Providencia rettgeri
2093Providencia stuartii
2094Providencia rustigianii
2100Salmonella spp
2101Salmonella dublin
2102Salmonella typhimurium
2103Salmonella paratyphi A
2104Salmonella paratyphi B
2105Salmonella derby
2106Salmonella typhi
2107Salmonella enteritidis
2108Salmonella bovis morbificans 2109Salmonella
2110Salmonella
2111Salmonella
2112Salmonella
2113Salmonella
2109Salmonella newport
2110Serratia spp.
2111Serratia ficaria
2112Serratia liquefaciens
2113Serratia fonticola
2114Serratia rubidaea
2115Serratia plymuthica
2116Serratia odorifera
2117Serratia marcescens
2120Shigella spp
2121Shigella boydii
2122Shigella dysenteriae
2123Shigella flexneri
2124Shigella snnei
2130Yersinia spp
2131Yersinia enteroxolitica
2132Yersinia pseudotuberculosis 2133Yersinia fredericksenii
2134Yersinia intermedia
2135Yersinia kristensenii
2136Yersinia ruckeri
2137Yersinia pestis
2140Kluyvera
3000Non fermenters G-b
3100Acinetobacter spp
3101Acinetobacter bauamnnii
3102Acinetobacter calcoaceticus
3103Acinetobacter haemolyticus
3104Acinetobacter johnsonii
3105Acinetobacter junii
3106Acinetobacter lwoffii
3200Alcaligenes spp
3201Alcaligenes faecalis
3202Alcaligenes xylosoxidans suhsp.xylosoxidans
Achromobacter xylosoxidans suhsp.xylosoxidans 3203Alcaligenes xylosoxidans subsp. denitrificans
Achromobacter xylosoxidans subsp. Denitrificans 3204Alcaligenes odorans
3300Burkholderia spp
3301Burkholderia cepacia
3302Burkholderia gladioli
3303Burkholderia mallei
3304Burkholderia pickettii
3305Burkholderia pseudomallei
3400Comamonas spp
3401Comamonas acidovorans
3402Comamonas testosteroni
3500Chromobacterium (Flavobactrium)spp
3501Chromobacterium meningosepticum(Flavobactrium) 3502Chromobacterium odoratum(Flavobactrium)
3503Chromobacterium indologenes(Flavobactrium) 3504Chromobacterium group II b(Flavobactrium)
3505Flavimonas oryzihabitans
3600Moraxella spp
3601Moraxella atlantae
3602Moraxella lacunata
3603Moraxella osloensis
3604Moraxella phenylpyruvica
3605Moraxella nonliquefaciens
3700Pseudomonas spp
3701Pseudomonas aeruginosa
3702Pseudomonas alcaligenes
3703Pseudomonas fluorescens
3704Pseudomonas mendocina
3705Pseudomonas sputira
3706Pseudomonas stutzeri
3707Pseudomonas pseudoalcaligenes
3801Stenotrophomonas maltophilia
3901Shewanella putrefaciens
4000Vibrionaeae
4100Aeromonas spp
4101Aeromonas caviae
4102Aeromonas hydrophila
4103Aeromonas sobria
4104Aeromonas salmonicida
4105Aeromonas schubertii
4106Aeromonas media
4107Aeromonas veronii
4200Plesiomonas spp
4201Plesiomonas shigelloides
4300Vibrio spp
4301Vibrio cholerae Group O1
4302Vibrio cholerae non-Group O1
4303Vibrio cholerae Group O139
4304Vibrio parahaemolyticus
4305Vibrio vulnificus
4306Vibrio fluvialis
4307Vibrio metschnikovii
4308Vibrio hollisae
4309Vibrio damsela
4310Vibrio alginolyticus
4311Vibrio mimicus
4312Vibrio furnissii
5100Chromobacterium spp
5101Chromobacterium violaceum
5200Pasteurella spp
5201Pasteurella multocida
5202Pasteurella haemolytica
5203Pasteurella pneumotropica
5204Pasteurella aerogenes
5205Pasteurella ureae
5206Pasteurella gallinarum
5207Pasteurella canis
5208Pasteurella bettyae
5209Pasteurella dagmatis
5300Haemophilus spp
5301Haemophilus parainfluenzae
5302Haemophilus influenzae
5303Haemophilus haemolyticus
5304Haemophilus parahaemolyticus
5305H.aphrophilus（Aggregatibacter actinomycetemcomitans）5306Haemophilus paraphrophilus
5307Haemophilus ducrehi
5308Haemophilus aegytius
5400Capnocytophaga spp.
5501Cardiobacterium hominis
5601Eikenella corrodens
5701Kingella app.
6100Neisseria spp
6101Neisseria gonorrhoeae
6102Neisseria meningitidis
6103Neisseria lactamica
6104Neisseria polysaccharea
6105Neisseria mucosa
6106Neisseria sicca
6107Neisseria subflava
6108Neisseria cinerea
6109Neisseria flavescens
6200Moraxella spp(Branhamella catarrhalis)
6201Moraxella catarrhalis(Branhamella catarrhalis)
6300Micrococcus spp
6301Micrococcus luteus
6302Micrococcus varians
6303Micrococcus roseus
6304Micrococcus kristinae
6400Gemella spp
6401Gemella haemolysans
6500Aerococcus spp
6501Aerococcus viridans
6600Leuconostoc spp
6700Pediococcus spp
6801Clostridium difficile
6900Mycobacterium spp.(fast growth)
6901Mycobacterium （except TB)
9000Fungus
9100Candida spp
9101Candida albicans
9102Candida famate
9103Candida rugosa
9104Candida guilliermondii 9105Candida krusei
9106Candida lusitaniae
9107Candida parapsilosis 9108Candida tropicalis
9109Candida stella
9110Candida pseudotropical
9200Cryptococcus spp
9201Cryptococcus albidus 9202Cryptococcus laurentii 9203Cryptococcus neoformans 9204Cryptococcus gattii
9301Torulopsis glabrata 9302Torulopsis candida
9999No Pathogen Isolated
葡萄球菌属
金黄色葡萄球菌
耳葡萄球菌
头状葡萄球菌
孔氏葡萄球菌
表皮葡萄球菌
溶血葡萄球菌
人葡萄球菌
猪葡萄球菌
中间葡萄球菌
缓慢葡萄球菌
腐生葡萄球菌
施氏葡萄球菌
模仿葡萄球菌
华纳葡萄球菌
木糖葡萄球菌
里昂葡萄球菌
解糖葡萄球菌
链球菌属某种
少酸链球菌
无乳链球菌
咽颊炎链球菌
牛链球菌
星座链球菌
停乳链球菌
马链球菌
马肠链球菌
中间链球菌
缓症链球菌
变异链球菌
肺炎链球菌
化脓性链球菌
兽瘟链球菌
血液链球菌
草绿色链球菌(a型溶血链球菌）
A群链球菌
B群链球菌
C群链球菌
G群链球菌
D群肠球菌
D群非肠球菌
A,C,F,G群链球菌（B型溶血链球菌）鸟肠球菌
酪黄肠球菌
坚韧肠球菌
粪肠球菌
屎肠球菌
鸡鹑肠球菌
空肠肠球菌
F群链球菌（B型溶血链球菌）
棒状杆菌属
白喉棒状杆菌
棒状杆菌重型亚种
棒状杆菌轻型亚种
棒状杆菌中间型亚种
假结核棒状杆菌
干燥棒状杆菌
假白喉棒状杆菌
牛棒状杆菌
生殖棒状杆菌
杰氏棒状杆菌
极小棒状杆菌
纹带棒状杆菌
溃疡棒状杆菌
解脲棒状杆菌
JK群棒状杆菌
人皮肤棒状杆菌
红球菌属某种
马红球菌
孪生球菌属
溶血孪生球菌
麻疹孪生球菌
片球菌属某种
戊糖片球菌
乳酸片球菌
有害片球菌
乳球菌属
格氏乳球菌
明串珠菌属
李斯特菌属某种
伊凡诺夫李斯特菌
产单核细胞李斯特菌
无害李斯特菌
格氏李斯特菌
西利坚李斯特菌
威尔逊李斯特菌
丹毒丝菌属
红斑丹毒丝菌
奴卡菌某属
星型奴卡菌
鼻疽奴卡菌
巴西奴卡菌
豚鼠耳炎奴卡菌
短链奴卡菌
放线菌属某种
化脓放线菌（化脓隐秘杆菌）纽氏放线菌无硝亚种
纽氏放线菌纽亚种
伯尔德放线菌
溶血隐秘杆菌
芽孢杆菌属某种
炭疽芽孢杆菌
短芽孢杆菌
蜡状芽孢杆菌
环状芽孢杆菌
地衣芽孢杆菌
巨大芽孢杆菌
短小芽孢杆菌
肠杆菌科
枸橼酸杆菌属某种
丙二酸盐阴性枸橼酸杆菌
法摩枸橼酸杆菌
布拉格枸橼酸杆菌
弗劳地枸橼酸杆菌
杨格枸橼酸杆菌
乌克曼枸橼酸杆菌
异型枸橼酸杆菌
克氏枸橼酸杆菌
爱德华菌属某种
迟缓爱德华菌
保科爱德华菌
肠杆菌属某种
产气肠杆菌
河生肠杆菌
阿斯布肠杆菌
阴沟肠杆菌
阪崎肠杆菌
格高菲肠杆菌
霍米奇肠杆菌
中间肠杆菌
聚团肠杆菌
埃希菌属某种
大肠埃希菌
O157大肠埃希菌
弗格森大肠埃希菌
赫尔曼大肠埃希菌
伤口大肠埃希菌
侵袭性大肠埃希菌AD群大肠埃希菌
致病性大肠埃希菌
产毒素大肠埃希菌
蜂房哈夫尼亚菌
克雷伯菌属某种
解鸟氨酸克雷伯菌
产酸克雷伯菌
肺炎克雷伯菌
鼻硬结克雷伯菌
土生结克雷伯菌
植物生克雷伯菌
臭鼻克雷伯菌
摩根菌属
摩根摩根菌生物1群摩根摩根菌西伯尼1型摩根摩根菌
变形杆菌属某种
奇异变形杆菌
普通变形杆菌
潘尼变形杆菌
普罗威登菌属某种
产碱普罗威登菌
雷极普罗威登菌
斯图普罗威登菌
拉氏普罗威登菌
沙门菌属某种
都柏林沙门菌
鼠伤寒沙门菌
甲型副伤寒沙门菌乙型副伤寒沙门菌德尔比沙门菌
伤寒沙门菌
肠炎沙门菌
病牛沙门菌
鼠伤寒沙门菌
丙型副伤寒菌
纽波特沙门菌
病牛沙门菌
都柏林沙门菌
纽波特沙门菌
沙雷菌属某种
无花果沙雷菌
液化沙雷菌
泉居沙雷菌
深红沙雷菌
普城沙雷菌
芳香沙雷菌
粘质沙雷菌
志贺菌属某种
鲍氏志贺菌
痢疾志贺菌
福氏志贺菌
宋内志贺菌
耶尔森菌属某种
小肠结肠炎耶尔森菌假结核耶尔森菌
弗氏耶尔森菌
中间耶尔森菌
克氏耶尔森菌
鲁氏耶尔森菌
鼠疫耶尔森菌
克鲁沃菌属
非发酵G-b
不动杆菌属某种
鲍曼不动杆菌
醋酸钙不动杆菌
溶血不动杆菌
约翰不动杆菌
琼氏不动杆菌
洛菲不动杆菌
产碱菌杆属某种
粪产碱杆菌
木糖氧化产碱杆菌木糖亚种(木糖氧化无色杆菌木糖亚种)
木糖氧化产碱杆菌反消化亚种(木糖氧化无色杆菌反消化亚种)芳香产碱杆菌
伯克霍德菌某种
洋葱伯克霍德菌
唐昌蒲伯克霍德菌
鼻疽伯克霍德菌
皮氏伯克霍德菌
假鼻疽伯克霍德菌
丛毛单胞菌属某种
食酸丛毛单胞菌
睾丸酮丛毛单胞菌
黄杆菌属某种
脑膜败血性黄杆菌
芳香黄杆菌
产吲哚黄杆菌
II b 群黄杆菌
栖稻黄单胞菌
莫拉菌属某种
亚特兰大莫拉菌
腔隙莫拉菌
奥斯陆莫拉菌
苯丙酮酸莫拉菌
非液化莫拉菌
假单胞菌属某种
绿脓假单胞菌
产碱假单胞菌
荧光假单胞菌
门多萨假单胞菌
恶臭假单胞菌
施氏假单胞菌
假产碱假单胞菌
嗜麦芽窄食单胞菌
腐败谢瓦纳拉菌
弧菌科
气单胞菌属某种豚鼠气单胞菌
嗜水气单胞菌
温和气单胞菌
杀蛙气单胞菌
舒伯特气单胞菌中间气单胞菌
威隆气单胞菌
邻单胞菌属某种类志贺邻单胞菌
弧菌属某种
O1群霍乱弧菌非O1群霍乱弧菌O139霍乱弧菌副溶血弧菌
致伤弧菌
河弧菌
梅氏弧菌
霍利斯弧菌
海鱼弧菌
溶藻弧菌
拟态弧菌
弗尼斯弧菌
色杆菌属某种
紫色色杆菌
巴斯德菌属某种多杀巴斯德菌
溶血巴斯德菌
侵肺巴斯德菌
产气巴斯德菌
尿素巴斯德菌
鸡巴斯德菌
犬巴斯德菌
贝氏巴斯德菌
达可马巴斯德菌
嗜血杆菌属某种副流感嗜血杆菌流感嗜血杆菌
溶血嗜血杆菌
副溶血嗜血杆菌嗜沫嗜血杆菌
副嗜沫嗜血杆菌
杜克雷嗜血杆菌
埃及嗜血杆菌
二氧化碳嗜纤维菌某种
人心杆菌
腐蚀艾肯菌
金氏菌属某种
奈瑟菌属某种
淋病奈瑟菌
脑膜炎奈瑟菌
乳糖奈瑟菌
多糖奈瑟菌
粘膜奈瑟菌
干燥奈瑟菌
浅黄奈瑟菌
灰色奈瑟菌
金黄色奈瑟菌
布兰汉菌属某种
卡他布兰汉菌
微球菌属某种
藤黄微球菌
易变微球菌
玫瑰色微球菌
克里斯汀微球菌
孪生球菌属某种
溶血孪生球菌
气球菌属某种
绿色气球菌
无色藻菌属某种
平面球菌属某种
难辩芽孢梭菌
分枝杆菌属某种（快生长）非结核分枝杆菌
真菌
假丝酵母菌属（念珠菌属）某种白色假丝酵母菌
无名假丝酵母菌
皱褶假丝酵母菌
季也蒙假丝酵母菌属
克柔假丝酵母菌属
葡萄牙假丝酵母菌
近平滑假丝酵母菌
热带假丝酵母菌
类星形假丝酵母菌
伪热带假丝酵母菌
隐球菌属某种
白色隐球菌
罗伦隐球菌
新型隐球菌
光滑球拟酵母菌
念珠球拟酵母菌
未检出致病菌