第2章 生命的化学特征
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考研科目,动物生物化学 第2章 生命的化学特征

4
(1)C、H、O和N
是组成生命体最基本的元素,生命 体总质量的99%,是构成糖类、脂类、 蛋白质和核酸的主要元素。
外层轨道上有一个或1个以上未成 对电子,可以形成单键、双键和三键。
5
6
生物分子中的共价键与键能
类型 单键 O-H H-H 458 433 键能(kJ/mol) 类型 双键 C=O C=N 708 612 键能* (kJ/mol)
本章主要内容
1.组成生命有机体的元素 2.生物大分子 3.生命有机体中的化学键 4.生物能量学 5.水在生命化学中的作用
2
重点与难点: 生物大分子与化学键 生物能量学
3
1.生命中的元素
生命与非生命物质在化学组成上 有很大的差异,然而组成生命物质的 元素都是存在于非生命界的元素。 天然存在的90多种大约30多种是 生命所必须的。
41
思考题
1 生物大分子,生物能量学,高能磷酸化 合物的概念。 2 生物分子中的化学键有哪些,有何作用。 3 生物化学反应的特点。 4 为什么没有水就没有生命。
42
9
(4)其它的微量元素
主要有铁与铜:化学价可(Cu2+/Cu+ , Fe3+/ Fe2+),在生物氧化过程中作为电 子递体,是许多酶的辅因子。
10
2 生物分子(biological macromolecules)
(1)生物大分子
参与生命有机体活动的
许多分子是非常巨大的,我 们把生物机体中这些巨大的 分子称为生物大分子。
① ATP的三个磷酸基团,使它 pH7.0时带有4个负电荷(ATP4-), 由负电荷相距较近,形成斥力,使磷 酰基团易于水解。
ATP水解ADP和Pi,AMP和PPi
普通生物学:第2章 生命的化学基础

作 用:
(1) 游离态,调节细胞的渗透压、PH值; (2) 合成有机体的原料; (3) 与有机物质结合,组成具有特殊性质的蛋
白质或作为酶的辅助因子,参与代谢活动。
3)单糖
多羟基醛或多羟基酮及其缩合物和某些衍生物称为糖。
(葡萄糖结构式)
天然单糖 大多数是 D-型糖
C1上羟基位置不同 时出现α-,β-两种 构型
氨基酸的α碳原子为手性碳原子,根据旋光性的不同, 左旋和右旋氨基酸分别命名为L- α-氨基酸(左旋)和 D- α-氨基酸(右旋),两者之间互为镜像体。 生物界种的各种蛋白质(除一些细菌的细胞壁中的短肽 和个别抗生素外)几乎都是由L- α-氨基酸所构成;含 D- α-氨基酸的极少。
氨基酸的功能:
(1)作为组建蛋白质的元件 (2)有的氨基酸或其衍生物具
一个氨基酸的羧基和另一个 氨基酸的氨基脱水缩合形成肽键
一条肽链的两端有不同结构和性质: 一端的氨基酸残基带有游离氨
基,称氨基端; 另一端的氨基酸残基带有游离
羧基,称羧基端。
2)、单糖通过糖苷键联成多糖链
(1) 贰糖
对贰糖结构的了解包括弄清楚:
单糖基成份
α-还是β-糖苷键
取代位置
麦芽糖
一条多糖链的两端有不同结构和性质: 一端的糖基有游离的半缩醛羟基,称还原端; 另一端的糖基没有游离的半缩醛羟基, 称非还原端。
吡喃型
(葡萄糖结构式)
单糖的生物功能: A、作为多糖的组成元件 B、作为燃料 C、组成寡糖参与细胞信号传递
4)氨基酸
氨基酸是同时具有α-氨基和α-羧基的小分子
(氨基酸通式)
参与蛋白合成的共有20种天然氨基酸的α碳原子上均连 接这4种基团,即: α羧基、 α氨基,一个H原子和一 个R基(除甘氨酸中为H原子外)R基代表任意基团。
(1) 游离态,调节细胞的渗透压、PH值; (2) 合成有机体的原料; (3) 与有机物质结合,组成具有特殊性质的蛋
白质或作为酶的辅助因子,参与代谢活动。
3)单糖
多羟基醛或多羟基酮及其缩合物和某些衍生物称为糖。
(葡萄糖结构式)
天然单糖 大多数是 D-型糖
C1上羟基位置不同 时出现α-,β-两种 构型
氨基酸的α碳原子为手性碳原子,根据旋光性的不同, 左旋和右旋氨基酸分别命名为L- α-氨基酸(左旋)和 D- α-氨基酸(右旋),两者之间互为镜像体。 生物界种的各种蛋白质(除一些细菌的细胞壁中的短肽 和个别抗生素外)几乎都是由L- α-氨基酸所构成;含 D- α-氨基酸的极少。
氨基酸的功能:
(1)作为组建蛋白质的元件 (2)有的氨基酸或其衍生物具
一个氨基酸的羧基和另一个 氨基酸的氨基脱水缩合形成肽键
一条肽链的两端有不同结构和性质: 一端的氨基酸残基带有游离氨
基,称氨基端; 另一端的氨基酸残基带有游离
羧基,称羧基端。
2)、单糖通过糖苷键联成多糖链
(1) 贰糖
对贰糖结构的了解包括弄清楚:
单糖基成份
α-还是β-糖苷键
取代位置
麦芽糖
一条多糖链的两端有不同结构和性质: 一端的糖基有游离的半缩醛羟基,称还原端; 另一端的糖基没有游离的半缩醛羟基, 称非还原端。
吡喃型
(葡萄糖结构式)
单糖的生物功能: A、作为多糖的组成元件 B、作为燃料 C、组成寡糖参与细胞信号传递
4)氨基酸
氨基酸是同时具有α-氨基和α-羧基的小分子
(氨基酸通式)
参与蛋白合成的共有20种天然氨基酸的α碳原子上均连 接这4种基团,即: α羧基、 α氨基,一个H原子和一 个R基(除甘氨酸中为H原子外)R基代表任意基团。
2生命的化学基础

运甲状腺素蛋白Transthyretin, with four identical polypeptide subunits
胶原蛋白、血红蛋白
大猩猩 长臂猿
恒河猴
核酸
贮存遗传信息,控制蛋白质的 合成 脱氧核糖核酸(DNA)和核糖 核酸(RNA) 组成单位:核苷酸 DNA双螺旋结构
核苷酸
磷酸 戊糖
蛋白质三级结构:旋转区+折叠区
蛋白质三级结构: 多肽链 R基团间的相互作用
蛋白质四级结构: 由2或多条肽链组成,各 亚基之间形成键
Tertiary structure
Polypeptide (single subunit of transthyretin)
Quaternary structure
大分子
多糖 蛋白质 核酸
复合大分子
糖蛋白 糖脂
脂蛋白
Hydrocarbon Structures
主要官能团
羰基
羟基 醛基 酮基羧基 氨基来自 糖类单糖 二糖 多糖
单糖:葡萄糖、果糖
Glucose
Fructose
线型和环形葡萄糖
Figure 3.4C
Abbreviated structure
血糖:血液中的葡萄糖,浓度在激素作用下维持相对稳定
食物消化吸收
肝糖元分解
蛋白质、脂肪分解转化
分解提供能量
血糖
肝糖元、肌糖元贮备
转变为脂肪或氨基酸
二糖:蔗糖(葡萄糖+果糖)
麦芽糖(葡萄糖+葡萄糖)
Sucrose
Figure 3.5
Glucose
Glucose
Maltose
多糖:淀粉、糖原、纤维素
Starch granules in potato tuber cells
生命的化学基础 (2)[可修改版ppt]
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氨基酸
氨基
羧基
不同氨基酸
丙氨酸 缬氨酸 组氨酸 苯丙氨酸
蛋白质一级结构:多肽链的氨基酸顺序
蛋白质二级结构:α螺旋和β折叠
Primary structure
Amino acid
Secondary structure
Hydrogen bond
Alpha helix
Pleated sheet
Figure 3.15, 16
糖精 阿斯巴甜 糖精钠 蔗糖素
脂质
脂肪 磷脂、蜡和固醇
脂肪(fat):甘油+脂肪酸
磷脂(phospholipids)
胆碱
卵磷脂
质膜
胆碱
磷酸
极性头 部甘油脂肪 酸 Nhomakorabea磷
非极性尾
胆
脂
部
固
醇
膜脂质
固醇
固醇类激素
蛋白质
功能 组成单位:氨基酸 蛋白质一、二、三、四级结构
蛋白质功能
结构蛋白 收缩蛋白 贮藏蛋白 防御蛋白:抗体 转运蛋白 信号蛋白 酶
Glucose monomer
STARCH
Glycogen granules in muscle tissue
GLYCOGEN
Cellulose fibrils in Cellulose
a plant cell wall
molecules
Figure 3.7
CELLULOSE
纤维素
淀粉和糖原
不同糖的甜度比较
碱基
※ 戊糖
核糖核酸和脱氧核糖核酸
T T
T
※碱基
Sugar–phosphate backbone
5 end
Nitrogenous bases
第2章生命的化学特征

水有自由水和结合水,前者流动性 大,含量可变,后者主要存在在胶体中, 相对稳定。
水最重要的性质:极性和内聚性。
55
(1) 水分子结构和及其相互作用
水是偶极分子 水分子是极性分子,既是氢键的受 体,又是氢键的供体。
(2) 水的物理性质
56
(3)水的溶媒性质
水是众多反应物的优良的溶剂,使 其自由扩散或发生相互作用。
28
原核细胞
真核细胞
29
原核细胞和真核细胞的比较
大小 细胞核
细胞质 细胞壁
代表
原核细胞
真核细胞
较小
较大
无成形的细胞核,核 有成形的真正的细
物质集中在核区。无 胞核。有核膜,有 核膜,无核仁。DNA 核仁。DNA与蛋白 不与蛋白质结合。 质形成染色体。
核糖体。
有各种细胞器。
有。
植物细胞、真菌 有, 动物细胞无。
14
(3) 酶作为代谢反应催化剂
一个细胞内有数百种不同的酶促反 应,通常以2-20个反应步骤连接成专一 的反应序列,称之为代谢途径(metabolic pathway)。
15
16
(4)生物都需要能量供应
太阳是地球上生物能量的最终来源
17
糖 脂肪 蛋白质
O2
CO2和H2O
ADP+Pi
能量
ATP 热能
α
P OCH 2
-O
-O
-O
O
H
H
H
N CH
N
H
ATP ADP AMP
HO
OH
(A-P~P~P)
42
③ K、Na、Ca、Mg等离子
Na+、K+:渗透压的平衡,神经肌肉正 常兴奋性,糖原合成和蛋白质代谢。
水最重要的性质:极性和内聚性。
55
(1) 水分子结构和及其相互作用
水是偶极分子 水分子是极性分子,既是氢键的受 体,又是氢键的供体。
(2) 水的物理性质
56
(3)水的溶媒性质
水是众多反应物的优良的溶剂,使 其自由扩散或发生相互作用。
28
原核细胞
真核细胞
29
原核细胞和真核细胞的比较
大小 细胞核
细胞质 细胞壁
代表
原核细胞
真核细胞
较小
较大
无成形的细胞核,核 有成形的真正的细
物质集中在核区。无 胞核。有核膜,有 核膜,无核仁。DNA 核仁。DNA与蛋白 不与蛋白质结合。 质形成染色体。
核糖体。
有各种细胞器。
有。
植物细胞、真菌 有, 动物细胞无。
14
(3) 酶作为代谢反应催化剂
一个细胞内有数百种不同的酶促反 应,通常以2-20个反应步骤连接成专一 的反应序列,称之为代谢途径(metabolic pathway)。
15
16
(4)生物都需要能量供应
太阳是地球上生物能量的最终来源
17
糖 脂肪 蛋白质
O2
CO2和H2O
ADP+Pi
能量
ATP 热能
α
P OCH 2
-O
-O
-O
O
H
H
H
N CH
N
H
ATP ADP AMP
HO
OH
(A-P~P~P)
42
③ K、Na、Ca、Mg等离子
Na+、K+:渗透压的平衡,神经肌肉正 常兴奋性,糖原合成和蛋白质代谢。
第2章生命的化学-文档资料

角蛋白(Keratin), 在指甲(fingernails)、 羽毛、头发和犀牛角 (rhinoceros horns) 等存在
微管(Microtubules), 球状结构蛋白组成, 在细胞分裂以及鞭毛(flagella)和纤毛 (cilia)构成中起重要作用
结构 氨基酸 1个氨基(-NH2) 和1个羧基 (-COOH)
缩合反应(Condensation)
一般是脱水合成,常常会脱掉一分子水 (dehydration) 并形成一个新的化学键 (synthesis)
水解(Hydrolysis, Hydration)
与缩合反应相反,它是多聚物的断裂过 程:水分子的-OH和-H分别连接到水解 产物上
生物小分子和生物大分子的关系
酮基 (=O)
甘油醛
代表性糖类的链式 (left) 和环状 (center and right) 结构式
D-Glucose 的模式图 和链式结
构式
二糖(Disaccharide )
蔗糖
半乳糖 乳糖
2个单糖分子通过脱水缩合将化学键联合 在一起形成二糖
麦芽糖
多糖(Polysaccharide)
棕榈酸 硬脂酸
饱和脂 肪酸
油酸
不饱和
脂肪酸
C18:19
C18:29,12
亚油酸
必需脂肪酸(Essential fatty acid) 人体不能够制造,必需从食物中摄取 的脂肪酸 亚油酸和亚麻酸
关键作用: 参与前列腺素(prostaglandin)的合成, 是细胞生长和特化必需的
动物组织中储存的脂肪95%以甘油三酸脂 (Triglycerides)的形式存在【2个不饱和脂肪 酸(亚油酸,linoleic acid)和1个饱和脂肪酸
微管(Microtubules), 球状结构蛋白组成, 在细胞分裂以及鞭毛(flagella)和纤毛 (cilia)构成中起重要作用
结构 氨基酸 1个氨基(-NH2) 和1个羧基 (-COOH)
缩合反应(Condensation)
一般是脱水合成,常常会脱掉一分子水 (dehydration) 并形成一个新的化学键 (synthesis)
水解(Hydrolysis, Hydration)
与缩合反应相反,它是多聚物的断裂过 程:水分子的-OH和-H分别连接到水解 产物上
生物小分子和生物大分子的关系
酮基 (=O)
甘油醛
代表性糖类的链式 (left) 和环状 (center and right) 结构式
D-Glucose 的模式图 和链式结
构式
二糖(Disaccharide )
蔗糖
半乳糖 乳糖
2个单糖分子通过脱水缩合将化学键联合 在一起形成二糖
麦芽糖
多糖(Polysaccharide)
棕榈酸 硬脂酸
饱和脂 肪酸
油酸
不饱和
脂肪酸
C18:19
C18:29,12
亚油酸
必需脂肪酸(Essential fatty acid) 人体不能够制造,必需从食物中摄取 的脂肪酸 亚油酸和亚麻酸
关键作用: 参与前列腺素(prostaglandin)的合成, 是细胞生长和特化必需的
动物组织中储存的脂肪95%以甘油三酸脂 (Triglycerides)的形式存在【2个不饱和脂肪 酸(亚油酸,linoleic acid)和1个饱和脂肪酸
第二章生命化学分析

4. 遗传信息的传递和表达遵循中心法则
第二章生命化学分析
4
1. 糖类是生物体的主要能源物质
三
酶
羧
促
糖
酸
水
酵
循
淀粉 糖原
解
葡萄糖
解
丙酮酸
环
呼 吸 链 CO2
+
H2O
2ATP
2ATP 26ATP
第二章生命化学分析
5
ATP是生物体能量流通的货币
• 能量直接来源
第二章生命化学分析
6
生物体把能量用在生命活动的各个方面
• 【蛋白质的一级结构】:蛋白质分子中 氨基酸的排列顺序,也叫初级结构或基 本结构。
• 蛋白质的一级结构靠共价键(肽键)维 系。
牛胰岛素的一级结构
第二章生命化学分析
20
蛋白质的结构分为4层
• 蛋白质的结构分为一级、二级、三级和 四级结构。
• 二级、三级和四级结构均为蛋白质的高 级结构。
第二章生命化学分析
生命科学导论 An Introduction to Life Sciences
第二章 生命的化学
• 所有的生命体有一个共同的语言,这个 语言就是化学。——Arthur Kornberg
1959年获诺贝尔 生理学或医学奖
亚瑟·科恩伯格
(1918第-二2章0生0命7化)学分析
2
大肠杆菌细胞的分子组成
第二章生命化学分析
12
氨基酸的结构
• 【氨基酸】是含有氨基和羧基的一类有 机化合物的统称,是生物功能大分子蛋 白质的基本组成单位。
✓ 侧链 ✓ 可变基团
氨基酸的结构通式
第二章生命化学分析
13
常见氨基酸有20种
第四版普通生物学第1篇2生命的化学基础

(3)原子的质量主要集中在原子核上。
几种原子的构成
你的结论?
原子种类 氢 碳 氧 钠 氯
质子数 1 6 8 11 17
ቤተ መጻሕፍቲ ባይዱ
中子数 0 6 8 12 18
核外电子数 1 6 8 11 17
质子数=核外电子数
质子数不一定等于中子数。
不是所有的原子都含有中子。
同位素:质子数与电子数相同,中子数 不同的原子。 12C、13C、14C:原子序数(质子数)都是6,
中子数为6、7、8 其中12C、13C为稳定性同位素,14C为放射性同
位素,原子核会自行衰变
同位素示踪:利用放射性同位素显示某 种原子在生物体内的来踪去迹,常用于生物 学研究、医学和疾病诊断等方面
1.自然界元素:92种 2.生命必需元素约25种 生物体的主要元素(大量元素)
C、 H 、O、 N、 P、S、K、 Ca、Cl等,占99.35%, 其中C、H、O、N 4种元素占 96%。 微量元素:含量少于0.01%
普通生物学
第1篇 细胞
南宫中学 鲍晓明
第二章 生命的化学基础
一、原子与分子 二、组成细胞的大分子 三、糖类 四、脂质 五、蛋白质 六、核酸
❖ 2.1.1 生2命.1需要原约子25与种分元素子
❖ 元素是由原子组成的,原子是物质的最 小的单位 质子
❖ 原子 中子 电子
原子的构成
质子(带正电) 原子核 原子 (带正电) 中子(不带电)
(不带电)
电子 (带负电)
核电荷数=质子数=核外电子数
电子运动速度=光速
构成原子的粒子的电性和质量
你有什么发现?
粒子 种类 质子 中子 电子
电性
1个单位正电荷 不带电
几种原子的构成
你的结论?
原子种类 氢 碳 氧 钠 氯
质子数 1 6 8 11 17
ቤተ መጻሕፍቲ ባይዱ
中子数 0 6 8 12 18
核外电子数 1 6 8 11 17
质子数=核外电子数
质子数不一定等于中子数。
不是所有的原子都含有中子。
同位素:质子数与电子数相同,中子数 不同的原子。 12C、13C、14C:原子序数(质子数)都是6,
中子数为6、7、8 其中12C、13C为稳定性同位素,14C为放射性同
位素,原子核会自行衰变
同位素示踪:利用放射性同位素显示某 种原子在生物体内的来踪去迹,常用于生物 学研究、医学和疾病诊断等方面
1.自然界元素:92种 2.生命必需元素约25种 生物体的主要元素(大量元素)
C、 H 、O、 N、 P、S、K、 Ca、Cl等,占99.35%, 其中C、H、O、N 4种元素占 96%。 微量元素:含量少于0.01%
普通生物学
第1篇 细胞
南宫中学 鲍晓明
第二章 生命的化学基础
一、原子与分子 二、组成细胞的大分子 三、糖类 四、脂质 五、蛋白质 六、核酸
❖ 2.1.1 生2命.1需要原约子25与种分元素子
❖ 元素是由原子组成的,原子是物质的最 小的单位 质子
❖ 原子 中子 电子
原子的构成
质子(带正电) 原子核 原子 (带正电) 中子(不带电)
(不带电)
电子 (带负电)
核电荷数=质子数=核外电子数
电子运动速度=光速
构成原子的粒子的电性和质量
你有什么发现?
粒子 种类 质子 中子 电子
电性
1个单位正电荷 不带电
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血红蛋白的空间结构
11
生物大分子通过组成它们的单体之 间的非共价相互作用,形成特定的空间 结构,从而具有了不同的生物学功能。 生物大分子是表现生命特征的基本 物质。
12
(2)有机小分子 细胞中还存在许多具有独特功能的 有机小分子物质,也是合成较大分子的前
体。
核苷酸、氨基酸、葡萄糖
脂肪酸、胆碱、甘油等
34
(4)细胞是一个高效率的能量转换器 细胞是一个高效率的能量转换器, 生命有机体中的能量转换是通过电子流 动来实现的。 光合细胞 非光合细胞
35
(5)水是生命的介质
水是生命有机体中含量最多的物 质,一般占体重的60%-70%。 水有自由水和结合水,前者流动 性大,含量可变,后者主要存在在胶 体中,相对稳定。
ΔG< 0,放能,可以做功,自发进行。 ΔG >0,吸能,非自发进行,必须供能才能进行。 ΔG =0,平衡状态。
24
体内能量的产生、转移和利用
25
(2)ATP(腺苷三磷酸)
分解代谢释放的能量并不能直接被 细胞利用,必须经一类高能物质,其中 最主要的是ATP暂时储存(能量载体和 递体)起来,用于细胞的生命活动。
细胞直能接利用的是腺苷三磷酸 ( ATP ) 中所储存的能量。
26
NH
2
ATP在3个磷酸基团中含有两 个磷酸酐键,成为高能分子
O γ
C
N HC N C C
N
CH
N
O
O β α
O
P ~O
P ~O
-
P
OCH
2
-O
-O
-O
H
O H H
H
HO ATP ADP AMP
OH
(A-P~P~P),
27
ATP的水解
脂 酸 肪 + HS CoA 脂 CoA合 酶 酰 成 Mg 2+ ATP AMP 脂 酰
~ SCoA + PPi
三磷酸酰苷(ATP):用于贮存和 转移化学能。
8
(3)K、Na、Cl、Ca、Mg
维持细胞渗透压、细胞容积、离子平衡、细 胞电位。 Na+、K+离子:渗透压的平衡,神经肌肉 正常兴奋性,糖原合成和蛋白质代谢。 Mg+:300多种酶的辅因子。 Ca2+:骨骼的主要成分,参与广泛的细胞 生理活动,如物质的转运与分泌,血液凝固,是 细胞信号传导的第二信使等。
① ATP的三个磷酸基团,使它 pH7.0时带有4个负电荷(ATP4-), 由负电荷相距较近,形成斥力,使磷 酰基团易于水解。
ATP水解ADP和Pi,AMP和PPi
28
② 当ATP水解为ADP3-和HPO42时,斥力得到缓和,电子可降到最低 能水平而促使ATP释放较多的自由能 (共振稳定性)。 ATP+H2O ADP + Pi
9
(4)其它的微量元素
主要有铁与铜:化学价可(Cu2+/Cu+ , Fe3+/ Fe2+),在生物氧化过程中作为电 子递体,是许多酶的辅因子。
10
2 生物分子(biological macromolecules)
(1)生物大分子
参与生命有机体活动的
许多分子是非常巨大的,我 们把生物机体中这些巨大的 分子称为生物大分子。
41
思考题
1 生物大分子,生物能量学,高能磷酸化 合物的概念。 2 生物分子中的化学键有哪些,有何作用。 3 生物化学反应的特点。 4 为什么没有水就没有生命。
42
13
(3)核酸、蛋白质和多糖等主要生物大分子
14
蛋白质的功能
催化功能 储存运输功能 防御功能 结构组成 运动功能 营养功能 遗传信息
15
调节功能
(4)类脂 类脂(如磷脂)是富含碳氢元素的一 族生物小分子,其在水溶液中溶解性较差、
兼具亲水和亲脂特性。
细胞的膜结构就ATP循环
ATP
肌酸 磷酸 肌酸
~P
氧化磷酸化 底物水平磷酸化
ADP
~P
机械能(肌肉收缩) 渗透能(物质主动转运) 化学能(合成代谢) 电能(生物电) 热能(维持体温)
33
(3)能量偶联反应
在生命有机体中一个放能的反应可以与一 个耗能的反应偶联以推动原本不能进行的反应。 葡萄糖+磷酸 葡萄糖-6-磷酸(耗能,ΔG>0,为 14kJ/mol) ATP ADP+Pi(放能,ΔG<0,为 -31 kJ/mol) 葡萄糖+ATP 葡萄糖-6-磷酸 + ADP(放 能,ΔG<0,为 -17 kJ/mol)
第2章 生命的化学特征
Chemical Properties of Life
1
本章主要内容
1.组成生命有机体的元素 2.生物大分子 3.生命有机体中的化学键 4.生物能量学 5.水在生命化学中的作用
2
重点与难点: 生物大分子与化学键 生物能量学
3
1.生命中的元素
生命与非生命物质在化学组成上 有很大的差异,然而组成生命物质的 元素都是存在于非生命界的元素。 天然存在的90多种大约30多种是 生命所必须的。
3.生命有机体中的化学键
在生物大分子之间主要存在的非共价的相互 作用力包括氢键、离子键、范德瓦尔力、疏水力。 (1)氢键(hydrogen bonds): 存在于带电荷的和不带电荷的分子之间。由 两个原子来分享一个氢原子,具有高度定向性, 一个是氢供体(O、N),另一个是氢受体(带部 分负电荷)。
ATP具有较高的磷酸基团转移潜势
29
有一些反应需要UTP、CTP和GTP
ATP + UDP
ATP + CDP
ADP + UTP(三磷酸尿苷)
ADP + CTP(三磷酸胞苷)
ATP + GDP
ADP + GTP(三磷酸鸟苷)
30
31
ATP循环 ATP是生物界普遍使用的供能物质, 有“通用货币” (general currency of ener gy)之称。 ATP水解为ADP并供出能量之后,又 可通过氧化磷酸化重新合成,从而形成 ATP循环。
36
水分子是极性分子,既是氢 键的受体,又是氢键的供体。 水分子的极性和形成氢键的 能力使其具有高度反应性。
37
水有高的介电常数(80),因此是 众多反应物的优良的溶剂,使其自由扩 散或发生相互作用。 没有水就没有生命。
38
水分子竞争羰基氧与亚氨基氮之间的氢键
39
水溶液中的离子
40
小结:
1 2 3 4 构成生命物质的主要元素 主要的化学键 生物能量学 水的生物学意义
P-O
C-H C-O C-C S-H
416
413 350 346 338
C=C
P=O 三键** C≡C
608
500 813
C-N
C-S N-O S-S
297
258 220 212
7
(2)S和P
可以形成相对比较弱的化学键, 在化学基团和能量转移中有重要作用。 巯基(-SH):用于携带和转移脂 酰基。
18
(2)离子键(ionic bonds) 正、负电荷之间的静电引力 (3)范德瓦尔力(Van der Waals bonds) 一定距离内(0.3-0.4nm)的原子之间通 过偶极发生的相互作用,本质上也是静电引力。
19
(4)疏水力(hydrophobic interaction) 非极性分子或基团在水相环境中相互 吸引、聚集的作用力。蛋白质折叠、生物 膜形成、酶对底物的催化。 (5)二硫键(disulfide bond) 指2个硫原子之间的共价键,对稳定蛋 白质的构象起重要作用。
20
4 种非共价作用力的示意图
21
22
4.生物能量学(bioenergetics)
生物能量学:研究生命有机体传递 和消耗能量的过程,阐明能量的转换和 交流的基本规律。 氧化方式吸收能量 太阳光吸收能量
23
(1) 自由能
自由能(G):指在一个体系的总能量中,在 恒温恒压条件下能够做功的那一部分能量。 自由能是一种状态函数,但变化(ΔG): A B ΔG= GB – GA
4
(1)C、H、O和N
是组成生命体最基本的元素,生命 体总质量的99%,是构成糖类、脂类、 蛋白质和核酸的主要元素。
外层轨道上有一个或1个以上未成 对电子,可以形成单键、双键和三键。
5
6
生物分子中的共价键与键能
类型 单键 O-H H-H 458 433 键能(kJ/mol) 类型 双键 C=O C=N 708 612 键能* (kJ/mol)
11
生物大分子通过组成它们的单体之 间的非共价相互作用,形成特定的空间 结构,从而具有了不同的生物学功能。 生物大分子是表现生命特征的基本 物质。
12
(2)有机小分子 细胞中还存在许多具有独特功能的 有机小分子物质,也是合成较大分子的前
体。
核苷酸、氨基酸、葡萄糖
脂肪酸、胆碱、甘油等
34
(4)细胞是一个高效率的能量转换器 细胞是一个高效率的能量转换器, 生命有机体中的能量转换是通过电子流 动来实现的。 光合细胞 非光合细胞
35
(5)水是生命的介质
水是生命有机体中含量最多的物 质,一般占体重的60%-70%。 水有自由水和结合水,前者流动 性大,含量可变,后者主要存在在胶 体中,相对稳定。
ΔG< 0,放能,可以做功,自发进行。 ΔG >0,吸能,非自发进行,必须供能才能进行。 ΔG =0,平衡状态。
24
体内能量的产生、转移和利用
25
(2)ATP(腺苷三磷酸)
分解代谢释放的能量并不能直接被 细胞利用,必须经一类高能物质,其中 最主要的是ATP暂时储存(能量载体和 递体)起来,用于细胞的生命活动。
细胞直能接利用的是腺苷三磷酸 ( ATP ) 中所储存的能量。
26
NH
2
ATP在3个磷酸基团中含有两 个磷酸酐键,成为高能分子
O γ
C
N HC N C C
N
CH
N
O
O β α
O
P ~O
P ~O
-
P
OCH
2
-O
-O
-O
H
O H H
H
HO ATP ADP AMP
OH
(A-P~P~P),
27
ATP的水解
脂 酸 肪 + HS CoA 脂 CoA合 酶 酰 成 Mg 2+ ATP AMP 脂 酰
~ SCoA + PPi
三磷酸酰苷(ATP):用于贮存和 转移化学能。
8
(3)K、Na、Cl、Ca、Mg
维持细胞渗透压、细胞容积、离子平衡、细 胞电位。 Na+、K+离子:渗透压的平衡,神经肌肉 正常兴奋性,糖原合成和蛋白质代谢。 Mg+:300多种酶的辅因子。 Ca2+:骨骼的主要成分,参与广泛的细胞 生理活动,如物质的转运与分泌,血液凝固,是 细胞信号传导的第二信使等。
① ATP的三个磷酸基团,使它 pH7.0时带有4个负电荷(ATP4-), 由负电荷相距较近,形成斥力,使磷 酰基团易于水解。
ATP水解ADP和Pi,AMP和PPi
28
② 当ATP水解为ADP3-和HPO42时,斥力得到缓和,电子可降到最低 能水平而促使ATP释放较多的自由能 (共振稳定性)。 ATP+H2O ADP + Pi
9
(4)其它的微量元素
主要有铁与铜:化学价可(Cu2+/Cu+ , Fe3+/ Fe2+),在生物氧化过程中作为电 子递体,是许多酶的辅因子。
10
2 生物分子(biological macromolecules)
(1)生物大分子
参与生命有机体活动的
许多分子是非常巨大的,我 们把生物机体中这些巨大的 分子称为生物大分子。
41
思考题
1 生物大分子,生物能量学,高能磷酸化 合物的概念。 2 生物分子中的化学键有哪些,有何作用。 3 生物化学反应的特点。 4 为什么没有水就没有生命。
42
13
(3)核酸、蛋白质和多糖等主要生物大分子
14
蛋白质的功能
催化功能 储存运输功能 防御功能 结构组成 运动功能 营养功能 遗传信息
15
调节功能
(4)类脂 类脂(如磷脂)是富含碳氢元素的一 族生物小分子,其在水溶液中溶解性较差、
兼具亲水和亲脂特性。
细胞的膜结构就ATP循环
ATP
肌酸 磷酸 肌酸
~P
氧化磷酸化 底物水平磷酸化
ADP
~P
机械能(肌肉收缩) 渗透能(物质主动转运) 化学能(合成代谢) 电能(生物电) 热能(维持体温)
33
(3)能量偶联反应
在生命有机体中一个放能的反应可以与一 个耗能的反应偶联以推动原本不能进行的反应。 葡萄糖+磷酸 葡萄糖-6-磷酸(耗能,ΔG>0,为 14kJ/mol) ATP ADP+Pi(放能,ΔG<0,为 -31 kJ/mol) 葡萄糖+ATP 葡萄糖-6-磷酸 + ADP(放 能,ΔG<0,为 -17 kJ/mol)
第2章 生命的化学特征
Chemical Properties of Life
1
本章主要内容
1.组成生命有机体的元素 2.生物大分子 3.生命有机体中的化学键 4.生物能量学 5.水在生命化学中的作用
2
重点与难点: 生物大分子与化学键 生物能量学
3
1.生命中的元素
生命与非生命物质在化学组成上 有很大的差异,然而组成生命物质的 元素都是存在于非生命界的元素。 天然存在的90多种大约30多种是 生命所必须的。
3.生命有机体中的化学键
在生物大分子之间主要存在的非共价的相互 作用力包括氢键、离子键、范德瓦尔力、疏水力。 (1)氢键(hydrogen bonds): 存在于带电荷的和不带电荷的分子之间。由 两个原子来分享一个氢原子,具有高度定向性, 一个是氢供体(O、N),另一个是氢受体(带部 分负电荷)。
ATP具有较高的磷酸基团转移潜势
29
有一些反应需要UTP、CTP和GTP
ATP + UDP
ATP + CDP
ADP + UTP(三磷酸尿苷)
ADP + CTP(三磷酸胞苷)
ATP + GDP
ADP + GTP(三磷酸鸟苷)
30
31
ATP循环 ATP是生物界普遍使用的供能物质, 有“通用货币” (general currency of ener gy)之称。 ATP水解为ADP并供出能量之后,又 可通过氧化磷酸化重新合成,从而形成 ATP循环。
36
水分子是极性分子,既是氢 键的受体,又是氢键的供体。 水分子的极性和形成氢键的 能力使其具有高度反应性。
37
水有高的介电常数(80),因此是 众多反应物的优良的溶剂,使其自由扩 散或发生相互作用。 没有水就没有生命。
38
水分子竞争羰基氧与亚氨基氮之间的氢键
39
水溶液中的离子
40
小结:
1 2 3 4 构成生命物质的主要元素 主要的化学键 生物能量学 水的生物学意义
P-O
C-H C-O C-C S-H
416
413 350 346 338
C=C
P=O 三键** C≡C
608
500 813
C-N
C-S N-O S-S
297
258 220 212
7
(2)S和P
可以形成相对比较弱的化学键, 在化学基团和能量转移中有重要作用。 巯基(-SH):用于携带和转移脂 酰基。
18
(2)离子键(ionic bonds) 正、负电荷之间的静电引力 (3)范德瓦尔力(Van der Waals bonds) 一定距离内(0.3-0.4nm)的原子之间通 过偶极发生的相互作用,本质上也是静电引力。
19
(4)疏水力(hydrophobic interaction) 非极性分子或基团在水相环境中相互 吸引、聚集的作用力。蛋白质折叠、生物 膜形成、酶对底物的催化。 (5)二硫键(disulfide bond) 指2个硫原子之间的共价键,对稳定蛋 白质的构象起重要作用。
20
4 种非共价作用力的示意图
21
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4.生物能量学(bioenergetics)
生物能量学:研究生命有机体传递 和消耗能量的过程,阐明能量的转换和 交流的基本规律。 氧化方式吸收能量 太阳光吸收能量
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(1) 自由能
自由能(G):指在一个体系的总能量中,在 恒温恒压条件下能够做功的那一部分能量。 自由能是一种状态函数,但变化(ΔG): A B ΔG= GB – GA
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(1)C、H、O和N
是组成生命体最基本的元素,生命 体总质量的99%,是构成糖类、脂类、 蛋白质和核酸的主要元素。
外层轨道上有一个或1个以上未成 对电子,可以形成单键、双键和三键。
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生物分子中的共价键与键能
类型 单键 O-H H-H 458 433 键能(kJ/mol) 类型 双键 C=O C=N 708 612 键能* (kJ/mol)