PUBMED检索基本知识

合集下载

pubmed检索方法

pubmed检索方法

pubmed检索方法Pubmed 检索方法Pubmed 是美国国家医学图书馆(National Library of Medicine)所开发的一个免费的生物医学文献库,包含了全球几乎所有的生物医学文献,是医学研究人员和医生进行搜索和查找相关医学文献的重要工具。

本文将介绍Pubmed 的检索方法。

一、关键词检索关键词检索是 Pubmed 最常用的检索方式,通过输入关键字搜索相关的文献。

在检索时需要注意以下几点:(1)关键词要准确。

Pubmed 检索采用布尔操作符(AND、OR、NOT)连接多个关键词,关键词之间要使用英文逗号(,)隔开。

使用过多的关键词可能会导致检索结果没有想象中的好。

(2)参数设置。

可以根据需求调整相关参数,例如年份、文献类型(Review、Clinical Trial、Randomized Controlled Trial等)、文章作者、机构等。

(3)英文文献。

Pubmed 绝大部分都是英文文献,所以检索时需要使用英文关键词。

(4)筛选性强的关键词。

例如疾病名称、独特的药品名称等。

Pubmed 支持多种文献类型检索,例如:(1)临床试验在 Pubmed 首页上,勾选临床试验会检索到近期的中断临床试验、未发布的临床试验等。

(2)随机对照试验勾选随机对照试验可以检索到已发表的随机对照试验。

(3)综述勾选文章类型为系统综述或综述,可以检索到该领域最新的文献综述。

三、学科分类检索Pubmed 中的文献都会有一个或多个学科分类号(MeSH Terms),用户可以通过选择学科分类号进行检索。

在检索时需要注意以下几点:(1)科学性强的关键词。

例如,临床试验、人类、治疗法等。

(2)与所需内容相关的关键词。

例如,药物作用机制、剂量方案等。

(3)使用适当数量的关键词。

使用过少的关键词会导致检索结果过多,使用过多的关键词会导致检索结果不够全面。

Pubmed 中的文献都会有一个分值,通过分值和其他指标来对文献进行评价。

pubmed基本知识普及

pubmed基本知识普及

PUBMED检索小技巧pubmed是我们最常用到的检索数据库,功能非常强大,但在实际应用过程中往往有一些非常实用的功能不被重视,下面就我的使用经验谈谈体会,请高手指正并补遗。

1、History功能:作为PUBMED的“四大金刚”之一,至少有50%的人忽略了它的好处。

当你检索的主题词有很多的别名、定义或缩写时,或者你要检索多个领域交叉的文章时,如果单单在检索框里输入检索词和逻辑运算符,将显得非常累赘、容易出错并且不易查全、查准。

这时你可以试试HISTORY功能:每次检索时只要输入最简单的检索式,然后进入HISTORY,这时你就发现刚才你所有的检索结果都在里面,而且还编上了号,接下来不用说了,你就可以随心所欲地排列组合你的检索词了,如:#1 AND#2,#2 OR#3 NOT#4,等等,就象在Medline中检索一样方便。

(注意:在HISTORY中输入检索式后按回车的效果与按PREVIEW 按钮是一样的,即仅显示检索结果有多少篇,但按GO按钮之后就会跳出HISTORY进入题名或文摘界面,再进HISTORY时就需切换一下,有点麻烦)2、CUBBY功能:使用CUBBY功能(在PUBMED界面的左边有CUBBY的链接)可以保存你的检索式。

如果需要跟踪某一领域的最新进展,可以将检索式保存在CUBBY中,定期调用查看一下就能紧跟潮流了:-)。

CUBBY功能需要注册,不过是完全免费的(大家抢啊,呵呵)。

3、高效利用PUBMED:在实验过程中常常会为引物设计、退火温度、蛋白质大小等等的实际问题所困扰,回顾文献往往效率很低,查不到很具体的东东,这时可以祭出PUBMED,把你所要找的东西直接敲进去,如Primer, RT-PCR, Western Blot,等等,总而言之就是把PUBMED 当作GOOGLE来用好了,由于PUBMED收录的文章关键词给得很全,很多,所以十步之内必有芳草,可能连你预期的实验结果图例都有了,呵呵。

pubmed文献检索方法

pubmed文献检索方法

pubmed文献检索方法摘要:一、PubMed简介二、文献检索方法1.基本检索2.高级检索3.检索策略三、检索实例四、检索技巧1.关键词选择2.运用布尔操作符3.限制检索范围五、文献管理与分析工具六、总结与建议正文:一、PubMed简介PubMed是由美国国立卫生研究院(NIH)开发和维护的一个免费生物医学文献数据库,包含了大量的生物医学、生命科学、化学等领域的研究文献。

它为广大科研工作者、医生和药师等提供了便捷的文献查询途径。

二、文献检索方法1.基本检索在PubMed首页,可以通过输入关键词或输入文献的题名、作者、出版年份等进行基本检索。

基本检索的结果会按照相关性排序。

2.高级检索点击检索框下方的“高级检索”按钮,可以进入高级检索界面。

高级检索允许用户对检索词、检索范围、文献类型等进行更详细的设定,从而提高检索的准确性。

3.检索策略在检索过程中,可以采用一些策略提高检索效果。

例如,使用截词符(*)进行词干检索,或将关键词用引号括起来进行精确检索。

三、检索实例以下是的一个检索实例:假设我们想查找关于“新冠病毒”(SARS-CoV-2)的研究文献,可以在检索框中输入“SARS-CoV-2”或“新冠病毒”,然后点击检索按钮。

检索结果会包括与新冠病毒相关的文章,如病毒基因序列、疫苗研究、治疗方法等。

四、检索技巧1.关键词选择选择合适的关键词是提高检索效果的关键。

可以通过查阅相关领域的专业词典、综述文章等,了解研究领域的主要术语和概念。

2.运用布尔操作符布尔操作符(AND、OR、NOT)在检索过程中起到筛选和组合检索词的作用。

例如,输入“新冠病毒AND 疫苗”,可以检索到同时涉及新冠病毒和疫苗的文章。

3.限制检索范围在检索过程中,可以通过设置文献类型、发表年份、语言等限制条件,缩小检索范围,提高检索的针对性。

五、文献管理与分析工具PubMed提供了多种文献管理与分析工具,如引文导出、文献收藏、文献标签等。

PubMed检索

PubMed检索

发展历程
NLM早在1879年即开始编译医学文献的检索刊物 《医学索引》(Index Medicus ,IM)
从1964年起,采用计算机进行电子编辑和排版,在此 基础上开发了“医学文献分析与检索系统”(Medical Literature Analysis & Retrieval System),即著名 的MEDLARS系统
MeSH转换表 Vitamin h→ "biotin"[MeSH Terms] OR "biotin"[All Fields] OR "vitamin h"[All Fields]
期刊转换表 new england journal of medicine → "N Engl J Med"[Journal] OR "new england journal of medicine"[All Fields]
临床查询(Clinical Queries)
Clinical Study Categories(临床研究类文献) Systematic Reviews(系统评价) Medical Genetics(医学遗传学)
MeSH: Clinical Queries
结果限定选项
直接以systematic review、Cochrane、meta-analysis、 Randomized Controlled Trial等为关键词进行检索
PubMed每条记录均有惟一的识别号 PMID(PubMed Unique Identifier) 。
❖ MEDLINE: PubMed主体部分,记录均标有 [PubMed-indexed for MEDLINE]

Pubmed基本的检索知识

Pubmed基本的检索知识

Pubmed基本的检索知识Pubmed是医学专业常用的数据库,对于医学科研工作至关重要,但是对于Pubmed最基本的检索知识你都了解吗?下面介绍了Pubmed三种检索方式,检验一下你都get到了吗?Pubmed主界面1基本检索引文状态标记值分为:[PubMed-indexed for MEDLINE]、[PubMed-in process]、[PubMed-OLDMEDLINE]、[PubMed – as supplied by publisher]四种状态。

[PubMed-indexed for MEDLINE]:被MEDLINE所收录并被标引MeSH主题词,具有完整的书目题录信息,检索此类文章方法:在检索框输入medline [sb]。

[PubMed-in process]:每天收录由MEDLINE的期刊出版商提供的尚未经过规范化处理的数据,该库中的记录只具有简单的书目信息和文摘、每星期当该库中数据被标引MeSH词、文献类型及其他数据时转入MedLine一次,而被处理前的数据从该数据库中删除。

检索此类文章方法:在检索框输入inprocess [sb]。

[PubMed-OLDMEDLINE]:含1950年至1965年期间发表的200万篇生物医学文献。

OldMedline的记录没有MeSH字段和摘要。

检索此类文章方法:在检索框输入oldmedline [sb] [PubMed –as supplied by publisher]:是由出版商提供的电子文献MEDLINE收录范围的文献,每日被添加到In Process Citation中去,换上[PubMed – in process]的标记,并赋予一个MEDLINE的数据识别号UI;不属于MEDLINE收录范围的文献则只有PubMed数据识别号PMID 而没有MEDLINE UI。

布尔逻辑运算符(检索时需大写)AND可用来表示其所连接的两个检索项的交叉部分,也即交集部分。

pubmed引文检索

pubmed引文检索

pubmed引文检索
在PubMed上进行引文检索(Citation Search)是一种查找特定文献的方法。

这允许你查找引用了或被引用了某一篇文章的其他文章。

以下是在PubMed上执行引文检索的一般步骤:
1.搜索原始文章:进入PubMed,使用文章的标题、作者或PMID(PubMed唯一标识符)等信息,找到你感兴趣的原始文章。

2.进入文章页面:点击文章标题,进入文章的详细页面。

3.找到引文选项:在文章详细页面中,查找引文或相关记录的选项。

通常,这个选项位于页面的右侧或下方。

4.进行引文检索:点击引文或相关记录的链接,这将显示引用了或被引用了原始文章的其他文章列表。

5.筛选和浏览引文:根据需要,你可以使用PubMed提供的筛选选项来缩小结果,例如按日期、文章类型等。

浏览引文列表,找到你感兴趣的文献。

6.查看引文详细信息:点击引文列表中的文献标题,以查看有关该文献的详细信息。

请注意,有时不是所有的引文信息都会在PubMed中显示,这取决于文献的可用性和PubMed数据库的更新。

此外,引文检索的准确性也受到引用格式和文献数据库互操作性的影响。

pubmed检索综述

pubmed检索综述

pubmed检索综述PubMed是生命科学和医学领域的一种重要文献检索工具,被广泛用于学术研究、医学实践和科学进展。

本文将深入探讨如何在PubMed上进行综述检索,以帮助研究人员更有效地获取相关文献,了解领域的最新动态。

1. PubMed简介在讨论综述检索之前,我们首先要了解PubMed的基本情况。

1.1 PubMed的来源PubMed是由美国国立医学图书馆(NLM)提供的免费文献数据库,涵盖了生物医学、生命科学和相关领域的大量文献。

1.2 PubMed的特点PubMed具有广泛的学科覆盖范围,包括医学、生物学、生物化学、药学等,是医学和生命科学领域研究者获取信息的重要工具。

2. 关键词的选择与构建在进行PubMed检索时,选择和构建合适的关键词是获取准确结果的关键。

2.1 主题词与自由词利用PubMed的主题词(MeSH词)和自由词进行关键词选择,以确保检索结果的广泛性和准确性。

2.2 同义词与扩展词考虑使用相关的同义词和扩展词,以涵盖不同表达方式的文献,提高检索的全面性。

2.3 关键词的组合合理组合关键词,使用AND、OR、NOT等逻辑运算符,构建复杂而精确的检索式,以确保检索结果符合研究目的。

3. 高级检索与筛选PubMed提供了丰富的高级检索和筛选功能,帮助研究者更精准地定位所需文献。

3.1 时间范围的设定通过设定检索时间范围,可以获取最新的研究成果,同时限制检索结果的数量。

3.2 文献类型的筛选在高级检索中,可以选择特定的文献类型,如综述、临床研究、病例报告等,以便更有针对性地获取信息。

3.3 作者、期刊和机构的限定通过指定作者、期刊或机构,可以进一步缩小检索结果的范围,确保文献的质量和相关性。

4. 利用PubMed工具优化检索PubMed提供了多种工具和功能,帮助用户更方便、更快速地进行文献检索。

4.1 My NCBI账户的建立通过建立My NCBI账户,用户可以保存检索历史、创建自定义检索、设置提醒等,提高检索的效率和个性化。

PubMed检索指南

PubMed检索指南

PubMed检索指南1.PubMed基本检索方式(Basic PubMed Search)进入PubMed基本检索方式主页,在检索框中可以输入任意词,包括文献作者,出版杂志等:∙键入一个或多个检索词(可以为任意词),如protein disulfide isomerase ,也可以输入缩略名如pdi等;输入多个词时,可自动识别成词组;但词数太多时,则以逻辑与的方式识别,如可以将protein disulfide isomerase识别成一个词,也有可能将其识别成“protein AND disulfide AND isomerase”尤其是出现数字等符号时不易识别成词组;∙对PubMed不能识别检索的词组,需加引号强调,如键入:“Insight II”∙以文献作者方式检索,作者名的输入格式为:姓+名如输入:Freesman DJ ,其中“姓”为全称,“名”则为首字母简写形式(“名”可以省略);∙键入的杂志名称可以是全名,也可以是杂志名的MedLine缩写格式∙或ISSN杂志号(见期刊浏览)。

∙检索时可在词尾加“*”号检索所有具有同样词头的词。

如键入:biolog*可查得biology或biological 等词。

PubMed可将多个词以词组形式查询,对PubMed不能识别检索的词组,需加引号强调,如键入:“Insight II”将识别成词组“Insight II”以方式查询,若键入:Insight II则有可能分开识别成“Insight” 和“II”两个词,以逻辑与“Insight AND II”的方式进行检索。

词与词间可用AND、OR或NOT逻辑进行连词检索。

键入检索词后,别忘了选择检索年限(30天,10年不等)及选择文献的页面显示数目。

按Enter回车键或鼠标击话界面中的“Search”按钮可得到查询文献提要(document summary page)。

2.PubMed高级检索方式 (Advanced Search)与基本检索方式不同的是增加了检索范围(search fields).和检索模式(search mode)的选择框。

  1. 1、下载文档前请自行甄别文档内容的完整性,平台不提供额外的编辑、内容补充、找答案等附加服务。
  2. 2、"仅部分预览"的文档,不可在线预览部分如存在完整性等问题,可反馈申请退款(可完整预览的文档不适用该条件!)。
  3. 3、如文档侵犯您的权益,请联系客服反馈,我们会尽快为您处理(人工客服工作时间:9:00-18:30)。

Google简介
➢由两个斯坦福大学博士生Larry Page与 Sergey Brin于1998年9月发明。
➢约搜索30亿张网页,包括35个国家和地区 的资源。
➢已占有全球搜索市场的80%。Google 在中 国的搜索市场的市场份额也已突破30%,并 且增长速度迅猛,在中文搜索市场有举足轻 重的作用。
1.MedScape (/) 2.MEDguide () 3. Natural healthweb (/) 4. MedExplorer () 5.Medwebplus ()
INTERNET
类型
根据以下四种分类标准进行划分: 1.按内容的组织和表现形式分: 2.按提供网络服务的方式分: 3.按信息资源的来源分: 4.按生物医学主题(学科或疾病)划分:
/htm/med /gxk.htm
INTERNET
Internet生物医学信息资源的特点
➢ “-” 操作符:排除所有包括搜索字词的结果,如 [Flowers -作者:Flowers ];
➢ 短语搜索:包括这一确切短语的结果,如 [“非小 细胞肺癌"];
➢ “OR” 操作符:包括搜索字词之一的结果,如 [哮喘 OR 咳嗽];
➢ “标题”操作符:如在[标题:mars] 得到的结果 只包括文件名中的搜索字词。
1.信息源丰富; 2.组织形式多样化; 3.更新速度快; 4.检索方式灵活; 5.动态变化,管理困难; 6.规范化程度不高。
INTERNET
Internet信息资源检索的方法
人们已经考虑到了网络资源的特点,在 Internet上建立了各类资源导航或指南或专门帮助 用户查找网上资源的搜索工具—搜索引擎(Search engines)。
-(mcculloch pitts 1943)
文 献 类 型
Google特点
➢布尔逻辑:+;-;OR ➢高级搜索:site,link,intitle,allintitle ,
inurl,allinurl 。 ➢查找PDF文件,filetype:pdf ➢每日要点、本地搜索、查询优化、参考工
具、按数字搜索、选择关键字 ➢使用帮助中借助“Google大全”
Google Scholar文献类型
➢期刊论文 ➢学位论文 ➢专业图书 ➢预印本 ➢文摘 ➢技术报告
பைடு நூலகம் Google Scholar检索方法
• 简单检索 • 高级检索
简单检索
高级检索
高级操作符
➢ “+” 操作符:确保您的搜索结果中包括 Google 学 术搜索技术通常忽略的普通字词、字母或数字, 如[+de knuth];
检索体系完备等特点,部分文献还可在网上直 接免费获得全文。 5.与Medline光盘数据库的区别:检索机制、检 索界面、检索方法以及收录文献数量不同。
1.Alta Vista ()
2.Yahoo
()
3.Google
()
4.SCIRUS
(//)
5.Webcrawler (/)
Internet 生物医学信息资源
及其检索
INTERNET
主要内容
概述 1.Internet生物医学信息资源 类型
特点 指南及引擎 2.Internet生物医学数据库及其检索
INTERNET
概述
1. Internet上的信息资源极其丰富,内容及表现 形式多样化;
2. Internet上的生物医学信息资源占30%左右; 3. Internet上的信息资源的分布方式: 4. E-mail、 WWW 、 FTP及Gopher
6.搜狐(SOHU) ()
7.天网
(/beidatianwang.htm)8.()INTERNET
医学主题指南及引擎
Internet上除提供大量的一般主题指南和搜索引擎外,还 有许多站点专门提供医学主题指南和搜索引擎。当然,一般 主题指南和引擎也可用于检索或浏览Internet上的医学信息资 源的站点。
搜索引擎:是一种能够通过Internet接受用户的 查询指令,并向用户提供符合其查询要求的信息资 源网址的系统。
INTERNET
一般主题指南及引擎
大部分搜索引擎既允许用户按它们对WWW资源的分
类一层一层地浏览网上信息,还允许用户输入任意检索词
检索网站及文献,所以这些搜索引擎兼备导航和检索的双
重功能。
INTERNET
PubMed
➢数据库概况 ➢数据来源 ➢数据库检索原理 ➢检索方法及技巧
INTERNET
PubMed概况
1.创建机构:美国国家医学图书馆下设的美国生 物技术信息中心(NCBI)
2.类型:Web数据库 3.网址: 4.特色:具有收录范围广、内容全、检索途径多、
Google Scholar其它检索功能
➢判断文献的学术参考价值 ➢判断学科的研究现状及趋势 ➢追踪学者的科研活动,对其学术地位进行
评价
INTERNET 生物医学数据库
INTERNET
Internet生物医学数据库
一次文献数据库:电子期刊全文数据库 二次文献数据库:PubMed 循证医学数据库:Cochrane library 生物信息学数据库:
Google Scholar学术搜索
• Google 学术搜索提供可广泛搜索学术文献 的简便方法。Google 学术搜索可帮助您在 整个学术领域中确定相关性最强的研究。
• 优点:学科范围广、检索方便灵活、链接 功能强
• 缺点:检索功能比不上数据库。
/schhp?hl=zh-CN
相关文档
最新文档