病毒滴度测定

稀释计数法
滴度单位：TU/mL，指每毫升中含有的具有生物活性的病毒颗粒数。「TU」为「transducing units」的缩写，中文为「转导单位」，表示可以感染并进入到靶细胞中的病毒基因组数。
第一天 细胞准备
将生长状态良好的 293 T 细胞消化计数后稀释至 1×100 000/mL，加入 96 孔板，100 μL/孔，为每个病毒准备 10 个孔ቤተ መጻሕፍቲ ባይዱ放入 37℃，5% 二氧化碳培养箱中培养。
感染开始后 20 小时，除去培养上清，换为 500 μL 含 DNaseI 的新鲜培养基。在 37℃ 消化 15 分钟，这一步是要除去残余的质粒 DNA。然后换为 2 mL 正常的培养基，继续培养 48 小时。
用 0.5 mL 0.25% 胰酶-EDTA 溶液消化细胞，在 37℃ 放置 1 分钟。用培养基吹洗下，离心收集细胞。按照 DNeasy 试剂盒的说明抽提基因组 DNA 。每个样品管中加入 200 μL 洗脱液洗下 DNA 。用 DNA 定量试剂盒定量（Bio-Rad）。基因组 DNA 可以稳定保存在 -20℃ 至少两个月。
第二天 加病毒
在 EP 管中做 10 倍梯度稀释，连续 10 个稀释度。稀释方法如下：每种病毒准备 10 个 1.5mL EP 管，每管加入 90 μL 培养液，往第一个管中加入 10 μL 病毒原液，混匀后，吸取 10 μL 加入第二个管混匀。依此类推，做十个稀释度（10—0.00000001）。
第八个Ep管中进行了第七次十倍稀释，所得病毒原液为第七个Ep中的1/10，记为1E-6 uL ；
换句话说：如果在加入1E-5 uL 病毒原液的孔中观察到3个带有荧光的细胞，说明该孔中至少有3个病毒颗粒感染了细胞，则该病毒的滴度等于带有荧光的细胞数除以病毒原液量，本例子中就是3/(1E-5)=3E+5，单位为TU/ uL ，也就等于3E+8 TU/mL。
可以采用倍比稀释来测定病毒的滴度。
第一个Ep管中加入10uL病毒原液，记为1E+1 uL ；
第二个Ep管中进行了第一次十倍稀释，所得病毒原液为第一个Ep中的1/10，记为1E+0 uL；
第三个Ep管中进行了第二次十倍稀释，所得病毒原液为第二个Ep中的1/10，记为1E-1 uL ；
依次类推…
第七个Ep管中进行了第六次十倍稀释，所得病毒原液为第六个Ep中的1/10，记为1E-5 uL ；
96孔板病毒滴定实验方法总结一
看了前面一个关于病毒滴定方法的帖子,自己也做过不少次,所以想写出一点儿,算是个总结,希望能对各位有所帮助.这里我写2种方法,一种是在稀释好的病毒液里加细胞悬液.另一种是在长成单层的细胞上,加入已经稀释好的病毒液.这两种方法我都做过,效果各有长处.
定量 PCR 法
病毒感染 1 天前，取 6 孔板接种 HOS 细胞。每孔细胞为 5×100 000 个。
接种细胞 24 小时后，取两个孔的细胞用血球计数板计数，确定感染时细胞的实际数目，记为 N。
弃去其他培养板中的培养基，更换为含有 5 μg/mL polybrene 的新鲜培养基。将浓缩病毒用培养基稀释 200 倍，也就是取 1 μL 病毒加入到 199 μL 的培养基中。在 3 个培养孔中分别加入 0.5 μL，5 μL 和 50 μL 的稀释病毒。
吸取 96 孔板中原有的培养基，加入含稀释好的病毒液。并做好标记。
第三天 追加培养液
在每个孔再加入 100 μL 完全培养液，利于细胞的生长。
第四天 观察结果并计算滴度
在荧光显微镜下观察结果，并数出最后两个有荧光的荧光细胞克隆数。假设为 X 和 Y，则滴度（TU/mL）=（X+Y×10）×1000/2/X 孔的病毒液的含量（μL）。
分别取 5 μL 基因组标准品和待测样品基因组 DNA 加入到 E-G 行中，每个样品重复 1 次。另留 1 个孔加入 5 μL 的水做为无模板对照（no-template control）。
所使用定量 PCR 仪为 ABI PRISM 7000 定量系统。循环条件设定为：50℃ 2 分钟，95℃ 10 分钟，然后是 95℃ 15 秒，60℃ 1 分钟的 40 个循环。
数据分析：测得的 DNA 样品中整合的慢病毒载体拷贝数用基因组数加以标定，得到每基因组整合的病毒拷贝数。
滴度（integration units per mL，IU/mL）的计算公式如下：
IU/mL= (C ×N× D×1000)/V
其中：C = 平均每基因组整合的病毒拷贝数；N = 感染时细胞的数目（约为 1×100000）D = 病毒载体的稀释倍数 ；V = 加入的稀释病毒的体积数。
在预冷的 96 孔 PCR 板上完成 PCR 体系建立。从总管 Ⅰ 中各取 45 μL 加入到 A-D 各行的孔中，从总管 Ⅱ 中各取 45 μL 加入到 E-G 各行的孔中。
分别取 5 μL 质粒标准品和待测样品基因组DNA 加入到 A-D 行中，每个样品重复 1 次。另留 1 个孔加入 5 μL 的水做为无模板对照（no-template control）。
准备 PCR 所需的试剂和样品。为病毒序列检测引物配总管 Ⅰ：
Forward primer （100 pmol/mL）：0.1μL × n
Reverse primer （100 pmol/mL）：0.1μL × n
Probe （100 pmol/mL)：0.1μL × n
水：19.7 μL × n
n = number of reactions。例如：总反应数为 40，将 1 mL 2× TaqMan Universal PCR Master Mix，4 μL forward primer，4 μL reverse primer，4 μL probe 和 788 μL 水混和。震荡后放在冰上。
2× TaqMan Master Mix：25 μL × n
10×RNaseP primer/probe mix：2.5 μL × n
水：17.5 μL × n
n = number of reactions。例如：总反应数为 40，将 1 mL 2× TaqMan Universal PCR Master Mix，100 μL 10×RNaseP primer/probe mix 和 700 μL 水混和。震荡后放在冰上。