五个不同地区牦牛部分生产性能候选基因多态性的研究

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牦牛GH基因和GHR基因的多态性及生长发育的性状标记的开题报告

牦牛GH基因和GHR基因的多态性及生长发育的性状标记的开题报告

牦牛GH基因和GHR基因的多态性及生长发育的性状标记的开题报告一、研究背景牦牛是一种适应高原环境的重要畜牧动物,其生长发育特点与祖先非常不同,具有显著的高原适应特性。

GH基因和GHR基因在牦牛的生长发育中起着重要的调控作用。

因此,研究牦牛GH基因和GHR基因多态性及其与生长发育性状的关系,对于深入探究牦牛高原适应机制以及遗传改良具有重要的意义。

二、研究目的1.分析牦牛GH基因和GHR基因的多态性,探究其与牦牛生长发育性状相关性;2.建立牦牛GH基因和GHR基因多态性分析的PCR-RFLP技术体系;3.为牦牛的遗传改良提供基础数据和遗传标记。

三、研究内容1.文献综述:对GH基因和GHR基因的研究历史、进展、现状及相关性状的报道进行归纳和总结。

2.多态性分析:采用PCR-RFLP技术对100头藏系牦牛进行GH基因和GHR基因多态性分析,测定基因型和等位基因频率,并进行遗传统计学分析。

3.生长发育性状测定:对100头牦牛进行体重、身高、体长等生长发育性状的测定,并与GH基因和GHR基因多态性进行相关性分析。

4.计算遗传参数:根据生长发育性状的变异量和GH基因和GHR基因的遗传变异量计算遗传参数,包括遗传力、遗传相关、遗传方差量等指标。

四、研究预期结果1.筛选出GH基因和GHR基因的多态性位点,并构建PCR-RFLP技术体系。

2.探究GH基因和GHR基因多态性位点与牦牛生长发育性状之间的关系。

3.建立牦牛GH基因和GHR基因遗传改良的基础,以提高牦牛的生产性能。

五、研究意义1.揭示牦牛GH基因和GHR基因在高原环境中的适应性机制,为进一步探究高原动物遗传适应提供基础数据。

2.提供GH基因和GHR基因遗传标记,为牦牛生殖、生产和遗传改良提供技术支持。

3.丰富畜牧遗传学研究的理论和实践内容。

牦牛PRKAG3、FAS基因多态性与肉质相关性研究

牦牛PRKAG3、FAS基因多态性与肉质相关性研究

牦牛PRKAG3、FAS基因多态性与肉质相关性研究牦牛PRKAG3、FAS基因多态性与肉质相关性研究引言:牦牛是一种重要的家畜动物,以其高产肉和适应恶劣环境的特性受到广泛关注。

肉质是评价牦牛品质的重要指标之一,而PRKAG3和FAS基因多态性在肉质性状中起着重要作用。

本文旨在探究牦牛PRKAG3和FAS基因多态性与肉质相关性的研究进展,为提高牦牛肉质品质提供基因遗传学的参考。

一、PRKAG3基因多态性与肉质质量PRKAG3基因,也被称为AMPKγ3基因,编码表达在肌肉组织中的蛋白质。

研究表明,PRKAG3基因在骨骼肌纤维类型、能量代谢和生长等方面具有重要作用。

PRKAG3基因的多态性主要表现为两种常见基因型:RR和QR。

研究发现,RR基因型牛的肉质品质相对较好,具有较高的肌肉pH值、色泽、嫩度和风味等特点;而QR基因型牛的肉质相对较差,呈现较低的pH 值、色泽暗淡、质地较粗糙等特点。

因此,PRKAG3基因多态性对牛肉质质量的影响不可忽视。

二、FAS基因多态性与肉质脂肪含量FAS基因是脂肪酸合成关键酶--脂肪酰辅酶A合成酶的编码基因,在调控脂肪代谢和肉质脂肪含量中发挥重要作用。

FAS基因的多态性主要表现为两种常见基因型:AA和AB。

研究发现,AA基因型牛的肉质脂肪含量相对较高,其背膘厚度和背膘面积较大;而AB基因型牛的肉质脂肪含量较低。

因此,FAS基因多态性对牛的脂肪积累和肉质脂肪含量有着一定的调控作用。

三、PRKAG3和FAS基因多态性与牦牛肉质的关联性研究一项研究分析了PRKAG3和FAS基因的多态性与牦牛肉质的关联性。

结果显示,RR基因型牦牛具有更好的肉质质量,包括较高的肌肉pH值、明亮的色泽和柔软的质地。

相比之下,QR 基因型牦牛的肉质质量较差,表现为较低的肌肉pH值、暗淡的色泽和较粗糙的质地。

此外,AA基因型牦牛的脂肪含量较高,而AB基因型牦牛的脂肪含量较低。

结论:牦牛PRKAG3和FAS基因的多态性与肉质性状之间存在一定的相关性。

中国部分牦牛品种线粒体DNA遗传多态性研究

中国部分牦牛品种线粒体DNA遗传多态性研究

中国部分牦牛品种线粒体DNA遗传多态性研究赖松家;王玲;刘益平;李学伟【期刊名称】《遗传学报:英文版》【年(卷),期】2005(32)5【摘要】采用DNA测序技术首次测定了中国5个牦牛品种(类群)35个个体线粒体DNA控制区(D loop)全序列,结果表明:牦牛线粒体DNA控制区全序列长度为891~895bp,T、C、A、G4种核苷酸的含量分别为28.5%、25.3%、32.5%、13.7%。

检测到55个变异位点,约占分析位点总数的6.16%,核甘酸变异类型有转换、颠换、插入/缺失4种。

确定了24种单倍型,单倍型H4和H6为中国牦牛的主体单倍型,各单倍型在品种间分布不平衡,所测定的5个牦牛品种(类群)单倍型多样度平均为0.9697±0.0180,说明我国牦牛D loop单倍型类型丰富。

牦牛品种内各序列平均核苷酸差异数为10.936,核苷酸多样度为1.231%;牦牛品种间核苷酸分歧度(Dxy)约为0.760%~2.155%,品种间双参数距离范围为0.000~0.029,表明我国牦牛遗传多态性丰富。

对D环序列变异的分子方差分析和单倍型网络关系图的结果表明:我国牦牛品种间出现显著的遗传分化,牦牛单倍型网络关系图聚为2个聚类簇,表明我国牦牛有2个母系来源,或者有2个主要的驯化地点。

【总页数】8页(P463-470)【关键词】牦牛;多态性;D-loop;单倍型【作者】赖松家;王玲;刘益平;李学伟【作者单位】四川农业大学动科院;西南农业大学荣昌校区动科院【正文语种】中文【中图分类】S813.1【相关文献】1.中国云南怒族群体线粒体DNA D环区SNP遗传多态性研究 [J], 高树辉;刘清波;桂宏胜;乔可;李生斌2.中国撒拉族线粒体DNA序列遗传多态性研究 [J], 刘新社;李生斌3.10个山羊品种线粒体DNA的遗传多态性 [J], 武艳平;关伟军;赵倩君;何晓红;浦亚斌;马月辉4.中国部分山羊品种线粒体DNA D-loop序列遗传多样性分析 [J], 刘益平;曹少先;傅泽红;徐敏;刘铁铮5.中国牦牛线粒体DNA多态性及遗传分化 [J], 涂正超;张亚平;邱怀因版权原因,仅展示原文概要,查看原文内容请购买。

牦牛GHR基因部分片段SNP多态对乳成分影响的研究

牦牛GHR基因部分片段SNP多态对乳成分影响的研究

份有限公司进行测序及检测 SNPꎮ
乳样采集 时 间 为 7 月 底 纯 放 牧 条 件 下ꎬ 采 集
50ml 泌乳牦母牛奶样干冰运往实验室ꎬ用超声波乳
点、盐、电导率ꎮ
数据统计软件采用 IBM SPSS Statistics 22ꎬ分析
因型组各乳成分差异显著性ꎮ
引物 1 扩增片段 1 长度为 635bpꎬ引物 2 扩增片
冰点值显著高于 CT 型ꎬ CC 型为该群体优势基 因
CC 型和 CT 型占比为 3 ∶ 1ꎬCT 型各乳成分含
组平均数采用配对样本 T 检验法比较差异显著性ꎬ
表2
基因型和 CT 基因型间冰点值差异显著ꎬCC 基因型
型ꎮ 其它乳成分不同基因型间差异不显著ꎮ
不同基因型间牦牛乳成分均值及差异显著性比较
片段 2
RC:GAGACTTCCATCCACCCAGAG
F:CATTCTATTTCAGTGGCTATCAAG
Exon 8
R:ATGTAGTCACTAGCCTCACCCTC
PCR 反 应 体 系: DNA 模 板 2μLꎬ 引 物 F、 R 各
品分析仪检测乳脂肪、乳蛋白、非脂乳固体、密度、冰
加 ddH2 O 至 50μLꎮ
3 讨论与结论
(1) 对中国荷斯坦牛 GHR 基因第 8 exon F279Y
位点 SNP 与泌乳性能的相关性研究发现ꎬ该 SNP 与
305d 泌乳量、乳脂率和乳蛋白率显著相关 [11] ꎮ 马
彦男等
[12]
研究表明ꎬ该位点突变形成的 AA 基因型
305d 泌乳量显著高于 AT 基因型ꎬ而 AT 基因型在
gene fragment for the SNP detectionꎬand combined with the milk composition ( milk fatꎬ milk protein and non fat

西藏牦牛、荷斯坦牛三个功能基因部分序列多态性的比较研究

西藏牦牛、荷斯坦牛三个功能基因部分序列多态性的比较研究

西藏牦牛、荷斯坦牛三个功能基因部分序列多态性的比较研究陈桂芳;谢庄;强巴央宗;李齐发;土登【期刊名称】《畜牧兽医学报》【年(卷),期】2003(034)002【摘要】利用聚合酶链式反应-单链构象多态性(PCR-SSCP)技术和聚合酶链式反应-限制性内切酶片段长度多态性(PCR-RFLP)技术,测定了西藏牦牛和荷斯坦牛催乳素基因、β-乳球蛋白基因和κ-酪蛋白基因三个功能基因部分序列多态性.结果显示:西藏牦牛和荷斯坦牛在催乳素基因和κ-酪蛋白基因位点上存在多态性,而在β-乳球蛋白基因位点均未发现D等位基因.【总页数】4页(P128-131)【作者】陈桂芳;谢庄;强巴央宗;李齐发;土登【作者单位】南京农业大学动物科技学院,南京,210095;南京农业大学动物科技学院,南京,210095;西藏农牧学院牧医院,西藏,860000;南京农业大学动物科技学院,南京,210095;西藏种畜场,西藏,860000【正文语种】中文【中图分类】S823.2【相关文献】1.中国荷斯坦牛FASN基因部分序列PCR-SSCP多态性与泌乳性状的相关性 [J], 马彦男;贺鹏迦;马永生;董艳娇;朱静;雷赵民;刘哲;吴建平2.西藏牦牛mtDNA cytb基因的序列多态性及其系统进化分析 [J], 姬秋梅;唐懿挺;张成福;柴志欣;赵上娟;信金伟;钟金城3.荷斯坦牛κ-酪蛋白基因5′和3′侧翼序列多态性研究 [J], 黄亮;尚海彬;魏蕊;宁素恒;杜文斌;张娟4.西藏牦牛和黑白花奶牛生长激素基因AluⅠ多态性的比较研究 [J], 陈桂芳;李齐发;强巴央宗;土登;谢庄5.荷斯坦牛DRA基因多态性及序列特征分析 [J], 刘丽霞;张丽;欧阳霞辉;乔自林;付保强因版权原因,仅展示原文概要,查看原文内容请购买。

牦牛IGF-Ⅱ及其受体基因多态与生长性状相关性研究

牦牛IGF-Ⅱ及其受体基因多态与生长性状相关性研究

牦牛IGF-Ⅱ及其受体基因多态与生长性状相关性研究牦牛IGF-Ⅱ及其受体基因多态与生长性状相关性研究摘要:牦牛(Bos grunniens)是高原地区的特有物种,其适应高寒环境以及优良的生长性能引起了广泛研究。

本文旨在探究牦牛IGF-Ⅱ及其受体基因多态性与牦牛生长性状之间的关系。

通过PCR扩增和直接测序技术对100头东北地区牦牛的IGF-Ⅱ和其受体基因进行多态性分析,并结合生长性状的测量数据进行相关性分析。

结果显示,牦牛IGF-Ⅱ和其受体基因存在多态性,其中IGF-Ⅱ基因的多态性主要为试剂SNP (单核苷酸多态性),而受体基因则为基因大小差异。

相关性分析表明,IGF-Ⅱ基因的多态性与牦牛体重、肩高以及胸围有一定的关联性,而受体基因的多态性则与牦牛体重和胸围呈显著相关。

这些研究结果为进一步理解牦牛生长调控机制提供了重要信息。

引言:牦牛被广泛用于青藏高原地区的畜牧业生产,其在逆境环境中仍能良好生长,因此成为研究生长性状调控机制的热点研究对象之一。

IGF-Ⅱ(胰岛素样生长因子2)是一种重要的细胞生长因子,其通过结合细胞膜上的IGF受体,参与细胞增殖、分化以及代谢调控等生理过程。

IGF-Ⅱ的表达与牦牛生长性状有关,而在牛类中IGF-Ⅱ基因的多态性也与体重、肩高等性状相关。

因此,本研究旨在探究牦牛IGF-Ⅱ及其受体基因的多态性与牦牛生长性状之间的相关性。

材料与方法:本实验选取了100头健康的东北地区牦牛,收集其血液样本作为基因组DNA提取的来源。

采用PCR扩增技术扩增IGF-Ⅱ和其受体基因的特定片段,并利用直接测序技术对PCR产物进行测序,得到基因序列。

通过比对已知IGF-Ⅱ和其受体基因序列的突变位点,确定其中的多态性位点。

同时,我们对上述选取的100头牦牛进行了牦牛体重、肩高以及胸围的测量。

通过统计学方法,计算出每个测量指标的平均值,并与IGF-Ⅱ和其受体基因的多态性位点进行相关性分析。

结果与讨论:通过测序分析,我们发现牦牛IGF-Ⅱ基因存在rs110312911和rs109483613两个SNP位点的多态性,其中rs110312911位点的多态性呈现明显差异,均为GC转换为GG的突变。

牦牛EPO基因的PCR-SSCP多态性研究

牦牛EPO基因的PCR-SSCP多态性研究

Ab ta t n t i a e , h o y o p ims o e p i t ( sr c :I h s p p r t e p l m r h s f h mo o e i EPO) g n n Ba h u y k, t n n e e i z o a Da o g
维普资讯
20 0 8年 第 7期
牦 牛 EP o基 因的 P R—S C C S P多态 性研 究
陈雪梅 金 双 钟金城 , 志杰。 , , 马
( . 南 民族 大 学 生 命 科 学 与 技 术 学 院 , 1西 四川 成 都 60 4 ;2 成 都 大 熊 猫 繁 育 研 究 基 地 , 川 成 都 6 00 ; 101 . 四 10 0 3青海省畜牧兽医科学 院 畜牧研究所 , 海 西宁 801) . 青 10 6
v r iy i ih a o he t e a r e s T h no yp sa e A A , B n e s t s r c m ng t hr e y k b e d . e ge t e r A a d BB ,n whi h A B e — i c g no
( . l g fLi ce c & Te h oo y S u h s iest o to aiis Ch n d 1 0 1 Chn ; 1 Col eo f S in e e e c n lg , o t we tUnv r i frNain l e , e g u 6 0 4 , ia y t
频 率逐 渐 升 高 , B型 的频率 则 降低 , 体 杂合度 和 多态信 息含 量也 逐 渐降低 , 种 变化 可能与牦 牛 B 群 这 对低 氧 的适 应能 力有 一定 的 关 系。 关键 词 : 牛 ;E 牦 PO基 因 ; C P R~S C S P

青海高原型牦牛GHR_基因多态性与生长发育的关联性

青海高原型牦牛GHR_基因多态性与生长发育的关联性
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g 极 度 不 平 衡 状 态,且 g.
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50)。 与 生 长 性 状 的 关 联 性 分 析 发 现,
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732373G>A 能够显著或极显著影响高原型牦牛的体质量和胸围,优势基因型分
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发育指标(体质量、体高、体斜长、胸围和管围)的关联性。【结果】青海高原型牦 牛 GHR 基 因 上 存 在 g.
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五个不同地区牦牛部分生产性能候选基因多态性的研究
本研究利用PCR-SSCP和PCR-RFLP技术,对新疆巴州牦牛、天祝白牦牛、甘南牦牛、青海环湖牦牛四个不同类群及培育品种大通牦牛PRL、PRLR、GH、GHR、IGF-Ⅰ五个候选基因遗传多态性进行了测定,分析了等位基因频率、基因型频率、多态信息含量、杂合度和有效等位基因数等指标,并运用最小二乘法分析了所发现的基因多态位点与牦牛体尺、体重等生长发育性状的关系,初步探讨了PRL、PRLR、GH、GHR、IGF-Ⅰ基因作为影响生长发育性状候选基因的可能性,取得了如下研究结果:1.利用PCR-SSCP技术对类胰岛素生长因子-Ⅰ基因(IGF-Ⅰ)多态性研究表明:(1)首次在牦牛IGF-Ⅰ基因的第1内含子发现PCR-SSCP多态,IGF-Ⅰ
基因第1内含子的PCR-SSCP多态性检测结果表明,该多态位点由一对等位基因A、B控制,序列比对发现在67bp处单碱基C的缺失,造成了该多态位点的出现。


位基因A(B)在大通牦牛、天祝白牦牛、甘南牦牛、青海环湖牦牛、新疆巴州牦
牛群体中的基因频率分别为:0.9028(0.0972)、0.9234(0.0766)、0.8485(0.1515)、0.7929(0.2071)、0.9200(0.0800),等位基因A为五个群体中的优势等位基因。

(2)IGF-Ⅰ基因第5外显子的PCR-SSCP分析结果表明,品种间基因型分布存在显著差异。

在大通牦牛中检测到了从、BB和AB三种基因型,而在其它群体中
只发现AA型,呈单态型,达到了纯合状态。

经克隆测序表明:该位点的多态是由于在202bp处一个T→C的突变,导致等位基因A突变成等位基因B。

(3)对IGF-Ⅰ基因上2个多态位点不同基因型与大通牦牛6月龄生长发育性状指标进行显著性检验,结果表明,IGF-Ⅰ基因第1内含子AA基因型的体重、体斜长显著高于AB、BB基因型(P<0.05)。

(4)IGF-Ⅰ基因的二个多态位点基因型与大通牦牛早期发育的分析表明,18
月龄IGF-Ⅰ第5外显子位点AA基因型的个体体高最小二乘均值(91.43cm),与BB 型(80.00cm)差异显著(P<0.05)。

在牦牛的早期选育中,AA型个体可以作为选留的对象。

(5)六月龄大通牦牛群体体尺指标与甘南牦牛和天祝白牦牛群体比较可以看出不论公牛群还是母牛群,大通牦牛的平均体重显著大于甘南牦牛和天祝牦牛群体平均体重(P<0.05):大通牦牛的平均体斜长显著比甘南牦牛和天祝白牦牛长(P<0.05),而胸围相比大通牦牛略高于其它两个群体但差异不显著(P>0.05)。

在这些体尺指标上,大通牦牛表现出明显的优势。

2.利用PCR-SSCP和PCR-RFLP技术对GH基因、GHR基因多态性进行了研究,结果表明:(1)GH基因第3外显子在183bp处发生T-C突变,该多态位点由一对等位基因A、B控制,其中A为优势等位基因,AA为优势基因型。

五个群体的哈代—温伯格平衡检验结果显示,青海大通牦牛、青海环湖牦牛、天祝白牦牛、甘南牦牛处于非平衡状态。

运用最小二乘法对三个牦牛群体进行分析发现GH基因第3外显子对体重有显著影响(P<0.05),其中,最小二乘法得出的均值,AA型最大,AB型次之,最小的为BB型。

另外,GH基因第3外显子对体长也有显著影响(P<0.05),其中AA型体长最长,AB型次之,BB型体长最短。

GH基因第3外显子对体高、胸围、管围无显著性影响(P>0.05)。

(2)GH基因第5外显子在64bp处发生A-C的突变。

GH基因第5外显子位点上,A1为优势等位基因,A1A1为优势等位基因型。

五个品种进行的哈代—温伯格平衡检验结果显示,甘南牦牛处于非平衡状态;运用最小二乘法对五个牦牛品种进行分析发现第5外显子对生长发育指标没有显著
影响(P>0.05)。

(3)经过PCR-SSCP分析,GH基因保守区位点呈单态性,没有发现多态性信息。

(4)经过PCR-RFLP分析,特异性GH-ⅠR引物对牦牛基因进行PCR扩增,得到一条长约1244bp的产物,用限制性内切酶AvaⅠ、HaeⅢ、HinfⅠ、PstⅠ、SmaⅠ进行酶切,AvaⅠ、HinfⅠ、HaeⅢ、PstⅠ均具有预期的酶切位点,没有发现多态性,而SmaⅠ不具有预期的酶切位点,经测序比较,发现在878位点处的SmaⅠ酶切位点“CCC|GGG”丢失。

特异性GH-2R引物对牦牛基因组进行PCR扩增,得到长度约为1037bp的DNA 片段。

采用限制性内切酶HinfⅠ、SmaⅠ、PstⅠ对该PCR产物进行单酶酶切,结果发现HinfⅠ、SmaⅠ、PstⅠ均具有酶切位点,且电泳检测结果与预期相一致,不具有限制性片段长度多态性。

而GH-2R在限制性内切酶HaeⅢ的切点中,电泳检测结果与预期不一致,经测序比较,发现在75位点处的酶切位点“CC|GG”丢失。

3.利用PCR-SSCP技术对PRL、PRLR基因多态性进行了研究,结果表明:催乳素受体基因的第2外显子、第3外显子在大通牦牛、甘南牦牛、天祝白牦牛、青海环湖牦牛、新疆巴州牦牛5个品种中检测到了AA、AB和BB基因型,而且在PRLR-exon2中A等位基因为5
个牦牛群体的优势等位基因,具有较高的基因频率;在PRLR-exon3中,B等位基因较A基因占优势。

PRLR-exon2在大通牦牛、新疆牦牛、天祝白牦牛、青海环湖牦牛、甘南牦牛A基因频率都超过了0.500,分别为0.520、0.560、0.600、0.580和0.640。

基因多态信息表现为中度多态。

测序表明催乳素受体基因第二外显子在174bp处的突变,为A→G,表现多态
性。

PRLR-exon3,在大通牦牛、天祝白牦牛、甘南牦牛、青海环湖牦牛、新疆牦牛五个群体中都检测出AA、BB、AB三个基因型,而且B等位基因为优势等位基因。

PRLR-exon3的PCR-SSCP结果及测序结果分析显示该位点的98bp处多态为C →G取代造成。

等位基因A(B)在大通牦牛,天祝白牦牛、甘南牦牛、青环湖原牦牛、新疆巴州牦牛的基因频率分别为:0.460(0.540)、0.420(0.580)、
0.500(0.500)、0.460(0.540)、0.450(0.550)。

在PRLR-exon3中,除了在天祝白牦牛中表现为高度多态,其余牦牛品种多为中度多态,遗传力较高,作为遗传杂交可能有较强优势。

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