静宁鸡肌肉生长抑制素基因单核苷酸多态性筛查及生物信息学分析
牛肌肉生长抑制素(MSTN)基因的检测、分型研究
牛肌肉生长抑制素(MSTN)基因的检测、分型研究
孙少华;李雪梅;魏学蕊;师守堃;李玉;冯利民
【期刊名称】《中国农业科技导报》
【年(卷),期】2001(3)6
【摘要】本研究根据皮埃蒙特牛肌肉生长抑制素 (MSTN)基因序列设计了 3条特异性引物 ,以纯种皮埃蒙特牛、皮荷杂种牛和荷斯坦牛的 DNA为模板 ,对是否携带MSTN基因的个体牛进行单核苷酸多态性分析。
【总页数】2页(P66-67)
【关键词】牛;双肌性状;肌肉生长抑制素基因;单核苷酸多态性;分型;MSTN
【作者】孙少华;李雪梅;魏学蕊;师守堃;李玉;冯利民
【作者单位】河北农业大学动物科技学院;中国农业大学动物科技学院;抚宁县利民牛场
【正文语种】中文
【中图分类】S823.2
【相关文献】
1.牛肌肉生长抑制素基因的检测、分型研究(简报) [J], 孙少华;李雪梅;魏学蕊;师守;常泽军;李玉;冯利民
2.锌指核酸酶(ZFN)介导的牛肌肉抑制素基因(MSTN)突变的研究 [J], 赵宇航;云亭;李荣凤;李雪玲
3.肌肉生长抑制素基因(MSTN)外显子1的多态性及其与边鸡生长性状的关联分析
[J], 张跟喜;丁馥香;是燕萍;王金玉;张李俊;张丽;施会强
4.肌肉生长抑制素基因(MSTN)的研究进展 [J], 乌日罕;付艳茹;格日勒图
5.肌肉生长抑制素基因(MSTN)编辑牛的肉质相关蛋白质组学研究 [J], 李欣;海超;刘春丽;白春玲;魏著英;李光鹏;赵跃芳
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鸡IFIT5基因单核苷酸多态性的生物信息学分析
通讯作者，女，博士，教授。主要研究方向：动物遗传育种。Ｅｍａｉｌ：ｒｏｓｅｇｅｎｇｌｙ＠１２６．ｃｏｍ。 收稿日期：２０１９０３０３；修改稿收到日期：２０１９０３２８
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河北科技师范学院学报 ３２卷
１．５ 对 ＵＴＲＳＮＰｓ进行评估分析 真核生物 ｍＲＮＡ的 ５′和 ３′非翻译区（ｕｎｔｒａｎｓｌａｔｅｄｒｅｇｉｏｎｓ，ＵＴＲ）在转录后期起着重要的调控作用，
ＩＦＩＴ（ＩｎｔｅｒｆｅｒｏｎＩｎｄｕｃｅｄＰｒｏｔｅｉｎＷｉｔｈＴｅｔｒａｔｒｉｃｏｐｅｐｔｉｄｅＲｅｐｅａｔＭｏｔｉｆｓ，ＩＦＩＴ）家族是一类主要受干扰 素、病毒和脂多糖诱导表达的干扰素诱导基因，其编码的蛋白可通过抑制翻译起始，识别、结合并隐退特 定类型的病毒核酸或蛋白以及参与调节细胞固有的和非固有的免疫反应等方式来抵抗病毒的入侵。 ＩＦＩＴ家族参与的免疫反应是鸡体内抵抗病毒感染的重要防线［１，２］，其中 ＩＦＩＴ５是鸡体内存在的 ＩＦＩＴ家 族的唯一成员。研究发现，ＩＦＩＴ５在鸡生物体内的先天免疫防线发挥重要作用［３］。
摘要：为了筛选鸡 ＩＦＩＴ５基因潜在的、具有生物学功能的 ｎｓＳＮＰｓ（ｎｏｎｓｅｎｓｅＳｉｎｇｌｅｎｕｃｌｅｏｔｉｄｅｐｏｌｙｍｏｒｐｈｉｓｍｓ， ＳＮＰｓ）位点和 ＵＴＲＳＮＰｓ（ｕｎｔｒａｎｓｌａｔｅｄｒｅｇｉｏｎｓＳＮＰｓ）位点。利用 ５种 ＳＮＰｓ在线工具对 ｎｓＳＮＰｓ进行分析预测有 害位点；使用 ＳＷＩＳＳＭＯＤＥＬ，Ｐｙｍｏｌ，Ｃｏｎｓｕｒｆｓｅｒｖｅｒ等软件对有害 ｎｓＳＮＰｓ位点进行蛋白质的空间结构，氨基酸 的氢键变化，及保守型等进行相关分析。此外，对 ＵＴＲＳＮＰｓ位点使用 ＵＴＲＳｃａｎ分析预测其结合模式元件是 否改变。结果表明：从 ＩＦＩＴ５基因的 ｎｓＳＮＰｓ位点筛选出来的 ６个有害 ｎｓＳＮＰｓ位点（Ｌ２２０Ｉ，Ｌ２２３Ｍ，Ｌ２２３Ｖ， Ｙ３７５Ｃ，Ｅ３９１Ｇ和 Ｙ４１４Ｄ）都为潜在性功能位点，其中 Ｅ３９１Ｇ位点最可能影响蛋白的结构和功能。从 ＵＴＲ ＳＮＰｓ筛选出 ９个位于 ｕＯＲＦ的位点可能影响 ＩＦＩＴ５基因的转录模式。 关键词：鸡；ＩＦＩＴ５基因；非同义 ＳＮＰｓ（ｎｓＳＮＰｓ）；ＵＴＲＳＮＰｓ；同源建模；保守性分析 中图分类号：Ｓ８３１．２ 文献标志码：Ａ 文章编号：１６７２７９８３（２０１９）０１００３３０６
肌肉生长抑制素基因(MSTN)外显子1的多态性及其与边鸡生长性状的关联分析
肌肉生长抑制素基因(MSTN)外显子1的多态性及其与边鸡生长性状的关联分析张跟喜;丁馥香;是燕萍;王金玉;张李俊;张丽;施会强【期刊名称】《农业生物技术学报》【年(卷),期】2011(19)1【摘要】为了对边鸡生长性状的标记辅助选择提供基础资料,本研究采用PCR-SSCP技术检测边鸡(Gallus gallus)及3个对照鸡(G.gallus)群体(京海黄鸡、尤溪麻鸡和Arbor Acre鸡)肌肉生长抑制素(myostatin,MSTN)基因外显子1的单核苷酸多态性,并与边鸡的生长性状进行相关性分析.结果表明,在边鸡、京海黄鸡和尤溪麻鸡中都检测到6种基因型(AA、AB、BB、BC、AC和CC),而在Arbor Acre鸡中只检测到4种基因型(AB、BC、AC和CC).总共检测到3个多态位点(G2 100A、G2 109A和C2 2440).在6～8和12周龄时,BB基因型个体的体重显著高于AA基因型个体(P<0.05).在14周龄时,BB基因型个体的体重显著高于AA和AC基因型个体(P<0.05).在16～18周龄时,BB基因型个体的体重显著高于其余5种基因型个体(P<0.05).研究结果提示,MSTN基因可能是影响边鸡生长性状的一个主效基因或是与之存在紧密遗传连锁的一个标记.%In order to lay a foundation for Marker-assisted Selection (MAS) for Bian chicken's growth traits,single nucleotide polymorphisms (SNPs) of exon 1 of the myostatin (MSTN) gene were detected in Bian chicken (Gallus gallus) and three reference chicken (G.gallus) populations (the Jinghai, Youxi and Arbor Acre chickens) by PCR-SSCP.And the relationship with growth traits in the Bian chicken was analysed.Results showed that the Bian, Jinghai and Youxi chickens alldisplayed six genotypes (AA, AB, BB, BC, AC and CC), while only four genotypes (AB, BC, AC and CC) were detected in the Arbor Acre chicken.Sequencing revealed three mutations (G2 100A, G2 109A and C2 244G) of the MSTN gene.Chickens ofBB genotype had significantly higher body weight than those of AA genotype (P＜0.05) from 6 to 8 week of age and 12 week of age.Chickens ofBB genotype had significantly higher body weight than those of AA and AC genotypes at 14 week of age (P＜0.05).Chickens of BB genotype had significantly higher body weight than those of the other five genotypes from 16 to 18 week of age (P＜0.05).These results preliminarily show that the MSTN gene is either a major gene that influences the body weight traits of the Bian chicken or a molecular marker in close linkage with them.【总页数】6页(P122-127)【作者】张跟喜;丁馥香;是燕萍;王金玉;张李俊;张丽;施会强【作者单位】扬州大学动物科学与技术学院,扬州,225009;山西省农业科学院畜牧兽医研究所,太原,030032;常州市武进区湖塘镇畜牧兽医站,武进213100;扬州大学动物科学与技术学院,扬州,225009;山西省农业科学院畜牧兽医研究所,太原,030032;山西省农业科学院畜牧兽医研究所,太原,030032;江苏京海禽业集团有限公司,南通,226103【正文语种】中文【相关文献】1.泸宁鸡和米易鸡MSTN基因多态性及其与生长性状的关联性 [J], 左斌;任冰冰;蒋小松;熊应龙;王康环;蒋利;刘光伟;王海;徐亚欧2.马氏珠母贝肌肉生长抑制素基因eSNP多态性与生长性状的关联分析 [J], 黄文;李琴;林坚士;何毛贤3.MSTN基因外显子3的多态性及其与边鸡生长性状的关联分析 [J], 张跟喜;丁馥香;赵秀华;王金玉;金崇富;张丽4.大河乌猪MSTN基因第3外显子多态性与眼肌面积的关联分析 [J], 程娜;牛元力;李志勋;龙罡;秦建鹏;邱丙姗;赵桂英;李祥5.刀鲚MSTN基因遗传多态性与生长性状的关联分析 [J], 于爱清;施永海;徐嘉波因版权原因，仅展示原文概要，查看原文内容请购买。
肌肉生长抑制素基因在重要经济动物育种中的研究进展
2023·05XUMUSHOUYI 畜牧兽医摘要：肌肉生长抑制素（myostain ，MSTN ）又称生长分化因子8，是转化生长因子-β超家族的一员，是动物体正常运作所必需的蛋白质，也是肌肉发育的负性调节因子，决定了动物的整体肌肉质量。
由于MSTN 的突变，许多大型动物，包括牛、羊、狗和人类，都表现出“双肌”表型。
本文首先概述MSTN 的结构特征、表达规律、生物学功能和作用机制，然后介绍了肌肉抑制素基因的多态性在动物育种领域的重要意义，以及MSTN 基因编辑技术在牛、羊、猪等经济动物生产中的应用情况。
关键词：肌肉生长抑制素；双肌表型；多态性；基因编辑肌肉性状是影响畜牧生产中的重要经济性状，提高家畜肌肉品质是家畜育种工作者的毕生追求。
肌肉生长抑制素（myostain ，MSTN ），又名生长分化因子8（growth and differentiation factor 8，GDF8），是目前唯一明确的对骨骼肌生长发育和再生起负向调节作用的分泌性糖蛋白，对肌肉发育和稳态维持都起着重要作用，其自然突变或敲除导致的蛋白功能失活或者表达量下降都会导致肌肉异常发达，反之，其表达上升则会引起肌肉萎缩。
MSTN 缺失型家畜骨骼肌重量增加，使得肌肉与其他组织相比，比例大大提高。
自然界中存在MSTN 天然突变体动物：如比利时蓝牛、皮埃蒙特牛、特克赛尔羊，其肌肉异常发达的“双肌”表型引起了遗传育种研究领域的高度关注。
1MSTN 基因的结构特征MSTN 基因编码的MSTN 蛋白因其具有转化生长因子β（transforming growth factor beta ）超家族的典型结构特征而成为了TGF -β超家族的成员之一，但相较于其他家族成员，其C 端的氨基酸序列要更短一些。
MSTN 基因在不同物种中结构相似且高度保守，包括三个相似大小的外显子以及两个内含子，但其在不同脊椎动物物种中的染色体定位并不相同。
MSTN 位于人、黑猩猩、牛、绵羊和山羊的2号染色体上，位于小鼠1号染色体上，位于大鼠9号染色体上，位于猪15号染色体上，位于马18号染色体，位于狗37号染色体，而兔、鸡的该基因定位在7号染色体。
鸡Nramp1基因第9外显子的单核苷酸序列多态性分析
鸡Nramp1基因第9外显子的单核苷酸序列多态性分析胡国顺;常国斌;王克华;陈蓉;刘艳;周琼;廖菁;陈国宏【期刊名称】《中国畜牧兽医》【年(卷),期】2010(0)6【摘要】以文昌鸡、安卡鸡及藏鸡为试验动物,利用PCR-SSCP方法检测Nramp1基因部分区域的单核苷酸多态性(SNP).结果发现,该区域存在2个突变,分别为C315G、C357T;共出现4种基因型,分别为GG、GT、TT及AA型,在文昌鸡和藏鸡群体内,T为优势等位基因,而安卡鸡中G为优势等位基因.3个群体该座位均处于哈代-温伯格平衡(P＞0.05),且3个群体间基因型分布无显著差异(P＞0.05).【总页数】3页(P119-121)【作者】胡国顺;常国斌;王克华;陈蓉;刘艳;周琼;廖菁;陈国宏【作者单位】扬州大学动物科学与技术学院,扬州,225009;扬州大学动物科学与技术学院,扬州,225009;中国农业科学院家禽研究所,扬州,225003;扬州大学动物科学与技术学院,扬州,225009;扬州大学动物科学与技术学院,扬州,225009;扬州大学动物科学与技术学院,扬州,225009;扬州大学动物科学与技术学院,扬州,225009;扬州大学动物科学与技术学院,扬州,225009【正文语种】中文【中图分类】S831【相关文献】1.文昌鸡MHC B-G基因第2外显子序列多态性分析 [J], 廖承红;郑继平;伍剑鸿;梁浩;张建行2.鸡瘦蛋白受体(OBR)基因外显子9单核苷酸多态性分析 [J], 顾志良;赵建国;李辉;孟和;王启贵;王清华;朱大海3.13个鸡品种NLRC5基因外显子8多态性分析 [J], 李芹;常国斌;窦套存;栾德琴;盛中伟;陈国宏4.京海黄鸡IGFⅡ基因外显子2多态性分析及其对繁殖性能的影响 [J], 李源;王金玉;顾玉萍;施会强;王慧华;侯启瑞5.不同鸡种GARS-AIRS-GART基因21号外显子单核苷酸序列多态性分析 [J], 龚琳琳;周琼;廖菁;王存波;常国斌;陈国宏;侯庆文;王伟因版权原因，仅展示原文概要，查看原文内容请购买。
鸡Myogenin基因单核苷酸多态检测及群体遗传分析
鸡Myogenin基因单核苷酸多态检测及群体遗传分析王启贵;李辉;李宁;王宇祥;唐志权【期刊名称】《东北农业大学学报》【年(卷),期】2008(039)006【摘要】肌纤维在决定肌肉生长和肉质方面起主要作用,并受到MyoD基因家族的调控.该家族基因编码螺旋-环-螺旋蛋白.以鸡Myogenin基因为候选基因,通过PCR-SSCP分析该基因5'调控区的变异.结果表明,在鸡Myogenin基因5'调控区存在3处SNPs,这些SNPs产生的不同基因型及等位基因在7个品种鸡间分布存在极显著的差异(P<0.001).推测该基因的变异对鸡生长发育可能有一定的影响.【总页数】4页(P82-85)【作者】王启贵;李辉;李宁;王宇祥;唐志权【作者单位】东北农业大学动物科学技术学院,哈尔滨,150030;东北农业大学动物科学技术学院,哈尔滨,150030;中国农业大学农业生物技术国家重点实验室,北京,100094;东北农业大学动物科学技术学院,哈尔滨,150030;东北农业大学动物科学技术学院,哈尔滨,150030【正文语种】中文【中图分类】S831;Q319【相关文献】1.河北太行鸡不同群体含黄素单氧化酶3基因多态性检测 [J], 赵思思;胡慧艳;贾青;孙凤莉;锡建中;李晓敏2.京海黄鸡钙调素基因单核苷酸多态性及群体遗传分析 [J], 俞亚波;王金玉;顾玉萍;刘大林;魏岳;戴国俊3.鸭脂联素基因单核苷酸多态性检测及群体遗传分析 [J], 董飚;龚道清;孟和;郁建锋;赵旭庭;段修军;顾志良4.鹅Myostatin基因单核苷酸多态性检测及群体遗传分析 [J], 郑云;龚道清;吴伟;赵旭庭;段修军;顾志良5.鸡Myostatin基因单核苷酸多态性的群体遗传学分析 [J], 顾志良;张海峰;朱大海;李辉因版权原因，仅展示原文概要，查看原文内容请购买。
家畜肌生成抑制素基因的研究进展
家畜肌生成抑制素基因的研究进展
金鑫燕
【期刊名称】《青海畜牧兽医杂志》
【年(卷),期】2009(39)6
【摘要】肌生成抑制素基因(mypstation,MSTN)活性的降低或丧失所出现的"双肌"动物,给畜牧业生产带来了显著的经济效益,因此,许多畜牧学者探讨如何利用MSTN来提高动物的生产力.本文对肉用大型家畜牛、猪、绵羊、山羊MSTN基因国内外研究进展及应用前景进行了综述,为家畜MSTN基因的进一步研究提供一定的理论参考.
【总页数】2页(P40-41)
【作者】金鑫燕
【作者单位】青海省畜牧兽医科学院,西宁,810016
【正文语种】中文
【中图分类】S829.9
【相关文献】
1.牛肌生成抑制素基因酵母双杂交诱饵载体的构建及鉴定 [J], 郑海舰;王军;柴孟龙;郑立双;窦长友;赵静
2.肌肉生成抑制素基因多态性与鹅肌内脂肪沉积的相关性分析 [J], 汤青萍;章双杰;郭军;邹剑敏
3.肌生成抑制素基因研究进展 [J], 李树伟;欧阳红生;王小霞
4.动物肌生成抑制素基因的研究进展 [J], 王全喜
5.木聚糖酶对AA肉鸡生产性能、内分泌及肌生成抑制素(MSTN)基因表达的影响[J], 程宝晶;李仲玉;张丽聪;单安山
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静宁鸡PPARa基因克隆与生物信息学分析
静宁鸡PPARa基因克隆与生物信息学分析作者：杨妍梅李玉覃圣蒋刘芽赵金潭陆晓东熊杰陈伟基扎西英派来源：《江苏农业学报》2019年第02期摘要：为阐明静宁鸡PPARa 基因的结构及功能，根据NCBI 上登录的原鸡PPARc 基因的CDS 序列设计引物，以静宁鸡肾脏为材料采用PCR 的方法，对目的基因进行克隆，并测序。
根据测序的结果，采用各类分析软件，对所获得的DNA 片段进行生物信息学分析。
结果成功克隆了静宁鸡PPARa 基因的全长CDS 序列。
生物信息学分析结果表明，该基因CDS 全长1407 bp ，所编码的蛋白质包含468个氨基酸。
其分子量为52300，等电点为5.85。
在二级和三级结构上，a-螺旋和无规则卷曲为蛋白的主要结构形式。
PPARc 蛋白是一个亲水性蛋白质，不存在跨膜区域，不含信号肽，没有N-糖基化位点，但存在16个0-糖基化位点，存在25个丝氨酸（Ser）磷酸化位点、12个苏氨酸（Thr）磷酸化位点和6个酪氨酸（Tyr）磷酸化位点。
静宁鸡PPARa蛋白在第100～168个氨基酸之间有1个ZnF_C4结构域，在第264～449个氨基酸之间有1个HOLI结构域。
同源性分析结果表明，静宁鸡PPARa基因与原鸡的亲缘关系最近。
静宁鸡PPARa基因的成功克隆和功能预测为进一步研究PPARa基因在静宁鸡脂肪代谢中的作用提供了基础。
关键词：静宁鸡;过氧化物酶体增殖剂激活受体;生物信息学分析中图分类号：Q785文献标识码：A文章编号：1000-4440（2019）02-0370-08过氧化物酶体增殖剂激活受体（Peroxisome proliferators-activated receptors，PPARs）在1990年被英国科学家Isseman和Green首先发现"。
它是一种新型的固醇类激素受体和配体依赖的核转录因子，属于核受体第一亚家族C群（NR1C）[2]。
PPARs是一个由3种核受体组成的家族，目前已知有3种亚型：PPARa、PPARγ、PPARβ。
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静宁鸡肌肉生长抑制素基因单核苷酸多态性筛查及生物信息学
分析
张丽;刘丽霞;戴洪伟;陈红;王瑞;岳炳辉
【期刊名称】《浙江大学学报（农业与生命科学版）》
【年(卷),期】2018(044)005
【摘要】为了在静宁鸡群体中筛选出肌肉生长抑制素基因(myostatin,MSTN)突变个体,通过若干世代选育而培育出产肉率较高的优良家禽品种,以第5世代静宁鸡为试验对象构建DNA混合池,通过分段扩增获得静宁鸡MSTN基因编码序列,并对其进行单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphism,SNP)筛查和生物信息学分析.结果表明:静宁鸡MSTN基因编码区全长1128 bp,编码375个氨基酸,该蛋白为亲水性蛋白;编码区共筛查到4个SNPs,分别为exonl-c.60G＞A、exonl-
c.195C＞G、exonl-c.234G＞A、exon3-c.966G＞T,均为同义突变;核苷酸突变后mRNA二级结构和自由能的改变导致其结构稳定性发生改变;蛋白质二、三级结构的主要元件为无规则卷曲,延伸链、a-螺旋和β-转角则散布于整个蛋白质结构中.综上表明,静宁鸡MSTN基因具有较高的突变性,为静宁鸡生长性状的标记辅助选择提供了分子基础.
【总页数】9页(P629-637)
【作者】张丽;刘丽霞;戴洪伟;陈红;王瑞;岳炳辉
【作者单位】西北民族大学生命科学与工程学院,兰州 730030;西北民族大学生命科学与工程学院,兰州 730030;西北民族大学生命科学与工程学院,兰州 730030;西
北民族大学生命科学与工程学院,兰州 730030;西北民族大学生命科学与工程学院,兰州 730030;青海畜牧兽医职业技术学院,青海湟源 812100
【正文语种】中文
【中图分类】S831.2
【相关文献】
1.鸡IFIT5基因单核苷酸多态性的生物信息学分析 [J], 张贝;郝文文;耿立英;彭永东;张传生;李祥龙
2.静宁鸡PPARα基因克隆及生物信息学分析 [J], 李萌楠;江婷;宋爱娟;杨悦;杨妍梅
3.八眉猪FABPs主要家族基因单核苷酸多态性筛查及生物信息学分析 [J], 张丽;农伟伦;卢建雄;张国华;刘丽霞
4.静宁鸡PPARα基因克隆与生物信息学分析 [J], 杨妍梅;李玉;覃圣;蒋刘芽;赵金潭;陆晓东;熊杰;陈伟基;扎西英派
5.务川黑牛TLR2基因的单核苷酸多态性(SNP)筛查及生物信息学分析 [J], 姜涛;秦雅晶;罗皎兰;米小梅;王进千;刘丽霞
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