优秀本科课件《生物化学与分子生物学第九版》:第三章 酶与酶促反应
金属激活酶(metal-activated enzyme) 金属离子为酶的活性所必需,但与酶的结合不甚紧密。
金属离子的作用: 参与催化反应,传递电子; 在酶与底物间起桥梁作用; 稳定酶的构象; 中和阴离子,降低反应中的静电斥力等。
人体各组织器官LDH同工酶谱(活性%)
红细胞 白细胞 血清 骨骼肌 心肌 肺 肾 肝 脾
作用
部分辅酶/辅基在催化中的作用
转移的基团
小分子有机化合物(辅酶或辅基)
名称
所含的维生素
氢原子(质子)
醛基 酰基
NAD+(烟酰胺腺嘌呤二核苷 酸,辅酶I NADP+(烟酰胺腺嘌呤二核苷 酸磷酸,辅酶II FMN(黄素单核苷酸) FAD(黄素腺嘌呤二核苷酸) TPP(焦磷酸硫胺素) 辅酶A(CoA) 硫辛酸
与酶蛋白结合疏松,可用透析或超滤的方法除去。
辅基 (prosthetic group):
与酶蛋白结合紧密,不能用透析或超滤的方法除去。
辅助因子多为小分子的有机化合物或金属离子。
作为辅助因子的有机化合物多为B族维生素的衍生物或卟啉化合物 它们在酶促反应中主要参与传递电子、质子(或基团)或起运载体
熟悉
熟悉影响酶促反应速率的因素及其机制
了解
酶的分类与命名、酶在医学中的应用
酶学研究简史
公元前两千多年,我国已有酿酒记载。 一百余年前,Pasteur认为发酵是酵母细胞生命活动的结果。 1878年,Kühne首次提出Enzyme一词。 1897年,Eduard Buchner用不含细胞的酵母提取液,实现了发酵。 1926年,Sumner首次从刀豆中提纯出脲酶结晶 (deoxyribozyme)。 1982 年 , Cech 首 次 发 现 RNA 也 具 有 酶 的 催 化 活 性 , 提 出 核 酶
(ribozyme)的概念。 1995年,Jack W.Szostak研究室首先报道了具有DNA连接酶活性DNA
片段,称为脱氧核酶(deoxyribozyme)。
第一节
酶的分子结构与功能
Structure and Function of Enzymes
酶的不同形式:
单体酶(monomeric enzyme):单一亚基构成的酶 。如牛胰核糖核酸酶,溶菌酶 等。
多酶体系:丙酮酸脱氢酶复合体
多功能酶:哺乳类动物脂肪酸合酶
7种酶活性都在一条多 肽链上,属多功能酶 ,由一个基因编码; 有活性的酶为两相同 亚基首尾相连组成的 二聚体。
一、酶的分子组成中常含有辅助因子
1. 单纯酶(simple enzyme):仅含有肽链的酶称为单纯酶。脲酶,蛋 白酶,淀粉酶,核糖核酸酶。
第三章
酶与酶促反应
Enzymes and Enzyme-Catalyzed reactions
第一节 酶分子的结构与功能 第二节 酶的工作原理 第三节 酶促反应动力学 第四节 酶的调节 第五节 酶的分类与命名 第六节 酶在医学中的应用
重点难点
掌握
酶的分子组成、酶的活性中心、同工酶、酶促反应 特点、米氏方程、别构调节、化学修饰调节、酶原 及其激活
寡聚酶(oligomeric enzyme):由多个相同或不同亚基以非共价键连接组成的酶。 如蛋白激酶A,磷酸果糖激酶-1。
多酶体系(multienzyme system):由几种不同功能的酶彼此聚合形成多酶体系或 称多酶复合物。如丙酮酸脱氢酶复合物。
多功能酶(multifunctional enzyme)或串联酶(tandem enzyme):一些多酶体系在 进化过程中由于基因的融合,多种不同催化功能存在于一条多肽链中,这类酶 称为多功能酶。如脂肪酸合酶。
与底物相结合Βιβλιοθήκη 催化基团 (catalytic group) 催化底物转变成产物
活性中心外的必需基团
位于活性中心以外,维持酶活性中心应有的空间构象和 (或)作为调节剂的结合部位所必需。
活性中心以外 的必需基团
结合基团
底物 催化基团 活性中心
溶菌酶的活性中心
溶菌酶的活性中心是一裂隙, 可以容纳肽多糖的6个单糖 基(A,B,C,D,E,F), 并与之形成氢键和van derwaals力。
2.缀合酶(conjugated enzyme):由酶蛋白和辅助因子共同构成的 酶。 辅助因子(cofactor):分为辅酶和辅基
全酶分子中各部分在催化反应中的作用:
酶蛋白决定反应的特异性 辅助因子决定反应的种类与性质
辅助因子分类
(按其与酶蛋白结合的紧密程度)
辅酶 (coenzyme):
金属酶 过氧化氢酶 过氧化物酶 己糖激酶
固氮酶 核糖核苷酸还原
羧基肽酶 碳酸酐酶
某些金属酶和金属激活酶
金属离子 Fe2+ Fe2+ Mg2+ Mo2+ Mn2+ Zn2+ Zn2+
金属激活酶 丙酮酸激酶 丙酮酸羧化酶 蛋白激酶 精氨酸酶 磷脂酶C 细胞色素氧化酶 脲酶
金属离子 K+、Mg2+ Mn2+、Zn2+ Mg2+、Mn2+ Mn2+ Ca2+ Cu2+ Ni2+
烟酰胺(维生素PP)之一
烟酰胺(维生素PP)之一
维生素B2(核黄素) 维生素B2(核黄素) 维生素B1(硫胺素) 泛酸 硫辛酸
烷基 二氧化碳
钴胺素辅酶类 生物素
维生素B12 生物素
氨基
磷酸吡哆醛
甲基、甲烯基、甲炔基、 四氢叶酸 甲酰基等一碳单位
吡哆醛(维生素B6之一) 叶酸
金属离子是最多见的辅助因子
二、酶的活性中心是酶分子中执行其催化功能的部位
酶的活性中心或活性部位(active site) 是酶分子中能与底物特异地结合并催化 底物转变为产物的具有特定三维结构的 区域。
酶的活性中心示意图
二、酶的活性中心是酶分子执行其催化功能的部位
活性中心内的必需基团
结合基团
(binding group)
催化基团是35位Glu,52位 Asp;
101位Asp和108位Trp是结 合基团。
三、同工酶催化相同的化学反应
定义:同工酶 (isoenzyme)是指催化相同的化学反应,但酶蛋白的分子结构、理化 性质乃至免疫学性质不同的一组酶。
乳酸脱氢酶同工酶的亚基构成
举例 1
LDH同工酶
LDH1 LDH2 LDH3 LDH4 LDH5
生物化学及分子生物学(人卫第九版)-03酶与酶促反应59页PPT
36、如果我们国家的法律中只有某种 神灵, 而不是 殚精竭 虑将神 灵揉进 宪法, 总体上 来说, 法律就 会更好 。—— 马克·吐 温 37、纲纪废弃之日,便是暴政兴起之 时。— —威·皮 物特
38、若是没有公众舆论的支持,法律 是丝毫 没有力 量的。 ——菲 力普斯 39、一个判例造出另一个判例,它们 迅速累 聚,进 而变成 法律。 ——朱 尼厄斯
40、人类法律,事物有规律,这是不 容忽视 的。— —爱献 生
66、节制使快乐增加并使享受加强。 ——德 谟克利 特 67、今天应做的事没有做,明天再早也 是耽误 了。——裴斯 泰洛齐 68、决定一个人的一生,以及整个命运 的,只 是一瞬 之间。 ——歌 德 69、懒人无法享受休息之乐。——拉布 克 70、浪费时间是一桩大罪过。——卢梭
生物化学与分子生物学课件-第三章-酶
第三章酶教学要求(一)掌握内容1. 酶、核酶的概念;酶的专一性及分类;结合酶、辅酶与辅基、酶活性中心和必需基团的概念。
2. 酶促反应的特点;米氏方程式;Km和Vmax概念及意义;最适pH、最适温度的概念;不同类型可逆抑制作用的概念、特点及Km和Vmax的变化。
3. 关键酶、变构酶的概念;酶原、酶原激活的概念、同工酶的概念。
(二)熟悉内容1. 结合酶中辅酶、金属离子的作用。
2. 诱导契合假说;酶-底物中间复合物学说。
3. Km和Vmax的测定方法。
4. 不可逆抑制剂、激活剂的概念和特点。
(三)了解内容1. 酶的命名与分类。
2. 临近效应、多元催化、表面效应。
3. 米-曼氏方程式的推导过程;酶活性测定方法。
4. 酶共价修饰调节概念;蛋白合成诱导、阻遏和酶降解对酶活性的调控。
5. 酶与医学的关系。
教学内容(一)概述1. 酶和核酶的概念.2. 酶的分类与命名。
(二)酶的分子结构与功能1. 酶的分子组成2. 酶的活性中心(1)概念;(2)必需基团、结合基团、催化基团的概念。
(三)酶促反应的特点与机制1. 酶促反应的特点(1)极高的催化效率;(2)高度的特异性;(3)可调节性。
2. 酶促反应的机制(1)酶-底物复合物的形成与诱导契合假说;(2)邻近效应与定向排列;(3)表面效应;(4)多元催化。
(四)酶促反应动力学1. 底物浓度对酶促反应速率的影响(1)中间产物学说与米-曼氏方程;(2)Km值和Vmax的意义;(3)Km值和Vmax值的测定。
2. 酶浓度对酶促反应速率的影响3. 温度对酶促反应速率的影响4. pH对酶促反应速率的影响5. 抑制剂对酶促反应速率的影响(1)不可逆性抑制作用;(2)可逆性抑制作用。
6. 激活剂对酶促反应速率的影响7. 酶活性测定与酶活性单位(五)酶的调节1. 酶活性的调节(1)酶原与酶原的激活;(2)变构酶与变构调节;(3)酶的共价修饰调节。
2. 酶含量的调节(1)酶蛋白合成的诱导与阻遏调节;(2)酶的降解调节。
生物化学生物化学生物化学第三章酶
教学ppt
J.B.Sumner
J.H.Northrop
证明了酶是蛋白质
6
*某些RNA有催化活性( ribozyme,核酶)
教学ppt
Thomas Cech University of Colorado at Boulder, USA
模拟生物催化剂:
8
教学ppt
二、酶的催化作用特点
(一)、酶与一般催化剂的共性
1、只能催化热力学上允许的反应,降低反应的活化能 2、不改变化学反应平衡常数 3、反应前后酶没有质和量的改变
9
ቤተ መጻሕፍቲ ባይዱ
教学ppt
(二)、酶作为生物催化剂的特点
1、高效性
*酶的催化效率通常比非催化反应高108~1020倍,比一 般催化剂高107~1013倍。 *酶加速反应的机理是降低反应的活化能。
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绝对专一性
酶只作用于特定结构的底物,进行一种专一的反 应,生成一种特定结构的产物 。
如:
N 2H 脲 酶
O C + H 2 O
2 N H 3 + C O 2
N 2H 尿 素
N C H 3H 脲 酶
O C
+ H 2 O
N 2H 甲 基 尿 素
教学ppt
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立体异构专一性
乳酸脱氢酶(Lactate dehydrogenase)
对同一种酶来讲,比活力愈高则表示酶的纯度越高(含 杂质越少)。
比活力是评价酶纯度高低的一个指标。
22
教学ppt
问题?
现有1g淀粉酶制剂,用水稀释1000mL,从中吸取0.5mL 测定该酶的活力,得知5分钟分解0.25g淀粉。计算每 克酶制剂所含的淀粉酶活力单位数。 (淀粉酶活力单位规定为:在最适条件下,每小时分 解1g淀粉的酶量为1个火力单位。)
生物化学 第三章 酶(共65张PPT)
含多条肽链则为寡聚酶,如RNA聚合酶,由4种亚基构成五聚体。
(cofactor)
别构酶(allosteric enzyme):能发生别构效应的酶
9 D-葡萄糖6-磷酸酮醇异构酶 磷酸葡萄糖异构酶
esterase)活性中心丝氨酸残基上的羟基结合,使酶失活。
酶蛋白
酶的磷酸化与脱磷酸化
五、酶原激活
概念
酶原(zymogen):细胞合成酶蛋白时或者初分 泌时,不具有酶活性的形式
酶原 切除片段 酶
(–)
(+)
酶原激活
本质:一级结构的改变导致构象改变,激活。
胰蛋白酶原的激活过程
六、同工酶
同工酶(isoenzyme)是指催化相同的化学反应, 而酶蛋白的分子结构、理化性质乃至免疫学性质 不同的一组酶。
正协同效应(positive cooperativity) 后续亚基的构象改变增加其对别构效应剂
的亲和力,使效应剂与酶的结合越来越容易。
负协同效应(negative cooperativity) 后续亚基的构象改变降低酶对别构效应剂
的亲和力,使效应剂与酶的结合越来越难。
协同效应
正协同效应的底物浓度-反应速率曲线为S形曲线
/ 即: Vmax = k3 [Et]
Km 和 Vmax 的测定
双倒数作图法 Lineweaver-Burk作图
将米氏方程式两侧取倒数
1/v = Km/Vmax[S] + 1/Vmax = Km/Vmax •1/ [S] + 1/Vmax 以 1/v 对 1/[S] 作图, 得直线图
斜率为 Km/Vmax
生化·第3章·酶ppt课件
Vmax[S] V=
Km+ [S]
V max 初 速 度 v
a
b 1 /2 V max
V≈Vmax
c
反应速率不再 增加,反应呈 零级反应
0 Km
[S ]
图 5-14 底 物 浓 度 对 酶 促 反 应 速 度 的 影 响
(二) Km和Vmax的意义
1.当反应速率为最大速率一半时,米氏方 程为:
当V =Vmax 时 2
酶:由活细胞合成的以蛋白质 为主的大分子生物催化剂。
大多数为蛋白质 少数为核酸 核酶(RNA)
脱氧核酶(DNA)
底物(S) 酶(E) 产物(P)
第一节 酶的分子结构与功能
单体酶:由一条肽链构成的酶(具有三级结 构)
寡聚酶:由多个相同或不同亚基以非共价键 相连的酶(具有四级结构)
多酶体系或多酶复合体:由几种不同功能的 一个团体 酶聚合形成的多酶复合物。
酶的必需基团在一级结构上可能相距 很远,但在空间结构上彼此靠近,组成 具有特定空间结构的区域,能与底物特 异结合并发挥催化作用,将底物转变为 产物的部位称为酶的活性中心 (active center)或活性部位。
A B
酶活性中心的示意图
活性中心内 结合基团 结合底物
必 需
必需基团
基
催化基团 催化底物
当底物浓度很低时([S]<<Km),分 母中的[S]可忽略不计,此时
Vmax[S] V=
Km+ [S]
Vmax[S] V=
Km
V max
初
c
反应速率与 速
b
[S]呈正比, 度
成一级反应 v
1/2V max
a
0 Km
生物化学与分子生物学:chap03 酶 2
E
增大 不变
增大 不变 增大
E、ES
不变 降低
增大 增大 不变
ES
减小 降低
不变 增大 减小
目录
六、激活剂对反应速度的影响
激活剂(activator) 使酶由无活性变为有活性或使酶活
性增加的物质。如金属离子(Mg2+)和小 分子化合物。
1.必需激活剂 (essential activator) ----对酶促反应不可缺少的激活剂
四、pH对反应速度的影响
最适pH: 酶催化抑制剂与抑制作用
➢ 酶的抑制剂(inhibitor) 凡能使酶的催化活性下降而不引起
酶蛋白变性的物质称为酶的抑制剂。 ➢抑制作用的类型:
不可逆性抑制 可逆性抑制
①竞争性抑制 ②非竞争性抑制 ③反竞争性抑制
目录
(二) 可逆性抑制作用
概念----抑制剂通常以非共价键与酶或 酶-底物复合物可逆性结合,使 酶的活性降低或丧失;抑制剂可 用透析、超滤等方法去除。
类型
竞争性抑制 非竞争性抑制 反竞争性抑制
目录
1. 竞争性抑制作用 定义: 抑制剂与底物的结构相似,能与底物 竞争酶的活性中心,从而阻碍酶底物 复合物的形成,使酶的活性降低。
特点:
① I与S结构类似,竞争酶的活性中心; ② 抑制程度取决于I与S之间的相对浓度; ③ 动力学特点:Vmax不变,表观Km增大。
目录
2.非竞争性抑制
定义:抑制剂与酶活性中心外的基团可 逆性结合,导致酶的三维构象改 变,降低酶的催化活性,但不影 响酶与底物的结合。
特点:
①抑制剂与酶活性中心外的必需基团结合, 底物与抑制剂之间无竞争关系;
Km降低。
E+S ES E+P + I ESI
生物化学生物化学生物化学第三章酶86页PPT
调节对象: 关键酶 调节方式
酶活性的调节(快速调节) 酶含量的调节(缓慢调节)
一 、酶活性的调节
(一)酶原与酶原的激活
酶原 (zymogen): 有些酶在细胞内合成或初分泌时只是酶的无活性
对同一种酶来讲,比活力愈高则表示酶的纯度越高(含 杂质越少)。
比活力是评价酶纯度高低的一个指标。
问题?
现有1g淀粉酶制剂,用水稀释1000mL,从中吸取0.5mL 测定该酶的活力,得知5分钟分解0.25g淀粉。计算每 克酶制剂所含的淀粉酶活力单位数。
(淀粉酶活力单位规定为:在最适条件下,每小时分 解1g淀粉的酶量为1个火力单位。)
*关系式为:V = K3 [E]
0
[E]
三、温度对反应速度的影响
酶 2.0
最适温度
活
1.5
(optimum temperature):性
1.0
0.5
0 10 20 30 40 50 60
温度 ºC
四、 pH对反应速度的影响
最适pH
酶
(optimum pH): 活
性
胃蛋白酶
淀粉酶
胆碱酯酶
0
2
4
6
8 10
特点:
*I与S结构类似,竞争酶的活性中心; *抑制程度取决于抑制剂与酶的相对亲和力及[S]; *动力学特点:Vmax不变,表观Km↑。
举例
1、丙二酸对琥珀酸脱氢酶的抑制
琥珀酸
琥珀酸脱氢酶
延胡索酸
FAD
COOH CH2 C H2 COOH 琥珀酸
FADH2
COOH CH2 COOH 丙二酸
2、磺胺药对细菌FH2合成酶的抑制
第三节、酶促反应的机理
生物化学 酶PPT
1980s,Thomas R. Cech和Sidney Altman分别在四膜 虫的RNA前体加工和细菌核糖核酸酶P复合物研究中 发现:RNA具有催化作用,并提出了核酶的概念。
1994年,Gerald.F.Joyce等发现了具有催化活性的 DNA(为人工合成),称为脱氧核酶。
1989年度 诺贝尔化学奖
按照与酶蛋白的结合程度,辅助因子又可分为: ① 辅酶(Coenzyme):
与酶蛋白结合疏松,可用透析或超滤方法除去。
② 辅基(Prosthetic group):
与酶蛋白结合紧密,不能用透析或超滤法除去。
三、维生素与辅助因子
1. 定义:维生素是维持人体正常生理功能或细胞正常代 谢所必需的营养物质,人体的需要量极小(常以毫克 或微克计),但在体内不能合成或合成量很少,必须 由食物供给的一类小分子有机化合物。
组成的多酶复合物。 • 多功能酶:指一些多酶体系在进化过程中
由于基因的融合,多种不同催化功能存在 于一条多肽链中,这类酶称为多功能酶或 串联酶。
二、酶的分子组成
按照分子组成分为两种: 单纯酶:指仅由氨基酸残基组成的酶。如淀粉酶等。
蛋白质部分:酶蛋白
结合酶
apoenzyme
非蛋白质部分:辅助因子 cofactor
尼克酸, NAD+; 尼克酰胺 NADP+
多种脱氢酶的辅酶(传递氢)
VitB6
吡哆醇 吡哆醛
磷酸吡哆醛 氨基酸脱羧酶和转氨酶的辅基
磷酸吡哆胺
吡哆胺
泛酸 遍多酸 CoA
酰基转移酶的辅酶
生物素 VitH 生物素 羧化酶的辅基
叶酸
FH4
一碳单位转移酶的辅酶
VitB12 钴胺素 甲钴胺素 甲基转移酶的辅酶
